microbiologia en iaas

8/18/2019 Microbiologia en IAAS

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Lectura 5: Microbiología en Prevención y Control de las IAAS / Profesora: Dra. Patricia García Cañete 1

Lectura 5: Microbiología en Prevención y Control de las IAASProfesora: Dra. Patricia García Cañete

Introducción

El laboratorio de microbiología tiene como rol fundamental contribuir en el diagnósticode las enfermedades infecciosas (ser capaz de identificar microorganismos a partir demuestras clínicas). También tiene un rol crucial en la prevención y control de las IAAS.

Rol de Laboratorio de Microbiología

Sus principales funciones son:

Aviso frente a Microorganismo (MO) Aviso frente a perfil de resistencia inusual Reporte selectivo de Agentes Antimicrobianos (AAM) Vigilancia de la resistencia Participar en el estudio de brotes Realizar la tipificación de cepas Participar en estudios de colonización: VRE-MRSA Participar en controles ambientales: agua-aire-superficies

Contenidos

IntroducciónMicroorganismos importantes en IAAS

Tinción de Gram

Microbiología y control de enfermedadesBacterias resistentes y relevancia epidemiológica

Funciones del laboratorio de microbiología en el control de las infecciones

Controles Ambientales

Referencias Bibliográficas

Laboratorio deMicrobiología

Identificación deMicroorganismo

Control deInfecciones


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Para esto es necesario:

Conocer los microorganismos importantes en IAAS y sus perfiles de resistencia.

Disponer de una buena muestra.

Dar aviso al Comité de Infecciones frente a perfiles de resistencia inusual.

Realizar el reporte selectivo de antimicrobianos.

Realizar la vigilancia de resistencia de microorganismos de importanciaepidemiológica.

Participar en el estudio de brotes.

Ser capaz de realizar la tipificación bacteriana.

Participar en los estudios de colonización y cultivos de vigilancia.

Participar en los controles ambientales.

Laboratorio de Microbiología

Identificación de microorganismos

Control de infecciones

Rol del laboratorio de microbiología: contribuir en el diagnóstico de lasenfermedades infecciosas (ser capaz de identificar microorganismos a partir demuestras clínicas).

Rol crucial en la prevención y control de las IAAS


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Microorganismos importantes en IAAS

Bacterias Virus Hongos Parásitos

Staphylococcusaureus

Rotavirus Candida albicans Giardia lamblia

Staphylococcuscoagulasa negativo

Virus Respiratoriosincicial

Candida spp Toxoplasma

Enterococcus spp VIH- Hepatitis B y C Cryptococcus Trypanosoma cruzi

Pseudomonasaeruginosa

Adenovirus Aspergillus

Acinetobacter

baunannii Virus Infuenza A y B Mucor

Klebsiella -Escherichia coliSerratia-Enterobacter-Citrobacter

Virus Varicela

La importancia de los microorganismos en IAAS radica en:

Capacidad de sobrevivir en el ambiente

Capacidad de colonizar al personal de salud

Capacidad de transmitirse por el aire

Capacidad de ser resistente a antisépticos y antimicrobianos

Capacidad de transmitirse por sangre o fluidos corporales


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Tinción de Gram

Tinción permite clasificar a las bacterias en Gram (+) y Gram (-)

Según su: Afinidad tintorial: Gram positivo (azul) o negativo (rojo).

Forma bacteriana: coco-bacilo-cocobacilo-curvo-espirilo. Disposición bacteriana: racimo-cadena-diplo.

Diplococo Gram (-):Neisseria

Cocáceas Gram (+) en racimo:Staphy lococcus

Cocáceas Gram (+) en cadena:Streptococcus Bacilos Gram (-)


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Microbiología y control de enfermedades

Para identificar microorganismos a partir de muestras clínicas

Es clave disponer de una buena muestra

Requisitos Indicación de la toma de la muestra (responsabilidad médica). Identificación correcta del paciente y del médico. Precisar del sitio de obtención de la muestra. Que provenga del sitio de infección.

Estos requisitos de la toma de la muestra deben especificarseen un Manual de Toma de Muestras, escrito en conjunto con

enfermería

La identificación de microorganismos por parte del laboratorio de Microbiologíacontribuye también en la calidad de la vigilancia epidemiológica.

