auria - university of oulu biopankki_2.p… · pohjois-suomen biopankki 13.8.2013 pia nyberg, ft...

Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri

Pohjois-Suomen biopankki

13.8.2013

Pia Nyberg, FT FinnTrials Tools- Vaativat biologiset näytteet, Tekes-hanke

PPSHP


Biopankkilaki 1.9.2013

• http://www.finlex.fi/fi/laki/alkup/2012/20120688 • Diagnostisten näytteiden kohdalla kudoslain

poikkeussäännöstä voi soveltaa 5 vuoden siirtymäajan, jos lääketieteelliseen tutkimukseen tarvittavia näytteitä ei ole saatavissa biopankista, mutta pääsääntöisesti siirto biopankkiin

• Tutkimusnäytteet: jos ei ole tarvetta näytteiden ja tietojen käyttöön primääritutkimuksen jälkeen, yksittäisen tutkimuksen osalta ei mikään muutu

• näytteiden laajemman jatkokäytön turvaaminen edellyttää biopankkisuostumusta (ja siis olemassa olevaa biopankkia)

• Valviran valvonta ja ohjaus

http://www.finlex.fi/fi/laki/alkup/2012/20120688


Biopankit apuna ’from bench to bedside’- prosessissa


Mitä sairaalabiopankki tarkoittaa?

Carpen & Kosma Duodecim 2012


Suomalaisten biopankkien vahvuuksia

• Homogeeninen väestöpohja (erityisesti Pohjois-Suomessa!)

• Kansalaisten myönteinen suhtautuminen tutkimukseen

• Korkealaatuinen julkinen terveydenhuolto

• Kansalliset rekisterit


Hyödyt terveydenhuollolle • Oikea hoito oikealle potilaalle • Uusien tutkimustulosten tehokkaampi siirto terveydenhoitoon


• Diagnostisten näytteiden tutkimuksellinen hyöty vähäinen ilman niihin liitettävää terveystietoa – Uudet tekniikat mahdollistavat

FFPE näytteiden monipuolisemman käytön, esim morfologian ja profiloinnin yhdistäminen

• Näytteiden ja niihin liittyvän kliinisen datan sekä kertyvän tutkimusdatan saatavuus

• Näytteiden laadukkuus (ammattimainen näytteiden ja tietojen säilytys)

• Vältetään päällekkäiset näytekeräykset

Hyödyt tutkijoille

Meriaux et al. J Proteomics 2010


Yritykset ja biopankki

• Kliiniset lääketutkimukset ovat vähentyneet Suomessa: trendi halutaan pysäyttää

• Public-private-partnership


Sairaalabiopankkien periaate

Biopankki

Palautuva tutkimusdata

Näytteen- hallintajärjes

telmä

Poimittu ja yhdistetty

tieto

Koodi- rekisteri

Suostumuk- sen hallinta

Tieto näytteestä

Potilastiedot tietovarastosta TAI suoraan eri järjestelmistä (qpati, Oberon, Esko jne)

Yhdistäminen rekisteri- tietoihin

Yhdistettyä potilasdataa voitaisiin käyttää sekä biopankkitutkimukseen että sairaan omiin tilastointeihin

Tutkija


Perustettavat sairaalabiopankit Auria (Turku)

Helsinki Tampere Kuopio Jyväskylä Oulu

Omistus TY 6/12 VSSHP 4/12 SaSHP 1/12 VSHP 1/12

HUS (valtuusto- päätös perustamisesta)

PSHP 40% TaY 30% Muut ERVA-SHP:t 30%

ISY KYS

KSSHP 70% JY 30%

PPSHP (tai PPSHP+ OY yhdessä?)

Organi- saatio

TYKS-SAPA liikelaitoksen patologian palvelualue

Patologian arkistosta pankki tai erillinen pankki arkiston yhteyteen

Oikeushlö PSHP: tiedekes-kukseen erillinen taseyksikkö

PSSHP:n alle?

