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REPHY : point sur la demande de labellisation pour le micro-phytoplancton Etat de la collaboration avec SOMLIT-RESOMAR Catherine Belin Ifremer, Nantes

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Page 1: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

REPHY : point sur la demande de labellisation pour le micro-phytoplancton

Etat de la collaboration avec

SOMLIT-RESOMAR

Catherine Belin Ifremer, Nantes

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REPHY : définitions

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• REPHY : Réseau d’Observation et de Surveillance du Phytoplancton et des Phycotoxines • Couverture nationale dans les domaines suivants

� la biologie (phytoplancton) � l’hydrologie (mesures physico-chimiques) � la biochimie (phycotoxines)

• Réseau d’Observation � séries temporelles pérennes, échantillonnage régulier toute l’année,

fréquence élevée, nombreux paramètres mesurés, phyto total

• Réseau de Surveillance � complète réseau observation pour répondre à la DCE et à la

DCSMM, contraintes moindres

• Phycotoxines : en cours d’externalisation

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REPHY 2016

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• REPHY : Réseau d’Observation et de Surveillance du Phytoplancton et des Phycotoxines

� la biologie (phytoplancton) � l’hydrologie (mesures physico-chimiques) � la biochimie (phycotoxines)

• Réseau d’Observation • Réseau de Surveillance • Phycotoxines : en cours d’externalisation

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REPHY : champ de la labellisation

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Demande de labellisation restreinte • au phytoplancton–flores totales seulement

� identification et dénombrement de tous les taxons identifiables en microscopie optique

• à certaines séries de données

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REPHY Observation 2016

37 points Observation dont 16 séries phytoplancton > 20 ans

- phytoplancton (flores totales : tous taxons) - chlorophylle-a - température - salinité - turbidité - oxygène dissous - nutriments

- + pigments sur certains points en 2016

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REPHY : proposition labellisation mars 2015

13 points proposés pour labellisation phyto parmi les 37 points Observation

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Séries proposées à la labellisation : critères

• Parmi les plus pertinentes vis-à-vis des quatre objectifs de recherche identifiés par Hernandez-Farinas (thèse, 2015) • 1. analyser les réponses aux changements environnementaux • 2. reconnaitre les niches écologiques et les habitats • 3. détecter les variations de phénologie • 4. caractériser les traits et groupes fonctionnels

• Les séries proposées répondent à l’un et/ou l’autre de ces

quatre objectifs

• Seules les données phytoplancton ont été prises en compte

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Séries proposées pour une labellisation

• Entente préalable entre Ifremer Port en Bessin et Université de Caen - Points non redondants

• Série REPHY phytoplancton • depuis 2002

Luc sur mer

Point SOMLIT

Point REPHY

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Séries proposées pour une labellisation

• Séries REPHY phytoplancton

• St Cast – Les Hébihens : 1987-2004 – puis depuis 2007 • Bréhat – Loguivy : 1987-2004 – puis depuis 2007

Point REPHY

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Séries proposées pour une labellisation

• Séries REPHY phytoplancton • Kervel + Kervel large : depuis 1987 • Men Du + Concarneau large : depuis 1992

Brest Ste Anne

Point SOMLIT

Point REPHY

Brest Lanvéoc

Roscoff

Entente entre Ifremer Concarneau et Station Marine Roscoff point REPHY St Pol large non retenu pour labellisation, car SOMLIT-Roscoff points REPHY rade de Brest non retenus pour labellisation, car deux points SOMLIT

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Séries proposées pour une labellisation

• Séries REPHY phytoplancton • Men er Roué et Ouest Loscolo : depuis 1987 • un observateur unique jusqu’en 2015

Point REPHY

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Séries proposées pour une labellisation

• Redondance entre REPHY - Le Cornard et SOMLIT - La Rochelle ?

• Séries REPHY phytoplancton • Le Cornard : depuis 1987 • Auger : depuis 1999

La Rochelle

Point SOMLIT

Point REPHY

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Séries proposées pour une labellisation

• Entente préalable entre Ifremer Arcachon et Station Marine d’Arcachon - Points non redondants

• Série REPHY phytoplancton • Teychan + Teychan bis : depuis 1987 • un observateur unique jusqu’en 2011

Arcachon

Point SOMLIT

Point REPHY

Page 14: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Séries proposées pour une labellisation

• Séries REPHY phytoplancton • Parc Leucate 2 : depuis 1987 • Barcares : depuis 1989

• un observateur unique jusqu’à

maintenant

Point REPHY

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Séries proposées pour une labellisation

• Accord entre Ifremer Sète et Université de Montpellier - Points non redondants • Série REPHY phytoplancton

• Bouzigues (a) : depuis 1987 • un observateur unique jusqu’à maintenant

Sète

Point SOMLIT

Point REPHY

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Séries proposées pour une labellisation

Marseille

Point SOMLIT

Toulon

Villefranche

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Justifications pour une labellisation des séries de données phytoplancton

du REPHY

Page 18: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Justification scientifique

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Phytoplancton : élément fondamental de la biodiversité marine • Physico-chimie + nutriments : indispensables pour l’explication des évolutions

biologiques • des données décisives pour

� caractériser les écosystèmes marins � décrire le fonctionnement des réseaux trophiques � mettre en évidence l’impact des changements globaux (changements climatiques et

pressions anthropiques) � évaluer la qualité des eaux marines

• Les problématiques scientifiques bénéficient de longues séries temporelles sur de nombreux sites littoraux soumis à des pressions environnementales et anthropiques contrastées

