tesis doctoral: regulación de la transcripción de

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PROGRAMA DE DOCTORADO EN INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de citoquinas por la modulación del metabolismo energético y el estrés del retículo endoplasmático en células dendríticas Presentada por Saioa Márquez Piñeiro para optar al grado de Doctora por la Universidad de Valladolid Dirigida por: Dr. Mariano Sánchez Crespo Dra. Mª Nieves Fernández García

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Page 1: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

PROGRAMA DE DOCTORADO

EN INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA

TESIS DOCTORAL:

Regulación de la transcripción de citoquinas por la

modulación del metabolismo energético y el estrés del

retículo endoplasmático en células dendríticas

Presentada por Saioa Márquez Piñeiro

para optar al grado de Doctora por la Universidad de Valladolid

Dirigida por:

Dr. Mariano Sánchez Crespo

Dra. Mª Nieves Fernández García

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Page 3: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

Secretaría Administrativa. Escuela de Doctorado. Casa del Estudiante. C/ Real de Burgos s/n. 47011-Valladolid. ESPAÑA

Tfno.: + 34 983 184343; + 34 983 423908; + 34 983 186471 - Fax 983 186397 - E-mail: [email protected]

Impreso 1T

AUTORIZACIÓN DEL DIRECTOR/A DE TESIS

(Art. 7.2 de la Normativa para la presentación y defensa de la Tesis Doctoral en la UVa)

D. Mariano Sánchez Crespo, con D.N.I. 10777731T, Profesor de Investigación del

CSIC en el Instituto de Biología y Genética Molecular, Dirección a efecto de

notificaciones Calle Sanz y Fores, 3, 47003 Valladolid, e-mail [email protected]

y Dª María Nieves Fernández García, con D.NI. 13914426R, Profesora del

departamento de Bioquímica y Biología Molecular, y Fisiología en la Facultad de

Medicina de la Universidad de Valladolid, como Directores de la Tesis Doctoral

titulada Regulación de la transcripción de citoquinas por la modulación del

metabolismo energético y el estrés del retículo endoplasmático en células

dendríticas realizada por Dª Saioa Márquez Piñeiro alumna del Programa de

Doctorado en Investigación Biomédica autorizan su presentación, considerando

que reúne los criterios de calidad científica suficientes para ser defendida

públicamente en esta Universidad.

Valladolid,...... de........................................ de...............

Los Directores de la Tesis,

Fdo.: Mariano Sánchez Crespo Fdo.: Mª Nieves Fernández García

SR/SRA. PRESIDENTE/A DE LA COMISIÓN DE DOCTORADO

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A la memoria de amatxu

y a mis chicos

“Necesitamos enseñar a que la duda no sea temida,

sino bienvenida y debatida.

No hay problema en decir:`No lo sé´”

Richard Feynman

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AGRADECIMIENTOS

Había pensado saltarme este apartado, no porque no tenga nada que agradecer, sino

porque padezco una extraña aversión a las ñoñerías y además mis dotes prosaicas

dejan bastante que desear. Pero, me han comentado que los agradecimientos es lo

único que se lee todo el mundo y que queda muy feo no ponerlos, así que he decidido

hacer un esfuerzo y ahí van:

A L@S que me abrieron la puerta de su laboratorio y no me han dado más que

facilidades para que consiga terminar esta tesis

A L@S que han compartido poyata y campana y han trabajado mano a mano

conmigo

A L@S que han tomado “el café”, me han amenizado los días y han pasado

ratos de ocio, llamémoslo así, fuera del IBGM

A L@S que me han entretenido en los pasillos, también de otras plantas, y

durante las comidas

A L@S que han coincidido en el laboratorio conmigo y han seguido su camino

A L@S que han contribuido realizando algunas de las técnicas

A L@S que me han sufrido fuera del laboratorio, sobre todo en casa

¡¡ MILLONES DE GRACIAS !!

Esta Tesis no hubiera podido ser sin vosotros.

Ah, y una mención de honor para LA que con esta lleva su enésima tesis

Bueno, pues ya está, no ha sido tan difícil, sólo espero no haberme dejado a nadie

gggg.

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Índice

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Page 11: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

ÍNDICE

3

Abreviaturas 7

Resumen 11

Introducción 15

1. El sistema inmune 17

1.1 Las células dendríticas 20

1.2 Citoquinas implicadas en la polarización de la respuesta inmune 22

La interleuquina 10 22

La interleuquina 23 24

La interleuquina 1β 26

2. Reprogramación metabólica en el sistema inmune 26

2.1 La ruta glucolítica 28

La hexoquinasa 30

La piruvato quinasa 32

2.2 El factor de transcripción HIF1α 33

3. El estrés de retículo endoplasmático 35

3.1 La respuesta a proteínas mal plegadas 36

La rama ATF6α 38

La rama PERK 38

La rama IRE 39

Objetivos 41

Materiales y métodos 45

1. Reactivos 47

2. Cultivos celulares 48

2.1 Obtención de células dendríticas humanas 48

2.2 Obtención de células dendríticas derivadas de médula ósea de ratón 49

3. Análisis de la expresión génica 50

3.1 Extracción del ARN total 50

3.2 Síntesis del ADN complementario 50

3.3 PCR cuantitativa en tiempo real 50

3.4 Análisis del splicing de XBP1 52

3.5 Análisis de las isoformas de la piruvato quinasa 52

3.6 Inmunoprecipitación de la cromatina 52

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ÍNDICE

4

4. Análisis de proteínas 54

4.1 Obtención de extractos celulares para inmunodetecciones (Western Blot) 54

Extractos celulares totales 54

Extractos nucleares y citosólicos 54

Electroforesis en condiciones desnaturalizantes, transferencia a

membranas de nitrocelulosa e inmunodetección 55

4.2 Cross linking de PKM2 56

4.3 ELISA 57

4.4 Microscopía de fluorescencia confocal de barrido láser 57

5. Estudios bioenergéticos 58

6. Medida de lactato 59

6.1 Medida de lactato extracelular 59

6.2 Medida de lactato intracelular 59

7. Medida de la corriente de Ca2+ intracelular 60

8. Análisis estadístico 61

Resultados 63

1. Reprogramación metabólica tras la estimulación de las células

dendríticas 65

1.1 Análisis del mecanismo implicado en la reprogramación metabólica 67

2. Modulación del metabolismo de la glucosa y regulación transcripcional

de la producción de citoquinas en células dendríticas 71

2.1 Efectos de la privación de glucosa 72

Expresión de citoquinas 72

Producción de lactato 73

Efecto del lactato de sodio y de la modulación del flujo de piruvato 75

Implicación de la respuesta a proteínas mal plegadas: el papel de la

rama IRE 77

El papel de las ramas ATF6 y PERK 85

2.2 Efectos de la regulación de la actividad de la PKM2 90

Expresión de citoquinas 91

Producción de lactato 91

Estudios bioenergéticos 92

Conformación y actividad quinasa de la PKM2 94

Page 13: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

ÍNDICE

5

Discusión 97

1. Caracterización de la reprogramación metabólica en células dendríticas 99

2. Modulación del metabolismo de la glucosa y regulación transcripcional

de la producción de citoquinas en células dendríticas 101

2.1 Efectos de la privación de glucosa 101

Implicación de la respuesta a proteínas mal plegadas 105

2.2 Efectos de la regulación de la actividad de la PKM2 109

Conclusiones 113

Bibliografía 117

Anexo I 133

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Abreviaturas

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ABREVIATURAS

9

ADN: Ácido desoxirribonucleico

ADNc: ADN complementario

ARN: Ácido ribonucleico

ARNm: ARN mensajero

Asn: Asparagina

ATF: Factor activador de la transcripción

BCR: Receptor de linfocitos B

BMDC: Célula dendrítica derivada de médula ósea

BiP: Proteína de unión a la inmunoglobulina

BSA: Albúmina sérica bovina

CBP: Proteína de unión a CREB

CD: Célula dendrítica

C/EBP: CCAAT/enhancer-binding protein

CHOP/DDIT3: DNA damage-inducible transcript 3

COX2: Ciclooxigenasa 2

CPA: Célula presentadora de antígeno

CRTC/TORC: cAMP regulated transcriptional transducers of regulated CREB activity

CREB: cyclic AMP response element-binding protein

Ct: Ciclo umbral

DAMP: Patrón molecular asociado a daño

DAPI: 4’,6-diamidin-2-fenilindol dihidroclorhídrico

DCA: Dicloroacetato

DEPC: Dietil-pirocarbonato

DSS: Disuccinimidil suberato

DTT: Ditiotreitol

dNTP: Desoxinucleótido trifosfato

ECAR: Tasa de acidificación extracelular

EDTA: Ácido etilendiaminotetraacético

EEM: Error estándar de la media

EGTA: Ácido etilenebis(oxonitrilo)tetraacético

ERAD: Degradación asociada al retículo endoplasmático

ERSE: Elemento de respuesta a estrés de RE

eIF2α: Factor iniciador de la traducción eucariótica 2α

FADH2: Flavín adenín dinucleótido

FBSi: Suero bovino fetal inactivado

GAPDH: Gliceraldehído fosfato deshidrogenasa

GM-CSF: Factor estimulador de colonias de granulocitos y macrófagos

GSK3β: Glicógeno sintasa quinasa 3β

G-6-P: Glucosa-6-fosfato

HBS: Tampón HEPES salino

HEPES: Ácido N-2-hidroxietilpiperazina-N'-etansulfónico

HIF: Factor inducible por hipoxia

HK: Hexoquinasa

HRE: Elemento de respuesta a hipoxia

IFN: Interferón

IKK: Quinasa de IB

IL: Interleuquina

IRE: Enzima que requiere inositol

IRF3: IFN regulatory factor 3

JAK: Janus kinase

kDa: KiloDalton

LDH: Lactato deshidrogenasa

LPS: Lipopolisacárido bacteriano

MAPK: Mitogen-activated protein kinase

MCT: Transportador de ácidos monocarboxílicos

MHC: Complejo mayor de histocompatibilidad

MPC: Transportador mitocondrial de piruvato

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ABREVIATURAS

10

MSK1: Mitogen and stress activated protein kinase-1

NAD: Nicotin adenin dinucleótido

NF-κB: Nuclear factor -light-chain-enhancer of activated B cells

NK: Célula Natural Killer

NLRP3: NOD-like receptor family, pyrin domain containing 3

OCR: Tasa de consumo de oxígeno

OXPHOS: Fosforilación oxidativa

PAMP: Patrón molecular asociado a patógeno

PBS: Tampón fosfato salino

PCR: Reacción en cadena de la polimerasa

PDH: Piruvato deshidrogenasa

PDK: Piruvato deshidrogenasa quinasa

PHD: Prolil-hidroxilasa

PERK: Protein kinase RNA-like endoplasmatic reticulum kinase

PK: Protein quinasa

PKM: Piruvato quinasa

PPP: Ruta de las pentosas fosfato

PRR: Receptor de reconocimiento de patrones

pb: Pares de bases

qPCR: PCR cuantitativa en tiempo real

RE: Retículo endoplasmático

RIDD: Decaimiento regulado dependiente de IRE1

RIP: Proteolisis intra-membrana regulada

RPMI: Medio Roswell Park Memorial Institute

TCA: Ciclo de los ácidos tricarboxílicos

TCR: Receptor de linfocitos T

Th: Linfocito T colaborador

TLR: Receptor tipo Toll

TRIF: Domain-containing adaptor-inducing interferon β

TRAF2: TNF receptor-associated factor 2

UPR: Respuesta a proteínas mal plegadas

SERCA: ATPasa de calcio del retículo endoplasmático

STAT: Signal transducer and activator of transcription

sXBP1: Proteína de unión a Caja-X

2-DG: 2-desoxi-D-glucosa

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Resumen

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RESUMEN

13

Las células dendríticas (CD) responden a señales procedentes del micro-entorno y

desarrollan funciones fundamentales para la defensa del individuo y la homeostasis

de los tejidos, pero que pueden ser nocivas si no se controlan adecuadamente. Sus

funciones efectoras están íntimamente ligadas a cambios en el metabolismo celular

por lo que la estimulación de las CD por patrones moleculares asociados a patógenos

(PAMP) conduce a una reprogramación metabólica cuya característica más

significativa es el aumento de la glucólisis aerobia que se refleja en la acumulación de

lactato y la acidificación extracelular.

En consonancia con estos cambios, la modulación farmacológica de la glucólisis

influye sobre el patrón transcripcional de manera dependiente del estímulo. Las

investigaciones realizadas hasta la fecha han correlacionado los cambios en la

expresión de citoquinas con las variaciones en los flujos de lactato, pero no se ha

podido explicar suficientemente la magnitud de los cambios transcripcionales

producidos lo que deja abierta la vía a nuevas investigaciones.

La inhibición de la hexoquinasa (HK) con 2-desoxi-D-glucosa (2-DG) aumenta la

transcripción del gen IL23A en respuesta al patrón fúngico zymosan y al

lipopolisacárido bacteriano (LPS), y de forma paralela disminuye la transcripción del

gen IL10 en respuesta al LPS. Además de reducir los niveles de lactato, la 2-DG activa

la respuesta a proteínas mal plegadas (UPR) asociada al estrés de retículo

endoplasmático. La forma en la que las distintas ramas de la UPR influyen en la trans-

activación de IL23A es estímulo-dependiente: La rama IRE1α/sXBP1 está implicada

en respuesta al zymosan, y la rama PERK y el factor de transcripción C/EBPβ en el

caso del LPS. Asimismo, la disminución de la transcripción de IL10 observada en

presencia de 2-DG en respuesta al LPS depende de la activación de PERK.

La modulación de la actividad de la piruvato quinasa (PKM2) con el compuesto ML-

265 disminuye la transcripción de las citoquinas IL-23, IL-10 e IL-1β en respuesta al

zymosan. Dado que no hemos podido caracterizar un patrón metabólico inducido por

el ML-265, estos efectos pueden explicarse por la interferencia del ML-265 con la

actividad proteína quinasa asociada a la PKM2.

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Introducción

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INTRODUCCIÓN

17

1. El sistema inmune

La función principal del sistema inmune es el mantenimiento de la homeostasis de los

tejidos y la integridad del organismo. Para ello posee una serie de elementos

humorales y celulares que intervienen en procesos fisiológicos fundamentales como

el desarrollo, la reproducción y la reparación de los tejidos, y que además son los

encargados de la defensa del organismo frente a diversos agentes (Sattler, 2017).

La respuesta defensiva depende de la capacidad que tienen las células del sistema

inmune para diferenciar “lo infeccioso no propio de lo propio no infeccioso”

(Janeway, 1992). En los mamíferos se distinguen dos modalidades de esta respuesta:

la respuesta innata y la respuesta adaptativa, aunque ambas están estrechamente

relacionadas. La respuesta inmune adaptativa incluye elementos humorales, como los

anticuerpos, y se organiza alrededor de dos clases de células especializadas, los

linfocitos T y los linfocitos B, que exhiben un amplio repertorio de receptores, TCR

(receptor de linfocitos T) y BCR (receptor de linfocitos B), cuya especificidad depende

de reordenamientos génicos que permiten un reconocimiento específico del antígeno

y la eliminación selectiva del patógeno, además de permitir la construcción de una

memoria inmunológica que protege de posibles reinfecciones.

Por el contrario, la inmunidad innata proporciona una respuesta más inmediata y no

específica, que constituye la primera línea de defensa del huésped. Está formada

también por elementos celulares (células epiteliales, monocitos, células dendríticas,

macrófagos, neutrófilos y células Natural Killer [NK]) y sistemas de activación

humorales como los sistemas del complemento, de la coagulación y de la fibrinólisis.

El componente celular está mayoritariamente compuesto por células fagocitarias y

presentadoras de antígenos (CPA). Las CPA, en especial las células dendríticas y los

macrófagos, tienen un papel fundamental en la conexión entre la inmunidad innata y

la adaptativa, ya que son las responsables de procesar y presentar antígenos a los

linfocitos T en el contexto del complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) (Figura

1). En consecuencia, la inmunidad innata tiene la función de iniciar, estimular y

polarizar la respuesta inmune adaptativa con objeto de eliminar el patógeno y

minimizar los daños causados al huésped (Medzhitov, 2007). Para ello, las células

fagocíticas, poseen receptores de reconocimiento de patrones (PRR) que

Page 26: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

18

interaccionan con los patrones moleculares asociados a patógenos expresados en los

microorganismos (Janeway, 1989) y con señales endógenas asociadas al daño tisular

(DAMP) (Matzinger, 1994). Estas moléculas activan distintas vías de señalización

intracelular que conducen a la liberación de citoquinas, quemoquinas, y otros

mediadores, que promueven la eliminación del patógeno y la activación y

polarización de la respuesta inmune adaptativa.

Figura 1. Interconexión entre la inmunidad innata y la adaptativa. Las células presentadoras de

antígenos tienen la capacidad de detectar y reconocer diferentes patógenos a través de sus receptores

de reconocimiento de patrones. Los PRR captan el antígeno para iniciar su procesamiento en pequeños

péptidos que unen a las moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad de clase II expresadas

en su superficie. La respuesta inmune adaptativa comienza con el reconocimiento del antígeno por los

receptores específicos de membrana de las células T. El linfocito T se activa tras reconocer el antígeno

procesado asociado con las moléculas MHC de clase II en la superficie de la CPA con dos consecuencias:

la activación de los linfocitos B por su receptor y su propia diferenciación que dependerá del patrón de

citoquinas secretado por la CPA. Figura adaptada de Cambronero et al., 2017.

Los microorganismos presentan gran cantidad de patrones moleculares asociados a

patógenos que son estructuras muy diversas altamente conservadas a lo largo de la

evolución. Ejemplo de ellos son el lipopolisacárido bacteriano y el zymosan. El LPS

presente en la membrana exterior de las bacterias Gram negativas, está formado por

dos dominios hidrofílicos y un dominio hidrofóbico. Los dominios hidrofílicos son el

núcleo central, que se compone de motivos repetidos de polisacáridos, y el antígeno

O, que es un glucano que se expone al exterior. El dominio hidrofóbico, denominado

lípido A, se compone de seis cadenas de ácidos grasos que lo anclan a la membrana y

Page 27: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

19

es el componente biológicamente activo del LPS. El zymosan es una preparación

insoluble y particulada de la pared celular de la levadura Saccharomyces cerevisiae

que se utiliza desde hace más de 50 años como arquetipo de estímulo fagocítico e

inflamatorio. Se compone de β(1-3) y β(1-6) glucanos, α-mananos, quitinas, proteínas

y lípidos (Figura 2).

Figura 2. Composición del zymosan y del lipopolisacárido bacteriano. El zymosan está compuesto

por un 73% de polisacáridos (de fuera hacia adentro α-mananos, β-glucanos y quitina), un 15% de

proteínas frecuentemente manosiladas y un 7% de lípidos que permanecen en el interior como resto

de la membrana plasmática (Fitzpatrick y DiCarlo, 1964). El LPS está compuesto por un polisacárido

que se expone al exterior (Antígeno O), el oligosacárido nuclear y el Lípido A que contiene

fosfoglucosilmiristamida y ácidos grasos que lo anclan a la membrana.

En la denominada sinapsis fagocítica, varios componentes de la pared celular

interaccionan con distintos PRR, inician el proceso fagocitario y el material englobado

se degrada en los fagolisosomas. Ello permite la liberación de nuevos PAMP (ADN o

ARN), que a su vez pueden activar PRR intracelulares. La integración de las señales de

diferentes PRR durante la fagocitosis induce la liberación de citoquinas y mediadores

lipídicos y la regulación de genes implicados en la respuesta inmune (Blander y

Sander, 2012). De los PRR expresados en las células dendríticas, el LPS es reconocido

por el receptor tipo Toll 4 (TLR4) (Lu, Yeh y Ohashi, 2008), mientras que los

encargados del reconocimiento de los patrones fúngicos son, principalmente, los

receptores lectina tipo C, Dectin-1 que reconoce el componente β-glucano, y Dectin-2

Page 28: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

20

y TLR2 que reconocen el componente constituido por las manosas de la pared

(Brown et al., 2003; Gantner et al., 2003; Dillon et al., 2006).

1.1 Las células dendríticas

Las células dendríticas se identificaron en 1973 por Steinman y Cohn, por su

morfología característica con pseudópodos de gran envergadura que las distinguía de

los macrófagos (Steinman y Cohn, 1973). Las CD se encuentran en los órganos

linfoides secundarios, en la mayoría de los tejidos periféricos y también en órganos

no linfoides, como la piel, los músculos, los pulmones, los riñones, los intestinos o el

hígado. Por ser células presentadoras de antígeno están equipadas con la maquinaria

para capturar y procesar antígenos, presentarlos a los linfocitos T y proporcionar

señales co-estimuladoras (moléculas de membrana y citoquinas) que polarizan la

respuesta inmunitaria (Steinman, 1991).

Las CD son una población heterogénea compuesta de varios subconjuntos distintos:

CD convencionales (cDC), células de Langerhans, células dendríticas plasmocitoides

(pDC) y células dendríticas derivadas de monocitos (moDC). Estos grupos se

separaron inicialmente de acuerdo con su fenotipo de superficie, pero se ha

demostrado que los subconjuntos de CD se pueden distinguir aún más por su

ontogenia y firma transcriptómica (Merad et al., 2013). Cuando se produce una

infección, aparecen en el foco inflamatorio las denominadas células dendríticas

inflamatorias, que se producen a partir de la diferenciación de los monocitos

reclutados al foco inflamatorio (León, López-Bravo y Ardavín, 2007). Estas células

dendríticas inflamatorias aparecen en respuesta a patógenos (Domínguez y Ardavín,

2010) y en enfermedades de base inflamatoria como el asma (Hammad et al., 2010) o

la artritis reumatoide (Campbell et al., 2011). La firma genética de las células

dendríticas inflamatorias es similar a la de las células dendríticas derivadas de

monocitos generadas in vitro (moDC), por lo que éstas serían sus homólogos (Segura

et al., 2013). El proceso de diferenciación de monocitos a células dendríticas se

controla por citoquinas que actúan como factores de crecimiento y diferenciación por

lo que en presencia del factor estimulador de colonias de granulocitos y macrófagos

(GM-CSF) e interleuquina-4 (IL-4) se pueden generar moDC in vitro. Estas células

poseen la capacidad de capturar y procesar antígenos, y presentan en su superficie

Page 29: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

21

altos niveles de MHC, CD1, FcγRII, CD40, complejo B7 (CD80/CD86), CD44, ICAM-1 y

CD11c y escasa expresión de CD14 (Sallusto y Lanzavecchia, 1994).

Cuando entran en contacto con el patógeno, las CD se someten a un programa de

cambios fenotípicos y moleculares denominado "maduración". El proceso de

maduración produce la disminución de la capacidad fagocitaria, la translocación a la

membrana plasmática de moléculas MHC de clase II, la secreción de citoquinas y la

migración hacia los ganglios linfáticos (Banchereau et al., 2000). La presentación de

los péptidos antigénicos en el MHC II a los linfocitos T vírgenes o naive junto con el

patrón de citoquinas liberado por la CD, en función del patógeno detectado, polarizan

la respuesta inmune adaptativa pudiendo diferenciar los linfocitos T colaboradores

(Th) a linfocitos Th1 (León, López-Bravo y Ardavín, 2007; Nakano et al., 2009),

linfocitos Th2 (Kool et al., 2008; Hammad et al., 2010), linfocitos Th17 (Segura et al.,

2013) o linfocitos Treg (Figura 3).

Figura 3. Polarización de la respuesta inmune adaptativa. La activación de las células dendríticas a

través de la mayoría de los TLR induce una robusta producción de IL-12p70 y la inducción de

respuestas Th1. En contraste, algunos ligandos de TLR2 inducen escasa producción de IL-12p70 y

abundante IL-10 por lo que inclinan el equilibrio hacia las respuestas Th2 o Treg. La señalización a

través de Dectin-1 induce la producción de IL-23 que se asocia con la inducción de una respuesta de

tipo Th17. Figura tomada de Pulendran, 2015.

Page 30: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

22

1.2 Citoquinas implicadas en la polarización de la respuesta inmune

Las citoquinas son pequeñas proteínas secretadas por las células del sistema

inmunitario que se unen a receptores de membrana de las células diana y

desencadenan cambios en la expresión génica y en el fenotipo que determinan las

características de la respuesta inmune (Blanco et al., 2008). Las citoquinas se pueden

clasificar por sus propiedades estructurales o funcionales. Se ha descrito que la

estimulación del TLR2 y de los receptores de lectina tipo C con zymosan induce una

fuerte producción de IL-23 e IL-10, mientras que estas citoquinas se producen en

menor medida tras la estimulación del TLR4 por LPS (Gerosa et al., 2008; Dennehy et

al., 2009). Asimismo, los glucanos favorecen la producción de IL-1β (Kankkunen et al.,

2010).

La interleuquina 10

La interleuquina 10 es un modulador negativo de la respuesta inmune. Su

importancia en el control de la respuesta inflamatoria se descubrió tras observarse

que ratones deficientes en IL-10 sufrían colitis no remitente en respuesta a la

microbiota intestinal (Kühn et al., 1993). La IL-10 puede regular directamente la

inmunidad innata y adaptativa a través de varios mecanismos, entre los que se

incluyen: la limitación de la activación y diferenciación de las células T en los ganglios

linfáticos, la supresión de la respuesta pro-inflamatoria en los tejidos, el control de la

eliminación de patógenos y la reducción del daño tisular (Couper, Blount y Riley,

2008). La IL-10 se produce por numerosos tipos celulares del sistema inmune, entre

los que se incluyen las células dendríticas, los macrófagos y los linfocitos T y B. Entre

sus efectos, típicamente anti-inflamatorios, se destaca su capacidad para reprimir la

producción de citoquinas pro-inflamatorias por las células del sistema inmune

bloqueando la respuesta Th1 (Fiorentino, Bond y Mosmann, 1989) y promoviendo

una respuesta Th2 o Treg.

El estudio de la regulación de la producción de IL-10 se ha centrado en el análisis de

mecanismos transcripcionales y post-transcripcionales. El papel de la regulación

post-transcripcional se ha destacado porque el ARNm de la IL-10 contiene un alto

número de elementos ricos en AU en la zona 3´-UTR (3’-untranslated region) que

pueden unir la proteína desestabilizadora tristetraprolina, implicada en la

Page 31: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

23

degradación del ARNm (Powell et al., 2000; Stoecklin et al., 2008). En cuanto a los

mecanismos transcripcionales, actualmente se acepta el papel central del factor de

transcripción CREB y sus co-activadores (Alvarez et al., 2009; Kelly, Wang e Ivashkiv,

2010; Mellett et al., 2011). La actividad de CREB depende de sus co-activadores CBP y

CRTC/TORC2 y puede regularse por varias quinasas incluyendo la glicógeno sintasa

quinasa 3β (GSK3β). Esta serina-treonina quinasa regula negativamente la actividad

de CREB al disminuir su capacidad de unión al ADN (Grimes y Jope, 2001). La

actividad de GSK3β se relaciona también con la retención de CRTC/TORC en el

citoplasma de las células al favorecer la actividad de quinasas activadas por AMP

como SIK2 (Katoh et al., 2006). En consecuencia, la inhibición de GSK3β favorece la

unión de CREB al sitio CRE presente en el promotor de IL10, el reclutamiento de CBP

y la translocación de CRTC/TORC2 al núcleo para la formación del complejo nuclear

P-CREB/TORC2/CBP que es necesario para la trans-activación de IL10 (Alvarez et al.,

2009). En el caso del LPS se ha descrito también la participación de STAT3 y un ciclo

autocrino dependiente de interferón β (IFN-β) e IRF3 (IFN regulatory factor 3)

(Chang et al., 2007) mientras que en respuesta al zymosan la activación por

fosforilación de STAT3 depende de otros mediadores secundarios y no se relacionaría

con la producción de IL-10 (Rodríguez et al., 2017).

El estudio de los mecanismos de regulación de la transcripción de IL10 puede tener

importancia clínica porque el descontrol de la producción de IL-10 es una estrategia

utilizada por algunos microorganismos patógenos, como los hongos, para evadir el

sistema inmune. Actualmente se está produciendo un aumento de la incidencia de

micosis invasivas como consecuencia del extendido uso de antibióticos, el elevado

número de pacientes inmunosuprimidos y la aplicación de técnicas de diagnóstico

intervencionistas. El hongo que más frecuentemente se aísla en los pacientes es

Candida, aunque Aspergillus, Cryptococcus y Pneumocystis, son también patógenos

oportunistas de relevancia en pacientes inmunodeprimidos. La candidiasis es una de

las principales causas de las infecciones sistémicas adquiridas en el hospital y, a pesar

de la terapia anti fúngica, al menos el 30% de los individuos afectados fallecen por

esta causa (Horn et al., 2009).

Page 32: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

24

La interleuquina 23

La IL-23 es una citoquina pro-inflamatoria que favorece la proliferación y

diferenciación de células Th17. Forma parte de la familia de citoquinas de IL-12 como

la IL-12p70, con la que comparte la subunidad p40 (codificada por el gen IL12B). La

dimerización de p40 con una subunidad de 19 kDa (gen IL23A) da lugar a la IL-23. Al

igual que la sub-unidad específica de la IL-12 p70, p35 (gen IL12A), p19 no se secreta

si no está asociada a la cadena p40 (Oppmann et al., 2000). La modulación de la

transcripción de las subunidades específicas (p35 y p19) es el principal mecanismo

de regulación del balance entre IL-12p70 e IL-23 y es de suma importancia en la

polarización de la respuesta inmune a los tipos Th1 y Th17 (Figura 4).

Figura 4. Esquema de la estructura de IL-23 e IL-12p70, receptores y vías de señalización. La IL-

12 se compone de las subunidades IL-12/23p40 e IL-12p35. La IL-23 incluye IL-23p19 e IL-12/23p40.

La IL-12 señaliza a través de las subunidades IL-12Rβ1 e IL-12Rβ2 y la IL-23 a través de las

subunidades IL-12Rβ1 e IL-23R. La estimulación de los receptores de IL-12 conduce a la fosforilación

de STAT4 a través de la actividad de las quinasas JAK2 y TYK2. La IL-23 también activa la vía JAK-STAT

pero actúa principalmente sobre STAT3. La IL-12 induce la producción de IFN-γ, que se requiere para

el desarrollo de la respuesta inmune Th1 mientras que IL-23 induce IL-17A, IL-17F y/o IL-22 y

estabiliza las células Th17. Figura tomada de Teng et al., 2015.

El estudio de los factores de transcripción implicados en la regulación transcripcional

de IL23A ha demostrado que el zymosan aumenta la unión del miembro de la familia

NF-B, c-Rel al promotor de IL23A junto a la quinasa MSK1 y al co-activador CBP. Esto

permite la fosforilación temprana de la serina 10 de la histona H3, lo que genera

condiciones óptimas para la activación de la transcripción. Por el contrario, el LPS

Page 33: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

25

tiene un efecto más débil sobre la unión de c-Rel al promotor de IL23A y produce su

unión al promotor de IL12A. Estas diferencias en la intensidad de ocupación de los

promotores por c-Rel explican la especificidad de la respuesta a los distintos

estímulos, de forma que el LPS produce principalmente IL-12p70 y el zymosan IL-23

(Alvarez et al., 2012). Además de la implicación de c-Rel, la activación de la

transcripción de IL23A con zymosan requiere la participación de otros factores como

ATF2, que se regula mediante dos fosforilaciones complementarias que dependen de

las proteínas quinasas C y A (PKC y PKA). La cascada Ras/Raf/MEK/ERK fosforila la

treonina 71 y la MAPK p38 fosforila la treonina 69 (Rodríguez et al., 2014). En

experimentos en células murinas estimuladas con LPS, se ha descrito el reclutamiento

de otros factores de transcripción al promotor de Il23a como CREB y C/EBP (Kocieda

et al., 2012), XBP1 (Wang et al., 2013) o CHOP/DDIT3 (Goodall et al., 2010). La

posible implicación XBP1 y CHOP tiene especial interés ya que son factores de

transcripción que participan en la respuesta a proteínas mal plegadas que se produce

en condiciones que implican estrés de retículo endoplasmático.