En Chile aproximadamente un 60% de las IAAS tiene respaldo microbiológico.

La recuperación de microorganismos permite también conocer la susceptibilidad alos antimicrobianos

Cada vez existe más resistencia bacteriana y bacterias multiresistentes

Bacterias resistentes y relevancia epidemiológica

Importancia Tratamiento

VISA - GISA + LinezolidSynercid

VRE Van BVRE Van A

+++ TeicoplaninaLinezolid Synercid

Enterobacterias productoras BLEE* ++++ Carbapenemicos

Enterobacterias Amp C ++++ Carbapenemicos

P. aeruginosa pan-resistente ++ Colistin

Acinetobacter baumanii pan-resistente ++ Colistin

*Beta lactamasa de espectro extendido.


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Fuente: Centres for Disease Control and Prevention. Laboratory capacity to detectantimicrobial resistence. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2000; 48: 1167-70

Participar en el estudio de brotes

El Laboratorio participa en el estudio de brotes:

- Los brotes aportan menos del 3% de las IAAS notificadas enel país.

- Los brotes son una situación de emergencia en el manejo delas IAAS porque en corto tiempo se produce un número decasos no esperados que requiere intervenciones especiales,investigación y reasignación de recursos humanos ymateriales.

Ver Grafico 1: Brotes epidémicos de IAAS notificados Chile1987-2004

Fuente: Informe de vigilancia epidemiológica de las infecciones intrahospitalarias2004, MINSAL

CTX

CTX/CLAV

CAZ

CAZ/CLAV

Un laboratorio que realizaadecuada vigilancia de

microorganismos,generalmente da la alerta de

un posible brote.


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Estudio de Brotes

Tabla1: Brotes notificados por agente etiológico 2004Fuente: Informe de vigilancia epidemiológica de las infecciones intrahospitalarias 2004,MINSAL

Note que si bien la frecuencia en todo el país es baja, la letalidad de los brotes es alta.Observe que la mayoría de los brotes pediátricos son por agentes virales versus losbrotes en adultos que son por bacterias.

Rol de Laboratorio de microbiología en las etapas de un brote

Etapa 1: Identificar elProblema

- Definición de caso- Buscar casos adicionales- Calcular tasas

Rol del Laboratorio - Vigilancia de laboratorio:- Comunicación al Comité de Infecciones- Confirmar identificación y susceptibilidad- Guardar datos- Guardar cepas

Etapa 2: Caracterizar elBrote

Quién- Cómo-Cuándo-Dónde

Rol del Laboratorio - Caracterizar cepas:- Métodos fenotípicos- Métodos genotípicos- N° y distribución de las cepas del brote


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Etapa 3: Considerarposibles causas

- Definir modo de transmisión- Identificar posibles reservorios- Identificar posibles vectores

Rol del Laboratorio - Conducir estudios complementarios: Obtenermuestras especiales: personal- pacientes-

ambientales- Seleccionar nuevas cepas por características

fenotípicas- Comparar cepas con cepa índice

Etapa 4: Control del Brote - Definir e implementar medidas de control- Evaluar eficacia de medidas de control

Rol del Laboratorio - Ajustar los procedimientos al Control deinfecciones

- Continuar vigilancia y el almacenaje de cepas- Mantener comunicación

La causa identificada por los hospitales en el 50% de los brotes notificados fue quiebrede técnicas de atención directa, en 25 % se identificó transmisión por las manos y en el

25% restante se atribuyeron los brotes a hacinamiento y falla de aislamiento depacientes.

Realizar la tipificación de cepas

El laboratorio debe ser capaz de realizar la tipificación bacteriana

Es clave saber si dos microorganismos corresponden o no a un clon.Esto tiene implicancias pues si son clonales, el principal mecanismos de transmisión es

por quiebre en las medidas de atención de salud.

Indicaciones de realizar tipificación bacteriana

SITUACION UTILIDAD

Clínica Infección vs contaminaciónRecaída-reinfección

Microbiológica Comparación de cepas

Epidemiológica Estudio de brotesMecanismos de transmisión

Fuente: Clinical Microbiology Reviews, Julio 2006, p. 512-530


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Técnicas fenotípicas de tipificación. Comparación de los sistemas

SistemaTipificación

% cepastipificables

Reproducibilidad Discriminación

Análisis plasmidial Mayoría Buena Alto

PCR-AP Todas Buena Alto

PFGE Todas Excelente Muy alto

Secuenciación Todas Excelente Muy alto

Fuente: Clinical Microbiology Reviews, Julio 2006, p.512-530.

