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L-102-5 Sil-Best Destain Kit Sil-Best Destain Kit は、銀染色後のタンパク質からの銀の除去が可能で、タンパク質の質量分析などのアプリケー ションに適用が可能です。また、過剰な銀染色を改善しますので、貴重なサンプルを有効に活用できます。 特 長 銀染色後のタンパク質から銀を除去することで、質量分析の前処理に適応可能 SDS-PAGE 後の過剰な銀染色を改善 適用例 ■質量分析(MS)への応用例 kDa 105 75 50 35 30 25 15 10 A B 電気泳動像(Sil-Best Stain One 染色) 泳動ゲル:SDS-15% ポリアクリルアミドゲル サンプル:① 分子量マーカー ②Cytochrome C(分子量12,000) ③Albumin(分子量67,000) 濃度 1 μg /μL のサンプルを 各レーン 10 μL アプライ 銀染色 :Sil-Best Stain One バンド B の MS スペクトルデータ バンド A の MS スペクトルデータ プロトコール概要 1. SDS-PAGE 2. 銀染色(Sil-Best Stain One) 3. ゲルの切り出し 4. 脱色(Sil-Best Destain Kit) 5. 脱水 6. 還元アルキル化 7. トリプシン消化 8. ペプチド抽出 9. ZipTip® (メルク株式会社メルクミリポア 事業本部)精製 10. ESI-MS データご提供:京都大学大学院 農学研究科 応用生命科学専攻 植田 充美 教授 / 森坂 裕信 研究員

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Page 1: Sil-Best Destain KitSil-Best Stain One - SP 冷蔵 06865-81 1 set 11,000 Sil-Best Stain-Neo for Protein and Nucleic Acid/PAGE - SP 冷蔵 05773-11 1 set 14,000 30(w/v)%-Acrylamide/Bis

L-102-5

Sil-Best Destain KitSil-Best Destain Kit は、銀染色後のタンパク質からの銀の除去が可能で、タンパク質の質量分析などのアプリケーションに適用が可能です。また、過剰な銀染色を改善しますので、貴重なサンプルを有効に活用できます。

特 長 ● 銀染色後のタンパク質から銀を除去することで、質量分析の前処理に適応可能● SDS-PAGE 後の過剰な銀染色を改善

適用例 ■ 質量分析(MS)への応用例

① ② ③kDa

1057550

3530

25

15

10 A

B

電気泳動像(Sil-Best Stain One 染色)

泳動ゲル:SDS-15% ポリアクリルアミドゲルサンプル:① 分子量マーカー     ② Cytochrome C(分子量 12,000)     ③ Albumin(分子量 67,000)     濃度 1 μg /μL のサンプルを     各レーン 10 μL アプライ銀染色 :Sil-Best Stain One

バンドBのMSスペクトルデータバンドAのMSスペクトルデータ

プロトコール概要

1. SDS-PAGE  ↓2. 銀染色(Sil-Best Stain One)  ↓3. ゲルの切り出し  ↓4. 脱色(Sil-Best Destain Kit)  ↓

5. 脱水  ↓6. 還元アルキル化  ↓7. トリプシン消化  ↓8. ペプチド抽出  ↓

9. ZipTip®(メルク株式会社メルクミリポア事業本部)精製

  ↓10. ESI-MS

データご提供:京都大学大学院 農学研究科 応用生命科学専攻 植田 充美 教授 / 森坂 裕信 研究員

Page 2: Sil-Best Destain KitSil-Best Stain One - SP 冷蔵 06865-81 1 set 11,000 Sil-Best Stain-Neo for Protein and Nucleic Acid/PAGE - SP 冷蔵 05773-11 1 set 14,000 30(w/v)%-Acrylamide/Bis

実施例 1 ■ 適正な銀染色像と脱色した像の比較

条件泳動ゲル:SDS-12%ポリアクリルアミドゲルサンプル:大腸菌抽出タンパク質銀染色 :Sil-Best Stain One

過剰な銀染色像

適正な銀染色像

脱色操作(トータル時間 55 分)

脱色した像

この例のように過剰な銀染色を改善できますので、貴重なサンプルが有効に活用できます。また、脱色後時間が経過してもほとんど像の変化はありません。

実施例 2 ■ 二次元電気泳動ゲルの脱色例

条件:一次元目:Immobiline pH3-10(GEヘルスケア)二次元目:SDS-12%ポリアクリルアミドゲル(ラージゲル)サンプル :HL-60細胞抽出タンパク質銀染色 :Sil-Best Stain One

脱色

過剰な銀染色像 脱色した像

注)実施例 1、2 の過剰な銀染色像は敢えて現像時間を大幅に延長し、バックグランドを上げています。通常 Sil-Best Stain One を用いると、低バックグランドの鮮明な染色が出来ます。

Page 3: Sil-Best Destain KitSil-Best Stain One - SP 冷蔵 06865-81 1 set 11,000 Sil-Best Stain-Neo for Protein and Nucleic Acid/PAGE - SP 冷蔵 05773-11 1 set 14,000 30(w/v)%-Acrylamide/Bis

他社比較

脱色操作(トータル時間 87 分)

脱色操作(トータル時間 55 分)

条件泳動ゲル:SDS-12%ポリアクリルアミドゲルサンプル:大腸菌抽出タンパク質銀染色 :Sil-Best Stain One

Sil-Best Destain Kit で脱色 A社製品で脱色

この例では脱色操作時間も短く、鮮明な脱色像が得られています。

注)過剰な銀染色像は敢えて現像時間を大幅に延長し、バックグランドを上げています。通常 Sil-Best Stain One を用いると、低バックグランドの鮮明な染色が出来ます。

プロトコール ■ プロトコール 1(銀染色後のバンドから銀を除去する場合)

