tibbİ laboratuvarda bİyolojİk
TRANSCRIPT
TIBBİ LABORATUVARDA BİYOLOJİK VARYASYON VE UYGULAMALARI
Prof. Dr. Ergül Belge KurutaşSütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya AD, Kahramanmaraş
Dünyada hastalık tanılarının % 70’ten
fazlası, laboratuvar testleriyle
konulmaktadır.
Bu oran giderek daha da artıyor.
Laboratuvar testlerinin doğruluğu 3 ana faktörün etkisindedir.
Preanalitik Faktörler
Analitik Faktörler
Postanalitik Faktörler
Analitik ve Postanalitik hatalar kalite kontrol programları ve dikkatli çalışmalarla en aza
indirilebilmektedir.
Analitik
%7-13
Cihaz hatası
İnterferans
Pre Analitik
% 32 - 75
Uygunsuztaşıma
ve işlem
Hatalı
kimlik
Yanlış
örnek
Yetersiz
örnek
Örnek
durumu
Post Analitik
% 18 – 18.8
Raporlama
Hatalı veri girişi
Onaylama hatası
LABORATUVAR TESTLERİNDE VARYASYON KAYNAKLARI
Analitikvaryasyon
Pre-analitikvaryasyon
Kişilerarası varyasyon
Total-analitik varyasyon Biyolojik varyasyon
Total-gözlenenvaryasyon
Kişiselvaryasyon
Laboratuvar tıbbındaanalitlerin ölçümündegüvenilir sonuçlarverilebilmesi için biyolojikvaryasyonun hesabakatılması gerekmektedir.
Güvenilir sonuçlar eldeedebilmek için varyasyonaneden olan kaynaklar en azaindirilmelidir. Bu süreç,örneklerin doğal varyasyonuhariç, ilişkili tüm laboratuvarsüreçleri için mümkündür.
BİYOLOJİK VARYASYON
Laboratuvar verilerinde biyolojik varyasyon, bir bireyde her bir analitin homeostatik ayar noktasında izlenen rastgele dalgalanmaları olarak tanımlanır.
Biyolojik Varyasyon
Tüm laboratuvar ölçümleri zamanla değişir.
Analitlerin zamansal değişimleri hakkında
bilgi, tanıda ve yorumlamada önemlidir.
Zamansal değişim oranı prognozda yararlı
olabilir.
• Onaylanan değerler homeostatik ayar
noktası etrafında rasgele dalgalanmayı
gösterir.
• Daha genel model ardışık sonuçlar
arasındaki korelasyonu sağlar (zaman
aralıklarında ki biyolojik varyasyon).
BİYOLOJİK VARYASYON MODELLERİ
BİYOLOJİK VARYASYONUN PRATİKTEKİ ÖNEMİ
• Bu sonuçların önemi nedir?
• Uygun analitik metot başarılı mı (tutarsızlık,doğruluk)?
• Ne zaman tekrar ölçmek gerekir?
• Bu sonuç, zaman içinde önemli ölçüdedeğişir mi?
TIBBİ LABORATUVAR ÖLÇÜMLERİNDE VARYASYON KOMPONENTLERİ
Analitik Varyasyon (CVA )
Birey-içi Biyolojik Varyasyon (CVI)
Bireyler-arası Biyolojik varyasyon (CVG)
BİREY-İÇİ BİYOLOJİK VARYASYON
• Yaş, cinsiyet
• Diyet, fiziksel egzersiz
• Patolojik durum, tedavi
• Gün-içi varyasyon, mevsimsel varyasyon
• Homeostazis
BİREYLER-ARASI BİYOLOJİK VARYASYON
Kişiler arasında biyolojik sıvıların komponentlerin konsantrasyonlarındaki
farklılıklar.
BİYOLOJİK VARYASYON ÖLÇÜMÜ
Nasıl deney yaparsınız?
Denek sayısı kaç olmalı?
Toplanan örneklerin sayısı kaç olmalı?