Criterios de interpretación patrones de PFGE

Categoría N° de diferenciasgenéticascomparadas con lacepa del brote

N° de diferenciasen los fragmentoscomparados con elpatrón del brote

Interpretaciónepidemiológica

Indistinguible 0 0 La cepa en estudioes parte del brote

Cercanamenterelacionado

1 2-3 La cepa en estudioes probablementeparte del brote

Posiblementerelacionado

2 4-6 La cepa en estudioes posiblementeparte del brote

Diferente 3 7 La cepa en estudiono es parte del brote

Fuente: Journal of Clinical Microbiology, Sept. 1995, p. 2233-2239

PFGE

- Fragmentos de macro-restricción- Evalúa > 90% DNA cromosomal- Lento (5-7 días)

- Laborioso- Caro- Equipamiento especial


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Detección de brote intrahospitalario

Brotes VRE-MRSA-Serratia marscescens Pseudobacteriemias por Ocrobactrum anthropi Bacteriemia post-transfusional por Pseudomonas fluoerescens Diseminación policlonal de Pseudomonas aeruginosa R a carbapenémicos

Participar en estudios de colonización: VRE-MRSA

El laboratorio debe participar en los estudios de colonización y cultivos devigilancia

Debe definir claramente en un protocolo la selección de:

Microorganismo Sitios a cultivar Población a vigilar

Se debe:

Establecer interpretación de los resultados Utilización de los datos Re-evaluación periódica para evaluar impacto epidemiológico

Análisis epidemiológicoEvaluación microbiológica

Tipificación bacteriana

CLONALIDAD MULTIPLES CLONES

Evaluación utilización AAM

Refuerzo de educación

Estudio de BroteIntervención

Refuerzo de educación

Epidemiólogo- Infectólogo


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Participar en controles ambientales: agua-aire-superficies

El laboratorio debe participar en los controles ambientales:

Indicaciones:

Cuando existe evidencia de asociación entre ambiente e infección.

Existe un plan diseñado por el Comité de Infecciones. Los resultados de los cultivos deben tener impacto directo en el plan. Basados en referencia de la literatura.

Consideraciones:

La decisión es tomada por el Comité de Infecciones. No existen estándares internacionales de cómo efectuarlos. Muestreos arbitrarios solo conducen a:

Subir costos Consumidor de tiempo Intervenciones innecesarias

Controles Ambientales

¿Qué se puede controlar?

Cultivos del ambiente Cultivos al personal de salud Cultivos a la probable fuente del brote

Procedimiento para los controles ambientales:

1. Disponer de información de la literatura.

2. Definir localización y accesibilidad de zona de muestreo.

3. Definir toma de la muestra, transporte y método microbiológico.

4. Definir muestras de control.

5. Resultados esperados según clasificación Spaulding.

6. Disponer un Plan preliminar de acciones correctivas.

Rol del Laboratorio de Microbiología

1. Aviso frente a MO Aviso frente a perfil de resistencia inusual2. Reporte selectivo de AAM

3. Vigilancia de la resistencia

4. Participar en el estudio de brotes

5. Realizar la tipificación de cepas

6. Participar en estudios de colonización: VRE-MRSA-BLEE-KPC

7. Participar en controles ambientales: agua-aire-superficies


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Referencias bibliográficas

Centres for Disease Control and Prevention. Laboratory capacity to detect

antimicrobial resistence. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2000; 48: 1167-70

Clinical Microbiology Reviews, Julio 2006, p.512-530

Epidemiologic and Infection Control Microbiology JM Miller In Clinical

Microbiology Procedures Handbook, 2nd Ed. HD Isenberg 2004

Hacek DM et al.Am J Clin Pathol 1999;111;647-654

Informe de vigilancia epidemiológica de las infecciones intrahospitalarias 2004,

MINSAL

Journal of Clinical Microbiology, Sept. 1995, p. 2233-2239

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