KSSHP:n alle (patologia)

MRC:n alle

Hlökunta Professori, johtaja, laatuvastaa-va, 2 IT-asiantuntijaa, tutkimus- assistentti

Koordinaattori (aloittaa kesällä), prosessi-, IT ja tieteellinen työryhmä

Johtaja, koordinaattori, IT-henkilö, 1-2 tutkimushoitajaa

Projekti- päällikkö, ohjaus- ja projekti- ryhmät

Johtaja, Projekti- päällikkö, sihteeri, työryhmä

Projektipäällikkö, projektiryh-mä, ohjausryh-mä, 5/13-> 20% IT-hlö

=Auria pankki: toteutuma =muut biopankit: suunnitelma ja/tai väliaikainen ratkaisu


• Nostaa kliinisen tutkimuksen profiilia ja tasoa – Mahdollisuus hyödyntää ainutlaatuisia pohjoissuomalaisia

näytemateriaaleja • Lisätä ihmisperäisten näytteiden keräystä ja käyttöä perus-

ja soveltavassa tutkimuksessa – Patologian näytearkistot – Prospektiivinen keräys vaativille biologisille näytteille

Pohjois-Suomen biopankin tavoitteet


P-S biopankin infra ja organisaatio

• OY:n strategiarahaa biopankki-infraan 150 000 € – Yhteistyö: biopankki, Pohjois-Suomen

syntymäkohortit, DIPP-diabetestutkimus – Näytesäilytys ja tiedonhallinta – yhteistyössä OY:n tietojenkäsittelyopin

laitoksen Center for Advanced System Studies CASS:n kanssa

• Oulun biopankki kytkeytyy 2013 aloittaneeseen Medical Research Centeriin (MRC)

• ERVA-alueen shp:t voivat halutessaan liittyä mukaan


Patologian kudosarkisto biopankin perusmateriaaliksi: pilotti 2013 Turku ja Oulu

–myöhemmin muut shp:t • OYS:n patologian kudosarkistossa diagnostiikkaa varten

otettuja näytteitä vuodesta 1973 • Patologian kudosarkistossa n. 2,2 milj kudosblokkia noin

500.000 potilaasta • Vuosittain noin 20 000 biopsianäytettä (totaalimäärä 40

000) • Sähköinen järjestelmä käytössä 1999 → • Myöhemmin mukaan voidaan ottaa myös:

• Tuorekudosnäytteitä • verinäytteitä (n. 0,5 milj/v)

Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri OYS:n patologian arkiston pilotti: SNOMED koodien erot eri shp:eissa -> Harmonisointi: laadunparannus sekä biopankkidatalle että

myös diagnostiikalle


Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Pahanlaatuiset kasvaimet elintyypeittäin

Olli Carpen, TYKS & TY


Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Rintasyöpänäytteet: histologiset alatyypit ja esimerkkejä

ennusteellisista/hoitoa ohjaavista tekijöistä

Olli Carpen TYKS & TY


Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Rintasyöpänäytteet: erilaistumisasteen korrelaatio kasvaimen kokoon

Olli Carpen TYKS & TY


Kiitokset

Aino-Liisa Oukka Juha Korpelainen Minna Mäkiniemi Paavo Pääkkö Petri Lehenkari Pekka Mattila Pasi Parkkila Eeva-Riitta Savolainen

• Turku: Tarja Laitinen, Heli Salminen-Mankonen, Olli Carpen, Panu Jaakkola, Päivi Rautava, Perttu Terho, Samu Kurki

• Kuopio: Veli-Matti Kosma, Arto Mannermaa, Hanna Tuhkanen

• Hki: Tuomas Mirtti • Tampere: Kimmo Savinainen, Jarkko

Penttinen • Jkylä: Marjukka Friman, Markku Kallajoki • FIMM: Juha Muilu, Kimmo Pitkänen • THL: Anu Jalanko, Sirpa Soini, Helena

Kääriäinen • Et al….

Pirjo Koistinen Merja Möttönen Roberto Blanco Kari Majamaa Johanna Uusimaa Juha Auvinen Et al…..

auria - university of oulu biopankki_2.p… · pohjois-suomen biopankki 13.8.2013 pia nyberg, ft...

Documents