тема 3 презентація
TRANSCRIPT
3.1. Формальні таксони царства Vira3.2. Підходи щодо класифікації вірусів3.3. Сучасна класифікація родин
вірусів3.4. Система класифікації вірусів
Балтімора
У 1966 році на міжнародному мікробіологічному конгресі у
Москві був затверджений Міжнародний комітет з
номенклатури вірусів – МКНВ. У 1973 році МКНВ був
перейменований на Міжнародний комітет з таксономії вірусів
(МКТВ) (International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV).
Порядок (Order) – складається із родин вірусів із спільними
характеристиками, що відрізняються від інших
порядків і родин (-virales) –Caudovirales, Herpesvirales,
Mononegavirales, Nidovirales, Picornavirales.
Родина (Family) i підродина (Subfamily) – об’єднуює роди,
представники яких мають один тип геному та вихідну
структурну організацію вірусної частки
(-viridae, -virinae);
Порядок Caudovirales
Родина Рід Типовий вид Чутливий організм
Myoviridae
Mu-подібні віруси Фаг Mu Enterobacteria Бактерії
P1-подібні віруси Фаг P1Enterobacteria Бактерії
P2-подібні віруси Фаг P2 Enterobacteria Бактерії
PhiH-подібні віруси Фаг PhiHHalobacterium Бактерії
SP01-подібні віруси Фаг SP01 Bacillus Бактерії
T4-подібні вірусиФаг T4
Enterobacteria Бактерії
Порядок CaudoviralesРодина Рід Типовий вид Чутливий
організм
Podoviridae
N4-подібні віруси Фаг N4 Enterobacteria Бактерії
P22-подібні віруси Фаг P22 Enterobacteria Бактерії
Phi29-подібнівіруси Фаг Phi29 Bacillus Бактерії
T7-подібні віруси Фаг T7 Enterobacteria Бактерії
Порядок Caudovirales
Родина Рід Типовий вид Чутливий організм
Siphoviridae
С2-подібні віруси Фаг C2 Lactococcus Бактерії
L5-подібні віруси Фаг L5 Mycobacterium Бактерії
λ-подібні віруси Фаг λ Enterobacteria Бактерії
N15-подібні віруси Фаг N15 Enterobacteria Бактерії
PhiC31-подібнівіруси
Фаг PhiC31 Streptomyces Бактерії
PsiM1-подібнівіруси
Фаг PsiM1 Methanobacterium Бактерії
T1-подібні віруси Фаг T1 Enterobacteria БактеріїT5-подібні віруси Фаг T5 Enterobacteria Бактерії
Порядок Herpesvirales
Родина Підродина Представник Чутливий організм
Alloherpes-viridae
Герпесвірусікталурід І типу Ікталуріди
Herpesviridae
AlphaherpesvirinaeВірус простого
герпесу І, ІІ типів
Хребетні
Betaherpesvirinae Цитомегаловірус Хребетні
Gammaherpesvirinae ВірусЕпштейна-Барр Хребетні
Malacoherpes-viridae
Герпесвірусостерід І типу Молюски
Порядок Mononegavirales
Родина Підродина Представник Чутливий організм
Bornaviridae Вірус хвороби борна Хребетні
Filoviridae Вірус Ебола Хребетні
Paramyxoviridae
Paramyxovirinae Вірус кору Хребетні
PneumovirinaeРеспіраторно-
синцитіальнийвірус
Хребетні
RhabdoviridaeВірус
везикулярногостоматиту
Хребетні
Порядок Nidovirales
Родина Представник Чутливий організм
Arteriviridae Вірус артериїту коней Хребетні
Coronaviridae Коронавірус людини Хребетні
Roniviridae Вірус асоційований із зябрами Ракоподібні
Порядок Picornavirales
Родина Представник Чутливий організм
Comoviridae Вірус кільцевої плямистості тютюну Рослини
Disistroviridae Вірус паралічу цвіркунів Безхребетні
Iflaviridae Вірус інфекційної слабкості тутових шовкопрядів Безхребетні
Marnaviridae РНК-вірус Heterosigma akashiwo Рослини
Picornaviridae Вірус гепатиту А Хребетні
Sequiviridae Вірус жовтої плямистості пастернаку Рослини
Некласифіковані родини (62)
Родина Представник Чутливий організм
Adenoviridae Аденовіруси овець, курей, індиків, людини Хребетні
Corticoviridae Фаг PM2 Pseudoalteromonas БактеріїCystoviridae ФагPhi6 Pseudomonas Бактерії
Luteoviridae Вірус скручування листя картоплі Рослини
Metaviridae Вірус Ty3 Saccharomyces cerevisiae Дріжджі
Orthomyxoviridae Вірус грипу А, В, С Хребетні
Papillomaviridae Папіломавірус людини, овець, корів, собак Хребетні
Retroviridae Вірус імунодефіциту людини Хребетні
Некласифіковані роди (19)
Рід Представник Чутливий організм
Deltavirus Вірус гепатиту дельта Хребетні
Hepevirus Вірус гепатиту Е Хребетні
Hordeivirus Вірус смугастості та мозаїки ячменю Рослини
Rhizidiovirus Вірус Rhizidiomyces Гриби
Tenuivirus Вірус смугастості рису Рослини
Tobamovirus Вірус тютюнової мозаїки Рослини
Umbravirus Вірус плямистості моркви Рослини
Крім вірусів, у царстві Viraрозглядаються й інші молекулярні паразити, які систематизуються у рамках невизначених таксонів. Це
віроїди (Viroid), серед яких виділено дві родини і 8 родів,
сателіти вірусів (Sattelites) і пріони (Prions).
