universidad interamericana de pr recinto de bayamón bioquimica: chem 4220 introducción a la...

60
Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto Ramirez Vivoni, Ph.D. Requisitos: Química Orgánica II (2222) y Química Analítica (3320)

Upload: magdalena-blanco-sanchez

Post on 25-Jan-2016

225 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Universidad Interamericana de PRRecinto de Bayamón

Bioquimica: CHEM 4220

Introducción a la Bioquímica

Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D.J. Roberto Ramirez Vivoni, Ph.D.

Requisitos: Química Orgánica II (2222) y Química Analítica (3320)

Page 2: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

¿Qué es bioquímica?

• ¿Cuál es una de las fuerzas que impulsa el desarrollo de la bioquímica?

El origen de la vida

Page 3: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

¿Cuál es el origen de la vida?

• Creada por uno o varios dioses• Siempre existió, solo se recicla• Generación espontánea• Un experimento de unos extraterrestres• Virus de otro planeta que llegó en un

meteorito

Page 4: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Integración de teorías

• Física clásica

• Evolución

Page 5: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Experimento Urey-Miller (1952)

Page 6: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Hipótesis de trabajo científica sobre el origen de la vida

Moléculas orgánicas se rearreglan, de acuerdo a condiciones del medio ambiente, en niveles de organización cada vez más complejos.

Page 7: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 8: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

| Section

Chapter |Periodic Trends: Atomic Size

8

• Periodicity of the Elements • 1• 4

Increasing atomic size

Incre

asin

g a

tom

ic size

Page 9: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

| Section

Chapter |Periodic Trends: Electronegativity

9

• Periodicity of the Elements • 1• 4

Increasing electronegativity

Incr

easi

ng

ele

ctro

negati

vit

y

Page 10: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

| Section

Chapter |Polaridad

Page 11: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 12: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 13: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 14: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 15: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 16: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Dipolo instantáneo

Page 17: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 18: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto
Page 19: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

PreguntasIdentifique el tipo de enlace (o enlaces) entre los

siguientes pares de átomos o moléculas:a)NaCl b) H2O c) H2O y H2O d) NH3 y H2O

Prediga cuál de los siguientes compuestos es soluble en agua:

a)CH3CH2OH b) CH3(CH2)10CH2OH

c) CH3CH2COOH

Page 20: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Grupos funcionales comunes

Page 21: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Dibuje las estructuras de los siguientes compuestos:

a) C2H4O2 (un ácido)

b) H2O2

c) H3PO4 (ácido fosfórico)

d) CH4N2O (una amida)

e) C3H4N2 (anillo aromático de 5 átomos)

Page 22: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Reacciones orgánicas

Page 23: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Reacciones orgánicas

Page 24: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Reacciones orgánicas

Page 25: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Reacciones orgánicas

Page 26: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Reacciones de compuestos orgánicos

• Sustitución : nucleofílica y electrofílica• Adición a enlaces dobles• Eliminación: E1 y E2• Oxidación-reducción• Acido/base

Page 27: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Adición

Page 28: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Eliminación

Page 29: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Sustitución

Page 30: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Rearreglo

Page 31: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Oxidación-reducción

Oxidación• Aumento en el número

de oxidación• Pérdida de electrones• Ganancia de oxígeno• Pérdida de hidrógenos

Agente oxidante: Causa la oxidación de otro compuesto

Reducción• Disminución del

número de oxidación• Ganancia de electrones• Pérdida de oxígeno• Ganancia de hidrógenos

Agente reductor: Causa la reducción de otro compuesto

Page 32: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Oxidación/reducción

Page 33: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Reacciones orgánicas ácido/base

Acidos y bases Bronseatd-Lowrey:•Acidos: donan protones (H+)•Bases: reciben protones (H+)

Ejemplo: HA + H2O ↔ H3O+ + A-

Par de ácido/base conjugado: HA/A-

Page 34: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Preguntas

Escriba la estructura del ácido conjugado de las siguientes bases:

a)OH- b) HCO3- c) H3NCH2COO-

d) CH3COO- e) H2PO4-

Escriba la estructura de la base conjugada de los siguientes ácidos:

a)H2O b) H3NCH2COOH c) CH3(CH2)10COOH

d) HCO3- e)NH3CH2(CH2)10CH2NH3

Page 35: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Isomería

• Estructural (constitucional)• Optica• Estereoisómeos:

– Conformacional– Enantiómeros– Diaestereoisómeros– Cis/trans

Page 36: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Isomería estructural

Page 37: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Isomería óptica

Ej: (+)-ácido láctico, (-)-ácido láctico

Page 38: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Isómeros conformacionales

Page 39: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Conformación de anillos

Page 40: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Imagen espejo: enantiómeros

Configuración: R S

Page 41: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Configuración L / D

CHO

CH2OH

HHO

CHO

CH2OH

OHH

D-Gliceraldehído L-Gliceraldehído

Page 42: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Diaestereoisómeros

Page 43: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Enlaces dobles cis/trans

Page 44: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Anillos cis/trans

Page 45: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Características generals de las biomoléculas

• Compuestos orgánicos• Su química depende de los grupos funcionales• Obedecen leyes de equilibrio, cinética y

termodinámica • Muchas son polímeros

Page 46: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

¿Qué son polímeros?

Page 47: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Tipos de biomoléculas

• Proteínas• Carbohidratos• Acidos nucleicos• Lípidos• Otros: Vitaminas, hormonas

Page 48: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

“Building blocks”(Bloques de construcción)

• Proteínas: Aminoácidos• Carbohidratos: Monosacáridos• Acidos nucleicos: Nucleótidos• Lípidos: ?

Page 49: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Lípidos

Se caracterizan por su insolubilidad o poca solubilidad en agua.

“No hay un esquema aceptado universalmente para clasificar los lípidos”.

Philip W. Kuchel, Universidad de Sydney, Australia

Page 50: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Aminoácidos

Page 51: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Configuración L/D de aminoácidos

Page 52: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Péptidos

Page 53: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Polipéptido

Page 54: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Proteínas

Page 55: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Carbohidratos

OHH

HHO

OHH

OHH

CH2OH

OH

OH

OH

H

OH

H

OHH

OH

CH2O

Page 56: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Polisacárido

Page 57: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Acidos nucleicos

Page 58: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Hebra de DNA

Page 59: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Lípidos

Page 60: Universidad Interamericana de PR Recinto de Bayamón Bioquimica: CHEM 4220 Introducción a la Bioquímica Profesor Alberto L. Vivon Alonso, PH.D. J. Roberto

Membrana celular