conceptos de genetica

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Page 1: conceptos de genetica

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CATEDRA DE BIOQUIMICA

FACULTAD DE MEDICINA

UNIVERSIDAD NACIONAL DEL NORDESTE

GUIA DE ACTUALIZACION DOCENTE

CONCEPTOS DE GENETICA

AÑO 2007

Autores

Dr. Gustavo Agolti . Profesor Adjunto por Concurso.

Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE

Dr. Alexis Codutti. Jefe de Trabajos Prácticos

Adscripto .Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE

Sr. Felix Miguel Viglione. Ayudante alumno rentado

por concurso.Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE.

Sr. Emiliano Lucas Gracilazo. Ayudante Alumno

Adscripto .Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE.

Sr. Sebastián Alfredo Golemba. Ayudante Alumno

Adscripto .Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE

Sr. Francisco Ferreira. Ayudante alumno adscripto

Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE

Dra. Nora C. Brandan. Jefa de Cátedra por concurso.

Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE

Page 2: conceptos de genetica

2

INDICE

B

BIBLIOGRAFÍA .................................................................................................................................... 47

E

ESTRUCTURA DEL ADN ...................................................................................................................... 4 ESTRUCTURA DEL GEN EUCARIOTA ........................................................................................... 20

F

FUNCION BIOLOGICA DEL ADN. .................................................................................................... 13

G

GENETICA MITOCONDRIAL. ........................................................................................................... 43

I

INTRODUCCION .................................................................................................................................... 3

N

NOCIONES ACTUALES DE GENÉTICA .......................................................................................... 40

R

REPLICACION DEL ADN ................................................................................................................... 14

T

TRADUCCION DEL DNA. SINTESIS PROTEICA. PROCESO POST-TRADUCCIONAL ......... 33

TRANSCRIPCION ................................................................................................................................. 21

Page 3: conceptos de genetica

3

INTRODUCCION

Todas las formas de vida, desde los virus hasta las plantas y los animales superiores, transmiten sus

caracteres a las siguientes generaciones a través del DNA (excepcionalmente RNA)

La funcionalidad génica esta regida por la dirección de la información genética que fluye desde el

ADN hacia el ARN, y a su vez desde éste hacia la síntesis de cadenas peptídicas que en su gran mayoría

conforman las proteínas con sus correspondientes estructuras terciarias o cuaternarias. Este flujo de la

información génica es lo que se conoce como “dogma central de la genética”.

Hoy, La idea del “dogma” puede no del todo ser correcta, ya que se ha descubierto que ciertos tipos

de virus pueden originar su material genético constituido por ADN sintetizándolo a partir de moléculas

de ARN con la colaboración de enzimas denominadas transcriptasas reversas, invirtiéndose el flujo de

la información que originalmente se había propuesto en el dogma.

http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripcion.htm#elongación

Page 4: conceptos de genetica

4

ESTRUCTURA DEL ADN

GENERALIDADES

El ADN es una macromolécula generada por medio de la polimerización de desoxirribonucleótidos.

La información contenida en dicho ADN para la síntesis proteica, es determinante de las funciones

esenciales que se llevan a cabo en la célula (Diferenciación, Crecimiento, Reproducción, Muerte).

El ADN es el medio o estructura que contiene y por el cual se transmite la información genética

(herencia).

CONSTITUCIÓN DEL ADN. COMPONENTES

Es un polímero lineal formado por subunidades repetitivas de nucleótidos que contienen un azúcar (2'

desoxi D ribosa), un grupo fosfato y una de cuatro bases nitrogenadas heterocíclicas (dos bases púricas:

Adenina, Guanina; y dos pirimídicas: Citosina, Timina).

Cada base está unida al carbono 1' de la 2' desoxi D ribosa mediante un enlace ß-N-glucosídico

(conformando así un nucleósido) y a su vez el fosfato podía unirse al carbono 3' o al carbono 5' del

azúcar (constituyendo así un nucleósido fosforilado o nucleótido).

A su vez los nucleótidos se unen por enlaces covalentes fosfodiéster entre el grupo OH de un

nucleótido y el fosfato de otro entre los carbonos 5' y 3' de residuos de azúcar adyacentes (enlaces

fosfodiéster 5'-3') y estas uniones sucesivas generan las cadenas polinucleotídicas.

Todos los nucleótidos en esa cadena son unidireccionales y la dirección de avance es 5'-> 3'(tienen

una orientación relativa de modo que si el primer nucleótido del carbono 5' está por encima del anillo de

la pentosa y el carbono 3' por debajo, la posición del carbono 5' se mantiene en los restantes).

Los extremos de las cadenas se denominan 5' y 3' denotando la dirección de las cadenas.

El contenido de bases nucleotídicas es equimolecular, es decir que la cantidad de dAdenina y dTimina

son equivalentes; como así también las de dCitosina y dGuanina. Pero el número de dAdenina+dTimina y

dGuanina+dCitosina, no son iguales entre si, conformando asi la Ley de Chargaff.

Page 5: conceptos de genetica

5

El DNA es una doble hélice, en ella cada una de sus hebras se enrolla alrededor de un eje central

generalmente en forma de hélice dextrógira. Los dos esqueletos de fosfato y azúcar se exponen al medio

acuoso (por su capacidad hidrofílica),rodeando a las bases, dejándolas hacia el interior de la molécula

(por ser estas ultimas hidrofóbicas). A su vez los enlaces fosfodiéster avanzan en dirección opuesta en las

dos hélices (cadenas antiparalelas).

Cada Adenina está unida a una Timina de la otra cadena mediante puentes de hidrógeno, al igual que

cada Citosina a una Guanina (dos y tres enlaces respectivamente). Los átomos de hidrógeno pueden

desplazarse de un átomo de nitrógeno a oxígeno (tautomerización) interconvirtiendo las posiciones de los

dadores y los aceptores de enlaces de hidrógeno en los apareamientos de las bases; en condiciones

fisiológicas normales los equilibrios de tautomerización están desplazados hacia la forma ceto y amino, es

decir, los átomos de nitrógeno unidos a los anillos de purina de la Adenina y pirimidina de la Citosina se

encuentran en forma de C-NH2 más que en forma de imino (C=NH). De la misma manera los átomos de

oxígeno del carbono 6 de la Guanina y del carbono 4 de Timina suelen encontrarse en forma ceto (C=O) y

en forma enólica (C-OH). Esto determina el ordenamiento de protones y por ende el patrón de enlaces en

el DNA.

