RNAi y siRNA

Joel Salazar-MendiguchíaMódulo Genómica y Proteómica

Máster en Genética AvanzadaUniversitat Autónoma de Barcelona

Definición

• Proceso de regulación génica secuencia-específico, desencadenado por RNA bicatenario

• Mecanismo altamente conservado entre eucariotas

• Importancia biológica (respuesta celular inmune a infecciones, estabilidad genética, desarrollo, etc)

• Diversas clases de RNA reguladores pequeños (20-30 nt), algunos de los cuales comparten biogénesis y vías

Small RNAs and silencing

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PUBLICACIONES EN REVISTAS INDEXADAS(RNAi, siRNA, miRNA)

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Historia

Historia…

Control negativo

Antisense mex-3

Wildtype

dsRNA mex-3

RNA silencing pathways

Utilidades

RNAiMedicina

BiotecnologíaGenómica Funcional/

”Knockdowns”

Estrategias de “entrega” in vivo

Estrategias no virales

Estrategias virales

Limitaciones

• Estabilidad de los dsRNA (ribonucleasas)• Vida media corta• Respuesta inmune inespecífica• Off-Target Effects (OTEs – específicos y

generales)• ¿Efectos adversos serios?• ¿Mejor vía de administración?

¡ ¡ ¡ G R A C I A S ! ! !

Bibliografía• Fire AG, Xu S, Montgomery MK, et al. Potent and specific genetic interference by

double-stranded RNA in Caenorrhabditis elegans. Nature. 1998, 291: 806-811• Scherr M, Morgan M, Eder M. Gene Silencing Mediated by Small Interfering

RNAs in Mammalian Cells. Current Med Chem. 2003, 10: 245-256• Jinek M, Doudna J. A three-dimensional view of the molecular machinery of

RNA interference. Nature. 2009, 457: 405-412• Castanotto D, Rossi J, The promises and pitfalls of RNA-interference-based

therapeutics. Nature. 2009, 457: 426-433• Siomi H, Siomi M. On the road to reading the RNA-interference code. Nature.

2009, 457:396-404• Moazed D. Small RNAs in transcriptional gene silencing and genome defence.

Nature. 2009, 457: 413-420 • Pfeffer S, Meister G, Landthaler M. RNA silencing. B.I.F Futura 2005, 20:83-91• Vázquez-Ortíz, Piña P, Salcedo M. Grandes alcances de los RNAs pequeños RNA

de interferencia y microRNA. Rev Inv Clin. 2006, 58: 335-349