Система класифікації вірусів Балтімора була запропонована у 1971
році Нобелівським лауреатом Девідом Балтімором. Згідно даної класифікації
віруси поділяються на 7 груп в залежності від механізму утворення
вірусної іРНК у інфікованій клітині.
І длДНК-віруси Реплікація вірусів з даним геномом
відбувається наступним чином:клітинний фермент ДНК-залежна РНК-полімераза на матриці вірусної ДНКсинтезує іРНК (ол(+)РНК), на основі якоїздійснюється синтез вірусних білків. Акопіювання вірусного ДНК-геномувідбувається за допомогою клітинногоферменту ДНК-залежної ДНК-полімерази.
ІІ олДНК-вірусиПри проникненні вірусів даної
групи до клітини відбуваєтьсядобудовування вірусного геному додволанцюгової ДНК за допомогоюклітинної ДНК-полімерази, аподальші процеси відбуваються замеханізмом вірусів І групи.
ІІІ длРНК-вірусиРазом із вірусною РНК до клітини
потрапляє РНК-залежна РНК-полімераза,яка забезпечує синтез ол(+)РНК. В своючергу ол(+)РНК забезпечує синтез віруснихбілків у інфікованій клітині і служитьматрицею для синтезу нових ол(-)РНКланцюгів вірусною РНК-полімеразою.Комплементарні ланцюги (+) і (–) РНКутворюють дволанцюгову РНК, якаупаковується у білкову оболонку, формуючитаким чином наступне покоління вірусів.
IV ол(+)РНК-вірусиПісля потрапляння вірусу до клітини на
матриці вірусної ол(+)РНК одразупочинається синтез вірусних білків,включаючи фермент РНК-залежну РНК-полімеразу, який синтезує молекули (-)РНКна матриці (+)РНК. Далі за допомогоювказаного ферменту у клітині на матриці(-)РНК починається синтез молекул вірусної(+)РНК, а із синтезованих вірусних білків іРНК збираються готові віріони.
V ол(-)РНК-вірусиГеном вірусів даної групи містить
інформацію про фермент РНК-залежнуРНК-полімеразу, який необхідний дляутворення ол(+)РНК на матриці вірусноїол(-)РНК у інфікованій клітині. Даліутворюються вірусні білки, в тому числі іРНК-залежна РНК-полімераза, яка наматриці ол(+)РНК ситнезує ол(-)РНК,після чого відбувається збірка віруснихчасток.
VІ олRT-РНК-вірусиАбо ретровіруси, тобто віруси, які
містять ол(+)РНК і мають у своємужиттєвому циклі стадію синтезу ДНКна матриці РНК. До даної групиналежать деякі онковіруси і таківіруси, як ВІЛ (не дивлячись на те, щойого геном представлений длРНК,стадія синтезу ДНК є невід’ємноючастиною його життєвого циклу).
VІІ длRT-ДНК-вірусиТобто віруси які містять
дволанцюгову ДНК і мають у своємужиттєвому циклі стадію синтезу ДНКна матриці РНК (ретроїдні віруси, такіяк вірус гепатиту В). ДволанцюговаДНК, яка міститься у геномі вірусівданої групи копіюється відмінним відвірусів І групи шляхом (у яких віруснуДНК синтезує клітинна ДНК-залежнаДНК-полімераза).
У вірусів даної групи спочатку наматриці вірусної ДНК клітиннимферментом ДНК-залежною РНК-полімеразою синтезується ол(+)РНК,на якій далі синтезуються віруснібілки і вірусна ДНК. Синтез вірусноїДНК на матриці РНК здійснюєфермент зворотня транскриптаза,інформація про синтез якогозакодована у вірусній ДНК.