Por el contrario, Adenina no puede aparearse con la Citosina, ni Guanina con Timina porque

habría dos enlaces de hidrógeno en uno de los puentes de unión, y ninguno en el otro. A-T y C-G

siempre se aparean entre sí determinando una complementariedad de bases (por lo que la

secuencia de una cadena determina la secuencia de la otra); esta complementariedad sienta las

bases del proceso de replicación del DNA ya que de la lectura de una cadena simple, surge la

síntesis de otra complementaria.

Page 6: conceptos de genetica

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http://www.biotech.bioetica.org/clase1-12.htm

CONFORMACION DEL DNA: ESTRUCTURA PROPIAMENTE DICHA:

La estructura del ADN esta íntimamente ligada a la composición de bases, y por efecto de

condiciones físico-químicas diferentes, puede sufrir variaciones en dicha estructura que determina la

unión de ciertas proteínas que juegan un importante papel en la expresión de su información(expresión

genética del ADN)

Esta conformación estructural del ADN pudo conocerse mediante estudios utilizando difracción con

rayos X., observándose que:

A)La variante estructural mas común es la conocida como ß-DNA , la cual se caracteriza porque:

1. La hélice completa una vuelta cada 10,4 pares de bases.

2. Una vuelta cubre una distancia de 3,4 nm (nanómetros), por lo tanto cada par de bases

incrementa la vuelta en 0,33 nm.

3. Los nucleótidos adyacentes en cada cadena están desfasados en 34,6º uno con respecto al

otro.

4. El diámetro de la doble hélice es de 2,37 nm.

B)Cuando se secan los cristales o disminuye el contenido de sales de la molécula del ß-DNA se

transforma en una molécula corta y gruesa conocida como A-DNA el cual a diferencia del ß en el que los

pares de bases se encuentran apilados paralelamente, las bases se encuentran desplegadas hacia la saliente

Page 7: conceptos de genetica

7

mayor de cada par de bases, El surco mayor se hace más estrecho y profundo y el menor más superficial y

ancho.

.La vuelta de hélice disminuye a 2,46 nm y por ende, el número de pares de bases por vuelta aumenta

a 11 aproximadamente (en condiciones fisiológicas no se lo encuentra).

C) En presencia de aumento de la concentración de cationes el DNA adopta la forma de Z-DNA

debido a que:

1. los nucleótidos C-G alternantes en el enlace glucosídico de G la posición es en cis y en C

el enlace glucosídico es anti, recorriendo entonces la cadena un zig-zag entre Guanina cis y

Citosina anti (Z-DNA de zig-zag).

2. Esta forma de ADN presenta 12 pares de bases por vuelta del DNA, que a su vez es de

4,56 nm; el diámetro es de 1,84 nm.

3. el surco mayor pasa a ser una superficie convexa y no un surco propiamente dicho, y el

surco menor es una hendidura profunda.

En las células la mayor parte del DNA se encuentra en la forma ß, aunque las regiones ricas en

pares de bases C-G pueden adoptar la conformación Z.

http://www.biotech.bioetica.org/clase1-12.htm

Page 8: conceptos de genetica

8

ESTABILIDAD DEL DNA:

Las fuerzas que estabilizan las estructuras complejas celulares como el ADN son siempre las

mismas, siendo lo suficientemente fuertes como para mantener la integridad estructural, pero lo

suficientemente débiles como para permitir la flexibilidad.de toda la molécula.

Pueden distinguirse cuatro fuerzas principales que atribuyen la estabilidad del DNA:

1)- Los enlaces hidrofóbicos: estabilizan los apareamientos de bases.

2)- Las bases apiladas determinan contactos o fuerzas de Van der Waals y éstas, si bien resultan

débiles individualmente, son aditivas, de forma que en una molécula que contenga de 104 pares de bases

(pb) o más suponen una importante fuerza de estabilidad.

3)- Entre los pares de bases se establecen uniones por puente de hidrógeno, el par C-G (tres puentes

de H) es más estable que el A-T (2 puentes de H) por tener un enlace más de hidrógeno.

4)- El esqueleto del DNA presenta una gran carga negativa debido a que sus enlaces fosfodiéster

tienen un carácter ácido a pH 7 (cercano a los valores de los líquidos corporales)y se produciría una

repulsión electrostática desestabilizadora de cadena si no interaccionara con cationes del medio,

uniéndose a cationes celulares como el Mg++(estabilizador de la doble hélice ). neutralizándose asi la

carga de la molécula

CONFORMACION DEL ADN EN EL NUCLEO. NIVELES DE COMPACTACIÖN.

Debido a la extensión del contenido genético (puede alcanzar los 2 metros de longitud en cada

celula), la necesidad de mecanismos de compactacion se hace mas que evidente teniendo en cuenta las

comparativamente reducidas dimensiones celulares.

Esta reduccion de tamaño del material genetico se logra por la asociación y el enrollamiento del ADN

con un grupo de proteínas (Histonas y otras proteinas ). El resultado de esta asociación de proteinas

histonicas y no histónicas junto al Acido Desoxirribonucleico se denomina cromatina.

Definición:”Cromatina es el complejo de DNA y proteína en el núcleo de la célula en interfase.”

Page 9: conceptos de genetica

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Hay dos tipos de proteínas que están formando un complejo con el DNA en el núcleo. Las proteínas

histonas son abundantes que tienen un rol estructural para compactar el DNA en nucleosomas. Están

presentes en un número de cincuenta millones de copias por célula y la masa total de histonas es casi la

misma que la del total del DNA. Las proteínas no histónicas son el segundo tipo de proteínas de la

cromatina. Este grupo comprende otras proteínas estructurales menos abundantes, como las proteínas de

unión a secuencias específicas del DNA , y RNA polimerasas.

La cromatina inactiva para la transcripción está empaquetada más densamente durante la interfase

celular (con microscopía electrónica) y se la conoce como "heterocromatina". La croma-tina activa para

la transcripción se tiñe con menor densidad y se la conoce como "eucromatina" (generalmente la

eucromatina se replica antes en el ciclo celular de los mamíferos que la heterocromatina).

A su vez hay dos tipos de heterocromatina:

Constitutiva: siempre está condensada y por lo tanto, inactiva. Se encuentra en regiones cercanas

al centrómero y telómeros.

