microbiologie wie ziet nog klaar? prof.dr. g. verschraegen uz gent
TRANSCRIPT
![Page 1: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/1.jpg)
Microbiologie wie ziet nog klaar?
Prof.dr. G. Verschraegen
UZ Gent
![Page 2: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/2.jpg)
- nieuwe bacteriën , nieuwe namen
- opinie omtrent toestellen
- nieuwe richtlijnen antibiogram NCCLS
![Page 3: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/3.jpg)
Geen echte officiële instantie die namen geeft of goedkeurt
Wel regels voor internationale nomenclatuur van bacteriën
Naamveranderingen Bacterien
![Page 4: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/4.jpg)
J. P. Euzéby : www.bacterio.cict.fr
Nomenclatuur enterobacteriaceae
![Page 5: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/5.jpg)
Eenvoudig voorbeeld: mengsel van E. coli en S. aureus
namen van deze kiemen zijn reeds heel oud en standvastig door de tijd: E. coli (1919), S. aureus (1884)
Bacteriële naamgeving: …..eeuwenoud
![Page 6: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/6.jpg)
Bacteriële naamgeving: ….. of piepjong
Continu worden nieuwe species beschreven: Enkele voorbeelden gepubliceerd in mei-nr. van International Journal of Systematic and Environmental Mircrobiology: (en hoe ze ontdekt werden)
Mycobacterium saskatchewanens (klinisch isolaat geïdentificeerd door 16S rRNA gene sequencing)
Pseudomonas antarctica sp. nov., Pseudomonas meridiana sp. nov. and Pseudomonas proteolytica sp. nov. (stammen geisoleerd uit de Poolzeeën. Identificatie en discriminatie aan de hand van zowel fenotypische als genotypische methoden..)
Pseudomonas lutea sp. nov. (stammen die fosfaat oplosbaar maken geïsoleerd uit de wortels van planten, identificatie gebaseerd op 16S rRNA gen sequencing)
Paenibacillus lactis (identificatie dmv fenotypie en genotypie van isolaten uit verse melk)
![Page 7: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/7.jpg)
Bacteriële naamgeving: ….. aanpassend aan nieuwe kennis door de tijdStreptococcus adjacens (Bouvet et al. 1989)
Abiotrophia adiacens (Kanamura et al. 1995)
Granulicatella adiacens (Collins et al. 2000)
16S rRNA gen sequentie vergelijk.
16S rRNA gen sequencing, cluster analyse met groter aantal stammen
![Page 8: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/8.jpg)
Erwinia herbicola
Enterobacter agglomerans (Beje et al., 1988)
Pantoea agglomerans (Gavini et al., 1989)
Erwinia milletiae Enterobacter agglomerans
= =
Ondanks de verschillende kenmerken gelegen aan isolatieplaats zijn ze allen hetzelfde species
Bacteriële naamgeving: ….. synoniemen & wijziging
Verwantschapsanalyse met genotypische technieken toont dat ze een aparte group zijn van de andere Enterobacters
![Page 9: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/9.jpg)
Bacteriële naamgeving: ….. evolutie binnen een genus
Klebsiella
K. granulomatisK. oxytocaK. pneumoniae
subsp. ozaenae subsp. pneumoniae subsp. rhinoscleromatis
K. trevisanii = K. planticola
K. ornithinolyticaK. terrigena
genus RaoultellaR. planticolaR. ornitholyticaR. terrigena
(nieuw heel recent species)
(species met vaste naamgeving) (synoniem)
splitsing genus (drie species in apart genus)
Klebsiella variicola
![Page 10: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/10.jpg)
Is nog een probleem 70 jaar oud gebruik >2500 serotypes, elke naam een species bv. S. typhimurium DNA-DNA hybridizatie : 5 (8) evolutionaire groepen in genus sterk verwant aan mekaar 1 species: choleraesuis > enterica. Choleraesuis echter ook serotype: verwarrend! Tendens: S. enterica (met 6 subspecies: salamae, houtenae, enterica, indica, arizonae, diarizonae) Of toch 2de species S. bongori?