Çalışmanın zaman ölçeği (Kısa , Uzun)
Analiz edilecek örneklerin analitik varyansı en aza düşürüldü mü?
Analiz edilen örneklerin verilerinde uç değerler var mı?
İstatistik yapıldı mı?
Analiz sonuçlarının uygulanması.
BİYOLOJİK VARYASYON ÖLÇÜMÜ
• Çalışılan birey sayısı ve örnek sayısı çokönemli olmamakla beraber, en az 10 bireyve 5 örnek ile çalışılması önerilmektedir.
Biyolojik Varyasyon Ölçümü
o Örnekler bir günden daha kısa aralıklarlaalınmamalıdır. Bu kısıtlamanın haricindeörneklemeler arasındaki süre istenilenaralıklarla yapılabilir (örneğin, örnekler hergün, haftada bir veya ayda bir alınabilir.
o Birçok bilgi küçük çalışmalardan eldeedilebilir.
Total varyasyon: pre-analitik varyasyon
(SDP) + analitik varyasyon (SDA) + kişisel
biyolojik varyasyon (SDI)
SDT2 = SDP
2 + SDA2 + SDI
2
SDT = (SDP2 + SDA
2 + SDI2)½
CVT = (CVP2 + CVA
2 + CVI2)½
CVT = (CVA2 + CVI
2)½
Varyasyonun Gaussian bir dağılımı vardır ve
değerler ± 1, ± 2 veya ± 3 SD aralığında
bulunabilir.
Ölçülen değer ± Z x (CVA2 + CVI
2)½
Z x (CVA2 + CVI
2)½
BİYOLOJİK DEĞİŞİMLERAnalit CVI 1 CVG 2 CVpre 3 CVtop4
Albumin 3.1 4.2 1.8 5.74ALP 6.4 24.8 3.4 2 6.03ALT 24.3 41.6 1.4 49.71AST 11.9 17.9 3.4 22.56Bilirubin 25.6 30.5 4.2 4 2.04BUN 12.3 18.3 22.8 9Kalsiyıum 1.9 2.8 1.6 3.86Kolesterol 6 15.2 1.2 16.66CK 22.8 40 1.4 47.45Klor 1.2 1.5 1.4 2.45Kreat inin 4.3 12.9 2.3 13.96GGT 13.8 41 2.3 43.87Glukoz 6.5 7.7 3.2 11.06Demir 26.5 23.2 2.4 37.71K 4.8 5.6 3.1 8.35LDH 6.6 14.7 3.4 16.80Mg 3.6 6.4 3.1 8.17Na 0.7 1 1.4 1.89Fosfor 8.5 9.4 2 13.52TProt 2.7 4 2 5.40Trigliserit 21 37.2 1.2 44.01ÜAsit 8.6 17.2 1.8 19.791 Birey içi biyolojik değişkenlik katsayısı2 Bireylerarası-biyolojik değişkenlik katsayısı3 Kaynaklardan elde edilen pre-analitik değişkenlik katsayısı4 CVpop
2 = CVpre2 + CVA
2 + CVI2 + CVG
2 (CVA<1/2 CVI)
HASTALIKTA VE SAĞLIKTA KREATİNİN
State of Health CVI Number of Subjects
Length of Studies (days)
Number Samples/Sub
Healthy Median? 4.3
CRF 5.3 17 21 8
Type 1 DM 5.9 27 56 8
Impaired renal function
6.9 9 2 11
Type 1 DM 6.5 11 56 8
Post renal transplant 11.5 41 90 8
Acute MI 13.4 20 4 19.5
CKD children 13.0 54 540 9
Within Subject Variation (CVI,%) for Serum Sodium and Urea
No. of Time Sex status Na+ Urea
subjects
11 0.5 h m H 0.6 2.2
11 8 h m H 0.5 6.0
62 1 d H 0.6 4.8
11 2 weeks m H 0.7 12.3
10 4 weeks m H 0.9 14.3
14 8 weeks F H 0.5 11.3
111 15 weeks m H 0.6 15.7
37 22 weeks m H 0.5 11.1
274 6 months - H 0.5 11.2
15 40 weeks - H 0.7 13.9
9 2 d - RF 0.8 6.5
15 6 weeks F HP 0.8 14.5
16 8 weeks m DM 0.8 13.0
ÖRNEKLERİN TOPLANMASI
• Şartlar pre-analitik değişkenleri en aza indirmek için olmalıdır.
