บทที่ 18...
TRANSCRIPT
บทท 18
พนธศาสตรและ
เทคโนโลยทางชวภาพ
เทคโนโลยชวภาพ (Biotechnology)
• การใชเทคโนโลยเพอทาใหสงมชวต หรอองคประกอบของ
สงมชวตมสมบตตามตองการ ยกตวอยางเชน
– การใชจลนทรยในการหมก
– การพฒนาปรบปรงพนธพชและสตว
– เทคโนโลยชวภาพทเกยวกบ DNA (DNA Technology)
พนธวศวกรรม (Genetic Engineering)
• พนธวศวกรรม (genetic engineering) หมายถง เทคโนโลยททา
การเคลอนยายยน (gene) จากสงมชวตสปชสหนงไปสสงมชวต
อกสปชสหนง เปนการสราง DNA สายผสม (recombinant DNA)
• สรางสงมชวตรปแบบใหม (novel) ทมคณลกษณะแบบใหม ซง
ไมเคยปรากฏในธรรมชาตมากอน
• เปลยนแปลงหนวยพนธกรรม
หรอ DNA ของสงมชวต
• เคลอนยายยนทอยเหนอกฎเกณฑ
ธรรมชาต สงมชวตทเกดขนอาจมยน
ลกผสมแบบใหม
การโคลนยน
Cloning : หมายถง กระบวนการสรางสงทมลกษณะทางพนธกรรม
เหมอนกนกบสงทมอยกอน
มนษยรจกโคลนนงมาแตสมยโบราณแลว แตเปนการรจกโคลนนง
ทเกดกบพช นนคอ การขยายพนธพชโดย ไมอาศยเพศ เชน การ
แตกหนอ
http://www.youtube.com/watch?v=OCro5zfc3uc&feature=player
_embedded#at=42
กระบวนการในพนธวศวกรรม ประกอบดวยกระบวนการโดยรวมคอ
1. การเตรยมยน (gene)หรอ DNA ทสนใจ
2. การตด DNA อยางจาเพาะดวยเอนไซมตดจาเพาะ
3. การเชอมตอชนสวนของ DNA ทแยกไดกบ DNA พาหะ (vector) เชน
พลาสมด (plasmid), phage, cosmid
4. การนาพาหะ (vector) ทมยนทสนใจแทรกอย หรอ DNA สายผสม ใส
เขาไปในเซลลผรบ (host)
– หลงจากนนเลยงเซลลผรบใหแบงเซลลหลายๆครง ทาใหเพมจานวนเซลล
หรอเพมปรมาณยนทนาสนใจ กระบวนการนเรยกวาการโคลนยน (gene
cloning)
5. การคดเลอกเซลลทม DNA สายผสมตามทตองการ
การโคลนยน
1.การเตรยมยน (gene)หรอ DNA ทนาสนใจ การเตรยมชนสวนยนหรอ DNA ทนาสนใจมหลายวธดงน
1. การสกดจากเซลลหรอเนอเยอของสงมชวตทตองการศกษา ซงเปน DNA ทงหมด
ในจโนมของสงมชวตชนดนน เรยกวา genomic DNA
2. การเตรยม DNA จาก mRNA
– โดยใชเอนไซม reverse transcriptase
– จะได DNA ทสงเคราะหขนหรอถอดรหสจาก mRNA เรยกวา complementary
DNA (cDNA)
3. การสงเคราะห DNA โดยวธทางเคม
– สามารถสงเคราะห oligonucleotide ใหมลาดบเบสทตองการโดยเครอง
สงเคราะหอตโนมต
– ม 2 วธทใชกนอยางกวางขวางคอ วธ phosphate triester และวธ phosphite
triester
2. การตด DNA อยางจาเพาะดวยเอนไซมตดจาเพาะ
• เอนไซมตดจาเพาะ (Restriction enzyme or restriction endonuclease)
• แบบท 2 (type II) เปนเอนไซมทใชกนมากในการ ตดตอยน
• ประกอบดวยโพลเพพไทดเพยงชนดเดยว