Salmonella
![Page 11: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/11.jpg)
Serotypes als species: - S. enteritidis - S. serovar Enteritidis - S. ser. Enteritidis - S. Enteritidis - Serovar veranderen in serotype Verschillende instanties verschillende schrijfwijzen : S. enterica subsp enterica serovar Typhimurium
serotypes
![Page 12: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/12.jpg)
Meeste laboratoria werken met beperkt
gamma antisera meest voorkomende
groepen
bv. S. serogroep B, D…
Verdere uitwerking in referentielab
bv. Salmonella serotype Typhimurium
Laborapporten salmonella
![Page 13: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/13.jpg)
Plesiomonas van Vibrionaceae naar Enterobacteriaceae Citrobacter : diversus en koseri “subjectieve” synoniemen
Enterobacter of Pantoea agglomerans?
Klebsiella ornithinolytica, terrigena en planticola Raoultella Klebsiella pneumoniae subsp ozaenaeKlebsiella pneumoniae subsp rhinoscleromatisKlebsiella oxytoca Calymatobacterium granulomatis Klebsiella granulomatis
Enterobacteriaceae
![Page 14: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/14.jpg)
Moeilijk te differentiëren: Citrobacter freundii complex Enterobacter agglomerans complex Klebsiella pneumoniae complex
![Page 15: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/15.jpg)
S. aureus subsp aureus
anaerobius
S. hominis subsp novobiosepticus
hominis
S. cohnii subsp cohnii
urealyticus
S. saprophyticus subsp saprophyticus
bovis
S. schleiferi subsp schleiferi
coagulans
Staphylococcen
![Page 16: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/16.jpg)
S. sanguis en sanguinis
S. bovis en agallolyticus
S. milleri en S. anginosus groep
(anginosus, constellatus, intermedius)
Streptococcen
![Page 17: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/17.jpg)
Oude pseudomonas Burkholderia Stenotrophomonas
(ex-Xanthomonas) Comamonas Shewanella Ralstonia Methylobacterium Sphingomonas Acidovorax Brevundimonas Delftia Pandoraea
Nonfermenters
![Page 18: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/18.jpg)
Agrobacterium radiobacter Rhizobium Pseudomonas paucimobilis Sphingomonas Flavobacterium multivorum Sphingobacterium P. putrefaciens, Alteromonas, Achromobacter, Ib Shewanella Weeksella zoohelmcum Bergeyella zoohelcum Flavobacterium odoratum Myroides odoratus Odoratimimus Comamonas acidovorans Delftia acidovorans
Naamwijzigingen
![Page 19: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/19.jpg)
Current classification of selected Pseudomonas rRNA homology group II to V organisms which have been recovered from humans
II Pseudomonas cepacia Burkholderia cepacia complex
genomovar I: B. cepaciagenomovar II: B. multivoransgenomovar III (unnamed
species)genomovar IV: B. statutegenomovar V: B.
