masz licencjat. i co dalej? - studia.eko.uj.edu.pl‚aw... · dr hab. marek romek – rozwój...
TRANSCRIPT
Masz licencjat.
I co dalej?
Różnorodność szansą na właściwy wybór
Instytut Zoologii UJ
ul. Gronostajowa 9
30-387 Kraków
Instytut Zoologii
• Zakład Anatomii Porównawczej
• Zakład Antropologii
• Zakład Biologii i Obrazowania Komórki
• Zakład Biologii Rozwoju i Morfologii Bezkręgowców
• Zakład Entomologii
• Zakład Immunologii Ewolucyjnej
• Pracownia Malakologii
• Zakład Neuroanatomii
• Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu
Katedra Fizjologii Zwierząt
• Zakład Biochemii Glikokoniugatów
• Zakład Endokrynologii
• Zakład Fizjologii i Toksykologii Rozrodu
• Zakład Hematologii Eksperymentalnej
• Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii
Muzeum Zoologiczne (Centrum Edukacji Przyrodniczej UJ)
www.iz.binoz.uj.edu.pl
Zakład Anatomii Porównawczej
• bardzo zróżnicowana tematyka
• współautorstwo publikacji
• badania w laboratorium i/lub w terenie
• możliwość uczestniczenia w grantach
• filogeografia płazów • czynniki warunkujące rozród niższych
kręgowców • komunikacja feromonalna u płazów ogoniastych • budowa układów rozrodczych i gametogeneza
(TEM, SEM) u kręgowców i bezkręgowców • struktura (TEM, SEM) narządów zmysłowych u
ryb i płazów • zróżnicowanie molekularne płazów w Europie
• magistranci mogą być włączani w granty (NCN i inne) prowadzone w ZAP (wsparcie finansowe)
• badania molekularne – pracownia DNA • badania cyto- i histologiczne – pracownia technik histologicznych • badania ultrastrukturalne – mikroskopia elektronowa transmisyjna i skaningowa (w Zakładzie Biologii i Obrazowania
Komórki) • badania immunofluorescencyjne – mikroskop fluorescencyjny (ZAP) i mikroskop konfokalny (ZBiOK) • badania terenowe – faunistyka i inwentaryzacja (kręgowce i wybrane grupy bezkręgowców) na terenach chronionych
• istotne wyniki uzyskane podczas wykonywania pracy magisterskiej są zawsze publikowane (współautorstwo)
Zakład Anatomii Porównawczej
Zakład Antropologii
Kierownik: prof. dr hab. Krzysztof Szostek
Specjalizacja - Biologia człowieka
Zakład Antropologii
ZAKRES SPECJALIZACJI •antropometria i antroposkopia,
•wykonywanie odbitek i analiza wzorów dermatoglificznych,
•badania paleodemograficzne,
•badanie i interpretacja obserwacji osteologicznych, odontologicznych i
paleopatologicznych,
•badania fizykochemiczne ludzkich populacji pradziejowych i historycznych.
CELE SPECJALIZACJI •ocena poziomu rozwoju fizycznego człowieka w powiązaniu z naukami
medycznymi i naukami o kulturze fizycznej,
•wykonywanie ekspertyz sądowych,
•wykonywanie ekspertyz anatomo- antropologicznych populacji
pradziejowych i historycznych.
REALIZACJA SPECJALIZACJI zaliczenie kursów specjalistycznych (35 ECTS)
zaliczenie kursów uzupełniających (min.10 ECTS)
zaliczenie seminarium i wykonanie pracy magisterskiej
Zakład Antropologii
TEMATYKA PRAC MAGISTERSKICH (przykłady):
• Rekonstrukcja stanu biologicznego i parametrów morfologicznych populacji pradziejowych.
• Analizy występowania zmian patologicznych w historycznych populacjach ludzkich
• Badania histomorfometryczne kości i zębów człowieka.
• Rekonstrukcja diety oraz migracji historycznych i przedhistorycznych grup ludzkich.
• Dziedziczenie wzorów dermatoglificznych.
• Symetria i asymetria cech morfologicznych człowieka.
• Wpływ czynników genetycznych, paragenetycznych i środowiskowych na stan
biologiczny noworodków.
• Wpływ czynników społeczno-ekonomicznych na wysokość i
masę ciała człowieka.
• Trendy sekularne w zakresie dojrzewania płciowego i parametrów
morfologicznych ciała
• Badania strategii życiowych naczelnych
w warunkach sztucznych i w środowisku naturalnym.
