antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · diagnostik på...
TRANSCRIPT
![Page 1: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/1.jpg)
Antibiotikaresistensövervakning Stramautbildning, Långholmen, 2015-03-13
Olle Aspevall
![Page 2: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/2.jpg)
2015-03-13
![Page 3: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/3.jpg)
Syften
• Underlag empirisk behandling.
• Underlag för revidering av farmakopé.
• Kartlägga burden of disease.
• Tidig varning för prevention.
• Upptäcka smittspridning.
• Utvärdera effekt av interventioner.
Surveillance standards for antimicrobial resistance, WHO 2002
![Page 4: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/4.jpg)
Typer
• Heltäckande – Sentinel
• Kontinuerlig – Episodisk
• Passiv – Aktiv
• Rutin – Utvidgad
Surveillance standards for antimicrobial resistance, WHO 2002
![Page 5: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/5.jpg)
Felkällor
• Selektion av provtagning.
• Selektion för resbest baserat på kliniska uppgifter.
• Selektion av resbest baserat på tid resbest.
• Multipla fynd på samma patient.
• variation beroende på metoder och lab.
![Page 6: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/6.jpg)
System för övervakning
• Punktprevalensstudier ; ResNet, Folkhälsomyndigheten
• EARS-Net, ECDC; europeiskt nätverk för övervakning av invasiva isolat (8 arter)
• Anmälningspliktiga agens; SmiNet, Folkhälsomyndigheten: MRSA, VRE, PNSP, Enterobacteriaceae med ESBL inkl ESBL-CARBA
• Svebar, kontinuerlig, real-tid, 13 lab, >60%, Folkhälsomyndigheten.
![Page 7: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/7.jpg)
• Phenotypic test methods
![Page 8: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/8.jpg)
ResNet: övervakning och kvalitetssäkring av resistensbestämning
![Page 9: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/9.jpg)
ResNet för övervakning och kvalitetssäkring
![Page 10: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/10.jpg)
AMR övervakning i Europa; EARSS/EARS-Net vid ECDC
EARSS 1998-2009 Start och kontinuerlig uppbyggnad/utveckling för att ge aktuell och
korrekt information (data for action), koordinerades från RIVM, Bilthoven, Holland
EARS-Net 2010 och framåt Europeiskt (EU) övervakningssystem av AMR hos invasiva isolat;
nätverk av nationella nätverk som leds av ECDC, Stockholm, Sweden
![Page 11: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/11.jpg)
Escherichia coli – UVI – aggregerade data från ResNet 2001-2014
0
5
10
15
20
25
30
35
2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016
Ampicillin
Mecillinam
Cefadroxil
Nitrofurantoin
Nalidixic acid
Ciprofloxacin
Trimethoprim
![Page 12: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/12.jpg)
EARS-Net 2009, 2013; E.coli-CephR
![Page 13: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/13.jpg)
EARS-Net 2009, 2013; K.pneum-CarbaR
![Page 14: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/14.jpg)
Staphylococcus aureus – sårodling – aggregerade data från ResNet 2001-2014
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016
Oxacillin/Cefoxitin
Erytromycin
Klindamycin
Fusidinsyra
Genta/Tobra
Norfloxacin
![Page 15: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/15.jpg)
EARS-Net 2009, 2013; S.aureus-MRSA
![Page 16: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/16.jpg)
Aktiviteter och presentation av statistik
• Epidemiologisk övervakning i SmiNet
• Isolat till SMI för epidemiologisk typning
• Aktuell statistik finns på SMIs hemsida, uppdateras månadsvis för anmälningspliktiga agens
• Veckoövervakning och årsrapporter för C. difficile.
• Fördjupad analys i SWEDRES (engelska)
![Page 17: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/17.jpg)
SmiNet
• Web-baserat elektroniskt rapporteringssystem
• Kliniska anmälningar och laboratorieanmälningar kombineras till fall i SmiNet – Undantag: ESBL med endast anmälningsplikt från laboratoriet
• ”Falldefinitioner – vid anmälan enligt smittskyddslagen”
– Socialstyrelsen, Ny version maj 2012
• SmiNet samfinansieras mellan SMI (50%) och landstingen (50%)
![Page 18: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/18.jpg)
Informationsflöden - SmiNet
SmiNet
Toby
Behandlande
läkare
Laboratorium
Smittskyddsenhet
![Page 19: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/19.jpg)
Vilken information finns i anmälan?
