sumber: yuwono, 2006 - staff official site unila |...
TRANSCRIPT
- Daerah DNA yang mengurai bergerak bersama RNApolimerase. Pergerakan ini berakhir ketika RNApolimerase mencapai akhir gen
4. Terminasi : terjadi pada daerah poly A.RNA dan RNA polimerase dilepas dari RNA polyA=S1AAAAAAA.31
Transkripsi pada organisme eukariot
Transkripsi pertama berupa precursor RNA yangselanjutnya diproses menjadi mRNA
c. Asam amino : monomer dari protein ’20 macam’
d. Aminoacyl synthetasetRNA + asam amino --------------→ aminoacyl tRNAe. Peptidyl transferase : biokatalisator pembentukan
ikatan peptidaf. Initiation factor
aminoacyl
sinthetase
KODE GENETIK
Bagaimana basa nitrogen pada DNA (4 macam) dapatdikombinasikan sehingga diperoleh kode spesifik untuk tiapasam amino (20 macam)
Ringkasan penerjemahan kode genetik (berdasar penelitian akhir1950an dan awal 1960an)
1. Kode genetik pada mRNA berupa kodon yang terdiri 3ribonukleotida (triplet)
2. Kode genetik bersifat unambigous : setiap triplet hanyamengkode satu asam amino
3. Kode genetik bersifat degenerate berarti satu asam aminobisa dikode oleh lebih dari satu kodon triplet
Kecuali yaitu met = AUG trp= UGG
4. Kodon mengandung kode start dan stop5. Kode genetik tidak overlap6. Kode genetik bersifat universalSama untuk virus, prokariot dan eukariot
Mengapa kodon berupa triplet?- Jika satu ribonukleotida : A, T, G, C = 41=4- Jika dua ribonukleotida : 42 = 16- Jika tiga ribonukleotida : 43 = 64
Kode genetik pertama ditemukan oleh Nirenberg &Mathaei (1961) : sintesis protein menggunakanhomopolimer RNA percobaan dimungkinkan oleh:
1. Sistem sintesis protein in vitro (cell free)2. Pembuatan mRNA sintetik menggunakan enzim
polynucleotide phosporilaseDalam sintesis protein in vitro, misalnya digunakan
mRNA poly U=UUUUUUU…Asam amino yang diinkorporasikan (disambung)
diketahui dengan cara melabel salah satu asamamino, misalnya 14C fenilalanin kedalam protein
Triplet binding assay (Nirenberg & Leader, 1964)Didasarkan pada pengamatan bahwa jika ribosom
didekatkan dengan sekuen RNA berupa triplet,ribosom akan mengikat sekuen RNA tersebut dantRNA yang membawa asam amino.
Percobaan dilakukan dengan cara menambahkan asamamino radioaktif + tRNA pada kompleks mRNA-ribosom. Inkubasi dilakukan pada filter nitroselulase.
Degenerasi (satu asam amino dikode>1 triplet)Mungkin disebabkan oleh ikatan hidrogen yang kurang
spesifik pada ribonukleotida III pada triplet terhadapantikodon pada tRNA
→ Hipotesis Wobble (hipotesis ‘goyang’) “pemasanganantara kodon/antikodon pada ribonukleotida I dan IIselalu S spesifik, tetapi penyimpangan kecil (Wobble)terjadi pada ribonukleotida III” Ribo nukleotida IIIyang spesifik : AUG=Met
UGG Tryp UGA=stop
Berikut adalah sekuen/urutan tiga ruas DNA padacoding strand /sense strand/utas penyandi. Jikatiga ruas tersebut disambung bisa merupakansuatu coding region suatu gen.
Sekuen I : 5’ AGT GTA AGT GAG TGA 3’
Sekuen II : 5’ GTG AAA GTA GAA 3’
Sekuen III : 5’ ATG TGT TCC ACG 3 ‘
Dengan asumsi tidak terdapat intron, dan pembacaandimulai dari nukleotida paling kiri,
a. Tentukan sekuen mRNA tiga ruas DNA tsb.b. Tentukan urutan asam amino pada protein hasil
translasi