La hiperactivación de linfocitos T con fenotipo Th17 es un factor patogénico de varias

enfermedades autoinmunes (McGeachy y Cua, 2007), entre las que se incluyen la

esclerosis múltiple (Cua et al., 2003), la psoriasis (Lee et al., 2004) y la artritis

reumatoide (Singh, Aggarwal y Misra, 2007). La inhibición de citoquinas con

anticuerpos monoclonales se ha convertido en una buena terapia para el tratamiento

de enfermedades autoinmunes, lo que explica el desarrollo de tratamientos con los

anticuerpos humanizados frente a IL-12 p40, ustekinumab y briakinumab, aprobados

para el tratamiento de la psoriasis y de la artritis psoriásica (Teng et al., 2015) y que

se estén llevando a cabo numerosos ensayos clínicos con anticuerpos frente a la

cadena p19, como el LY2525623, para el tratamiento general de otras enfermedades

autoinmunes. Dado que la susceptibilidad genética a la enfermedad muchas veces no

está directamente asociada con las citoquinas o sus receptores sino con elementos

claves en las rutas de señalización, incidir directamente en el mecanismo patogénico

efector podría ser más beneficioso (Liu et al., 2013). Del mismo modo, conocer estas

cascadas de señalización puede ser importante para potenciar la producción de IL-23

en los casos en que la respuesta Th 17 sea deficiente, como ocurre en algunos

procesos cancerosos (Zou y Restifo, 2010) e infecciones fúngicas como las producidas

por Candida albicans. Además, algunos autores relacionan el fenotipo Th17 con el

Page 34: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

26

crecimiento tumoral (Grivennikov et al., 2012) aunque es un tema controvertido ya

que también se ha descrito que los linfocitos Th17 pueden potenciar una respuesta

antitumoral (Martin-Orozco et al., 2009). Estos datos justifican la relevancia clínica

del estudio de los mecanismos de regulación de la producción de IL-23.

La interleuquina 1β

De forma opuesta a la IL-10, y al igual que la IL-12 p70 y la IL-23, la interleuquina 1β

(IL-1β) es una citoquina pro-inflamatoria producida predominantemente por

monocitos y macrófagos que se ha relacionado con la polarización de los linfocitos al

tipo Th17 en el micro-entorno tumoral (Kryczek et al., 2009). Esta citoquina es una

diana para el tratamiento de enfermedades inflamatorias con anticuerpos como el

canakinumab (anti-IL-1β) y el receptor soluble anakinra. La IL-1β se produce en

forma de precursor inactivo (pro-IL-1β) que debe sufrir un procesamiento enzimático

para producir la proteína activa. Este proceso está regulado por unas plataformas

proteicas denominadas inflamasomas. Las caspasas intracelulares son unas de las

principales enzimas encargadas de este procesamiento. En respuesta a distintas

señales, los inflamasomas se ensamblan mediante interacciones proteína/proteína y

la formación del complejo desencadena la activación de las caspasas. El estrés de

retículo también se ha relacionado con la producción de la IL-1β a través de la

activación del inflamasoma NLRP3 en la ateroesclerosis (Hoseini et al., 2018), o por la

activación de TRIF y la caspasa-8 en macrófagos estimulados con LPS (Shenderov et

al., 2014).

2. Reprogramación metabólica en el sistema inmune

La conexión entre el metabolismo y las funciones de las células del sistema inmune se

describió a principios de los años 60 al observarse que el bloqueo de rutas

metabólicas utilizadas para obtener energía generaba cambios en las funciones de las

células inmunitarias (Oren et al., 1963). En los últimos años, el papel fundamental del

metabolismo energético en la determinación de la función de las células inmunitarias

ha alcanzado gran relevancia, lo que ha conducido a la definición del

"Inmunometabolismo" como un nuevo campo de investigación (Pearce y Pearce,

Page 35: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

27

2013). El metabolismo celular se considera actualmente un elemento fundamental de

la respuesta inmune que puede conducir al desarrollo de pequeñas moléculas que por

su participación en distintas rutas metabólicas pueden tener aplicaciones

terapéuticas (O'Neill, Kishton y Rathmell, 2016).

Las rutas metabólicas cumplen generalmente tres funciones principales: i)

generación de energía, ii) producción de “bloques de construcción” necesarios para el

mantenimiento y la proliferación celular, y iii) modulación de la respuesta celular.

Tras la activación por los PAMP, las células inmunes aumentan notablemente su

demanda de nutrientes para iniciar una respuesta inmune efectiva. El tipo y el destino

de los nutrientes utilizados por las células inmunitarias son muy diferentes y

dependen de los requisitos funcionales de la célula. Por ejemplo, la presentación de

antígenos por las células mieloides precisa la producción de lípidos y ácidos nucleicos

obtenidos a través de la reutilización de intermediarios de las rutas metabólicas

(O'Neill y Pearce, 2016). Además, algunos metabolitos funcionan como moléculas de

señalización durante la estimulación celular (Haas et al., 2016).

La reprogramación metabólica de las células dendríticas y los macrófagos se ha

estudiado detalladamente en respuesta al LPS. En este caso se produce un cambio

caracterizado por la caída de la fosforilación oxidativa (OXPHOS) y el aumento de la

producción de lactato a partir del piruvato generado en la glucólisis, a pesar de la

presencia de oxígeno en cantidad suficiente (Kelly y O'Neill, 2015). Este cambio es

similar a la firma metabólica descrita en las células tumorales denominada efecto

Warburg (Warburg, 1956) (Figura 5). Estas observaciones han permitido elaborar la

hipótesis de que el efecto Warburg es una característica general de las células

mieloides activadas en la respuesta inmune innata. Sin embargo, pruebas recientes

sugieren una reprogramación metabólica mucho más compleja, con la activación de

diferentes vías metabólicas en las células mieloides en función del tipo de estímulo y

del contexto inmunológico (Lachmandas et al., 2016).

Page 36: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

28

Figura 5. Efecto Warburg. En las células diferenciadas, en reposo, la glucosa se metaboliza a piruvato.

Parte del piruvato se convierte en lactato, pero la mayoría se utiliza en el ciclo de Krebs tras su

conversión en acetil-CoA. El ciclo de Krebs genera NADH y FADH2, que donan electrones a la cadena

mitocondrial de transporte de electrones para que la fosforilación oxidativa pueda progresar,

rindiendo hasta 36 moléculas de ATP por cada molécula de glucosa. En células altamente proliferativas

o tumorales, el perfil metabólico cambia de la OXPHOS a la glucólisis aerobia para la obtención de ATP,

donde la mayoría del piruvato se utiliza para la producción de lactato, incluso en presencia de oxígeno,

rindiendo sólo 2 moléculas de ATP por cada molécula de glucosa. A cambio de este menor rendimiento

energético, la acumulación de intermediarios glucolíticos proporciona los sustratos necesarios para la

biosíntesis de otras moléculas, por ejemplo ribosa-5-P para la síntesis de nucleótidos a través de la

ruta de las pentosas fosfato. Figura adaptada de Martínez-Costa, 2015.

2.1 La ruta glucolítica

La naturaleza del estímulo tiene un efecto importante sobre la reprogramación

metabólica de las células mieloides. Esto se explica por la diversidad de patrones

presentes en los distintos microorganismos y el reclutamiento selectivo de rutas de

señalización específicas. No obstante, el aumento del flujo glucolítico en células

dendríticas tras su estimulación es una constante (Kelly y O'Neill, 2015). La glucólisis

comienza con la captación de glucosa y su procesamiento en el citosol hasta la

formación de piruvato. La vía glucolítica es relativamente ineficaz desde el punto de

vista energético, puesto que produce dos moléculas de ATP por cada glucosa

incorporada. Sin embargo, es beneficiosa para las células ya que en ella se produce la

reducción de NAD+ a NADH y pueden desviarse numerosos intermediarios

metabólicos a rutas anabólicas, tales como la síntesis de ácidos grasos, de

aminoácidos y de nucleótidos. El piruvato tiene dos destinos principales: la

Page 37: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

29

conversión en lactato en una reacción catalizada por la enzima lactato

deshidrogenasa (LDH) o, alternativamente, entrar en la mitocondria a través del

transportador de piruvato mitocondrial 1 (MPC1) para su conversión en acetil-CoA

por el complejo piruvato deshidrogenasa (PDH) (Figura 6).

Figura 6. Principales rutas metabólicas en células dendríticas. La vía de la glucólisis permite la

importación de glucosa y su conversión a piruvato en el citosol. El piruvato tiene dos posibles destinos.

El primero es la conversión en lactato por la LDH, que produce NAD+ que puede reutilizarse para la

producción de ATP en la glucólisis (flecha punteada). Alternativamente, el piruvato entra en la

mitocondria a través del transportador MPC1, donde el complejo piruvato deshidrogenasa lo convierte

en acetil-CoA. En la mitocondria, el acetil-CoA se incorpora al ciclo de los ácidos tricarboxílicos (TCA) y

conduce a la producción de NADH y FADH2, que sirven como sustratos para la cadena de transporte de

electrones (ETC), y por lo tanto mantienen la fosforilación oxidativa y la producción de ATP. Las células

inmunes utilizan, además, tres vías adicionales para satisfacer sus demandas metabólicas y

funcionales: la ruta de las pentosas fosfato (PPP), la glutaminólisis y la oxidación de ácidos grasos. La

G-6-P es el punto de entrada para la PPP, que genera ribosas para la síntesis de nucleótidos. Durante la

glutaminólisis, la glutamina se metaboliza a glutamato y posteriormente a α-cetoglutarato, que puede

incorporarse al TCA. El destino de la glutamina depende del estado de activación de la célula inmune.

Puede oxidarse completamente para generar ATP o usarse “in reverse” para reponer los intermedios

metabólicos del TCA, puesto que el citrato en estas células se exporta de la mitocondria para generar

acetil-CoA en el compartimento citoplasma/núcleo que se utiliza en reacciones biosintéticas. La β-

oxidación de los ácidos grasos produce acetil-CoA, que ingresa en el TCA para generar ATP. Figura

tomada de Pearce y Everts, 2015.

Page 38: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

30

Los datos disponibles indican que las células no mejoran la actividad glucolítica

simplemente regulando la expresión de las enzimas de la ruta para acelerar las

reacciones y los mecanismos moleculares que explican este cambio aún no han sido

completamente establecidos. La mayoría de la investigación dedicada a explicar estos

mecanismos se ha llevado a cabo en células tumorales, las cuales muestran una

reprogramación metabólica similar a la descrita en las células del sistema inmune,

como son el aumento de la glucólisis y la glutaminólisis y la disminución de la

OXPHOS. En la terapia anti-tumoral se están probando numerosos compuestos que

actúan sobre enzimas claves de la vía glucolítica, como la hexoquinasa y la piruvato

quinasa por su implicación en el cambio metabólico requerido para la proliferación

de estas células (Akins, Nielson y Le, 2018). A pesar de que este tema ha sido menos

estudiado en células dendríticas, el consenso actual es que ambas enzimas están

implicadas en el cambio metabólico que se observa en las células del sistema inmune

(Everts y Pearce, 2014; Pearce y Everts, 2015).

La hexoquinasa

La hexoquinasa es una enzima específica de tejido que fosforila la glucosa a glucosa-6-

fosfato (G-6-P). La formación de G-6-P es la primera reacción de la glucólisis y

también el punto de partida de la vía de las pentosas fosfato, una vía metabólica

paralela a la glucólisis, que genera NADPH, pentosas y ribosa-5-fosfato, un precursor

para la síntesis de nucleótidos. Se han descrito cuatro isoformas de HK en mamíferos.

Las hexoquinasas I, II y III tienen un tamaño de aproximadamente 100 kDa y

comprenden dos dominios hexoquinasa (N y C-terminal), con una secuencia

altamente homóloga. Además, comparten varias propiedades incluida una alta

afinidad por la glucosa, incluso en bajas concentraciones (por debajo de 1 mM), y la

inhibición por el producto de reacción glucosa-6-fosfato. La hexoquinasa IV o

glucoquinasa tiene un tamaño aproximado de 50 kDa, posee un único dominio

hexoquinasa y se caracteriza por su baja afinidad por la glucosa (Li et al., 2014). La

mayoría de las hexoquinasas se expresan ampliamente aunque las distintas isoformas

predominan en algunos tejidos. La HK-I se expresa de forma ubicua y es más

abundante en el cerebro y el riñón. La HK-II se expresa en niveles altos sólo en un

número limitado de tejidos adultos como el adiposo (Wilson, 2003). La HK-III se

expresa en principalmente en el bazo y los linfocitos y la HK-IV es la isoforma

Page 39: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

31

predominante en el hígado y el páncreas. La HK-II se considera la forma de HK

inducible, ya que su expresión puede aumentar aproximadamente 100 veces en las

células Th17 y además se ha observado que su inhibición con 2-desoxi-D-glucosa

mejora la inflamación en ratones en un modelo de encefalomielitis autoinmune

experimental al facilitar la formación de células Treg y suprimir la diferenciación de

células Th17 (Shi et al., 2011). También se ha descrito que la 2-DG suprime la

activación de las células dendríticas inducida por la ocupación del receptor TLR4 que

provoca la translocación de la HK-II a la mitocondria, siendo esta translocación el

mecanismo implicado en el aumento de la glucólisis (Everts et al., 2014).

La 2-DG es un mimético de la glucosa que tiene el grupo hidroxilo de la posición 2

reemplazado por hidrógeno y que actúa como un inhibidor competitivo del

metabolismo de la glucosa (Grossbard y Schimke, 1966). En la mayoría de las células,

la HK fosforila la 2-desoxi-D-glucosa para transformarla en 2-desoxi-D-glucosa-6-

fosfato que no puede metabolizarse y se acumula inhibiendo la fosfoglucosa

isomerasa y la HK (Ralser et al., 2008) . Asimismo, por su similitud estructural con la

manosa, la 2-DG ejerce un mayor efecto competitivo con ésta que con la glucosa al

encontrarse la manosa en los tejidos en concentraciones mucho menores (Kurtoglu,

Maher y Lampidis, 2007). Este hecho tiene gran repercusión en todas las reacciones

que requieren manosa como sustrato además de glucosa, incluidas las N-

glicosilaciones de proteínas. La N-glicosilación consiste en la incorporación de un

precursor glicano formado por N-acetilglucosamina, manosa y glucosa a residuos de

asparagina (Asn) presentes en las proteínas. Por este motivo la 2-DG puede

desencadenar el estrés del retículo endoplasmático y la respuesta a proteínas mal

plegadas (Andresen et al., 2012) (Figura 7).

Page 40: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

32

Figura 7. Esquema del mecanismo de acción de la 2-desoxi-D-glucosa. Al ser el compuesto

resultante de la pérdida del grupo hidroxilo del carbono 2 de la manosa y de la glucosa, la 2-DG

produce una disminución de los niveles de glucosa-6-P y de manosa-6-P necesarios para la formación

de UDP-N-acetilglucosamina y GDP-manosa, respectivamente. La carencia de estas moléculas puede

alterar la N-glicosilación de proteínas afectando a su plegamiento y desencadenar el estrés de retículo

endoplasmático y la respuesta a proteínas mal plegadas.

La piruvato quinasa

La piruvato quinasa cataliza el último e irreversible paso de la glucólisis: la

conversión de fosfoenolpiruvato a piruvato mediante la transferencia de un grupo

fosfato al ADP. En los mamíferos hay cuatro isoformas de la piruvato quinasa (Harada

et al., 1978) codificadas por dos genes, PKLR y PKM cuya expresión se regula por

factores específicos de tejido (Noguchi et al., 1987) y por splicing alternativo

(Noguchi, Inoue y Tanaka, 1986). El gen PKLR codifica la PKL expresada en hígado,

intestino y riñón, y la PKR, expresada en eritrocitos. El gen PKM codifica las isoformas

PKM1, que es un tetrámero constitutivamente activo (Ikeda, Tanaka y Noguchi, 1997)

expresado en muchos tejidos diferenciados, y PKM2 que se expresa universalmente

durante la embriogénesis y mayoritariamente en células en proliferación, aunque

también se ha demostrado que se expresa en tejidos diferenciados y células que no

proliferan, y se sobre-expresa en tumores (Altenberg y Greulich, 2004; Clower et al.,

Page 41: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

33

2010). Durante la reprogramación metabólica, que tiene lugar en células inmunes

activadas y en células tumorales, la expresión de la PKM1 disminuye en favor de la

PKM2.

De las isoformas de PKM presentes en las células humanas sólo la conformación y

actividad de la PKM2 puede modificarse alostéricamente (Ikeda y Noguchi, 1998;

Ashizawa et al., 1991; Christofk et al., 2008) y se le atribuyen distintas funciones

dependiendo de su conformación y localización (Gao et al., 2012; Matsuda et al.,

2016). Sin embargo, el mecanismo molecular por el cual esta isoforma aumenta el

flujo glucolítico aún no se ha esclarecido. Mientras la forma tetramérica de PKM2 es

altamente glucolítica (Tamada, Suematsu y Saya, 2012), la forma dimérica presente

en el núcleo de las células tumorales sería responsable del efecto Warburg por su

interacción con el factor de transcripción HIF1α (Luo et al., 2011; Tennant, 2011;

Wang et al., 2014a). La interacción HIF1α/PKM2 y su influencia en el aumento de la

glucólisis se ha descrito también en macrófagos murinos (Palsson-McDermott et al.,

2015).

2.2 El factor de transcripción HIF1α

HIF es un miembro altamente conservado de la subfamilia PER-ARNT-SIM (PAS)

perteneciente a la familia de factores de transcripción hélice-bucle-hélice básica

(bHLH) (Wang et al., 1995). Para el desarrollo de su función, HIF forma un complejo

heterodimérico consistente en una subunidad α y una β. La subunidad α tiene dos

isoformas, HIF1α o HIF2α. La subunidad β es el translocador nuclear del receptor de

hidrocarburos arílicos (ARNT) y se expresa de forma constitutiva. Tras la

dimerización, el complejo HIFα/HIFβ se traslada al núcleo donde se une a los

promotores de genes diana que contienen elementos de respuesta a la hipoxia (HRE).

Esta unión inicia la transcripción de una batería de genes involucrados en la

adaptación celular a la hipoxia, el metabolismo y la función celular (Semenza, 2001).

La señalización de HIF se regula principalmente por la estabilidad de su subunidad α.

En células en reposo, HIF1α se hidroxila en residuos de prolina por las prolil-

hidroxilasas (PHD). Esta hidroxilación permite la ubiquitinación de HIF1α por la

ubiquitina ligasa de von Hippel-Lindau (VHL) E3, y el consiguiente marcaje para una

rápida degradación proteasomal. Las PHD son dependientes de oxígeno, por lo tanto,

Page 42: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

34

en condiciones normóxicas, HIF1α se degrada continuamente, lo que explica los bajos

niveles de HIF1α detectados en condiciones basales. Por el contrario, la hipoxia inhibe

la actividad de la PHD y atenúa la hidroxilación de HIF1α, por lo que en ausencia de

degradación proteasomal, se acumula, se traslada al núcleo y aumenta la

transcripción de los genes que contienen secuencias HRE. Entre estos genes se

encuentran los de las enzimas glucolíticas hexoquinasa II y fosfofructoquinasa (Riddle

et al., 2000; Obach et al., 2004) y el de la lactato deshidrogenasa (Firth, Ebert y

Ratcliffe, 1995).

En las células inmunes la estabilización de HIF1α puede ocurrir de manera

independiente del oxígeno ya que se ha demostrado la inducción de la expresión de

HIF1α en macrófagos cultivados en condiciones normóxicas en presencia de

diferentes patógenos (Peyssonnaux et al., 2005). Del mismo modo, el LPS induce la

acumulación de la proteína HIF1α en macrófagos a través de la activación

transcripcional y traduccional, actuando independientemente de la estabilización de

HIF1α inducida por hipoxia (Blouin et al., 2004) y se ha determinado que el factor

nuclear NF-κB, que desempeña un papel central en la regulación de la respuesta

inmune a la infección, también es necesario para la respuesta transcripcional del

ARNm de HIF1α inducida por bacterias (Rius et al., 2008). Al igual que los

macrófagos, tras la estimulación de los TLR, las células dendríticas estabilizan HIF1α

(Jantsch et al., 2011) y experimentan un cambio metabólico similar al observado en

otras células inmunes activadas, lo que les permite utilizar la glucólisis aerobia para

inducir su maduración y desarrollar su función (Jantsch et al., 2008; Krawczyk et al.,

2010).

Page 43: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

35

Figura 8. Regulación y activación de HIF1α en células del sistema inmune. Durante la hipoxia y en

repuesta a los receptores de reconocimiento de patrones, HIF1α se estabiliza y forma complejos con

HIF1β. El complejo HIF1 completo se traslada al núcleo donde se une a los elementos sensibles a

hipoxia con sus co-activadores, CBP/p300 y PKM2. Los genes con HRE en sus promotores incluyen

enzimas metabólicos y mediadores pro-inflamatorios. Bajo una tensión normal de oxígeno, y en

ausencia de estimulación, las enzimas prolil-hidroxilasas (PHD) oxidan los residuos de prolina de

HIF1α lo que conlleva el reclutamiento de la ubiquitina ligasa de von Hippel-Lindau E3 (pVHL), que

ubiquitina a HIF1α para su degradación por el proteasoma. Figura adaptada de Stothers et al., 2018.

3. El estrés de retículo endoplasmático

Los cambios en la composición del medio celular que ocurren durante la respuesta

inmune pueden perturbar gravemente la función del retículo endoplasmático (RE). El

retículo endoplasmático es una extensa red tubular-reticular separada del citosol

circundante por una bicapa lipídica: la membrana del RE. Es un orgánulo crucial para

el mantenimiento de la homeostasis del calcio y su función principal es la síntesis y el

plegamiento de proteínas secretadas y transmembrana, que constituyen

aproximadamente un tercio de todas las proteínas que se producen en la célula

(Anelli y Sitia, 2008). Tras ser traducidas por los ribosomas asociados a la membrana

del RE, las proteínas ingresan en el lumen del RE donde se produce su plegamiento,

gracias a las chaperonas. En el lumen se producen también otras modificaciones

complejas de las proteínas que incluyen, por ejemplo, la N-glicosilación y la formación

de enlaces disulfuro (Saibil, 2013; Sevier y Kaiser, 2002). Debido a que las proteínas

Page 44: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

36

de la vía secretora a menudo median funciones de señalización cruciales, las formas

que no están correctamente plegadas se eliminan a través de un proceso de

degradación denominado degradación asociada al retículo endoplásmico (ERAD). De

esta forma las proteínas mal plegadas se trasladan al citosol para su posterior

ubiquitinación y degradación por el proteasoma 26S (Smith, Ploegh y Weissman,

2011).

Cuando la capacidad de plegamiento de las proteínas por el RE se ve superada, se dice

que las células experimentan estrés de retículo (Tabas y Ron, 2011). La respuesta a

proteínas mal plegadas es un mecanismo altamente conservado que permite a la

célula manejar el estrés del retículo endoplásmico que se produce, por ejemplo, por la

demanda secretora asociada con los cambios efectores sufridos por los fagocitos tras

su activación por los PAMP. En este sentido, se ha demostrado que la UPR tiene

funciones cruciales en la inmunidad y la inflamación habiéndose descrito su

implicación en la diferenciación, maduración, supervivencia, y presentación

antigénica de las células dendríticas (Martins et al., 2016).

3.1 La respuesta a proteínas mal plegadas

La comunicación entre el retículo endoplasmático y el núcleo en células que

experimentaban estrés por la acumulación de proteínas mal plegadas, se describió en

mamíferos por primera vez en 1988 (Kozutsumi et al., 1988). Este fenómeno se

caracterizó genéticamente en S. cerevisiae. En esta levadura, el estrés del RE regula

positivamente un conjunto de genes involucrados en el plegamiento de proteínas, y el

control de calidad y la secreción de las mismas (Cox y Walter, 1996). En vertebrados,

la UPR ha evolucionado hacia el establecimiento de una red compleja de vías de

señalización interconectadas iniciada por la estimulación de tres transductores de

señal ubicados en la membrana del RE: ATF6α, PERK e IRE1α. En condiciones

homeostáticas, los dominios luminales de estos sensores se mantienen en un estado

inactivo mediante su asociación con la proteína de unión a la inmunoglobulina (BiP;

también conocida como GRP78). Sin embargo, debido a la mayor afinidad de BiP por

las proteínas mal plegadas, cuando éstas se acumulan en el lumen del RE, BiP se

disocia de los transductores iniciándose así la señalización (Bertolotti et al., 2000; Ye

et al., 2000) (Figura 9). De este modo, la activación de la UPR desencadena dos

eventos celulares temporalmente distintos para mitigar el plegamiento incorrecto de

Page 45: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

37

proteínas: una reacción inicial para reducir la síntesis de proteínas y mejorar la

degradación de proteínas mal plegadas y una segunda ola de regulación de la

transcripción de cientos de genes diana implicados en el control de proteostasis

global.

Figura 9. Esquema de la activación de las tres ramas de la respuesta a proteínas mal plegadas.

La visión clásica de la activación de la UPR sugiere que GRP78 se une de manera constitutiva a los

dominios luminales de ATF6, IRE1α y PERK, para secuestrarlos en forma inactiva. Cuando las proteínas

mal plegadas se acumulan en el lumen del RE, se unen a GRP78, lo que permite la liberación de los

sensores UPR y que estos activen sus vías de señalización. PERK dimeriza y se autofosforila.

Posteriormente fosforila a eIF2α, se inhibe la traducción general dependiente de Cap y permite la

traducción de ciertas proteínas como ATF4 que activa la transcripción de CHOP. Al liberarse de GRP78,

ATF6 se moviliza al aparato de Golgi para su procesamiento por las proteasas S1P y S2P y la liberación

de un fragmento citosólico que se traslada al núcleo para inducir la expresión de sus genes diana como

XBP1. IRE1 activo también oligomeriza y actúa como quinasa y endonucleasa. Uno de sus objetivos es

el ARNm de XBP1 que sufre un procesamiento para producir un factor de transcripción activo, XBP1s.

Figura adaptada de Gorman et al., 2012.

Page 46: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

38

La rama ATF6α

ATF6α es una proteína transmembrana tipo II con un extremo N-citoplásmico que

contiene un motivo básico de cremallera de leucina. En células sometidas a estrés de

RE actúa como un factor de transcripción tras sufrir una proteólisis intra-membrana

regulada (RIP). La forma presente en el RE es de 90 kDa y tiene dos secuencias de

localización en Golgi que están enmascaradas por la unión a BiP (Shen et al., 2002).

Cuando se genera estrés en el RE, ATF6α se disocia de BiP, se traslada al Golgi y su

mitad C-terminal se escinde por la proteasa del sitio 1 (S1P). El extremo N-terminal

anclado a la membrana se escinde por la proteasa del sitio 2 (S2P) y se libera una

proteína de 50 kDa en el citosol. La proteína de 50 kDa se traslada al núcleo para

activar la expresión de genes diana de la UPR como XBP1, CHOP o GRP78 junto con

los elementos de respuesta a estrés de RE (ERSE). ATF6α también puede activar

transcripcionalmente componentes de la ERAD por heterodimerización con sXBP1

(Malhi y Kaufman, 2011).

La rama PERK

PERK es una quinasa transmembrana de tipo I que en condiciones de estrés

oligomeriza y se trans-autofosforila en el residuo treonina 981. Una vez activa inhibe

la traducción general de proteínas al interferir con el ensamblaje 5'-cap a través de la

fosforilación en la serina 51 del factor iniciador de la traducción eucariótica 2 (eIF2α)

(Harding, Zhang y Ron, 1999). Este hecho reduce la sobrecarga de proteínas que

entran en el RE de una célula estresada, pero también permite la traducción selectiva

del ARNm que codifica el factor activador de la transcripción 4 (Vattem y Wek, 2004).

ATF4 se traslada al núcleo, donde activa los genes UPR que codifican las proteínas

que son necesarias para la respuesta antioxidante y la biosíntesis y transporte de

aminoácidos. ATF4 también activa la transcripción de la proteína homóloga a C/EBP

(CHOP/DDIT3), que forma heterodímeros con ATF4 para regular los genes con

funciones en la UPR, la autofagia y la traducción del ARNm (Han et al., 2013). Además,

la fosforilación de eIF2α representa un punto de convergencia de diferentes vías de

estrés, conocidas como la "respuesta integrada al estrés", que se rige por quinasas

específicas que se activan por inflamación, infecciones virales, privación de nutrientes

y deficiencia de hemo (Pakos-Zebrucka et al., 2016).

Page 47: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

39

La rama IRE

La rama IRE es la más arcaica y conservada de la UPR. En mamíferos se identificaron

dos genes, Ire1α e Ire1β. Ire1α se expresa ampliamente mientras que la expresión de

Ire1β se limita al epitelio intestinal aunque también podría estar presente en otros

tipos celulares (Bertolotti et al., 2001). IRE1α es una proteína transmembrana de tipo

I con doble función ya que posee actividades serina/treonina quinasa y

endoribonucleasa. En respuesta a la acumulación de proteínas mal plegadas en el RE,

el dominio luminal de IRE1α se autoasocia, permitiendo que IRE1α dimerice y se

trans-autofosforile, induciendo así un cambio conformacional que activa su dominio

RNAsa para catalizar la escisión de un intrón de 26 nucleotidos del interior del ARNm

de XBP1 (Calfon et al., 2002). Este evento de splicing no convencional es completado

por la liagasa RtcB que une los dos fragmentos del ARNm de XBP1 (Jurkin et al., 2014)

y cambia el marco de lectura abierto del ARNm para generar un factor de

transcripción estable y activo conocido como sXBP1. El dominio RNasa de IRE1α

también regula la estabilidad de múltiples ARN a través de una reacción de escisión

endonucleolítica directa que involucra secuencias específicas en un proceso conocido

como decaimiento regulado dependiente de IRE1 o RIDD (Hollien y Weissman, 2006).

Aunque XBP1 es el sustrato de IRE1α preferido, bajo condiciones profundas de estrés,

el RIDD puede ser impulsado por la formación de oligómeros de IRE1α de orden

superior que dotan de una mayor avidez por los sustratos de ARNm no XBP1 al

dominio RNasa de IRE1α (Han et al., 2009) (Figura 10).