• Sağlıklı bireyler olacak.
• Her zamanki yaşam biçimleri.
• Hiçbir ilaç almayacak (alkol, sigara?).
• Aynı kişi tarafından kan alınmalı.
• Günün aynı saatinde düzenli aralıklarda olmalı.
• Numunenin transportu, işlenmesi ve saklanması için protokol ayarlanmalı.
Tercih edilen protokol: Cotlove ark.
• Sağlıklı birey.
• Örnekler ayarlanan zaman aralıklarında alınır.
• Örnekler işlenmiş ve dondurulmuş olarak saklanır.
• BÜTÜN örnekler mevcuttur:
• Tek bir zaman periyodunda tüm numunelerin analizi yapılır.
• Eşzamanlı tekrarlı analiz gerçekleştirilir.
• Kalite kontrol örnekleri ile birlikte çalışılır.
• Avantajı: Analitik varyansı en aza düşürmek
• Dezavantajı:
1) Sınırlı sayıda hasta ve örnekler çalışabilir
2) Analit saklama şartlarında stabil olmalı
Diğer Protokoller: Costongs ve ark.
• Cotlove ark. gibi toplama ve saklama işlemi yapılır.
• Tek bir zaman periyodunda tüm örneklerin analizi yapılır.
• Analitik varyansı değerlendirmek için kalite kontrol veya hasta örneklerini deneylerini çift çalışma gerçekleştirilir.
• Numuneleri toplama gününde bir veya iki kez analiz yapılmalı
• Dezavatajı: total varyans ile birey-içi vayanskarıştırılabiliyor
• Avantajı: Eğer örnek unstabil ise kullanışlı
VERİ ANALİZİ
Uç değerlerin identifikasyonuCochran testi –uç değerler
Reed testi –uygun olmayan bireyler
Nested varyans analizi (ANOVA)
2 AŞAMADA
BİYOLOJİK VARYASYON VERİ UYGULAMALARI
• Analitik hedeflerin saptanması (I, B, TEa).
• Seri sonuçlarında değişikliğinin önemi değerlendirilmesi (RDD ya da CD).
• Referans aralıkların kullanımının değerlendirilmesi (II).
• Homeostatik ayar noktalarını belirlemek için gerekli örnek sayısının değerlendirilmesi (NHSP).
Biyolojik Varyasyon Veri Uygulamaları
• Rapor değerlendirme stratejileri
• En iyi örneğin seçilmesi
• Mevcut testlerin kullanılabirliğinin
karşılaştırılması.
ANALİTİK HEDEFLERİN AYARI
Tutarsızlık (imprecision) için kabul edilen analitik hedef
CVGoal = ½ CVI
bundan dolayı;
CVAnalytical = CVGoal
Başarıldığı taktirde bir bireyin analitik hedefi (CVAnalytical): ¼ CVI
(Harris. Am J Clin Pathol 1979:72;274)
ANALİTİK HEDEFLERİN KULLANIMI
• Yöntem ve ekipman değerlendirilmesi
• Yöntem geliştirmenin ilk aşamalarında ele
alınmalıdır.
• Kabul Edilebilir Analitik İndeks (Index of Ficudiality)
CVAnalytical /CVGoal = <1 olduğunda, analitik hedef karşılanmış olur.
(Fraser Clin Chem 1988:34;995)
Ardışık Sonuçlardaki Değişikliklerin Öneminin Değerlendirilmesi
• Seri ölçümlerde sonuçların farklı olabilmesi için sonuçların
nümerik farklılığının total varyasyondan büyük olması
gereklidir. Bu değere kritik fark (CD) veya referans değişim
değeri (RDD) denir.