Zakład Antropologii
Aktywność naukowa i organizacyjna
Konferencja Naukowa Studentów Antropologii
Konferencja Polskiego Towarzystwa Antropologicznego
Naukowe Koło Antropologów UJ
Wykopaliska archeologiczne
Zakład Biologii i Obrazowania
Komórki
Zakład Biologii i Obrazowania Komórki Instytut Zoologii, II p., segment C http://www.biologia.studies.uj.edu.pl/binoz/iz/STRONY/20/index.html Dzień otwarty – Zapraszamy studentów do odwiedzenia
Zakładu 1 czerwca, 2015 w godz. 11.00-13.00.
Zakład Biologii i Obrazowania
Komórki
Tematyka badań:
Prof. dr hab. Elżbieta Pyza (kierownik Zakładu), dr Jolanta Górska-Andrzejak – biologia komórek nerwowych, mechanizmy neuroplastyczności, zegar biologiczny i rytmika okołodobowa Granty: FP7-PEOPLE-2012-ITN nr 316790, europejski (2013-2017) “INsectTIME – Insect Timing” NCN, nr NZ3/02908 (2013-2016) „Rola oksygenazy hemowej w regulacji zegara dobowego Drosophila melanogaster” NCN, nr NN 301 038 (2011- 2014: „Rola białka Bruchpilot (BRP) w plastyczności synaptycznej w układzie wzrokowym Drosophila melanogaster”, NCN 2011/03/N/NZ3/01250 (2012-2014) "Molekularny mechanizm okołodobowej plastyczności interneuronów L2 w układzie wzrokowym Drosophila melanogaster"
Dr hab. Anna M. Osyczka – komórki macierzyste, osteogeneza
Grant: NCN nr 2011/01B/NZ4/00664 (2011-2014) „Inżynieria tkanki kostnej z wykorzystaniem ludzkich mezenchymalnych komórek macierzystych, białek morfogenetycznych kości, bioaktywnych rusztowań i dynamicznych warunków hodowli”
Dr hab. Grzegorz Tylko – mikroanaliza, cytotoksykologia, biologia komórki - autofagia
Dr hab. Marek Romek – rozwój zarodkowy
Grant: NCN „Czynniki modyfikujące hodowane zarodki świni: implikacje cytologiczne i biotechnologiczne”
Dr hab. Janusz Karasiński – komórki macierzyste, układ mięśniowy
Grant: NCN nr N N303 804240 (2011-2014) „Rola komórek macierzystych w przebudowie endometrium w modelu macicy świni”
Zakład Biologii i Obrazowania
Komórki
Metody stosowane w badaniach:
mikroskopia konfokalna i elektronowa
analiza RNA (qPCR) i białek (Western blot,
immunoprecypitacja)
lumino-, fluoro- i spektrometria
cytometria
hodowla komórek
immunocytochemia
badania z wykorzystaniem zwierząt transgenicznych
Przykłady publikacji, których współautorami są studenci: Borowska J., E. Pyza (2011) Effects of heavy metals on insect immunocompetent cells. Journal of Insect Physiology, 57:760-770. Damulewicz M., E. Pyza (2011) The clock input to the first optic neuropil of Drosophila melanogaster expressing neuronal circadian plasticity. PLoS ONE, 6: 21258. Pamula E., J. Kokoszka, K. Cholewa-Kowalska, M. Laczka, L. Kantor, L. Niedzwiedzki, G. C. Reilly, J. Filipowska, W. Madej, M. Kolodziejczyk, G. Tylko, A. M. Osyczka (2011) Degradation, bioreactivity, and osteogenic potential of composites made of PLGA and two different sol-gel bioactive glasses. Annals of Biomedical Engineering, 39(8): 2114-2129. Skarżyńska J., M. Damulewicz, J. Filipowska, W. Madej, P. S. Leboy, A. M. Osyczka (2011) Modification of smad1 linker modulates BMP- mediated osteogenesis of adult human MSC. Connective Tissue Research, 52(5): 408-414. Plewa A., W. Niemiec, J. Filipowska, A. M. Osyczka, R. Lach, K. Szczubialka, M. Nowakowska A.(2011) Photocrosslinkable diazoresin/pectin films – synthesis and application as cell culture supports. European Polymer Journal, 47: 1503-1513. Filipiak M., G. Tylko, W. Kilarski (2012) Flow cytometric determination of genome size in European sunebleak Leucaspius delineates (Heckel, 1843). Fish Physiol Biochem, 38 (2): 355-362. Górska-Andrzejak J., R. Makuch, J. Stefan, A. Görlich, D. Semik, E. Pyza (2013): Circadian expression of the presynaptic active zone protein Bruchpilot in the lamina of Drosophila melanogaster. Developmental Neurobiology, 73:14-26. Filipiak M., G. Tylko, E. Pyza (2012): Zinc induces caspase-dependent mitochondrial pathway of the programmed cel death in haemocytes of Drosophila melanogaster. Biomaterials 25: 507-516.