Page 48: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

INTRODUCCIÓN

40

Figura 10. Esquema de la vía de señalización de la rama IRE. En células sometidas a estrés, BiP se

asocia a las proteínas mal plegadas e Ire1 se activa debido a los cambios conformacionales inducidos

por la dimerización de monómeros y la trans-autofosforilación. Los oligómeros de orden superior, que

podrían formarse con estímulos de estrés adicionales, refuerzan la actividad RNasa de Ire1. Ire1

activado media el splicing del ARNm de XBP1 en eucariotas superiores. Ire1 también puede actuar por

vías alternativas. Ire1 fosforilado se asocia con TRAF2 y activa la ruta JNK a través de ASK1. Además

mediante el RIDD, Ire1 degrada los ARNm localizados en la membrana del RE a través de su actividad

RNasa, lo que conduce a una reducción en la cantidad de proteínas en el lumen del RE. Figura tomada

de Coelho y Domingos, 2014.

Los genes diana de sXBP1 pueden variar según el tipo de tejido y los estímulos, ya

que, sXBP1 tiene la capacidad de interactuar con otros factores de transcripción

formando heterodímeros (Hetz, 2012). El eje de señalización IRE1α/XBP1, por lo

tanto, influye en muchas vías de señalización que anteriormente se creía que estaban

fuera del alcance del programa tradicional de UPR. Además, la aplicación más reciente

de las técnicas globales de creación de perfiles de ARNm ha expandido enormemente

las dianas transcripcionales directas de XBP1 conocidas que abarcan, entre otras, el

metabolismo de los lípidos (Lee et al., 2008), las citoquinas pro-inflamatorias

(Martinon et al., 2010), la vía de respuesta a la hipoxia HIF1α (Chen et al., 2014), o la

ruta de síntesis de hexosaminas (Wang et al., 2014b). Esta extensión funcional se ha

asignado también a otros factores de transcripción activados por la UPR como CHOP,

aunque el número de estudios es más escaso.

Page 49: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

Objetivos

Page 50: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de
Page 51: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

OBJETIVOS

43

El objetivo general ha sido caracterizar la reprogramación metabólica que sufren las

células dendríticas estimuladas por patrones moleculares asociados a patógenos y

determinar los efectos que la modulación del metabolismo de la glucosa tiene sobre la

regulación transcripcional de la producción de citoquinas. Para ello se establecieron

los siguientes objetivos específicos:

1. Caracterizar la reprogramación metabólica en células dendríticas

estimuladas con zymosan y con LPS:

1.1 Determinar el perfil metabólico inducido por la estimulación de las CD.

1.2 Estudiar los posibles mecanismos implicados en la reprogramación metabólica

de las CD.

2. Analizar los efectos de la modulación del metabolismo de la glucosa sobre la

expresión de citoquinas en células dendríticas estimuladas con zymosan y

con LPS:

2.1 Determinar el efecto de la privación de glucosa sobre la transcripción de IL-23,

IL-10 e IL-1β e identificar los mecanismos moleculares involucrados en el

cambio transcripcional observado, lo que incluye:

Estudiar el efecto de la modulación farmacológica del metabolismo energético

sobre los niveles de lactato y la producción de citoquinas.

Estudiar la implicación de la respuesta a proteínas mal plegadas.

2.2 Determinar el efecto de la regulación farmacológica de la actividad de la enzima

PKM2 sobre la transcripción de IL-23, IL-10 e IL-1β y analizar si dicho efecto es

consecuencia de cambios en su función glucolítica y/o quinasa.

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Materiales y métodos

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Page 55: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

47

1. Reactivos

El MKC8866 fue donado por el Dr. John Patterson, MannKind Corporation, Valencia,

CA. El resto de reactivos fueron adquiridos a las siguientes casas comerciales:

Active Motive: Nuclear Extract Kit

Bio-Rad: Poliacrilamida

Biotium: GelRed nucleic acid stain

Calbiochem: tunicamicina

Cayman Chemical Company: ML-265

Fluca: Nonidet-P-40

GE Healthcare: Ficoll Paque

Gibco: Suero bovino fetal (FBS)

Invitrogen: TRIzol, transcriptasa inversa, oligos N6

Lonza: L-glutamina, penicilina/estreptomicina, RPMI 1640

Merck: Tris-HCl, KCl, Tris, KH2PO4, MgCl2

Miltenyi Biotec: GM-CSF murino, GM-CSF humano, IL-4

NEB: StuI

Promega: RNAsin

R&D Systems: kit ELISA IL-23

Santa Cruz: Reactivos para los estudios de inmunoprecipitación de cromatina

Scharlab: Cloroformo, isopropanol, metanol, etanol, acetonitrilo, glicina, NaCl,

Na2HPO4

Sellenckchem: GSK2606414

Sigma: albúmina de suero bovina (BSA), SyBr Green I Master Mix, Lactate assay kit

II, zymosan de Saccharomyces cerevisiae, LPS de Escherichia coli, formaldehido, 2-

desoxi-D-glucosa, tapsigargina, D-manosa, lactato de sodio, dicloroacetato (DCA),

EDTA, EGTA, dodecilsulfato sódico (SDS), ortovanadato, Tween-20, HEPES, poli-L-

lisina, Tritón, ditiotreitol (DTT), citrato sódico, β-glicerofosfato, acetato sódico

Stemcell: Optiprep

Thermo Scientific: ECL, dNTPs, disuccinimidil suberato (DSS), marcadores de peso

molecular, Hoechst 33342

Tocris: 4µ8C

Page 56: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

48

2. Cultivos celulares

2.1 Obtención de células dendríticas humanas

Las células dendríticas se obtuvieron de células mononucleares aisladas de la capa

leuco-plaquetaria que aparece entre el plasma y los glóbulos rojos tras la

centrifugación de la sangre total, y que se denomina habitualmente según el término

inglés de buffy coat. Los concentrados sanguíneos de donantes sanos del grupo 0

fueron proporcionados por el Centro de Hemoterapia y Hemodonación de Castilla y

León, y se diluyeron en proporción 1:1 (v:v) con tampón fosfato salino (PBS) (136

mM NaCl, 2,7 mM KCl, 8 mM Na2HPO4, 1,5 mM KH2PO4 pH 7,4). Se añadieron 30 ml

de esta mezcla sobre 15 ml de una solución de Ficoll Paque y se centrifugaron a 700 x

g durante 30 minutos sin freno de desaceleración para obtener en la parte superior la

fase acuosa con la mezcla de plasma y PBS, y en capas inferiores en forma sucesiva, un

anillo en el que se encuentran las células mononucleares, el Ficoll Paque y por último

los eritrocitos y los polimorfonucleares. Se recogieron 2 anillos de células

mononucleares con pipeta Pasteur en tubos Falcon y se lavaron por centrifugación a

440 x g durante 10 minutos en 50 ml de PBS. El precipitado celular se resuspendió en

3 ml de Optiprep (Iodixanol 60%) y se creó un gradiente de densidades al añadir, sin

mezclar, las fases de 7 ml de Ficoll Paque, 20 ml de una solución 1 mM EDTA, 0,5%

BSA y 33% Optiprep en tampón HEPES salino (HBS) (10 mM HEPES y 0,8% NaCl pH

7,4) y 1 ml de HBS. Se centrifugó a 700 x g durante 25 minutos sin freno de

desaceleración para obtener dos anillos celulares entre las distintas fases: en la parte

superior uno formado por monocitos y otro en la parte inferior que contiene los

linfocitos. Se recuperó el anillo de monocitos, se lavó en PBS y se repitió el proceso de

separación por gradiente de densidad para obtener una población de monocitos de

mayor pureza.

Tras realizar el recuento del número total de células, se distribuyeron 30 millones de

las mismas en placas de cultivo de 100 mm de diámetro con 5 ml de medio RPMI

1640 suplementado con 10% de suero bovino fetal inactivado (FBSi), 2 mM de L-

glutamina y 100 U/ml de penicilina/estreptomicina. Las células se dejaron adherir

durante al menos 60 minutos a 37°C en atmósfera con 5% de CO2. Transcurrido este

tiempo, se retiró por aspiración el medio con las células no adheridas y se inició el

Page 57: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

49

proceso de diferenciación a células dendríticas inmaduras (CDi), añadiendo a 7 ml

finales del medio anterior, 800 U/ml de GM-CSF y 500 U/ml de IL-4 (Valera et al.,

2008). La incubación se mantuvo durante 5 días a 37°C en atmósfera con un

contenido de CO2 del 5% (Figura 11). El FBSi se mantuvo al 10% durante el proceso

de diferenciación y se redujo al 2% para la realización de los experimentos.

Figura 11. Esquema del proceso de obtención de células dendríticas humanas.

2.2 Obtención de células dendríticas derivadas de médula ósea de ratón

Para obtener células dendríticas derivadas de médula ósea de ratón (BMDC), se

diseccionaron los fémures y las tibias de ratones con fondo genético C57BL6, se

cortaron las epífisis y se extrajo la médula ósea mediante inyección de PBS frío

(Figura 12). La suspensión de células se filtró y se centrifugó 10 minutos a 400 x g.

Las células se resuspendieron en RPMI suplementado con 10% de FBSi, 2mM de L-

glutamina, 100 U/ml de penicilina/estreptomicina y 10 ng/ml de GM-CSF murino y se

mantuvieron en cultivo durante 5 días a 37°C en atmósfera con 5% de CO2. Para la

realización de los experimentos el FBSi se redujo al 2%.

Los ratones Ern1f/fVav1-Cre fueron obtenidos por el Dr. Cubillos-Ruiz (Medical

College, NY, Estados Unidos) a través de una colaboración con el profesor Takao

Iwawaki (Kazanawa Medical University, Ishikawa, Japón).

Figura 12. Imágenes del

proceso de obtención de la

médula ósea de un ratón.

Page 58: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

50

3. Análisis de la expresión génica

3.1 Extracción del ARN total

La extracción de ARN total se llevó a cabo mediante la adición de 1 ml de TRIzol a 107

CD. Tras la resuspensión en TRIzol, las células se centrifugaron a 12000 x g durante

10 minutos a 4°C para obtener el sobrenadante y eliminar los restos celulares. Para

separar la fase acuosa, que contiene el ARN, de la orgánica, que contiene el ADN y las

proteínas, se añadieron 200 µl de cloroformo, se agitó vigorosamente, y tras

mantener la mezcla 3 minutos a temperatura ambiente, se centrifugó a 12000 x g

durante 15 minutos a 4°C. La fase acuosa se suplementó con 250 µl de isopropanol y

250 µl de una disolución 0,8 M citrato sódico y 1,2 M NaCl en H2O-DEPC. La mezcla se

mantuvo 10 minutos a temperatura ambiente con agitación ocasional y se centrifugó

a 12000 x g a 4°C durante 10 minutos para precipitar el ARN. El precipitado se lavó

con etanol al 75% en H2O-DEPC dos veces y se dejó secar al aire. Finalmente se

resuspendió en 15 µl de H2O-DEPC. La cantidad de ARN presente en la muestra se

valoró con un NANO DROP (ratio A260/A280).

3.2 Síntesis del ADN complementario

Para la síntesis del ADN complementario (ADNc) se partió de 3 µg de ARN que se

diluyeron a un volumen final de 11,1 µl con H2O-DEPC. Tras el calentamiento durante

10 minutos a 68°C, se añadieron a cada muestra 8,9 µl de un tampón de

retrotranscripción formado por 50 mM Tris-HCl, 75 mM KCl, 3mM MgCl2, 10 mM DTT,

1 mM desoxinucleotidos trifosfato (dNTP), 15 ng/µl oligos N6, 1U/µl RNAsin y 10

U/µl de transcriptasa inversa del virus de la leucemia murina (RT M-MLV). La

incubación se mantuvo a 37°C durante 1 hora.

3.3 PCR cuantitativa en tiempo real

La amplificación del ADNc se llevó a cabo con esta técnica basada en la detección

continua del producto de amplificación durante la reacción en cadena de la

polimerasa (PCR) con un reactivo que aumenta su fluorescencia tras su unión al ADN

de doble cadena. La reacción de PCR se llevó a cabo con el equipo LightCycler® 480

empleando SyBr Green I Master, 1,5 µl de ADNc y 0,2 nM de cada cebador en placas de

96 pocillos. Las condiciones del termociclador fueron una desnaturalización inicial

Page 59: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

51

(hot start) durante 5 minutos a 95°C seguida de 45 ciclos de tres pasos: 95°C durante

15 segundos (desnaturalización del ADN), 60°C durante 20 segundos (hibridación del

ADN) y 72°C durante 5 segundos (elongación del ADN). La curva de fusión se realizó

con el cambio paulatino de temperatura de 60°C a 95°C a razón de 0,2°C/segundo. Se

utilizó la enzima gliceraldehído fosfato deshidrogenasa (GAPDH) como gen

constitutivo para valorar la abundancia relativa de los diferentes ARNm usando el

método comparativo del 2 -ΔΔCt (Fold Increase): se determina el ciclo umbral (Ct) que

es aquél en el que la fluorescencia supera el umbral que marca que la amplificación

comienza a ser exponencial. Los resultados se expresan como la media de los Ct del

gen que se analiza con respecto a los Ct de la GAPDH (ΔCt condición x = Ct gen diana –

Ct GAPDH) y a este valor se le resta el ΔCt del control (ΔΔCt = ΔCt condición x - ΔCt

control). En las Tablas 1 y 2 se muestran las secuencias de los cebadores utilizados

para la detección de los tránscritos de humanos y de múridos.

Humanos

Nombre Secuencias (5′-3′) Sentido Antisentido

DDIT3/CHOP GCAGAGATGGCAGCTGAGTC AGCCAAGCCAGAGAAGCAGGGT

GAPDH GTCAGTGGTGGACCTGACCT AGGGGAGATTCAGTGTGGTG

HIF1α AGTGTACCCTAACTAGCCGA GTGCAGTGCAATACCTTCC

IL1B ATGATGGCTTATTACAGTGGCAA GTCGGAGATTCGTAGCTGGA

IL10 GAGAACAGCTGCACCCACTT GGCCTTGCTCTTGTTTTCAC

IL12B CATGGGCCTTCATGCTATTT TTTGCATTGTCAGGTTTCCA

IL23A CATGGGCCTTCATGCTATTT TTTGCATTGTCAGGTTTCCA

PKM1 GCATCATGCTGTCTGGAGAA AACTATCAAAGCTGCTGCTA

PKM2 CTATCCTCTGGAGGCTGTGC ACGATTATGGCCCCACTGCA

XBP1 TAAGACAGCGCTTGGGGATGGA ATACCGCCAGAATCCATGGGGA

Tabla 1. Cebadores utilizados para la detección de transcritos de humanos.

Múridos

Nombre Secuencias (5′-3′) Sentido Antisentido

Gapdh GTCAGTGGTGGACCTGACCT AGGGGAGATTCAGTGGTG

Il23a AGGGAACAAGATGCTGGATT AGTAGATTCATATGTCCCGCT

sXbp AAGAACACGCTTGGGAATGG CTGCACCTGCTGCGGAC

Tabla 2. Cebadores utilizados para la detección de transcritos de múridos.

Page 60: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

52

3.4 Análisis del splicing de XBP1

Tras realizar la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) con cebadores que abarcan las

regiones sin splicing en las condiciones anteriormente señaladas, se llevó a cabo una

electroforesis en gel de agarosa al 3%, con marcadores de peso molecular de ADN, en

la que se corrió el producto de amplificación a 100 V durante 20 minutos. Para

visualizar las bandas con y sin splicing que difieren en 26 pares de bases (pb) se tiñó

el gel con GelRed nucleic acid stain. Se usó la expresión de GAPDH como control de

carga.

3.5 Análisis de las isoformas de la piruvato quinasa

Las isoformas de la PKM se generan por el splicing alternativo de exones mutuamente

excluyentes y se diferencian en que el ARNm de PKM1 contiene el exón 9 y carece del

exón 10, mientras que el ARNm de PKM2 incluye el exón 10 y carece del exón 9. Las

qPCR se llevaron a cabo con cebadores diseñados en los exones 8 y 11 que dan un

producto de amplificación de 218 pb para la PKM1 y de 183 pb para la PKM2. Esto

permite el análisis cuantitativo de cada isoforma y la confirmación de su

identificación mediante el tratamiento del amplicón de PCR con la enzima de

restricción StuI que reconoce la secuencia AGGCT en el exón 10 y digiere el fragmento

de ARNm de PKM2 en dos productos de 149 pb y 34 pb. Para la digestión, se llevaron

5 µl del producto de PCR a un volumen final de 9 µl con un tampón 10 mM Tris-HCl

pH 7,5, 10 mM MgCl2 y 0,1 mg/ml BSA, al que se añadieron 10 U (1 µl) de StuI. La

incubación se mantuvo durante 1 hora a 37°C. Las diferentes bandas se visualizaron

tras realizar una electroforesis en un gel de agarosa al 3%, con marcadores de ADN,

teñido con GelRed nucleic acid stain.

3.6 Inmunoprecipitación de la cromatina

Con el fin de estudiar los mecanismos de regulación transcripcional, se llevaron a

cabo experimentos de inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP) para analizar la

unión directa de los factores de transcripción. Se utilizaron 2x107 células dendríticas

por condición a las que tras la estimulación se les añadió formaldehido (1 % final).

Las CD se incubaron a temperatura ambiente durante 15 minutos para fijar las

uniones entre las proteínas y el ADN, y la reacción de entrecruzamiento se paró con

Page 61: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

53

glicina 0,125 M. Tras 5 minutos de incubación se lavaron las células con PBS y se

resuspendieron en un tampón de lisis en el que se mantuvieron durante 30 minutos a

4°C. Tras la centrifugación a 400 x g durante 5 minutos, el precipitado se lavó con PBS

frío, se congeló en nitrógeno líquido y se mantuvo a -80°C durante toda la noche. A las

muestras descongeladas a temperatura ambiente se les añadieron 300 μl de un

tampón de lisis con alta salinidad y para fragmentar la cromatina se procedió a su

sonicación en un Bioruptor (Diagenode) para generar fragmentos de ADN de entre

100 y 1000 pares de bases. Tras la centrifugación a 9300 x g durante 15 minutos, se

recuperó el sobrenadante que contiene la cromatina y parte de este se utilizó como

control (input). La solución de cromatina se incubó a 4°C durante 1 hora en un

rotador orbital en presencia de 50 μl de proteína A/G Plus Agarosa para disminuir las

uniones inespecíficas. Tras eliminar las bolas por centrifugación, se añadieron 10 μg

de anticuerpo frente al factor de transcripción de interés y se incubó a 4°C en un

rotador orbital durante toda la noche. Al día siguiente se añadieron otros 50 μl de

proteína A/G Plus Agarosa, se incubó durante 2 horas a 4°C en el rotador orbital, se

centrifugó a 13400 x g durante 1 minuto y se desechó el sobrenadante. Las bolas de

agarosa se lavaron 2 veces con un tampón de alta salinidad y 4 veces con un tampón

de lavado comercial. Para romper los entrecruzamientos y liberar el ADN, se

añadieron 400 μl de un tampón de elución y se incubó a 68°C durante 2 horas. Las

muestras se centrifugaron para eliminar las partículas de agarosa y el ADN se purificó

añadiendo 400 μl de fenol/cloroformo/isoamilalcohol, se centrifugó durante 3

minutos a 14000 x g y se recuperó la fase acuosa a la que se añadió 1 ml de etanol al

100% y 40 μl de acetato sódico 3 M. Tras mantenerlo a -20°C toda la noche, se

centrifugó durante 25 minutos a 14000 x g y el ADN precipitado se lavó con etanol al

70% para ser resuspendido, finalmente, en 30 μl de H2O grado Milli-Q.

Una vez purificado el ADN, se llevó a cabo la amplificación por qPCR con cebadores

diseñados frente a distintas zonas del promotor de IL23A y de IL10 (Tabla 3). Para la

cuantificación relativa se utilizaron los Ct del input (ΔCt = Ct condición X - Ct input) y

los resultados se expresan como % del mismo aplicando la ecuación 2 -ΔCt X 100/36

en la que 36 es el factor de dilución.

Page 62: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

54

Nombre Secuencias (5′-3′) Sentido Antisentido

IL23A Caja-X2 Proximal CTCTAGCCACAGCAACCACA GCCCGCCCTTTATACCAGCA

IL23A Caja-X2 Medial CTTAGCTGTTTCATCGATGTT CAGGAGTTCTGGGTAGTCG

IL23A Caja-X2 Distal TTCCATTGGTGTCCACCTTA CTTTAGATTAAACATTTCCAGCA

IL23A CHOP-C/EBP Proximal AGAACTCCTGGGCTTCCTAGCCAT GGCCTCATTCTGACGTCATCCA

IL23A CHOP-C/EBP Distal TAACGGTTTAGGCCCAGCTGAC TGTTGCGTGGCAGGAACTACA

IL10 Sitio CRE GGCAATTTGTCCACGTCACT TGATTTCCTGGGGAGAACAG

Tabla 3. Cebadores utilizados en los estudios de ChIP.

4. Análisis de proteínas

4.1 Obtención de extractos celulares para inmunodetecciones (Western Blot)

Extractos celulares totales

Tras ser lavadas con PBS por centrifugación, las CD se lisaron por la adición, para

5x106 células, de 50 µl de un medio compuesto por 20 mM HEPES, 40 mM β-

glicerofosfato, 2 mM ortovanadato, 10 mM EGTA, 2,5 mM MgCl2, 1 mM DTT y 1%

Nonidet P-40 suplementado con inhibidores de proteasas y fosfatasas (1 mg/ml

leupeptina, 5 mg/ml aprotinina, 0,1 M PMSF, 1 M NaF, 0,1 M pNPP, 0,1 M DTT y 200

mM ortovanadato). Tras la incubación en hielo durante 30 minutos, el lisado se

centrifugó a 4°C durante 10 minutos a 10200 x g para obtener el sobrenadante con

los extractos proteicos. La cuantificación de las proteínas se realizó mediante el

método colorimétrico descrito por Bradford (Bradford, 1976) que se basa en un

desplazamiento del máximo de absorción (entre 465-595 nm) del colorante azul de

Coomassie G-250 unido a las proteínas. La concentración de las proteínas se

determinó midiendo la absorbancia a 595 nm en un espectrofotómetro con la ayuda

de una curva patrón construida usando BSA como estándar.

Extractos nucleares y citosólicos

La obtención de los extractos nucleares se realizó empleando el Nuclear Extract Kit de

Active Motif siguiendo las instrucciones del fabricante. Tras lavar 107 células

dendríticas en 1 ml de PBS con inhibidores de fosfatasas se añadieron 300 µl de

Page 63: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

55

tampón hipotónico y se incubaron durante 15 minutos en hielo. A continuación se

añadieron 15 µl de detergente y, tras la agitación en vortex, se centrifugó a 14000 x g

durante 30 segundos para recuperar el sobrenadante (extractos citosólicos) y el

precipitado con la fracción nuclear. Al precipitado se le añadieron 50 µl del tampón de

lisis AM1 suplementado con DTT e inhibidores de proteasas (PIC), se mantuvo 30

minutos en hielo, se centrifugó a 14000 x g durante 10 minutos y se recuperó el

sobrenadante en el que se encuentra el extracto nuclear. La cantidad de proteína se

valoró según el método Bradford.

Electroforesis en condiciones desnaturalizantes, transferencia a

membranas de nitrocelulosa e inmunodetección.

Las muestras se sometieron a electroforesis en gel de poliacrilamida en condiciones

desnaturalizantes y reductoras según el procedimiento descrito por Laemmli

(Laemmli, 1970). Se cargaron de 50 a 100 µg de los correspondientes extractos,

previamente mezclados con tampón de Laemmli (60 mM Tris pH 6.8, 10 % glicerol

(v/v), 2 % SDS (p/v), 0.002 % azul de bromofenol (p/v)) suplementado con 20 mM

DTT, en geles de poliacrilamida (SDS/PAGE) a concentraciones finales de

poliacrilamida de 8, 10 o 12% en función del peso molecular de la proteína de interés.

El tampón de electroforesis estaba compuesto por 25 mM Tris, 0,2 M glicina y 1 g/l

SDS.

Tras la electroforesis a 25 mA, el contenido del gel se transfirió a una membrana de

nitrocelulosa mediante el sistema de transferencia de Bio-Rad en condiciones

húmedas a 100 V, durante 90 min, utilizando un tampón de transferencia compuesto

por 25 mM Tris, 0,2 M glicina, 20% metanol, 1 g/l SDS. Las membranas transferidas

se bloquearon por incubación con agitación suave, durante 1 hora a temperatura

ambiente en una solución compuesta por TTBS (0,05 M Tris-HCl, 0,15 M NaCl, 0,05%

Tween-20) y 5% BSA o 5% de leche desnatada, en función de las especificaciones del

anticuerpo primario. Tras el bloqueo se añadió el anticuerpo primario resuspendido

en su correspondiente solución de bloqueo y las muestras se mantuvieron durante

toda la noche en agitación suave a 4°C. Tras 3 lavados de 10 minutos con TTBS, se

añadió a las membranas el anticuerpo secundario, frente al anticuerpo primario,

conjugado con peroxidasa de rábano y se mantuvieron en agitación suave durante 1

hora a temperatura ambiente. Tras un nuevo lavado, se incubaron con el reactivo

Page 64: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

56

comercial ECL que permite la detección de los anticuerpos conjugados con peroxidasa

de rábano al originar un producto quimioluminiscente. Finalmente se expusieron a

películas auto-radiográficas que se revelaron con un equipo Curix-60 de AGFA. Los

anticuerpos primarios utilizados se muestran en la Tabla 4.

Anticuerpo Casa Comercial Dilución

ATF6 Abcam 1:500

β-actina Sigma 1:5000

CHOP Santa Cruz 1:500

COX-2 Santa Cruz 1:500

eIF2α Cell Signaling 1:1000

HIF1α Novus Biologicals 1:500

Histona H3 Abcam 1:1000

PKM2 Cell Signaling 1:1000

Pro-IL1β Cell Signaling 1:1000

P-S52-eIF2α Invitrogen 1:1000

P-Ser-9-GSK3β Cell Signaling 1:1000

P-Y705-STAT3 Cell Signaling 1:1000

STAT3 Cell Signaling 1:1000

sXBP1 BioLegend 1:500

TBP Diagenode 1:30000

Tabla 4. Anticuerpos empleados en Western Blot, casas comerciales y concentraciones

utilizadas.

4.2 Cross linking de PKM2

Se sembraron 107 células dendríticas por condición y se lavaron 3 veces con PBS a pH

8. El cross linking se realizó incubando las células durante 30 minutos a temperatura

ambiente, con disuccinimidil suberato 650 µM según describió Palsson-McDermott et

al., 2015. La reacción se paró mediante la adición de 100 mM Tris-HCl pH 7,4,

manteniendo las células durante 15 minutos a temperatura ambiente. La lisis celular

se realizó en las condiciones anteriormente descritas, pero omitiendo el DTT. La

electroforesis se realizó en gel de poliacrilamida al 8% para visualizar proteínas en el

rango de 60-240 KDa.

Page 65: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

57

4.3 ELISA

La IL-23 presente en los sobrenadantes provenientes de 106 células/ml se cuantificó

mediante un kit comercial de ELISA de la marca R&D Systems siguiendo las

instrucciones del fabricante. Las células en suspensión se centrifugaron a 6000 x g

durante 30 segundos y el sobrenadante se volvió a centrifugar a 16000 x g durante 1

minuto para eliminar los restos celulares. Se añadieron 100 µl del reactivo RD1-22 a

cada pocillo y 100 µl del estándar, control o la muestra y se incubó durante 2 horas

en agitación a temperatura ambiente. Se lavó la placa 4 veces, se añadieron 200 µl del

conjugado a cada pocillo y se volvió a incubar durante 2 horas. Tras lavar de nuevo se

añadieron 200 µl de la solución sustrato y se incubó durante 30 minutos a

temperatura ambiente protegido de la luz. Por último se añadieron 50 µl de la

solución de stop y se leyó la absorbancia a 450 nm.

4.4 Microscopía de fluorescencia confocal de barrido láser

Se añadieron 500 µl de una suspensión de células a una concentración de 4x105

células/ml sobre cristales de 12 mm de diámetro cubiertos con poli-L-lisina y se

dejaron adherir durante al menos 12 horas. Tras la estimulación, se lavaron con una

solución de BSA al 0,2% en PBS y se fijaron con formaldehido al 10% en PBS durante

30 minutos. Los cristales se volvieron a lavar 2 veces y se añadió Tritón al 0,3% para

permeabilizar las células. Después de incubar durante 10 minutos se realizó el

bloqueó con 10% de FBS en PBS durante 20 minutos. Los cristales se lavaron durante

5 minutos con PBS/BSA y se incubaron con los anticuerpos anti-HIF1α o anti-PKM2

(dilución 1:200 en PBS suplementado con el 1% de BSA) durante 1 hora.

Transcurrido este tiempo y tras 3 lavados de 5 minutos, se añadieron el anticuerpo

secundario (IgG anti-conejo generado en cabra marcado con Alexa-Fluor 480, dilución

1:100) y el DAPI (dilución 1:1000), para teñir los núcleos. Se lavaron por última vez

las preparaciones, se montaron sobre una gota de Gelvatol en porta-objetos de un

tamaño de 26x76 mm y se sellaron con esmalte. Los cristales se observaron usando

un microscopio Leica TCS SP5 con un láser de luz blanca y un objetivo de aceite de

inmersión Leica 63PL APO NA 1.40. El análisis de las imágenes y los fluorogramas de

co-localización subcelular se realizaron usando el paquete de software LAS AF Lite del

confocal Leica y el software Adobe Photoshop CS5.1.

Page 66: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

58

5. Estudios bioenergéticos

El análisis bioenergético de las CD se llevó a cabo utilizando los analizadores de flujo

extracelular Seahorse Bioscience XFe24 o Seahorse Bioscience XFe96 en los

experimentos en los que las células se pre-incubaron con el compuesto ML-265. En el

primer caso, las células se estimularon con distintas concentraciones de zymosan o

LPS durante 30 minutos y 4 horas. A continuación se adhirieron 2x105 CD a placas de

Seahorse cubiertas de poli-ornitina y se analizaron la tasa de acidificación extracelular

(ECAR) y la tasa de consumo de oxígeno (OCR) de acuerdo con el protocolo XF Cell

Mito Stress Test en medio XF (medio RPMI 1640 con 11,1 mM de glucosa, 4 mM de

glutamina y 2% de FBSi). El equipo mide las variaciones en el pH y la presión de O2

bajo condiciones basales y en respuesta a distintos compuestos que se van

adicionando secuencialmente: 1 µM oligomicina (OM) que inhibe el complejo V

mitocondrial o ATP sintasa, 1,5 µM carbonilcianuro-p-trifluorometoxifenilhidrazona

(FCCP) agente desacoplante que permite el paso de protones a través de la

membrana, y 100 nM rotenona /1 µM antimicina A (Rot/AA) que bloquean los

complejos I y III de la cadena de transporte de electrones mitocondrial (Figura 13).

Los datos obtenidos se normalizaron en función de la cantidad de proteína. En los

experimentos en los que se utilizó el compuesto ML-265, las células se adhirieron con

Cell-Tak a las placas de Seahorse y se pre-trataron con 50 µM de ML-265 durante 30

minutos. Tras 30 minutos de estabilización en el equipo, se inyectaron los estímulos y

se analizaron la ECAR y la OCR aplicando el protocolo anterior. En este caso la

normalización, en función del número de células, se realizó mediante la medida de la

absorbancia utilizando la tinción con Hoechst 33342.

