rekayasa genetik penambat gas n2

5
TEKNOLOGI PENAMBATAN GAS N2 UDARA & REKAYASA GENETIK Ir. Sri Sumarsih, MP. Email: [email protected] Weblog: Sumarsih07.wordpress.com Website: agriculture.upnyk.ac.id Materi Kuliah Bioteknologi Pertanian Prodi Agroteknologi Pertemuan Ke 13 resting spore heterocyst 5 µm Penambat Nitrogen di alam LEGUM LICHENES BGA Azolla pinnata Azolla filiculoides ENZIM NITROGENASE Enzim nitrogenase terdiri 2 sub unit protein: a. Mo-Fe Protein, labil terhadap asam b. 2 Fe Protein, sangat sensitif terhadap O 2 Aktivitas reaksi enzim nitrogenase diperlukan: a. substrat N 2 , N 2 O, C 2 H 2 b. Mg +2 dan ATP (sumber energi) c. reduktan: Ferredoksin (Clostridium, Azotobacter, Anabaena), Flavoprotein (Azotobacter), atau Fe-S protein (bakteroid) Reaksi total reduksi N 2 oleh nitrogenase: N 2 +16ATP+8e - +10H + +Mg +2 2NH 4 + +H 2 +16ADP+Pi Fiksasi N 2 dihambat oleh adanya pemupukan NH 4 dan NO 3 serta pH masam Bakteri Penambat Nitrogen Tipe/Sifat Jenis Mikroorganisme Asimbiotik/Asosiasi: Bakteri Aerobik Bakteri Mikroaerofilik Bakteri Fakultatif Bakteri Anaerobik Blue Green Algae/fotosintetik Azotobacter, Beijerinckia Azospirillum, Thiobacillus, Spirillum Bacillus, Escherichia, Pseudomonas Clostridium, Desulfovibrio Nostoc, Anabaena, Rhodospirillum Simbiotik: Bakteri Blue Green Algae Rhizobium-Legum Anabaena azollae-Azolla

Upload: dindra-diyah-amaliya

Post on 08-Nov-2015

31 views

Category:

Documents


15 download

DESCRIPTION

untuk memperoleh enzim nitrogenase

TRANSCRIPT

  • TEKNOLOGI PENAMBATAN GAS N2

    UDARA & REKAYASA GENETIK

    Ir. Sri Sumarsih, MP.Email: [email protected]

    Weblog: Sumarsih07.wordpress.com

    Website: agriculture.upnyk.ac.id

    Materi Kuliah

    Bioteknologi Pertanian

    Prodi AgroteknologiPertemuan Ke 13

    resting spore heterocyst

    5 m

    Penambat Nitrogen

    di alam

    LEGUM LICHENES

    BGA

    Azolla pinnataAzolla

    filiculoides

    ENZIM NITROGENASE Enzim nitrogenase terdiri 2 sub unit protein:

    a. Mo-Fe Protein, labil terhadap asam

    b. 2 Fe Protein, sangat sensitif terhadap O2

    Aktivitas reaksi enzim nitrogenase diperlukan:

    a. substrat N2, N2O, C2H2

    b. Mg+2 dan ATP (sumber energi)

    c. reduktan: Ferredoksin (Clostridium, Azotobacter, Anabaena),

    Flavoprotein (Azotobacter), atau Fe-S protein (bakteroid)

    Reaksi total reduksi N2 oleh nitrogenase:

    N2+16ATP+8e-+10H+ +Mg+2 2NH4

    ++H2+16ADP+Pi

    Fiksasi N2 dihambat oleh adanya pemupukan NH4 dan NO3 serta pH

    masam

    Bakteri Penambat Nitrogen

    Tipe/Sifat Jenis Mikroorganisme

    Asimbiotik/Asosiasi:

    Bakteri Aerobik

    Bakteri Mikroaerofilik

    Bakteri Fakultatif

    Bakteri Anaerobik

    Blue Green

    Algae/fotosintetik

    Azotobacter, Beijerinckia

    Azospirillum, Thiobacillus, Spirillum

    Bacillus, Escherichia, Pseudomonas

    Clostridium, Desulfovibrio

    Nostoc, Anabaena, Rhodospirillum

    Simbiotik:

