pengantarbiokim (internat)

7/24/2019 PengantarBiokim (internat)

1/39

ELL COME

TO PLAYS COURSE

BIOCHEMISTRY


2/39

Tujuan Perkuliahan

Mengenalkan dan memahamkanbahasa biokimia : Kosakata (istilah dan

struktur kimia), tatabahasa (reaksi-

reaksi kimia), struktur kalimat (Jalurmetabolisme) dan arti (keterkaitan

metabolik)


3/39

Apa itu Biokimia

Definisi: Websters dictionary: ios ! "unani,

artinya #hidu$% #Kimia mahluk hidu$& Kimia

yang ter'adi dan men'adi ciri kehidu$an%

Webet dictionary: #iokimia adalah kimia

dari bahan-bahan dan $roses-$roses yang

ter'adi dalam tubuh mahluk hidu$& sebagai

u$aya untuk memahami $roses kehidu$andari sisi kimia#


4/39

Apa itu !iokimia

Pemahaman bentuk dan fungsibiologis dari sudut pandang kimia

ertu'uan untuk memahami interaksi

molekul-molekul tak hidu$ yangmenghasilkan *enomena kom$leks dan

e*isien yang men'adi ciri-ciri kehidu$an

serta men'elaskan keseragaman kimiadari kehidu$an yang beragam


5/39

Hal"hal #an$ %ipelajari

Struktur kimia dan bentuk tiga dimensi molekulbiologi

Interaksi antar biomolekul

Sintesis dan degradasi biomolekul dalam selPerolehan dan pemanfaatan energi oleh sel

Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan

pengkoordinasian aktifitasnyaPenyimpanan, pemindahan dan ekspresi

informasi genetika


6/39

Sejarah Biokimia

Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk hidup.

Enam unsur utama

penyusun sel hidup adalah:

C, H, , !, P, dan S.

"nsur kimia utamapenyusun mahluk hidup

adalah bahan minor

penyusun kerak bumi

#kandungan utama $%& !,

'(& Si, %.)& *l, $.+& e,

dan -.+& Ca.

++./

+01

+.23

21+4

Jumlah 5raksi6lektron bebas7nsur

889 $enyusun sel adalah 4, 3, , dan /


7/39

Unsur dengan berat atom paling ringan

membentuk ikatan paling kuat

Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup memiliki beratatom yang rendah; H, O, N dan C adalah unsur dengan beratatom relatif paling kecil yang masing-masing mampumembentuk ikatan tunggal, rangkap, rangkap 3 dan rangkap4


8/39

Sejarah Biokimia

/emudian, identifikasi tipe molekul yang ditemukan dalam mahluk hidup

sam mino

ukleotida

Karbohidrat

;i$ida


9/39

Sejarah Biokimia

Selan0utnya memahami mekanisme biomolekul membuat mahluk hidup

men0adi hidup


10/39

Hu!un$an antara

Biokimia %an ilmu

lainn#a

/imia !rganik yang mem$ela'ari si*at-si*atbiomolekul

1iofisika, yang meman*aatkan teknik-teknik *isika

untuk mem$ela'ari struktur biomolekulutrisi, yang meman*aatkan $engetahuan tentang

metabolisme untuk men'elaskan kebutuhanmakanan bagi mahluk hidu$ mem$ertahankankehidu$an normalnya

/esehatan, yang mencari $emahaman tentangkeadaan sakit dari sudut $andang molekular


11/39

Mikrobiologi, yang menun'ukkan bah


12/39

& E'ER(I)hal #an$ perlu

%iketahui a%alah

*ara+

Memperolehnya

Mengubahnya

Memanfaatkannya

Ti$a hal #an$ %i!utuhkan

,el


13/39

-./ MOLE0UL SE1ERHA'A )hal #an$ perlu %iketahui

a%alah *ara+

Mengubahnya

Mempolimerisasikannya

Mendegradasinya

Ti$a hal #an$ %i!utuhkan

,el


14/39

-2/ ME0A'ISME0IMIA) untuk+

Mem$eroleh energi

Men'alankan reaksi kimia secara berurutan

Mensintesis > mendegradasi makromolekul

Mem$ertahankan suatu keadaan steady state

yang dinamis

?


15/39

Strate$i ,el 34+ mahluk hi%upmen$$unakan ,i,tem reak,ikimia !erpa,an$an untuk

men%oron$ reak,i #an$ ,ulitterja%i


16/39

Strate$i ,el 3.+ mahluk hi%upmen$$unakan en5im untukmemper*epat reak,i #an$,eme,tin#a lam!at


