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Evolução do Melhoramento Genético
1º Leilão com DEPs-AG (Faz. Camparino/Zoetis) – Agosto 2012
1º Sumário com DEPs-AG (ANCP/Zoetis) – Agosto 2011
DEP Genômica
Marcador Molecular
DEPs
Parentesco
Fenótipo
Marcadores de DNA
Alterações na sequência de DNA dos
animais que podem resultar em
diferenças no seu desempenho.
Marcadores de DNA
A A A A A C A A A A
A A A A A C G A A A
SNPPolimorfismo de Nucleotídeo Único
MVP = somatória do efeito total dos marcadores para cada característica
O que é o MVP?Predição do Valor Molecular
Confiabilidade
• Correlação do valor genético e o MVP
• O quanto podemos confiar no painel
• Depende da base de descoberta
– Número de animais
– Densidade do painel
– Acurácia da DEP utilizada na pesquisa
Como foi Desenvolvido?
• Chip da Illumina®
• 763 touros de alta acurácia foram genotipados no 770k
• O restante dos animais foram genotipados no 50k
• Participação das fazendas: Carlos Viacava, Colonial Agropecuária, Fazenda Jandaia, Fazenda Camparino, Rancho da Matinha, Rebanho BRGN da EMBRAPA Cerrados e Universidade Federal de Uberlândia.
Produto Comercial
• Chip da Illumina®
• Mais de 12 mil marcadores de DNA
• Imputação para o 50k
• Maior confiabilidade
MVP Accuracies with 6K imputed vs. 50K,770KTrait
Cor(50K vs 6Kto50KImp)
Cor(770K vs 6Kto770KImp)
Cor(770K vs 6Kto50Kto770K)
AFC 0.98 0.96 0.98
CAP 0.97 0.95 0.97
GL 0.97 0.96 0.97
HPR 0.98 0.97 0.98
MA120 0.97 0.96 0.97
MA210 0.97 0.95 0.97
SC365 0.97 0.96 0.97
SC450 0.97 0.95 0.97
STAY 0.97 0.94 0.97
WT120 0.98 0.96 0.98
WT210 0.98 0.96 0.98
WT365 0.98 0.94 0.96
WT450 0.96 0.93 0.96
BCW 0.93 0.89 0.92
BCY 0.93 0.89 0.93
MW 0.91 0.88 0.91
MY 0.93 0.90 0.93
PW 0.94 0.91 0.94
PY 0.94 0.91 0.93
HEIGHT 0.98 0.97 0.98
FAT 0.97 0.95 0.97
REA 0.98 0.96 0.98
AVG 0.96 0.94 0.96
10
CaracterísticasCaracterística Unidade
Idade ao Primeiro Parto meses
Probabilidade de Parto Precoce %
Stayability %
Produtividade Acumulada kg/ano
Habilidade Materna aos 120 Dias kg
Perímetro Escrotal aos 365 Dias cm
Perímetro Escrotal aos 450 Dias cm
Peso aos 120 Dias kg
Peso aos 365 Dias kg
Peso aos 450 Dias kg
Área de Olho de Lombo cm2
Espessura de Gordura mm
Características NovasCaracterística Unidade
Período de Gestação dias
Habilidade Materna aos 210 Dias Kg
Peso aos 210 Dias Kg
Estrutura a Desmama escore
Musculosidade a Desmama escore
Precocidade a Desmama escore
Estrutura ao Sobreano escore
Musculosidade ao Sobreano escore
Precocidade ao Sobreano escore
Altura cm
Índice Reprodutivo
Característica Ponderação
(%)
Idade ao Primeiro Parto 13
Probabilidade de Parto Precoce 16
Stayability 34
Produtividade Acumulada 11
Habilidade Materna aos 120 Dias 7
Peso aos 210 Dias 9
Peso aos 365 Dias 10
Índice de Desempenho
Característica Ponderação (%)
Idade ao Primeiro Parto 13
Produtividade Acumulada 11
Perímetro Escrotal aos 365 Dias 10
Peso aos 210 Dias 19
Peso aos 365 Dias 19
Peso aos 450 Dias 19
Área de Olho de Lombo 4
Espessura de Gordura 5
ConfiabilidadeCaracterística Confiabilidade Característica Confiabilidade
Idade ao Primeiro Parto 0.74 Peso aos 365 Dias 0.70
Probabilidade de Parto Precoce 0.75 Peso aos 450 Dias 0.63
Período de Gestação 0.64 Estrutura a desmama 0.42
Stayability 0.69 Musculosidade a desmama 0.54
Produtividade Acumulada 0.62 Precocidade a desmama 0.6
Habilidade Materna aos 120 Dias 0.65 Estrutura ao Sobreano 0.46
Habilidade Materna aos 210 Dias 0.67 Musculosidade ao Sobreano 0.60
Perímetro Escrotal aos 365 Dias 0.67 Precocidade ao Sobreano 0.56
Perímetro Escrotal aos 450 Dias 0.66 Altura 0.73
Peso aos 120 Dias 0.75 Área de Olho de Lombo 0.59
Peso aos 210 Dias 0.74 Espessura de Gordura 0.44
DEP Genômica
Avaliação Genética Tradicional
Pedigree Fenótipo Progênies
DEP
+ +
Adaptado do 17o Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores – Incorporação de marcadores de DNA na Avaliação Genética
Parceria com ANCP
Pedigree Fenótipo Progênies
DEP GenômicaAdaptado do 17o Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores – Incorporação de marcadores de DNA na Avaliação Genética
+++
Aumento de Acurácia
Exemplo
Tradicional Acurácia Molecular Acurácia
DIPP -0,81 0,16 -1,12 0,56
DPE365 0,28 0,17 0,36 0,64
NANA 2986
03/12/2011
Exemplo
Tradicional Acurácia Molecular Acurácia
DIPP -1,47 0,21 -2,27 0,56
DPE365 0,59 0,21 0,72 0,65
COL A7149
25/10/2007
Exemplo
Tradicional Acurácia Molecular Acurácia
DIPP -1,73 0,55 -2,60 0,66
DPE365 0,83 0,73 1,00 0,78
COL A 360
09/11/1999
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