recombinación

Crossing-over

Recombinación del DNA

• Recombinación generalizada u homóloga• Recombinación sitio-específica• Transposición• Elección de copia (copy choice) (RNA viruses)

Recombinación homólogageneralizada eucariótica.

Recombinación homóloga

Empalme recombinante

Parcherecombinante


Empalme recombinante Parche recombinante

Robin Holliday


Matthew Meselson Charles Radding


Empalme recombinante Parche recombinante


Recombinantes en parche

Empalme recombinate


Mapeo por ligamiento

Alfred Sturtevant

(157+146)/2335 = 0.13

pr 13.0 um vg--|---------------------------|--

“Hacia finales de 1911, durante una conversación con Morgan, descubrí de pronto que las variaciones en la fuerza delligamiento, que ya habían sido atribuídas por Morgan a las diferencias espaciales entre los genes, ofrecían la posibilidadde determinar su secuencia en la dimensión lineal de un cromosoma. Me fuí a casa y pasé la mayor parte de la noche(mientras descuidaba mis tareas de la universidad) produciendo el primer mapa de un cromosoma.”

Frecuencia de recombinación

Thomas Hunt Morgan

En Drosophila, dos genes recesivos (b y vg) producen el color del cuerpo negro yalas vestigiales, respectivamente. Otro gen recesivo (cn) se encuentra entre los locib y vg y produce color cinabrio en los ojos. Cuando se retrocruzan moscas silvestrespara estos tres caracteres, se separan las hembras hijas y se cruzan con machostesters, se producen 664 moscas de tipo silvestre, 652 negras-cinabrio-vestigiales,72 negras-cinabrio, 68 vestigiales, 70 negras, 61 cinabrio-vestigiales, 4 negras-vestigiales y 6 cinabrio.

b+ cn+ vg+ 664b cn vg 652b cn vg+ 72b+ cn+ vg 68b cn+ vg+ 70b+ cn vg 61b cn+ vg 4b+ cn vg+ 6Total 1599



b+ cn+ vg+ 664 RF(b-cn)= (70+61+4+6)*100/1599 = 8.8 cMb cn vg 652b cn vg+ 72 RF(cn-vg)= (72+68+4+6)*100/1599 = 9.4 cMb+ cn+ vg 68b cn+ vg+ 70 RF(b-vg)= (72+68+70+61)*100/1599 = 16.9 cMb+ cn vg 61b cn+ vg 4b+ cn vg+ 6Total 1599



b+ cn+ vg+ 664 RF(b-cn)= (70+61+4+6)*100/1599 = 8.8 cMb cn vg 652b cn vg+ 72 RF(cn-vg)= (72+68+4+6)*100/1599 = 9.4 cMb+ cn+ vg 68b cn+ vg+ 70 RF(b-vg)= (72+68+70+61)*100/1599 = 16.9 cMb+ cn vg 61b cn+ vg 4b+ cn vg+ 6 b 8.8 cM cn 9.4 cM vgTotal 1599 |_____________|__________________| | | 16.9 cM



b+ cn+ vg+ 664 8.8 cM + 9.4 cM = 18.2 cM > 16.9 cM !!!b cn vg 652b cn vg+ 72b+ cn+ vg 68b cn+ vg+ 70b+ cn vg 61b cn+ vg 4b+ cn vg+ 6 b 8.8 cM cn 9.4 cM vgTotal 1599 |_____________|__________________| | | 16.9 cM



b+ cn+ vg+ 664 Fr dobles rec esp = 0.088*0.094*1599 = 13.2b cn vg 652 Fr dobles rec obs = 4+6 = 10b cn vg+ 72b+ cn+ vg 68 i = (13.2-10)*100/13.2 = 24.2% !!!b cn+ vg+ 70b+ cn vg 61b cn+ vg 4b+ cn vg+ 6 b 8.8 cM cn 9.4 cM vgTotal 1599 |_____________|__________________| | | 16.9 cM

Interferencia

Interferencia

Análisis de meiosis individuales

El ciclo de vida haploide. Neurospora crassa.


Neurospora crassa


Peritecios

Ascas

Mecanismo de recombinación eucariótica

Recombinación homóloga bacteriana:asimilación de cadenas sencillas.

Puntos críticos chi:

5’-GCTGGTGG-3’3’-CGACCACC-5’

Aparecen en el DNA de E. coliCada 5-10 kb.

Maquinaria de recombinación bacteriana

E. coli RecA protein


Model for active RecA filament


RuvAB complex


RuvC


RuvC reconoce el tetranucleótidoATTG


Recombinación sitio-específica

Microbiol Rev. 1992 December; 56(4): 509–528.Use of gel retardation to analyze protein-nucleic acid interactions.D Lane, P Prentki, and M Chandler


recombinación

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