    Bakteri

    Blue Green Algae

    Rhizobium-Legum

    Anabaena azollae-Azolla

  • KEMAMPUAN BAKTERI SIMBIOTIK

    TANAMAN DLM MEMFIKSASI N2

    TANAMAN

    SIMBION

    Kg N2 /Ha /

    TAHUN

    ALFALFA

    RED CLOVER

    PEA

    SOYBEAN

    COWPEA

    VETCH

    125-335

    85-190

    80-150

    65-115

    65-130

    90-155

    KEMAMPUAN FIKSASI N2NONSIMBIOTIK

    MIKROBA KONDISI HARI ugN/ml

    AZOTOBACTER

    CYLINDROSPERMUM

    KLEBSIELLA

    CLOSTRIDIUM

    CHLOROBIUM

    RHODOSPIRILLUM

    AEROB

    AEROB/CAHAYA

    ANAEROB

    ANAEROB

    ANAEROB/CAHAYA

    ANAEROB/CAHAYA

    3

    55

    2

    10

    5

    10

    1050

    52

    60

    136

    20

    76

    Figure 6.13

    Bakteri penambat nitrogen

    Penambat Nitrogen non-simbiotik:

    -Azotobacter, hidup di rhizosfer tanaman di lahan kering

    -Clostridium, hidup di tanah tergenang/ tanah sawah

    -Azospirillum, hidup di permukaan / dalam akar

    -Cyanobacteria, BGA, hidup di tanah tergenang /tanah sawah

    Penambat Nitrogen simbiotik:

    -Rhizobium- hidup dalam bintil akar leguminosae

    -Anabaena azollae-hidup dalam daun Azolla pinnata

    Teknik Konvensional Pembuatan

    Pupuk Hayati Penambat Gas N2

    Bisakah menanam bakteri penambat N2? Jawabnya tentu bisa

    Mau mencoba?

    Caranya bagaimana?

    Mulai dari isolasi, kultur & perbanyakan

    Untuk apa?

    Untuk pupuk hayati pengganti pupuk N kimia

    Produknya disebut apa?

    Inokulum bakteri penambat nitrogen

  • Isolasi Bakteri

    Penambat N2 Udara

    Bintil akar disterilkan,

    dipecah,

    diambil cairannya

    menggunakan jarum ose

    Ose

    digoreskan

    di atas

    media agar

    Bintil

    akar

    Koloni hasil kultur bintil

    akar yang terpisah

    diambil dengan ose

    Simpan dalam refrigerator

    (almari es tapi bukan di

    freezernya)

    DITANAM DI

    MEDIA AGAR

    MIRING

    Pembuatan

    kultur murni

    Rhizobium

    TEKNIK

    PRODUKSI /

    PERBANYAKAN

    MIKROBA

    SECARA

    SEDERHANA

    Media

    dari

    bahan

    yang

    mudah

    didapat

    Skala

    produksi

    kecil

    menggunakan

    fermentor

    sederhana

    Kultur

    murni

    ditanam

    dalam

    media

    cair

    bifase

    digojok

    Agar hasil lebih banyak

    dari kultur gojok dipindah

    ke fermentor

    dipindah ke

    fermentor sederhana

  • PERBANYAKAN

    BAKTERI

    DENGAN

    TEKNOLOGI

    MODERN

    Starter

    DIPERBANYAK DALAM

    FERMENTOR MODERN

    Kultur murni

    Penggandaan skala produksi

    mikrobaAlur proses pembuatan inokulum bakteri secara industri

    Beberapa

    bentuk

    produk

    inokulumSetelah

    bakteri

    diperbanyak

    dicampur

    dengan

    carrier

    Rekayasa Genetik Bakteri

    Penambat N2 Gen yang mengkode penambatan N2

    disebut gen nif (nitrogen fixation)

    Gen nif bisa disisipkan pada organisme

    lain dengan ekspresi mampu menambat

    gas N2

    Untuk memberi kemampuan menambat

    gas N2 pada bakteri lain atau untuk

    membuat tanaman mampu menambat gas

    N2 dari udara

    Organisasi Gen nif

    Gen nif pada kromosom bakteri Klebsiella

    terdiri atas 17 gen:

    - Sintesis FeMoCo kofaktor (nif B)

    - Sintesis protein nitrogenase (K genes)

    - Pengaturan (nif A)

  • Proses rekayasa genetik pada

    prokariotSkema genetic engineering untuk

    pengembangan tanaman penambat gas N2

    Step I:

    DNA plasmid disisipi gen penanda (gen ketahanan

    thd antibiotik)

    Step II

    DNA plasmid disambung dg gen nif

    Step III

    Plasmid dimasukkan ke sel bakteri Agrobacterium

    tumefaciens, kmdn plasmid dimasukkan ke dlm

    sel tanaman