pep tida biologi
DESCRIPTION
nilkTRANSCRIPT
PEPTIDA
Peptida adalah polimerisasi asam L α amina oleh ikatan peptida membentuk rangka struktural
protein.
Peptida besar perannya di bidang biomedis, terutama endokrinologi, misalnya
Hormon, preparat insulin untuk DMPreparat mikostatin, nodulamin dihasilkan
sianbakteri.
Mematikan dalam dosis besarMengobati tumor hepar di dosis kecil
Antibiotik – gramisin AAnti tumor- bleomisinDipeptida aspartat
Sintesis kimiawi yang cepat , teknologi DNA rekombinan akan meningkatkan pembuatan hormon-hormon, vaksin-vaksin peptida
Struktur peptida
Tripeptida alami tersusun dari alanin, sistein dan valin
AA yg gugus karboksilnya ikut membangun peptida disebut residu aminoasil
Rangkaian AA membentuk struktur primer protein
Struktur primer mempengaruhi aktivitas biologis (1)Mutan DNA mengubah kode
genetikPenyisipan ggs aminoasil yang
tak tepat ke polipeptida protein
Struktur primer mempengaruhi aktivitas biologis (2)
Walau sering tanpa efek, tapi dapat menurunkan atau menghilangkan efek yang ringan (intoleran alkohol pada banyak orang Asia)serius (penyakit sel sabit)
Metode baru penelusuran struktur protein dan DNA diperlukan dalam pengetahuan penyakit metabolisme herediter
Pemberian nama
Nama peptida berdasarkan urutan AA pembentuknya ,bisa tiga huruf, dapat pula satu huruf
Suatu heksapeptidaGlu-Ala-Lys-Gly-Tir-Asn atau
E A K G Y A
Peptida dengan AA tak lazim (1)
Peptida dihasilkan oleh jamur, bakteri, hewan tingkat rendah mengandung AA tak lazimAntibiotika Nisin, Subtilin, epidermin mengandung AA lantionin yg tak lazim
Peptida dengan AA tak lazim (2)
TRH: gugus terminal glutamat mengalami siklisasi menjadi piroglutamat,
terminal karboksil mengalami amidasi
Peptida adalah polielektrolit(1)
Untuk kepentingan biologis ikatan peptida tak memiliki muatan, walau pada berbagai pH
Pembentuk peptida dari AA pada pH 7.4 disertai kehilangan muatan + dan –
Peptida adalah polielektrolit(2)
Muatan peptida pada pH fisiologis disebabkan gugus karboksil, amino ujung serta R yang bersifat asam atau basa
Gaya non kovalen membatasi konformasi peptida
Dl larutan banyak konformasi peptida Namun didominasi konformasi tertentu Penyebab adalah:
hambatan sterikinteraksi Coulombiktan hidrogeninteraksi hidrofobik
Peptida / protein perlu konformasi spesifik utk aktifitas biologisnya
Peptida punya aktifitas biologis Peptida, BM rendah ( 3 – 100 residu AA)
sebagian besar berupa hormon Tetapi ada hormon yang hanya punya
satu ikatan peptida, yaitu dipeptida Satu AA dapat membentuk ikatan peptida
(dipeptida) dengan 20 AA lain, sehingga terdapat 39 dipeptida
Gly – GlyAla - Gly Gly – Ala
Jumlah dipeptida yg dibentuk 780 buah
Jumlah tripeptida, tetrapeptida yang dapat dibentuk jauh lebih besar
Peptida bereaksi khas
Terdapat 2 reaksi khas
1. Ikatan peptida dapat dihidrolisa dengan perebusan dalam asam atau basa kuat, menghasilkan AA bebas
Ikatan peptida dapat pula dihidrolisa dengan Enzim ( tripsin, kimotripsin) tripsin pada ggs karboksil residu lisin dan arginin
Kimotripsin memutus iktan peptida gugus karboksil fenilalanin, triptopan, tirosin
2. Ikatan peptida bereaksi dengan 1-fluoro2-4 dinitrobenzen melalui ggs amino menghasitklkan 2-4 dinitrofenilamino
Pereaksi ini bereaksi pula dengan alfa amino residu terminal membentuk dinitrofenilpeptida
Aktifitas biologis peptidaPeptida:Produk hidrolisa proteinPeptida bebas
hormon: insulinglukagonkotrikotropin
Beberapa hormon dengan peptida lebih pendek:oksitosin –kontraksi uterusbradikinin – menghambat pembengkakan jaringanTRH- meransang pelepasan hormon lain
Peptida pendek lain Enkefalin dibentuk di SSP
Bila ia mengikat reseptor tertentu di sel otak akan menimbulkan efek analgesik
Merupakan obat bius tubuh yg dibuat sendiri,
Karena molekul ini juga berikatan dengan morpin, heroin, jenis candu lain di otak
Racun jamur amanitin juga suatu peptida, suatu antibiotika
Analisis kandungan AA dl peptida
Hidrolisis ikatan peptida dengan HCl panas Campuran AA ditreatmen dengan 6 amino N
hidroksisuksinilmidilkarbamat menghasilkan derivat berfluoresen
Kemudian pisahkan dan identifikasi dengan HPLC
Ninhidrin juga banyak digunakan