workshop on tools for dna sequencing and resequencing in

10
Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in diagnostics 14 th of January 2010 Harnack-Haus, Berlin, Germany

Upload: others

Post on 23-Apr-2022

3 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in diagnostics

14th of January 2010Harnack-Haus, Berlin, Germany

Page 2: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

���������

• ����� ��� ��������������������������������

�����������

• ����� �������������������������� ����������

• ����������������������� ������������� ������

�����������

• ��� ���������� �������������� �������

• ��� ������ ������������ �������������������

Page 3: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

����������������������������������� ���

�������������������� ������!

����������

" #$%������&��' �����������(

�������������' ���� ���)��

������������*������

" #)%������&��' �����������(

�' �����' ���������+�������� �

�+������' �����

" #,%�-����������(�����.������

/ ��������.�*�������

" #0%����������.�*�������

" #1%���� �2����������3��������

" #4%�&���������������' �������

" #5%�/ �����' ���

www.cng.fr/READNA

Page 4: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

,�� 2��������������.�*������

• 3����������

• 6���������7�$�8�

– ��' ��1�8������

– 9�+���������

– 1:;;;:;;;�����

• � ����������������< ����

Page 5: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in
Page 6: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in
Page 7: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in
Page 8: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

" �������� �������������� ��' ���

,�� ����������������*��������

• 2���' ����' ����� ��' ����������

• ��������' ���

• 6���(������������������� ��' �����

• 3�=>������>���������

• ������������� �/ �3�( ����������

• ���' �������������� ���������������

Page 9: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

WP2 – Activities

1) riboPCR MS Sequencing (CEA).

2) HLA Typing (CEA).

3) DASH Resequencing (ULEIC-FGEN-GWAVE).

4) Datta Arrays (ULEIC-PHO-MPIMG).

5) Risk Profiling of multifactoiral diseases by MALDI

mass spectrometry (MPIMG-CAU).

Page 10: Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in

riboPCR MS Sequencing and HLA Typing

RNA/DNA Chimeras

DNA + mixThermocycling

Incubation

Mass spectrometer

Target

Alkali Cleavage

Sample transfer

Alkali

CEA - Ivo Gut / Florence MaugerCEA- LIST - Vincent Picaud