Facultativa: en ocasiones está condensada, pero otras veces es transcripta activamente

apareciendo entonces como eucromatina. El DNA asociado a las histonas y proteinas no histónicas

(cromatina) se compacta progresivamente hasta organizarse en cromosomas, que en metafase y en los

mamíferos presentan una simetría doble, con cromátides hermanas conectadas a un centrómero. Estos

cromosomas en metafase son inactivos para la trascripción.Uno de los Cromosomas "X" en las hembras

de los mamíferos es inactivo y heterocromático. Pero en la gametogénesis el cromosoma X se separa y se

vuelve activo para la transcripción durante la embriogénesis temprana, por lo tanto es "heterocromatina

facultativa".

La cromatina es extraordinariamente importante ya que es la forma de empaquetar al DNA dentro del

núcleo de las células eucariotas.

Nucleosomas:

El bloque básico de la construcción y compactación de la cromatina es el nucleosoma Este es un

complejo de DNA y proteínas básicas (histonas) que puede ser de cinco clases (H1 - H2A - H2B - H3 -

H4) constituyendo prácticamente la misma masa que la del DNA en la misma célula.

Page 10: conceptos de genetica

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Conformando el nucleosoma límite o “core” del nucleosoma se encuentran alrededor de 146 pares de

bases de DNA envueltas dos veces alrededor de un octámero de cuatro proteínas histonas ( histonas

nucleosomales denominadas H2A, H2B, H3, H4, 2 Copias de cada tipo en cada octámero).La histona H1

se uniría por ultimo abarcando 20 pares de bases mas conformando el Nucleosoma completo con 166 pb.

aproximadamente.

Las histonas son ricas en residuos arginina y lisina( aa básicos) por medio de los cuales se unen

fuertemente a los enlaces fosfodiéster (aa ácidos).

El ensamblaje de los nucleosomas está dado por una proteína fuertemente aniónica, la

nucleoplasmina. Es pentamérica, no se une al DNA ni a la cromatina pero actúa en forma reversible y

estequiométricamente a un octámero de histonas, de tal manera que estas ya no se adhieren en forma no

específica a superficies con carga negativa como las del DNA.

Es así que la nucleoplasmina mantiene en el núcleo un ambiente iónico conducente a la interacción

específica del DNA e histonas.

El nucleosoma ya formado libera la nucleoplasmina de las histonas al parecer los nucleosomas

muestran preferencia por ciertas regiones del DNA, pero la base de esta distribu-ción "no aleatoria"

denominada AJUSTE DE FASE se desconoce.

La cromatina asi compactada en nucleosomas está organizada de acuerdo a un motivo repetitivo que

se produce cada 10nm llamada justamente fibra de 10 nm la cual se encuentra formada por los el ADN

compactado en los nucleosomas y el ADN libre entre ellos. El segmento de ADN no enrollado mas el

enrollado alrededor de las histonas abarcaria unos 200 pares de bases. La digestión parcial de la

cromatina con nucleasas produce la hidrólisis de aproximada-mente 1/4 de los segmentos de 200 pb y la

liberación de la histona H1. Este DNA sensible a las nucleasas se denomina "espaciador". El fragmento

intacto se denomina nucleosoma límite o partícula central y contiene un DNA de 146 pb y 8 histonas, dos

H2A, H2B, H3, y H4.. las cuales conforman el octámero de histonas.

El empaquetamiento del DNA en nucleosomas para formar la fibra de 10 nm (“rosario en cadena” al

microscopio electrónico) es sólo el primer nivel en la compactación. Puede compactarse aún más en

varios niveles hasta el cromosoma en metafase. Cada nivel de compactación requiere de proteínas no

histónicas diferentes. Por ejemplo puede involucrar a proteínas no histónicas que sólo están presentes en

la metafase.

Page 11: conceptos de genetica

11

El superempaquetamiento de los nucleosomas en la fibra de 10 nm origina el orden de compactación

superior, llamado fibra de 30 nm o solenoide . Dicho proceso llevado a cabo en en el núcleo es en

apariencia dependiente de las histonas H1.. Estas histonas se superponen a la unión de dos nucleosomas y

son las responsables de la estabilidad de las fibras de 30 nm. Por lo tanto dicha fibra se mantiene gracias

a la acción cooperativa de las histonas H1 que están unidas al DNA espaciador Los nucleosomas de

dichas fibras parecen enrollados en una ordenación helicoidal llamada "solenoide".

La cromatina se compacta aun mas, debido a que la fibra de 30 nm forma lazos, de diversa longitud,

los cuales nacen de un cordón proteico constituido de proteinas no histonicas.

Dado que el conjunto de cordones proteicos compone una suerte de andamiaje en los extremos de

cada lazo de ADN asociado al cordon proteico lleva el nombre de SAR (Scaffold Asociated Regions). Se

considera que cada lazo constituye una unidad de replicación y transcripcion de ADN, es decir, un gen.

Los estadios de compactacion superiores de la información genética son poco conocidos.

Cuando una molécula de DNA se empaqueta en forma de nucleosoma y fibra de 10 nm resultante

disminuye su longitud en 7 a 10 veces y luego con la formación de las fibras de 30 nm, su longitud

disminuye en 50 a 70 veces . Pero cuando la cromatina está condensada en los cromosomas antes de la

división celular la longitud del ADN se reduce en 7000 veces aproximadamente .

Page 12: conceptos de genetica

12

El nucleosoma es la unidad fundamental de "empaquetamiento" del ADN eucariótico. El núcleo ("core") del mismo consiste en dos

moléculas de H2A, H2B, H3, y H4; alrededor de las cuales el ADN se enrolla dos veces (1) . La histona 1 esta fuera del núcleo. Este nivel de

empaquetamiento (" packing") se conoce como "cuentas de un collar" ra de 10 Nm (2).El siguiente nivel se conoce como la fibra de 30 nm ,

cuyos detalles de organización no se conocen completamente. Las fibras se condensa a posteriori en dominios en bucle de 300 nm (3). Los

dominios son parte de las secciones condensadas (4) ( 700 nm) de los cromosomas (el cromosoma tiene un ancho de unos 1400 nm en la

metafase) (5).

http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/adntema3.htm#The%20eukaryotic%20chromosome

TIPOS DE ADN:

1.- Altamente repetitivo: representa el 10 al 15% del genoma.

Unidad de repetición 5 a 10 pb.

Las sondas específicas localizan este DNA en regiones centroméricas y paracentroméricas.

