regulace mitosy a replikace dna

47
vstupy výstupy velikost signály poškození ... gen. exprese morfogeneze ... Regulace mitosy a replikace DNA a její souvislost s degradací cyklinů (ponenáhlu se dotýkáme výstupů)

Upload: cody

Post on 29-Jan-2016

62 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

Regulace mitosy a replikace DNA. a její souvislost s degradací cyklinů (ponenáhlu se dotýkáme výstupů). vstupy. výstupy. velikost signály poškození. gen. exprese morfogeneze. (B. Němec, 1900?). Co vlastně dělá „MPF“?. Naivní model: MPF G2/metafáze MPF metafáze/anafáze. - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: Regulace mitosy a replikace DNA

vstupy výstupy

velikostsignálypoškození ...

gen. expresemorfogeneze...

Regulace mitosy a replikace DNA

a její souvislost s degradací cyklinů

(ponenáhlu se dotýkáme výstupů)

Page 2: Regulace mitosy a replikace DNA

(B. N

ěmec

, 190

0?)

Page 3: Regulace mitosy a replikace DNA

Co vlastně dělá „MPF“?

Naivní model:MPF G2/metafázeMPF metafáze/anafáze

... ale je to složitější!

Page 4: Regulace mitosy a replikace DNA

Standardní mitosa (živočišné buňky)

profáze metafáze

anafáze A

telofáze

anafáze B

Page 5: Regulace mitosy a replikace DNA

Pučivá kvasinka – co poznáme?

S

Meta/AnaA

AnaB/Telo

Page 6: Regulace mitosy a replikace DNA
Page 7: Regulace mitosy a replikace DNA

Rostlinnou mitosu lze chápat jako variaci

Page 8: Regulace mitosy a replikace DNA

cortical array preprophase band spindle

fragmoplast

Page 9: Regulace mitosy a replikace DNA

... ale najdou se i zajímavější (Dinoflagellata!)

(„permanentně kondenzované chromozómy“)

Cer

atiu

m s

p.

Page 10: Regulace mitosy a replikace DNA

Jaderná membrána přetrvává, chromozómy stále „kondenzovány“ a vázány k ní, vřeténko „vně“ ...

Tedy: co následuje, nemusí být univerzální (možná ani u Opisthokont!)

Page 11: Regulace mitosy a replikace DNA

Úloha CDK-cyklinových komplexů: co je třeba pro vstup do mitosy

(G2/M)?

• Aktivace CDK vazbou „mitotických cyklinů“ (CLB, CycA/B), tedy degradace CKI a cyklinů předchozí vlny

• Aktivace CDK fosforylací T161

• Dereprese CDK defosforylací T14, Y15

Jak jsou kontrolovány další kroky ... a jak se oddělují chromatidy?

Page 12: Regulace mitosy a replikace DNA

Rekapitulace:

• Obnova CLN kinázy stabilizuje CLB.

• Model!

Page 13: Regulace mitosy a replikace DNA

Mají „cyklové hodiny“ trojtaktní motor?

sta rt

repl

ica t

ionm

itos is

rep l

icat

ion m

itos is

CLB activ ity

s ta rtC LN txn

S ic1

C LB

(CKI)

CL

N

CLB

none

Page 14: Regulace mitosy a replikace DNA

Co je „destruction machinery“?

... opět proteasom + E2/E3!

Page 15: Regulace mitosy a replikace DNA

Alternativní E3: APC – anaphase promoting complex

S C

F(Cdc4)

(Cdc53)

Page 16: Regulace mitosy a replikace DNA

Další role APC: separace chromosomů

SMC (structural maintenance of chromosomes)

SCC (sister chromatid cohesion)

Sesterské chromatidy drží pohromadě kohesinové komplexy.

místo proteolyt. štěpení (C. H. Haering)

Page 17: Regulace mitosy a replikace DNA
Page 18: Regulace mitosy a replikace DNA

Dekoheze:

• Fosforylace kohesinů – kinázy skupiny Polo (Plk), Aurora

• Štěpení zbylých zprostředkováno APC!!

Page 19: Regulace mitosy a replikace DNA

Shugoshin: ochrana centromeric. kohesinů?

Page 20: Regulace mitosy a replikace DNA

Mitosa vs. meioze

• meiotické kohesiny (vydrží Ana I, lépe stabilizovány Shugoshinem?)

• variantní proteinové komplexy centromer (monopolární přichycení k vřeténku)

Page 21: Regulace mitosy a replikace DNA

Amatomie APC/cyklosomu (cyclosome)

• Podjednotky: Cdc16, Cdc23, Cdc26, Cdc27, BimE + 3 další

• Regulace: Cdc20 nebo Cdh1– Cdc20 sám degradován via

APC– Cdh1 je substrátem CDK

(inaktivační P ace!)

mND fenotyp

Page 22: Regulace mitosy a replikace DNA

APC i regulátory lze najít i u rostlin

Tarayre et al. 2004

Page 23: Regulace mitosy a replikace DNA

Aktivace APC – zjednodušeně:

Polo, Cdc5, Aurora etc. (kinázy)

Page 24: Regulace mitosy a replikace DNA

Regulace APC pomocí CDK, Cdc20 a Cdh1

APC(inactive)

APC(active)

APC(active)

Cdc20

Cdh1

Cdh1P

mitoticCDK

autoinhibice APCCdc20

mitotic CDK APCCdh1

P

P

mitotic CDK APCPolo, Cdc5, Aurora etc.

