tipos de intrones gu-ag au-ac grupo i grupo ii grupo iii intrones gemelos pre-trna arqueales...
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Tipos De intrones
• GU-AG• AU-AC• Grupo I• Grupo II• Grupo III• Intrones
gemelos• pre-tRNA• Arqueales
• pre-mRNA nuclear eucariote• pre-mRNA nuclear eucariote• pre-rRNA nuclear eucariote• RNAs de organelos• RNAs de organelos• RNAs de organelos
• pre-tRNA nuclear eucariote• varios RNAs
Problema: Definición de los sitios de splicing
Solución: Secuencias consenso del mRNA en la fronterasentre exón/intrón. Acción de snRNA medianteel apareamiento Watson Crick a sitios crucialesdel mRNA. Complejos RNA-proteína (snRNP´s).
Ocurrencia: Co-transcripcional. Pol II CTD recluta los factores de splicing.
Factores: 5 snRNA: U1 (165 nts), U2 (185), U4 (145), U5 (106), U6 (116).100 proteínas (organizadas como U1 snRNP, U2 snRNP, etc.). Abundancia 2.5 105 – 1 x 106
Catálisis: Transesterificación del RNA
Tres problemas topológicos
• ¿Cómo identificar sitios de splicing distantes varias kb entre ellos?
• ¿Cómo identificar los sitios de splicing correctos sin saltarse alguno?
• ¿Cómo evitar la utilización de sitios crípticos ó espurios?
¿Cuáles son los puntos de regulación
del splicing?
Complejo de definición del exón
¿Se remueven los intrones en algún orden específico?
Procesamiento de un exón extra-largo
Intrones del grupo I Intrones del grupo II (III)
tamaño 400-3000 bases 400-2500 bases
ocurrencia ampliamente distribuidos en mitocondrias de hongos y plantas, en virus, cloropastos y rRNA nuclear en eucariotes simples
raros, algunos mRNA en mitocondrias y cloroplastos de hongos y plantas
nucleófilo GTP-3´OH, Ex-3´OH pAp-2´OH, Ex-3´OH
tipo de reacción doble transesterificación doble transesterificación
ORFs endonucleasas, madurasas
endonucleasas, transcriptasa reversa
función biológica movilidad del intrón movilidad del intrón
Resumen: procesamiento de intrones de los grupos I y II
Intron del grupo IIIntron del grupo I
¿Cómo Se Especifican Los Sitios Del Autoprocesamiento?
intrón del rRNA de Tetrahymena
Procesamiento por corte especifico - RNAs no codificantes
Procesamiento por modificación química de pre r-RNAs y pre t-RNAs
Un pre rRNA humano sufre 106 metilaciones y 95 pseudouridilaciones de manera específica y con un patrón
extremadamente conservado
Edicion de RNAs
¿Que sucede cuando hay intrones múltiples
en un gene?
Ejemplos de splicing alternativo
Transporte del mRNA procesado
Factores de especificidad para el procesamiento y la poliadenilación
Histonas 100/minOtras proteínas 100/minProteínas ribosomales 150/min
Subunidades ribosomales 5/minmRNA 1/min
Control de la estabilidad del RNA y su degradación
Señales que identifican al mRNA procesado
(a)
(b)
Remoción de señales durante la primera ronda de traducción de un mensajero silvestre
Circularización del mRNA después de la primera ronda de traducción
Activación de los factores de liberación por codones de terminación prematuros
La formación de complejos de RF, SC y marcadores del sitio de procesamiento activan a la enzima que
remueve el cap