tim penyusun : soraya rahmanisa, m.sc dr. tiwuk...
TRANSCRIPT
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 1
MODUL BLOK ELEKTIF
BIOMOLEKULER
Tim Penyusun :
Soraya Rahmanisa, M.Sc
Dr. Tiwuk Susantiningsih, M.Biomed
FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS LAMPUNG
TAHUN 2017
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 2
PENDAHULUAN
Gambaran Umum Blok
Blok Elektif merupakan blok ke-21 yang akan dilaksanakan pada semester 7, tahun
ketiga. Blok ini berjalan selama 4 minggu dengan 3 minggu aktif dan satu minggu
ujian. Blok ini memiliki beban 4 SKS. Tujuan pembelajaran Blok 21 ini adalah untuk
mengantarkan mahasiswa sehingga mampu mengidentifikasi prinsip dasar,
penggunaan dan pengelolaan dalam bidang kesehatan internasional, patient safety,
manajemen bencana alam dan menguasai mekanisme molekuler yang mendasari
terjadinya berbagai penyakit/ masalah kesehatan terkait.
Ilmu Terkait
Biologi, Biokimia, Kimia Kedokteran, Fisika Kedokteran, Mikrobiologi, Patologi
Klinik, Patologi Anatomi, Farmakologi, ilmu Kedokteran Forensik.
Tujuan umum
Blok elektif merupakan blok yang menyediakan kompetensi tambahan untuk
diperdalami mahasiswa sesuai dengan peminatan mahasiswa.
Tujuan Khusus
Blok elektif ”Biologi Molekuler” ini mahasiswa diharapkan mampu memahami
mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya berbagai penyakit/ masalah
kesehatan terkait.
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 3
Pada blok ini mahasiswa diharapkan mampu :
1. Menjelaskan prinsip-prinsip hukum fisika dalam diagnostik molekuler.
2. Menjelaskan sifat kimia karbohidrat dan lipid dalam menunjang fungsi hidup
3. Menjelaskan struktur dan fungsi protein dalam melaksanakan fungsi hidup
4. Menjelaskan struktur dan peran asam nukleat dalam melaksanakan fungsi hidup
5. Menjelaskan mekanisme transfer informasi genetik, ekspresi gen, gene
rearrangement, gene therapy, serta kelainan-kelainan yang dapat terjadi
6. Menjelaskan mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya perubahan sifat-sifat
mikroorganisme di dalam tubuh
7. Menjelaskan mekanisme molekuler patogenesis infeksi mikroorganisme
8. Menjelaskan mekanisme keseimbangan onkogenesis dan apoptosis serta terapi
kanker
9. Dapat menjelaskan prinsip dan aplikasi berbagai teknik molekuler yang digunakan
dalam diagnosis, terapi, dan rekayasa genetika
Dasar Topik
1. Dasar Biologi Molekuler dan Aplikasinya dalam bidang kedokteran
2. Dasar – dasar dan aplikasi Stem Cell
3. Mikrobiologi molekuler
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 4
4. Rekayasa genetika
Strategi Pembelajaran
1. Kuliah
2. Diskusi kelompok
3. Presentasi
4. Critical appraisal
5. Reading
6. Independen learning
7. Problem based learning
8. Observasi
9. Learning project
10. Praktikum
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 5
KERANGKA TOPIK
Elektif Biomolekuler
peran biologi
molekuler dalam
dunia kedokteran
mekanisme molekuler
yang mendasari
perubahan sifat
dalam tubuh
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 6
KEGIATAN PEMBELAJARAN
A. Tutorial.
Diskusi tutorial pada blok Elektif Biomolekuler terdapat 3 skenario selama 3
minggu. Setiap skenario terdiri dari 2 kali pertemuan, step 1-5 dan step 7. Step 6
belajar secara mandiri untuk mencari jawaban learning objektif pada skenario.
