tl tin sinh học.hang_phuong

Upload: nguyen-nguyenhang

Post on 07-Apr-2018

228 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    1/22

    BI TP LN

    DCH V ENTREZ/TUTOR CA

    NCBI

    SINH VIN: NGUYN NGUYN HNGNG TH THU PHNG

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    2/22

    Entrez l dch v qun l v lin kt thng tin ca c sd liu NCBI

    Dch v ny m nhim vai tr kt ni lin thng gia cc

    mng thnh mt tng th

    tm kim nhanh v d dng

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    3/22

    Giao din trang ch ca dch v Entrez:

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    4/22

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    5/22

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    6/22

    Giao din ca dch v: Entrez/tutor

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    7/22

    Cc ng dng ca c s d liu

    Entrez/tutorialNhn dng mt c trng,c im trnh t mRNA

    trong hng t chui nm trong ngn hng d liu

    nucleotide ca Entrez.

    Ly c nhng thng tin lin quan v ghi chp vmt protein

    Nhn dng nhng vng bo th ca protein

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    8/22

    Nhn dng nhng t bin trong gen hoc protein

    Tm cu trc 3 chiu ca protein hoc s vng mt can; nhn bit cu trc ca cc chui tng ng

    Xem xt biu hin gen v download nhng vng trnht cn xc nh

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    9/22

    Giao din ca Entrez Help

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    10/22

    Nguyn tc khi tm kim trong Help s s dng cc tiliu thnh phn ca Entrez c bit nh l PubMed, sdng ng link ti PubMed Help

    Vic tm kim trong Entrez Help c thc hin bngcch g t kha; c th tm trong tp sch ang tm, trongtt c cc quyn sch, trong c s PubMed, hay trong ttc cc trang Help ca NCBI (tick vo c s d liu bn

    mun tm)

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    11/22

    Giao din ca Entrez Databaes

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    12/22

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    13/22

    C th g trc tip t kha vo ca s tmkim hoc s dng nhng ng link di

    Tm kim bn gc v nhng sa chac cp nht.D liu bao gm Nucleotide v trnh t,

    cu trc protein, b gen c gii trnht, phn loi v cc lnh vc khc

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    14/22

    V d s dng ng link:

    Khi di chuy n chu t t i m c c n tm ki m, s

    xu t hi n ng link t i cc m c lin quan

    Kch chu t vo ph n

    b n quan tm

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    15/22

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    16/22

    Kt qu tm kim:

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    17/22

    Giao din ca Batch Entrez

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    18/22

    S dng Batch Entrez ti mt file ca Gls hoc bxung d liu v Nucleotide hoc Protein; hoc ti ln mtdanh sch bn ghi tng t t c s d liu khc ca

    Entrez

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    19/22

    Giao din ca Entrez Utilitise

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    20/22

    Entrez Utilitise l cng c cung cp phng tin ncc c s d liu bn ngoi Entrez trn giao din cu hica cc trang Web hp thc khc; v c th gip cho vicly ra kt qu tm kim s dng trong tng lai trong mtmi trng khc

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    21/22

    Giao din ca LinkOut

  • 8/3/2019 TL tin sinh hc.Hang_Phuong

    22/22

    LinkOut l mt dch v ca Entrez, cho php truy cp t

    PubMed v bt c c s d liu Entrez ti mt phm vim rng thng tin v dch v vt qua ngoi gii hnEntrez

    Ch p dng cho mt h s d liu c trng, c th

    Thng qua cc ng link lm thun tin tip cn cc

    ngun d liu m rng, d hiu, b xung c tm thybng Entrez