vietnamiensisgenomovar VI (unnamed
species)genomovar VII: B. ambifaria genomovar VIII: B. anthinagenomovar IX: B. pyrrocinia
Pseudomonas gladioli Burkholderia gladioliPseudomonas cocovenenans Burkholderia gladioliPseudomonas mallei Burkholderia malleiPseudomonas pseudomallei Burkholderia
pseudomalleiBurkholderia thailandensis
Pseudomonas Former species Current species rRNA homology designation designation group
![Page 20: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/20.jpg)
Current classification of selected Pseudomonas rRNA homology group II to V organisms which have been recovered from humans
II Pseudomonas
(Burkholderia) pickettii Ralstonia pickettiiPseudomonas pickettii biovar 3/'thomasii’ Ralstonia mannitolilytica
III Pseudomonas (Comamonas) acidovorans Delftia acidovorans Pseudomonas testosteroni Comamonas
testosteroni Pseudomonas delafieldii Acidovorax delafieldii Pseudomonas facilis Acidovorax facilis
IV Pseudomonas diminuta Brevundimonas diminuta Pseudomonas vesicularis Brevundimonas
vesicularis
V Pseudomonas (Xanthomonas) Stenotrophomonas maltophilia
maltophilia Stenotraphomonas africana
Pseudomonas Former species Current species rRNA homology designation designation group
![Page 21: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/21.jpg)
Vd-3: Rhizobium radiobacter IIk-1: Sphingomonas paucimobilis IVd: Peudomonas-like groep 2 EF-1: Herbaspirillum species 3 IIk-2: Sphingobacterium
multivorum
Letters en cijfers
Ib: Shewanella IIj: Bergeyella zoohelmcum M4: Oligella urethralis IVe: Oligella ureolytica Vd 1 en 2 : Ochrobactrum
![Page 22: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/22.jpg)
Chlamydia pneumoniae en psittaci Chlamydophila Ehrlichia phagocytophila Anaplasma phagocytophilum Rickettsia tsutsugamushi Orientia Anaërobe Gram-negatieve staven: Prevotella, Porphyromonas Bacteroides forcythus Tannerella
forcythensis Fusobacterium alocis Filifactor alocis Fusobacterium sulci Eubacterium sulci Anaërobe Gram-positieve : strepto: Finegoldia Atopobium Staven: Eubacterium Colinsella Actinomyces pyogenes Arcanobacterium
Naamveranderingen
![Page 23: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/23.jpg)
(DF-1) : Capnocytophaga ochracea (DF-2) : Capnocytophaga canimorsus Kingella indologenes: Sutonella Tropheryma whippelii T. whipplei Pasteurella haemolytica Mannheimia Nutrioneel variant streptococcen: Abiotrophia defectiva Adiacens en elegans Granulicatella Stomatococcus mucilaginosus : Rothia mucilaginosa
Andere
![Page 24: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/24.jpg)
Identificatie: Benefiet voor labo en/of ZH Steun van instelling Sneller resultaat en beter voor patiënt Gegevens om op te beslissen Welk type financiering
Aankoop toestellen
![Page 25: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/25.jpg)
Niet te vroeg kopen : kinderziekten Wachten op publicaties peer reviewed journals ID en AB OK Duur test Kostprijs kwaliteitscontrole inbegrepen Houdbaarheid, stockageplaats, leveringsmodaliteiten Epidemiologische programma’s Link apotheek, andere Rapporten OK Accurate resultaten
Toestellen technisch
![Page 26: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/26.jpg)
Koppelbaar aan lab-computer, uni-, bi-directioneel Service 24/24 365/365 Uitbreidbaar Oefentijd Service contract en prijs Benodigdheden: tafel, stopcontacten Updates software kosteloos
Toestellen fabrikant
![Page 27: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/27.jpg)
Gaan kijken bij gebruikers Combinatie identificatie en AB Wat niet in software zit kan er niet uitkomen
Citrobacter braakii missen in database is gering probleem > sakazakii Snel antwoorden = vaak forceren bv. inoculum dikker Nog steeds problemen
Toestellen advies
Database entries of the Enterobacteriaceae (human isolates/ (Continued)
Vitek MicroScan
Organism API20E, BBL IDS RaplD GNI, GNI+, version 4.0 Crystal onE, version version version version 4.0 1.93 R8.03 R8.03
Enterobacter agglomerans group X X X X X (six spp.) X
Enterobacter amnigenus group 1 X X X X X X (groups 1 X X X (1 and X
and 2) 2)
Enterobacter amnigenus group 2 X X X X X X (groups 1 X X X (1 and X
and 2) 2)
Enterobacter asburiae X X X X X X X X X X X (E. cloacae)
ID-GNB, version R02.03
ID 32E, version
1.0