NO CODIFICANTE.

2.- Medianamente repetitivo:

Secuencias Alu I: 300 pb repetidos en número de 100.000 copias por genoma haploide. Sitios

sensibles a la digestión por Alu I. Utilizadas para identificar DNA de origen humano. NO

CODIFICANTE.

Secuencias LINE I: sensibles a la digestión Kpn I. 5 a 7 kb de longitud. Aproximadamente 5.000

copias por genoma haploide.

- Genes RNAr 45s.

- Genes RNAr 5s. 70 a 90 copias.

- Genes RNAt. Aproximadamente 1.200 copias.

3.- Secuencia única:

- Genes Clase I: transcriptos por la Ez RNA polimerasa I.

Genes RNAr 45s, localizados en cromosomas acrocéntricos (constricciones secundarias) o

satelitados: Cromosomas 13, 14, 15, 21 y 22. Organizados en tandem. El conjunto de estos genes

asociados en interfase da origen al nucleolo.

Page 13: conceptos de genetica

13

- Genes Clase II: transcriptos por RNA polimerasa II. Genes que codifican para proteínas y SnRNPs.

Son genes de copia única:

- Solitarios.

- Clusters o agrupaciones (RNAr 45s).

- Familias (familia ß globina, Ó globina).

- Superfamilias (inmunoglobulinas, receptor T).

- Genes domésticos (house keeping genes). Ej. enzimas necesarias para rutas metabólicas presentes en

todas las células.

- Pseudogenes: formando parte de familias génicas. Han perdido la capacidad de expresión

(silenciosos).

- Genes homeóticos o genes que contienen "homeobox". Responsables de la aparición de patrones

complejos de desarrollo.

-Genes Clase III: Transcriptos por RNA polimerasa III.Codifican para los diferentes RNAt y para

RNAr de 5s.

FUNCION BIOLOGICA DEL ADN.

La información genética almacenada en la secuencia de nucleótidos del DNA sirve para dos

propósitos:

1)- Es fuente de información para la síntesis de todas las moléculas de proteínas de la célula.

2)- Provee la información heredada por las células hijas o la progenie.

Ambas funciones requieren que la molécula de DNA sirva como molde en el primer caso para la

TRANSCRIPCION de la información al RNA. Y en el segundo para la REPLICACION de la

información en las moléculas hijas del DNA.

Page 14: conceptos de genetica

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El genoma completo contiene suficiente DNA para codificar 1,5 millones de pares de genes, sin

embargo, los humanos tienen solo aproximadamente 100.000 proteínas esenciales. Esto implica que la

mayor parte del DNA no codifica, es decir, su información nunca es traducida pero sirve para regular la

expresión del gen.

REPLICACION DEL ADN

La función primaria de la duplicación o replicación del ADN es la provisión de progenies con la

información genética poseída por el progenitor por lo que debe ser completa, y llevada a cabo con alta

fidelidad para conservar la estabilidad genética dentro del organismo y de las especies.

La replicación o duplicación del ADN posee ciertas caracteristicas a destacar:

1. Es un proceso altamente complejo y ordenado que sigue una polaridad 5' a 3' típica de la

síntesis de todos los procesos génicos , incluyendo la síntesis de RNA y de las proteínas.

2. En las células eucariotas la replicación del DNA comienza en sitios múltiples y avanza

simultáneamente en ambas direcciones (es bidireccional).

3. Es semiconservadora, debido a que luego de la duplicación de una celula, las celulas hijas

poseen una hebra de ADN proveniente de su progenitora.

La replicación del DNA consta de tres pasos:

1)- Iniciación: Los múltiples sitios que sirven como origen de la replicación del DNA eucariótico

están escasamente definidos, sin embargo es evidente que la iniciación es regulada tanto en el espacio

como en el tiempo, ya que las burbujas inician el proceso en forma sincrónica.

Se cree que los dominios funcionales de la cromatina se duplican como unidades intactas, implicando

que los orígenes de replicación están localizados con especificidad respecto a las unidades de

transcripción.

Durante la replicación debe haber una separación de las dos tiras para que cada una sirva como

molde, esta separación es promovida por los factores de iniciación de la replicación que son conjuntos de

proteínas que son capaces de reconocer y asociarse transitoriamente al origen DE INICIO DE

Page 15: conceptos de genetica

15

REPLICACION para facilitar e inducir la apertura, desestabilizando temporariamente esa región.Dichas

regiones de iniciación de la replicación se corresponderian con secuencias de adn específicas

denominadas secuencias duplicantes autónomas las que serian reconocidas por las proteinas antes

mencionadas actuando como sitio de inicio de la replicación . En la apertura de la molécula de DNA hace

falta una enzima que continúe abriendo al DNA a partir de su punto de origen. Esa molécula es una

enzima que recibe el nombre de helicasa que se adelantan a la horquilla de replicación. Para estabilizar la

burbuja se requieren de moléculas de proteínas que mantienen la estructura de simple tira (proteína SSB

que es un tetrámero). Todo esto forma un complejo proteico denominado "REPLISOMA").

Además de la separación de las cadenas debe existir un desenrrollamiento de la molécula de DNA (un

giro por cada 10 pares de nucleótidos) para permitir la separación de las tiras. La función es

proporcionada por enzimas que introducen mellas en una tira de la doble hélice desenrrollada,

permitiendo por lo tanto que el proceso de desenrrollamiento prosiga, la mella una vez aliviada la tensión

en los extremos de la burbuja de replica-ción es rapidamente reparada o sellada (sin gasto de energía).

Estas enzimas encargadas de tal función son las topoisomerasas que se conocen de dos tipos. La

Topoisomerasa I que mella y sella una única hebra de DNA y la Topoisomerasa II que mella y sella las

dos cadenas a la vez.

La duplicación requiere de un segmento RNA corto que actúa como cebador sintetizado por una

enzima con actividad de RNA polimerasa (primasa) dada por la DNA polimerasa Ó (8 a 10 nucleótidos

de longitud). El grupo 3' OH del monofosfato recientemente agregado es entonces libre de llevar a cabo

un ataque nucleofílico sobre el siguiente trifosfato de desoxiribonucleótido.

La selección del desoxirribonucleótido apropiado depende del apareamiento de bases que dicta la

hebra patrón del DNA, conservándose estos por enlaces de hidrógeno. Estos fragmentos de DNA

agregados a un componente de RNA cebo que se conoce como fragmento de Okazzaki (hebra

discontinua).

