nleaders teamnleaders.org/.../07-notes-for-dr-anas-lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · lecture...

14
Nleaders Team Microbiology Notes for Dr.Anas Lectures [ 19 + 20 ] Smile ^_^ its Sunah 6/30/19 You can find this file in www.nleaders.org

Upload: others

Post on 24-Sep-2020

2 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Nleaders Team Microbiology Notes for Dr.Anas Lectures [ 19 + 20 ]

Smile ^_^ its Sunah 6/30/19 You can find this file in www.nleaders.org

Page 2: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Lecture 19 /Micro

( (a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rodsرح نحكي عن بهاي المحاضرة •

والباثو جين الي بهاي المحاضرة كثير مهمين : in different environmentsوبكونو curvedانهم بكونو بميزهم •

❖ Campylobacter

• gram negative rods وأهمpathogen بهاي المجموعة هوCampylobacter jejuni الي بميزهم انهم

microaerophilic بدهم نسبة معينة من يعنيO2 لهيك بتالقيهم داخل لحتى يعيشوtube بمنطقة فيها نسبة محددة من

%.10-5االكسجين

infectionالبكتيريا وهي داخلة وبتساهم بتقليل بقتلو barrierهم جزء من gastric acid انه innateزي ما حكينا ب •

• Jejune is most common cause of bacterial gastro interites

microbiological findings among USبحكي انه paperنيجي للجدول الموجود بالساليد وهو مأخوذ من •

emergency departments patients oresenting with 549 episodes of bloody diarrhea at

11 emergency ID NET sites

القو انه معهم مجموعة من البكتيريا ومنهم blkody diarrheaيعني انه شافو مجموعة من الناس بيجو عالطوارئ ومعهم •

Campylobacter

Shiga toxin escherichia coliبنسميه bloody diarrheaبرضو بعمل E. Coliفي عنا نوع من انواع •

. )STEC( اما باقي انواعE. Coli بتعملwatery diarrhea

• Campylobacter is zoonotic infection ( يعني الحيوانات الي بتنقله مثل الدواجن الملوثةcontaminated polurty )

أو غير المطبوخة بشكل جيد.

يعني بالعادة ما بتنتقل عبر الغذاء المعالج uncommon transmitted by foot handlerهاي البكتيريا أيضاً •

كمية كبيرة من البكتيريا لتعمل المرض وهالكمية الكبيرة مش موجودة ب يعني بدها high inoculumوكمان هالبكتيريا بتكون •

food handlers.

من اعراضها بيجي بحكيلك المريض عندي حرارة ووجع بالبطن واسهال و الخخ. موجودين بالساليد •

.��الحظو انو لسا بنحكي عن نوع واحد من البكتيريا هللا يحرقها شو عليها حكي •

بعد ما antibodiesناتجة انه بضل Campylobacter jejuniب infectionالهم عالقة بعد syndrome 2عنا •

الي هم syndrome ٢وح المرض بتهاجم الجسم بالغلط يعني تقريبا هاد الي بصير ومن هاي المضاعفات بنتج عنا ال ير

guillain-barre syndrome and reactive arthritis وبكونوuncommon بس بنزبد نسبتها لما ما نعالج

الحالة بسرعة.

❖ Helicobacter

الي بميزها spiralGram negative rods andالي حكينا عنها بأول المحاضرة بكونو هاد النوع الثاني من البكتيريا •

عدة شغالت منها : بسبب Acidityانه ممكن تقعد بالمعدة مع انه عليها

neutralizتعمل ب ammoniaوبنتج ureaالي بعمل على تكسير urease productionحركتها اللولبية إضافة الى •

to the gastric acid وهيك بتخفacidity بعدين هالبكتيريا بتفوت على المعدةmucus layer وبتعمل

environment خاصة فيها وبصاحب هالتغيير بenvironment المعدة افرازwhich destroys : mucunase

mucus.

