mis on sünteetiline bioloogia? - ut · geneetiline kood esimene genoom järjestatud (fx174) pcr...
TRANSCRIPT
![Page 1: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/1.jpg)
![Page 2: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/2.jpg)
Mis on sünteetiline bioloogia?Mart Loog
Tehnoloogiainstituut
![Page 3: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/3.jpg)
![Page 4: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/7.jpg)
![Page 8: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/10.jpg)
![Page 11: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/11.jpg)
![Page 12: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/12.jpg)
Looduse ümberprogrammeerimineReprogramming Life
![Page 13: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/13.jpg)
Sekvenaator
![Page 14: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/14.jpg)
Süntesaator
![Page 15: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/15.jpg)
![Page 16: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/16.jpg)
![Page 17: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/17.jpg)
AlusedDNA sekveneerimise võimekuse kasv ja hinna langus (viimased 15 aastat)
DNA sünteesi hinna langus (viimased 5 aastat)
Süsteemibioloogia esiletõus (ca viimased 15 aastat)
Insener-disaini rakendamine sünteetiliste biomolekulaarsete süsteemide loomine (viimased 14 aastat)
![Page 18: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/18.jpg)
Vaade ajalukku
1953 1958 1966 1980 1983 2001 2014 2016
DNA kaksikheeliksi struktuur:
James D WatsonFrancis Crick
Semikonservatiivne replikatsioon
Geneetiline kood
Esimene genoom
Järjestatud (FX174)
PCR
(CRISPR)–Cas9 genome editing
Human genome project -READ
Human genome project -WRITE
![Page 19: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/19.jpg)
![Page 20: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/21.jpg)
The goal is to launch HGP-write in 2016 with $100 million in committed support, from public, private, philanthropic, industry, and academic sources from around the world.
By focusing on building the 3 Gb of human DNA, HGP-write would push current conceptual and technical limits by orders of magnitude and deliver important scientific advances.
![Page 22: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/22.jpg)
2026
DNA sekveneerimise ja sünteesi hind langeb hingematva kiirusega
![Page 23: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/23.jpg)
Sünteetiline pärm
![Page 24: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/24.jpg)
‘Build-a-genome’ kursusJohns Hopkins University.Esimene täielikult sünteetiline pärmi kromosoom (2014)
![Page 25: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/25.jpg)
![Page 26: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/26.jpg)
Bioloogiliste süsteemide disain on ...
aeglane süsteemid ülikeerulised
puuduvad standardid
![Page 27: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/27.jpg)
Bioloogilised süsteemid on suured ja keerulised.
![Page 28: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/28.jpg)
Modulaarsus ja standardid
![Page 29: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/29.jpg)
![Page 30: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/30.jpg)
Sünteetilise bioloogia esimene artikkel
![Page 31: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/31.jpg)
A generalized repressilator model
Strelkowa N , and Barahona M J. R. Soc.
Interface 2010;7:1071-1082
![Page 32: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/32.jpg)
Elowitz & Liebler (2000) Nature, 403:335
Sünteetilise bioloogia esimene artikkel
![Page 33: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/33.jpg)
Repressilation in living bacteria. a, b, The growth and timecourse of GFPexpression for a single cell of E. coli host strain MC4100 containing the repressilatorplasmids (Fig. 1a). Snapshots of a growing microcolony were taken periodically both in¯uorescence (a) and bright-®eld (b). c, The pictures in a and b correspond to peaks andtroughs in the timecourse of GFP ¯uorescence density of the selected cell. Scale bar,4 mm. Bars at the bottom of c indicate the timing of septation events, as estimated frombright-®eld images.
![Page 34: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/34.jpg)
Rakk kui arvuti (biocomputing)
![Page 35: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/35.jpg)
Toolbox for integrated circuits
Kinase Input 2
Kinase Input 3
Output 2
Kinase n
Kinase Input 1
Output 1
![Page 36: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/36.jpg)
Loogilised võrgud
![Page 37: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/37.jpg)
Loogilised võrgud
![Page 38: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/38.jpg)
4-input AND gate
Suurim takistus bioloogiliste süsteemide disainil: võrgustike erinevad tasandid kipuvad üksteisega interakteeruma ja signaale lekitama. Et seda vältida kasutasid autorid suunatud evolutsiooni.
Tae Seok Moon et al. (2012) Nature DOI: 10.1038
![Page 39: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/39.jpg)
Analoogarvutus elusrakkudes
Daniel et al. (2013) Nature, 497:619
![Page 40: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/40.jpg)
Rakuvabrikud
![Page 41: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/41.jpg)
![Page 42: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/42.jpg)
05.11.14 Arengufond
Biotöötlus - taimsete rakukultuuride ja/või vetikate kasutamine erinevate ainete biosünteesiks
Lindberg & Ratcliffe
Synthetic plant biology:
the roots of a bio-based society
Current Opinion in Biotechnology 2014
![Page 43: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/43.jpg)
Artemisia annua biosünteetilisi ensüüme kodeerivad geenid viidi pärmi genoomi
25 g/L
![Page 44: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/44.jpg)
Amyris ja Artemisiniini luguEsimene sünteetilise bioloogia firma:
Amyris, Emeryville, California, asutatud 2003
2005 - 42.6 miljonit $ Melinda ja Bill Gates’i fondist malaariaravimi tootmiseks pärmist
IPO 2010
![Page 45: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/45.jpg)
Solazyme: ümberprogrammeeritud vetikad, mis toodavad palmiõli
![Page 46: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/46.jpg)
SB ja meditsiin
![Page 47: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/47.jpg)
Precision Tumor Recognition by T Cells WithCombinatorial Antigen-Sensing Circuits
![Page 48: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/48.jpg)
Programmeeritud bakterid, mis tapavad vähirakke
Vähirakkude hävitamine atsetüülsalitsüülhappe (Aspiriini)abil.