2)- Elongación: Una vez sintetizado el primer de RNA por las enzimas con actividad de primasa

(DNA polimerasa alfa), la elongación es efectuada por las DNA polimerasas. En eucariontes se describen

las DNA polimerasas Alfa (Beta , Gama , Delta ).

La ADN Polimerasa Alfa es un complejo de varias subunidades. Una de las cuales posee actividad

polimerasa propiamente dicha. Sintetiza la hebra discontinua de DNA. También tiene actividad de

primasa, sintetizando RNAc (cebador)

Page 16: conceptos de genetica

16

La ADN Polimerasa Beta parece ser una única cadena polipeptídica de gran peso molecular. Es

menos activa que la anterior. Intervendría en la reparación, sintetizando moléculas de DNA en los

espacios vacíos dejados por los RNA cebos.

La ADN Polimerasa Gama es una polimerasa mitocondrial. Actúa en la duplicación de su genoma

(DNA que existe en forma circular).

La ADN Polimerasa Delta sintetiza la hebra líder o continua de DNA.

Una molécula de DNA Polimerasa Alfa es capaz de polimerizar aproximadamente 100 nucleótidos

por segundo. Una velocidad 10 veces menor que la de las bacterias. Esto puede deberse a la interferencia

producida por los nucleosomas.

Se replica el genoma entero en los mamíferos en nueve horas. Este es período promedio requerido

para la formación de un genoma tetraploide a partir de un diploide.

Esto requiere la presencia de orígenes múltiples de replicación del DNA. (Se verá más adelante).

El fenómeno de elongación en eucariontes no es simétrico entre los dos filamentos modelos. La

progresión de la horquilla de replicación (o burbuja) se hace en sentido 3' -- 5'(la lectura, la síntesis es en

sentido 5- 3) de uno de los filamentos de DNA modelo.

En este sentido la DNA polimerasa delta circula a partir de un solo segmento de RNA cebador

ubicado a continuación de la horquilla de replicación y forma un filamento continuo de DNA (filamento

director, hebra líder).

El otro filamento, por el contrario, no puede ser recorrido por la DNA polimerasa alfa sino en el

sentido inverso de la progresión de la horquilla porque sobre este filamento la horquilla avanza en el

sentido 5' a 3' por lo que es necesario que se sintetizan múltiples fragmentos de RNAc (RNAc = RNA

cebador) (como habíamos dicho esta actividad la lleva a cabo la misma DNA pol alfa). En esta hebra de

síntesis discontinua se encuentran los fragmentos de Okazzaki formados por el RNA primer y DNA cuyo

tamaño es de 200 pb.

La DNA pol delta cataliza la elongación de cadena incorporando DNTP (desoxinucleótidos

tri-fosforados) en forma de DNMP(desoxinucleótidos monofosforados), con una tasa de error de una base

Page 17: conceptos de genetica

17

por cada 103 a 105 permitiendo que el RNA naciente se extienda en forma extremadamente precisa como

una molécula de DNA.

3)- Terminación: Tras la replicación, el replisoma debe separarse y la ADN polimerasa altamente

procesativa debe liberarse de la hebra molde, sin embargo el mecanismo íntimo todavía se desconoce.

Apenas se han determinado genes de terminación y no parece que existan secuencias específicas de

terminación. La replicación culmina cuando se completa todo el genoma. Y tras la replicación del

cromosoma entero las dos moléculas bica-tenarias del DNA son separadas por la DNA topoisomerasa I.

En los mamíferos (eucariotas) el complejo de iniciación comienza a remover los RNAc llenándose los

espacios libres con el desoxinucleótido de base apropiada. Los RNA cebadores formados son totalmente

removidos por la Ez. Ribonucleasa H (a excepción de RNAc mitocondrial) y rellenado por la DNA pol ß

en ambas hebras. Luego son ligados los nuevos fragmentos al DNA neoformado a través de DNA ligasas.

Asimetría de la transcripción: la asimetría de la transcripción significa que solamente se transcribe para cada gen una de las dos

hélices de ADN, la hélice que se toma como molde para producir el ADN se la denomina hélice codificadora o hélice con sentido y la otra

hélice de ADN, la que no se transcribe, se la denomina hélice estabilizadora o hélice sin sentido.

http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripcion.htm#elonga

ción

Page 18: conceptos de genetica

18

Telómeros

Siempre el extremo 3' de la cadena de DNA es mucho más largo que el extremo 5'. Estos extremos

son ricos en G. En realidad, existe una secuencia repetitiva o hexámero (que se repite entre 75 a 100

veces). El hexámero típico del telómero humano es TTAGGG.

Esta región se caracteriza por:

- Puede plegarse, y producir apareamientos no comunes entre nucleótidos de guani-na. Así se protege

al DNA de la acción de las exonucleasas.

- El extremo 3' corresponde a la hebra discontinua en la duplicación del DNA. Sabiendo que se

requieren 200 pb entre dos primers para la acción enzimática, existiría una peque-ña fracción del DNA

próximo al extremo 3' que no sería duplicado por la inexistencia de los 200 pb. Al existir una

prolongación del extremo 3', la enzima puede sintetizar el RNA cebador sobre el telómero de la cadena,

impidiéndose así la duplicación incompleta del DNA.

- Si un cromosoma no tuviera telómero, se asociaría fácilmente a otro cromosoma. Esa asociación

produciría un número anormal de cromosomas.

Se puede constatar a nivel citológico que la presencia de un telómero es algo así como un capuchón

en el extremo 3' de la cadena de DNA, produciendo la asimetría de las cadenas complementarias.

La enzima con función de síntesis de telómeros es la Desoxirribonucleotidil transferasa terminal

(telomerasa) que en el extremo 3' añade el polihexanucleótido terminal en un número de 75 a 100;

generando la asimetría funcional del DNA.

La telomerasa es la enzima responsable de la síntesis de la estructura antes mencionada, permite

completar la síntesis de DNA sobre la hebra discontinua y explica la ausencia de pérdida de material

genético a través de múltiples ciclos de replicación.

Cuándo ocurre la síntesis de DNA?

En las células animales y en el humano ocurre solamente en un período específico de la vida celular.