من mucusوإلنهم دمرو epithelial lining of intestineبتأذي Cytokinesوبنفس الوقت كمان هالبكتيريا بتفرز •

الخاصة فيها، بعدين الخاليا فيها المعدة اصال بتصير تأذي نفسها إلنه بطل في طبقة تحميها من الحموضة mucunaseخالل

.inflammationبتبلش تموت وبصير في عنا عملية

Page 3: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

وهسا inflammationالي حكينا عنه فوق هو اول مرحلة بتصير لما تفوت هالبكتيريا للمعدة وبتنتهي هالمرحلة بحدوث •

بنيجي للمرحلة الثانية الي بصير فيها عدة شغالت منها :

وضل موجود هاالشي وبصير عنا غثيان وحرقة واذا ما تعالج gastritisبصير عنا inflammationبعد ما تعمل هالبكتيريا •

يعني ulcer in gastric or duodenalرح يعمللي continues inflammation in the intestineيعني

.peptic ulcerهالبكتيريا هي سبب ب

بأي محل بزيذ نسبة حدوث السرطان عندي إلنه بكون chronic inflammationهسا في مالحطة الزم نعرفها انه اي •

وهيك بتزيد نسبة الخاليا السرطانية انها تطلع. homeostasisوخرب environmentهالمكان تغيرت ليه

• Mental break زمان كانو اخواننا مفكرين انه مش البكتيريا الي بتعمل :peptic ulcer لحد ما اجى طبيب ناسي اسمه

يعني عمل proth of bacteriaلحد ما عمل atool cultureعمل ابحاث وأول تجارب عملها ما زبطت معه لصعوبة عمل

المهم لما شربها صارت معه اعراض القرحة واثبت بعد )��االخ زرع هالبكتيريا وعملها سائل وشربها )مفكرها ايس تي

.��هو البكتيريا واخذ جائزة نوبل هالطافي هاض peptic ulcerبعدة سنوات انه سبب هلتجربة

❖ Vibrio

وعندها وبتعمل مرض بنسميه الكوليرا Gram negative facultative anaerobic road shapedهاي البكتيريا هي •

polar flagella ألنهم بيجو على واحد من القطبين تبعونها، ومثل اغلب البكتيرياsusceptible to stomach acid يعني

نه بتتحسس كثير من حموضة المعدة وبتموت منها واذا دنصاب باالمراض الي بتعملها مثل الكوليرا الزم اخذ نسبة كبيرة منها إل

ولهيك بالعادة صعب تنتقل من شخص لشخص إلنه اذا وصلتك من شخص تاني Acidity of stomachاغلبها بموت من

هالبكتيريا رح تكون نسبتها قليلة وتموت بالمعدة لهيك بالعادة بتنتقل بمجتمعات كاملة اذا كانت المي اصال ملوثة فيها.

بحيرات والبحار وهيك يعني عند ال grow naturally in estuarine and marine environmentsطب وين موجودة ؟ •

. halophilic or salt loveوبتكون متعودة على بيئة المياه المالحة لهيك بسموها

.NaClبتحتاج لنموها •

هسا رح اشرحلكم الرسمة وهي بتحكي كيف بتوصل هالبكتيريا لجسمنا : •

بالبيئة الي هي موجودة فيها انت اول اشي بتكون •

• Persistence ودة هناك، بالبحر مثالً وبعدين بتعمل يعني هي بتكون موجfloating biofilm aggregates يعني بتتجمع مع

يعني جوا الصدفيات. shellfishوبصيرو يلفلفو بالبحيرة وممكن كمان هالبكتيريا نالقيها جوا يحميها biofilmبعض وبتعمل

لما ingest with vibrio choleraالمهم صارت البكتيريا موجودة بهالمي ، انت بتيجي بتشرب من مصدر هالمي الملوث •

( ، والي against gastric acid) الي حولها بحميها وبساعدها انها ما تموت من حموضة المعدة biofilmعجسمك تفوت

هسا رح نحكي عنها. عنيفة جداً diarrheaوبتعمل attach to intestine wallبضل منها وما بموت وبوصل بعمل

يعني الي بكون عندهم مياه شرب غير نظيفة او in communities with poor sanitationلهيك هالبكتيريا بنالقيها •

ملوثة وبالغالب بتكون بأماكن الحروب مثل اليمن والعراق النه بكونو صعب يوصلو لمي نظيفة.

الحل بانه نتخلص من هالوباء هو بتوفير مياه شرب غير ملوثة لنخفف من الحاالت. •

:choleraوالي هو هسا حنحكي عن المرض الي بتسببه هالبكتيريا •

• , electrolyte, minerals lossand ionssevere watery diarrhea with dehydration

وهاالشي بسبب انه يصير جفاف ووفاة النه فقد باالضافة للسوائل معادن وحديد. •

منها بتعمل وباء بتكون تعرضت لعوامل متعددةبتعمل وباء في انواع معينة choleraطبعاً مش كل انواع •

• vibrio cholera that cause epidemic بتكون اخذتvirulence factor such as cholera toxin or

chemotaxis protein وهاالشي بخليهاvery virulent .وبتعمل وباء

geneبعدي البكتيريا وبحط فيها Bacteriophageبيجي non-toxogenic v. Choleraيعني بكون عنا •

responsible for toxin وبتتحول لToxin v. Cholera خذناها قبل ب وهاي الطريقة اhorizontal gene

transfer and called trasnfusion .