• การตด DNA จะเกดทตาแหนงจาเพาะในบรเวณจดจา (recognition site) หรอจดใกลกบบรเวณจดจา ทาใหไดชนขนาด DNA ทมขนาดแนนอน
ตวอยางเอนไซมตดจาเพาะ
(restriction enzyme)
Blunt end vs. sticky end
3. การเชอมตอชนสวนของ DNA ทแยกไดกบ
DNA พาหะ (vector) • การเชอมตออาศยเอนไซม ligase
• การทาพนธวศวกรรมตองนา DNA ทสนใจเขาสภายในเซลลผรบ โดยอาศย DNA พาหะ
(vector)
• คณสมบตของ DNA พาหะ (vector)มดงน
– มสวนของ DNA ทเปนจดเรมในการจาลองตว (origin of replication,ORI) ทาให
สามารถเพมจานวนตวเองไดพรอมๆ กบ DNA ทใสเขาไป
– มยนเครองหมาย (marker gene) สาหรบใชในการคดเลอก เชน ยนทดอยา
ปฏชวนะ ยนทเกยวกบการสรางหรอสลายกรดอะมโนและนาตาลบางชนด
– มบรเวณจดจาของเอนไซมชนดใดชนดหนงหรอหลายชนดเพยง ตาแหนงเดยวใน
โมเลกลของ DNA พาหะ (unique or polylinker site)
ชนดของ DNA พาหะ(vector)
ขนอยกบขนาดของ DNA ทนามาเชอมและเซลลผรบ
ตารางแสดง DNA พาหะ(vector)ชนดตางๆและขนาดของชน DNA ทแทรกในพาหะได
DNA พาหะ (vector) รปราง เซลลผรบ
(host) ขนาดของชน DNA ทแทรกได
Plasmid DNA สายค, วงกลม E. coli ยาวไดถง 10 กโลเบส
Bacteriophage DNA สายตรง, ไวรส E. coli
ยาวไดถง 20 กโลเบส
Cosmid DNA สายค, วงกลม E. coli
30-50 กโลเบส
Yeast Artificial
Chromosome-YACs
โครโมโซมเทยม
,ยสต yeast
250-1000 กโลเบส (1 เมกะ
เบส)
pBR322, 4.36kb
Plasmid
Fig. 14-9: Cloning by cosmids. The cosmid is cut at a BglII site next to the cos site. Donor genomic DNA is cut using Sau3A, which gives sticky ends compatible with BglII. A tandem array of donor and vector DNA results from mixing. Phage is packaged in vitro by cutting at the cos site. The cosmid with inserts recircularizes once in the bacterial cell.
4. การนาพาหะ (vector) ทมยนทสนใจแทรกอย หรอ DNA สายผสม ใสเขาไป
ในเซลลผรบ
• ขนตอนการนา DNA สายผสม ใสเขาไปในเซลลผรบมหลายวธ คอ
4.1 Transformation
• เปนการนา DNA ในรปplasmidเขาสเซลลผรบ
• เซลลผรบทนยมใชกนมากคอ E. Coli
• โดยทาใหเซลลผรบเปน competent cell กอน มสองวธคอ
– การใชสารเคม เชน dimethyl sulfoxide-DMSO, CaCl2,
MgCl2
– Electroporation- ใชกระแสไฟฟาทาใหเกดรทเยอหมเซลล
ทาให DNA หรอพลาสมดเขาสเซลลได
– การใชแสงlaser ทาใหเกดรทเยอหมเซลล
4.2 Transfection
– เปนการนา DNA ของphageทมขนาดเลก เชน M13 เขาสเซลลผรบ
– เมอแบคทเรยไดรบ DNA ของphageจานวนมาก เซลลจะแตกและ
phage จะบกรกเซลลอนตอไปทาใหเกดจดใส (clear plaque)
