workshop on tools for dna sequencing and resequencing in
TRANSCRIPT
Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in diagnostics
14th of January 2010Harnack-Haus, Berlin, Germany
���������
• ����� ��� ��������������������������������
�����������
• ����� �������������������������� ����������
• ����������������������� ������������� ������
�����������
• ��� ���������� �������������� �������
• ��� ������ ������������ �������������������
����������������������������������� ���
�������������������� ������!
����������
" #$%������&��' �����������(
�������������' ���� ���)��
������������*������
" #)%������&��' �����������(
�' �����' ���������+�������� �
�+������' �����
" #,%�-����������(�����.������
/ ��������.�*�������
" #0%����������.�*�������
" #1%���� �2����������3��������
" #4%�&���������������' �������
" #5%�/ �����' ���
www.cng.fr/READNA
,�� 2��������������.�*������
• 3����������
• 6���������7�$�8�
– ��' ��1�8������
– 9�+���������
– 1:;;;:;;;�����
• � ����������������< ����
" �������� �������������� ��' ���
,�� ����������������*��������
• 2���' ����' ����� ��' ����������
• ��������' ���
• 6���(������������������� ��' �����
• 3�=>������>���������
• ������������� �/ �3�( ����������
• ���' �������������� ���������������
WP2 – Activities
1) riboPCR MS Sequencing (CEA).
2) HLA Typing (CEA).
3) DASH Resequencing (ULEIC-FGEN-GWAVE).
4) Datta Arrays (ULEIC-PHO-MPIMG).
5) Risk Profiling of multifactoiral diseases by MALDI
mass spectrometry (MPIMG-CAU).
riboPCR MS Sequencing and HLA Typing
RNA/DNA Chimeras
DNA + mixThermocycling
Incubation
Mass spectrometer
Target
Alkali Cleavage
Sample transfer
Alkali
CEA - Ivo Gut / Florence MaugerCEA- LIST - Vincent Picaud