RDD = 2½ * Z * (CVA2 + CVI2)½
Olasılık = % 95 Z = 1.96Olasılık = % 99 Z = 2.58
• Birey -içi varyans homojen olduğunda sadece geçerlidir.
(Costongs J Clin Chem Clin Biochem 1985;23:7-16)
REFERANS DEĞİŞİM DEĞERİ
• Laboratuvarların istenilen kalite değerlerineulaşabilmesi için kullanılan formül, özellikle CVI ‘yabağlı olduğundan RDD değeri bütün laboratuvarlariçin aynıdır.
• Bu durum, sağlık durumundaki değişiklikler için,analitlerin çoğunluğunun yüksek bireysellik (birey-içibiyolojik varyasyonun bireyler-arası biyolojikvaryasyondan daha düşük olması) göstermesindenötürü RDD kavramının popülasyona dayalı referansaralıklarından daha iyi bir yaklaşım olacağı anlamınagelmektedir
63 yaşında, erkek hasta
Serum kolesterol 254 mg/dL
1 ay sonra tekrarlandığında 223 mg/dL
Bu değişim anlamlı mı?
Yaşam tarzı değişiklikleri
Hastamızda Kolesterol 1: 254 mg/dL
Kolesterol 2: 223 mg/dL
Fark 31 mg/dL
Yüzde olarak ifade edersek (31/254) x 100= %12
Z = 1.96 (P<0.05 için) ve 2.58 (P<0.01 için)
CVA %1.6 ve CVI %6
(RDD)= 2 ½ x Z x (CVA2 + CVI
2)½
Z=1.96 için RDD %17.2
Z=2.58 için RDD %22.6
İKİ DEĞER BİRBİRİNDEN FARKLI
DEĞİL!
Popülasyona Dayalı Referans Değerlerin Kullanılabilirliğinin Değerlendirilmesi
Popülasyona dayalı referans değerler
bireysellik indeksi (index of individuality, II) ile
adlandırılmakta olup birey-içi biyolojik
varyasyonun bireyler-arası biyolojik
varyasyona oranı ile belirlenir
BİREYSELLİK İNDEKSİ
• Bireysellik indeksi, test sonuçlarının referans aralık ile karşılaştırılarak değerlendirilmesinin uygunluğu hakkında bilgi veren bir parametredir.
• İndeks sonucu küçüldükçe bireysellik artar. Eğer II <0.6 ise bireysellik yüksektir ve sonuçların mümkün olduğunca kişinin kendi eski sonuçlarına göre değerlendirilmesi uygundur.
• II >1.4 ise sonuçların referans değerlere göre ele alınması uygun kabul edilir.
Biological variation components in urine samplesof patients with T2DM or DN and healthy
individuals.
aCVA (%) bCVTI (%) cCVG (%) dI.I. eRCV (%)
T2DM patients
CAT 4.27 18.09 32.07 0.56 50.10
CuZnSOD 6.25 14.45 27.03 0.53 40.02
MDA 7.16 31.39 17.28 1.81 86.95
DN patients
CAT 3.56 15.14 29.67 0.51 41.93
CuZnSOD 5.22 8.61 24.02 0.35 23.84
MDA 8.23 25.40 16.25 1.56 70.35
Healthy Individuals
CAT 3.51 9.08 23.48 0.38 27.92
CuZnSOD 4.00 5.60 31.08 0.18 15.51
MDA 7.23 21.00 11.96 1.50 49.86
Components of biological variation and derived parameters for oxidative stress biomarkers and LDH
in mice.