– จดใส (clear plaque)คอจานวน DNA ของphageทเขาสเซลล
แบคทเรย
4.3 Transduction
– เปนการนา DNA ของcosmid,lamda phage ทมขนาดใหญเขาส
เซลลผรบ
– โดยบรรจลงในอนภาคของ phage กอนแลวจงนาเขาเซลล
– วธนมประสทธภาพสงกวา Transformation
จดใส (clear plaque)
คอจานวน DNA ของphageทเขาสเซลลแบคทเรย
5.การคดเลอกเซลลทม DNA สายผสมตามทตองการ
5.1 การคดเลอกโดยอาศยลกษณะ (phenotype)
– เปนการอาศยการแสดงออกของยนเครองหมาย (marker gene) และมการสรางโปรตนออกมา
– เชน การสรางเอนไซมบางชนดททาใหเกด clear zone ในอาหารเลยงเชอทม substrate (IPTG) อย
– หรอพบลกษณะการดอยาในเซลลผรบทไดรบมาจากพลาสมด
5.2 การคดเลอกโดย DNA hybridization
– อาศยการจบคกนของสาย DNA ทเปนตวตดตาม (probe) กบ DNA เปาหมายทตองการตรวจหาทมลาดบเบสคสมกน บน membrane
– โดย probe จะตดฉลากดวยสารไอโซโทปหรอเอนไซม
5.3 การคดเลอกโดยวธทางอมมวโนวทยา
– ทาไดเมอโคลนทตองการแสดงออกได โดยผลตโปรตน แตโปรตนไมแสดงลกษณะหรอ phenotype ทชดเจน
– เปนการตรวจสอบโปรตนทเซลลผลตขนโดยใชแอนตบอดทจาเพาะกบโปรตนทตองการนน
การคดเลอกโดยอาศยลกษณะ (phenotype)
• Plasmid/phageทมสวนของยนทสราง b-galactosidase จะสรางเฉพาะ a-fragment
• เมอ Plasmid/phage ถกนาเขาสแบคทเรย ภายใตภาวะทถกกระตนดวย IPTG จะทาใหมการสราง b-galactosidaseในแตละ fragment ซงสามารถเปลยน X-gal ใหเปนสนาเงนได
• แตถาม foreign DNA มาเชอมจะทาใหเกดการทางานของยนดงกลาวบกพรอง
• ไมมการสราง b-galactosidase ไมสามารถเปลยน X-gal ไดจงใหโคโลนสขาว
Polymerase Chain Reaction (PCR)
• เพมจานวน DNA ในหลอดทดลอง
• เครองมอ thermocycler
ขนตอนของกระบวนการ PCR
1. การแยกสายดเอนเอเกลยวคออกจากกน (Denaturation) ใช
อณหภม ประมาณ 94 องศาเซลเซยส เมอเรมตนดเอนเอ
แมแบบ จะอยในลกษณะทเปนเกลยวค เมอเพมอณหภมถง
ประมาณ 94 องศาเซลเซยส จะทาใหพนธะไฮโดรเจนระหวางค
เบสของดเอนเอถกทาลาย ทาใหเสนดเอนเอแยกออกจากกน
2. การจบของไพรเมอรกบ DNA แมแบบ (Annealing) เมอแยกสาย
ดเอนเอออกจากกนแลว จะลดอณหภมลงเหลอ 40 - 62 องศา
เซลเซยส เพอใหดเอนเอสงเคราะหขนาดสนประมาณ 15 - 25
คเบส ทเรยกวา ไพรเมอร (Primer) เขามาจบบรเวณทมลาดบ
เบสคสมกน ในการสงเคราะหดเอนเอ
3. การสงเคราะห DNA สายใหมตอจากไพรเมอร
(Extension) ใชอณหภม ประมาณ 68-72 องศาเซลเซยส
ในขนตอนนจะเปนการสรางสายดเอนเอตอจาก
ไพรเมอร โดยอณหภมทใชจะพอเหมาะกบ การทางาน
ของ Taq DNA polymerase
• http://www.maxanim.com/genetics/PCR/pcr.swf