50 µm BMP
anti-pSmad1,5,8
anti-Smad1
adeno-Smad1control empty wtmutated
- + - + - + - +
0.9 1.2 3.2 2.5fold change pSmad/Smad
BMP vs. untreated
BMP
anti-pSmad1,5,8
anti-Smad1
adeno-Smad1control empty wtmutated
- + - + - + - +
0.9 1.2 3.2 2.5fold change pSmad/Smad
BMP vs. untreated TCP matrix
polymer insulin
TCP matrix
polymer insulin
Zakład Biologii Rozwoju
i Morfologii Bezkręgowców
Zróżnicowana tematyka badawcza
Obecnie realizowane prace magisterskie (wybrane):
Przebieg oogenezy u skorka Chaetospania borneensis (Eudermaptera, Spongiphoridae):
różnicowanie komórek odżywczych i geneza oosomu
Ultrastruktura, rozmieszczenie oraz transowarialny przekaz endosymbiotycznych mikroorganizmów
u czerwców z rodziny Ortheziidae (Hemiptera, Coccinea)
Organizacja jajnika rozwielitki wielkiej, Daphnia magna (Crustacea, Branchiopoda)
Organizacja jądra oocytu jesiotra rosyjskiego, Acipenser gueldenstaedtii (Chondrostei)
Pracownicy: Prof. dr hab. Teresa Szklarzewicz (Kierownik Zakładu)
Prof. dr hab. Szczepan Biliński
Dr hab. Mariusz Jaglarz
Dr Monika Żelazowska
Dr Anna Jabłońska
Dr Anna Michalik
Dr Wacław Tworzydło
Zakład Biologii Rozwoju
i Morfologii Bezkręgowców
Współautorstwo publikacji:
Szklarzewicz T., Michalik A., Czaja A., Szydłowska S. (2010). Germ cell cluster
formation and ovariole structure in Puto albicans and Crypticerya morrilli (Insecta, Hemiptera,
Coccinea). Phylogenetic mplications. European Journal of Entomology, 107: 589- 596.
Udział w Konferencjach Naukowych:
Tworzydło W., Kisiel E., Pituch B. (2011) Structure of the germarium in the ovary of Thermobia
domestica (Hexapoda, Zygentoma). XX International Symposium of Polish network of molecular
and cellular biology: Molecular and Physiological Aspects of Processes in the Organism. Kraków
Tworzydlo W., Drozdz J., Kisiel E. (2013) The Balbiani body in the female germline cells of
Thermobia domestica (Insecta, Zygentoma). 2nd Global Conference on Entomology, Kuching,
Malezja (Borneo)
Zakład Entomologii
lokalizacja:
Instytut Zoologii UJ, III p. Sektor D
lokalizacja:
Gorce: Ochotnica Górna-Jaszcze
Zakład Entomologii
Zakład Entomologii – oferta dla studentów 1. Udział w realizowanych projektach badawczych Zakładu;
badania prowadzone są na: chrząszczach, niesporczakach i roztoczach w zakresie: bioróżnorodności, faunistyki (fauna Polski, w szczególności obszary górskie, monitoring faunistyczny); ekologii, biogeografii, ochrona przyrody, taksonomii, filogenezy, filogeografii, ewolucji, kariologii i analiz molekularnych.
2. Wykonywanie własnych projektów w ramach dostępnych
w laboratorium modeli zwierzęcych i sprzętu badawczego.
Pracownia Malakologii
Tematy prac magisterskich: Makro- i mikroewolucja na poziomie
morfologicznym i molekularnym, morfologia i filogeneza ślimaków i
małży; możliwe też tematy z zakresu faunistyki i ekologii mięczaków.
Seminaria: Malakologia ewolucyjna, metody numeryczne w taksonomii
filogenetycznej i fenetycznej, taksonomia molekularna.
