optimasi metode analisis molekuler delapan aksesi sorgum...

OPTIMASI METODE ANALISIS MOLEKULER

DELAPAN AKSESI SORGUM (Sorghum bicolor (L.) Moench)

DAERAH JAWA TIMUR MENGGUNAKAN PENANDA RAPD

SKRIPSI

Diajukan untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan

Mencapai Derajat Sarjana S-1

Jurusan Agronomi

Diajukan Oleh:

Syaiur Rohman

NIM. 201310200311091

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI

JURUSAN AGRONOMI

FAKULTAS PERTANIAN PETERNAKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH MALANG

2018

44

SKRIPSI

OPTIMASI METODE ANALISIS MOLEKULER

DELAPAN AKSESI SORGUM (Sorghum bicolor (L.) Moench)

DAERAH JAWA TIMUR MENGGUNAKAN PENANDA RAPD

Oleh:

SYAIUR ROHMAN

NIM: 201310200311070

Disusun berdasarkan Surat Keputusan Dekan

Fakultas Pertanian Peternakan Universitas Muhammadiyah Malang

Nomor: E.6.I/186.a/FPP-UMM/II/2018 dan rekomendasi Komisi Skripsi

Fakultas Pertanian Peternakan UMM pada tanggal: 7 Februari 2018

dan keputusan Ujian Sidang yang dilaksanakan pada tanggal 1 Februari 2018

Dewan Penguji:

Dr. Ir. Agus Zainudin, M.P. Ir. Dyah Titi Muhardini, M.P.

Ketua/Pembimbing Utama Anggota/Pembimbing Pendamping

Aulia Zakia, SP. MSi Dr. Ir. Muhidin, M.Si.

Anggota Anggota

Malang, 23 Februari 2018

Mengesahkan:

Dekan, Ketua Jurusan,

Dr. Ir. David Hermawan, M.P., IPM. Dr. Ir. Ali Ikhwan, M.P.

NIP. 19640526199003 NIP. 196410201991011001

KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat dan

hidayah-Nya sehingga penulis mampu menyelesaikan penelitian serta skripsi yang

berjudul “Optimasi Metode Analisis Molekuler Delapan Aksesi Sorgum

Daerah Jawa Timur Menggunakan Penanda RAPD” tepat pada waktunya tanpa

halangan yang berarti.

Pelaksanaan penelitian dan skripsi ini tidak terlepas dari bimbingan, arahan,

dukungan, dan motivasi kuat serta bantuan dari berbagai pihak. Oleh karena itu,

dalam kesempatan ini, penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada yang

terhormat:

1. Dr. Ir. Agus Zainuddin, MP. selaku pembimbing utama yang telah banyak

meluangkan waktu dan pikiran untuk memberikan bimbingan serta arahan yang

sangat berguna sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan baik.

2. Ir. Dyah Titi Muhardini, MP selaku pembimbing pendamping yang telah banyak

meluangkan waktu dan pikiran untuk memberikan bimbingan serta arahan yang

sangat berguna sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan baik.

3. Ibu Sulistyawati, yang telah memberikan banyak bantuan dan wawasan

mengenai penelitian yang dilakukan oleh penulis.

4. Bapak Kholis, yang telah membantu dan memberi arahan dalam berbagai

kegiatan di Laboratorium.

5. Dian Abdillah sebagai partner dalam penelitian yang dilakukan oleh penulis.

6. Serta semua pihak yang telah membantu dan tidak dapat saya sebutkan satu-

persatu.

Penulis menyadari tiada satu pun karya manusia yang sempurna, sehingga

kritik dan saran demi perbaikan karya ini sangat penulis harapkan. Meski demikian,

penulis berharap karya sederhana ini dapat bermanfaat bagi pembaca sekalian.

Malang, Januari 2018

Penulis

DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR .......................................................................................... 45

DAFTAR ISI ......................................................................................................... 46

DAFTAR TABEL ................................................................................................ 48

DAFTAR GAMBAR ............................................................................................ 49

DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................ 50

RINGKASAN ........................................................... Error! Bookmark not defined.

