OHRC Advisory Committee

“Research Report”

17 September 2012

David L. G. Noakes

Professor & Senior Scientist

OSU ‐ OHRC

Education and Outreach• Chinook Surrogate Workshop  ‐ OHRC (June 2012)

• Oregon STEM Web Meeting – 11 September 2012

• Otolith Research Workshop – 25 – 26 October 2012

• FW 473 Fish Ecology – Distance Education (online version)

• FW 573 Fish Ecology & Conservation – Distance Education (online)

• Student Poster – OCAMP, Oregon Coastal STEM

Recent Presentations

“Science Pub”, (HMSC), Toledo, Oregon  5 June 2012

Nanjing Agricultural University, 3 August 2012

ODFW Hatchery Managers, Big K Ranch,  16 August 2012 (Noakes, Putman)

“Apps for Salmon” ‐ Corvallis Science Pub – 10 September 2012

Research Funding 

•Lincoln County & Tillamook County – Coast STEM –Ruth McDonald ($210,000 per year; 2 years) ‐ awarded

•Noakes & Schreck – COE – Steelhead ($355,000 per year; 2 years +) ‐ awarded

•Noakes – Campbell Family Foundation – fish screens ($35,000 per year, 2 years) – pre‐proposal

•Noakes & Schreck – NSF – freshwater systems (pre‐proposal) ($300,000 per year; 3 years)

•Noakes – Moore Foundation (in progress)

Research Discussions• David Noakes, Kathleen Cole, Neil Thompson, Bruce Morrison –

“temperature, growth and sex of individual hatchery and wild steelhead smolts”

• David Noakes, Carl Schreck, Cam Sharpe, David Griffiths, Eric Billman, Ryan Couture – “Steelhead surrogates”

• David Noakes, Andy Dittman, Ryan Couture, Joseph O’Neil – “olfactory imprinting – steelhead embryos”

• Kathleen O’Malley, David Noakes, Ryan Couture – “coho mate selection”

• Alsea Anglers, Kathleen O’Malley, Bob Buckman, ODFW, David Noakes –“hatchery steelhead selection”

• Ben Clemens, David Noakes – “lamprey biology and conservation”

• Carl Schreck, Luis  Tort, David Noakes – “stress and fish biology”

• Desiree Tullos, Jason Dunham, David Noakes –” woody debris, log jams and fish behavior”

• David Noakes, Chuck Kimmel, Carl Schreck – “phenotypic plasticity”

Publications• Gao & Noakes. 2012. Chemical signatures of otoliths and application in fisheries. 

Environmental Biology of Fishes DOI: 10.1007/s10641‐012‐0076‐4. 

• Gao, Conrad, Bean & Noakes. 2012. Statistical analysis on otolith data of anadromous fishes. Environmental Biology of Fishes DOI: 10.1007/s10641‐012‐0072‐8.

• Noakes (Editor). 2012. Ecological interactions of hatchery and wild salmon. Environmental Biology of Fishes 94: 1 – 361.

• Leblanc, C. & Noakes, D. L. G. 2012. Visible elastomer implants for marking small Rainbow trout Oncorhynchus mykiss (Walbaum). North American Journal of Fisheries Management 32: 10.1080/02755947.2012.683234.

• Kristjánsson, B. K., Skúlason, S., Snorrason, S. S., Noakes & D. L. G. 2012. Fine‐scale parallel patterns in diversity of small benthic Arctic charr (Salvelinus alpinus) in relation to the ecology of lava/groundwater habitats. Ecology and Evolution 2: 1099 – 1112.

• McPhee, M., V., D. L. G. Noakes & F. W. Allendorf.  2012. Developmental rate: A unifying mechanism for sympatric divergence in postglacial fishes? Current Zoology 58 (1): 21 – 31.