Page 67: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

59

Figura 13. Representación de las gráficas de la tasa de consumo de oxígeno y de acidificación

extracelular obtenidas con el Seahorse. El protocolo XF Cell Mito Stress Test permite calcular

distintos parámetros del metabolismo celular adicionando secuencialmente distintos compuestos: OM,

FCCP y Rot/AA. Mediante las variaciones de la presión de O2 provocadas se pueden calcular la

respiración basal (basal), la respiración máxima (maximum), la capacidad respiratoria de reserva

(SRC), el consumo de oxígeno destinado a la producción de ATP (ATP production), la fuga de protones

(H+ leak) y el consumo de oxígeno no debido a la respiración mitocondrial (non-mitocondrial

respiration) y mediante las variaciones de pH la glucólisis basal (glycolysis), la capacidad glucolítica

máxima (maximum glycolytic capacity) y la reserva glucolítica (glycolytic reserve).

6. Medida de lactato

6.1 Lactato extracelular

Se recuperaron los sobrenadantes correspondientes a 106 células/ml. La suspensión

celular se centrifugó a 6000 x g durante 30 segundos para precipitar las células y el

sobrenadante se centrifugó posteriormente a 13000 x g durante 10 minutos a 4°C

para precipitar el material insoluble. Se desproteinizaron 500 µL de este

sobrenadante mediante su paso por columnas MWCO de 10 kDa cut-off para eliminar

la enzima lactato deshidrogenasa y la fracción soluble se analizó utilizando el test

colorimétrico Lactate Assay Kit II de Sigma siguiendo las instrucciones del fabricante.

Con este propósito se cargaron placas de 96 pocillos con de 0,5 a 10 µl de muestra en

un volumen final de 50 µl con una mezcla de reacción compuesta por tampón de

ensayo, enzima y sustrato. La placa se incubó durante 30 minutos a temperatura

ambiente protegida de la luz y se midió la absorbancia a 450 nm.

6.2 Lactato intracelular

El lactato intracelular se midió por cromatografía líquida de ultra-rendimiento de fase

reversa y espectrometría de masas (UPLC-MS). Se realizó una extracción de

Page 68: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

60

metabolitos mediante la lisis de las células con una mezcla metanol:acetonitrilo:agua

(2:2:1, v/v/v). Se utilizaron 2x107 CD por condición, que se lavaron con PBS por

centrifugación, previamente a la adición de 1 ml de la mezcla anteriormente descrita.

La incubación se mantuvo a 4°C y el homogeneizado celular se traspasó a tubos

Eppendorf, se agitó en vortex durante 30 segundos y se congeló en nitrógeno líquido

durante 1 minuto. Tras la descongelación a temperatura ambiente, las muestras se

sonicaron durante 15 minutos a 4°C. Después de un segundo ciclo de congelación y

sonicación el lisado se mantuvo a -20°C durante 1 hora y se centrifugó a 16000 x g

durante 15 minutos a 4°C para su desproteinización. El sobrenadante se evaporó a

sequedad en un evaporador SpeedVac y el residuo sólido se solubilizó en una mezcla

de acetonitrilo:agua (1:1, v/v). Posteriormente se sonicó durante 10 minutos a 4°C y

se centrifugó a 16000 x g durante 15 minutos para eliminar el material insoluble.

Finalmente, para el análisis por UPLC-MS, las muestras se volvieron a evaporar a

sequedad y se resuspendieron en agua Milli-Q.

La separación cromatográfica se realizó con una columna Acquity CORTECS UPLC®

C18, 1.6 µm, 2.1x100 mm (Waters) conectada a una fuente de ionización por

electrospray de un espectrómetro de masas Q-TOF SYNAPT HDMS G2 (Waters). El

gradiente de elución se hizo con dos eluyentes agua:metanol:ácido fórmico (95:5:0,1,

v/v/v) con 5 mM de formato de amonio y 100% acetonitrilo con 0,1% de ácido

fórmico y 5 mM de formato de amonio.

El análisis de los espectros de masas se calculó en el modo ión negativo para los

ácidos carboxílicos, método que permite la detección de analitos tanto de alta

(escaneo completo) como de baja energía (energía de colisión) con una

fragmentación parcial del ión.

7. Medida de los niveles de Ca2+ intracelular

Se adhirieron 2x105 células a cristales de 12 mm de diámetro cubiertos de poli-

ornitina y se incubaron durante 1 hora a temperatura ambiente con 4 µM fura 2-

acetoximetil ester (FURA-2) en un medio con la siguiente composición: 145 mM NaCl,

5 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM CaCl2, 10 mM glucosa, y 10 mM HEPES, pH 7,4.

Page 69: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

MATERIALES Y MÉTODOS

61

Posteriormente los cristales se lavaron con medio fresco y se montaron en un

microscopio Nikon Diaphot. Las soluciones test se aplicaron por perfusión continua a

2-3 ml/minuto. Para las medidas de fluorescencia, las CD se epi-iluminaron

alternativamente a 340 y 380 nm y se analizó la luz emitida a 520 nm utilizando la

Cámara Digital Hamamatsu C4742-98 con el software Hamamatsu Simple PCI 6.6. Los

fotogramas consecutivos obtenidos se cuantificaron pixel por pixel usando el software

ImageJ.

8. Análisis estadístico

Los datos obtenidos en al menos tres experimentos independientes se analizaron con

el programa estadístico Prisma (GraphPad Software) y se representan como la media

± error estándar de la media (EEM). La comparación entre dos grupos

experimentales se llevó a cabo mediante el test Student t-test de dos colas. Las

diferencias se consideraron significativas para un valor de p˂0,05.

Page 70: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de
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Resultados

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RESULTADOS

65

1. Reprogramación metabólica tras la estimulación de las células

dendríticas

Con el fin de estudiar los cambios metabólicos, se realizaron mediciones en tiempo

real del consumo de oxígeno y del pH del medio tras la estimulación de las CD con

distintas concentraciones de zymosan y de LPS, utilizando el analizador de flujo

extracelular Seahorse XFe24. Como se muestra en la Figura 14 (paneles B y C) ambos

estímulos produjeron un incremento de la ECAR y, en el caso del zymosan, una

tendencia al aumento de la OCR, especialmente tras 4 horas de estimulación. Este

aumento fue similar con las distintas concentraciones de estímulo utilizadas (Figura

14 A) y se observó a partir de los 30 minutos de estimulación, lo que indica que el

cambio en el perfil bioenergético caracterizado por una baja razón OCR/ECAR se

produce rápidamente y en presencia de concentraciones reducidas de los estímulos

(Figura 14 D). En concordancia con el aumento de la OCR inducida por el zymosan, el

consumo de oxígeno destinado a la producción de ATP también tendió a aumentar a

las 4 horas (Figura 14 E).

Page 74: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

66

Figura 14. Efecto del zymosan y del LPS sobre el metabolismo bioenergético de las células

dendríticas. (A) Registros del protocolo XF Mito Stress Test Kit obtenidos en CD estimuladas con

distintas concentraciones de zymosan y de LPS. (B-E) Análisis de la ECAR y la OCR. Las CD se incubaron

durante los tiempos indicados en presencia 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS y se adhirieron a

placas revestidas de poli-ornitina. Los datos se normalizaron en función de la cantidad de proteína y se

representan como la media ± EEM de tres experimentos independientes.* Indica p˂0.05 con respecto

al control.

Page 75: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

67

El fenotipo metabólico, definido por la relación entre la OCR y la ECAR, se clasifica

como quiescente, aeróbico, energético o glucolítico en función del predominio de la

glucólisis o de la respiración mitocondrial, los resultados obtenidos muestran un

fenotipo metabólico claramente desplazado hacia la zona glucolítica, asociado con

una ligera desviación a la zona energética en el caso del zymosan (Figura 15).

1.1 Análisis del mecanismo implicado en la reprogramación metabólica

Uno de los mecanismos que promueven el aumento de la glucólisis, incluso en

situaciones de normoxia, es la activación del factor de transcripción HIF1. Esto se

debe a la estabilización de su subunidad HIF1α y a la subsiguiente inducción de la

expresión de genes que codifican enzimas implicadas en la glucólisis. En macrófagos y

algunos tipos de células tumorales la actividad de HIF1α depende de la formación de

un complejo en el núcleo con la PKM2. Asimismo, la PKM2 puede actuar como

proteína quinasa y fosforilar STAT3 (Gao et al., 2012), por lo que genera un bucle de

retroalimentación positiva puesto que a su vez, P-Y705-STAT3 activa la transcripción

de HIF1α (Dang et al., 2011; Shehade et al., 2015). Sobre estas bases, se procedió a

estudiar la posible participación de estas proteínas en la inducción de los cambios

metabólicos.

Las distintas isoformas de la PKM catalizan el último paso de la glucólisis, consistente

en la conversión del fosfoenolpiruvato en piruvato. En las células inmunes en reposo

y en los tejidos diferenciados, esta reacción está mediada por PKM1. Sin embargo,

durante la reprogramación metabólica que se produce en células inmunes activadas,

la expresión de PKM1 puede disminuir en favor de PKM2. Con el fin de estudiar la

expresión de las isoformas de PKM generadas por splicing alternativo de exones

Figura 15. Fenotipo metabólico de las

células dendríticas. Representación del

fenotipo metabólico tras 30 minutos de

estimulación con 1 mg/ml de zymosan o

10 µg/ml de LPS. Los resultados se

representan como la media de tres

experimentos independientes.

Page 76: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

68

mutuamente excluyentes, se analizó su ARNm mediante qPCR con dos pares de

cebadores que generan productos distinguibles por el número de pares de bases.

Además, sus amplicones difieren en la presencia en el transcrito de PKM2 de un sitio

de restricción StuI que permite su digestión en dos productos de 149 pb y 34 pb. La

normalización del ARNm de las isoformas de PKM con respecto a la GAPDH mostró

una expresión preferencial del ARNm de PKM2 frente a PKM1 (Figura 16 A). La

diferente migración de las dos isoformas y su distinta sensibilidad al tratamiento con

StuI se muestran en la Figura 16 B. El estudio de la expresión de la proteína mediante

microscopía confocal mostró una alta expresión de PKM2 en el núcleo y en el

citoplasma de las CD estimuladas con zymosan (Figura 16 C).

Figura 16. Expresión de las isoformas de PKM. (A y B) Tras 5 días de diferenciación en presencia de

GM-CSF e IL-4 se extrajo el ARNm de las CDi y se analizó mediante qPCR. (A) Expresión del ARNm de

las isoformas de PKM con respecto a la GAPDH. Los resultados se representan como la media ± EEM de

cuatro experimentos independientes. (B) Digestión por StuI del amplicon de PKM2. El resultado es

representativo de cuatro experimentos independientes. (C) Imagen de microscopía de fluorescencia

confocal de la enzima PKM2. Las células se estimularon con 1 mg/ml de zymosan durante 4 horas.

Con la intención de determinar los niveles de expresión de HIF1α y la activación de

STAT3, mediante la detección de la proteína fosforilada, se realizaron experimentos

de qPCR y Western Blot. El zymosan y el LPS activaron la fosforilación de la tirosina

705 de STAT3 (Figura 17 B) y aumentaron la expresión del ARNm de HIF1α y la

Page 77: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

69

estabilización de la proteína (Figura 17 paneles A y B). El patrón temporal de

fosforilación de STAT3 y de expresión de HIF1α fue diferente para cada estímulo

(Figura 17 B). En el caso del zymosan se apreció una clara fosforilación de STAT3 a las

4 horas que coincidió con la detección de HIF1α a ese tiempo, aunque la expresión de

HIF1α alcanzó una mayor intensidad a las 7 horas, para disminuir posteriormente. En

el caso del LPS, la fosforilación de STAT3 a las 4 horas fue menos evidente, al igual

que la expresión de HIF1α que alcanzó su máximo nivel de expresión a las 24 horas.

La estabilización y translocación nuclear de HIF1α en respuesta al zymosan se

confirmó mediante estudios de inmunofluorescencia de microscopía confocal (Figura

17 C).

Figura 17. Expresión de HIF1α y fosforilación de STAT3. Las CD se estimularon con 1 mg/ml de

zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4 horas (A y C) o los tiempos indicados (B). (A) Análisis de la

inducción del ARNm de HIF1α mediante qPCR. Los resultados se representan como la media ± EEM

de cinco experimentos independientes.* Indica p˂0,05 con respecto al control. (B) Expresión de

HIF1α y fosforilación de STAT3 en fracciones nucleares. Los extractos proteicos se analizaron

mediante Western Blot. Se utilizó la proteína de unión a la caja TATA (TBP) como control de carga. El

resultado es representativo de dos experimentos independientes. (C) Imagen de microscopía de

fluorescencia confocal del factor de transcripción HIF1α.

Page 78: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

70

Tomados en conjunto, estos resultados muestran la presencia de estas proteínas en

los núcleos de las CD estimuladas con zymosan y LPS. A pesar de que el patrón

temporal de la estabilización de HIF1α no explicaría los cambios en el perfil

bioenergético que se observan a los 30 minutos, los resultados sugieren una posible

implicación en el mantenimiento del mismo.

Page 79: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

71

2. Modulación del metabolismo de la glucosa y regulación

transcripcional de la producción de citoquinas en células

dendríticas

El cambio más significativo que se encontró en el metabolismo de las CD estimuladas

por PAMP fue el aumento de la ECAR que se explica por el incremento de la

concentración de lactato extracelular como consecuencia del aumento de la glucólisis

aerobia (Krawczyk et al., 2010; Everts et al., 2012; Kelly y O'Neill, 2015). Por este

motivo se decidió realizar experimentos de modulación del flujo glucolítico con el fin

de modificar los niveles de lactato y analizar su posible papel sobre la expresión de

citoquinas, prestando especial atención a la citoquina IL-23. En la Figura 18 se

muestra el esquema del mecanismo de actuación de algunos de los compuestos

utilizados con este fin.

Figura 18. Esquema del abordaje farmacológico empleado para modular el metabolismo de la

glucosa. Con el fin de inhibir el flujo glucolítico se utilizaron medio sin glucosa y el inhibidor de la

hexoquinasa, 2-DG. El compuesto ML-265 actúa reforzando la forma tetramérica de la enzima PKM y

aumentando su actividad glucolítica. El compuesto UK5099 inhibe el transportador mitocondrial de

piruvato y bloquea el flujo de piruvato a la mitocondria, mientras que el DCA inhibe la piruvato

deshidrogenasa quinasa, por lo que favorece la activación de la piruvato deshidrogenasa. El lactato de

sodio puede aumentar las concentraciones intracelulares de lactato a través del transportador de

monocarboxilatos y también puede activar el receptor GPR81.

Page 80: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

72

2.1 Efectos de la privación de glucosa

Con este propósito se utilizaron medio sin glucosa y 2-DG, un inhibidor de la HK y de

la fosfoglucosa isomerasa ampliamente utilizado para simular las condiciones de

privación de glucosa en algunos procesos metabólicos.

Expresión de citoquinas

Se analizó la transcripción del ARNm de la cadena p19 de la citoquina IL-23 (gen

IL23A). La pre-incubación con 2-DG indujo un aumento significativo del transcrito

mientras que la ausencia de glucosa en el medio no mostró ningún efecto (Figura 19

A). Este incremento de los niveles de ARNm sólo coincidió con el aumento de la

cantidad de proteína, medida en los sobrenadantes, en respuesta al LPS (Figura 19 E).

Una explicación plausible de estos resultados es que la IL-23 es una citoquina

heterodimérica que incluye la cadena p40 (gen IL12B), por lo que la producción de la

proteína depende también de la expresión de la cadena p40. En este sentido, el

zymosan induce una escasa expresión de IL-12 p40 (Rodríguez et al., 2014), mientras

que el LPS es un potente inductor de la expresión de la cadena p40 (Figura 19 B). El

hecho de que la disponibilidad de la cadena común p40 es un factor limitante para la

secreción de la citoquina, junto a la elevada producción de IL-23 inducida por el

zymosan (alcanzando casi los 4 ng por millón de células), pueden explicar la

incapacidad de las CD para generar una mayor cantidad de IL-23 en respuesta al

zymosan y la discordancia observada entre los niveles de proteína y ARNm.

Ni la privación de glucosa, ni la adición de 2-DG influyeron sobre la inducción del

ARNm de las citoquinas IL-10 e IL-1β en respuesta al zymosan. Sin embargo, la 2-DG

en combinación con el LPS produjo una disminución de los transcritos de ambas

citoquinas, en especial de la IL-10 (Figura 19 paneles C y D). La IL-1β se produce en

forma de un precursor inactivo (pro-IL-1β) que debe sufrir un procesamiento

enzimático para producir la proteína activa. Como se muestra en la Figura 19 F, el

zymosan y el LPS indujeron la expresión de pro-IL-1β pero con patrones temporales

diferentes, siendo mucho más temprana la aparición de la proteína en respuesta al

LPS (4 horas) que al zymosan (24 horas). La pre-incubación de las CD con 2-DG abolió

la expresión de pro-IL-1β en ambos casos.

Page 81: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

73

Figura 19. Efecto de la 2-DG y de la privación de glucosa sobre la expresión de citoquinas. Las CD

se pre-incubaron en presencia de glucosa (11,1 mM), ausencia de glucosa o en presencia de 2-DG (10

mM) y glucosa durante 1 hora. (A-D) Análisis de la inducción del ARNm de distintas citoquinas

mediante qPCR. Tras la pre-incubación las CD se estimularon con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de

LPS durante 4 horas. (E) Producción de IL-23. Tras la pre-incubación las CD se estimularon con

zymosan o LPS durante 24 horas a las concentraciones anteriormente indicadas y se midió por ELISA la

cantidad de IL-23 presente en los sobrenadantes. Los datos se normalizaron en función del número de

células. Los resultados se representan como la media ± EEM de tres a diez experimentos

independientes.* Indica p˂0.05 con respecto a la glucosa. (F) Expresión de pro-IL1β. Tras la pre-

incubación las CD se estimularon con zymosan o LPS durante los tiempos señalados a las

concentraciones anteriormente indicadas. Los extractos proteicos se analizaron mediante Western

Blot. Se utilizó la β-actina como control de carga. El resultado es representativo de dos experimentos

independientes.

Producción de lactato

A la vista del distinto efecto producido por la privación de glucosa y la incubación con

2-DG y con el fin de determinar el modo en que estas condiciones afectaban al flujo

glucolítico, se analizaron los niveles de lactato en los sobrenadantes. Como se

Page 82: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

74

muestra en la Figura 20, el incremento de los niveles de lactato inducidos por el

zymosan y el LPS disminuyó intensamente en ausencia de glucosa y en menor medida

en presencia de 2-DG.

Figura 20. Efecto de la 2-DG y de la privación de glucosa sobre la producción de lactato. Las CD

se pre-incubaron en presencia de glucosa (11,1 mM), ausencia de glucosa o en presencia de 2-DG (10

mM) y glucosa durante 1 hora y posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml

de LPS durante 24 horas. La producción de lactato se midió en los sobrenadantes mediante un kit

comercial y se normalizó en función del número de células. Los resultados se representan como la

media ± EEM de tres experimentos independientes.* indica p˂0.05 con respecto a la glucosa.

Además de regular la expresión de enzimas de la glucólisis, HIF1α se ha relacionado

con la producción de citoquinas pro-inflamatorias en macrófagos (Tannahill et al.,

2013) y se ha descrito que su estabilización se regula por los niveles de lactato en

monocitos (Wei et al., 2015; Gupta et al., 2016). Por este motivo se estudió su

expresión en las distintas condiciones. La privación de glucosa y la presencia de 2-DG

disminuyeron la expresión de HIF1α inducida por el zymosan, siendo este efecto

revertido por el lactato de sodio (Figura 21).

Figura 21. Efecto de la 2-DG y de la

privación de glucosa sobre la expresión

de HIF1α. Las CD se pre-incubaron

durante 1 hora con las adiciones indicadas

a las siguientes concentraciones: glucosa

11,1 mM, 2-DG 10 mM y lactato de sodio

15 mM. Posteriormente se estimularon

con 1 mg/ml de zymosan durante 4 horas y

los extractos proteicos se analizaron

mediante Western Blot. Se utilizó la β-

actina como control de carga. El resultado

es representativo de dos experimentos

independientes.

Page 83: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

75

Efecto del lactato de sodio y de la modulación del flujo de piruvato

Para analizar el efecto del lactato sobre la expresión de citoquinas se adicionó lactato

de sodio y se bloqueó la entrada de piruvato a la mitocondria con el inhibidor del

transportador mitocondrial de piruvato UK5099.

La adición de lactato de sodio tuvo efectos diferentes en función del estímulo

utilizado. Produjo el aumento del ARNm de IL23A e IL10 y una tendencia a disminuir

el ARNm de IL1B en respuesta al zymosan. En el caso del LPS se observó un aumento

de la transcripción de IL23A y no se observó efecto significativo sobre la inducción de

las otras citoquinas (Figura 22 A). De forma opuesta, el compuesto UK5099 redujo la

transcripción de todas las citoquinas, especialmente en respuesta al zymosan a pesar

de aumentar la concentración de lactato intracelular (Figura 22 B), lo que pone de

manifiesto la importancia de la entrada de piruvato a la mitocondria. De acuerdo con

este resultado, la pre-incubación de las células con DCA, un compuesto que favorece

la actividad de la piruvato deshidrogenasa al inhibir la actividad de la piruvato

deshidrogenasa quinasa (Patel y Korotchkina 2006) y que aumenta la actividad del

ciclo de Krebs y el flujo de piruvato a la mitocondria (Kaplon et al., 2013; Meiser et al.,

2016) indujo un aumento del ARNm de IL23A e IL10 (Figura 22 C).

Page 84: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

76

Figura 22. Efecto del lactato de sodio, del UK5099 y del DCA sobre la transcripción de

citoquinas. Las CD se pre-incubaron en presencia de lactato de sodio (15 mM) durante 1 hora,

UK5099 (50 µM) o DCA (5 mM) durante 30 minutos y posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de

zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4 horas o 30 minutos (B panel inferior derecho). (A, B y C)

Análisis de la inducción del ARNm de distintas citoquinas mediante qPCR. (B panel inferior derecho)

Niveles de lactato intracelular medidos por UPLC-MS y normalizados en función de la cantidad de

proteína. Los resultados se representan como la media ± EEM de tres a cuatro experimentos

independientes.* Indica p˂0.05.

Se ha descrito que las células del sistema inmune, además del transportador de

monocarboxilatos, que es el utilizado por el lactato, también poseen un receptor

acoplado a proteínas G, GPR81, que reconoce el lactato (Haas et al., 2016). La

activación de este receptor produce el aumento del inositoltrisfosfato e inhibe la

Page 85: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

77

adenilato ciclasa a través de una ruta de señalización que incluye proteínas Gαi (Ge et

al., 2008). Con el fin de determinar si la adición de lactato de sodio conduce a la

activación de este receptor en células dendríticas, se realizaron experimentos con el

sensor ratiométrico de calcio intracelular FURA2. La adición de lactato aumentó la

razón de fluorescencia confirmando de esta forma la funcionalidad de este receptor y

la actividad de esta ruta en las CD (Figura 23).

Figura 23. Efecto del lactato de sodio sobre la concentración intracelular de calcio. Las CD se

adhirieron a placas de poli-ornitina y se marcaron con fura 2 acetoxi-metil-ester (4 µM) durante 1

hora. (A) Imagen tomada del microscopio Nikon Diaphot con las células epi-iluminadas a 380 nm. (B)

Razón de fluorescencia generada por la perfusión de las adiciones indicadas. Succinato (0,5 mM)

(Succ), fumarato (0,5mM) (Fum), lactato (15 mM) (Lac).

Estos resultados indican que existen receptores en las CD que reconocen como

ligandos a intermediarios metabólicos de la glucólisis y del ciclo de Krebs, aunque no

sea posible discriminar que parte del efecto pueda explicarse por la señalización de

los receptores, frente al efecto dependiente de la entrada de lactato por el

transportador de monocarboxilatos.

Implicación de la respuesta a proteínas mal plegadas: el papel de la

rama IRE

A la vista de que los resultados obtenidos no se podían explicar simplemente por las

variaciones en los niveles de lactato generadas por el bloqueo del metabolismo de la

glucosa, se estudiaron otros efectos de la 2-DG. La 2-DG, además de ser un mimético

de la glucosa, es el producto resultante de la pérdida del grupo hidroxilo anclado al

Page 86: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

78

carbono-2 de la manosa por ello puede interferir en todas las reacciones que utilizan,

además de glucosa, manosa como sustrato incluidas las N-glicosilaciones de

proteínas, por lo que es razonable postular que este compuesto podría desencadenar

el estrés del retículo endoplasmático y activar la UPR.

La activación del factor de transcripción XBP1 de la rama IRE de la UPR depende de la

actividad endonucleasa de IRE1α, que tras ser activada por fosforilación en

condiciones de estrés, escinde 26 pb del ARNm inicial de XBP1 para que se traduzca

la proteína activa (Calfon et al., 2002). Para analizar la activación de la rama IRE, se

estudió el splicing del ARNm de XBP1 mediante una reacción de qPCR con cebadores

que amplifican la forma con splicing y la intacta. La Figura 24 A muestra como la pre-

incubación de las células con 2-DG aumentó el ARNm de XBP1 de manera más

significativa cuando las células se estimularon posteriormente con zymosan o LPS.

Para analizar el splicing de XBP1, se realizó una electroforesis en gel de agarosa con el

producto de amplificación de la qPCR que determinó que la pre-incubación de las

células con 2-DG sólo generó un splicing evidente de XBP1 cuando se utilizó en

combinación con los PAMP, como indica la aparición de la intensa banda sXBP1

(Figura 24 B). Por el contrario, la ausencia de glucosa en el medio no tuvo ningún

efecto ni sobre la transcripción, ni sobre el splicing de XBP1.

Figura 24. Efecto de la privación de glucosa y de la 2-DG sobre la transcripción y el splicing de

XBP1. Las CD se pre-incubaron en presencia de glucosa (11,1 mM), ausencia de glucosa o en presencia

de 2-DG (10 mM) y glucosa durante 1 hora y posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de zymosan o

10 µg/ml de LPS durante 4 horas. (A) Análisis de la inducción del ARNm de XBP1 mediante qPCR. Los

resultados se representan como la media ± EEM de cuatro experimentos independientes.* Indica

p˂0.05 con respecto a la glucosa. (B) Análisis del splicing de XBP1. Tras realizar una qPCR con

cebadores que abarcan las regiones sin el splicing se realizó una electroforesis en gel de agarosa con

los productos de amplificación. uXBP1 indica la forma sin splicing, sXBP1 indica la forma con splicing.

Se utilizó la expresión de GAPDH como control de carga. El resultado es representativo de cuatro

experimentos independientes.

Page 87: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

79

Con el fin de analizar estos resultados en el contexto de la UPR, se indujo estrés de

retículo con compuestos que inducen la UPR por distintos mecanismos: la

tunicamicina, un potente inhibidor de las N-glicosilaciones, y la tapsigargina que

inhibe la ATPasa de calcio del retículo endoplasmático (SERCA) y genera estrés al

modificar las concentraciones de calcio intracelular, pero que no influye en las

reacciones de N-glicosilación. Para determinar el efecto de estos compuestos sobre la

glicosilación de proteínas, se eligió la ciclooxigenasa 2 (COX2), como un representante

característico de las posibles alteraciones en la N-glicosilación. La COX2 es una

enzima que posee cuatro asparaginas glicosiladas, tres de las cuales se encuentran en

su centro activo y son necesarias para su correcto plegamiento y actividad catalítica

(Otto, DeWitt y Smith, 1993). La enzima completamente glicosilada posee una masa

de 76 kDa y la forma no glicosilada en los residuos Asn 68, Asn 144 y Asn 410,

presenta una masa molecular de 68 kDa. Como se observa en la Figura 25 A y en

concordancia con la bibliografía (Yu y Kim, 2010) el pre-tratamiento de la células

dendríticas con 2-DG y tunicamicina redujo la N-glicosilación de COX-2, produciendo

un cambio en la migración de esta proteína, detectable por Western Blot, mientras que

la tapsigargina no mostró ningún efecto. Sin embargo, los tres compuestos indujeron

un gran splicing de XBP1, especialmente en presencia de los PAMP, lo que confirma la

activación de la rama IRE de la UPR (Figura 25 B). Además, estos compuestos

ofrecieron resultados similares a los generados por la 2-DG en combinación con los

PAMP en cuanto a la transcripción de citoquinas, ya que tanto la pre-incubación de las

CD con tunicamicina como con tapsigargina aumentaron los niveles del ARNm de

IL23A cuando las células se estimularon con zymosan o LPS y redujeron los niveles de

ARNm de IL-10 en respuesta al LPS (Figura 25 C).

Page 88: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

80

Figura 25. Efecto de la 2-DG, la tunicamicina y la tapsigargina sobre la glicosilación de COX2, el

splicing de XBP1 y la transcripción de citoquinas. Las CD se pre-incubaron en presencia de 2-DG

(10 mM), tunicamicina (10 µM) o tapsigargina (1 µM) durante 1 hora y posteriormente se estimularon

con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4 horas. (A) Análisis de la glicosilación de COX2.

Los extractos proteicos se analizaron mediante Western Blot. Gli-COX2 indica la forma glicosilada. Se

utilizó la β-actina como control de carga. El resultado es representativo de dos experimentos

independientes. (B) Análisis del splicing de XBP1. Tras realizar una qPCR con cebadores que abarcan

las regiones sin el splicing se realizó una electroforesis en gel de agarosa con los productos de

amplificación. uXBP1 indica la forma sin splicing, sXBP1 indica la forma con splicing. Se utilizó la

expresión de la GAPDH como control de carga. El resultado es representativo de tres experimentos

independientes. (C) Análisis de la inducción del ARNm de IL23A e IL10 mediante qPCR. Los resultados

se representan como la media ± EEM de tres a cuatro experimentos independientes.* Indica p˂0.05 con

respecto al control.

Los resultados anteriores mostraban una posible relación entre la transcripción de

IL23A e IL10 y la forma procesada de XBP1, por ello se llevaron a cabo experimentos

de qPCR utilizando inhibidores de la actividad endonucleasa de IRE1α y suplementos

de manosa, con intención de revertir el impacto de la 2-DG sobre el splicing de XBP1 y

valorar los efectos sobre la transcripción de estas citoquinas. La adición de manosa y

el inhibidor de la actividad endonucleasa de IRE1α, MKC8866, bloquearon el splicing

del ARNm de XBP1 producido por la 2-DG en combinación con los PAMP, como indica

la desaparición de la banda de la forma con splicing de XBP1 (Figura 26 A). El pre-

Page 89: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

81

tratamiento de las células con estos compuestos revirtió el efecto de la 2-DG sobre la

transcripción de IL23A en respuesta al zymosan, puesto que los niveles de ARNm

fueron similares a los inducidos por la estimulación de las CD con zymosan en

ausencia de 2-DG (Figura 26 B). El resultado con el LPS fue diferente, ya que dos

inhibidores de la actividad endonucleasa de IRE1α con distinta estructura química,

MKC8866 y 4µ8C no inhibieron el incremento del ARNm de IL23A causado por la 2-

DG (Figura 26 paneles B y C). Asimismo, se observó la ausencia de efecto del pre-

tratamiento con 2-DG sobre la transcripción de IL10 inducida por el zymosan, ya que

los niveles de ARNm de esta citoquina no se modificaron en estas condiciones.

Ninguno de los dos inhibidores de IRE1α tuvo efecto sobre la disminución de la

transcripción de IL10 observada en el sistema 2-DG-LPS (Figura 26 D). Estos

resultados sugieren la implicación de mecanismos diferentes para la modificación del

patrón de citoquinas generado por la 2-DG en función de la naturaleza del PAMP.