Page 4: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

يعني متل كإنك خالط رز مع مي تقريبا ولهيك rice-white stoolsاالسهال الي بتسببه الكوليرا، بسبب شدته الكبيرة بسموه •

.dehydrationبموتو مرضى الكوليرا من

فيها المرض ؟طب هسا ليش هيك بصير او شو الطريقة الي بصير •

• V. Cholera بتفرزtoxin اسمهcholera toxin مكون من اشياء ما بتهمنا بس فيهSub units A and B متل ما

بتفوت جوا وبتعمل مشاكل مثل انه : Aبالجسم وبتمسكه و بترتبط Bشرحنا بالمحاضرات الي قبل

• Increaesd of cyclic AMP والزيادة بcAMP بتخلي Cl يطلع لبرا الخاليا وبلحقهNa ليعدل الوضع وبس يصير

وبصير عنده ions+waterوهيك واالنسان بصير يخسر ionsبرا بصير الماء يطلع وراه ومعه NaClعنا

dehydration +muscle cramps طب جفاف عرفنا ليش بصير عنده بس ليش بصير عنا وجع بالعضالت؟ إلنه ما في

electrolytes همين كثير بحركة العضالت، هاد تقريبا اهم اشي بصير باالضافة لعدد امراض. وهم م

❖ Bartonella

henselaebartonellaبصير من scartsh disease-catهاي البكتيريا شائعة بالمحالت الي بتربي بسس وبتعمل •

لى البسس تنتقل هلبكتيريا وهيك. بالتحديد وبتكون موجودة عند بعض البسس مش كلها وممكن من خالل القمل الي بكون ع

بالمكان الي blister/bumpالبسة ممكن تنقل هالبكتيريا للناس اذا كانت مش كيوت،. يعني اذا جرحتك او عضتك وبصير عنا •

. بتعضك فيه

��بس هيك بكفي عن هالبكتيريا ومش غلط تقرأو الي ضل.. •

❖ Rickettsiaceae

بتحمل كثير امراض معها ticksوحكينا lymeالقراد يعني ، الي بتسبب مرض tickحكينا بالمحاضرة الماضية عن •

بس بختلفو شوي بشكل fever, chills, aches, pain, rashواالمراض الي بتسببهم هاي الحشرة متشابهين باالعراض

الي من هاي البكتيريا بكون بشكل اخر. rashبس �� targetحكينا بتكون متل lymeالي بمرض rashهاالعراض مثالً

obligate intracellularالي بميزها انها بتكون ricketrsiaحكينا بحملو امراض ومنهت ticksالمهم هدول •

pathogen يعني الزم تكونin cytoplasm of eukaryotic cell فلما توصلtick وبالعادة بتضل اللك وتقرصك

كل ما طولت اكثر كل ما كانت نسبة انها تسبب المضاعفات عالية. جوا جسمك، و

��بس بنا هيك عن هالبكتيريا ومش غلط تقرأو الي ضل كمان مرة. •

❖ Neisseria

• Gram negative cocci

Neisseria gonorrhoeae and. Neisseria meningitidisالي هم بتعمل مرضين مهمين •

• Neisseria meningitidis يعتبر احدhealthy bacteria .بجسمنا

• and otherchocolate agar is fastidious and only grows on enriched N. Gonorrhoeae

supplemented media .

ن فيه؟ شو بكو chocolate agar، طب chocolate agarبدها مواد خاصة لتنمو لهيك بنحطهم على يعني هالبكتيريا •

المهم، ما بكون فيه شكالطة اكيدد هو إلنه لونه غامق بسموه ��هالمزحة من الدكتور مش مني ، ��شكالطة سويسرية طبعا

. blood cellsلتطلع مواد بنحتاجها موجودة داخل lysisبس سخنوه وعملوله blood agarهيك وبكون عبارة عن

, pathogrnبحتوي على dischargeوهو مرض السيالن وبصير فيه gonorrheaمرض وهو خلينا نحكي عن اول •

dead wbc, bacteria.. etc .