Zakład Immunologii Ewolucyjnej
PRACOWNICY Prof. dr hab. Barbara Płytycz, [email protected] Dr hab. Magdalena Chadzińska (kierownik Zakładu), [email protected] Dr hab. Elżbieta Kołaczkowska, [email protected] Dr Joanna Homa, [email protected]
Tylko w ostatnich 5 latach magistranci ZIE: •Obronili z sukcesem 40 prac magisterskich •Byli wykonawcami w 4 projektach badawczych NCN, EU •Byli współautorami 16 oryginalnych prac naukowo-badawczych opublikowanych w czasopismach z tzw. Listy Filadelfijskiej, 6 prac popularno-naukowych i 45 doniesień konferencyjnych
Nasi magistranci badali między innymi: •Proces aktywacji układu profenoloksydazy u dżdżownic
•Wpływ chemokin CXC i interferonu gamma na aktywność granulocytów karpia
•Wpływ RAGE i stabiliny-1 na produkcję MMP-9 i MMP-2 podczas zapalenia jamy otrzewnej myszy
Zakład Immunologii Ewolucyjnej
PATO G EN Y
•EWOLUCJA ODPORNOŚCI •ODPORNOŚĆ WRODZONA/ZAPALENIE/SEPSA
•POWIĄZANIA MIĘDZY UKŁADEM NEUROENDOKRYNNYM A
ODPORNOŚCIOWYM
BADANIA IN VITRO
BADANIA IN VIVO
Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu
1. Genetyczna kontrola jakości gamet, a szczególnie rola chromosomu Y
w spermatogenezie i płodności samców ssaków
2. Analiza zwierzęcych modeli chorób metabolicznych
u człowieka
3. Kontrola cyklu komórkowego oraz epigenetyczne
modyfikacje chromatyny w oocytach myszy
Zakład Neuroanatomii
Zakład Neuroanatomii
Zakład Neuroanatomii
Zakład Endokrynologii
PRACOWNICY Prof. dr hab. Barbara Bilińska (kierownik Zakładu), [email protected]
Prof. dr hab. Maria Słomczyńska, [email protected]
Dr hab. Jerzy Galas, [email protected]
Dr hab. Małgorzata Duda, [email protected]
Dr hab. Małgorzata Kotula-Balak, [email protected]
Dr Anna Hejmej, [email protected]
Dr Katarzyna Knapczyk-Stwora, [email protected]
Zakład Endokrynologii
Rola androgenów w regulacji ekspresji genów budujących połączenia
międzykomórkowe w gonadzie męskiej, najądrzu i prostacie knura i szczura
Molekularne podstawy rozwoju jajnika świni po zastosowaniu
anty-androgenów (także środowiskowych) w okresie życia płodowego
(model in vivo i in vitro);
Opracowanie nowego systemu izolacji i hodowli pęcherzyków
jajnikowych pierwotnych i pierwszorzędowych pozwalającego uzyskiwać oocyty
wysokiej jakości;
Regulacja czynności pęcherzyka jajnikowego i funkcją wzgórka
jajonośnego szczurów;
Rola fotoperiodu w regulacji funkcjonowania komórek jajnikowych
nornicy rudej;
Molekularne podłoże zaburzeń męskiego układu rozrodczego w wyniku
działania czynników estrogennych i anty-androgennych;
Rola estrogenów w regulacji spermatogenezy.
Zakład Endokrynologii
Tylko w ostatnich 5 latach nasi magistranci Zakładu: •Obronili z sukcesem 47 prac magisterskich •Byli uczestnikami programu ERASMUS •Byli wykonawcami w 2 projektach badawczych NCN •Byli współautorami 11 oryginalnych prac naukowo-badawczych i 20 doniesień konferencyjnych
Zakład Hematologii Eksperymentalnej
Funkcjonowanie komórek hematopoetycznych w warunkach fizjologicznych, patologicznych
i pod wpływem działania czynników cytotoksycznych
Badania in vitro Badania in vivo
Zakład Hematologii Eksperymentalnej
- Kompleksowa analiza programowanej śmierci komórki - autofagii, apoptozy, nekrozy,
starzenia się komórki, różnicowania, katastrofy mitotycznej i cyklu komórkowego w warunkach
in vitro i in vivo
- Określenie zależności pomiędzy procesami zachodzącymi na poziomie komórkowym,
biochemicznym i molekularnym pod wpływem działania związków o potencjalnych
właściwościach przeciwnowotworowych
- Analiza ekspresji genów zaangażowanych w odpowiedź patologicznych i prawidłowych
komórek hematopoetycznych na testowane związki o potencjalnej aktywności
przeciwnowotworowej
- Określenie strategii unicestwiania komórek patologicznych poprzez indukowanie określonego
typu śmierci komórkowej, katastrofy mitotycznej, różnicowania czy starzenia się komórki
- Określenie odpowiedzi prawidłowych komórek hematopoetycznych na działanie testowanych
czynników cytotoksycznych
- Selekcjonowanie testowanych związków wykazujących wysoką aktywność
przeciwleukemiczną i ograniczone do minimum niepożadane działanie na prawidłowe komórki
hematopoetyczne
Tematyka badań realizowanych w Zakładzie Hematologii Eksperymentalnej:
Zakład Biochemii Glikokoniugatów
Zespół : dr hab. Małgorzata Przybyło
dr hab. Dorota Hoja-Łukowicz
dr Ewa Pocheć
dr Marcelina Janik
dr Monika Bubka
kierownik Zakładu: prof. dr hab. Anna Lityńska
Tematyka badawcza:
• Badanie struktury i zmienności glikoprotein
• Badanie funkcja glikanów w komórkach prawidłowych
i zmienionych patologicznie
• Znaczenie glikozylacji adhezyjnych białek w progresji
nowotworowej badanej poprzez zdolności adhezyjne, migracyjne
i inwazyjne.