Figura 26. Efecto de los inhibidores de IRE1α y de la adición de manosa sobre el splicing de

XBP1 y la transcripción de citoquinas. Las CD se pre-incubaron durante 30 minutos en presencia de

MKC8866 (10 µM), manosa (1 mM) o 4µ8C (10 µM) antes de ser tratadas con 2-DG (10 mM) durante 1

hora y posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4 horas. (A)

Análisis del splicing de XBP1. Tras realizar una qPCR con cebadores que abarcan las regiones sin el

splicing se realizó una electroforesis en gel de agarosa con los productos de amplificación. uXBP1

indica la forma sin splicing, sXBP1 indica la forma con splicing. Se utilizó la expresión de GAPDH como

control de carga. El resultado es representativo de tres experimentos independientes. (B, C y D)

Análisis de la inducción del ARNm de IL23A e IL10 mediante qPCR Los resultados se representan como

la media ± EEM de tres a cuatro experimentos independientes.* Indica p˂0.05 con respecto a la 2-DG.

Page 90: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

82

Además de los estudios de expresión de ARNm, se analizó mediante Western Blot la

expresión de la proteína sXBP1. Esta se detectó en el núcleo de las CD sin estimular y,

aunque pareció aumentar en combinación con la 2-DG con respecto al LPS, no sufrió

grandes variaciones con los distintos pre-tratamientos (Figura 27 C). Teniendo en

cuenta que estudios bioinformáticos previos mostraban la presencia de Cajas-X2 en el

promotor de IL23A identificados con la base de datos TRANSFAC (Rodríguez et al.,

2014) (Figura 27 A), y que se ha descrito que XBP1 juega un papel en la regulación de

diversas dianas que exhiben estas secuencias (Acosta-Alvear et al., 2007), se

realizaron estudios de inmunoprecipitación de cromatina para valorar la unión

directa de sXBP1 a estas secuencias. La simple pre-incubación de las células con 2-DG

aumentó la unión de sXBP1 a las tres Cajas-X2 que se analizaron y esta unión fue

mayor cuando se estimularon las células con zymosan. Este efecto fue revertido por el

inhibidor de la actividad endonucleasa de IRE1α MKC8866 (Figura 27 B). El LPS

mostró una tendencia a aumentar la unión de sXBP1 a la Caja-X2 distal y el pre-

tratamiento de las CD con 2-DG no ofreció grandes variaciones al utilizar este

estímulo (datos no mostrados).

Page 91: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

83

Figura 27. Implicación de sXBP1 en la

trans-activación de IL23A. (A) Estructura

del promotor de IL23A. Esquema de los sitios

de unión de los factores de transcripción más

relevantes identificados utilizando la base de

datos TRANSFAC. En color rojo se muestran

las Cajas-X2 (X2-Box) proximal (-259), medial

(-1181) y distal (-1848) a las que se puede

unir sXBP1. Figura adaptada de Rodríguez et

al. ,2014. (B y C) Las CD se pre-incubaron

durante 30 minutos en presencia de MKC8866

(10 µM) antes de ser tratadas con 2-DG (10

mM) durante 1 hora y posteriormente se

estimularon con 1mg/ml de zymosan o 10

µg/ml de LPS durante 4 horas (C) y con

1mg/ml de zymosan durante 1 hora (B). (B)

Análisis de la unión de sXBP1 a las Cajas-X2

del promotor de IL23A mediante ChIP. Los

resultados se representan como la media ±

EEM de tres experimentos independientes. *

Indica p˂0.05 con respecto al control. (C)

Expresión de la proteína sXBP1 en fracciones

nucleares. Los extractos proteicos se

analizaron mediante Western Blot. Se utilizó la

histona H3 como control de carga. El

resultado es representativo de dos

experimentos independientes.

Page 92: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

84

Puesto que el abordaje farmacológico mostraba la implicación de sXBP1 en la trans-

activación de IL23A, se estudió el efecto de la deleción del gen que codifica IRE1α,

Ern1, en experimentos con ratones Ern1f/fVav1-Cre que tienen el gen delecionado

específicamente en el sistema hematopoyético. En estudios preliminares se comprobó

que las células dendríticas derivadas de médula ósea de ratón respondían de forma

similar a las CD derivadas de monocitos humanos a los diferentes compuestos. Como

se muestra en la Figura 28 (paneles A y B), se observó un aumento de los niveles de

ARNm de Il23a al combinar la 2-DG con los PAMP y la inducción de la UPR como

demuestra la aparición de la banda de la forma con splicing de Xbp1 en el gel de

agarosa. Pero, a diferencia de las CD humanas, la inhibición de la actividad

endonucleasa de IRE1α con el compuesto 4µ8C revirtió parcialmente el efecto de la 2-

DG en respuesta al LPS ya que, aunque los niveles del ARNm de il23a no llegaron a ser

tan bajos como los inducidos por el estímulo en ausencia de 2-DG, sí se redujeron

significativamente con respecto al incremento generado por la combinación 2-DG-

LPS. Otra diferencia observada (Figura 28 C panel izquierdo), fue que la simple

adición de 2-DG generó el splicing del ARNm de Xbp1 en la misma medida que cuando

se combina con el zymosan y el LPS, aunque en ese caso no induce la transcripción de

Il23a. En concordancia con la respuesta a la inhibición farmacológica de la actividad

endonucleasa de IRE1α, la expresión del ARNm de IL-23 en respuesta a la 2-DG fue

drásticamente inferior en las células de los ratones con la deleción cuando se

estimularon con zymosan o con LPS (Figura 28 C panel derecho).

Page 93: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

85

Figura 28. Efecto de la inhibición farmacológica y de la deleción de IRE1α sobre la transcripción

de Il23a en células dendríticas derivadas de médula ósea de ratón. Las BMDC se pre-incubaron

durante 30 minutos en presencia de 4µ8C (10 µM) antes de ser tratadas con 2-DG (10 mM) durante 1

hora y posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4 horas. (A)

Análisis de la inducción del ARNm de Il23a mediante qPCR. Los resultados se representan como la

media ± EEM de tres experimentos independientes. * Indica p˂0.05. (B) Análisis del splicing de XBP1.

Tras realizar una qPCR con cebadores que abarcan las regiones sin el splicing se realizó una

electroforesis en gel de agarosa con los productos de amplificación. uXBP1 indica la forma sin splicing,

sXBP1 indica la forma con splicing. El resultado es representativo de tres experimentos independientes.

(C) Análisis de la inducción del ARNm de sXbp1 e Il23a mediante qPCR en BMDC de ratones control

(Ern1f/f) y con el gen delecionado (Ern1f/fVav1-Cre). Las BMDC se pre-incubaron en presencia de 2-DG

(10 mM) durante 1 hora y posteriormente se estimularon con 1mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS

durante 4 horas. Los resultados se representan como la media ± EEM tres experimentos

independientes.* Indica p˂0.05.

El papel de las ramas ATF6 y PERK

Para abordar la implicación de las otras dos ramas de la UPR que se pueden activar

cuando hay estrés de retículo endoplasmático: ATF6 y PERK, se realizaron

experimentos de Western Blot con intención de detectar la fragmentación de ATF6,

que demostraría la activación de esta rama, y la fosforilación de eIF2α como indicador

de la activación de la ruta PERK. Como se muestra en la Figura 29 A, la 2-DG aumentó

la fragmentación de ATF6 en las células sin estimular pero no incrementó el efecto del

Page 94: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

86

zymosan y el LPS que por sí solos también indujeron su fragmentación. Los niveles de

la proteína escindida fueron superiores tras la estimulación con zymosan que con el

pre-tratamiento de las CD con 2-DG. El zymosan produjo un cambio en la migración de

la proteína sin fraccionar probablemente debido a cambios en su glicosilación que se

producen previamente a su escisión por las proteasas de Sitio-1 (S1p) (Hong et al,

2004).

En cuanto a la fosforilación de eIF2α y de acuerdo con una reciente publicación que

muestra que el LPS no afecta la fosforilación de eIF2α (Shan et al., 2017), no hubo

variaciones en el nivel de fosforilación de eIF2α al pre-tratar las células con 2-DG,

incluso en presencia de los PAMP (Figura 29 B).

Figura 29. Efecto de la 2-DG sobre la escisión de ATF6 y la fosforilación de eIF2α. Las CD se pre-

incubaron en presencia de 2-DG (10 mM) durante 1 hora y posteriormente se estimularon con 1

mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 1 hora (A) o los tiempos indicados (B). Los extractos

proteicos se analizaron mediante Western Blot. Se utilizó la β-actina como control de carga. Los

resultados son representativos de al menos dos experimentos independientes.

Dado que la fosforilación de eIF2α no parecía la mejor forma de valorar la activación

la vía PERK/eIF2α/ATF4/CHOP y al existir publicaciones que relacionan

directamente a DDIT3/CHOP con la transcripción de IL23A (Goodall et al., 2010), se

decidió analizar la expresión de este factor de transcripción. La inducción del ARNm

de DDIT3/CHOP no sufrió cambios al incubar las células en medio sin glucosa, pero sí

se modificó con el pretratamiento con 2-DG, observándose un claro incremento

independiente de la estimulación con los PAMP (Figura 30 A) lo que confirma la

activación de la rama PERK de la UPR por la 2-DG. Al analizar la expresión de la

proteína en extractos nucleares, CHOP pudo detectarse en las células en reposo, de

Page 95: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

87

acuerdo con un estudio previo en monocitos humanos (Riek et al., 2012). La 2-DG no

produjo cambios en sus niveles nucleares en las células en reposo ni tras la

estimulación con LPS (Figura 30 B). El pre-tratamiento de las CD con 2-DG tampoco

revirtió la desaparición nuclear de CHOP provocada por el zymosan. Estos datos

sugieren que en presencia de patrones fúngicos, las CD se protegen de los efectos

proapoptóticos atribuidos a CHOP, lo que permitiría el mantenimiento de la

capacidad fagocítica de las CD durante las infecciones por hongos (Rodríguez et al.,

2014) y permiten descartar la participación directa de CHOP/DDIT3 en la

transcripción de citoquinas en CD estimuladas con zymosan.

Figura 30. Efecto de la 2-DG sobre la expresión de CHOP. Las CD se pre-incubaron en presencia de

glucosa (11,1 mM), ausencia de glucosa o en presencia de 2-DG (10 mM) y glucosa durante 1 hora y

posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4 horas. (A)

Análisis de la inducción del ARNm de DDIT3/CHOP mediante qPCR. Los resultados se representan

como la media ± EEM de tres experimentos independientes.* Indica p˂0.05 con respecto a la glucosa.

(B) Expresión de CHOP en fracciones nucleares. Los extractos proteicos se analizaron mediante

Western Blot. Se utilizó la histona H3 como control de carga. El resultado es representativo de tres

experimentos independientes.

Con el fin de abordar con más detalle la posible implicación de esta rama de la UPR se

hicieron experimentos con el inhibidor de PERK, GSK2606414. El GSK2606414

revirtió el incremento de los niveles del ARNm de CHOP/DDIT3 inducido por la 2-DG

(Figura 31 A) y en concordancia con la desaparición de CHOP producida por el

zymosan, no mostró ningún efecto sobre la transcripción de citoquinas en este

sistema. Sin embargo, la inhibición de PERK con GSK2606414, redujo

significativamente la inducción del ARNm de IL23A provocado por el LPS en

presencia de 2-DG (Figura 31 B) y generó también un aumento inesperado del ARNm

de IL10 cuando se estimularon las células con LPS. Asimismo, la combinación del

Page 96: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

88

inhibidor de PERK con LPS, indujo la expresión del tránscrito de IL10 en niveles

similares a los producidos por el LPS, incluso cuando la estimulación se hizo en

presencia de 2-DG (Figura 31 C). Estos resultados indican que las distintas ramas de

la UPR modulan la expresión de citoquinas de forma dependiente del estímulo.

El hallazgo de que la inhibición farmacológica de PERK tuviera efectos sobre la

transcripción de citoquinas en las células dendríticas estimuladas con LPS junto al

hecho de que ATF4 se pudiera unir a los sitios ATF2 del promotor de IL23A

(Rodríguez et al., 2014) sugirieron la necesidad de realizar experimentos de

inmunoprecipitación de la cromatina para valorar la implicación directa de este

factor sobre la trans-activación de IL23A. Sin embargo, el análisis de la unión de ATF4

al promotor de IL23A no mostró ninguna variación en las distintas condiciones (datos

no mostrados), por ello se postuló la participación de otros factores de transcripción.

La trans-activación de IL23A en respuesta al LPS se ha relacionado con diversos

factores incluido C/EBPβ (Kocieda et al., 2012) que pertenece a la misma familia de

factores de transcripción que CHOP y tiene varios sitios de unión al promotor de la

IL23A (Figura 27 A). Estudios previos del laboratorio han demostrado una menor

Figura 31. Efecto de la inhibición de PERK

sobre la transcripción de distintos genes. Las

CD se pre-incubaron en presencia de

GSK2606414 (1 µM) durante 30 minutos antes

de ser tratadas con 2-DG (10 mM) durante 1

hora y posteriormente se estimularon con 1

mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4

horas. La inducción del ARNm de DDIT3, IL23A

e IL10 se analizó mediante qPCR. Los resultados

se representan como la media ± EEM de tres a

cinco experimentos independientes.* Indica

p˂0.05.

Page 97: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

89

unión de CHOP y mayor unión de C/EBPβ a los sitios CHOP-C/EBP de este promotor

en respuesta al LPS (Rodríguez et al., 2014) y además se ha descrito la relación de

C/EBPβ con las ramas IRE y PERK de la UPR (Hayakawa et al., 2010) por lo que se

estudió la unión de este factor a los sitios CHOP-C/EBP del promotor de IL23A. Como

se muestra en la Figura 32, a diferencia de lo observado con el zymosan, la 2-DG

incrementó significativamente la unión de C/EBPβ al promotor de IL23A en respuesta

al LPS, lo que sugiere su asociación con el efecto de la 2-DG sobre la transcripción de

IL23A.

Figura 32. Análisis de la unión de C/EBPβ al promotor de IL23A mediante ChIP. Las CD se pre-

incubaron en presencia de 2-DG (10 mM) durante 1 hora y posteriormente se estimularon con 1

mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 1 hora. Los resultados se representan como la media ±

EEM de tres experimentos independientes.* Indica p˂0.05.

En lo que se refiere a la regulación transcripcional de IL10, se acepta ampliamente el

mecanismo dependiente de CREB y del co-activador CBP. La actividad de CREB se

regula negativamente por la glicógeno sintasa quinasa 3β. Por este motivo, la

inhibición de GSK3β favorece la unión de CREB al sitio CRE del promotor de IL10, el

reclutamiento de CBP y la translocación de CRTC/TORC2 al núcleo para la formación

del complejo nuclear P-CREB/TORC2/CBP que es necesario para la trans-activación

de IL10. Además, hay numerosos estudios que relacionan el estrés de retículo con la

activación, por variaciones en el estado de fosforilación, de GSK3β (Chang et al., 2011;

McAlpine et al., 2012; Kim et al., 2015). La fosforilación en la serina 9 de esta proteína

es inhibitoria mientras que la fosforilación de la tirosina 216 aumenta su actividad

(Beurel, Grieco y Jope, 2015).

Page 98: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

90

Para valorar el estado de activación de GSK3β dependiente de su fosforilación, se

realizaron experimentos utilizando anticuerpos específicos frente a ambas

fosforilaciones. Las células dendríticas mostraron un aumento la fosforilación

inhibitoria de la serina 9 cuando se estimularon con LPS, efecto que fue en parte

contrarrestado por la pre-incubación de las CD con 2-DG (Figura 33 A) y no se

observaron variaciones en la fosforilación activadora de la tirosina 216 (datos no

mostrados). También se analizó la unión directa del co-activador CBP al sitio CRE del

promotor de IL10. Tanto el zymosan como el LPS aumentaron la unión de CBP con

respecto a las células sin estimular y la pre-incubación con 2-DG no tuvo efecto en las

CD estimuladas con zymosan, pero sí redujo la unión de CBP al promotor de IL-10 en

las células tratadas con LPS (Figura 33 B). Este resultado explicaría la disminución de

la transcripción de IL10 inducida por la 2-DG en respuesta al LPS.

Figura 33. Efecto de la 2-DG sobre la fosforilación de GSK3β y la unión de CBP al promotor de

IL10. Las CD se pre-incubaron en presencia de 2-DG (10 mM) durante 1 hora y posteriormente se

estimularon con 1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 1 hora. (A) Análisis de la fosforilación

de GSK3β. Los extractos proteicos se analizaron mediante Western Blot. Se utilizó la β-actina como

control de carga. El resultado es representativo de tres experimentos independientes. (B) Análisis de la

unión de CBP al sitio CRE del promotor de IL10 mediante ChIP. Los resultados se representan como la

media ± EEM de dos experimentos independientes.

2.2 Efectos de la regulación de la actividad de la PKM2

La piruvato quinasa cataliza el último paso de la glucólisis, la conversión de

fosfoenolpiruvato a piruvato a través de la transferencia de un grupo fosfato al ADP.

La conformación y actividad de la PKM2 pueden modificarse alostéricamente por

intermediarios metabólicos y por compuestos farmacológicos. Tras haber confirmado

la expresión preferencial de la isoforma PKM2 en las células dendríticas (Figura 16),

Page 99: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

91

se utilizó el compuesto ML-265 (también denominado TEPP-46) con el fin de

aumentar el flujo glucolítico. Este compuesto refuerza la tetramerización de PKM2 y

la convierte en una enzima altamente glucolítica que incrementa la formación de

lactato y disminuye el flujo de piruvato a la mitocondria (Christofk et al., 2008;

Anastasiou et al., 2012).

Expresión de citoquinas

Las CD se pre-trataron con ML-265 previamente a la estimulación y se midió la

inducción de la transcripción de distintas citoquinas mediante qPCR. Como se

muestra en la Figura 34, los resultados difirieron según el estímulo utilizado. Los

niveles de los transcritos de IL23A, IL10 e IL1B disminuyeron de forma muy

significativa en presencia de ML-265 en respuesta al zymosan, mientras que no

experimentaron variación alguna en respuesta al LPS.

Producción de lactato

Con el fin de determinar si los cambios sobre la actividad glucolítica generados por el

compuesto ML-265 podían explicar las variaciones observadas sobre la transcripción

de citoquinas, se analizaron los niveles de lactato intracelular y en el medio de cultivo.

Figura 34. Efecto del compuesto ML-265

sobre la transcripción de citoquinas. Las

CD se pre-incubaron en presencia de ML-

265 (50 µM) durante 30 minutos y

posteriormente se estimularon con 1 mg/ml

de zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 4

horas. Los resultados se representan como

la media ± EEM de tres experimentos

independientes.* Indica p˂0.05.

Page 100: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

92

De forma inesperada, no se observó ningún cambio en los niveles de este metabolito

en presencia de ML-265 (Figura 35). La producción de lactato aumentó en respuesta

al zymosan y al LPS, aunque el efecto de los estímulos mostró notables diferencias. A

las 24 horas el aumento de la concentración extracelular inducida por ambos

estímulos fue similar. Sin embargo, la medida de los niveles intracelulares de lactato

realizada tras 30 minutos de estimulación mostró niveles más elevados en el caso del

zymosan, lo que indicaría una mayor rapidez de acción de este estímulo.

Figura 35. Efecto del compuesto ML-265 sobre la producción de lactato. Las CD se pre-incubaron

en presencia de ML-265 (50 µM) durante 30 minutos y posteriormente se estimularon con 1 mg/ml de

zymosan o 10 µg/ml de LPS durante 24 horas (A) o 30 minutos (B). (A) Niveles de lactato extracelular

medidos mediante un kit comercial. La cantidad de lactato presente en los sobrenadantes se normalizó

en función del número de células. (B) Niveles de lactato intracelular medidos por UPLC-MS. La

cantidad de lactato presente en las células se normalizó en función de la cantidad de proteína. Los

resultados se representan como la media ± EEM de tres a cuatro experimentos independientes.

Estudios bioenergéticos

En un intento adicional para caracterizar el efecto global del ML-265, se realizaron

nuevos experimentos dirigidos a monitorizar la bioenergética de las CD en tiempo

real con el analizador de flujo extracelular Seahorse XFe96. La Figura 36 muestra

como el pre-tratamiento de las células con ML-265 no produjo cambios ni en la tasa

de acidificación extracelular ni en la de consumo de oxígeno distintos de los inducidos

por los estímulos. Sin embargo, estos experimentos permitieron mostrar, una vez

más, los distintos patrones de respuesta asociados con cada estímulo. Mientras que el

zymosan aumentó de forma notable la ECAR y la OCR, el LPS sólo aumentó

ligeramente la ECAR a lo largo del ensayo.

Page 101: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

93

Figura 36. Efecto del compuesto ML-265 sobre la bioenergética de las células dendríticas. Registros

del equipo Seahorse Bioscience XFe96 tras la aplicación del protocolo XF Mito Stress Test Kit obtenidos

tras la pre-incubación de las CD con ML-265 (50 µM) durante 30 minutos y su posterior estimulación con

1 mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS, normalizados en función del número de células. (A) Tasa de

acidificación del medio. (B) Tasa de consumo de oxígeno.

Page 102: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

94

Conformación y actividad quinasa de la PKM2

A la vista de la ausencia de cambios metabólicos inducidos por el ML-265 y puesto

que a la PKM2 se atribuyen distintas funciones y grado de actividad dependiendo de

su conformación, se llevó a cabo un ensayo de cross linking para estudiar su

ensamblaje. De acuerdo con los resultados obtenidos en otros tipos celulares como

los macrófagos y las células glomerulares de riñón (Shirai et al., 2016; Qi et al., 2017),

las CD mostraron una gran cantidad de la formas monomérica y tetramérica en

comparación con la forma dimérica. La distribución entre las tres conformaciones no

se modificó ni por el ML-265, ni por los estímulos, tanto cuando se utilizaron de forma

aislada como con la combinación de ambos (Figura 37).

Tanto la histona H3 como STAT3 se encuentran entre las proteínas mejor

caracterizadas susceptibles de ser fosforiladas por las formas

monoméricas/diméricas de la PKM2, por ello se estudió el efecto del ML-265 en la

fosforilación de la serina 10 de la histona H3 y la de la tirosina 705 de STAT3 a las 3 y

6 horas, en concordancia con el patrón temporal de fosforilación de STAT,

previamente descrito en células estimuladas. Si bien no hubo variaciones en la

fosforilación de la histona (datos no mostrados), el ML-265 inhibió fuertemente la

fosforilación de STAT3 inducida por los PAMP (Figura 38).

Figura 37. Efecto del zymosan, LPS y ML-

265 sobre la conformación de la enzima

PKM2. Las CD se pre-incubaron en

presencia de ML-265 (50 µM) durante 30

minutos y posteriormente se estimularon

con 1mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS

durante 1 hora. Pasado este tiempo se llevó

a cabo el cross-linking mediante la adición

de disuccinimidil suberato (650 µM). Los

extractos obtenidos, en condiciones no

reductoras, se analizaron en un gel de

poliacrilamida al 8% para visualizar

proteínas en el rango de 60-240 kDa. Se

utilizó la β-actina como control de carga. El

resultado es representativo de dos

experimentos independientes.

Page 103: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

RESULTADOS

95

Tomados en conjunto estos resultados y dado que el único efecto que pudo atribuirse

al ML-265 fue la disminución de la fosforilación de STAT3, la caída de la transcripción

de citoquinas inducida por el zymosan en presencia de ML-265 podría explicarse por

la interferencia de este compuesto con la actividad proteína quinasa de la enzima

PKM2.

Figura 38. Efecto del compuesto ML-

265 sobre la fosforilación de STAT3.

Las CD se pre-incubaron en presencia

de ML-265 (50 µM) durante 30 minutos

y posteriormente se estimularon con 1

mg/ml de zymosan o 10 µg/ml de LPS

durante los tiempos indicados. Los

extractos proteicos se analizaron

mediante Western Blot. Se utilizó la β-

actina como control de carga. El

resultado es representativo de dos

experimentos independientes.

Page 104: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de
Page 105: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

Discusión

Page 106: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de
Page 107: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

99

1. Caracterización de la reprogramación metabólica en células

dendríticas

La activación de las células dendríticas por la interacción de los PAMP con sus

receptores, induce la adquisición de nuevas funciones como la producción de

citoquinas, de mediadores lipídicos y de otras moléculas de señalización, y la

migración a los ganglios linfáticos (Joffre et al., 2009). Este cambio de un estado

quiescente a otro activado coincide con una reprogramación metabólica que modula

la respuesta efectora y proporciona el soporte energético necesario para el cambio

funcional (Pearce y Pearce, 2013; Ganeshan y Chawla, 2014).

En concordancia con los resultados obtenidos, numerosos estudios previos ponen de

manifiesto que el cambio metabólico más prominente observado en las CD

estimuladas por los PAMP es el aumento de la glucólisis (Krawczyk et al., 2010; Everts

et al., 2012; O'Neill y Hardie, 2013). En estos estudios el patrón glucolítico se

acompaña de un descenso paralelo de la OXPHOS. Sin embargo, los experimentos

mostrados en el presente estudio indican que cuando las CD se activan con zymosan o

LPS, además de producirse un aumento temprano (30 minutos) de la glucólisis, la

OCR se mantiene o incluso se incrementa, al igual que el consumo de oxígeno

destinado a la producción de ATP en la OXPHOS. En este sentido, se ha descrito que

elevadas tasas glucolíticas y de respiración mitocondrial constituyen el fenotipo

metabólico característico de CD tolerogénicas que expresan de forma abundante

proteínas relacionadas con la OXPHOS y son resistentes a la maduración (Morelli y

Thomson, 2007; Ferreira et al., 2012; Malinarich et al., 2015) mientras que en la

maduración de las células dendríticas hay una regulación a la baja de los genes

implicados en la OXPHOS (Jin et al., 2010). En contraposición con estos estudios y en

concordancia con los resultados obtenidos, estudios recientes concluyen que los

macrófagos pro-inflamatorios mantienen la oxidación del piruvato para la producción

de citoquinas (Meiser et al., 2016) y que la activación de distintos TLR pueden inducir

el aumento de la glucólisis y de la OXPHOS en monocitos humanos (Lachmandas et al.,

2016).

Independientemente de la controversia sobre la actividad de la OXPHOS, que parece

depender del estado de maduración celular, del contexto inmune y del estímulo

Page 108: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

100

utilizado, el aumento de la glucólisis es una constante. Numerosos estudios señalan al

factor de transcripción HIF1, bien de forma aislada o en colaboración con otras

proteínas como STAT3 y PKM2, como el principal activador de estos cambios. Los

resultados presentados en esta memoria confirman la inducción de HIF1α tras la

activación de los PRR en ausencia de hipoxia, mediante mecanismos tanto

transcripcionales como traduccionales, y muestran la presencia de estas proteínas en

los núcleos de las CD. Sin embargo, el patrón temporal de aparición de HIF1α no

permite explicar plenamente el aumento de la glucólisis observado claramente tras

30 minutos de estimulación. Una interpretación plausible es que aunque HIF1, PKM2

y STAT3 puedan estar implicados en el mantenimiento de una respuesta más tardía,

los cambios iniciales pueden explicarse más satisfactoriamente por la translocación

de la hexoquinasa II a la mitocondria, de forma similar a lo que ocurre en los

linfocitos T (van der Windt et al., 2013). En respuesta a agonistas de los TLR, Akt

fosforila la HK-II y promueve su unión a la membrana mitocondrial donde puede

interaccionar directamente con los canales de aniones dependientes de voltaje y

aumentar su actividad, gracias a que esa localización facilita el acceso a altas

concentraciones de ATP (Everts et al., 2014). Esta interpretación concuerda con la

abundante bibliografía mostrando que la vía PI3K/Akt está implicada en los cambios

metabólicos inducidos en células dendríticas y monocitos murinos por la ocupación

de los TLR (Krawczyk et al., 2010; Cheng et al., 2014; Arts et al., 2016). Además, un

estudio reciente en células dendríticas derivadas de monocitos humanos confirma

una mayor expresión y actividad de esta quinasa en respuesta a los TLR (Perrin-

Cocon et al., 2018).

Page 109: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

101

2. Modulación del metabolismo de la glucosa y regulación

transcripcional de la producción de citoquinas en células

dendríticas

Los resultados obtenidos confirman el gran número de estudios señalando que el

aumento del flujo glucolítico es de vital importancia para una correcta función

efectora, en la que se incluye la producción de citoquinas. En el presente estudio

destaca la prominencia de la producción de IL-10 e IL-23 en respuesta a los

componentes β-glucano y α-manano del zymosan, frente a una menor producción de

estas citoquinas tras la estimulación del TLR4 por el LPS. La relevancia clínica de

estos resultados se justifica por el papel de estas citoquinas en distintos procesos

patológicos. Por ejemplo, la IL-23 promueve la diferenciación y proliferación de los

linfocitos Th17 (Kreymborg et al., 2007) y numerosos estudios confirman la

participación de estos linfocitos en la patogenia de enfermedades autoinmunes como

artropatía psoriásica, esclerosis múltiple y artritis reumatoide (McGeachy y Cua,

2007), y en el crecimiento tumoral (Grivennikov et al., 2012). En este sentido, en el

tratamiento de procesos como la psoriasis, la artritis psoriásica o la enfermedad de

Crohn se utilizan anticuerpos monoclonales para bloquear la actividad de esta

citoquina. Del mismo modo, la IL-10 está implicada en la polarización de los linfocitos

a un fenotipo Threg o regulador que suprime la respuesta pro-inflamatoria y controla

la producción de daño tisular por mecanismo inmune (Couper, Blount y Riley, 2008).

Debido a esto, una excesiva producción de IL-10 puede contribuir a la expansión de

micosis invasivas y a la infección por micobacterias.

2.1 Efectos de la privación de glucosa

A la vista de la importancia del metabolismo de la glucosa en la reprogramación

metabólica, es comprensible que la intervención sobre el mismo afecte a la

producción de citoquinas. La pre-incubación de las células dendríticas con 2-DG

aumenta la transcripción de IL23A durante la estimulación con zymosan y LPS y

genera una disminución de la transcripción de IL10 e IL-1B en el caso del LPS.

Sorprendentemente, la ausencia de glucosa en el medio no tiene consecuencias en

respuesta a ninguno de los dos estímulos. Esta diferencia de comportamiento entre la

privación de glucosa y el efecto de la 2-DG sobre la producción de citoquinas también

Page 110: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

102

se ha descrito en linfocitos T humanos CD4+ y CD8+ aunque no se propuso ninguna

explicación sobre el posible mecanismo (Renner et al., 2015). Una interpretación

posible de este resultado es que las CD mantengan niveles intracelulares de glucosa

suficientes durante un periodo prolongado de tiempo o que utilicen metabolitos

alternativos como glutamina, ácidos grasos o aminoácidos de cadena ramificada. Sin

embargo, el hallazgo más llamativo en este sentido ha sido la descripción de que las

CD expresan la maquinaria necesaria para metabolizar el glucógeno, lo que permite la

utilización de sus depósitos intracelulares para desarrollar su función efectora (Thwe

et al., 2017).