Page 19: conceptos de genetica

19

Esta es la fase sintética o "S", el cual está separado temporalmente de la fase mitótica por períodos no

sintéticos referidos como etapas G1 y G2 que se presentan antes y después de la fase S. La célula regula

la síntesis del DNA burdamente a traves de mecanismos como el de ciclinas cdk 1 y 2 permitiéndo que

ocurra solo en dicha fase “s” La síntesis de Histonas nuevas coincide con la division celular y la

replicación del ADN. Parece ser que las histonas recién sintetizadas forman nucleosomas con el duplex de

la hebra retardada, mientras que las originales permanecen en el duplex director o conductor.

Muchos de los virus que producen cáncer son capaces de interrumpir la aparente restricción que

normalmente controla la entrada de las células en la fase "S" pero es probable que intervenga la

fosforilación de las moléculas de proteínas del huésped.

Durante la fase "S" las células eucarióticas contienen mayor cantidad de DNA pol Ó y dNTP.

Durante esta fase el DNA nuclear es replicado completamente "una vez, y sólo una". Es debido a que

la cromatina es marcada para impedir esa nueva réplica, por un mecanismo de metilacion en una region

especifica conocida como ORC/OGT.

En general un par cromosómico se replicará simultáneamente y dentro de una porción fija de la fase

"S", y se cree que la regulación de la síntesis es una propiedad intrínseca de cada cromosoma individual

.

http://www.tecnovet.uchile.cl/AlasbimnImages/tc-2002(1)-soto-fig001.jpg

Page 20: conceptos de genetica

20

ESTRUCTURA DEL GEN EUCARIOTA

El ADN posee segmentos funcionales, conocidos como “genes”.

Desde el punto de vista bioquímico, éstos segmentos se definen como la secuencias de ADN que

contienen la información requerida para fabricar una molécula de ARN; y si esta última corresponde a

un ARN mensajero; a partir de él, construir una proteina.

Existen sitios determinados dentro del cromosoma, donde se localizan los genes, llamados locus

(loci).

A su vez, el gen posee varias partes funcionales:

Promotor: sitio de de inicio de la transcripción y/ o que señala a partir de qué nucleótido debe

iniciarse la misma. Suele localizarse cerca del extremo 5’ del segmento codificador.Se incluirian las cajas

TATA y GC o CAAT.

Segmento Codificador: es la porciòn de información genética que contiene la secuencia a

transcribirse. Dentro de este segmento existen partes codificantes (Exones) y no codificantes (Intrones).

Segmentos Reguladores: determinan cuando debe transcribirse el gen y cuantas veces debe hacerlo.

Existen dos tipos de reguladores, los Amplificadores(enhancers) y los Inhibidores(silencers).Secuencias

de Terminación; marcan la finalización de la síntesis de ARN.

Page 21: conceptos de genetica

21

http://web.educastur.princast.es/proyectos/biogeo_ov/2BCH/B4_INFORMACION/T404_TRAS_TRADU

/informacion.htm

TRANSCRIPCION

Comprende la síntesis de una molécula de RNA a partir de DNA. Es un proceso complejo en el que

intervienen enzimas denominadas RNA polimerasas y otras proteínas relacionadas. Los pasos requeridos

para la transcripción son:

1)- Iniciación.

2)- Alargamiento.

3)- Terminación.

El proceso se comprende mejor en procariontes y virus, pero se han hecho considerables

avances en descifrar la transcripción en células de mamíferos.

Page 22: conceptos de genetica

22

Es importante entender los principios que rigen la regulación y metabolismo del RNA ya que su

modificación es la que regula la tasa de síntesis proteica y la variación en los cambios metabólicos.

Es esta la forma en que los seres vivos se adaptan a los cambios del medio.

El proceso de síntesis de RNA es semejante en procariontes y eucariontes, siendo las principales

características en eucariontes:

1.- El sitio de síntesis de cada molécula de RNA (RNAr en nucleólo y RNAm - RNAt en el núcleo).

2.- Ciertas modificaciones post-transcripcionales o proceso de maduración de los RNAs (mas

adelante descriptas)

3.- El alto grado de complejidad del dispositivo trancripcional.

Como habíamos dicho la enzima encargada de la síntesis de RNAs es la RNA polimerasa, que fue

mejor estudiada en E. coli (procariotas) y sirvió como modelo para las otras RNA polimerasas. Se sabe

que está formada por dos subunidades alfa , una ß, una ß' y un factor sigma o proteína reguladora que

modifica la especificidad del reconocimiento al promotor.

Tipos de Polimerasa:

ENZIMA TRANSCRIBE PRODUCTO LUGAR

ARN Polimerasa I Genes de clase 1 ARNr Nucleolo

ARN Polimerasa II Genes de clase 2 ARNm Núcleo

ARN Polimerasa III Genes de clase 3 ARNt-ARN5s Núcleo

Esta enzima es la responsable de la polimerización de nucleótidos (incorporación de ribonucleótidos

trifosforados como monofosforados, al romper 2 enlaces de alta energia en el RNTP para generar los

enlaces fosfodiéster) se adhiere al promotor en la tira codificadora, y se comienza la síntesis de RNA en

el punto de iniciación, continuando el proceso hasta alcanzar una secuencia de terminación. Este DNA

que sirve como plantilla de transcripción se denomina “unidad de transcripción" comprendiendo desde el

sitio de iniciación a la terminación de dicho proceso. El ARN sintetizado en dirección 5' a 3' a partir de

esa plantilla recibe el nombre de “transcripto primario” o "copia primaria".

Page 23: conceptos de genetica

23

SEÑALES DE INICIO DE LA TRANSCRIPCION .Transcripción de Genes tipo II

En los mamíferos (eucariontes) las señales de transcripción son complejas :

Hay dos elementos que son promotores proximales.

- El primero define donde comenzar la transcripción.

- El segundo con cuánta frecuencia lo hará.

Es probable que la RNA pII se una al DNA en la región de la caja TATA (ubicada a

aproximadamente 32 nucleótidos corriente arriba y comience por ende la transcripción 32 nucleótidos

corriente abajo de esta caja, por lo tanto, estaría implicada en proporcionar la señal de dónde se iniciará la

transcripción.

Secuencias alejadas del sitio de iniciación corriente arriba (-80 pb) forman otro elemento (promotor)

sencillo encargado de dar la frecuencia del fenómeno (la mutación en este sector reduce de 10 a 20 veces

la frecuencia de transcripción). Estos elementos se conocen como cajas GC y CAAT, cada una de ellas se

une a una proteína específica que activaría a dichos promotores: SP1 para la caja GC y CTF o c/EPB,

NF1 y NFy para la caja CAAT.