• http://www.sciencemedia.com/website/demos/biochem/PCRMuta
genesis.swf
ลายพมพ DNA (DNA Fingerprint)
ลายพมพ DNA (DNA Fingerprint) DNA ทงหมดของสงมชวตนนประกอบดวย 2 สวน
• coding DNA ทาหนาทควบคมการสรางโปรตนท
มความสาคญตอกลไกตางๆ ภายในรางกาย ซงจะ
มอยเพยงรอยละ 5 ของชด DNAทงหมด
• noncoding DNA รอยละ 95 มสวนหนงทเปนเบส
ซาตอเนอง (tandem repeat) อยหลายตาแหนง
Tandem Repeat
เบสซาตอเนองนเองทนามาทาเปนลายพมพดเอนซงเปน
เครองหมายพนธกรรม ทาใหสามารถรลกษณะของจานวนการ
ซาของทอน DNA แตละชดในแตละตาแหนงบนสาย DNA ของ
สงมชวตและบคคลได
สามารถใชความแตกตางกนของขนาดและจานวนการซา
ของทอน DNA แตละชดน บงบอกถงขอมลพนธกรรม
เฉพาะของแตละบคคลได
หลกการทางานของเทคโนโลยลายพมพ DNA
1. เกบตวอยางเซลล ตวอยางตองม DNA ทมคณภาพ ไมเสอม
สลาย (ปจจยททาให DNA เสอมสลายคอ ระยะเวลา อณหภม
ความชน แสงแดด สารเคม จลนทรย ฯลฯ)
2. สกด DNA จากเซลลของตวอยาง
3. ตรวจลายพมพดเอนเอ หลกการคอ เลอกตด DNA ในสวนท
แสดงเอกลกษณเฉพาะบคคล โดยใช restriction enzyme
จากนนนาชนสวน DNA ทถกตดมาวเคราะหตามขนาดดวยวธ
Gel Electrophoresi
4. แปลผลลายพมพ DNA โดยการอานผลจากลกษณะตาแหนง
ของแถบดเอน หรอกราฟทได
ประโยชนของลายพมพ DNA
• ใชพสจนความสมพนธทางสายเลอด
• ใชในการตดตามการรกษาผปวยทไดรบการปลก
ถายไขกระดก ในการรกษาลคเมย ผปวยตองรบ
การปลกถายไขกระดกจากผให หากลายพมพด
เอนเอเลอดผปวยเปลยนไป แตลายพมพเซลลอน
ๆ เหมอนเดม แสดงวารางกายไมปฏรรยาตอตาน
ไขกระดกจากผให
• ใชพสจนหลกฐานทางนตเวชศาสตร
Gel Electrophoresis
Electrophoresis เปนเทคนคทใชแยกโมเลกลของ
สารทมประจออกจากกนโดยใชกระแสไฟฟา
สารทมประจนนเคลอนทผานตวกลางชนดหนงใน
สารละลาย สารทประจตางกนจะเคลอนทไปใน
ทศทางตรงกนขาม
อตราการเคลอนทยงขนอยกบขนาด รปรางโมเลกล
แรงเคลอนไฟฟาและตวกลางทใชดวย
โมเลกลของ DNA ประกอบดวยหมฟอสเฟตจานวน
มาก สารละลายของ DNA จงมประจเปนลบท pH
เปนกลาง
เมออยในสนามไฟฟาโมเลกลของ DNA จะเคลอนท
จากขวลบไปยงขวบวก
ความเรวในการเคลอนทของโมเลกล DNA จงขนอย
กบขนาดเปนสวนใหญ อยางไรกตามมปจจยอนทม
ผลตอการเคลอนทของโมเลกล DNA ดวยดงน
การประยกตใชเทคโนโลยของ DNA
1. เชงการแพทยและเภสชกรรม
• การวนจฉยโรค
• การบาบดดวยยน
• การสรางผลตภณฑทางเภสชกรรม
2. เชงนตวทยาศาสตร
3. เชงการเกษตร
• การทาฟารมสตวเพอสขภาพมนษย
• การสรางสงมชวตดดแปลงพนธกรรม
(transgenic organisms)
4. การใชพนธศาสตรเพอศกษาคนควาหายน
และหนาทของยน
5. การประยกตใชเพอสงแวดลอม