I. PENDAHULUAN ................................................. Error! Bookmark not defined.

1.1 Latar Belakang ........................................... Error! Bookmark not defined.

1.2 Rumusan Masalah ...................................... Error! Bookmark not defined.

1.3 Tujuan ......................................................... Error! Bookmark not defined.

1.4 Hipotesis ..................................................... Error! Bookmark not defined.

II. TINJAUAN PUSTAKA ...................................... Error! Bookmark not defined.

2.1 Morfologi dan Klasifikasi Tanaman Sorgum ........... Error! Bookmark not

defined.

2.2 Analisis Molekuler Tanaman Sorgum ........ Error! Bookmark not defined.

2.3 Penapisan Primer RAPD ............................ Error! Bookmark not defined.

2.4 Penanda Molekuler ..................................... Error! Bookmark not defined.

III. METODE PENELITIAN ................................. Error! Bookmark not defined.

3.1 Waktu dan Tempat ..................................... Error! Bookmark not defined.

3.2 Bahan dan Alat ........................................... Error! Bookmark not defined.

3.3 Pelaksanaan Penelitian ............................... Error! Bookmark not defined.

3.3.1 Pengambilan Sampel untuk Isolasi DNA ... Error! Bookmark not

defined.

3.3.2 Isolasi DNA .................................. Error! Bookmark not defined.

3.3.3 Visualisasi DNA dengan Elektroforesisi Gel Agarose ........ Error!

Bookmark not defined.

3.3.4 Analisis Kemurnian dan Konsentrasi Isolat DNA ............... Error!


3.3.5 Amplifikasi DNA dengan PCR .... Error! Bookmark not defined.

3.3.6 Variabel Pengamatan ................... Error! Bookmark not defined.

3.4 Analisis Data .............................................. Error! Bookmark not defined.

3.5 Alur Penelitian ............................................ Error! Bookmark not defined.

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN .......................... Error! Bookmark not defined.

4.1 Hasil ........................................................... Error! Bookmark not defined.

4.2.1 Kualitas DNA Tanaman Sorgum Error! Bookmark not defined.

4.2.2 Konsentrasi dan Kemurnian DNA Hasil Isolasi Tanaman

Sorgum ......................................... Error! Bookmark not defined.

4.2.3 Amplifikasi DNA Bedasarkan Seleksi Primer RAPD ......... Error!


4.2 Pembahasan ................................................ Error! Bookmark not defined.

4.2.1 Kualitas DNA Tanaman Sorgum Error! Bookmark not defined.

4.2.2 Konsentrasi dan Kemurnian DNA Hasil Isolasi Tanaman

Sorgum ......................................... Error! Bookmark not defined.

4.2.3 Amplifikasi DNA Berdasarkan Seleksi Primer RAPD ........ Error!


V. KESIMPULAN DAN SARAN ........................... Error! Bookmark not defined.

5.1 Kesimpulan ................................................. Error! Bookmark not defined.

5.2 Saran ........................................................... Error! Bookmark not defined.

DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................... 52

LAMPIRAN .............................................................. Error! Bookmark not defined.

DAFTAR TABEL

Nomor Teks Halaman

1. Komposisi larutan buffer I .............................. Error! Bookmark not defined.

2. Komposisi larutan bufer II .............................. Error! Bookmark not defined.

3. Komponen reaksi PCR .................................... Error! Bookmark not defined.

4. Jenis dan susunan basa dari primer RAPD yang digunakan Error! Bookmark

not defined.

5. Hasil pengukuran konsentrasi dan kemurnian DNA sampel hasil

isolasi. Error! Bookmark not defined.