Zakład Biochemii Glikokoniugatów
Stosowane metody:
• hodowle komórkowe
• izolacja białek
• rozdział elektroforetyczny, Western blot, identyfikacja
białek
• qRT-PCR, wyciszanie i nadekspresja genów
• testy funkcjonalne (adhezja, migracja, inwazja, transmigracja)
• analiza struktur oligosacharydowych przy użyciu lektyn i metodą
spektroskopii mas
• badanie ekspresji antygenów powierzchniowych metoda cytometrii
przepływowej
• badanie apoptozy metoda cytometrii przepływowej
• badanie aktywności metaloproteinaz (zymografia)
• immunohistochemia
Zakład Fizjologii i Toksykologii Rozrodu
PRACOWNICY Kierownik: Prof. dr hab. E. Gregoraszczuk Dr hab. A. Ptak Dr A. Rak-Mardyła Dr P. Kwiecińska
WSPÓŁPRACA:
Zakład Chemii Analitycznej, Politechnika Krakowska
Klinika Endokrynologii Ginekologicznej , Collegium Medicum UJ
Zakład Patomorfologii, Centrum Onkologii im M Skłodowskiej Curie
Instytut Ochrony Środowiska i Zdrowia Publicznego,
Uniwersytet Gdański
Zakład Neurologii, Szpital Uniwersytecki, Oslo, Norwegia
DOKTORANCI Mgr A. Karpeta Mgr J. Barć Mgr A. Wróbel Mgr E. Fiedor
http://www.zftr.binoz.uj.edu.pl/
Zakład Fizjologii i Toksykologii Rozrodu
http://www.zftr.binoz.uj.edu.pl/
Tematyka badań:
działaniem hormonów metabolicznych: leptyna, grelina, rezystyna ,
adiponektyna, visfatyna ,apelina, chimeryna.
potencjalne leki anty-nowotorowe
toksykologii rozrodu – wpływu polibromowane dibenzoetery ( PBDE),
bisphenol A (BPA), polichlorowane naftaleny (PCN), benzopiren (BaP) ,
parabeny , benzopiren jako czynników zaburzających funkcje endokrynne
Stosowane metody badawcze: • oznaczanie proliferacji komórek (test Alamar Blue, wbudowanie
bromodezoksyurydyny - BrdU)
• określenie stopnia żywotności komórek (błękit trypanu, test LDH, XTT, PAC)
• badanie procesu apoptozy (fluorometryczne oznaczanie aktywności kaspaz: 3, 8 i 9; fragmentacja DNA, barwienie komórek apoptotycznych – TUNEL)
• fluorometryczne oznaczanie aktywności enzymów detoksykacyjnych (CYP1A1 - EROD, CYP1A2 - MROD, CYP2B - PROD)
• Western Blot
• ELISA
• real-time PCR
Zakład Neurofizjologii Chronobiologii
W Zakładzie prowadzone są badania na temat mechanizmu działania zegara
biologicznego, komórkowych mechanizmów modyfikacji przekaźnictwa
synaptycznego oraz badania behawioralne nad lękiem, depresją i mechanizmami
pamięci
Zakład Neurofizjologii Chronobiologii
Tematyka prac magisterskich:
Instytut Zoologii
Podsumowanie:
Warsztaty Biologii Ewolucyjnej
Zjazdy
Ornitologów
10th Congress of European Society for Evolutionary Biology
Rok dla ekologii i zdrowego stylu zycia
Projekt MacMan
Projekt SCALES
• Badania naukowe na światowym poziomie o
różnorodnej tematyce
• międzynarodowe projekty badawcze w ramach
programów wymiany SOCRATES - ERASMUS,
CEEPUS
• projekty badawcze (krajowe i międzynarodowe)
• zjazdy, konferencje i warsztaty naukowe
• współautorstwo w publikacjach naukowych
• Festiwal Nauki, Noc Biologów, Noc Naukowców