Variables
aCVA
(%)
aCVI
(%)
bCVG (%) dRCV
(%)
eII (Categoryf)
G6PD (U/g Hb) 1.19 22.51 7.38 62.43 3.05 (High)
CAT (U/g Hb) 14.09 23.03 29.42 74.78 0.78 (intermediate)
SOD (U/g Hb) 6.18 11.12 21.14 35.23 0.52 (Low)
GST (U/g Hb) 9.13 12.00 12.58 41.76 0.95 (intermediate)
LDH (U/g Hb) 2.11 16.45 11.27 45.93 1.45 (intermediate)
GSH (µmol/g Hb) 4.12 23.40 11.20 65.81 2.08 (High)
MDA (nmol/g Hb) 4.75 9.03 31.55 28.26 0.28 (Low)
Adv Lab Med Int. 2014; 4(1): 9-16
Biological variations of Xanthine oxidase and
myeloperoxidase in sterile human urine
Meral Miraloglu, Ergul Belge Kurutas, Pınar Ciragil.
Abstract
The analytical, intra-individual and inter-individual variations were determined for
xanthine oxidase (XO) and myeloperoxidase (MPO) and the reference values were
established. A total of 380 apparently healthy people, 177 male and 203 female (from 20
to 82 years, average 40 years old), were randomly selected from villages and cities of the
southern part of Turkey. XO and MPO activities in human sterile urine samples were
measured by spectrophometric method. The distributions were Gaussian and no
significant difference was observed between the male and female subjects. The mean
value (standard deviation) of the population investigated for XO was 414.0 (93.3) U/L,
and for MPO 104.5 (49.2) U/L, respectively. The analytical, intra-individual and interindividual
variations were assessed in 20 apparently healthy subjects and were found to
be; XO: 6.2 %, 21.2%, and 19.2% MPO: 4.0%, 16.4%, 11.7% respectively. The results of
the index individuality showed that reference values of XO and MPO could be used for
diagnostic purposes in various diseases.
Key words: Sterile urine, xanthine oxidase, myeloperoxidase, biological variations
Adv Lab Med Int. 2014; 4(3): 64-72
Evaluation of reference values and biological variations for
neuron – specific enolase in sterile human urine
ergul belge kurutas, Meral Miraloglu.
Abstract
The analytical, intra-individual and inter-individual variations for neuron-specific enolase (NSE)
were determined and the reference values were established in sterile human urine. A total 400
apparently healthy people, 192 male and 208 female (from 25 to 63 years, average 44 years old),
were randomly selected from villages and cities of the southern part of Turkey. Reference values of
NSE were established from this population. Furhermore, biological variations of NSE were assessed
in 20 apparently healthy subjects for over thirty-day period. NSE activity in spot urines of all
individual were determined by ELISA method. The mean value (standard deviation) of the
population investigated for NSE was 0.496±0.136 ng/mg Cr. Furhermore, the analytical, intra-
individual and inter-individual variations were assessed in 20 apparently healthy subjects and were
found to be; NSE: 5.0 %, 20.2% and 14.2%. The results of the index individuality showed that
reference values of NSE could be used for diagnostic purposes in various diseases.
Key words: Sterile urine, neuron-specific enolase, biological variations
• Modeli anlamak ve uygulamak basittir
• Biyolojik varyasyon üzerine birçok veri vardır.
• Bireyin kendi içinde ve bireyler arasındaki biyolojik varyasyon hangi coğrafyada olursa olsun sabit.
• Modelin büyük oranda pratik ve eğitici değeri vardır.
İstenilen analitik kalite de birey içi ve bireyler arası
biyolojik varyasyon esas alınmalıdır. Çünkü; ;
SONUÇ
Biyolojik varyasyon verileri ile
Analitik kalite hedefleri belirlenebilir.
Seri ölçümlerdeki farkların anlamlılığı değerlendirilir (RDD).
Popülasyon tabanlı referans aralıklarının kullanılırlığıdeğerlendirilir.
Homeostatik karar noktasının belirlenmesi için gereken örneksayısı belirlenir.
Sonuçlarin en iyi raporlanma tarzı belrlenir.
En iyi örnek seçilir (en düşük değişkenliği olan).
Mevcut testler arası karşılaştırma yapılır.
Testlerin klinik kullanılırlığı değerlendirilir.