“Salmon Migration”

D. Noakes & P. Klimley (co‐editors)

Special Issue of Environmental Biology of Fishes

OnLine First (December 2012)

http://science.calwater.ca.gov/stage/sci_news_0610_tags.html

“Threatened Fishes: Fish Conservation”

D. Noakes 

Special Issue of Environmental Biology of Fishes

OnLine First (April 2013)

http://www.springerlink.com/content/102877/?Content+Status=Accepted

“Otoliths: microstructure and microchemistry”

• Yongwen Gao & David Noakes (Co‐Editors)– Environmental Biology of Fishes

http://www.springerlink.com/content/102877/?Content+Status=Accepted

Awards and Recognition

• American Fisheries Society2012 Award of Excellence

• Gilbert Ichthyological SocietyPresident (2012 – 2014)

Research Conferences

Annual AFS Meeting

20 – 24 August 2012

St. Paul, Minnesota

Research Conferences

Presentations

Research Conferences Presentations

• Ecology, Ethology & Evolution of Fishes – University of Windsor – June 2012 (4 research papers)

• International Fish Biology Congress – Madison, Wisconsin – July 2012 (2 research papers)

• Gilbert Ichthyological Society, Oregon – September 2012 (3 oral papers)

• Northwest Fish Culture Conference – Dittman et al September 2012 (oral paper, olfactory imprinting)

Research Conferences• Saving Our Salmon – Portland, October 2012

• Oregon AFS, 2013

• International Ethological Congress, Newcastle, August 2013

• International Conference on Salmon Smolts, Iceland, August 2013

• Indo‐Pacific Fish Conference, Japan, July 2013

• Migration and Survival Mechanisms of Juvenile Salmon and Steelhead in Ocean Ecosystems, April 2013, Honolulu, Hawaii 

• Gilbert Ichthyological Society, September 2013

Research Projects and Proposals

Stable Isotopes – passive marking

Otolith marking – operations research (oxygen isotopes)

‐ Fish reared under controlled conditions, preserved – Gao analyses (October 2012)

Collaboration: Dr. Robbins Church, EPA; Dr. Yongwen Gao, Makah Tribal Fisheries; Dr. Ben Clemens, ODFW

Olfactory Imprinting – Homing & Straying

• Olfactory Imprinting during incubation

• Andy Dittman, David Noakes, Ryan Couture, Joseph O’Neil 

• Chinook salmon, steelhead

• Ongoing – ODFW hatchery rearing and testing (autumn – winter 2012)

Hatchery Survey: homing and straying

• Dr. Nathan Putman– Hatchery questionnaire

– Survey of existing data

– Research proposal development

Geomagnetic Imprinting: Homing and Straying• Geomagnetic Imprinting (Oregon Sea Grant funding)

• David Noakes, Ken Lohmann, Andy Dittman, Sam Chan, Pete Klimley, Tom Quinn, Nathan Putman, Michael Banks, Jennifer Nielsen, Carl Schreck

• Nathan Putman presentation

• Salmon carcass surrogates – discussion NW Fish Products (industry)

• Fish passage – discussions (Silvies Valley Ranch) (Letter of Intent)

• Fish passage alternative – discussions (Dr. Guillermo Giannico)

Landscape Ecology: production and performance

Influences on Development and Performance

• Carl Schreck, David Noakes, Chuck Kimmel (Oregon) “phenotypic plasticity”

• Genetic and environmental effects; hatchery and wild; effects of domestication

• Re‐adaptation of hatchery fish

Chinook & Steelhead Surrogate Project

• US ACOE, ODFW, USGS, OSU

• OHRC studies: feeding, density, self‐selection, diets

• Re‐adaptation of hatchery fish; performance of hatchery and wild fish

• Dr. Eric Billman ‐ Presentation to OHRC Advisory Committee 

Otolith WorkshopOHRC, ODFW

25 – 26 October 2012

David Noakes, Ben Clemens

coordination with ODFW, OR AFS, BPA, Oregon Sea Grant, GLFC, Tribal groups 

Invited speakers, research proposal development 

Development of Distance Education course – Fisheries & Wildlife Department, Oregon State University

Lamprey Workshop

OHRC “Spring 2013”

David Noakes, Ben ClemensOHRC, OSU, ODFW

- invited speakers- conservation, restoration, enhanced production

(“hatcheries ?”), field techniques- native species, Tribal values and interests