Programmeeritud süsteem, mis koordineerib bakteri-populatsiooni tungimistvähirakkudesse.
CD - cytosine deaminase
![Page 49: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/49.jpg)
![Page 50: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/50.jpg)
![Page 51: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/51.jpg)
![Page 52: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/52.jpg)
![Page 53: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/53.jpg)
Elusad fotod ja amööbide võidujooksud
![Page 54: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/54.jpg)
Renicke et al. (2013) Chemistry & Biology 20, 619
![Page 55: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/55.jpg)
Sünteetiline bioloogia kui võimalus Eestile?
![Page 56: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/56.jpg)
![Page 57: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/57.jpg)
![Page 58: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/58.jpg)
![Page 59: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/59.jpg)
![Page 60: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/60.jpg)
![Page 62: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/62.jpg)
![Page 63: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/63.jpg)
We are starting a new metabolic engineering project in cooperation with
Competence Centre for Food and Fermentation Technologies led by Raivo Vilu.
The goal of the project is to engineer Lactococcus lactis to be a better workhorse
in milk fermentation.
• belongs to lactic acid bacteria
• ferments milk, makes yoghurt, sour
milk etc
• produces lactic acid as a metabolic
end-product
• generally recognised as safe (GRAS)
status
Tanel Tenson ja Arvi Jõers: sünteetiline bioloogia bakteris
![Page 64: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/64.jpg)
64 www.icosagen.com
Tartu, Estonia, 4pm-9am
IcoPark since 2014
Imetaja rakud: Mart Ustavi grupp ja Icosagen
![Page 65: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/65.jpg)
65 www.icosagen.com
Conventional plasmidpQMCF plasmid
QMCF Technology
DNA/nuclear compartment
binding protein
![Page 66: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/66.jpg)
![Page 67: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/67.jpg)
![Page 68: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/68.jpg)
![Page 69: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/69.jpg)
![Page 70: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/70.jpg)
![Page 71: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/71.jpg)
Valkude multi-fosforüülimisel põhinevad signaaliprotsessorid biomolekulaarsetes süsteemides
Kõivomägi et al. (2013) Nat. Str. Biol
![Page 72: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/72.jpg)
(S/T)P
Valgu stabiilsus
Lokalisatsioon
Valk-valk interaktsioonid
P PP
PP P
Proteiinkinaas Cdk reguleerib raku pooldumistC valkude multi-fosforüülimise kaudu
![Page 73: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/73.jpg)
Multifosforüülimise kood
![Page 74: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/74.jpg)
QuipuFosforüülimine on nagu Kipu
P
P
P
P
P
P
P
PP
P
P
P
P
P
P
P
P
P
…kuidas on muster kirjutatud ja kuidas seda dekodeerida?
![Page 75: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/75.jpg)
P
Phospho adaptor
P
PPP PP
OH
OH
OH OH
P
Kinase 2
Kinase 1
Kinase 2Phospho adaptor
OH OHDocking
Conformational phospho-switch module
Secondary input module
Docking
Docking
Primary input module
OH
Sünteetilised multifosforüülimise moodulid
![Page 76: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/76.jpg)
NAND
Input1 Input2 Output
0 0 1
1 0 1
0 1 1
1 1 0
AND
Input1 Input2 Output
0 0 0
1 0 0
0 1 0
1 1 1
OR
Input1 Input2 Output
0 0 0
1 0 1
0 1 1
1 1 1
Logic gates
![Page 77: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/77.jpg)
Logic gates
XNOR
Input1 Input2 Output
0 0 1
1 0 0
0 1 0
1 1 1
NOR
Input1 Input2 Output
0 0 1
1 0 0
0 1 0
1 1 0
XOR
Input1 Input2 Output
0 0 0
1 0 1
0 1 1
1 1 0
![Page 78: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/78.jpg)
Müra filter (persistence detector) (A), pulsi generaator (B), adaptatsiooni moodul (C).
![Page 79: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/79.jpg)
Tulevik
![Page 80: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/80.jpg)
Helendavad taimed
![Page 81: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/81.jpg)
Elusad ehitusmaterjalid
![Page 82: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/82.jpg)
Elusad ehitusmaterjalid
![Page 83: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/83.jpg)
![Page 84: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/84.jpg)
Sünteetiline elu Marsil
![Page 85: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/85.jpg)
Sünteetiline elu Marsil
![Page 86: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/86.jpg)
Sünteetiline elu Marsil
![Page 87: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/87.jpg)
Combined Liver & Kidney Function
![Page 88: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/88.jpg)
Combined Liver & Kidney Function
![Page 89: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/89.jpg)
Combined Liver & Kidney Function = Kliver
![Page 90: Mis on sünteetiline bioloogia? - ut · Geneetiline kood Esimene genoom Järjestatud (FX174) PCR (CRISPR)–Cas9 genome editing Human genome project -READ Human genome project -WRITE](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041610/5e36f60aefab3e70b44acbfa/html5/thumbnails/90.jpg)
As the branches of the tree of life, and of hominids, continue to grow and spread, many of our grandchildren will likely engineer themselves into what we would consider a new species, one with extraordinary capabilities, a Homo evolutis.
Juan Enriquez, a well-respected futurist