B. Kuliah.
Selama blok ini berjalan akan dilakukan beberapa kali tatap muka dengan para
narasumber dalam bentuk kuliah. Kuliah yang diberikan akan disesuaikan dengan
modul masing-masing tiap minggunya. Fungsi dari kuliah adalah untuk
penstrukturan materi, penjelasan subjek yang dirasa sulit, diskusi materi yang tidak
tercover dalam tutorial, memberikan pandangan multidisiplin ilmu dan
mengintegrasikan pengetahuan.
C. Praktikum.
Praktikum merupakan penunjang teori-teori yang didapat mahasiswa.. Topik
praktikum menyesuaikan dengan tema pembelajaran yang diberikan. Peraturan
mengenai pelaksanaan praktikum laboratorium diserahkan ke bagian masing-
masing cabang ilmu. Kehadiran praktikum harus 100%.
D. Pleno.
Pleno akan diadakan pada minggu ke . Setiap topik dalam tutorial akan ditampilkan
dalam pleno oleh 2-3 kelompok yang ditunjuk. Pleno bertujuan untuk menyamakan
persepsi mahasiswa tentang Learning Objective pada skenario. Dihadiri oleh
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 7
pengampu setiap mata kuliah/pakar. Mahasiswa dapat langsung bertanya kepada
pakarnya mengenai hal yang diragukan atau yang belum mengerti.
E. Belajar Mandiri
Mahasiswa belajar mandiri berdasarkan tujuan blok dan tujuan skenario, namun
dapat dikembangkan berdasarkan referensi yang direkomendasikan atau sumber -
sumber yang diperoleh dari internet. Belajar mandiri merupakan inti dari kurikulum
berbasis kompetensi.
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 8
Daftar Pustaka
1. Watson et al 2008, Molecular Biology of the Gene, McGRawhill Book Company.
2. Lehninger, A.L. 2004. Dasar-Dasar Biokimia jilid 1,2 dan 3 (penj. Maggy Thenawidjaja Erlangga, Jakarta
3. McKee, T. 2003. Physiological Chemistry Ed. McGraw - Hill, Inc
4. Peter Snustad &MichaelJ. Cimmons .2007. Principles of Genetic. 3 rd ed.
5. Albert B, et al. 2008. Molecular Biology of the Cell,5th ed ,McGrawHill Book Company
6. Nussbaum et al 2001. Genetic Medicine. 6th ed.
7. P Gardner EJ, Simmons MJ, and Snustad D, 1991. Genetic control of immune response, in Principles of Genetics, John Willey & Sons Inc New York 8. PR Murray, KS Rosenthal, MA.2005. Medical Microbiology, 5th ed. Pfaller Elsevier Mosby 9. Jawetz, Melnick and Adelbergg”s .2007.Medical Microbiology, ed 24 GE Brooks,JS Butel,SA Morse Appleton and Lange, California. 10. C.Mims et.al . 1995. Mim’sPathogenesis of Infectious Diseases. Ed 4, Academic Press Inc,San Diego 11. Talaro KP, 2008, Foundations in Microbiology,ed 6 McGraw Hill International Edition 12 . C E Underwood .2004.General and Systematic Pathology. Ed 4 J Churchill Livingstone,Toronto 13. Robert F. Mueller, Ian D Young. 2003. Emery’s Elements of Medical Genetics.
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 9
Churchill Livingstone 14. Benyamin E, Sunshine G, Leskowtz S, 2005. Immunology A Short Course 5’ ed John Wiley, New York 15. Butler JM Amsterdarm.2005. Forensic DNA typing Second ed,Elsevier Ac.Press 16. Goodman & Gilnmans.2005. The Pharmacological basis of Therapeutic. 11th ed McGraw-Hill, NewYork 17. Pringgoutomo, S.,Himawan,S., Tjarta .,A..2008. Buku Ajar Patologi. Sagung Seto.
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 10
KERANGKA PENILAIAN
Nilai akhir blok basic science 1 terdiri atas komponen-komponen sebagai berikut:
1. Tutorial : 5 %
2. Praktikum : 20 %
3. UTB : 20 %
4. Ujian Akhir blok : 35 %
5. Project biomol : 20 %
A. Tutorial
Penilaian tutorial terdiri atas interaksi verbal mahasiswa selama tutorial. Dinilai menurut
keaktifannya (sharing, ide, konsentrasi, argumentasi, dominasi, perilaku/kesopanan/ attitude,
disiplin. Mahasiswa wajib mengikuti tutorial 100%. Komponen penilaian tutorial juga memasukkan
penilaian dari laporan tertulis belajar mandiri terbimbing.
