capacity development in research design and basic ... research-design-r2r-all.pdf · case-control...
TRANSCRIPT
Basic Research Design (short version for R2R)
Chaiyos Kunanusont MD, PhD
Bangkok Health Research Center
Capacity development in research design and basic biostatistics for BMC and
BDMS staff planning to conduct Routine to Research (R2R) projects in 2015
1
* Basic concepts for research
* Epidemiological concept
* Research designs
* Clinical trials and some specific issues
* Literature reviews, IRB approval
* Statistics by research designs
*
2
*
Research question(s)
Research Design
Research Statistics
Sample size
Protocol development
How common is measles?
Can vaccine protect?
Descriptive… Analytic … Experiment
Prevalence rates… OR/RR… IR
n … n1n2
Protocol development
3
*
Host--Agent--Environment Relationship
HOST AGENT
Environment
*
Natural History of Disease
Incubation period
ระยะเวลาจากเรมสมผส ถงมอาการ หรออาการแสดง
“The time interval between initial contact with
an infectious agent and the appearance of the
first sign or symptom of the disease in question…”
contact sign/symptom
Time
Incubation period
** Descriptive study: Disease frequency time/ place/
person
* Analytical study: Compare between 2 different groups
* Disease vs non-disease to determine cause or
* Exposed vs non-exposed to determine disease occurrences
* Experimental study: Analytical studies with at least an Intervention
* Clinical trials: Experimental studies to determine efficacy of treatment or preventive measures
* Others: eg. nested case-control, retrospective cohort
6
Stu
dy d
esi
gn
Analytical
Experimental Clinical trial
Observational
Cohort
Case-control
Cross-sectional
Descriptive Observational
Cross-sectional
Case report/series
*
7
*
Time
Exposure Outcome
X-sec X-sec X-sec X-sec X-sec
Retrospective Prospective
case-control
cohort study
8
Non Cases
Describe only Cases
*
Non Cases
Describe Cases and Non cases
*
Study factors associated with the problem
Stu
dy d
esi
gn
Analytical
Experimental Clinical trial
Observational
Cohort
Case-control
Cross-sectional
Descriptive Observational
Cross-sectional
Case report/series
With comparison
group
No comparison
group
Exposure given by
researcher
Natural exposure
11
*
*1. Systematic error
• Selection bias • Information bias • Confounding bias
2. Random errors
12
** Selection bias is any bias arising from the
way that study participants are selected (or select themselves) from the source population
* Information bias is any bias arising from errors in classification of the exposure or disease status of the study participants
* Confounding bias occurs if a factor is * associated with exposure and is a risk for the outcome.
* Thus, the underlying risk of disease is different in the exposed and non-exposed groups
13
14
*
15
*
*เปนการศกษาเชงทดลอง ในผปวย เพอประเมนประสทธผล ของการรกษา เปรยบเทยบกนระหวางการรกษาใหม กบการรกษาตามมาตรฐานทมอย หรอเปรยบเทยบวธการรกษาใหม กบการทไมไดรกษาเลย (ในกรณทยงไมมการรกษามาตรฐาน)
*ผรวมในการศกษา (Subjects) ตองไดรบการวนจฉยวาเปนโรคจรง และไมอยในระยะตน หรอทายจนเกนไป จนไมไดรบประโยชนจากผลการรกษา ซงอาจท าใหเกดอคต (Bias) ได
16
*
Eligible
Subjects Randomization
Treatment 1
Treatment 2
New method of treatment
Standard method of treatment or Placebo