Page 25: Regulace mitosy a replikace DNA

Jaký to má smysl??

APC(inactive)

APC(active)

APC(active)

Cdc20

Cdh1

Cdh1P

mitoticCDK

P

P

anafáze

telofáze/G1

Page 26: Regulace mitosy a replikace DNA

Co přepíná mezi oběma mody? Cdc14 protein fosfatáza!

(fenotyp jako Cdc15)

APC(inactive)

APC(active)

Cdh1

Cdh1P

mitoticCDK

P

Cdc14

Page 27: Regulace mitosy a replikace DNA

Mitotic exit network (MEN) a role Cdc14, Cdc15 ...

• CDC14: dual specifity protein phosphatase.

• až do anafáze inaktivní, v jadérku, vázána na inhibitor Cfi1/Net1

• uvolnění fosforylací inhibitoru

kináza

kináza

fosfatáza

GTPázaGAP GEF

Page 28: Regulace mitosy a replikace DNA
Page 29: Regulace mitosy a replikace DNA

Fourteen Early Anaphase Release (FEAR) network.

• Role v přechodné aktivaci Cdc14 v časné anafázi

• zahrnuje opět Polo kinázy

Page 30: Regulace mitosy a replikace DNA
Page 31: Regulace mitosy a replikace DNA

P.S.: co degraduje CLN?

Page 32: Regulace mitosy a replikace DNA

Replikace DNA

a její regulace

Page 33: Regulace mitosy a replikace DNA

Regulace replikace spřažena s transkripcí!

... což není překvapující (předn. 4)

(histony, RNR etc.)

Page 34: Regulace mitosy a replikace DNA

Klíčovou úlohu mají replikační počátky.

Proč se počátky replikují právě jednou za cyklus?

Page 35: Regulace mitosy a replikace DNA

ARS versus počátek replikace in vivoPřímá vizualizace: DNA combing(Lebofsky and Bensimon 2002)

autonomous replicatingsequence

Page 36: Regulace mitosy a replikace DNA

... ale jde to i méně sofistikovaně

1. - EtBr2. + EtBr

(Fangman et al.)

Page 37: Regulace mitosy a replikace DNA

Každý ORI má své cykliny

G1 S G2 M"start"

Cln3

Cln1,2

Clb5,6

Clb3,4

Clb1,2

Model of the Ability of B-Type Cyclins to Promote S Phase and Activate Replication Origins(A), (B), and (C) show time lines (not to scale) representing the cell cycle in CLB, clb5, and clb5 clb6 strains, respectively. Arrows indicate the time of bud emergence during the cell cycle, and the duration of S phase in each case is drawn as an open box. Firing of the various replication origins is shown by shaded circles. Light shading represents origins activated early in S phase, and darker shading those origins activated later. Hatched bars represent the proposed capability of different Clb-Cdk1p activities to promote timely firing of early and late replication origins.

(Donaldson et al. 1998)

Page 38: Regulace mitosy a replikace DNA

Trvání eukaryotního BC - příklady

• Saccharomyces - v bohatém médiu 1,5-2 h• Drosophila: 6 min až 10 hod

M S

6 min 10 h

M M

S

SG2

G2 G1

... zde používány specifické embryonální ORI!

Page 39: Regulace mitosy a replikace DNA

Replikační počátek váže řadu proteinů

(DePamphilis 2003)

Page 40: Regulace mitosy a replikace DNA

Cdc6 (S. cer.), cdc18+ (S.p.)

Mutace S. cerevisiae S. pombe

t.s. G1 arrest G1 arrest

overexprese „overreplication“

delece „haploidní mitosa“

(S. Piatti et al.)... a exprese je regulovaná

Page 41: Regulace mitosy a replikace DNA

Haploidní mitosa v buňkách bez Cdc6

Page 42: Regulace mitosy a replikace DNA

Chromosomy se rozcházejí náhodně!

(Piatti et al., EMBO J. 1995)

Page 43: Regulace mitosy a replikace DNA

Je Cdc6 „licensing factor“?

(Rao and Johnson)

Page 44: Regulace mitosy a replikace DNA

Cdc6 jakožto transientní „licensing factor“

Page 45: Regulace mitosy a replikace DNA

Je Cdc6 jedinou překážkou rereplikace?

APC???

(Piatti et al. 1997)

Page 46: Regulace mitosy a replikace DNA

Ale to, co se rereplikuje, není jaderná DNA!

Pozor na interpretaci,a na mitochondrie!!

Page 47: Regulace mitosy a replikace DNA

Kontrola replikace: 2 stavy ORC

prereplikační postreplikační

Cdc6, Mcm

S-fáze

anafáze

CLB-CDK

CLB-CDKAPC

Sic1

Cdc34 CLN-CDK