MIDI, version 4
Conventional, version 22.28
Biolog," version
6.01
Rapid, version 22.28
![Page 28: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/28.jpg)
Vergelijkingspunt bv. NCCLS met kwaliteitscontrole
stammen, stammen met gekende R-mechanismen, reeks
stammen in spectrum van AB
Aanvaardbaar: categorie overeenkomst > 89.9%
Major verschil >=3% op de gevoelige
stammen
Very major verschil: als een functie
van het totaal aantal resistente MO getest
<=7.5% en 1.5% met 95% confidentie
limiet
<10% van elk genus getest
Wat niet kan gehaald worden moet
door de fabrikant op de bijsluiter worden vermeld met
aanraden van andere methode
Toestellen aanvaardbare werking
![Page 29: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/29.jpg)
Mechanisch betrouwbaar Accreditering standaardisatie inoculum Automatisatie Vermijden overschrijffouten Cumulatieve AB resultaten Link met voorschrift AB snelle check Expert software mogelijk Toch steeds door microbioloog verifiëren
Toestellen Voordelen
![Page 30: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/30.jpg)
Geen echte volledige automatisatie Manueel inoculum Hardware duur, duurder dan manuele testen Onderhoudscontract 1 producent, weinig flexibiliteit, andere systemen in stand te houden vermits niet goed voor alle MO bv pneumococcen toestellen steeds in evolutie eigen performantie moeilijk na te gaan
Toestellen Nadelen
![Page 31: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/31.jpg)
Enterococcen: vanB en high level genta en
strepto geven problemen
Staphylo: oxa-R te veel of te weinig
Aztreo valselijk R proteus en morganella
Valse carbapenem R
Toestellen: enkele voorbeelden
![Page 32: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/32.jpg)
![Page 33: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/33.jpg)
![Page 34: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/34.jpg)
FDA-approved molecular diagnostic tests for infectious diseases
Test Method/manufacturer
C. trochomatis detection Hybridization/Gen-Probe; LCR/Abbott;PCR/Roche;
Hybrid capture/Digene;SDA/Becton Dickinson
N. gonorrhoeae detection Hybridization/Gen-Probe; LCR/Abbott; SDA/Becton Dickinson; Hybrid capture/ Digene
C. trachomatis and N. gonarrhoeae
multiplex PCR/Roche; TMA/Gen-Probe
Culture confirmation for Mycobacterium spp Hybridization/Gen-Probe
Culture confirmation for fungi and bacteria“ Hybridization/Gen-Probe
Detection of group A streptococcus Hybridization/Gen-Probe
HCV detection RT-PCR/Roche
Methicillin-resistant S. aureus detection Cycling probe technology/ID Biomedical
HIV quantitation (standard or ultrasensitive) RT-PCR/Roche; NASBA/bioMerieux
HIV resistance genotyping CLIP sequencing/Visible Genetics
HPV detection Hybrid capture/Digene
M. tuberculosis detection TMA/Gen-Probe; PCR/Roche
Gardnerella, Trichomonas, and Candida detection Hybridization/Becton Dickinson
CMV detection Hybrid capture/Digene; NASBA/bioMerieuxa Fungi include B. dermatitidis, C. immitis, Cryptococcus neoformans, and H. capsulatum. Bacteria include Campylobacter spp., Enterococcus spp., group A streptococcus, group B streptococcus, H. influenzae, N. gonorrhoeae, S. pneumoniae, S. aureus, and L. monocytogenes.
![Page 35: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/35.jpg)
Bioterrorisme: Y. pestis
B. anthracis
B. mallei
B. pseudomallei
referentielabo
niet bespreken
Laatste wijzigingen antibiogram volgens Nccls
![Page 36: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/36.jpg)
Niet bespreken ---- op te vragen:
Table 2 I: Vibrio cholerae
Table 3 B: Reference Guide to QC Testing
frequency
Table 7: Listeria spp. en N. meningitidis
referentielabo
Listeria ampi<= 2 µg/mL = S
Table 8: check identificatie -> antibiogram bv. S.
maltophilia imipenem-S, cotrim-R
![Page 37: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/37.jpg)
Tentatief voor 1 jaar
Telithromycine toegevoegd in aantal tabellen
Rifampine -> G+: niet in monotherapie
LV: niet rapporteren want niet keuze-preparaat
Perorale producten
1ste en 2de generatie cefalo (uitz. Cefur
sodium)
clinda
macroliden
tetracyclines
FQ
Algemene opmerkingen
![Page 38: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/38.jpg)
Salmonella, Shigella: niet rapporteren: aminoglycosiden
Salmonella: : 1ste en 2de gen.