17
*
*Principles: respect persons, beneficence, justice
*Ethical considerations
1. Rights: รบทราบขอมล เขาใจ และตดสนใจรวมการวจย อยางเปนอสระ
2. Safety: ความปลอดภย และปลอดจากอนตราย รวมถงเหตการณไมพงประสงค
3. Well-being:สภาวะสมบรณทงรางกายและจตใจของผเขารวมการวจย
*Non-scientific = un-ethic
*Feasibility
*Researchers’ competency i.e. technical K, E and GCP
*Project is “do-able” adq. resources, quality results
*Cost and use / generalization of the results
18
*
*การวจยในคน หมายถง กระบวนการศกษา ทออกแบบอยางเปนระบบ เกยวกบการทดสอบสมมตฐาน หรอ หาขอสรป ในลกษณะทเปนความรทวไป ทฤษฏ หลกการ แบบแผนความสมพนธ หรอขอมลพนฐานทรวบรวมได ในคน หรอทเกยวของกบคน ทงทมชวต หรอเสยชวต โดยกระท าตอรางกาย จตใจ เซลล สวนประกอบของเซลล สารพนธกรรม สงสงตรวจ เนอเยอ สารคดหลง รวมถงการศกษาจากขอมลทบนทกในเวชระเบยน หรอขอมลดานสขภาพของผเขารวมการวจย ทงน การศกษาดงกลาวตองเปนไปเพอใหไดมาซงขอมลสขภาพ
19
*
Somkiat Tonphu
BHRC
20
*
http://www.sciencedirect.com
23
*
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
24
*
http://scholar.google.co.th/
25
*URL ของ paper ทตองการ*** *ชอเรอง *ชอผแตง *ชอวารสาร *ฉบบ/ปทตพมพ *รายละเอยดอนๆถาม
ขอมลตางๆเปนแบบWord (ไม print screen)
26
*
*กอนการเขารบพจารณาจากคณะกรรมการจรยธรรมจะตองไดรบอนมตโครงการจากผอ านวยการโรงพยาบาลกอน
*หากเปนโครงการทปรกษากบศนยวจย จะเสนอความคดเหนตอผอ านวยการโรงพยาบาลเพอขออนญาตให
*ระยะเวลา 1-2 สปดาห
27
*เอกสารทตองเตรยม 16 ชด ศกษาขอมลยอนหลง (Retrospective chart review)
1. โครงรางการวจย (Proposal) 2. ประวตผวจยหลก (Principle Investigator CV) 3. แบบบนทกขอมล (Data Collection Form) 4. อนๆ เชน ภาคผนวก ฯลฯ ตามแตกรณ (ถาม)
เกบขอมลในผปวย (Prospective clinical study) 1. โครงรางการวจย (Proposal) 2. ประวตผวจย (Principle Investigator) 3. แบบบนทกขอมล (Data Collection Form) 4. เอกสารชแจงผเขารวมการวจย (Patient Information Sheet) เปนสรปขอมล
เกยวกบการวจยทเปนภาษาธรรมดาอานเขาใจไดงาย 5. หนงสอแสดงความยนยอมเขารวมโครงการวจย(Informed Consent Form) 6. อนๆ เชน ภาคผนวก ฯลฯ ตามแตกรณ (ถาม)
28
*
รอบการประชม(ทกวนพธแรกของเดอน) ระยะเวลาการสงเอกสาร(กอนวนท 10 ของทกเดอน) ผลของการพจารณา(15 – 30 วนหลงจากการประชม) ผล 1 รบรอง อาจจะมแกไขเลกนอยหรอไมม ผล 2 รบรองในหลกการ มแกไขตองสงเขารบการพจารณาใหมแตไม Full board ผล 3 ไมรบรองในหลกการ มแกไขตองสงเขารบการพจารณาใหม Full board
29
จดพจารณาของคณะกรรมการจรยธรรมการวจย
1. ชอโครงการภาษาไทย / องกฤษ ตองตรงกน 2. ประวต และประสบการณผวจยทอยและ
เบอรโทรศพทผวจย(มอถอ) 3. แหลงทน 4. หลกการและเหตผล 5. สถานทด าเนนการวจย 6. ระยะเวลาทศกษา 7. การทบทวนวรรณกรรม 8. วตถประสงค 9. รปแบบการวจย 10. ขนาดตวอยาง 11. Inclusion criteria, Exclusion criteria 12. การถอนอาสาสมครจากโครงการ 13. วธการด าเนนการวจย 14. การใชกลมเปรยบเทยบ 15. จ านวนครงทนดผเชารวมศกษา 16. การวดผลการวจย 17. การใชสถตในการวเคราะห
18. Vulnerable subjects 19. การบงคบใหเชารวมโครงการวจย 20. การค านงถงอาสาสมครทง ทางดานรางกายและจตใจ 21. การเกบเลอด หรอ เนอเยอ 22. Recruitment process 23. เอกสารชแจงและเอกสารยนยอม, Assent(อาสาสมครอาย<18 ป)
24. Informed Consent process 25. ประโยชนทคาดวาจะไดรบ 26. ความเสยงในการเขารวมงานวจย 27. คาตอบแทนอาสาสมคร 28. การรกษาพยาบาลหรอชดเชย 29. การรกษาความลบ 30. การใชวตถทางชวภาพ 31. การวจยทางพนธศาสตร 32. เอกสารเพมเตมเพอการวจย เชนหนงสอแนะน าการ
ปฏบตตว,เครองมอทใชวดผลการวจย,Questionnaireภาพถาย, บนทกสวนตว, ฯลฯ
33. ความเสยงของโครงการ
30
*
31
1. Study design ใชแบบไหน?
2. ใชสถตอะไร?
3. Sample size เทาไหร?
4. แปลผลอยางไร?