<試薬調製方法>脱色液 1:キットA液 10 μL + キットB液 10 μL + 精製水 180 μL

<脱色操作>

100 μL の脱色液 1を加え、脱色されるまで(10 分程度)振とう

脱色液を除去 → 精製水 500 μLを加え、15 分振とうし、除去(× 3回)

必要に応じて処理(プロテアーゼ処理など)を行い、MSなどのアプリケーションへ

タンパク質が検出されたゲルを切り出し、エッペンドルフチューブなどに移す

②脱色

③洗浄

④アプリケーション

①ゲルの切り出し

■ プロトコール 2(過剰な染色像からの最適化:ミニゲル 10 cm × 10 cm × 1 mm)

<試薬調製方法>ゲルサイズやトレイサイズにより、試薬の調製量は変わります。ゲルが十分浸る量を調製してください。

注)少しだけバックグランドを下げたい場合は、A液、B液の量を減らしてください。

脱色液 2:キットA液 200 μL + キットB液 200 μL + 精製水 50 mL停止液 :酢酸 10 mL + 精製水 90 mL

<脱色操作>

トレイに脱色液 2をゲルが十分浸る程度加え、振とうさせ約 5~ 60 分脱色注)過剰な脱色が行われないように、最適と思われる状態より少し手前で脱色を停止

トレイから脱色液 2を除去し、停止液に15分浸す

トレイから停止液を除去し、100 mL 以上の精製水で 5~ 10 分程度洗浄

トレイに精製水を100 mL 加え、過剰に染色されたゲルを破損しないように浸す→ 5分穏やかに振とうし、精製水を除去 → もう一度繰り返す

②脱色

③脱色停止

④洗浄

①洗浄

Page 4: Sil-Best Destain KitSil-Best Stain One - SP 冷蔵 06865-81 1 set 11,000 Sil-Best Stain-Neo for Protein and Nucleic Acid/PAGE - SP 冷蔵 05773-11 1 set 14,000 30(w/v)%-Acrylamide/Bis

ご注意 試験・研究用以外には使用しないでください。

ナカライテスク株式会社〒 604-0855 京都市中京区二条通烏丸西入東玉屋町 498

■販売取扱店

1811

Web site https://www.nacalai.co.jp/

0 1 2 0 - 4 8 9 - 5 5 2価格 ・納期のご照会製品に関する技術的なご照会 https://www.nacalai.co.jp/ss/Contact/

TEL:075-211-2703

試  薬 は こ こ に

キット内容 試薬名 容量 数量A 液 5 mL 1B 液 5 mL 1

使用回数 ① 銀染色後のバンドから銀を除去する場合 : 500 ~ 1,000 サンプル分② 過剰な染色像を最適化する場合 : ミニゲル(10 cm × 10 cm × 1 mm)約 25 回分

価格表

製品名 規格 貯法 製品番号 容量 価格Sil-Best Destain Kit SP 冷蔵 07983-30 1 kit 7,500

関連製品

アクリルアミド / ビス混合液使用方法概略:使用するゲルのアクリルアミド%濃度により、関連製品を混合し、ゲルを作成参考として実施例で使用した 12%ゲルの作成割合を示します。他の濃度のゲル、濃縮ゲル作成の場合、40%アクリルアミド / ビス混合液を使用の場合は、製品添付文書を参考にしてください。

12% ゲル作製

液名 製品番号作製ゲル量

(10 mL)(20 mL)(30 mL)精製水 - 3.4 6.8 10.230(w/v)% アクリルアミド / ビス混合液 06144 or 06141 4.0 8.0 12.0 分離ゲル調製用緩衝液 30651 2.5 5.0 7.5 10(w/v)% ペルオキソ二硫酸アンモニウム溶液 02634 0.1 0.2 0.3N,N,N',N'- テトラメチルエチレンジアミン 33401 0.006 0.012 0.018

関連製品価格表

製品名 毒劇物 規格 貯法 製品番号 容量 価格Sil-Best Stain One - SP 冷蔵 06865-81 1 set 11,000Sil-Best Stain-Neo for Protein and Nucleic Acid/PAGE - SP 冷蔵 05773-11 1 set 14,00030(w/v)%-Acrylamide/Bis Mixed Solution(37.5:1) 劇 SP 冷蔵 06144-05 500 mL 10,50030(w/v)%-Acrylamide/Bis Mixed Solution(29:1) 劇 SP 冷蔵 06141-35 500 mL 10,50040(w/v)%-Acrylamide/Bis Mixed Solution(37.5:1) 劇 SP 冷蔵 06121-95 500 mL 13,50040(w/v)%-Acrylamide/Bis Mixed Solution(29:1) 劇 SP 冷蔵 06119-45 500 mL 13,500Separating Gel Buffer Solution(4x) for SDS-PAGE - SP 室温 30651-05 500 mL 8,00010(w/v)%-Ammonium Peroxodisulfate Solution - SP 冷凍 02634-34 10 mL 3,800

N, N, N', N'-Tetramethylethylenediamine - SP 室温33401-72 25 g 1,90033401-14 100 g 4,70033401-85 500 g 15,600

Pre-stained Protein Markers(Broad Range) for SDS-PAGE - SP 冷凍 02525-35 500 μL 16,500Pre-stained Protein Markers(High Range) for SDS-PAGE - SP 冷凍 26039-75 500 μL 16,500

Pre-stained Protein Markers(Low Range) for SDS-PAGE - SP 冷凍28944-74 5 X 100 μL 17,00028941-75 500 μL 16,500

※記載の内容は、'18 年 11 月現在の情報に基づいております。※研究者の皆様のご所属などは、データご提供時の情報に基づいております。※価格に消費税は含まれておりません。