Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr · 2018-12-11 ·...
TRANSCRIPT
![Page 1: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/1.jpg)
Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR
Τομέας Φαρμακογνωσίας & Χημείας Φυσικών Προϊόντων, Τμήμα Φαρμακευτικής, Εθνικό &Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Μαρία-Ελένη ΓραφάκουΥποψήφια Διδάκτωρ
Επιβλέπουσα: Καθ. Ελένη Σκαλτσά
![Page 2: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/2.jpg)
ΦΑΡΜΑΚΟΝ + ΓΝΩΣΙΣ
ΘΕΩΡΗΤΙΚΟ ΜΕΡΟΣ
![Page 3: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/3.jpg)
✓Στόχος: χημική και φαρμακολογική μελέτη των φαρμακευτικών φυτών
✓Τα φαρμακευτικά φυτά αποτελούν είδη ευρείας εξάπλωσης, εμφανίζοντας πληθώρα εθνοφαρμακολογικών αναφορών και φυτοχημικών μελετών. Τα αντίστοιχα ενδημικά φυτικά είδη με στενή εξάπλωση παρουσιάζουν ερευνητικό ενδιαφέρον, καθώς αποτελούν δυνητικά σημαντικές πηγές νέων βιοδραστικών δευτερογενών μεταβολιτών.
Το Εργαστήριο Φαρμακογνωσίας & Χημείας Φυσικών Προϊόντων
✓ Ελλάδα: biodiversity spot
![Page 5: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/5.jpg)
Chemistry of Natural Products
SECONDARY METABOLITES
![Page 6: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/6.jpg)
• Το μεταβόλομα αποτελεί το σύνολο των μεταβολιτών (πρωτογενών και δευτερογενών) ενός βιολογικού συστήματος.
• Δύο μεγάλα πεδία απαντώνται στην έρευνα μικρών μορίων βιολογικής προέλευσης, η μεταβολομική και η χημεία φυσικών προϊόντων.
![Page 7: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/7.jpg)
Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy
Advanced analytical method for the identification &
characterization of biological small
molecules
![Page 8: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/8.jpg)
Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy
![Page 9: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/9.jpg)
Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy
Tα φάσματα NMR κάθε ένωσης είναι χαρακτηριστικά.
![Page 10: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/10.jpg)
The whole fractionation and final isolation procedure is continuously monitored by NMR:
✓ Extraction and fractionation is carried out by non-deuterated solvents
✓ The resultant solutions are dried under vacuum and subsequently re-
dissolved in deuterated solvent, specifically chloroform-d
Schripsema J., 2010. Phytochem. Anal., 21, 14-21.
![Page 11: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/11.jpg)
The whole fractionation and final isolation procedure is continuously monitored by NMR:
✓ Extraction and fractionation is carried out by non-deuterated solvents
✓ The resultant solutions are dried under vacuum and subsequently re-
dissolved in deuterated solvent, specifically chloroform-d
![Page 12: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/12.jpg)
The whole fractionation and final isolation procedure is continuously monitored by NMR:
✓ Extraction and fractionation is carried out by non-deuterated solvents
✓ The resultant solutions are dried under vacuum and subsequently re-
dissolved in deuterated solvent, specifically chloroform-d
![Page 13: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/13.jpg)
Project: NMR metabolomic strategy: Metabolites isolated from Calea jamaicensis
![Page 14: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/14.jpg)
Project: NMR metabolomic strategy: Metabolites isolated from Calea jamaicensis
Χρωμένια & Σεσκιτερπενικές Λακτόνες
✓isolation
✓structure elucidation
✓evaluation of the biological activities High activity in living systems
Strong pharmacological interest
Chadwick et al., 2013. Int. J. Mol. Sci.,14, 12780-12805Costa et al., 2016. Eur J Med Chem, 10;123:487-507
ΠΡΑΚΤΙΚΟ ΜΕΡΟΣ
![Page 15: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/15.jpg)
Amaral et al., 2017. J. Med. Plants Res., 11, 518-537.Wussow et al., 1985. Systematic Botany, 10, 241.
✓ Asteraceae family
✓ 125 spp.
✓ Τροπικές & υποτροπικές περιοχές της Αμερικής
✓ Χρήση στη λαϊκή θεραπευτική (skin infections, dermatitis, gastroenteritis & diarrhoia, diabetes, urinary problems, fever)
✓ C. jamaicensis ενδημικό από το Μεξικό έως την Κολομβία.
Το γένος Calea L. (Asteraceae)
![Page 16: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/16.jpg)
VLC (silica gel) cHex-EtOAc-Me2CO μείγματα
αυξημένης πολικότητας
Εκχύλιση της δρόγης (maceration): cyclohexane/ether/ methanol 1:1:1
Υγρό-υγρό εκχύλιση(EtOAc)
![Page 17: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/17.jpg)
NMR spectra of the terpenoid crude extract
and derived sub-fractions have given certain
evidence of compounds belonging to chromenes &
sesquiterpene lactones
CRUDE EXTRACT
![Page 18: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/18.jpg)
VLC (silica gel) cHex-EtOAc-Me2CO μείγματα
αυξημένης πολικότητας
Εκχύλιση της δρόγης (maceration): cyclohexane/ether/methanol 1:1:1
Υγρό-υγρό εκχύλιση (EtOAc)
![Page 19: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/19.jpg)
Kλάσμα Α
Kλάσμα ΒKλάσμα C
Kλάσμα D
Kλάσμα G
Kλάσμα F
Kλάσμα E
Kλάσμα HKλάσμα I
![Page 20: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/20.jpg)
Ten metabolites have been isolated so far
Further purificationRP18-HPLC, prep.TLC, CC and microscale CC (pipette) on silica gel
![Page 21: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/21.jpg)
Κλάσμα Β
![Page 22: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/22.jpg)
Κλάσμα Β
![Page 23: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/23.jpg)
Κλάσμα BM
![Page 24: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/24.jpg)
Κλάσμα C
![Page 25: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/25.jpg)
Κλάσμα CK
![Page 26: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/26.jpg)
Κλάσμα D
![Page 27: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/27.jpg)
Κλάσμα DK
![Page 28: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/28.jpg)
Centaurea spp.
C. papposa
![Page 29: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/29.jpg)
Crocus sativus L. (Iridaceae)
Christodoulou E, Grafakou ME, Skaltsa H, Kadoglou N,
Kostomitsopoulos N, Valsami G. JPP, accepted 18/11/2018.
![Page 30: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/30.jpg)
Euphorbia spp.
![Page 31: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022050205/5f5887c6baade8374605e67f/html5/thumbnails/31.jpg)
Natural Products Chemistry