Cefalo
Extra-intestinale
isolaten:
nalidixine-R
= klinisch
Falen FQ
Meer commentaren naar clinicus: bv. P. aeruginosa en
neutropenie of ernstige infectie
Max. dosis AP-PEN of CAZ + aminoglycoside
Waarschuwingen
![Page 39: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/39.jpg)
Salmonella … (disk en dilutie)
Probleem van ESBL: - E. coli
- K. pneumoniae
- K. oxytoca
- Voor andere MO niet
gevalideerde
methode ESBL
cefepime
Enterobacteriaceae
![Page 40: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/40.jpg)
![Page 41: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/41.jpg)
![Page 42: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/42.jpg)
![Page 43: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/43.jpg)
![Page 44: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/44.jpg)
![Page 45: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/45.jpg)
![Page 46: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/46.jpg)
![Page 47: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/47.jpg)
P. aeruginosa en Acinetobacter spp.
+ B. cepacia: cefta, mero, mino 20-24u incubatie ipv 16-18u
+ S. maltophilia: mino, levo, cotrim
Andere: dilutiemethode
Cefta: R I S
P. aeruginosa <= 14mm 15-17 >=18
B. cepacia <=17 18-20 >=21
Mero
P. aeruginosa <=13 14-15 >=16
B. cepacia <=15 16-19 >=20
Nonfermenters: disk diffusie
![Page 48: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/48.jpg)
Telithromycine: R I S <=18 19-21 >=22 waarschuwen: oxa-R SA en CNS: alle bètalactam inactief R I SOxa SA <=10 11-12 >=13 MIC <=2->=4 CNS <=17 >=18 0.25-0.5 Oxa-S: bètalactam rapporteren zoals bekomen Cefoxitine 30µg disk: gewone aflezing: R I S <=14 15-17 >=18 predictie mecA: <=19 SA >=20 incub 24u <=24 CNS >=25
Stafylococcen
![Page 49: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/49.jpg)
Macroliden: SA en CNS constitutief MLSB
Induceerbaar
Efflux: M
Nog geen QC stammen beschikbaar
Stafylococcen
op bloedagar
clinda wsch R
15-26mmCLINDA
ERYTHRO
clinda erythro 2µg 15µg
![Page 50: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/50.jpg)
MIC >= 4 µg/mL: stam doorsturen naar ref labo
OXA > CNS: S. epidermidis : afleescriteria en
mec A correleren
goed
S. lugdunensis, S. saprophyticus: te veel
R:
MIC 0.5 à 2µg/mL mec A en PBP2a
bepalen : indien
negatief
= Oxa-S
andere
bètalactams
volgens afleescriteria
MIC >= 4µg/mL met mecA of PBP2a negatief
= OXA-R
Stafylococcen
![Page 51: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/51.jpg)
Voorspelbaar: E. faecalis ampi-S = imi-S
Waarschuwing:
Cefalo’s, amino (tenzij HLR) clinda, cotrim: niet
rapporteren.
In vitro-S, in vivo-R
(peni of ampi) + amino meestal nodig voor
ernstige infecties zoals endocarditis
vanco voor ernstige infecties + amino meestal
aangewezen
Enterococcen
![Page 52: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/52.jpg)
Telithromycine R I
S
<=15 16-18
>=19
ter herinnering: oxa 1 <= 19 : meer MIC bepalingen
uitvoeren
MIC: amox, amox-clav: enkel non-meningitis
criteria
Cefotax – ceftriax- cefepime: 2
afleescriteria!!!: non-
meningitis
en meningitis
Pneumococcen
![Page 53: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/53.jpg)
Geen wijzigingen
Bèta grote kolonies A, C, G en B en bèta kleine
kolonies (anginosus – ex-milleri): verschillende
afleescriteria!!!