La frecuencia de inicio de la transcripción depende de estas interacciones proteicas con DNA,

mientras que la interacción proteína-DNA en la caja TATA asegura la fidelidad de lectura de inicio del

DNA. Se dice que estas proteínas están actuando en trans porque se forman a partir de la lectura del DNA

ubicado en otros cromosomas. En tanto que las cajas TATA, GC y CAAT actuarían en forma cis porque

están en el mismo DNA a ser transcripto.

http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripcion.htm#elonga

ción

Page 24: conceptos de genetica

24

Hay una tercera clase de elementos que pueden incrementar o reducir la tasa basal de la velocidad de

transcripción (genes amplificadores o silenciadores) conocidos también como Enhancer que pueden

encontrarse corriente arriba o abajo del sitio de iniciación.

Al contrario de los elementos promotores proximales, los amplificadores o silenciadores pueden

ejercer sus efectos aunque se encuentren a cientos o miles de pb lejos de las unidades de transcripción

localizados en el mismo cromosoma (también están en posición cis).

La expresión de genes de tejido específicos, por ejemplo, el gen de la albúmina es media-da por

secuencias específicas del DNA.

Una característica común de todos los elementos basales y reguladores es que está implicada en la

interacción de proteínas específicas con el DNA. Las señales para terminar la transcripción ejecutada por

la RNA p II eucariótica son poco comprendidas, creyéndose que las mismas existen bastante lejos

corriente abajo de la secuencia codificadora de los genes.

Page 25: conceptos de genetica

25

http://web.educastur.princast.es/proyectos/biogeo_ov/2BCH/B4_INFORMACION/T404_TRAS_TR

ADU/diapositivas

Page 26: conceptos de genetica

26

Genes de clase III. Su transcripción y ubicación intragénica de los elementos promotores:

La RNA p III reconoce un promotor que está en el interior del gen. En el caso de los genes

eucarióticos para la síntesis del RNAt existen dos bloques promotores separados internos, llamados

bloques A y B que actúan como promotores intragénicos.

Las secuencias de los bloques A y B existen en la molécula madura del RNAt, en regiones que están

altamente conservadas y participan en la formación del ASA DHU y en el asa C (la distancia óptima

entre los bloques A y B para la función del promotor es entre 30 a 40 pb corriente arriba del bloque A).

Para el segmento 5s de RNAr parece haber un patrón proteínico específico de transcripción, el cual,

una vez que se ha unido al promotor intragénico para ese gen, probablemente interactúe en una molécula

de RNA p III para colocar sus sitios catalíticos sobre el punto de inicio de la transcripción del DNA..

La transcripción de los genes del RNAr 5s también comienza con la formación de un complejo

estable de transcripción constituído por los factores TF III A, TF III B, TF III C. El primer factor proteína

que se une al DNA es la TF III A que reconoce y se une fuertemente a nucleótidos específicos del bloque

C y al elemento intermedio (E.I.) de ICR (complejo de reconocimiento de inicio), alinéandose con el gen

al interaccionar con nucleótidos del bloque A.

Luego se une el TF III C que interacciona con el TF III A y con el gen del RNAr 5s. A continuación,

el TF III B se une al anterior complejo y la RNA p III se une al complejo estable de transcripción y

comienza el proceso en el sitio +1.

Los factores de transcripción de los genes de clase I se unen a sitios promotores que varían de

organismo en organismo.

Genes de clase I. Su transcripción y ubicación extra/intragénica de los elementos promotores

En las células eucarióticas los genes que codifican las moléculas de RNAr se transcriben como un

único precursor grande.

Page 27: conceptos de genetica

27

Las secuencias promotoras de los genes de clase I se ubican justo antes del sitio de iniciación de la

transcripción. En una unidad repetitiva del gen conocida como "espaciador no transcribible".

Las distintas unidades repetitivas varían de organismo en organismo pero tienen elementos comunes:

- Todos los promotores consisten en varios sitios de unión que pueden subdividirse en tres regiones

importantes.

Se extiende a lo largo del sitio de iniciación, generalmente de -40 hasta +20 y se requiere para la

iniciación de RNA p I.

Es la región de unión al factor de transcripción TFID que al igual que la unión del TFII D a la región

TATA ayuda a la polimerasa a encontrar correctamente el sitio de iniciación (región de -40 a -15).

Esta región se localiza entre -150 y -100 y está relacionada en la U de factores de transcripción (TFI

A, TFI C, UBF-I, SLI).

El UBF-I se une entre la región -120, -105. El TFI C se une al complejo TFI D-gen del RNAr y el

factor SLI. Luego ingresa el TFI A e ingresa la RNA p I completando la maquina-ria transcripcional de

genes clase I.

Sitios de terminación para todas las clases de genes transcribibles.

La etapa de terminación es poco conocida. No se conoce el sitio génico donde se disocia el complejo,

pero en todos los casos se sabe que la transcripción finaliza en un sitio único.

Las tres RNA p eucarióticas terminan en sitios que poseen un agrupamiento de T sobre la cadena no

molde del gen.

Estas filas de T (T-runs) van a ser la única secuencia necesaria para la terminación, ya que no hay

regiones obvias con simetría d y ad que permitan la formación de horquillas en el RNA como ocurre en

bacterias.

Page 28: conceptos de genetica

28

MODIFICACIONES POST-TRANSCRIPCIONALES

Introducción: A diferencia del RNAm de los procariotas que participa en la síntesis proteica a

medida que es transcripto, el RNAm eucariótico formado no lo hace, dado que las moléculas de RNA

naciente son sintetizadas en moléculas algo mayores que la molécula final funcionalmente activa .

No se trata directamente de RNAm sino de su precursor de mayor tamaño (RNA nuclear heterogéneo

o premensajero. En efecto, muchas de los trancriptos primarios del RNA contienen o pueden originar mas

de una molécula.de ARN maduro .

Es así que en eucariotas el procesamiento de estos precursores es requerido para la generación de

RNAs funcionalmente activos.

El procesamiento sucede primariamente dentro del núcleo e incluye fundamentalmente para el RNA heterogéneo nuclear ciertas modificaciones :

1.- Escisión de las secuencias no codificantes (llamado corte y empalme).