• A l’inverse les approches en écologie du phytoplancton amènent à faire évoluer les dispositifs d’observation • cette association entre recherche et observation s’inscrit dans un cercle vertueux :

les méthodes innovantes augmentent la quantité et la qualité des infos disponibles

Page 19: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Positionnement international

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Participation à des GT internationaux, par exemple • ICES/WGPME (WG on Phytoplankton and Microbial Ecology)

� analyse comparative des séries temporelles phytoplancton dans l’Atlantique nord, en relation avec les changements climatiques

� autre objectif à court terme : mettre en relation les séries temporelles de zooplancton et de phytoplancton

Page 20: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Crédibilité scientifique des équipes

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Crédibilité validée par la dernière évaluation AERES

• Parmi les points forts : • VIGIES (Nantes) : Compétences SI (Quadrige²) et biostatistique,

site WEB Environnement Littoral, valorisation des données, coordination REPHY

• PELAGOS (Brest) : compétences pluridisciplinaires, très investi dans algues toxiques, expertise paramètres hydro, nombreuses publis

• LERs (12 implantations) : plateau technique performant, bonne structuration, travail en réseau, rôle de sentinelle et d’interface, implication dans des programmes de recherche sur phyto

Page 21: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Démarche qualité

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Sur l’ensemble de la chaîne prélèvements-analyses-bancarisation en accord avec les protocoles internationaux et les normes quand ils existent, sinon procédures qualité internes en cohérence avec :

• ISO/IEC 17025:2005 - Exigences générales concernant la compétence des laboratoires d'étalonnages et d'essais

• Norme NF EN 15972:2011 – Guide pour l’étude quantitative et qualitative du phytoplancton marin

• Norme NF EN 15204:2006 – Norme guide pour le dénombrement du phytoplancton par microscopie inversée (méthode Utermöhl)

• Participation Ifremer à la rédaction de la norme en cours sur « Echantillonnage du phytoplancton dans les eaux intérieures et les eaux littorales »

• Accréditations pour nutriments • Intercalibrations et EIL

• Chloro et nutriments : assurés par Ifremer / PELAGOS • Phyto : BEQUALM

• Formations régulières • Qualification des données

• Processus de qualification mis en œuvre pour attribuer un niveau de qualité à chaque donnée (Bon, Douteux ou Faux)

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Mise à disposition des données

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Quadrige² : SI national et inter-opérable • SI national de référence pour l’environnement littoral (MEDDE) • inter-opérable

� s’appuie sur référentiels mondiaux (WoRMS) ou nationaux (SANDRE) � compatible avec SI européens (EMODNET, SeaDataNet)

• Mise à disposition données brutes de Q² par l’outil SURVAL • http://www.ifremer.fr/surval2/

� données + couches cartographiques

• Fourniture de données, par ex • CIEM - OSPAR • AEE • DCE (GIGs) • DCSMM

• Mise à disposition dans BD internationales • OBIS, EMODNET, SeaDataNet

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Exploitation et valorisation des données

• Nombreux produits de synthèse (produits WEB, rapports, bulletins

• Thèses et publications • Plus de 50 articles publiés dans revues à comité de lecture, utilisant les données

du REPHY • Thèse (2003) : Isabelle Gailhard-Rocher

� Analyse de la variabilité spatio-temporelle des populations micro-algales côtières observées par le REPHY

• Thèse (2015) : Tania Hernandez-Farinas � Analyse et modélisation des évolutions à long terme de la biodiversité

phytoplanctonique dans les zones côtières sous l’effet des pressions environnementales et anthropiques

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Principales collaborations

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• Université de Mons - Belgique � outil FlowCAM / ZooPhytoImage

• CNRS-ULCO-LOG Wimereux � cytométrie en flux, fluorimétrie spectrale, etc � DYMAPHY, projet européen INTERREG IV A

• Université de Caen � cytométrie en flux, etc

• CNRS Roscoff) � projets de recherche communs avec Ifremer Brest sur la diversité génétique du phyto � formations communes RESOMAR-REPHY en taxinomie du phytoplancton

• Muséum National d’Histoire Naturelle • Station marine d’Arcachon • Université de Montpellier • CNRS de Villefranche • etc

Page 25: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Perspectives REPHY 2016 nouvelles mesures, nouvelles méthodes

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Nouvelles mesures 2016

Points REPHY Observation

- analyses pigmentaires sur certains points dès janvier 2016

- étude sur faisabilité mesures de cytométrie en flux en routine sur certains points

- acquisition d’échantillons pour étude sur biodiversité génétique (un ou deux points)

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Nouvelle méthode d’observation du phyto

Colloque RESOMAR, Montpellier, 18 novembre 2015 - Labellisation REPHY - Catherine Belin, Ifremer

• outil FlowCAM / ZooPhytoImage • système couplé de numérisation et d’analyse semi-automatique

d’images pour l’identification et le dénombrement du micro-phytoplancton

• Matériel : FlowCAM • Logiciel : ZooPhytoImage (Ph. Grosjean, Univ. Mons, Belgique) • Financement 2013-2015 : ONEMA

Page 28: REPHY : point sur la demande de labellisation pour le

Merci

Photos phytoplancton : Nadine Neaud-Masson