6. Polimorfisme pita hasil amplifikasi dengan 5 primer RAPD ................. Error!


7. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 02 ... Error! Bookmark

not defined.6


not defined.7


not defined.8


not defined.9

11. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 20 .............................. 60

DAFTAR GAMBAR

Nomor Teks Halaman

1. Tanaman Sorgum ............................................ Error! Bookmark not defined.

2. Alur penelitian ................................................ Error! Bookmark not defined.

3. Visualisasi elektroforesis hasil isolasi DNA genom Sorgum (Sorgum

bicolor L. Moench). Sumur (1) Lamongan 1, Sumur (2) Lamongan 2,

Sumur (3) Tuban dan Sumur (4) Tulungaggung ............Error! Bookmark not

defined.

4. DNA tidak dapat teramplifikasi dengan primer: (a) OPA 06, (b) OPA 8,

(c) OPA 11, (d) OPA 12, (e) OPA 16, (f) OPA 18, (M) Marka, (1)

Lamongan 1, (2) Lamongan 2, (3) Tuban, (4)Tulungagung. .................. Error!


5. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 02 Error! Bookmark not

defined.

6. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 10. ..... Error! Bookmark

not defined.


not defined.


not defined.


not defined.

10. Aplikasi GelAnalyzer 2010. ............................ Error! Bookmark not defined.

11. Tampilan baris menu GelAnalyzer 2010 ........ Error! Bookmark not defined.

12. Jendela direktori pemilihan file yang akan dianalisis ....Error! Bookmark not

defined.

13. Tampilan jendela analisis gel .......................... Error! Bookmark not defined.

14. Baris marker yang akan diklibrasi. ................. Error! Bookmark not defined.

15. Tampilan kurva berdasarkan intensitas pita pada gel. ...Error! Bookmark not

defined.

16. Baris marker yang telah dikalibrasi. ............... Error! Bookmark not defined.

17. Pita amplikon yang telah dianalisis dengan GelAalyzer 2010 ................ Error!


18. Jendela direktori penyimpanan hasil analisis. . Error! Bookmark not defined.

19. Pengambilan sampel daun sorgum untuk isolasi DNA: a) lahan penanaman

sorgum; b) pemotongan daun yang dipilih; c) penyimpanan daun pada

kantung plastik bersegel; d) penyimpanan sampel di coolbox. ............... Error!


20. Kegiatan isolasi DNA: a) beberapa alat untuk ekstraksi DNA; b) bufer

isolasi DNA; c) beberapa larutan untuk isolasi DNA; d) tube sampel

kapasitas 1500 µl; e) Daun sorgum yang telah digerus; f) inkubasi sampel

yang telah diberi bufer ekstraksi; g) sentrifugasi sampel; h) sampel yang

telah disentrifus. .............................................. Error! Bookmark not defined.

21. Proses analisa DNA hasil isolasi: a) elektroforesis gel agarose; b)

visualisasi hasil elektroforesis dengan UV-Transilluminator; c) analisa

kemurnian dan konsentrasi DNA dengan spektrofotometer; d) analisa

dengan PCR-RAPD. ....................................... Error! Bookmark not defined.

DAFTAR LAMPIRAN

Nomor Teks Halaman

Protokol Pembuatan Larutan

Stok .............................................................................................................. Err

or! Bookmark not defined.

Metode Isolasi DNA yang Digunakan pada

Penelitian ...................................................................................................... Err


Data Biner 8 Genotipe Sorgum Lokal Jawa Timur Berdasarkan Primer

OPA

02 .................................................................................................................. Err



OPA

10 .................................................................................................................. Err



OPA

13 .................................................................................................................. Err



OPA

19 .................................................................................................................. Err



OPA

20 .................................................................................................................. Err


Perhitungan Berat Molekul Fragmen DNA Berdasarkan Jarak Migrasi

Menggunakan GelAnalyzer

2010 .............................................................................................................. Err


Dokumentasi Pelaksanaan Kegiatan

Penelitian ...................................................................................................... Err


DAFTAR PUSTAKA

Anam K. 2010. Isolasi dan Pemetaan DNA plasmid. Bogor : Bioteknologi Sekolah

Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor.