17/39

Ba$aimana en5im !i,a

memper*epat reak,i

Penjela,an termo%inami,


18/39

Ba$aimana en5im !i,a

memper*epat reak,i

Penjela,an mekani,ti,


19/39

Atom 0ar!on #an$ ,an$at lentur

merupakan tulan$pun$$un$

kehi%upan


20/39

0on6er,i i,omer kimiamem!utuhkan pemutu,anikatan ko6alen


21/39

Stereoi,omer,+Sama ,e*ara kimia)!er!e%a ,e*ara !iolo$i


22/39

Stereoi,omer,+Sama ,e*ara kimia)!er!e%a ,e*ara !iolo$i


23/39

Tran,7orma,i Biokimia

%apat %ikelompokkan ke

%alam 8 kelompok !e,ar

@eaksi $emindahan Arou$

@eaksi 3ksidasi-reduksi

Benyusunan kembali

Rearrangements(isomerizations) @eaksi $emotongan

@eaksi kondensasi


24/39

Biomolekul 9 Struktur

?enya


25/39

Bio,inte,i,Mem!utuhkan

molekul

,e%erhanauntuk %iran$kai

,e*ara ko6alen

melalui!er!a$ai

kom!ina,i


26/39

4: 0eelektrone$ati7an ke%ua atom

3 1D

/l 1

1

/ 2D

B 2+

4 2+

a 8

K E

Kekuatan ikatan kimia

di$engaruhi oleh

/eele3tronegatifan tinggi 4/ebutuhan akan elektron


27/39

.: ;umlah elektron #an$ !erikatan


28/39

0ekuatan !e!erapaikatan kimia+

Approx. Avg.

Fri$le: E2 kJmole

Couble: G+ kJmole

?ingle: 1D kJmole


29/39

(u$u,


30/39

'ukleo7ilBiolo$i #an$

Pentin$+

(u$u, 7un$,i

#an$ ka#a

elektron


31/39

BIO0IMIA

-M0S4==.A/

drs. Winarto Hariadi, M.Si.

Dr. Sedyo Hartono

Dr. Irfan D. Prijambada


32/39

;a%ual > SAP

Crs Winarto 4ariadi, M?i2.-8-20sam mino dan Brotein H

- Fin'auan umum

- sam mino

- iosintesis asam amino

D

Crs Winarto 4ariadi, M?i+0-8-20Karbohidrat HH

- @eaksi monosakarida

- Hkatan glikosida

- 5ungsi karbohidrat

.

Crs Winarto 4ariadi, M?i+-8-20Karbohidrat H

- Fin'auan umum- Monosakarida

- Cisakarida

- Bolisakarida

1

Crs Winarto 4ariadi, M?i1-8-20ir dan u**er2

Cr Hr*an C Bri'ambada20-E-20Bendahuluan :- Konse$ dasar biokimia

- @eaksi-reaksi biokimia

+

Dosen5anggal5opik /uliaho.


33/39

;a%ual > SAP

Cr Hr*an C Bri'ambada+2-++-20;i$ida HH

- 5ungsi asam lemak dan li$id

- iosintesis asam lemak

8

Cr Hr*an C Bri'ambadaD-++-20;i$ida H

- Fin'auan umum

- sam lemak 'enuh > tak 'enuh

- @eaksi asam lemak

E

Fo$ik Kuliah + sd GJadual dari5akultas

7'ian tengah semester0

Cr Hr*an C Bri'ambada+-+-20sam mino dan Brotein HH

- Be$tida

- ?truktur $rotein

- 5ungsi asam amino dan $rotein

- iosintesis $rotein

G

Dosen5anggalTopik KuliahNo.


34/39

;a%ual > SAP

Cr ?edyo 4artono1-+2-206nIim

- Fin'auan umum

- Klassi*ikasi enIim

- KoenIim dan ko*aktor

- Mekanisme dan kinetika ker'a enIim- Benghambatan

+2

Cr ?edyo 4artono2G-++-20sam nukleat HH

- ?truktur C dan @

- Hn*ormasi genetik

++

Cr ?edyo 4artono+8-++-20sam nukleat H

- Fin'auan umum

- ukleosida dan nukleotida

+

Dosen5anggalTopik KuliahNo.


35/39

;a%ual > SAP

Fo$ik Kuliah E sd +.Jadual dari

5akultas

7'ian khir ?emester+D

Cr ?edyo hartono+-+2-20Metabolisme H

- Fin'auan umum

- Jalur metabolisme

+1

Cr ?edyo 4artono+0-+2-20Metabolisme HH

- ioenergetika

- Kontrol metabolisme

+.

Dosen5anggal5opik /uliaho.


36/39

Buku A*uan

Frudy McKee and James McKee 21iochemistry: Fhe Molecular asis o* ;i*eFhird edition McAra /o +880 Brinci$les o*iochemistry2ndedition Worth Bublishers

lbert ; ;ehninger +88D Casar-dasariokimia (lih bahasa: Maggy Fhena


37/39

Penilaian

5otal ilai "0ian 6 Mid 6 5ugas dari $ dosen dibagi $#7ata8rata dari ilai Dosen I 6 II 6 III 6 I9

Pengharkatan

* : rata8rata kelas 6 ;,+ < stde=

1 : > rata8rata kelas 6 ;,+ < stde= ? rata8rata kelas 6 @,+ < stde=

C : > rata8rata kelas 6 @,+ < stde= ?

rata8rata kelas A @,+ < stde=

D : > rata8rata kelas A @,+ < stde= ?

rata8rata kelas A ;,+ < stde=

E : > rata8rata kelas A ;,+ < stde=


38/39

Tata Terti! 0uliah

Fe$at Hnggris

aca salah satu dua buku acuan

Ker'akan Fugas, Mid, > 7'ian


39/39

0e,impulan

Karbon dengan struktur tetrahedralmemiliki si*at ikatan yang lu

pengantarbiokim (internat)

Documents