B. Praktikum
Penilaian diberikan dengan memberikan ujian praktikum pada akhir blok. Dengan menilai afektif,
kognitif, dan keterampilan psikomotor di laboratorium. Instruktur akan memberikan pre test atau
post test dan tugas.
C. SOCA (Student Oral Case Analysis)
SOCA adalah salah satu bentuk ujian lisan untuk menguji kemampuan kognitif dan afektif, meliputi
ilmu kedokteran dasar dan kasus klinis terutama level kompetensi 4. Blok ini metode yang
digunakan adalah skenario yang mengacu pada modul blok Basic Science 1.
D. Ujian Akhir Blok
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 11
Ujian akhir blok dilaksanakan pada minggu ke 7 pada akhir blok. Jumlah soal ujian adalah 150 butir
dengan 1 hari ujian. Nilai ujian blok 50% dari nilai keseluruhan. Syarat mengikuti ujian blok adalah
kehadiran kuliah minimal 80%.
E. Nilai Akhir Blok
Nilai akhir blok berupa huruf mutu dengan ketentuan sebagai berikut (sesuai dengan peraturan
akademik Unila):
Huruf Mutu Bobot Skore Nilai
A 4 > 76
B+ 3,5 71- <76
B 3 66 - <71
C+ 2,5 61 - <66
C 2 56 - <61
D 1 50 -<56
E 0 <50
Namun jika rerata nilai kelas < 66 akan dilakukan penilaian berdasarkan perhitungan standar deviasi
dan penentuan rentang nilai juga berdasarkan rentang deviasi.
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 12
BLUE PRINT ASSESMENT
No. Tujuan DM LV BB JML MTD Bidang ilmu
1 2 3 4 5 6
Menjelaskan
tentang dasar
dasar biologi
molekuler
Menjelaskan
aspek fisika
dalam biologi
molekuler
Menjelaskan sifat
kimia lipid,
karbohidrat dan
metabolismenya
Menjelaskan
peran protein
dalam
melaksanakan
fungsi hidup
Menjelaskan
struktur dan peran
asam nukleat
dalam
menjalankan
fungsi hidup
Menjelaskan
teknik molekuler
dalam diagnosis,
terapi ,
kedokteran
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 13
forensik, dan
rekayasa genetik
7 8 9 10 11
Menjelaskan jenis
jenis stem cell
Menjelaskan
secara umum
tentang
kemampuan
diferensiasi sel
Stem Cell
Menjelaskan
peran stem cell
dalam terapi
penyakit
degenarif, infeksi
dan kanker
Menjelaskan
mekanisme kerja
stem cell pada
penyakit
degenarif, infeksi
dan kanker
Menjelaskan
secara umum
bagaimana
memilah stem cell
yang diinginkan
12
Menjelaskan jenis jenis reaksi PCR
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 14
13 14 15 16 17 18 19
Menjelaskan Peran/manfaat PCR dalam bidang biologi molekuler dan kesehatan
Menjelaskan macam-macam metode ekstraksi/ isolasi DNA
Menjelaskan/memahami macam-macam metode ekstraksi/ isolasi RNA
Menjelaskan isolasi RNA dari jaringan, serum/darah dan DNA
Menjelaskan bagaimana membuat cDNA dari RNA
Menjelaskan tentang miRNA dan perannya dalam terapi kanker
Menjelaskan cara isolasi miRNA
Keterangan :
DM = Domain LVL = Level
MTD = Metode BB = Bobot
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 15
JML = Jumlah
Menurut taksonomi Bloom, kompetensi yang harus dicapai :
C1 = hanya sebatas tahu, mengingat/menghafal
C2 = pemahaman, terjemah dan menyimpulkan
C3 = aplikasi, penerapan, menggunakan konsep, prinsip, prosedur untuk
memecahkan masalah
C4 = analisa, memecah konsep menjadi bagian-bagian, mencari hubungan antara
bagian
C5 = sintesis, diagnosis, menggabungkan bagian-bagian menjadi satu
C6 = evaluasi, membandingkan nilai-nilai, ide-ide, metode dengan standar SOP
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 16
MODUL PEMBELAJARAN
Tujuan pembelajaran blok Elektif ini akan dicapai melalui 3 modul. Masing-
masing modul akan dilaksanakan selama 1 minggu. Tujuan pembelajaran tersebut
diharapkan dapat dicapai melalui kuliah, tutorial, praktikum, dan belajar mandiri.