La ausencia de glucosa en el medio genera una bajada más drástica de lactato en los

sobrenadantes de las CD estimuladas que la inhibición de la glucólisis con 2-DG. Esta

caída del lactato inhibe la estabilización de HIF1α, por lo que puede descartarse la

participación de HIF en el incremento de la expresión del ARNm de IL23A observado

en estas condiciones. Aunque algunos autores han demostrado una relación directa

con la transcripción de IL-1β en astrocitos (Zhang et al., 2006) y en macrófagos a

tiempos más tardíos (Tannahill et al., 2013), HIF1α desaparece por completo de los

extractos proteicos al utilizar un medio sin glucosa sin que ello se acompañe de

cambios en la transcripción de citoquinas a las 4 horas, por lo que no podría

explicarse por este mecanismo la disminución de la transcripción de IL1B observada

con la combinación 2-DG–LPS, que además se acompaña de la abolición de la

producción de pro-IL-1β inducida por la 2-DG. La ausencia de la actividad de HIF1α

tampoco explica el efecto de la 2-DG en la expresión de pro-IL-1β, dado que esta

expresión se observa a las 24 horas en respuesta al zymosan, periodo que coincide

con una menor expresión de HIF1α. El hecho de que la pro-IL-1β no se detecte hasta

las 24 horas en las células tratadas con zymosan indica una respuesta mucho más

tardía que la inducida por el LPS y estaría de acuerdo con la ausencia de efecto de la

2-DG sobre el ARNm de IL1B a tiempos más precoces.

La adición de lactato de sodio también genera respuestas diferentes en función del

estímulo. Con el zymosan se observa un aumento del ARNm de IL23A y de IL10,

mientras que el LPS sólo aumenta el de IL23A. Sin embargo, la transcripción de la IL-

1β muestra una tendencia a disminuir con ambos estímulos. Estos resultados

coinciden en parte con otros estudios en los que el lactato secretado por las células

Page 111: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

103

tumorales incrementa la transcripción de IL23A en células del sistema inmune

estimuladas con ligandos de los TLR 2/4 (Shime et al., 2008). Pero, en este caso, sería

la entrada de lactato en la célula el responsable de los cambios del nivel de

producción de citoquinas (Colegio et al., 2014; Abebayehu et al., 2016). Esta entrada

se produciría a través de los transportadores MCT, que a su vez depende del pH,

puesto que el lactato entra acompañado por un protón (Halestrap, 2012) y el efecto

no se observa en presencia de lactato de sodio. Este hecho permite distinguir los

efectos propiamente debidos al ion lactato de los efectos causados por la bajada de

pH. A pesar de estos condicionantes, la bajada de pH que frecuentemente se observa

en el micro-entorno tumoral no ha sido tenida en cuenta en todos los estudios.

El lactato también puede actuar a través del receptor GPR81 cuya funcionalidad se ha

mostrado en este estudio. Este hecho añade complejidad a las contradictorias

interpretaciones existentes en cuanto a la función de este receptor. Mientras que la

deleción del gen Gpr81 en macrófagos murinos no induce cambios en la expresión de

algunas citoquinas inducida por el lactato (Errea et al., 2016), también se ha descrito

que el Gpr81 interviene en la producción de IL-1β inducida por la estimulación de los

TLR (Hoque et al., 2014).

La inhibición de la entrada de piruvato en la mitocondria con el compuesto UK5099,

que aumenta los niveles de lactato intracelular, mostró un efecto negativo sobre la

transcripción de IL23A, Il10 e IL1B, mientras que el aumento del flujo de piruvato con

el DCA indujo el efecto opuesto. Estos resultados confirman la importancia que tiene

la entrada de piruvato a la mitocondria para la inducción de algunas citoquinas, como

ya se había descrito para IL-1β, IL-6 y PD-L1 (Shirai et al., 2016; Watanabe et al.,

2017). Otro inhibidor del transportador de monocarboxilatos, el CHC, que se utiliza

para bloquear el paso de lactato por los MCT mostró un efecto similar en resultados

preliminares (no mostrados). Estos resultados son compatibles con la interpretación

de que el efecto del lactato se debe a su entrada en la célula por el transportador en

lugar de por la activación de su receptor (Colegio et al., 2014). Dado que se ha

descrito que el compuesto CHC también inhibe la entrada de piruvato a la

mitocondria (Nancolas et al., 2016), es difícil discriminar hasta qué punto alguno de

los efectos atribuidos al lactato no puedan deberse a cambios paralelos en el

metabolismo del piruvato.

Page 112: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

104

Las diferencias observadas en la transcripción de IL10 inducida por cada estímulo

pueden explicarse por las distintas vías de señalización activadas por cada PAMP

(Rodríguez et al., 2017). El LPS actúa a través del receptor TLR4 y activa las vías de

MyD88 y TRIF que inducen los factores reguladores de interferón (IRF) y el sistema

JAK/STAT, mientras que los componentes del zymosan se reconocen por los

receptores TLR2 y de lectina tipo C como Dectin 1 y 2 que inducen también la

activación de Syk (Figura 39). Este distinto reclutamiento de vías de señalización es

un factor de la mayor relevancia para explicar los resultados obtenidos.

Figura 39. Esquema de las vías de señalización utilizadas por el zymosan y el LPS. El zymosan

señaliza a través de TLR-2 y receptores de lectina tipo C para activar las vías de MyD88 y Syk. El LPS es

reconocido por el TLR4 y activa las rutas de los adaptadores TRIF/TRAM y MyD88.

Tomados en conjunto, los datos indican que las variaciones de los niveles de lactato

están implicadas en el cambio de patrón de expresión de algunas citoquinas bien sea

por sus efectos intracelulares o actuando a través de su receptor. Este resultado

refuerza el papel funcional que estos últimos años se está asignando al lactato como

molécula señalizadora, frente a la interpretación tradicional que lo consideraba un

producto de desecho del metabolismo. Estos efectos son particularmente notables en

el sistema inmune y en el micro-entorno tumoral, donde alcanza concentraciones

muy elevadas y constituye un punto de confluencia entre la respuesta inmune y la

proliferación cancerosa (Haas et al., 2016; Pucino et al., 2017). Aunque estos datos

sean relevantes para explicar los distintos resultados obtenidos con los tratamientos

de inmunoterapia anticancerosa (Nenu et al., 2017; Ippolito et al., 2018), los datos

obtenidos indican que la intervención sobre el metabolismo de la glucosa en la

Page 113: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

105

transcripción de citoquinas como IL23A, IL10 e IL1B no se puede explicar

simplemente por la reducción de los niveles de lactato y deben tenerse en cuenta

otros mecanismos en los que interviene la glucosa, como es la glicosilación de

proteínas.

Implicación de la respuesta a proteínas mal plegadas

Algunos estudios han desvelado que la respuesta a proteínas mal plegadas forma

parte de un programa transcripcional controlado por los receptores de

reconocimiento de patógenos en las células del sistema inmune innato (Cláudio et al.,

2013) que conduce a la activación de los elementos de la UPR tras la interacción de

los PAMP con los fagocitos. Los resultados presentados muestran que aunque el

zymosan y el LPS pueden incidir ligeramente sobre estas vías, a la vista del leve

splicing de XBP1 y el fraccionamiento de ATF6 observados, la combinación con la 2-

DG potencia significativamente la activación de las ramas IRE Y PERK de la UPR. La 2-

DG genera estrés de retículo endoplasmático al interferir con las reacciones de N-

glicosilación de proteínas por un mecanismo similar a la tunicamicina, mientras que

la tapsigargina produce el estrés por inhibición de la SERCA. El hecho de que los tres

compuestos tengan efectos similares en la modificación del patrón de citoquinas, en

respuesta al zymosan y al LPS, indicaría que es la inducción de la UPR, más que la

inhibición de la glicosilación de proteínas, el mecanismo que explicaría el aumento de

la trans-activación de IL23A. En este sentido debe mencionarse que en un modelo de

espondiloartritis en ratas se ha podido correlacionar el estrés de retículo con la

producción de IL-23 (DeLay et al., 2009).

La participación de XBP1 en la producción de citoquinas pro-inflamatorias en

macrófagos (Martinon et al., 2010), su relación directa con la transcripción de IL23A

(Wang et al., 2013) y la presencia de Cajas-X2 a las que se puede unir en el promotor

de IL23A hacían indispensable valorar la posible implicación de este factor en el

aumento de transcripción de IL23A generado por la 2-DG. Los experimentos

realizados con los inhibidores de la actividad endonucleasa de IRE1α y la manosa, que

revierten el splicing de XBP1 generado por la 2-DG, demuestran la importancia de

sXBP1 en la regulación de IL23A en respuesta al zymosan. Asimismo, los resultados

obtenidos en los estudios de ChIP confirman el aumento de la unión directa de este

factor de transcripción al promotor de IL23A cuando las células se estimulan con

Page 114: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

106

zymosan en presencia de 2-DG. Dado que sXBP1 puede encontrarse en el núcleo de

las células en reposo, es posible que sea necesario algún mecanismo adicional como

puede ser la interacción con otros factores de transcripción, como se ha descrito

durante la regulación de la homeostasis de la glucosa (Zhou et al., 2011; Park et al.,

2014), o alguna modificación post-traduccional como la fosforilación por distintas

quinasas para que pueda migrar al núcleo o ejercer su funcionalidad completa (Lee et

al., 2011; Liu et al., 2016).

Los experimentos realizados con las BMDC de los ratones Ern1f/fVav1-Cre, que

presentan la deleción selectiva en el sistema hematopoyético del gen que codifica

Ire1α, confirman que una parte del efecto sobre la trans-activación de il23a puede

asociarse de forma inequívoca con esta ruta de la UPR. Aunque el abordaje

farmacológico ha proporcionado resultados compatibles con esta interpretación, no

se pueden descartar otros mecanismos puesto que la activación de NF-B está

alterada bajo condiciones de estrés en líneas celulares con knockdown de Ire1α y

fibroblastos embrionarios de ratón Ern1-/-. El mecanismo propuesto tras estos

estudios sería la formación de un complejo entre Ire1α y la quinasa de IκB (IKK) a

través de la proteína adaptadora TRAF2 (Hu et al., 2006). Además, recientemente se

ha reforzado la relación directa entre ambas rutas ya que IKKβ puede fosforilar

sXBP1 en los residuos T48 y S148 (Liu et al., 2016).

En lo que respecta a la participación de PERK, el gran incremento en la inducción del

ARNm de CHOP generada por la 2-DG confirma la activación de esta vía. Los

resultados obtenidos con los inhibidores farmacológicos sobre la transcripción de

IL23A e IL10 en las células estimuladas con LPS indicarían su participación en

respuesta a ese estímulo, pero no en el caso del zymosan, lo que de nuevo indicaría

que las distintas ramas de la UPR pueden contribuir a la producción de citoquinas de

forma dependiente del estímulo. Pueden citarse como ejemplos en este sentido la

diferente regulación de la producción de CXCL10 y CCL2 en células foto-receptoras

(Zhu et al., 2017) y la producción de IL-1β en monocitos (Snodgrass et al., 2016).

La reversión del aumento de transcripción de IL23A y de la disminución de la de IL10

producidos por la inhibición farmacológica de la ruta PERK, concuerda con los

resultados que muestran que la inhibición de PERK disminuye la respuesta al LPS

mediante la reducción de la transcripción de genes pro-inflamatorios a través de la

Page 115: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

107

represión traduccional (Guthrie et al., 2016). La activación de PERK se asocia con una

activación máxima de NF-κB durante la UPR por la disminución de los niveles de IKK

(Deng et al., 2004; Tam et al., 2012) y también a través de la competencia entre la

subunidad RelA/p65 y CREB por la unión a CBP, que se encuentra en cantidades

limitadas en el núcleo (Vo y Goodman, 2001). Además, en monocitos se ha

demostrado un aumento de la producción de IL-10 ligado a la inhibición de GSK3β. La

inhibición de esta quinasa aumenta la capacidad de unión de CREB fosforilado en la

serina 133 a CBP y al ADN, paralelamente a la disminución de la unión RelA/p65 a

CBP (Martin et al., 2005). Este mecanismo coincide con los resultados obtenidos, a la

vista de la reducción de la fosforilación inhibitoria de GSK3β y la menor unión de CBP

al promotor de IL10 en presencia de 2-DG que cuando las CD se estimulan sólo con

LPS. La competencia entre NF-κB y CREB por CBP explicaría la recuperación de los

niveles del ARNm de IL-10 tras la inhibición de PERK, ya que al existir menos

subunidades RelA/p65 libres se favorecería la unión CREB-CBP y, en consecuencia, la

trans-activación de IL10.

Los experimentos de ChIP confirman la participación directa de C/EBPβ en el

incremento de la transcripción de IL23A en respuesta a la combinación 2-DG-LPS. La

asociación de C/EBPβ con la UPR ha sido objeto de investigación detallada. Se ha

descrito que C/EBPβ induce la activación transcripcional de XBP1 en adipocitos (Guo,

Li y Tang, 2015) y, a su vez, XBP1 se induce por la ocupación de una Caja-X2 presente

en células humanas y ausente en roedores (Chen et al., 2004) y también por la ruta

PERK (Hayakawa et al., 2010). Además, su condición de factor pionero en macrófagos

y su participación en la apertura de la estructura de la cromatina, posiciona a C/EBPβ

como un elemento clave para la formar enhanceosomas con otros factores y estimular

la transcripción (Plevy et al., 1997; Bradley, Zhou y Smale, 2003).

Por otra parte, se ha descrito un nuevo mecanismo por el que la ruta

PERK/JAK1/STAT3 contribuiría a la inflamación inducida por el estrés de retículo. La

dimerización de PERK atraería a JAK a su entorno, lo que permitiría de forma

sucesiva su autofosforilación, la fosforilación del dominio intracitoplasmático de

PERK en las tirosinas 585 y 619, la activación de su actividad quinasa y la

fosforilación de la tirosina 705 de STAT3 (Meares et al., 2014). Datos recientes avalan

la interconexión entre las rutas IRE y PERK a través de STAT3 ya que éste tiene un

Page 116: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

108

papel crítico en la activación no canónica de la UPR mediante un mecanismo en el que

intervienen IRE1α y XBP1 y se produce tras la estimulación con citoquinas (Yan et al.,

2016). Los resultados mostrados en esta memoria indican que el zymosan y el LPS

inducen la fosforilación de STAT3, bien a través de algún mediador secundario o por

activación de la rama TRIF/TRAM en el caso del LPS/TLR4 (Rodríguez et al., 2017).

Tomados colectivamente, los datos presentados indicarían que el mecanismo

actualmente aceptado de regulación transcripcional de IL23A, en las CD, que incluye

la activación de NF-κB, ATF2 y C/EBPβ (Brain et al., 2013; Deng et al., 2004; Al-

Salleeh y Petro, 2008) es potenciado por el reclutamiento de las ramas IRE y PERK,

como se muestra en el diagrama explicativo (Figura 40).

Figura 40. Esquema de las rutas implicadas en la regulación transcripcional de IL23A durante la

respuesta a proteínas mal plegadas. En la parte superior se muestra la estructura del promotor

proximal de IL23A con los elementos reguladores para la unión de XBP1, ATF2, NF-κB y C/EBPβ. La

formación de un enhanceosoma que contiene NF-κB, C/EBPβ y XBP1 parece ser el mecanismo más

probable, con una distinta combinación de elementos dependiendo de la naturaleza del estímulo. La

ruta IRE1α está involucrada en todos los casos y afecta a la activación de NF-κB y a la actividad de

XBP1, esta última en el caso del zymosan. STAT3 se activa por los patrones fúngicos a través de

mediadores secundarios, mientras que el LPS activa IRF3 e IFNβ de forma dependiente de los

adaptadores TRIF/TRAM acoplados a TLR4. La rama PERK de la UPR y C/EBPβ son más importantes

en respuesta a LPS. Las líneas discontinuas indican rutas avaladas por otros estudios y no exploradas

en los experimentos presentados.

Page 117: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

109

La relevancia clínica de estos resultados se demuestra por el hecho que las CD

presentes en el ambiente tumoral muestran una activación de XBP1 que bloquea la

respuesta inmune anti-tumoral y favorece la proliferación de las células cancerosas

(Cubillos-Ruiz et al., 2015). El presente estudio muestra que la estimulación de

distintos PRR en condiciones de estrés de retículo induce un patrón transcripcional

de citoquinas favorable a la progresión tumoral. En este sentido, se ha demostrado

que la producción de IL-23 por las células mieloides asociadas a tumor en tejidos

accesibles a productos microbianos es un factor favorecedor de la carcinomatosis de

colon (Grivennikov et al., 2012). Además, en contextos en los que la reacción

inflamatoria se influye por la presencia de IL-23, como es el caso de la ateromatosis

(Subramanian, Thorp y Tabas, 2015), se ha observado que la inhibición de la rama

IRE frena su progresión (Tufanli et al., 2017).

2.2 Efectos de la regulación de la actividad de la PKM2

La regulación de la PKM2 ha sido objeto de especial interés desde que se demostró

que se sobre-expresa en células tumorales con alto consumo de glucosa y elevada

producción de lactato, aunque el mecanismo por el que puede influir en la demanda

energética y la actividad anabólica precisas para mantener la proliferación de las

células cancerosas no se ha definido satisfactoriamente. La PKM2 cataliza la

transformación de fosfoenolpiruvato a piruvato mediante la donación de un grupo

fosfato al ADP en el último paso de la glucólisis, pero además de llevar a cabo esta

reacción, se le atribuyen distintas actividades dependientes de su conformación y

localización (Boukouris, Zervopoulos y Michelakis, 2016). La semejanza del cambio

metabólico sufrido por las células del sistema inmune con el de las células tumorales

justifica el análisis de la función de PKM2 en la reprogramación metabólica y las

consecuencias de su modulación farmacológica sobre la función efectora de las CD.

A la vista de la confirmación de que la PKM2 es la isoforma predominante en las CD,

se decidió utilizar el compuesto ML-265 para reforzar su conformación tetramérica

(Tamada, Suematsu y Saya, 2012) con el fin de aumentar el flujo glucolítico. La pre-

incubación de las células con este compuesto produjo una disminución de la

transcripción de IL23A, IL10 e IL1B inducida por el zymosan, mientras que no se

observó ningún efecto sobre la respuesta al LPS. Se ha descrito que el refuerzo de la

conformación tetramérica de la PKM2 aumenta la producción de lactato y disminuye

Page 118: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

110

el flujo de piruvato, probablemente por la formación de un complejo supramolecular

con la lactato deshidrogenasa (Mazurek et al., 2001; Christofk et al., 2008; Anastasiou

et al., 2012). De forma opuesta, se ha referido que la fosforilación de la tirosina 105 de

la PKM2, que previene la formación de tetrámeros, promueve el efecto Warburg en

células tumorales (Hitosugi et al., 2009) y la glucólisis en macrófagos de ratón, y

reduce la producción de IL-1B, por un mecanismo dependiente de su presencia en el

núcleo y su asociación con otras proteínas (Palsson-McDermott et al., 2015). En

nuestro sistema no hemos observado cambios apreciables en los niveles de

intermediarios metabólicos inducidos por el ML-265, ni variaciones en la

bioenergética estudiada a tiempo real. El hecho de que la actividad de la PKM2

también se pueda regular por modificaciones post-traduccionales, como se muestra

en la Figura 41 (Yang y Lu, 2013) dificulta la elaboración de una hipótesis definida

sobre el mecanismo de acción del ML-265.

Figura 41. Mecanismo de regulación de la actividad glucolítica de la PKM2 descrito por Yang y

Lu, 2013. La actividad de la PKM2 puede regularse por intermediarios metabólicos y por

modificaciones post-traduccionales inducidas por distintos estímulos. La presencia de fructosa

bisfosfato (FBP) favorece la conformación tetramérica. El factor de crecimiento de fibroblastos 1

(FGFR1), la presencia de elevados niveles de glucosa y de especies reactivas de O2 (ROS) ejercen un

efecto opuesto.

Los experimentos de cross-linking muestran una conformación de la PKM2 en la que a

pesar de la predominancia de la forma monomérica, existe una cantidad notable de

tetrámeros, tanto en las células en reposo como tras la estimulación. Estos resultados

coinciden en parte con los de Palsson-McDermont, quienes muestran que el ML-265

inhibe la translocación nuclear de la PKM2 inducida por el LPS, sin que se aprecien

cambios en los niveles de proteína en el citosol. La microscopia confocal confirmó la

presencia de PKM2 en los núcleos de las células estimuladas con zymosan, pero no se

Page 119: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

111

pudo determinar sin ambigüedad la redistribución de la PKM2 entre el citoplasma y

el núcleo. La disminución de la conformación dimérica en el núcleo podría explicar

por qué el ML-265 disminuye la fosforilación de la tirosina 705 de STAT3 inducida

por los PAMP sin que se observe efecto sobre la fosforilación de la histona, ya que en

estudios in vitro se ha determinado que la forma dimérica fosforila preferentemente

STAT3 mientras que la forma tetramérica fosforila la histona H3 (Yang et al., 2012;

Gao et al., 2012), aunque los datos disponibles indican que la forma dimérica

predomina en el núcleo. También se ha descrito el papel de cambios post-

traduccionales en la PKM2 en la mediación de su translocación al núcleo. Alguno de

estos cambios son la fosforilación en la serina 37 por ERK2 (Yang et al., 2012) y la

sumoilación (Spoden et al., 2009). Otra posible explicación de la discrepancia entre

los efectos del ML-265 y la ausencia de cambios en la conformación de PKM2 es que la

transición entre las formas monomérica/dimérica y tetramérica tiene una gran

plasticidad y parece ser especie y célula-específica. Por ejemplo, la forma tetramérica

no se encuentra en monocitos y sí en macrófagos de pacientes con enfermedad

coronaria de los que desaparece tras la estimulación (Shirai et al., 2016).

Dado que no se pudo encontrar ningún cambio metabólico asociado al ML-265 pero sí

observamos la disminución de la fosforilación de STAT3, la explicación más plausible

para la reducción en la transcripción de citoquinas podría encontrarse en la

interferencia con la actividad quinasa de esta enzima sobre algún sustrato en las rutas

de señalización activadas por el zymosan. Teniendo en cuenta que se ha definido

como uno de los mecanismos de acción del ML-265 la resistencia de la forma

tetramérica a la disociación por proteínas con fosfotirosinas (Anastasiou et al., 2012)

y que la fosforilación de tirosinas es un mecanismo de señalización ampliamente

utilizado por los receptores de lectina tipo C, no se puede descartar un efecto a este

nivel.

En resumen, los resultados obtenidos indican que el compuesto ML-265 regula la

actividad quinasa de la PKM2 y tiene efectos sobre las funciones efectoras de las

células dendríticas estimuladas por patrones fúngicos. Esto podría tener relevancia

clínica a la vista de algunos estudios que demuestran una menor mortalidad por

sepsis en relación con una menor producción de citoquinas como la IL-1β o la IL-18,

en ratones con knockout condicional de la PKM2 en células mieloides (Xie et al.,

Page 120: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

DISCUSIÓN

112

2016). Además, el intenso desarrollo que se está llevando a cabo de moléculas que

modulen la actividad de PKM2 en procesos cancerosos (Adem, Comakli y Uzun, 2018)

es un argumento importante para profundizar en el conocimiento de su función y su

regulación en las células del sistema inmune.

Page 121: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

Conclusiones

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CONCLUSIONES

115

1. Las células dendríticas experimentan un incremento rápido y sostenido de la

glucólisis cuando se estimulan con zymosan y con LPS. La fosforilación oxidativa se

mantiene en el caso del LPS y se incrementa en respuesta al zymosan.

2. La estimulación de las CD con zymosan y con LPS estabiliza el factor de

transcripción HIF1α con un patrón temporal compatible con su implicación en el

mantenimiento del cambio bioenergético producido tras la activación celular, pero

no en el inicio del mismo.

3. La 2-DG modula el patrón transcripcional de citoquinas de manera estímulo-

dependiente. En respuesta al zymosan aumenta la transcripción de IL23A y en

respuesta al LPS aumenta la transcripción de IL23A y reduce la transcripción de

IL10 e IL1B.

4. Los niveles de lactato influyen en la transcripción de citoquinas. El lactato de sodio

aumenta el ARNm de IL23A en respuesta al zymosan y al LPS, y el ARNm de IL10 en

respuesta al zymosan.

5. El flujo de piruvato a la mitocondria es necesario para la transcripción de IL10 e

IL23A en las CD estimuladas con zymosan y con LPS.

6. La 2-DG activa la respuesta a proteínas mal plegadas y aumenta la trans-activación

de IL23A en respuesta a los PAMP. La rama IRE1α/sXBP1 está implicada en el

aumento de la transcripción en respuesta al zymosan y la rama PERK y el factor de

transcripción C/EBPβ en el caso del LPS.

7. La activación de la rama PERK está implicada en la disminución de la transcripción

de IL10 en respuesta a la 2-DG en combinación con el LPS.

8. La 2-DG aumenta la unión del factor sXBP1 a las Cajas-X del promotor de IL23A en

respuesta al zymosan y la unión de C/EBPβ a los sitios CHOP-C/EBP en respuesta

al LPS. Asimismo, en combinación con el LPS, la 2-DG disminuye la unión de CBP al

sitio CRE del promotor de IL10.

9. La modulación de la actividad de la PKM2 con el compuesto ML-265 disminuye la

transcripción del ARNm de las citoquinas IL-23, IL-10 e IL-1β en respuesta al

zymosan. Ante la ausencia de un patrón metabólico característico inducido por el

Page 124: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

CONCLUSIONES

116

ML-265, los efectos observados pueden explicarse por la interferencia del ML-265

con la actividad proteína quinasa asociada a la PKM2 ya que el ML-265 disminuye

la fosforilación de STAT3 inducida por los PAMP.

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Bibliografía

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BIBLIOGRAFÍA

119

Abebayehu, D., Spence, A. J., Qayum, A. A., Taruselli, M. T., McLeod, J. J., Caslin, H. L., Chumanevich, A. P., Kolawole, E. M., Paranjape, A., Baker, B., Ndaw, V. S., Barnstein, B. O., Oskeritzian, C. A., Sell, S. A. y Ryan, J. J. (2016) 'Lactic Acid Suppresses IL-33-Mediated Mast Cell Inflammatory Responses via Hypoxia-Inducible Factor-1α-Dependent miR-155 Suppression', J Immunol, 197(7), pp. 2909-17.

Acosta-Alvear, D., Zhou, Y., Blais, A., Tsikitis, M., Lents, N. H., Arias, C., Lennon, C. J., Kluger, Y. y Dynlacht, B. D. (2007) 'XBP1 controls diverse cell type- and condition-specific transcriptional regulatory networks', Mol Cell, 27(1), pp. 53-66.

Adem, S., Comakli, V. y Uzun, N. (2018) 'Pyruvate kinase activators as a therapy target: a patent review 2011-2017', Expert Opin Ther Pat, 28(1), pp. 61-68.

Akins, N. S., Nielson, T. C. y Le, H. V. (2018) 'Inhibition of Glycolysis and Glutaminolysis: An Emerging Drug Discovery Approach to Combat Cancer', Curr Top Med Chem, 18(6), pp. 494-504.

Al-Salleeh, F. y Petro, T. M. (2008) 'Promoter analysis reveals critical roles for SMAD-3 and ATF-2 in expression of IL-23 p19 in macrophages', J Immunol, 181(7), pp. 4523-33.

Altenberg, B. y Greulich, K. O. (2004) 'Genes of glycolysis are ubiquitously overexpressed in 24 cancer classes', Genomics, 84(6), pp. 1014-20.

Alvarez, Y., Municio, C., Alonso, S., Sánchez Crespo, M. y Fernández, N. (2009) 'The induction of IL-10 by zymosan in dendritic cells depends on CREB activation by the coactivators CREB-binding protein and TORC2 and autocrine PGE2', J Immunol, 183(2), pp. 1471-9.

Alvarez, Y., Rodríguez, M., Municio, C., Hugo, E., Alonso, S., Ibarrola, N., Fernández, N. y Crespo, M. S. (2012) 'Sirtuin 1 is a key regulator of the interleukin-12 p70/interleukin-23 balance in human dendritic cells', J Biol Chem, 287(42), pp. 35689-701.

Anastasiou, D., Yu, Y., Israelsen, W. J., Jiang, J. K., Boxer, M. B., Hong, B. S., Tempel, W., Dimov, S., Shen, M., Jha, A., Yang, H., Mattaini, K. R., Metallo, C. M., Fiske, B. P., Courtney, K. D., Malstrom, S., Khan, T. M., Kung, C., Skoumbourdis, A. P., Veith, H., Southall, N., Walsh, M. J., Brimacombe, K. R., Leister, W., Lunt, S. Y., Johnson, Z. R., Yen, K. E., Kunii, K., Davidson, S. M., Christofk, H. R., Austin, C. P., Inglese, J., Harris, M. H., Asara, J. M., Stephanopoulos, G., Salituro, F. G., Jin, S., Dang, L., Auld, D. S., Park, H. W., Cantley, L. C., Thomas, C. J. y Vander Heiden, M. G. (2012) 'Pyruvate kinase M2 activators promote tetramer formation and suppress tumorigenesis', Nat Chem Biol, 8(10), pp. 839-47.

Andresen, L., Skovbakke, S. L., Persson, G., Hagemann-Jensen, M., Hansen, K. A., Jensen, H. y Skov, S. (2012) '2-deoxy D-glucose prevents cell surface expression of NKG2D ligands through inhibition of N-linked glycosylation', J Immunol, 188(4), pp. 1847-55.

Anelli, T. y Sitia, R. (2008) 'Protein quality control in the early secretory pathway', EMBO J, 27(2), pp. 315-27.

Arts, R. J. W., Carvalho, A., La Rocca, C., Palma, C., Rodrigues, F., Silvestre, R., Kleinnijenhuis, J., Lachmandas, E., Gonçalves, L. G., Belinha, A., Cunha, C., Oosting, M., Joosten, L. A. B., Matarese, G., van Crevel, R. y Netea, M. G. (2016) 'Immunometabolic Pathways in BCG-Induced Trained Immunity', Cell Rep, 17(10), pp. 2562-2571.

Ashizawa, K., Willingham, M. C., Liang, C. M. y Cheng, S. Y. (1991) 'In vivo regulation of monomer-tetramer conversion of pyruvate kinase subtype M2 by glucose is mediated via fructose 1,6-bisphosphate', J Biol Chem, 266(25), pp. 16842-6.

Banchereau, J., Briere, F., Caux, C., Davoust, J., Lebecque, S., Liu, Y. J., Pulendran, B. y Palucka, K. (2000) 'Immunobiology of dendritic cells', Annu Rev Immunol, 18, pp. 767-811.

Bertolotti, A., Wang, X., Novoa, I., Jungreis, R., Schlessinger, K., Cho, J. H., West, A. B. y Ron, D. (2001) 'Increased sensitivity to dextran sodium sulfate colitis in IRE1beta-deficient mice', J Clin Invest, 107(5), pp. 585-93.

Page 128: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

120

Bertolotti, A., Zhang, Y., Hendershot, L. M., Harding, H. P. y Ron, D. (2000) 'Dynamic interaction of BiP and ER stress transducers in the unfolded-protein response', Nat Cell Biol, 2(6), pp. 326-32.

Beurel, E., Grieco, S. F. y Jope, R. S. (2015) 'Glycogen synthase kinase-3 (GSK3): regulation, actions, and diseases', Pharmacol Ther, 148, pp. 114-31.