Akhare A A, Sakhare S B, Kulwal P L, Dhumale D B and Kharkar A (2008). RAPD

Profile Studies In Sorgum For Identification Of Hybrids And Their

Parents. Int J Integrative Biol 3 (1): 18-24.

Apriwinda. 2013. Studi Fermentasi Nira Batang Sorgum Manis (Sorgum Bicolor

(L) Moench) Untuk Produksi Etanol. Skripsi. Fakultas Pertanian

Universitas Hasanuddin Makassar. Makassar.

Azrai M. 2005. Pemanfaatan Marka Molekuler dalam Proses Seleksi Pemuliaan

Tanaman. Jurnal Agrobiogen 1(1): 26-37

Barbanti, L., S. Grandi, A. Vecchi, and G. Venturi. 2006. Sweet And Fiber Sorgum

(Sorgum Bicolor (L) Moench), Energi Crops In The Frame Of

Environmental Protection From Excessive Nitrogen Loads. Europ. J.

Agron. 25(1):30-39.

Bardakci, F. 2001. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Turk.

J. Biol. 25:185-196

Caetano-Anollés, G., 2004. DNA Amplification Fingerprinting. A forum for DNA

marker methodologies: University of Illinois at Urbana- Champaign.

Candra, M. J. 2011. Pengaruh Pemberian Mikoriza Vesikular Arbuskular

(MVA)Dan Berbagai Dosis Pupuk Kompos Terhadap Pertumbuhan Dan

Hasil Tanaman Sorgum (Sorgum bicolor (L.) Moench). Universitas

Pembangunan Nasional Veteran. Yogyakarta.

Carsono, N., P. N. Lukman, F. Damayanti, U. Susanto, dan S. Sari. 2014.

“Identifikasi Polimorfis Marka-marka Molekuler Yang Diduga Berkaitan

Dengan Karakter Daya Hasil Tinggi Pada 30 Genotip Padi.” Chimica et

Natura Acta 2 (1): 91-95.

Chen, H.A., 2000. PCR [online]. Chen's own protocols: Chen’s protocol list: PCR.

http://users. breathe.com/hachen/protocols/PCR.html.

CIMMYT. 2005. Laboratory Protocols: CIMMYT Aplied Molecular Genetics

Laboratory. Third Edition. Mexico, D.F.

Dalfi, U. S., U. D. Chavan, dan J. V. Patil. 2012. “Varietal Identification of Sorgum

(Sorgum bicolor (L.) Monech) Cultivars by RAPD Markers.” Indian J

Agric Biochem 25 (1): 48-51.

De Wet, J.M.J., J.R.Harlan, and E.G. Price.1970. Origin Of Variability In The

Spontanea Complex Of Sorgum Bicolor. American Journal of Botany

57(6):704-707.

Demeke, T. and R. P. Adams. 1994. The Use of PCR-RAPD Analysis in Plant

Taxonomy and Evolution. In : Griffin, H. G. and A. M. Griffin. Eds. PCR

Technology: Current Innovations. Boca Raton. CRC Press : 179-191.

Deptan. 1990. Teknologi Budidaya Sorgum. Departemen Pertanian. Balai

Informasi Pertanian Provinsi Irian Jaya. www.pustaka.litbang.

deptan.go.id.

Direktorat Budidaya Serealia. 2013. Kebijakan Direktorat Jenderal Tanaman

Pangan dalam Pengembangan Komoditas Jagung, Sorgum dan Gandum.

Direktorat Jenderal Tanaman Pangan. Kementan RI. Jakarta.

Direktorat Gizi Departemen Kesehatan RI. 1992. Daftar Komposisi Bahan

Makanan. Bhratara, Jakarta. 57 p.

Direktorat Jenderal Tanaman Pangan (2007). Persebaran Daerah Penghasil

Sorgum di Indonesia. Departemen Pertanian. Jakarta.

