dzialuk zmienność i struktura genetyczna drzew iglastych w ... · 11 loci w 2 reakcjach...

ZmiennoZmiennośćść i struktura genetyczna i struktura genetyczna drzew iglastych w Polscedrzew iglastych w Polsce

dr Artur Dzialukdr Artur Dzialuk

Katedra GenetykiKatedra GenetykiInstytut Biologii EksperymentalnejInstytut Biologii Eksperymentalnej

ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania sosny zwyczajnejsosny zwyczajnej

ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru sosny zwyczajnej w Polscezbioru sosny zwyczajnej w Polsce

MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))

11 11 lociloci w 2 reakcjach multipleks PCRw 2 reakcjach multipleks PCR

Sosna Sosna --mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowedrowe

PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici

PID = 0.0000000000000000018PID = 0.0000000000000000018

PID = 0.00000000000000018%PID = 0.00000000000000018%

SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji

PD = 99.999999999999999982PD = 99.999999999999999982

PD = 99.9999999999999982%PD = 99.9999999999999982%

ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania śświerka pospolitegowierka pospolitego

ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru zbioru śświerka pospolitego w wierka pospolitego w PolscePolsce

MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))

12 loci w 2 reakcjach multiplexmultiplex PCR

ŚŚwierk wierk -- mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowedrowe

PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici

PID = 0.0000000000000000000062PID = 0.0000000000000000000062

PID = 0.00000000000000000062%PID = 0.00000000000000000062%

SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji

PD = 99.9999999999999999999938PD = 99.9999999999999999999938

PD = 99.99999999999999999938%PD = 99.99999999999999999938%

ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania jodjodłły pospolitejy pospolitej

ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru jodzbioru jodłły pospolitej w Polscey pospolitej w Polsce

14 14 lociloci w 2 reakcjach w 2 reakcjach multiplexmultiplex PCRPCR

MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))

jodjodłła a -- mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowedrowe

PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici

PID = 0.00000000000000000255PID = 0.00000000000000000255

PID = 0.000000000000000255%PID = 0.000000000000000255%

SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji

PD = 99.99999999999999999745PD = 99.99999999999999999745

PD = 99.999999999999999745%PD = 99.999999999999999745%

ZasiZasięęg wystg wystęępowania powania modrzewia europejskiegomodrzewia europejskiego

ZasiZasięęg wystg wystęępowania i schemat powania i schemat zbioru modrzewia europejskiego w zbioru modrzewia europejskiego w PolscePolsce

15 15 lociloci w 3 reakcjach w 3 reakcjach multiplexmultiplex PCRPCR

MikrosatelityMikrosatelity jjąądrowe (drowe (nSSRnSSR))

modrzew modrzew -- mikrosatelitymikrosatelity jjąądrowe drowe

PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośścici

PID = 0.0000000000000000000000776PID = 0.0000000000000000000000776

PID = 0.00000000000000000000776%PID = 0.00000000000000000000776%

SiSiłła dyskryminacjia dyskryminacji

PD = 99.9999999999999999999999224PD = 99.9999999999999999999999224

PD = 99.99999999999999999999224%PD = 99.99999999999999999999224%

WsobnoWsobnośćśćistotna statystycznieistotna statystyczniesosna zwyczajna f=sosna zwyczajna f=

śświerk pospolity f=wierk pospolity f=

jodjodłła pospolita f=a pospolita f=

modrzew europejski f=modrzew europejski f=

Nie można zaniedbać istnienia wsobności w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.Nie można zaniedbać istnienia wsobności w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.

Struktura genetyczna Struktura genetyczna ––osobniki nie sosobniki nie sąą rozmieszczone losoworozmieszczone losowo

Nie można zaniedbać istnienia tej struktury w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.Nie można zaniedbać istnienia tej struktury w obliczeniach prawdopodobieństwa zgodności.

PrawdopodobiePrawdopodobieńństwo identycznostwo identycznośści dla badanych gatunkci dla badanych gatunkóów drzew lew drzew leśśnych nych ww porporóównaniuwnaniu do zestawu stosowanego powszechnie w genetyce sdo zestawu stosowanego powszechnie w genetyce sąądowej dowej do do genotypowaniagenotypowania czczłłowiekaowieka

Gatunek Liczba loci PID Człowiek – zestaw PowerPlex®16 (Promega)

Caucasian-Americans 16 1 : 1.83 × 1017 African-Americans 16 1 : 1.41 × 1018 Sosna zwyczajna 11 1 : 5.51 × 1017 Świerk pospolity 12 1 : 1.61 × 1020 Jodła pospolita 14 1 : 3.92 × 1017 Modrzew europejski 15 1 : 1.29 × 1022

Prawdopodobieństwo porównywalne z wartościami uzyskiwanymi w analizach człowieka !!!Prawdopodobieństwo porównywalne z wartościami uzyskiwanymi w analizach człowieka !!!