*
32
1. นามสเกล (Nominal scale)
เพศ (ชาย, หญง) ผลการรกษา (หาย, ไมหาย)
กลมเลอด (A B O และ AB)
2. อนดบสเกล (Ordinal scale)
ความเจบปวย (ไมเจบ เจบนอย เจบมาก)
ความพงพอใจ (ไมพงพอใจ พงพอใจนอย พงพอใจมาก)
*
33
3. ชวงสเกล (Interval scale)
อณหภม วดเปนองศาเซลเซยส (๐C) อณหภม 5
๐C หาง
จาก 6 ๐C เทากบ 6
๐C หางจาก 7
๐C และท 0
๐C ไมไดม
ความหมายวาไมมอณหภม (ศนยไมแท)
4. อตราสวนสเกล (Ratio scale)
มศนยแท เชน นาหนก สวนสง ความดนโลหต ระดบนาตาลในเลอด
*
34
1. ขอมลแจงนบ
1.1 ขอมลกลม (Categorical data)
1.2 ขอมลอนดบ (Ordinal data)
2. ขอมลทวดคาเปนตวเลข
2.1 ขอมลไมตอเนอง (Discrete data)
2.2 ขอมลตอเนอง (Continuous data)
*
ตวแปร กลม (ชอ) ขอมล เพศ ชาย, หญง ชาย 15 คน หญง 30 คน
กลมเลอด กรป A, B, O, AB A 12คน B 9คน O 20คน AB 8คน
ความรนแรงของโรค
นอย ปานกลาง มาก
นอย 20คน ปานกลาง 10คน มาก 8คน
35
1. การประมาณคาสดสวนประชากรกลมเดยว
𝑛 =𝑍2𝛼 2 𝑃(1 − 𝑃)
𝑒2
2. การประมาณคาเฉลยประชากรกลมเดยว
𝑛 =𝑍2𝛼 2 𝜎2
𝑒2
*
36
3. การประมาณคาสดสวนประชากรสองกลม
𝑛/𝑔𝑟𝑜𝑢𝑝 =2 𝑍𝛼 + 𝑍𝛽
2𝑃(1 − 𝑃)
∆2
โดยท P= (PT + PC)/2
4. การประมาณคาเฉลยประชากรกลม
𝑛/𝑔𝑟𝑜𝑢𝑝 =2(𝑍𝛼 + 𝑍𝛽)
2𝜎2
∆2
*
37
*
วตถประสงค
ประเภทขอมล
Categorical 2 group
Categorical >2 group
Ordinal Continuous (Normal)
Time to
event
บรรยายตวอยาง Proportion Proportion Median, IQR
Mean, SD Kaplan Meier
การประมาณคาและการเปรยบเทยบประชากรเดยว
One sample Z Chi-square or Binomial test
Chi-square Wilcoxon One sample t test
-
38
*
ประเภทขอมลตวแปร
ปจจย
ประเภทขอมลตวแปรผล (Outcome)
Categorical Ordinal Continuous Time to event
Categorical 2 group
Chi-square Fisher’s
Wilcoxon T-test Cox proportional hazards regression
Categorical >2 group
Chi-square Fisher’s
Kruskal wallis
ANOVA Wilcoxon
Cox proportional hazards regression
Ordinal Chi-square Fisher’s
Spearman rank
Pearson’s correlation coefficient (r) Linear Regression
Cox proportional hazards regression
Continuous (Normal)
Logistic Regression
Linear Regression
Pearson’s correlation coefficient (r) Linear Regression
Cox proportional hazards regression
39
*
ประเภทขอมลตวแปร
ปจจย
ประเภทขอมลตวแปรผล (Outcome)
Categorical Ordinal Continuous Time to event
Categorical 2 or more group
OR, Logistic regression
- - Cox proportional hazards regression
Ordinal OR, Logistic regression
- - Cox proportional hazards regression
Continuous (Normal)
OR, Logistic regression
- - Cox proportional hazards regression
40
*
ประเภทขอมลตวแปร
ปจจย
ประเภทขอมลตวแปรผล (Outcome)
Categorical Ordinal Continuous Time to event
Categorical 2 or more group
OR, Conditional logistic regression
- - -
Ordinal OR, Conditional logistic regression
- - -
Continuous (Normal)
OR, Conditional logistic regression
- - -
41
*
ประเภทขอมลตวแปรปจจย
ประเภทขอมลตวแปรผล (Outcome)
Categorical Ordinal Continuous Time to event
Categorical 2 or more group
RR, Logistic regression
- - Cox proportional hazards regression
Ordinal RR, Logistic regression
- - Cox proportional hazards regression
Continuous (Normal)
RR, Logistic regression
- - Cox proportional hazards regression
42