Doyle J.J and Doyle J.L. 1990. Isolation of Plant DNA From Fresh Tissue. Focus.

Moscow.12(1):13-15.

FAO Stat 2011. Food and Agriculture Organization. Data base:

http://faostat.fao.org/site/567/ DesktopDefault.aspx?PageID=567#ancor.

Statistical Database on Agriculture.

Gardner, F. P., R. B. Pearce, dan R. L. Mitchell. 1991. Fisiologi Tanaman Budidaya

Terjemahan Herawati Susilo. Universitas Indonesia Press. Jakarta. 428

hal.

Grewal, A., A. Sharma, S. Pahuja, dan S. Khatak. 2013. “Dna extraction

optimization in Sorgum (Sorgum bicolor l. Moench) for marker analysis.”

World Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences 2 (6): 5046-

5051.

Hartati D. 2006. Keragaman Genetik Sengon (Albazia falcataria L. Fosberg)

Melalui DNA Marker. Pusat Penelitian dan Pengembangan Hutan

Tanaman (P3HT). Yogyakarta.

House, L. R. 1985. A Guide To Sorgum Breeding. International Crops Research

Institute for Semi-Arid Tropics. Andhra Pradesh, India.

Husniyati, T. 2012. Analisis Variasi Genetik Populasi Tanaman Karet (Hevea

Brasiliensis) Sumber Eksplan Untuk Perbanyakan In Vitro Berdasarkan

RAPD. Institut Pertanian Bogor. Skripsi. Departemen Biokimia Fakultas

Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Institut Pertanian Bogor.

Irmawati. 2003. Perubahan Keragaman Genetik Ikan Kerapu Tikus Generasi

Pertama pada Stok Hatchery. Tesis. Institut Pertanian Bogor. Bogor.

Jose, J. and R. Usha. 2000. Extraction Of Geminiviral DNA From A Highly

Mucilaginous Plant (Abelmoschus Esculentus). Plant Mol. Biol. Rep. 18:

349 - 355.

http://www.pustaka.litbang/

Komalasari, K. 2009. Pengaruh Perbandingan Volume Darah Dan lisis Buffer

Serta Kecepatan Sentrifugasi Terhadap Kualitas Produk DNA Pada Sapi

Friesian Holstein (Fh). Institut Pertanian Bogor. Skripsi. Departemen Ilmu

Produksi Dan Teknologi peternakan Fakultas Peternakan Institut Pertanian

Bogor.

Laimeheriwa, J Ir. 1990. Teknologi Budidaya Sorgum. Departemen Pertanian Balai

Informasi Pertanian Provinsi Irian Jaya. Jayapura.

Lingga, I. F., Restu, M., dan Kusniwinanti, T. 2012. Optimalisasi Suhu dan Lama

Inkubasi Dalam Ekstraksi Dna Tanaman Bitti (Vitex Cofassus Reinw)

Serta Analisis Keragaman Genetik dengan Teknik Rapd-Pcr. J. Sains &

Teknologi 12 (3): 265 – 276

Maftuchah. 2009. Analisis Keragaman Genetik Tanaman Jarak Pagar Lokal

(Jatropha Curcas L.) Berdasarkan Penanda Molekuler Random Amplified

Polymorphic DNA. Gamma Jurnal Ilmu Ek-Sakta 5 (1):54-62.

Maftuchah, dan A. Zainudin. 2006. “Pengembangan metode isolasi DNA genom

pada tanaman Jarak Pagar (Jatropha curcas L.).” Humanity 2 (1): 63-69.

Makmur, A.A. & Adam, H.F. 2013. Review: Gelatin, Source, Extraction, and

Industrial Appliation. J. Acta Sci Pol,. Technol. Aliment 12 (2), 135-147.

Mudjisihono, M. S. 1987. Budidaya dan Pengolahan Sorgum. Penebar Swadaya.

Jakarta. hal 87.