• Genital infections in urethra and vurtually all infected men have acute symptoms

• In women it's a symptomatic and in men symptomatic and the symptoms is purulent

discharge in site of genorrhea .

Page 5: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

هي السحايا الي بتغلف الدماغ Menengiسحايا ، نشرح شوي عنه،. وهو التهاب ال meningitidisالمرض التاني هو •

ومن البكتيريا الي بتعمل هالمرض هي والنخاع الشوكي فهدول الخاليا كثير مهمين واذا التهبو بكون مشكلة خطيرة

Neisseria meningitidis .

• The Neisseria meningitidis can be found in pharynx of healthy individuals

بأعداد nasopharynxممكن تبلش تتكاثر داخل pharynxبس اذا جهاز المناعة كان فيه خلل هالبكتيريا الموجودة ب •

يصير عنا immune systemوممكن اذا شغلت وبتوصل للدم bacteremiaوبتعمل كبيرة وبتصير تهاجم االنسجة

sepces or septicemia .

• Menengococcemia يعني فيMenengi coccus وبصير يبين على موجودة بالدمskin النها بتفوت عblood

vessle وبتعملhemmorage .

:يعني مراحل وصول البكتيريا للسحايا هي •

• Interaction with nasopharyngeal eepithelium > blood vessle > Cerebrospinal fluid

وبكون موجود بين االم الجافية والعنكبوتية. meningitidisه البكتيريا بتعمل التهاب السحايا اذا وصلت CSFطبعاً •

��، ليش السمكة بتخاف من الدينار؟ إلنه فيها مية قرش هاها خلينا نكمل اخر بكتيريا هساخدو هالنكتةتعتبو صح؟ وانا كمان •

❖ Pseudomonas

مش الزم كلها بتتعلق بإنه يصير عندك جهاز مناعة مش مزبوط أو وصلت لمحالت infectionهالبكتيريا بتعمل مجموعة من •

يعني انتهازية وبتستغل اي اشي لتعمل المرض والخطورة بالبكتيريا الي بتكون opportunistic وبسموهاتوصلها

opportunistic انه اغلبهم بكونوresistance to many antibiotic ًبتكون. لهيك خطيرة جدا

fruity odorوغير هيك الها pyocyaninاسمها معينة بتعطيها اللون االخضر diesبتطلع cultureالها صفات ب •

. يعني متل ريحة حلويات وفواكه وهيك

.فيها. cytochromic oxidaseيعني بكون موجود oxidase positiveهالبكتيريا بتطلع oxidaseبفحص •

innate barrier of skin is brokenإلنه الحروقالي بتعملها ؟ اهم اشي بتعمله هو عند مرضى infectionشو •

بكل سهولة وصعب تتعالج infectionوبتعمل Pseudomonasومن ضمنهم opportunistic pathogenوبتيجي

لكثير مضادات حيوية. resistanceإلنه بتكون متل ما حكينا

وبصير نفس الي صار بمرضى الحروق.. mucuaإلنه بتجمع عندهم cystic fibrosisممكن كمان عند مرضى •

إلنها حتستغل هاالصابة وتيجي. او اذا في إصابات بالعين او باالذن •

ممكن تنتقل الك / لما تروحو Pseudomonasلهيك اذا بتروح ع منتجع فيه بركة وكانت فيه الرطبةبتحب البيئات •

��.�🙂�وال ال يجماعة Pseudomonasشوفو اذا في عالمسابح اتطلعو منيح

��بعض االسئلة الي حكاها الدكتور بالمحاضرة للتفريغ الماضي إلني نسيت اكتبها

Actinomyces /nocardia/Lactobacillus /Propionibacteriumالخيارات :

/listeria/Corynebacterium

▪ PropionibacteriumAny of these involved in a disease acne valgares?

▪ Any of these part of normal vaginal flora? Lactobacillus

▪ Any of these common in infection with immune compromised or food borne?

Listeria

▪ Any of these is responsible for diphtheria? Corynebacterium

▪ Any of these is make chronic infection and sinus or fistula /and like a fungus ?

Actinomyces or Nocardia

Page 6: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن
Page 7: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 8: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 9: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 10: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 11: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 12: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 13: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner

Page 14: Nleaders Teamnleaders.org/.../07-Notes-for-Dr-Anas-Lectures-19-20-.pdf · 2019. 7. 20. · Lecture 19 Micro)a group of curved, aerobic microaerophilic gram negative rods) نع يكحن

Scanned by CamScanner