MODUL I.
A. Tujuan Pembelajaran :
1. Menjelaskan tentang dasar dasar biologi molekuler
2. Menjelaskan aspek fisika dalam biologi molekuler
3. Menjelaskan sifat kimia lipid, karbohidrat dan metabolismenya
4. Menjelaskan peran protein dalam melaksanakan fungsi hidup
5. Menjelaskan struktur dan peran asam nukleat dalam menjalankan fungsi hidup
6. Menjelaskan teknik molekuler dalam diagnosis, terapi , kedokteran forensik,
dan rekayasa genetik
B. Kuliah & Praktikum
No Topik Kegiatan Fasilitator
1 Pengantar Modul Biologi
molekuler
Kuliah PJ BLOK
2 Nutrigenomik
Kuliah (Gizi) dr. Dian Isti A, MPH
3 Sifat kimia lipid,
karbohidrat dan
metabolismenya
Kuliah PJ BLOK
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 17
4 Overview Peran protein
dalam melaksanakan fungsi
hidup
Kuliah, dr. Evi K, M.Sc.
5 Struktur dan peran asam
nukleat dalam
menjalankan fungsi hidup
Kuliah dr. Syazili Mustofa, M.Biomed
6 Teknik molekuler dalam
diagnosis, terapi
dan kedokteran forensik,
dan rekayasa
genetik.
Kuliah Pakar
(Forensik)
dr. Galih , SpF (2 x 50’)
C. Tutorial
Skenario 1
Skenario Pemicu :
Jasad seorang wanita ditemukan dalam sebuah koper dalam keadaan sudah rusak dan
tidak dapat dikenali, diperkirakan wanita tersebut tewas dibunuh 3 hari yang lalu.
Polisi lalu memeriksa dan mengidentifikasi jasad wanita tersebut melalui pemeriksaan,
odontologi dan DNA. Untuk membantu identifikasi korban, polisi meminta sampel
darah keluarga korban.
Pertanyaan Minimal :
1. Jelaskan metode identifikasi jasad/korban pada skenario di atas !
2. Jelaskan metode yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi kasus jasad korban di atas !
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 18
MODUL II. STEM CELL
A. Tujuan Pembelajaran :
1. Menjelaskan jenis jenis stem cell
2. Menjelaskan secara umum tentang kemampuan diferensiasi sel Stem Cell
3. Menjelaskan peran stem cell dalam terapi penyakit degenarif, infeksi dan
kanker
4. Menjelaskan mekanisme kerja stem cell pada penyakit degenarif, infeksi dan
kanker
5. Menjelaskan secara umum bagaimana memilah stem cell yang diinginkan
B. Kuliah
No Topik Kegiatan Fasilitator
1 Dasar – dasar dan aplikasi stem
cell Kuliah DR. dr. Asep Sukohar, M.Kes
2 Mekanisme transfer informasi
10orensi,
ekspresi gen, gene
rearrangement, serta
kelainan-kelainan yang dapat
terjadi
Kuliah
3 Mikrobiologi molekuler
Kuliah Dr. Ety A. M.Biomed
4 Mekanisme molekuler
patogenesis infeksi
Kuliah DR. dr. Jhons FS, M.Kes
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 19
5 Mekanisme onkogenesis
Kuliah dr. Rizki Hanriko, Sp.PA/
DR .dr.Muhartono, S.Ked, ,
M.Kes, Sp.PA
C. Tutorial
MODUL III
A. Tujuan Pembelajaran :
1. Menjelaskan jenis jenis reaksi PCR
