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Red Académica i2basqueHPC
Josu Aramberri ([email protected])
Iñaki Serna ([email protected])
II Workshop Ibercivis
CIEMAT, 13 de septiembre de 2011
Accessing Supercomputing resources in Spain and Europe IberGrid
2011 ¿QUIÉNES SOMOS?
I2basque es una REN autonómica, financiada por el Departamento de Educación, Universidades e Investigación del Gobierno Vasco.
Desde Enero del 2011 somos parte de IkerBasque – Fundación Vasca para la Ciencia
Proporcionamos comunicaciones avanzadas y servicios TIC a los agentes de la Red Vasca de Ciencia y Tecnología:
Universidades públicas y privadas Centros Científicos y Tecnológicos Hospitales e investigación biomédica Entidades gestoras de I+D
Áreas en las que desarrollamos nuestra actividad:
Comunicaciones Cálculo intensivo Multimedia y Videoconferencia Contenidos en Internet: LMS, CMS
RECURSOS HPC
IBM iDataplex 128 nodos, 1024 procesadores 90 TB disco, 8.2 TB RAM 11TFlops Infiniband Torque + Moab RHEL 5.2 Próxima incorporación a la
RES
Cluster gt3 29 nodos, 232 procesadores 12 TB disco, 458 GB RAM 1378 GFlops Gigabit Ethernet Sun Grid Engine CentOS 5.3
Cluster gt 16 nodos, 66 procesadores
12 TB disco, 67 GB RAM Gigabit Ethernet Sun Grid Engine CentOS 4.4
Accessing Supercomputing resources in Spain and Europe IberGrid 2011
Accessing Supercomputing resources in Spain and Europe IberGrid 2011
Mecanismos de acceso y grupos que pueden acceder
Pueden solicitar recursos las entidades afiliadas a i2basque, enviando el formulario especificado en nuestra página web a [email protected]
http://i2basque.es/index.php/Cálculo_intensivo
Valores de peticiones y accesos
Número de usuarios: 24 repartidos entre los clusters
Peticiones entre 8 y 256 procesadores
Otros recursos
IBERCIVIS: conexión de los KZgunes
Conexión con IBERCIVIS
Servidor intermedio
Pasarela entre la red de los KZgune (10.x.x.x) y la Red Académica Garantizar el tráfico de entrada/salida del cliente BOINC
Conexión con IBERCIVIS
Situación actual
Pasarela configurada y en fase de pruebas Cliente BOINC preconfigurado para instalación piloto Verificación del control del tráfico con Ibercivis (ida y vuelta) En fase de instalación en un parque de 2.400 equipos
Retos
Balanceado de tráfico con distintos servidores/aplicaciones Tiempo de actividad de los equipos en los KZgunes
Jornada laboral 24 * 7
Aplicaciones en el País VascoCaso de CIC Biogune (Adriana Rojas)
Aplicación
Investigación en cáncer de hígado Docking de proteinas Ahora usan Autodock Adaptación a Ibercivis: Neurosim-Gromacs Calendario: noviembre-diciembre
Retos
2 millones de comparaciones => 5 minutos Alternativas
BD de proteinas (1-2 millones en la BD, ficheros .pdb de proteínas) Librerías comerciales: 1.500 compuestos (fichero + polvos)
Ibercivis en el País Vasco
Petición ciudadana
Petición de ideas del Gobierno Vasco Administración abierta, concepto asociado a OpenGov Incorporación a IBERCIVIS atendiendo una idea recibida por este canal
Otros temas relacionados
Necesitamos especialistas en HPC Propuesta de master, incluyendo uso de Ibercivis Proyectos de master en aplicaciones Ibercivis
Ibercivis y el Dianemólogo
Un invento de Leonardo Torres Quevedo
Patentado en 1907 Un nuevo procedimiento destinado a copiar sin necesidad de acudir a la
taquigrafía un discurso a medida que se pronuncia. Utilizado en el Ateneo de Madrid en una conferencia de Amós Salvador titulada
“La velocidad de la luz”
Antecedente simbólico de Ibercivis
Distribuye las frases de conferenciante entre varios copistas (8 a 12) Cada frase es una work-unit (wu), que se anota en una ficha Reuniendo las fichas ordenadas se obtiene la transcripción del discurso