• Klinisk anmälan
– Basuppgifter: anmälningsdatum, diagnos, personuppgifter – När? Var? Hur?: smittdatum, smittland, smittväg, provtagningsorsak – Övriga uppgifter av betydelse för smittskyddet – Åtgärder/Förhållningsregler – Uppgifter om ansvarig läkare
• Laboratorieanmälan – Basuppgifter – Provinformation: undersökningsmaterial
– Resultat: metod, art, diagnosspecifika fynd, resistens,epidemiologisk typning
– Ansvarig läkare på laboratoriet – Uppgifter om ansvarig läkare
![Page 20: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/20.jpg)
Antibiotikaresistenta diagnoser i SmiNet
ESBLCARBA : Anmälningsplikt och smittspårningsplikt införd 15 maj
Övriga diagnoser med koppling antibiotikaresistens på SMI (andra enheter): Gonorré, GAS, H.influenza och TBC
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
7000
8000
9000
10000
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014
Sverige
MRSA
ESBL
VRE
PNSP
![Page 21: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/21.jpg)
Number of ESBLCARBA cases annually notified in Sweden 2007-2014.
![Page 22: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/22.jpg)
Diagnostik på agens inom smittskyddslagen
• Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas för varje nytt fall – MRSA, VRE, ESBLCARBA
• Diagnostik: Resistenskarakterisering
• Enterobacteriaceae: PCR för ESBLA, ESBLM, ESBLCARBA
• MRSA: PCR för nuc, mecA, mecALGA251 och PVL-gener
• VRE: PCR för E.faecalis/E.faecium och vanA/vanB • Resistensbestämning (Alla)
Epidemiologisk typning • PFGE (Enterobacteriaceae, MRSA, VRE) • MLST (VRE, på utvalda isolat) • spa-typning (MRSA)
Punktprevalensmätningar
![Page 23: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/23.jpg)
Intiativ AB-resistenta diagnoser, med koppling till arbetet med SmiNet
• Aktiv komplettering av den epidemiologisk informationen i SmiNet (MRSA och VRE) – Samarbete med utsedd kontaktperson/er
(SME/Vårdhygien) – Nätverk att ”fånga upp” information
• Laboratorienätverk
![Page 24: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/24.jpg)
Återkoppling SmiNet
![Page 25: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/25.jpg)
Svebar
• Alla odlingsresultat, avidentifierade
• varje natt, automatiskt
• varningar med e-post
• rapporteringsverktyg på hemsida
![Page 26: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/26.jpg)
Svebar – data export and import
• Laboratoriet exporterar de sista 14 dagarnas odlingsresultat
• Filerna importeras av Svebar under natten
• Svebar hanterar inkommna resultat (synonymisering och Ignorering av resultat) samt meddelar vilka den inte känner igen (Åtgärdslista)
• Varje fil går igenom den CENTRALA och den LOKALA ”early warning exceptional phenotype trapping” system.
• CENTRAL och LOKAL rapporter skapas
• Data från den 14:e dagen deponeras i ”övervakningsdatabasen”
![Page 27: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/27.jpg)
• Rapporterande laboratorium
• År
• Ålder och kön på patient (årtal och månad)
• Lab-nummer (remissens ID-nummer)
• Provtyp (Undersökningsmaterial)
• Analys (ex. urinodling, blododling)
• Mikroorganism (alternativt NEGATIV)
• Resistens (SIR, Zon, Diskstyrka, MIC, Tolkning MIC)
Skickas inte (än)
• Provtagande enhet (HSA-Id)
Data som skickas till Svebar
![Page 28: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/28.jpg)
Status Svebar
• 13 laboratorier deltar:
Växjö, Karlskrona, Halmstad, Kalmar, Visby, Trollhättan NÄL, Borås, Malmö/Lund, Karolinska US, Västerås, Östersund, Karlstad, Sahlgrenska
• >60% täckning.
• Ytterligare laboratorier är på gång med anslutning
• ”Officiell lansering” (inbjudan för påkoppling) 28 mars 2012.
• Svebar ingick som en del i ett regeringsuppdrag till SMI 2011 gällande övervakning av antibiotikaresistens.
• Intentionsförklaring gällande Svebar – SMI erbjuder laboratorierna samfinansiering av utvecklingskostnad för programvara gällande uppkoppling mot Svebar
![Page 29: Antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · Diagnostik på agens inom smittskyddslagen •Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042022/5e79ee0c90b60c5fb42afb63/html5/thumbnails/29.jpg)
Tack!