rekayasa genetik penambat gas n2
DESCRIPTION
untuk memperoleh enzim nitrogenaseTRANSCRIPT
-
TEKNOLOGI PENAMBATAN GAS N2
UDARA & REKAYASA GENETIK
Ir. Sri Sumarsih, MP.Email: [email protected]
Weblog: Sumarsih07.wordpress.com
Website: agriculture.upnyk.ac.id
Materi Kuliah
Bioteknologi Pertanian
Prodi AgroteknologiPertemuan Ke 13
resting spore heterocyst
5 m
Penambat Nitrogen
di alam
LEGUM LICHENES
BGA
Azolla pinnataAzolla
filiculoides
ENZIM NITROGENASE Enzim nitrogenase terdiri 2 sub unit protein:
a. Mo-Fe Protein, labil terhadap asam
b. 2 Fe Protein, sangat sensitif terhadap O2
Aktivitas reaksi enzim nitrogenase diperlukan:
a. substrat N2, N2O, C2H2
b. Mg+2 dan ATP (sumber energi)
c. reduktan: Ferredoksin (Clostridium, Azotobacter, Anabaena),
Flavoprotein (Azotobacter), atau Fe-S protein (bakteroid)
Reaksi total reduksi N2 oleh nitrogenase:
N2+16ATP+8e-+10H+ +Mg+2 2NH4
++H2+16ADP+Pi
Fiksasi N2 dihambat oleh adanya pemupukan NH4 dan NO3 serta pH
masam
Bakteri Penambat Nitrogen
Tipe/Sifat Jenis Mikroorganisme
Asimbiotik/Asosiasi:
Bakteri Aerobik
Bakteri Mikroaerofilik
Bakteri Fakultatif
Bakteri Anaerobik
Blue Green
Algae/fotosintetik
Azotobacter, Beijerinckia
Azospirillum, Thiobacillus, Spirillum
Bacillus, Escherichia, Pseudomonas
Clostridium, Desulfovibrio
Nostoc, Anabaena, Rhodospirillum
Simbiotik:
Bakteri
Blue Green Algae
Rhizobium-Legum
Anabaena azollae-Azolla
-
KEMAMPUAN BAKTERI SIMBIOTIK
TANAMAN DLM MEMFIKSASI N2
TANAMAN
SIMBION
Kg N2 /Ha /
TAHUN
ALFALFA
RED CLOVER
PEA
SOYBEAN
COWPEA
VETCH
125-335
85-190
80-150
65-115
65-130
90-155
KEMAMPUAN FIKSASI N2NONSIMBIOTIK
MIKROBA KONDISI HARI ugN/ml
AZOTOBACTER
CYLINDROSPERMUM
KLEBSIELLA
CLOSTRIDIUM
CHLOROBIUM
RHODOSPIRILLUM
AEROB
AEROB/CAHAYA
ANAEROB
ANAEROB
ANAEROB/CAHAYA
ANAEROB/CAHAYA
3
55
2
10
5
10
1050
52
60
136
20
76
Figure 6.13
Bakteri penambat nitrogen
Penambat Nitrogen non-simbiotik:
-Azotobacter, hidup di rhizosfer tanaman di lahan kering
-Clostridium, hidup di tanah tergenang/ tanah sawah
-Azospirillum, hidup di permukaan / dalam akar
-Cyanobacteria, BGA, hidup di tanah tergenang /tanah sawah
Penambat Nitrogen simbiotik:
-Rhizobium- hidup dalam bintil akar leguminosae
-Anabaena azollae-hidup dalam daun Azolla pinnata
Teknik Konvensional Pembuatan
Pupuk Hayati Penambat Gas N2
Bisakah menanam bakteri penambat N2? Jawabnya tentu bisa
Mau mencoba?
Caranya bagaimana?
Mulai dari isolasi, kultur & perbanyakan
Untuk apa?
Untuk pupuk hayati pengganti pupuk N kimia
Produknya disebut apa?
Inokulum bakteri penambat nitrogen
-
Isolasi Bakteri
Penambat N2 Udara
Bintil akar disterilkan,
dipecah,
diambil cairannya
menggunakan jarum ose
Ose
digoreskan
di atas
media agar
Bintil
akar
Koloni hasil kultur bintil
akar yang terpisah
diambil dengan ose
Simpan dalam refrigerator
(almari es tapi bukan di
freezernya)
DITANAM DI
MEDIA AGAR
MIRING
Pembuatan
kultur murni
Rhizobium
TEKNIK
PRODUKSI /
PERBANYAKAN
MIKROBA
SECARA
SEDERHANA
Media
dari
bahan
yang
mudah
didapat
Skala
produksi
kecil
menggunakan
fermentor
sederhana
Kultur
murni
ditanam
dalam
media
cair
bifase
digojok
Agar hasil lebih banyak
dari kultur gojok dipindah
ke fermentor
dipindah ke
fermentor sederhana
-
PERBANYAKAN
BAKTERI
DENGAN
TEKNOLOGI
MODERN
Starter
DIPERBANYAK DALAM
FERMENTOR MODERN
Kultur murni
Penggandaan skala produksi
mikrobaAlur proses pembuatan inokulum bakteri secara industri
Beberapa
bentuk
produk
inokulumSetelah
bakteri
diperbanyak
dicampur
dengan
carrier
Rekayasa Genetik Bakteri
Penambat N2 Gen yang mengkode penambatan N2
disebut gen nif (nitrogen fixation)
Gen nif bisa disisipkan pada organisme
lain dengan ekspresi mampu menambat
gas N2
Untuk memberi kemampuan menambat
gas N2 pada bakteri lain atau untuk
membuat tanaman mampu menambat gas
N2 dari udara
Organisasi Gen nif
Gen nif pada kromosom bakteri Klebsiella
terdiri atas 17 gen:
- Sintesis FeMoCo kofaktor (nif B)
- Sintesis protein nitrogenase (K genes)
- Pengaturan (nif A)
-
Proses rekayasa genetik pada
prokariotSkema genetic engineering untuk
pengembangan tanaman penambat gas N2
Step I:
DNA plasmid disisipi gen penanda (gen ketahanan
thd antibiotik)
Step II
DNA plasmid disambung dg gen nif
Step III
Plasmid dimasukkan ke sel bakteri Agrobacterium
tumefaciens, kmdn plasmid dimasukkan ke dlm
sel tanaman