reconstrução filogenética: inferência bayesiana

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Reconstruo filogentica: Inferncia Bayesiana. Inferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhana Inferncia filogentica Bayesiana Prtica: MrBayes - PowerPoint PPT Presentation

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  • Reconstruo filogentica: Inferncia BayesianaInferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhanaInferncia filogentica BayesianaPrtica: MrBayesObjetivos: Compreender os princpios de inferncia Bayesiana e a sua nfase na probabilidade dos parmetros e no na probabilidade da amostra como no caso clssico (verossimilhana).

  • Inferncia filogentica porverossimilhana mximaVerossimilhana (L) Probabilidade (Amostra | Hipteses)

  • Inferncia baseada no conceito de verossimilhana (L)

  • Sequncia 1 A A T C G A G C C A T A G C GSequncia 2 A A C A G A C A C A G T C C GProbabilidades de transio segundo o modelo de Jukes & Cantor

  • Qual a funo de verossimilhana, L(t), para todos os stios?

  • Qual o parmetro desconhecido na funo de verossimilhana?O parmetro desconhecido na funo de verossimilhana t

  • ln L = 1589,77447 e t = 0,03091825Importante: Estima-se um nico valor para o parmetro.

  • O parmetro desconhecido na funo de verossimilhana tQuem t?Produto da taxa de substituio pelo tempoNmero total, por stio, de substituies em entre duas linhagens t = comprimento do ramo = 0,03091825

  • Reconstruo filogentica: Inferncia BayesianaInferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhana Inferncia filogentica BayesianaPrtica: MrBayes

  • Inferncia Bayesiana

  • 216

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  • 217

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  • 216

  • 218

  • 221

  • 224

  • Reconstruo filogentica: Inferncia BayesianaInferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhana Inferncia filogentica Bayesiana Prtica: MrBayes

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