Muladno.2010. Teknologi Rekayasa Genetika. Edisi Kedua. Bogor: IPB Press.

Mutakin. 2013. Respon Pertumbuhan dan Produksi Tiga Varietas Sorgum

(Sorghum Bicolor L. Moench) dengan Perbedaan Sistem Pengolahan

Tanah. Jurnal Online Agroteknologi, 1(4) 1163-1170.

Nagaral, M. S., V. C. Patil, dan D. P. Biradar. 2009. “RAPD Based assessment of

genetic diversity in pop sorgum.” Karnataka J. Agric. Sci. 22 (2): 261-263.

Nurhaimi-Haris, S. Woelan dan A. Darussamin. 1998. RAPD analysis of genetic

ariability in plant rubber (Hevea brasiliensis Muell. Arg.) clones. Menara

Perkebunan 66 (1): 9 – 19

Pabendon, M.B., Mas’ud, S., S, Rosalia., Nur, A. 2012. Penampilan Fenotipik dan

Stabilitas Sorgum Manis untuk Bahan Baku Bioetanol.Penelitian Pertanian

Tanaman Pangan Vol. 31 No. 1.

Padmalatha, K. and M. N. V. Prasad. 2006. Optimization of DNA Isolation and PCR

Protocol for RAPD Analysis of Selected Medicinal and Aromatic Plant of

Conservation Concern from Peninsular India. African Journal of

Biotechnology. 5 (3): 230-234.

Palan, B. V., A. A. Kale, B. D. Pawar, A. S. Jadhav, S. R. Gadakh, dan V. P.

Chimote. 2014. “Molecular Analysis Of Cytoplasmic Male Sterile System

Of Sorgum (Sorgum bicolour (L.) Moench) By RAPD and ISSR Markers.”

Vegetos 27 (2): 207-212.

Pharmawati, M. 2009. Optimalisasi Ekstraksi DNA dan PCR-RAPD pada Grevillea

spp. (Proteaceae). Jurnal Biologi. 13 (1): 12-16

Prana, T.K., & Hartati, N. S.. 2003. Identifikasi Sidik Jari DNA Talas (Colocasia

Esculenta L. Schott) Indonesia dengan Teknik RAPD (Random Amplified

Polymorphic DNA): Skrining Primer dan Optimalisasi Kondisi PCR.

Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI. Cibinong. Jurnal Natur Indonesia 5

(2): 107-112.

Rahmi, Syuryawati, dan Zubachtirodin. 2007. Teknologi Budidaya Sorgum. Balai

Penelitian Tanaman Serealia. Maros.

Ruwaida, I. P. 2009. Analisis Keragaman Dna Tanaman Durian Sukun (Durio

zibethinus Murr.) Berdasarkan penanda RAPD. Universitas Sebelas Maret

Surakarta

Sambrook, J., E.f. Fritsch and T. Maniatis. 1989. Moleculer cloning: A Laboratory

Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New

York, USA.

Santoso, P.J. 2005. Modified CTAB-based DNA isolation procedure for fruit crops.

Jurnal Stigma XIV(1):1-4.

Sathelly, K., R. Govindannagari, S. Pandey, S. K. Kompelli, Viasarada, dan T.

Kaul. 2014. “A Simple and Efficient Method for High Quality DNA

Extraction from Sweet Sorgum [Sorgum bicolor (L.) Moench].” Annals of

Plant Sciences 3 (7): 761-764.

Sanjaya, L., G. A. Wattimena, E. Guharja, M. Yusup, H. Aswindinoor dan P. Stam.

2002. Keragaman Ketahanan Aksesi Capsicum terhadap Antraknose

(Colletotrichum capsici) berdasarkan Penanda RAPD. Jurnal

Bioteknologi Pertanian. 7 (2): 37-42.