Blanco, P., Palucka, A. K., Pascual, V. y Banchereau, J. (2008) 'Dendritic cells and cytokines in human inflammatory and autoimmune diseases', Cytokine Growth Factor Rev, 19(1), pp. 41-52.

Blander, J. M. y Sander, L. E. (2012) 'Beyond pattern recognition: five immune checkpoints for scaling the microbial threat', Nat Rev Immunol, 12(3), pp. 215-25.

Blouin, C. C., Pagé, E. L., Soucy, G. M. y Richard, D. E. (2004) 'Hypoxic gene activation by lipopolysaccharide in macrophages: implication of hypoxia-inducible factor 1alpha', Blood, 103(3), pp. 1124-30.

Boukouris, A. E., Zervopoulos, S. D. y Michelakis, E. D. (2016) 'Metabolic Enzymes Moonlighting in the Nucleus: Metabolic Regulation of Gene Transcription', Trends Biochem Sci, 41(8), pp. 712-730.

Bradford, M. M. (1976) 'A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding', Anal Biochem, 72, pp. 248-54.

Bradley, M. N., Zhou, L. y Smale, S. T. (2003) 'C/EBPbeta regulation in lipopolysaccharide-stimulated macrophages', Mol Cell Biol, 23(14), pp. 4841-58.

Brain, O., Owens, B. M., Pichulik, T., Allan, P., Khatamzas, E., Leslie, A., Steevels, T., Sharma, S., Mayer, A., Catuneanu, A. M., Morton, V., Sun, M. Y., Jewell, D., Coccia, M., Harrison, O., Maloy, K., Schönefeldt, S., Bornschein, S., Liston, A. y Simmons, A. (2013) 'The intracellular sensor NOD2 induces microRNA-29 expression in human dendritic cells to limit IL-23 release', Immunity, 39(3), pp. 521-36.

Brown, G. D., Herre, J., Williams, D. L., Willment, J. A., Marshall, A. S. y Gordon, S. (2003) 'Dectin-1 mediates the biological effects of beta-glucans', J Exp Med, 197(9), pp. 1119-24.

Calfon, M., Zeng, H., Urano, F., Till, J. H., Hubbard, S. R., Harding, H. P., Clark, S. G. y Ron, D. (2002) 'IRE1 couples endoplasmic reticulum load to secretory capacity by processing the XBP-1 mRNA', Nature, 415(6867), pp. 92-6.

Cambronero, M.R, D. Prado-Cohrs y M. Lopez Sanroma. (2017) 'Basic immunological concepts applied to vaccination.' Elsevier.vacunas. doi: 10.1016/j.vacun.2017.10.001

Campbell, I. K., van Nieuwenhuijze, A., Segura, E., O'Donnell, K., Coghill, E., Hommel, M., Gerondakis, S., Villadangos, J. A. y Wicks, I. P. (2011) 'Differentiation of inflammatory dendritic cells is mediated by NF-κB1-dependent GM-CSF production in CD4 T cells', J Immunol, 186(9), pp. 5468-77.

Chang, E. Y., Guo, B., Doyle, S. E. y Cheng, G. (2007) 'Cutting edge: involvement of the type I IFN production and signaling pathway in lipopolysaccharide-induced IL-10 production', J Immunol, 178(11), pp. 6705-9.

Chang, Y. S., Tsai, C. T., Huangfu, C. A., Huang, W. Y., Lei, H. Y., Lin, C. F., Su, I. J., Chang, W. T., Wu, P. H., Chen, Y. T., Hung, J. H., Young, K. C. y Lai, M. D. (2011) 'ACSL3 and GSK-3β are essential for lipid upregulation induced by endoplasmic reticulum stress in liver cells', J Cell Biochem, 112(3), pp. 881-93.

Chen, C., Dudenhausen, E. E., Pan, Y. X., Zhong, C. y Kilberg, M. S. (2004) 'Human CCAAT/enhancer-binding protein beta gene expression is activated by endoplasmic reticulum stress through an unfolded protein response element downstream of the protein coding sequence', J Biol Chem, 279(27), pp. 27948-56.

Chen, X., Iliopoulos, D., Zhang, Q., Tang, Q., Greenblatt, M. B., Hatziapostolou, M., Lim, E., Tam, W. L., Ni, M., Chen, Y., Mai, J., Shen, H., Hu, D. Z., Adoro, S., Hu, B., Song, M., Tan, C., Landis, M. D., Ferrari, M., Shin, S. J., Brown, M., Chang, J. C., Liu, X. S. y Glimcher, L. H. (2014) 'XBP1 promotes triple-negative breast cancer by controlling the HIF1α pathway', Nature, 508(7494), pp. 103-107.

Page 129: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

121

Cheng, S. C., Quintin, J., Cramer, R. A., Shepardson, K. M., Saeed, S., Kumar, V., Giamarellos-Bourboulis, E. J., Martens, J. H., Rao, N. A., Aghajanirefah, A., Manjeri, G. R., Li, Y., Ifrim, D. C., Arts, R. J., van der Veer, B. M., van der Meer, B. M., Deen, P. M., Logie, C., O'Neill, L. A., Willems, P., van de Veerdonk, F. L., van der Meer, J. W., Ng, A., Joosten, L. A., Wijmenga, C., Stunnenberg, H. G., Xavier, R. J. y Netea, M. G. (2014) 'mTOR- and HIF-1α-mediated aerobic glycolysis as metabolic basis for trained immunity', Science, 345(6204), pp. 1250684.

Christofk, H. R., Vander Heiden, M. G., Harris, M. H., Ramanathan, A., Gerszten, R. E., Wei, R., Fleming, M. D., Schreiber, S. L. y Cantley, L. C. (2008) 'The M2 splice isoform of pyruvate kinase is important for cancer metabolism and tumour growth', Nature, 452(7184), pp. 230-3.

Clower, C. V., Chatterjee, D., Wang, Z., Cantley, L. C., Vander Heiden, M. G. y Krainer, A. R. (2010) 'The alternative splicing repressors hnRNP A1/A2 and PTB influence pyruvate kinase isoform expression and cell metabolism', Proc Natl Acad Sci U S A, 107(5), pp. 1894-9.

Cláudio, N., Dalet, A., Gatti, E. y Pierre, P. (2013) 'Mapping the crossroads of immune activation and cellular stress response pathways', EMBO J, 32(9), pp. 1214-24.

Coelho, D. S. y Domingos, P. M. (2014) 'Physiological roles of regulated Ire1 dependent decay', Front Genet, 5, pp. 76.

Colegio, O. R., Chu, N. Q., Szabo, A. L., Chu, T., Rhebergen, A. M., Jairam, V., Cyrus, N., Brokowski, C. E., Eisenbarth, S. C., Phillips, G. M., Cline, G. W., Phillips, A. J. y Medzhitov, R. (2014) 'Functional polarization of tumour-associated macrophages by tumour-derived lactic acid', Nature, 513(7519), pp. 559-63.

Couper, K. N., Blount, D. G. y Riley, E. M. (2008) 'IL-10: the master regulator of immunity to infection', J Immunol, 180(9), pp. 5771-7.

Cox, J. S. y Walter, P. (1996) 'A novel mechanism for regulating activity of a transcription factor that controls the unfolded protein response', Cell, 87(3), pp. 391-404.

Cua, D. J., Sherlock, J., Chen, Y., Murphy, C. A., Joyce, B., Seymour, B., Lucian, L., To, W., Kwan, S., Churakova, T., Zurawski, S., Wiekowski, M., Lira, S. A., Gorman, D., Kastelein, R. A. y Sedgwick, J. D. (2003) 'Interleukin-23 rather than interleukin-12 is the critical cytokine for autoimmune inflammation of the brain', Nature, 421(6924), pp. 744-8.

Cubillos-Ruiz, J. R., Silberman, P. C., Rutkowski, M. R., Chopra, S., Perales-Puchalt, A., Song, M., Zhang, S., Bettigole, S. E., Gupta, D., Holcomb, K., Ellenson, L. H., Caputo, T., Lee, A. H., Conejo-Garcia, J. R. y Glimcher, L. H. (2015) 'ER Stress Sensor XBP1 Controls Anti-tumor Immunity by Disrupting Dendritic Cell Homeostasis', Cell, 161(7), pp. 1527-38.

Dang, E. V., Barbi, J., Yang, H. Y., Jinasena, D., Yu, H., Zheng, Y., Bordman, Z., Fu, J., Kim, Y., Yen, H. R., Luo, W., Zeller, K., Shimoda, L., Topalian, S. L., Semenza, G. L., Dang, C. V., Pardoll, D. M. y Pan, F. (2011) 'Control of T(H)17/T(reg) balance by hypoxia-inducible factor 1', Cell, 146(5), pp. 772-84.

DeLay, M. L., Turner, M. J., Klenk, E. I., Smith, J. A., Sowders, D. P. y Colbert, R. A. (2009) 'HLA-B27 misfolding and the unfolded protein response augment interleukin-23 production and are associated with Th17 activation in transgenic rats', Arthritis Rheum, 60(9), pp. 2633-43.

Deng, J., Lu, P. D., Zhang, Y., Scheuner, D., Kaufman, R. J., Sonenberg, N., Harding, H. P. y Ron, D. (2004) 'Translational repression mediates activation of nuclear factor kappa B by phosphorylated translation initiation factor 2', Mol Cell Biol, 24(23), pp. 10161-8.

Dennehy, K. M., Willment, J. A., Williams, D. L. y Brown, G. D. (2009) 'Reciprocal regulation of IL-23 and IL-12 following co-activation of Dectin-1 and TLR signaling pathways', Eur J Immunol, 39(5), pp. 1379-86.

Page 130: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

122

Dillon, S., Agrawal, S., Banerjee, K., Letterio, J., Denning, T. L., Oswald-Richter, K., Kasprowicz, D. J., Kellar, K., Pare, J., van Dyke, T., Ziegler, S., Unutmaz, D. y Pulendran, B. (2006) 'Yeast zymosan, a stimulus for TLR2 and dectin-1, induces regulatory antigen-presenting cells and immunological tolerance', J Clin Invest, 116(4), pp. 916-28.

Domínguez, P. M. y Ardavín, C. (2010) 'Differentiation and function of mouse monocyte-derived dendritic cells in steady state and inflammation', Immunol Rev, 234(1), pp. 90-104.

Errea, A., Cayet, D., Marchetti, P., Tang, C., Kluza, J., Offermanns, S., Sirard, J. C. y Rumbo, M. (2016) 'Lactate Inhibits the Pro-Inflammatory Response and Metabolic Reprogramming in Murine Macrophages in a GPR81-Independent Manner', PLoS One, 11(11), pp. e0163694.

Everts, B., Amiel, E., Huang, S. C., Smith, A. M., Chang, C. H., Lam, W. Y., Redmann, V., Freitas, T. C., Blagih, J., van der Windt, G. J., Artyomov, M. N., Jones, R. G., Pearce, E. L. y Pearce, E. J. (2014) 'TLR-driven early glycolytic reprogramming via the kinases TBK1-IKKɛ supports the anabolic demands of dendritic cell activation', Nat Immunol, 15(4), pp. 323-32.

Everts, B., Amiel, E., van der Windt, G. J., Freitas, T. C., Chott, R., Yarasheski, K. E., Pearce, E. L. y Pearce, E. J. (2012) 'Commitment to glycolysis sustains survival of NO-producing inflammatory dendritic cells', Blood, 120(7), pp. 1422-31.

Everts, B. y Pearce, E. J. (2014) 'Metabolic control of dendritic cell activation and function: recent advances and clinical implications', Front Immunol, 5, pp. 203.

Ferreira, G. B., Kleijwegt, F. S., Waelkens, E., Lage, K., Nikolic, T., Hansen, D. A., Workman, C. T., Roep, B. O., Overbergh, L. y Mathieu, C. (2012) 'Differential protein pathways in 1,25-dihydroxyvitamin d(3) and dexamethasone modulated tolerogenic human dendritic cells', J Proteome Res, 11(2), pp. 941-71.

Fiorentino, D. F., Bond, M. W. y Mosmann, T. R. (1989) 'Two types of mouse T helper cell. IV. Th2 clones secrete a factor that inhibits cytokine production by Th1 clones', J Exp Med, 170(6), pp. 2081-95.

Firth, J. D., Ebert, B. L. y Ratcliffe, P. J. (1995) 'Hypoxic regulation of lactate dehydrogenase A. Interaction between hypoxia-inducible factor 1 and cAMP response elements', J Biol Chem, 270(36), pp. 21021-7.

Fitzpatrick FW y DiCarlo FJ (1964).' Zymosan'. Ann. N.Y. Acad. Sci. 118: 233-262.

Ganeshan, K. y Chawla, A. (2014) 'Metabolic regulation of immune responses', Annu Rev Immunol, 32, pp. 609-34.

Gantner, B. N., Simmons, R. M., Canavera, S. J., Akira, S. y Underhill, D. M. (2003) 'Collaborative induction of inflammatory responses by dectin-1 and Toll-like receptor 2', J Exp Med, 197(9), pp. 1107-17.

Gao, X., Wang, H., Yang, J. J., Liu, X. y Liu, Z. R. (2012) 'Pyruvate kinase M2 regulates gene transcription by acting as a protein kinase', Mol Cell, 45(5), pp. 598-609.

Ge, H., Weiszmann, J., Reagan, J. D., Gupte, J., Baribault, H., Gyuris, T., Chen, J. L., Tian, H. y Li, Y. (2008) 'Elucidation of signaling and functional activities of an orphan GPCR, GPR81', J Lipid Res, 49(4), pp. 797-803.

Gerosa, F., Baldani-Guerra, B., Lyakh, L. A., Batoni, G., Esin, S., Winkler-Pickett, R. T., Consolaro, M. R., De Marchi, M., Giachino, D., Robbiano, A., Astegiano, M., Sambataro, A., Kastelein, R. A., Carra, G. y Trinchieri, G. (2008) 'Differential regulation of interleukin 12 and interleukin 23 production in human dendritic cells', J Exp Med, 205(6), pp. 1447-61.

Goodall, J. C., Wu, C., Zhang, Y., McNeill, L., Ellis, L., Saudek, V. y Gaston, J. S. (2010) 'Endoplasmic reticulum stress-induced transcription factor, CHOP, is crucial for dendritic cell IL-23 expression', Proc Natl Acad Sci U S A, 107(41), pp. 17698-703.

Page 131: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

123

Gorman, A. M., Healy, S. J., Jäger, R. y Samali, A. (2012) 'Stress management at the ER: regulators of ER stress-induced apoptosis', Pharmacol Ther, 134(3), pp. 306-16.

Grimes, C. A. y Jope, R. S. (2001) 'CREB DNA binding activity is inhibited by glycogen synthase kinase-3 beta and facilitated by lithium', J Neurochem, 78(6), pp. 1219-32.

Grivennikov, S. I., Wang, K., Mucida, D., Stewart, C. A., Schnabl, B., Jauch, D., Taniguchi, K., Yu, G. Y., Osterreicher, C. H., Hung, K. E., Datz, C., Feng, Y., Fearon, E. R., Oukka, M., Tessarollo, L., Coppola, V., Yarovinsky, F., Cheroutre, H., Eckmann, L., Trinchieri, G. y Karin, M. (2012) 'Adenoma-linked barrier defects and microbial products drive IL-23/IL-17-mediated tumour growth', Nature, 491(7423), pp. 254-8.

Grossbard, L. y Schimke, R. T. (1966) 'Multiple hexokinases of rat tissues. Purification and comparison of soluble forms', J Biol Chem, 241(15), pp. 3546-60.

Guo, L., Li, X. y Tang, Q. Q. (2015) 'Transcriptional regulation of adipocyte differentiation: a central role for CCAAT/enhancer-binding protein (C/EBP) β', J Biol Chem, 290(2), pp. 755-61.

Gupta, P., Singh, A., Gowda, P., Ghosh, S., Chatterjee, A. y Sen, E. (2016) 'Lactate induced HIF-1α-PRMT1 cross talk affects MHC I expression in monocytes', Exp Cell Res, 347(2), pp. 293-300.

Guthrie, L. N., Abiraman, K., Plyler, E. S., Sprenkle, N. T., Gibson, S. A., McFarland, B. C., Rajbhandari, R., Rowse, A. L., Benveniste, E. N. y Meares, G. P. (2016) 'Attenuation of PKR-like ER Kinase (PERK) Signaling Selectively Controls Endoplasmic Reticulum Stress-induced Inflammation Without Compromising Immunological Responses', J Biol Chem, 291(30), pp. 15830-40.

Haas, R., Cucchi, D., Smith, J., Pucino, V., Macdougall, C. E. y Mauro, C. (2016) 'Intermediates of Metabolism: From Bystanders to Signalling Molecules', Trends Biochem Sci, 41(5), pp. 460-471.

Halestrap, A. P. (2012) 'The monocarboxylate transporter family--Structure and functional characterization', IUBMB Life, 64(1), pp. 1-9.

Hammad, H., Plantinga, M., Deswarte, K., Pouliot, P., Willart, M. A., Kool, M., Muskens, F. y Lambrecht, B. N. (2010) 'Inflammatory dendritic cells--not basophils--are necessary and sufficient for induction of Th2 immunity to inhaled house dust mite allergen', J Exp Med, 207(10), pp. 2097-111.

Han, D., Lerner, A. G., Vande Walle, L., Upton, J. P., Xu, W., Hagen, A., Backes, B. J., Oakes, S. A. y Papa, F. R. (2009) 'IRE1alpha kinase activation modes control alternate endoribonuclease outputs to determine divergent cell fates', Cell, 138(3), pp. 562-75.

Han, J., Back, S. H., Hur, J., Lin, Y. H., Gildersleeve, R., Shan, J., Yuan, C. L., Krokowski, D., Wang, S., Hatzoglou, M., Kilberg, M. S., Sartor, M. A. y Kaufman, R. J. (2013) 'ER-stress-induced transcriptional regulation increases protein synthesis leading to cell death', Nat Cell Biol, 15(5), pp. 481-90.

Harada, K., Saheki, S., Wada, K. y Tanaka, T. (1978) 'Purification of four pyruvate kinase isozymes of rats by affinity elution chromatography', Biochim Biophys Acta, 524(2), pp. 327-39.

Harding, H. P., Zhang, Y. y Ron, D. (1999) 'Protein translation and folding are coupled by an endoplasmic-reticulum-resident kinase', Nature, 397(6716), pp. 271-4.

Hayakawa, K., Nakajima, S., Hiramatsu, N., Okamura, M., Huang, T., Saito, Y., Tagawa, Y., Tamai, M., Takahashi, S., Yao, J. y Kitamura, M. (2010) 'ER stress depresses NF-kappaB activation in mesangial cells through preferential induction of C/EBP beta', J Am Soc Nephrol, 21(1), pp. 73-81.

Hetz, C. (2012) 'The unfolded protein response: controlling cell fate decisions under ER stress and beyond', Nat Rev Mol Cell Biol, 13(2), pp. 89-102.

Hitosugi, T., Kang, S., Vander Heiden, M. G., Chung, T. W., Elf, S., Lythgoe, K., Dong, S., Lonial, S., Wang, X., Chen, G. Z., Xie, J., Gu, T. L., Polakiewicz, R. D., Roesel, J. L., Boggon, T. J., Khuri, F. R., Gilliland, D. G., Cantley, L. C., Kaufman, J. y Chen, J. (2009) 'Tyrosine phosphorylation inhibits PKM2 to promote the Warburg effect and tumor growth', Sci Signal, 2(97), pp. ra73.

Page 132: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

124

Hollien, J. y Weissman, J. S. (2006) 'Decay of endoplasmic reticulum-localized mRNAs during the unfolded protein response', Science, 313(5783), pp. 104-7.

Hoque, R., Farooq, A., Ghani, A., Gorelick, F. y Mehal, W. Z. (2014) 'Lactate reduces liver and pancreatic injury in Toll-like receptor- and inflammasome-mediated inflammation via GPR81-mediated suppression of innate immunity', Gastroenterology, 146(7), pp. 1763-74.

Horn, D. L., Neofytos, D., Anaissie, E. J., Fishman, J. A., Steinbach, W. J., Olyaei, A. J., Marr, K. A., Pfaller, M. A., Chang, C. H. y Webster, K. M. (2009) 'Epidemiology and outcomes of candidemia in 2019 patients: data from the prospective antifungal therapy alliance registry', Clin Infect Dis, 48(12), pp. 1695-703.

Hoseini, Z., Sepahvand, F., Rashidi, B., Sahebkar, A., Masoudifar, A. y Mirzaei, H. (2018) 'NLRP3 inflammasome: Its regulation and involvement in atherosclerosis', J Cell Physiol, 233(3), pp. 2116-2132.

Hu, P., Han, Z., Couvillon, A. D., Kaufman, R. J. y Exton, J. H. (2006) 'Autocrine tumor necrosis factor alpha links endoplasmic reticulum stress to the membrane death receptor pathway through IRE1alpha-mediated NF-kappaB activation and down-regulation of TRAF2 expression', Mol Cell Biol, 26(8), pp. 3071-84.

Ikeda, Y. y Noguchi, T. (1998) 'Allosteric regulation of pyruvate kinase M2 isozyme involves a cysteine residue in the intersubunit contact', J Biol Chem, 273(20), pp. 12227-33.

Ikeda, Y., Tanaka, T. y Noguchi, T. (1997) 'Conversion of non-allosteric pyruvate kinase isozyme into an allosteric enzyme by a single amino acid substitution', J Biol Chem, 272(33), pp. 20495-501.

Ippolito, L., Morandi, A., Giannoni, E. y Chiarugi, P. (2018) 'Lactate: A Metabolic Driver in the Tumour Landscape', Trends Biochem Sci.

Janeway, C. A. (1989) 'Approaching the asymptote? Evolution and revolution in immunology', Cold Spring Harb Symp Quant Biol, 54 Pt 1, pp. 1-13.

Janeway, C. A. (1992) 'The immune system evolved to discriminate infectious nonself from noninfectious self', Immunol Today, 13(1), pp. 11-6.

Jantsch, J., Chakravortty, D., Turza, N., Prechtel, A. T., Buchholz, B., Gerlach, R. G., Volke, M., Gläsner, J., Warnecke, C., Wiesener, M. S., Eckardt, K. U., Steinkasserer, A., Hensel, M. y Willam, C. (2008) 'Hypoxia and hypoxia-inducible factor-1 alpha modulate lipopolysaccharide-induced dendritic cell activation and function', J Immunol, 180(7), pp. 4697-705.

Jantsch, J., Wiese, M., Schödel, J., Castiglione, K., Gläsner, J., Kolbe, S., Mole, D., Schleicher, U., Eckardt, K. U., Hensel, M., Lang, R., Bogdan, C., Schnare, M. y Willam, C. (2011) 'Toll-like receptor activation and hypoxia use distinct signaling pathways to stabilize hypoxia-inducible factor 1α (HIF1A) and result in differential HIF1A-dependent gene expression', J Leukoc Biol, 90(3), pp. 551-62.

Jin, P., Han, T. H., Ren, J., Saunders, S., Wang, E., Marincola, F. M. y Stroncek, D. F. (2010) 'Molecular signatures of maturing dendritic cells: implications for testing the quality of dendritic cell therapies', J Transl Med, 8, pp. 4.

Joffre, O., Nolte, M. A., Spörri, R. y Reis e Sousa, C. (2009) 'Inflammatory signals in dendritic cell activation and the induction of adaptive immunity', Immunol Rev, 227(1), pp. 234-47.

Jurkin, J., Henkel, T., Nielsen, A. F., Minnich, M., Popow, J., Kaufmann, T., Heindl, K., Hoffmann, T., Busslinger, M. y Martinez, J. (2014) 'The mammalian tRNA ligase complex mediates splicing of XBP1 mRNA and controls antibody secretion in plasma cells', EMBO J, 33(24), pp. 2922-36.

Kankkunen, P., Teirilä, L., Rintahaka, J., Alenius, H., Wolff, H. y Matikainen, S. (2010) '(1,3)-beta-glucans activate both dectin-1 and NLRP3 inflammasome in human macrophages', J Immunol, 184(11), pp. 6335-42.

Page 133: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

125

Kaplon, J., Zheng, L., Meissl, K., Chaneton, B., Selivanov, V. A., Mackay, G., van der Burg, S. H., Verdegaal, E. M., Cascante, M., Shlomi, T., Gottlieb, E. y Peeper, D. S. (2013) 'A key role for mitochondrial gatekeeper pyruvate dehydrogenase in oncogene-induced senescence', Nature, 498(7452), pp. 109-12.

Katoh, Y., Takemori, H., Lin, X. Z., Tamura, M., Muraoka, M., Satoh, T., Tsuchiya, Y., Min, L., Doi, J., Miyauchi, A., Witters, L. A., Nakamura, H. y Okamoto, M. (2006) 'Silencing the constitutive active transcription factor CREB by the LKB1-SIK signaling cascade', FEBS J, 273(12), pp. 2730-48.

Kelly, B. y O'Neill, L. A. (2015) 'Metabolic reprogramming in macrophages and dendritic cells in innate immunity', Cell Res, 25(7), pp. 771-84.

Kelly, E. K., Wang, L. e Ivashkiv, L. B. (2010) 'Calcium-activated pathways and oxidative burst mediate zymosan-induced signaling and IL-10 production in human macrophages', J Immunol, 184(10), pp. 5545-52.

Kim, S., Joe, Y., Kim, H. J., Kim, Y. S., Jeong, S. O., Pae, H. O., Ryter, S. W., Surh, Y. J. y Chung, H. T. (2015) 'Endoplasmic reticulum stress-induced IRE1α activation mediates cross-talk of GSK-3β and XBP-1 to regulate inflammatory cytokine production', J Immunol, 194(9), pp. 4498-506.

Kocieda, V. P., Adhikary, S., Emig, F., Yen, J. H., Toscano, M. G. y Ganea, D. (2012) 'Prostaglandin E2-induced IL-23p19 subunit is regulated by cAMP-responsive element-binding protein and C/AATT enhancer-binding protein β in bone marrow-derived dendritic cells', J Biol Chem, 287(44), pp. 36922-35.

Kool, M., Soullié, T., van Nimwegen, M., Willart, M. A., Muskens, F., Jung, S., Hoogsteden, H. C., Hammad, H. y Lambrecht, B. N. (2008) 'Alum adjuvant boosts adaptive immunity by inducing uric acid and activating inflammatory dendritic cells', J Exp Med, 205(4), pp. 869-82.

Kozutsumi, Y., Segal, M., Normington, K., Gething, M. J. y Sambrook, J. (1988) 'The presence of malfolded proteins in the endoplasmic reticulum signals the induction of glucose-regulated proteins', Nature, 332(6163), pp. 462-4.

Krawczyk, C. M., Holowka, T., Sun, J., Blagih, J., Amiel, E., DeBerardinis, R. J., Cross, J. R., Jung, E., Thompson, C. B., Jones, R. G. y Pearce, E. J. (2010) 'Toll-like receptor-induced changes in glycolytic metabolism regulate dendritic cell activation', Blood, 115(23), pp. 4742-9.

Kreymborg, K., Etzensperger, R., Dumoutier, L., Haak, S., Rebollo, A., Buch, T., Heppner, F. L., Renauld, J. C. y Becher, B. (2007) 'IL-22 is expressed by Th17 cells in an IL-23-dependent fashion, but not required for the development of autoimmune encephalomyelitis', J Immunol, 179(12), pp. 8098-104.

Kryczek, I., Banerjee, M., Cheng, P., Vatan, L., Szeliga, W., Wei, S., Huang, E., Finlayson, E., Simeone, D., Welling, T. H., Chang, A., Coukos, G., Liu, R. y Zou, W. (2009) 'Phenotype, distribution, generation, and functional and clinical relevance of Th17 cells in the human tumor environments', Blood, 114(6), pp. 1141-9.

Kurtoglu, M., Maher, J. C. y Lampidis, T. J. (2007) 'Differential toxic mechanisms of 2-deoxy-D-glucose versus 2-fluorodeoxy-D-glucose in hypoxic and normoxic tumor cells', Antioxid Redox Signal, 9(9), pp. 1383-90.

Kühn, R., Löhler, J., Rennick, D., Rajewsky, K. y Müller, W. (1993) 'Interleukin-10-deficient mice develop chronic enterocolitis', Cell, 75(2), pp. 263-74.

Lachmandas, E., Boutens, L., Ratter, J. M., Hijmans, A., Hooiveld, G. J., Joosten, L. A., Rodenburg, R. J., Fransen, J. A., Houtkooper, R. H., van Crevel, R., Netea, M. G. y Stienstra, R. (2016) 'Microbial stimulation of different Toll-like receptor signalling pathways induces diverse metabolic programmes in human monocytes', Nat Microbiol, 2, pp. 16246.

Laemmli, U. K. (1970) 'Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4', Nature, 227(5259), pp. 680-5.

Page 134: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

126

Lee, A. H., Scapa, E. F., Cohen, D. E. y Glimcher, L. H. (2008) 'Regulation of hepatic lipogenesis by the transcription factor XBP1', Science, 320(5882), pp. 1492-6.

Lee, E., Trepicchio, W. L., Oestreicher, J. L., Pittman, D., Wang, F., Chamian, F., Dhodapkar, M. y Krueger, J. G. (2004) 'Increased expression of interleukin 23 p19 and p40 in lesional skin of patients with psoriasis vulgaris', J Exp Med, 199(1), pp. 125-30.

Lee, J., Sun, C., Zhou, Y., Gokalp, D., Herrema, H., Park, S. W., Davis, R. J. y Ozcan, U. (2011) 'p38 MAPK-mediated regulation of Xbp1s is crucial for glucose homeostasis', Nat Med, 17(10), pp. 1251-60.

León, B., López-Bravo, M. y Ardavín, C. (2007) 'Monocyte-derived dendritic cells formed at the infection site control the induction of protective T helper 1 responses against Leishmania', Immunity, 26(4), pp. 519-31.

Li, M., Gao, Z., Wang, Y., Wang, H. y Zhang, S. (2014) 'Identification, expression and bioactivity of hexokinase in amphioxus: insights into evolution of vertebrate hexokinase genes', Gene, 535(2), pp. 318-26.

Liu, J., Ibi, D., Taniguchi, K., Lee, J., Herrema, H., Akosman, B., Mucka, P., Salazar Hernandez, M. A., Uyar, M. F., Park, S. W., Karin, M. y Ozcan, U. (2016) 'Inflammation Improves Glucose Homeostasis through IKKβ-XBP1s Interaction', Cell, 167(4), pp. 1052-1066.e18.

Liu, X., Fang, L., Guo, T. B., Mei, H. y Zhang, J. Z. (2013) 'Drug targets in the cytokine universe for autoimmune disease', Trends Immunol, 34(3), pp. 120-8.

Lu, Y. C., Yeh, W. C. y Ohashi, P. S. (2008) 'LPS/TLR4 signal transduction pathway', Cytokine, 42(2), pp. 145-151.

Luo, W., Hu, H., Chang, R., Zhong, J., Knabel, M., O'Meally, R., Cole, R. N., Pandey, A. y Semenza, G. L. (2011) 'Pyruvate kinase M2 is a PHD3-stimulated coactivator for hypoxia-inducible factor 1', Cell, 145(5), pp. 732-44.

Malhi, H. y Kaufman, R. J. (2011) 'Endoplasmic reticulum stress in liver disease', J Hepatol, 54(4), pp. 795-809.