Bèta kleine zie S. viridans
S. viridans: geen afleescriteria in diameters: MIC
doen
Herhaling: identificatie noodzakelijk voor juiste
AB techniek of aflezing
Andere Streptococcen
![Page 54: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/54.jpg)
QC stam voor amox-clav: E. coli ATCC 35218
Telithromycine R I
S
<= 11 12-14
>=15
Haemophilus spp
![Page 55: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/55.jpg)
Members of the family Enterobacteriaceae with expected resistance to
commonly tested antimicrobial agents
Organism(s) Antimicrobial
agent(s) to which
resistance is
expected
Citrobacter, Enterobacter , Klebsiella, Morganella,
Providencia, Proteus vulgaris, Proteus penneri,
Serratia,Yersinia Ampicillin
Citrobacter freundii, Enterobacter, Morganella,
P. vulgaris, P. penneri, Providencia, Serratia, Yersinia Cefazolin,
cephalothin
Klebsiella Ticarcillin
C. freundii, Enterobacter, Serratia Cefbxitin,
cefotetan
C. freundii, Enterobacter, P. vulgaris, Serratia Cefuroxime
'Citrobacter, Enterobacter, Serratia Amoxicillin-
clavulanic acid, ampicillin-
sulbactam
Artificiele Intelligentie
![Page 56: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/56.jpg)
Susceptibility test results that may indicate cross-resistance to other antimicrobial agents Antimicrobial agents
Organism Primary resistance Associated resistanceStaphylococcus Oxacillin Methicillin, cloxacillin, dicloxacillin,
nafcillin, other penicillins, -lactam--lactamase inhibitor combinations, cephems and carbapenems
Gentamicin Other aminoglycosides Penicillin (j3-lactamase positive) Ampicillin, amoxicillin,
azlocillin, carbenicillin, mezlocillin, piperacillin, ticarcillin
Erythromycin Azithromycin, clarithromycin Ciprofloxacin Ofloxacin, levofloxacin
Members of the family Enterobacteriaceae, Gentamicin Tobramycin Pseudomonas aeruginosa Amikacin Gentamicin, tobramycin
Ciprofloxacin Ofloxacin, levofloxacin
Klebsiella spp., Escherichia coli Ceftazidime Cefotaxime, ceftriaxone, ceftizoxime,
aztreonam Cefotaxime Ceftazidime, ceftriaxone, ceftizoxime,
aztreonamEnterococcus spp. High levels of gentamicin High levels of tobramycin, high levels
of amikacin
![Page 57: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/57.jpg)
![Page 58: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/58.jpg)
![Page 59: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/59.jpg)
Oud probleem: cefur sodium > axetil Telithromycine R I S Stafylo <= 18 19-21 >=22 Haemophilus <= 11 12-14 >=15 Pneumo <=15 16-18 >= 19 3x verschillend medium 3x verschillende QC stammen en verschillende limieten
Van theorie naar praktijk (1)
![Page 60: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/60.jpg)
Zelfde QC stam
Verschillende voedingsbodems
Verschillende limietwaarden Bv. E.coli ATCC en amox/clav: MH: 4/2 16/8 HTM 16/2 64/2 Amox: >= 256 Kan plasmide verliezen
Van theorie naar praktijk (2)
![Page 61: Microbiologie wie ziet nog klaar? Prof.dr. G. Verschraegen UZ Gent](https://reader036.vdocuments.net/reader036/viewer/2022081502/5551a0f04979591f3c8bba1b/html5/thumbnails/61.jpg)
Zeer complex Hoe complexer hoe meer kans op fouten Zonder juiste identificatie geen juiste gevoeligheidsbepaling Hoe meer belang de identificatie krijgt hoe langer vooraleer antibiogram Het bos en de bomen En wat met accreditering
Eindbeschouwingen