Sembiring dan Subekti, N. A. 2013. Produsen Utama Sorgum Dunia. Dalam

Sorgum : Inovasi Teknologi dan Pengembangan, oleh Kementerian

Pertanian Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian, disunting oleh

Sumarno, D. S. Damardjati, M. Syam, Hermanto. Jakarta. IAARD Press.

1-5.

Sharma, A., A. G. Namdeo and K.R.Mahadik. 2008. Molecular Markers: New

Prospects in Plant Genome Analysis. Pharmacognosy Reviews 2 (3): 23-

31.

Sirappa, M. P. 2003. Prospek Pengembangan Sorgum di Indonesia sebagai

Komoditas Alternatif untuk Pangan,Pakan, dan Industri. Jurnal Litbang

Pertanian 22: 133-140.

Siregar, U.J., Sudarmonowati, E. & Hartati, N.S. 1998. Development of RAPD

protocol for Shorea laevis. Annales Bogorienses 5: 85-92.

Soeranto, H. 2002. Prospek dan Potensi Sorgum Sebagai Bahan Baku Bioetanol.

Badan Tenaga Nuklir Nasional (BATAN). Jakarta.

Suarni. 2012. Potensi Sorgum sebagai Bahan Pangan Fungsional. Iptek Tanaman

Pangan 7(1): 58-66.

Subagio, H. dan M. Aqil. 2014. Perakitan dan Pengembangan Varietas Unggul

Sorgum untuk Pangan, Pakan, dan Bioenergi. Balai Penelitian Tanaman

Serealia. Sulawesi Selatan. Maros.

Sudjadi. 2008. Bioteknologi Kesehatan. Yogyakarta: Kanisius

Suryana, I. A. 2017. Penampilan Agronomis Dan Hasil Nira Beberapa Genotipe

Sorgum (Sorgum Bicolor (L.) Moench) Yang Ditanam Secara

Tumpangsari dengan Ubi kayu (Manihot Esculanta Crantz) Pada Dua

Lokasi Yang Berbeda. Skripsi. Fakultas Pertanian Universitas Lampung.

Bandar Lampung.(daru,2003).

Susilowati, S.T dan H.P. Saliem.2013. Dalam Sorgum : Inovasi Teknologi dan

Pengembangan, oleh Kementerian Pertanian Badan Penelitian dan

Pengembangan Pertanian, disunting oleh Sumarno, D. S. Damardjati, M.

Syam, Hermanto. Jakarta. IAARD Press. 24-37.

Syafaruddin dan T.J. Santoso. 2011. Optimasi Teknik Isolasi dan Purifikasi DNA

yang Efisien dan Efektif Pada Kemiri Sunan (Reutalis Trisperma (Blanco)

Airy Shaw). Jurnal Littri 17(1): 11-17.

Tingey, S.V., J.A. Rafalski, and M.K. Hanafey. 1994. Genetic analysis with RAPD

markers. In: Coruzzi, C. and P. Puidormenech (eds.). Plant Molecular

Biology. Belin: Springer-Verlag.

Triana., S.H., M.S. Gani., A.C. Malina., Hamka. 2010. Analisis Keragaman Genetik

Dalam Seleksi Mendapatkan Induk Kerapu Macan (Ephinephelus

fuscoguttatus) Yang Tahan Bakteri Vibrio parahaemolitycus Dan Toleran

Salinitas Rendah Serta Salinitas Tinggi. Lembaga Penelitian Dan

Pengembangan Sumberdaya, Universitas Muslim Indonesia, Makassar.

Williams J.G, and Ronald I.A.1990. DNA Polymorphisms Amplified By Arbitrary

Primers Are Useful As Genetic Markers. Nucleic Acid Research

18(22):6531-6535.

Wirnas D. 2005. Analisis Kuantitatif dan Molekular dalam Rangka Mempercepat

Perakitan Varietas Baru Kedelai Toleran Terhadap Intensitas Cahaya

Rendah [makalah]. Bogor: Sekolah Pascasarjana IPB.

optimasi metode analisis molekuler delapan aksesi sorgum...

Documents