Malinarich, F., Duan, K., Hamid, R. A., Bijin, A., Lin, W. X., Poidinger, M., Fairhurst, A. M. y Connolly, J. E. (2015) 'High mitochondrial respiration and glycolytic capacity represent a metabolic phenotype of human tolerogenic dendritic cells', J Immunol, 194(11), pp. 5174-86.

Martin, M., Rehani, K., Jope, R. S. y Michalek, S. M. (2005) 'Toll-like receptor-mediated cytokine production is differentially regulated by glycogen synthase kinase 3', Nat Immunol, 6(8), pp. 777-84.

Martin-Orozco, N., Muranski, P., Chung, Y., Yang, X. O., Yamazaki, T., Lu, S., Hwu, P., Restifo, N. P., Overwijk, W. W. y Dong, C. (2009) 'T helper 17 cells promote cytotoxic T cell activation in tumor immunity', Immunity, 31(5), pp. 787-98.

Martinez-Costa, O. (2015) 'Glicolisis, efecto Warburg y flexibilidad metabólica tumoral'. SEBBM doi.org/10.18567/sebbmdiv_RPC.2015.06.1

Martinon, F., Chen, X., Lee, A. H. y Glimcher, L. H. (2010) 'TLR activation of the transcription factor XBP1 regulates innate immune responses in macrophages', Nat Immunol, 11(5), pp. 411-8.

Martins, A. S., Alves, I., Helguero, L., Domingues, M. R. y Neves, B. M. (2016) 'The Unfolded Protein Response in Homeostasis and Modulation of Mammalian Immune Cells', Int Rev Immunol, 35(6), pp. 457-476.

Matsuda, S., Adachi, J., Ihara, M., Tanuma, N., Shima, H., Kakizuka, A., Ikura, M., Ikura, T. y Matsuda, T. (2016) 'Nuclear pyruvate kinase M2 complex serves as a transcriptional coactivator of arylhydrocarbon receptor', Nucleic Acids Res, 44(2), pp. 636-47.

Matzinger, P. (1994) 'Tolerance, danger, y the extended family', Annu Rev Immunol, 12, pp. 991-1045.

Page 135: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

127

Mazurek, S., Zwerschke, W., Jansen-Dürr, P. y Eigenbrodt, E. (2001) 'Effects of the human papilloma virus HPV-16 E7 oncoprotein on glycolysis and glutaminolysis: role of pyruvate kinase type M2 and the glycolytic-enzyme complex', Biochem J, 356(Pt 1), pp. 247-56.

McAlpine, C. S., Bowes, A. J., Khan, M. I., Shi, Y. y Werstuck, G. H. (2012) 'Endoplasmic reticulum stress and glycogen synthase kinase-3β activation in apolipoprotein E-deficient mouse models of accelerated atherosclerosis', Arterioscler Thromb Vasc Biol, 32(1), pp. 82-91.

McGeachy, M. J. y Cua, D. J. (2007) 'The link between IL-23 and Th17 cell-mediated immune pathologies', Semin Immunol, 19(6), pp. 372-6.

Meares, G. P., Liu, Y., Rajbhandari, R., Qin, H., Nozell, S. E., Mobley, J. A., Corbett, J. A. y Benveniste, E. N. (2014) 'PERK-dependent activation of JAK1 and STAT3 contributes to endoplasmic reticulum stress-induced inflammation', Mol Cell Biol, 34(20), pp. 3911-25.

Medzhitov, R. (2007) 'Recognition of microorganisms and activation of the immune response', Nature, 449(7164), pp. 819-26.

Meiser, J., Krämer, L., Sapcariu, S. C., Battello, N., Ghelfi, J., D'Herouel, A. F., Skupin, A. y Hiller, K. (2016) 'Pro-inflammatory Macrophages Sustain Pyruvate Oxidation through Pyruvate Dehydrogenase for the Synthesis of Itaconate and to Enable Cytokine Expression', J Biol Chem, 291(8), pp. 3932-46.

Mellett, M., Atzei, P., Jackson, R., O'Neill, L. A. y Moynagh, P. N. (2011) 'Mal mediates TLR-induced activation of CREB and expression of IL-10', J Immunol, 186(8), pp. 4925-35.

Merad, M., Sathe, P., Helft, J., Miller, J. y Mortha, A. (2013) 'The dendritic cell lineage: ontogeny and function of dendritic cells and their subsets in the steady state and the inflamed setting', Annu Rev Immunol, 31, pp. 563-604.

Morelli, A. E. y Thomson, A. W. (2007) 'Tolerogenic dendritic cells and the quest for transplant tolerance', Nat Rev Immunol, 7(8), pp. 610-21.

Nakano, H., Lin, K. L., Yanagita, M., Charbonneau, C., Cook, D. N., Kakiuchi, T. y Gunn, M. D. (2009) 'Blood-derived inflammatory dendritic cells in lymph nodes stimulate acute T helper type 1 immune responses', Nat Immunol, 10(4), pp. 394-402.

Nancolas, B., Guo, L., Zhou, R., Nath, K., Nelson, D. S., Leeper, D. B., Blair, I. A., Glickson, J. D. y Halestrap, A. P. (2016) 'The anti-tumour agent lonidamine is a potent inhibitor of the mitochondrial pyruvate carrier and plasma membrane monocarboxylate transporters', Biochem J, 473(7), pp. 929-36.

Nenu, I., Gafencu, G. A., Popescu, T. y Kacso, G. (2017) 'Lactate - A new frontier in the immunology and therapy of prostate cancer', J Cancer Res Ther, 13(3), pp. 406-411.

Noguchi, T., Inoue, H. y Tanaka, T. (1986) 'The M1- and M2-type isozymes of rat pyruvate kinase are produced from the same gene by alternative RNA splicing', J Biol Chem, 261(29), pp. 13807-12.

Noguchi, T., Yamada, K., Inoue, H., Matsuda, T. y Tanaka, T. (1987) 'The L- and R-type isozymes of rat pyruvate kinase are produced from a single gene by use of different promoters', J Biol Chem, 262(29), pp. 14366-71.

O'Neill, L. A. y Hardie, D. G. (2013) 'Metabolism of inflammation limited by AMPK and pseudo-starvation', Nature, 493(7432), pp. 346-55.

O'Neill, L. A., Kishton, R. J. y Rathmell, J. (2016) 'A guide to immunometabolism for immunologists', Nat Rev Immunol, 16(9), pp. 553-65.

O'Neill, L. A. y Pearce, E. J. (2016) 'Immunometabolism governs dendritic cell and macrophage function', J Exp Med, 213(1), pp. 15-23.

Page 136: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

128

Obach, M., Navarro-Sabaté, A., Caro, J., Kong, X., Duran, J., Gómez, M., Perales, J. C., Ventura, F., Rosa, J. L. y Bartrons, R. (2004) '6-Phosphofructo-2-kinase (pfkfb3) gene promoter contains hypoxia-inducible factor-1 binding sites necessary for transactivation in response to hypoxia', J Biol Chem, 279(51), pp. 53562-70.

Oppmann, B., Lesley, R., Blom, B., Timans, J. C., Xu, Y., Hunte, B., Vega, F., Yu, N., Wang, J., Singh, K., Zonin, F., Vaisberg, E., Churakova, T., Liu, M., Gorman, D., Wagner, J., Zurawski, S., Liu, Y., Abrams, J. S., Moore, K. W., Rennick, D., de Waal-Malefyt, R., Hannum, C., Bazan, J. F. y Kastelein, R. A. (2000) 'Novel p19 protein engages IL-12p40 to form a cytokine, IL-23, with biological activities similar as well as distinct from IL-12', Immunity, 13(5), pp. 715-25.

Oren, R., Farnham, A. E., Saito, K., Milofsky, E. y Karnovsky, M. L. (1963) 'Metabolic patterns in three types of phagocytizing cells', J Cell Biol, 17, pp. 487-501.

Otto, J. C., DeWitt, D. L. y Smith, W. L. (1993) 'N-glycosylation of prostaglandin endoperoxide synthases-1 and -2 and their orientations in the endoplasmic reticulum', J Biol Chem, 268(24), pp. 18234-42.

Pakos-Zebrucka, K., Koryga, I., Mnich, K., Ljujic, M., Samali, A. y Gorman, A. M. (2016) 'The integrated stress response', EMBO Rep, 17(10), pp. 1374-1395.

Palsson-McDermott, E. M., Curtis, A. M., Goel, G., Lauterbach, M. A., Sheedy, F. J., Gleeson, L. E., van den Bosch, M. W., Quinn, S. R., Domingo-Fernandez, R., Johnston, D. G., Jiang, J. K., Israelsen, W. J., Keane, J., Thomas, C., Clish, C., Vander Heiden, M., Vanden Heiden, M., Xavier, R. J. y O'Neill, L. A. (2015) 'Pyruvate kinase M2 regulates Hif-1α activity and IL-1β induction and is a critical determinant of the warburg effect in LPS-activated macrophages', Cell Metab, 21(1), pp. 65-80.

Park, S. W., Herrema, H., Salazar, M., Cakir, I., Cabi, S., Basibuyuk Sahin, F., Chiu, Y. H., Cantley, L. C. y Ozcan, U. (2014) 'BRD7 regulates XBP1s' activity and glucose homeostasis through its interaction with the regulatory subunits of PI3K', Cell Metab, 20(1), pp. 73-84.

Pearce, E. J. y Everts, B. (2015) 'Dendritic cell metabolism', Nat Rev Immunol, 15(1), pp. 18-29.

Pearce, E. L. y Pearce, E. J. (2013) 'Metabolic pathways in immune cell activation and quiescence', Immunity, 38(4), pp. 633-43.

Perrin-Cocon, L., Aublin-Gex, A., Diaz, O., Ramière, C., Peri, F., André, P. y Lotteau, V. (2018) 'Toll-like Receptor 4-Induced Glycolytic Burst in Human Monocyte-Derived Dendritic Cells Results from p38-Dependent Stabilization of HIF-1α and Increased Hexokinase II Expression', J Immunol, 201(5), pp. 1510-1521.

Peyssonnaux, C., Datta, V., Cramer, T., Doedens, A., Theodorakis, E. A., Gallo, R. L., Hurtado-Ziola, N., Nizet, V. y Johnson, R. S. (2005) 'HIF-1alpha expression regulates the bactericidal capacity of phagocytes', J Clin Invest, 115(7), pp. 1806-15.

Plevy, S. E., Gemberling, J. H., Hsu, S., Dorner, A. J. y Smale, S. T. (1997) 'Multiple control elements mediate activation of the murine and human interleukin 12 p40 promoters: evidence of functional synergy between C/EBP and Rel proteins', Mol Cell Biol, 17(8), pp. 4572-88.

Powell, M. J., Thompson, S. A., Tone, Y., Waldmann, H. y Tone, M. (2000) 'Posttranscriptional regulation of IL-10 gene expression through sequences in the 3'-untranslated region', J Immunol, 165(1), pp. 292-6.

Pucino, V., Bombardieri, M., Pitzalis, C. y Mauro, C. (2017) 'Lactate at the crossroads of metabolism, inflammation, and autoimmunity', Eur J Immunol, 47(1), pp. 14-21.

Pulendran, B. (2015) 'The varieties of immunological experience: of pathogens, stress, and dendritic cells', Annu Rev Immunol, 33, pp. 563-606.

Page 137: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

129

Qi, W., Keenan, H. A., Li, Q., Ishikado, A., Kannt, A., Sadowski, T., Yorek, M. A., Wu, I. H., Lockhart, S., Coppey, L. J., Pfenninger, A., Liew, C. W., Qiang, G., Burkart, A. M., Hastings, S., Pober, D., Cahill, C., Niewczas, M. A., Israelsen, W. J., Tinsley, L., Stillman, I. E., Amenta, P. S., Feener, E. P., Vander Heiden, M. G., Stanton, R. C. y King, G. L. (2017) 'Pyruvate kinase M2 activation may protect against the progression of diabetic glomerular pathology and mitochondrial dysfunction', Nat Med, 23(6), pp. 753-762.

Ralser, M., Wamelink, M. M., Struys, E. A., Joppich, C., Krobitsch, S., Jakobs, C. y Lehrach, H. (2008) 'A catabolic block does not sufficiently explain how 2-deoxy-D-glucose inhibits cell growth', Proc Natl Acad Sci U S A, 105(46), pp. 17807-11.

Renner, K., Geiselhöringer, A. L., Fante, M., Bruss, C., Färber, S., Schönhammer, G., Peter, K., Singer, K., Andreesen, R., Hoffmann, P., Oefner, P., Herr, W. y Kreutz, M. (2015) 'Metabolic plasticity of human T cells: Preserved cytokine production under glucose deprivation or mitochondrial restriction, but 2-deoxy-glucose affects effector functions', Eur J Immunol, 45(9), pp. 2504-16.

Riddle, S. R., Ahmad, A., Ahmad, S., Deeb, S. S., Malkki, M., Schneider, B. K., Allen, C. B. y White, C. W. (2000) 'Hypoxia induces hexokinase II gene expression in human lung cell line A549', Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol, 278(2), pp. L407-16.

Riek, A. E., Oh, J., Sprague, J. E., Timpson, A., de las Fuentes, L., Bernal-Mizrachi, L., Schechtman, K. B. y Bernal-Mizrachi, C. (2012) 'Vitamin D suppression of endoplasmic reticulum stress promotes an antiatherogenic monocyte/macrophage phenotype in type 2 diabetic patients', J Biol Chem, 287(46), pp. 38482-94.

Rius, J., Guma, M., Schachtrup, C., Akassoglou, K., Zinkernagel, A. S., Nizet, V., Johnson, R. S., Haddad, G. G. y Karin, M. (2008) 'NF-kappaB links innate immunity to the hypoxic response through transcriptional regulation of HIF-1alpha', Nature, 453(7196), pp. 807-11.

Rodríguez, M., Domingo, E., Alonso, S., Frade, J. G., Eiros, J., Crespo, M. S. y Fernández, N. (2014) 'The unfolded protein response and the phosphorylations of activating transcription factor 2 in the trans-activation of il23a promoter produced by β-glucans', J Biol Chem, 289(33), pp. 22942-57.

Rodríguez, M., Márquez, S., de la Rosa, J. V., Alonso, S., Castrillo, A., Sánchez Crespo, M. y Fernández, N. (2017) 'Fungal pattern receptors down-regulate the inflammatory response by a cross-inhibitory mechanism independent of interleukin-10 production', Immunology, 150(2), pp. 184-198.

Saibil, H. (2013) 'Chaperone machines for protein folding, unfolding and disaggregation', Nat Rev Mol Cell Biol, 14(10), pp. 630-42.

Sallusto, F. y Lanzavecchia, A. (1994) 'Efficient presentation of soluble antigen by cultured human dendritic cells is maintained by granulocyte/macrophage colony-stimulating factor plus interleukin 4 and downregulated by tumor necrosis factor alpha', J Exp Med, 179(4), pp. 1109-18.

Sattler, S. (2017) 'The Role of the Immune System Beyond the Fight Against Infection', Adv Exp Med Biol, 1003, pp. 3-14.

Segura, E., Touzot, M., Bohineust, A., Cappuccio, A., Chiocchia, G., Hosmalin, A., Dalod, M., Soumelis, V. and Amigorena, S. (2013) 'Human inflammatory dendritic cells induce Th17 cell differentiation', Immunity, 38(2), pp. 336-48.

Semenza, G. L. (2001) 'HIF-1 and mechanisms of hypoxia sensing', Curr Opin Cell Biol, 13(2), pp. 167-71.

Sevier, C. S. y Kaiser, C. A. (2002) 'Formation and transfer of disulphide bonds in living cells', Nat Rev Mol Cell Biol, 3(11), pp. 836-47.

Shan, B., Wang, X., Wu, Y., Xu, C., Xia, Z., Dai, J., Shao, M., Zhao, F., He, S., Yang, L., Zhang, M., Nan, F., Li, J., Liu, J., Jia, W., Qiu, Y., Song, B., Han, J. J., Rui, L., Duan, S. Z. y Liu, Y. (2017) 'The metabolic ER stress sensor IRE1α suppresses alternative activation of macrophages and impairs energy expenditure in obesity', Nat Immunol, 18(5), pp. 519-529.

Page 138: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

130

Shehade, H., Acolty, V., Moser, M. y Oldenhove, G. (2015) 'Cutting Edge: Hypoxia-Inducible Factor 1 Negatively Regulates Th1 Function', J Immunol, 195(4), pp. 1372-6.

Shen, J., Chen, X., Hendershot, L. y Prywes, R. (2002) 'ER stress regulation of ATF6 localization by dissociation of BiP/GRP78 binding and unmasking of Golgi localization signals', Dev Cell, 3(1), pp. 99-111.

Shenderov, K., Riteau, N., Yip, R., Mayer-Barber, K. D., Oland, S., Hieny, S., Fitzgerald, P., Oberst, A., Dillon, C. P., Green, D. R., Cerundolo, V. y Sher, A. (2014) 'Cutting edge: Endoplasmic reticulum stress licenses macrophages to produce mature IL-1β in response to TLR4 stimulation through a caspase-8- and TRIF-dependent pathway', J Immunol, 192(5), pp. 2029-2033.

Shi, L. Z., Wang, R., Huang, G., Vogel, P., Neale, G., Green, D. R. y Chi, H. (2011) 'HIF1alpha-dependent glycolytic pathway orchestrates a metabolic checkpoint for the differentiation of TH17 and Treg cells', J Exp Med, 208(7), pp. 1367-76.

Shime, H., Yabu, M., Akazawa, T., Kodama, K., Matsumoto, M., Seya, T. e Inoue, N. (2008) 'Tumor-secreted lactic acid promotes IL-23/IL-17 proinflammatory pathway', J Immunol, 180(11), pp. 7175-83.

Shirai, T., Nazarewicz, R. R., Wallis, B. B., Yanes, R. E., Watanabe, R., Hilhorst, M., Tian, L., Harrison, D. G., Giacomini, J. C., Assimes, T. L., Goronzy, J. J. y Weyand, C. M. (2016) 'The glycolytic enzyme PKM2 bridges metabolic and inflammatory dysfunction in coronary artery disease', J Exp Med, 213(3), pp. 337-54.

Singh, R., Aggarwal, A. y Misra, R. (2007) 'Th1/Th17 cytokine profiles in patients with reactive arthritis/undifferentiated spondyloarthropathy', J Rheumatol, 34(11), pp. 2285-90.

Smith, M. H., Ploegh, H. L. y Weissman, J. S. (2011) 'Road to ruin: targeting proteins for degradation in the endoplasmic reticulum', Science, 334(6059), pp. 1086-90.

Snodgrass, R. G., Huang, S., Namgaladze, D., Jandali, O., Shao, T., Sama, S., Brüne, B. y Hwang, D. H. (2016) 'Docosahexaenoic acid and palmitic acid reciprocally modulate monocyte activation in part through endoplasmic reticulum stress', J Nutr Biochem, 32, pp. 39-45.

Spoden, G. A., Morandell, D., Ehehalt, D., Fiedler, M., Jansen-Dürr, P., Hermann, M. y Zwerschke, W. (2009) 'The SUMO-E3 ligase PIAS3 targets pyruvate kinase M2', J Cell Biochem, 107(2), pp. 293-302.

Steinman, R. M. (1991) 'The dendritic cell system and its role in immunogenicity', Annu Rev Immunol, 9, pp. 271-96.

Steinman, R. M. y Cohn, Z. A. (1973) 'Identification of a novel cell type in peripheral lymphoid organs of mice. I. Morphology, quantitation, tissue distribution', J Exp Med, 137(5), pp. 1142-62.

Stoecklin, G., Tenenbaum, S. A., Mayo, T., Chittur, S. V., George, A. D., Baroni, T. E., Blackshear, P. J. y Anderson, P. (2008) 'Genome-wide analysis identifies interleukin-10 mRNA as target of tristetraprolin', J Biol Chem, 283(17), pp. 11689-99.

Stothers, C. L., Luan, L., Fensterheim, B. A. y Bohannon, J. K. (2018) 'Hypoxia-inducible factor-1α regulation of myeloid cells', J Mol Med (Berl), 96(12), pp. 1293-1306.

Subramanian, M., Thorp, E. y Tabas, I. (2015) 'Identification of a non-growth factor role for GM-CSF in advanced atherosclerosis: promotion of macrophage apoptosis and plaque necrosis through IL-23 signaling', Circ Res, 116(2), pp. e13-24.

Tabas, I. y Ron, D. (2011) 'Integrating the mechanisms of apoptosis induced by endoplasmic reticulum stress', Nat Cell Biol, 13(3), pp. 184-90.

Tam, A. B., Mercado, E. L., Hoffmann, A. y Niwa, M. (2012) 'ER stress activates NF-κB by integrating functions of basal IKK activity, IRE1 and PERK', PLoS One, 7(10), pp. e45078.

Page 139: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

131

Tamada, M., Suematsu, M. y Saya, H. (2012) 'Pyruvate kinase M2: multiple faces for conferring benefits on cancer cells', Clin Cancer Res, 18(20), pp. 5554-61.

Tannahill, G. M., Curtis, A. M., Adamik, J., Palsson-McDermott, E. M., McGettrick, A. F., Goel, G., Frezza, C., Bernard, N. J., Kelly, B., Foley, N. H., Zheng, L., Gardet, A., Tong, Z., Jany, S. S., Corr, S. C., Haneklaus, M., Caffrey, B. E., Pierce, K., Walmsley, S., Beasley, F. C., Cummins, E., Nizet, V., Whyte, M., Taylor, C. T., Lin, H., Masters, S. L., Gottlieb, E., Kelly, V. P., Clish, C., Auron, P. E., Xavier, R. J. y O'Neill, L. A. (2013) 'Succinate is an inflammatory signal that induces IL-1β through HIF-1α', Nature, 496(7444), pp. 238-42.

Teng, M. W., Bowman, E. P., McElwee, J. J., Smyth, M. J., Casanova, J. L., Cooper, A. M. y Cua, D. J. (2015) 'IL-12 and IL-23 cytokines: from discovery to targeted therapies for immune-mediated inflammatory diseases', Nat Med, 21(7), pp. 719-29.

Tennant, D. A. (2011) 'PK-M2 Makes Cells Sweeter on HIF1', Cell, 145(5), pp. 647-9.

Tufanli, O., Telkoparan Akillilar, P., Acosta-Alvear, D., Kocaturk, B., Onat, U. I., Hamid, S. M., Çimen, I., Walter, P., Weber, C. y Erbay, E. (2017) 'Targeting IRE1 with small molecules counteracts progression of atherosclerosis', Proc Natl Acad Sci U S A, 114(8), pp. E1395-E1404.

Valera, I., Fernández, N., Trinidad, A. G., Alonso, S., Brown, G. D., Alonso, A. y Crespo, M. S. (2008) 'Costimulation of dectin-1 and DC-SIGN triggers the arachidonic acid cascade in human monocyte-derived dendritic cells', J Immunol, 180(8), pp. 5727-36.

van der Windt, G. J., O'Sullivan, D., Everts, B., Huang, S. C., Buck, M. D., Curtis, J. D., Chang, C. H., Smith, A. M., Ai, T., Faubert, B., Jones, R. G., Pearce, E. J. y Pearce, E. L. (2013) 'CD8 memory T cells have a bioenergetic advantage that underlies their rapid recall ability', Proc Natl Acad Sci U S A, 110(35), pp. 14336-41.

Vattem, K. M. y Wek, R. C. (2004) 'Reinitiation involving upstream ORFs regulates ATF4 mRNA translation in mammalian cells', Proc Natl Acad Sci U S A, 101(31), pp. 11269-74.

Vo, N. y Goodman, R. H. (2001) 'CREB-binding protein and p300 in transcriptional regulation', J Biol Chem, 276(17), pp. 13505-8.

Wang, G. L., Jiang, B. H., Rue, E. A. y Semenza, G. L. (1995) 'Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension', Proc Natl Acad Sci U S A, 92(12), pp. 5510-4.

Wang, H. J., Hsieh, Y. J., Cheng, W. C., Lin, C. P., Lin, Y. S., Yang, S. F., Chen, C. C., Izumiya, Y., Yu, J. S., Kung, H. J. y Wang, W. C. (2014a) 'JMJD5 regulates PKM2 nuclear translocation and reprograms HIF-1α-mediated glucose metabolism', Proc Natl Acad Sci U S A, 111(1), pp. 279-84.

Wang, Q., Franks, H. A., Lax, S. J., El Refaee, M., Malecka, A., Shah, S., Spendlove, I., Gough, M. J., Seedhouse, C., Madhusudan, S., Patel, P. M. y Jackson, A. M. (2013) 'The ataxia telangiectasia mutated kinase pathway regulates IL-23 expression by human dendritic cells', J Immunol, 190(7), pp. 3246-55.

Wang, Z. V., Deng, Y., Gao, N., Pedrozo, Z., Li, D. L., Morales, C. R., Criollo, A., Luo, X., Tan, W., Jiang, N., Lehrman, M. A., Rothermel, B. A., Lee, A. H., Lavandero, S., Mammen, P. P. A., Ferdous, A., Gillette, T. G., Scherer, P. E. y Hill, J. A. (2014b) 'Spliced X-box binding protein 1 couples the unfolded protein response to hexosamine biosynthetic pathway', Cell, 156(6), pp. 1179-1192.

Warburg, O. (1956) 'On the origin of cancer cells', Science, 123(3191), pp. 309-14.

Watanabe, R., Shirai, T., Namkoong, H., Zhang, H., Berry, G. J., Wallis, B. B., Schaefgen, B., Harrison, D. G., Tremmel, J. A., Giacomini, J. C., Goronzy, J. J. y Weyand, C. M. (2017) 'Pyruvate controls the checkpoint inhibitor PD-L1 and suppresses T cell immunity', J Clin Invest, 127(7), pp. 2725-2738.

Page 140: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

BIBLIOGRAFÍA

132

Wei, L., Zhou, Y., Yao, J., Qiao, C., Ni, T., Guo, R., Guo, Q. y Lu, N. (2015) 'Lactate promotes PGE2 synthesis and gluconeogenesis in monocytes to benefit the growth of inflammation-associated colorectal tumor', Oncotarget, 6(18), pp. 16198-214.

Wilson, J. E. (2003) 'Isozymes of mammalian hexokinase: structure, subcellular localization and metabolic function', J Exp Biol, 206(Pt 12), pp. 2049-57. y Tang, D. (2016) 'PKM2-dependent glycolysis promotes NLRP3 and AIM2 inflammasome activation', Nat Commun, 7, pp. 13280.

Yan, D., Wang, H. W., Bowman, R. L. y Joyce, J. A. (2016) 'STAT3 and STAT6 Signaling Pathways Synergize to Promote Cathepsin Secretion from Macrophages via IRE1α Activation', Cell Rep, 16(11), pp. 2914-2927.

Yang, W. y Lu, Z. (2013) 'Regulation and function of pyruvate kinase M2 in cancer', Cancer Lett, 339(2), pp. 153-8.

Yang, W., Xia, Y., Hawke, D., Li, X., Liang, J., Xing, D., Aldape, K., Hunter, T., Alfred Yung, W. K. y Lu, Z. (2012) 'PKM2 phosphorylates histone H3 and promotes gene transcription and tumorigenesis', Cell, 150(4), pp. 685-96.

Ye, J., Rawson, R. B., Komuro, R., Chen, X., Davé, U. P., Prywes, R., Brown, M. S. y Goldstein, J. L. (2000) 'ER stress induces cleavage of membrane-bound ATF6 by the same proteases that process SREBPs', Mol Cell, 6(6), pp. 1355-64.

Yu, S. M. y Kim, S. J. (2010) 'Endoplasmic reticulum stress (ER-stress) by 2-deoxy-D-glucose (2DG) reduces cyclooxygenase-2 (COX-2) expression and N-glycosylation and induces a loss of COX-2 activity via a Src kinase-dependent pathway in rabbit articular chondrocytes', Exp Mol Med, 42(11), pp. 777-86.

Zhang, W., Petrovic, J. M., Callaghan, D., Jones, A., Cui, H., Howlett, C. y Stanimirovic, D. (2006) 'Evidence that hypoxia-inducible factor-1 (HIF-1) mediates transcriptional activation of interleukin-1beta (IL-1beta) in astrocyte cultures', J Neuroimmunol, 174(1-2), pp. 63-73.

Zhou, Y., Lee, J., Reno, C. M., Sun, C., Park, S. W., Chung, J., Fisher, S. J., White, M. F., Biddinger, S. B. y Ozcan, U. (2011) 'Regulation of glucose homeostasis through a XBP-1-FoxO1 interaction', Nat Med, 17(3), pp. 356-65.

Zhu, S., Liu, H., Sha, H., Qi, L., Gao, D. S. y Zhang, W. (2017) 'PERK and XBP1 differentially regulate CXCL10 and CCL2 production', Exp Eye Res, 155, pp. 1-14.

Zou, W. y Restifo, N. P. (2010) 'T(H)17 cells in tumour immunity and immunotherapy', Nat Rev Immunol, 10(4), pp. 248-56.

Page 141: TESIS DOCTORAL: Regulación de la transcripción de

Anexo I

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PUBLICACIONES

135

Durante la realización de la tesis he participado en diferentes proyectos de

investigación que han dado lugar a las siguientes publicaciones:

*Márquez, S., J. J. Fernández, C. Mancebo, C. Herrero-Sánchez, S. Alonso, T. A.

Sandoval, M. Rodríguez Prados, J. R. Cubillos-Ruiz, O. Montero, N. Fernández, y M.

Sánchez Crespo. 2019. Tricarboxylic Acid Cycle Activity and Remodeling of

Glycerophosphocholine Lipids Support Cytokine Induction in Response to Fungal

Patterns. Cell Rep 27 (2):525-536.e4. doi: 10.1016/j.celrep.2019.03.033.

Herrero-Sánchez, M. C., E. B. Angomás, C. de Ramón, J. J. Tellería, L. A. Corchete, S.

Alonso, M. D. C. Ramos, M. J. Peñarrubia, S. Márquez, N. Fernández, L. J. García Frade,

y M. Sánchez Crespo. 2018. Polymorphisms in Receptors Involved in Opsonic and

Nonopsonic Phagocytosis, and Correlation with Risk of Infection in Oncohematology

Patients. Infect Immun 86 (12). doi: 10.1128/IAI.00709-18.

*Márquez, S., J. J. Fernández, E. Terán-Cabanillas, C. Herrero, S. Alonso, A. Azogil, O.

Montero, T. Iwawaki, J. R. Cubillos-Ruiz, N. Fernández, y M. S. Crespo. 2017.

Endoplasmic Reticulum Stress Sensor IRE1α Enhances IL-23 Expression by Human

Dendritic Cells. Front Immunol 8:639. doi: 10.3389/fimmu.2017.00639.

Rodríguez, M., S. Márquez, J. V. de la Rosa, S. Alonso, A. Castrillo, M. Sánchez Crespo, y

N. Fernández. 2017. Fungal pattern receptors down-regulate the inflammatory

response by a cross-inhibitory mechanism independent of interleukin-10 production.

Immunology 150 (2):184-198. doi: 10.1111/imm.12678.

Rodríguez, M., S. Márquez, O. Montero, S. Alonso, J. G. Frade, M. S. Crespo, y N.

Fernández. 2016. Pharmacological inhibition of eicosanoids and platelet-activating

factor signaling impairs zymosan-induced release of IL-23 by dendritic cells. Biochem

Pharmacol 102:78-96. doi: 10.1016/j.bcp.2015.12.001.

*Artículos en los que están publicados la mayoría de los resultados presentados en

esta tesis.