2. Menjelaskan Peran/manfaat PCR dalam bidang biologi molekuler dan kesehatan
3. Menjelaskan macam-macam metode ekstraksi/ isolasi DNA
4. Menjelaskan/memahami macam-macam metode ekstraksi/ isolasi RNA
5. Menjelaskan isolasi RNA dari jaringan, serum/darah dan DNA
6. Menjelaskan bagaimana membuat cDNA dari RNA
7. Menjelaskan tentang miRNA dan perannya dalam terapi kanker
8. Menjelaskan cara isolasi miRNA
B. Kuliah
No Topik Kegiatan Fasilitator
1 Farmakovigilance dan Farmakogenetik (Interaksi obat – senyawa biomolekuler)
Kuliah dr.Dwi Indria A, M.Sc.SpKK/
dr. Novita Carolia, M.Sc
2 Kapita Selekta (Dr.Asep) Kuliah Dr.dr. Asep Sukohar, M.Kes
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 20
3 Regulasi ekspresi gen pada
eukariot, prokariot, dan virus
Kuliah Dr. Evi K. M.Sc
4 Resistensi mikroorganisme
terhadap antibiotik, antivirus,
dan antijamur
Kuliah Dr.Ety A.M.Biomed
5 Cell Cycle dan apopotosis Kuliah
Pakar
Dr. dr. Susianti, M.Sc.
C. Tutorial
JADWAL PEMBELAJARAN
JAM Minggu 1.
SENIN
SELASA
RABU
KAMIS
JUMAT
07.00 - 07.50
07.50 - 08.40 Kontrak
Blok
08.40 - 09.30
09.30 - 10.20
10.20 - 11.10 Tutorial 1 Tutorial 1
11.10 - 12.00
12.00 - 13.00 ISHOMA
13.00 - 13.50 CSL Sem I
Prakt. Histologi : Jaringan
Dasar
CSL Sem I
13.50 - 14.40
13.50 - 14.40
14.40 - 15.30
15.30 - 16.20
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 21
JAM Minggu II. DASAR BIOLOGI MOLEKULER SENIN
22/10/2012 SELASA
23/10/2012 RABU
24/10/2012 KAMIS
25/10/2012 JUMAT
26/10/2012 07.00 - 07.50
07.50 - 08.40
08.40 - 09.30
09.30 - 10.20
10.20 - 11.10 Tutorial 2 Tutorial 2
11.10 - 12.00 12.00 - 13.00 ISHOMA
13.00 - 13.50
13.50 - 14.40
13.50 - 14.40
14.40 - 15.30
15.30 - 16.20
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 22
JAM Minggu III. APLIKASI BIOLOGI MOLEKULER SENIN
29/10/2012 SELASA
30/10/2012 RABU
31/10/2012 KAMIS
1/11/2012 JUMAT 2/11/2012
07.00 - 07.50
07.50 - 08.40 Kuliah : Penelusuran
Gen
08.40 - 09.30 Kuliah : Dasar terapi
penyakit secara
molekuler
Kuliah Biomed : Pengantar
Bioinformatika
09.30 - 10.20
10.20 - 11.10 Tutorial 3 Tutorial 3
11.10 - 12.00 12.00 - 13.00 ISHOMA
13.00 - 13.50 Kuliah Biologi Medik :
Teknologi rekombinan
DNA dan terapi gen
CSL Sem I CSL Sem I
13.50 - 14.40
13.50 - 14.40
14.40 - 15.30
15.30 - 16.20
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 23
JAM Minggu IV
SENIN 19/11/2012
SELASA 20/11/2012
RABU 21/11/2012
KAMIS 22/11/2012
JUMAT 23/11/2012
07.00 - 07.50
07.50 - 08.40
08.40 - 09.30
09.30 - 10.20
10.20 - 11.10
11.10 - 12.00 12.00 - 13.00 ISHOMA
13.00 - 13.50
13.50 - 14.40
13.50 - 14.40
14.40 - 15.30
15.30 - 16.20
Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler
Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 24