2.- Adición de nucleótidos suplementarios en sus dos extremos. Modificaciones de nucleótidos.

3.- Salidas del RNAm fuera del núcleo, hacia el citoplasma y más particularmente al RER

Sin embargo, en las células de mamíferos, el RNA nuclear con terminaciones 5' rematadas no forman

parte del RNAm citoplasmático en el 50 al 75% de los casos.

El RNA nuclear perdido es notablemente mayor que el que se puede explicar por la pérdida de

secuencias intercaladas solas.

1.- Escisión de las secuencias no codificantes:

Las copias primarias de los genes estructurales contienen RNA complementario a las trans-cripciones

de secuencias intercaladas, sin embargo las secuencias de intrones (porciones no codificantes para la

síntesis proteica) del RNAnh son separadas de la copia y los exones (porción codificante del RNAnh en la

Page 29: conceptos de genetica

29

síntesis proteica) son empalmados de manera apropiada en el núcleo antes de que la molécula de RNAm

resultante, aparezca en el cito-plasma para la traducción. Este proceso se conoce "splicing" o corte y

empalme.

La mayoría de las moléculas de RNAnh de los eucariotas contiene intrones. A veces hasta unos 50

por gen. El tamaño de un intrón varía entre 65 y 10.000 nucleótidos, con la excepción de las secuencias

consenso de corta longitud que aparecen en los sitios de splicing y en el sitio de ramificación. Las

secuencias de los distintos intrones no son para nada parecidas entre sí.

El splicing del RNAnh no implica una reacción de "autocatálisis" (como los intrones de genes de tipo

I y II) y depende de un conjunto de 4 ribonucleoproteínas (snRNPs) que se ensamblan para formar el

complejo de splicing y lograr que la reacción sea de forma ordenada y secuencias.

El proceso comienza con:

1.- Se une la RNP U1 al sitio de splicing 5' mediante el apareamiento de bases entre la RNP U1 y el

RNAnh.

2.- Luego la RNP U2 se une al sitio de ramificación del intrón, mientras que una RNP U5 se adhiere

al sitio de splicing en 3'.

3.- Las tres RNPs unidas se desplazan coordinadamente, se unen a la RNP U4 + U6 y escin-den el

intrón. Esta reacción requiere la hidrólisis de ATP.

La reacción catalizada por el complejo de splicing es en realidad análoga a las de auto-splicing.

En una primera etapa se produce transesterificación. Hay ataque al grupo 2' OH del sitio de

ramificación, se abre el sitio de splicing 5'.

En una segunda etapa de transesterificación, los exones se unen y el intrón resulta escindido con una

estructura de lazo ( la reacción dura de algunos segundos hasta 20 minutos).

Algunas moléculas de RNAr contienen intrones. Hasta ahora han podido ser caracterizado dos tipos

de intrones:

- Los del grupo I y los del grupo II. Algunos de estos intrones se escinden por sí solos sin la ayuda de

proteína alguna.

Page 30: conceptos de genetica

30

Los intrones del grupo I son retirados como moléculas lineales. En estos intrones el autosplicing

requiere magnesio y un cofactor de guanosina. Este se añade al extremo 5' terminal del intrón con una

reacción de transesterificación, liberándose el exón en 5'.

A continuación, el grupo 3' OH del extremo terminal 3' del exón 5' ataca al extremo del exón 3' en

otra reacción de transesterificación.

El intrón liberado así es capaz de catalizar su propia ciclación.

Esta reacción es reversible, lo que sugiere que estos intrones son ejemplos de enzimas de RNA.

Los intrones del grupo II que verifican autosplicing, suelen encontrarse en RNAr mitocondrial y en

los genes que codifican para proteínas. Estos no requieren cofactores de guanosina, pero sí espermidina.

El mecanismo incluye:

El ataque al sitio de splicing 5' por el grupo 2' OH de un resto de adenosina del intrón.

El ataque subsecuente del grupo 3' OH del exón 5' al sitio de splicing 3'. Une los dos exones y libera

el intrón con una estructura de lazo.

La existencia de intrones pone en duda algunas ideas bioquímicas que han perdurado por años.

Hoy en día se piensa que los genes bacterianos carecen de interés. No porque no los hayan podido

adquirir, sino porque los han perdido a lo largo del proceso evolutivo.

Los intrones podrían haber permitido la rapida evolución de los organismos primitivos al reordenar su

DNA más fácilmente.

Este concepto, denominado "reordenación de exones" se encuentra apoyado por la observa-ción de

que muchas proteínas están compuestas por varios dominios discretos. Cada uno de los cuales se halla

codificado por un exón determinado. Es más, algunos organismos euca-riotas poseen muy pocos genes

con intrones y de hecho podrían haber sustituído casi todos sus exones originales por "pseudogenes

funcionales"

Page 31: conceptos de genetica

31

2.- Adición de nucleótidos suplementarios:

Antes de la salida del núcleo, se unen al extremo 5' del RNAm que lleva un residuo fosfa-to sobre el

OH en 5' de la última ribosa, es bloqueado por el agregado de un capuchón o CAP (guanina metilada en

posición 7), la fijación se hace con pérdida de un residuo fosfato.

En el extremo 3', que existe una secuencia AATAAA que sirve de señal para una nucleasa que separa

toda la secuencia de nucleótidos antes de esta señal. Las AAA restantes son reconocidas por una enzima

llamada adenilatotransferasa que fija una secuencia de 100 a 200 nucleótidos de A o poli A (el proceso

dura uno a dos minutos). La transferasa requie-re ATP.

La función del CAP y de la poli A se presume sirven para el paso a través de la M.C. de los RNAm y

los protegen en el citoplasma contra las ribonucleasas. Además, el CAP fija proteínas específicas e inicia

la traducción proteica.

Modificaciones aportadas al RNAr:

Sus precursores son de muy alta masa molecular.

Su ruptura permite la eliminación de intrones (como se vio) y la formación de RNAr de menor

tamaño.

Es efectuado por endoribonucleasas específicas.

Algunos OH en 2' de ribosa son metilados por un sistema enzimático que utiliza SAM (s-adenosil

metionina como donador de metilos.

Una célula hepática fabrica en promedio 3.000 ribosomas por minuto.

Modificaciones aportadas a los RNA pequeños:

Las moléculas de RNAt son sintetizadas en forma secuencial como precursor de gran tamaño,

escindido por distintas ribonucleoproteínas: P, Q y Tr.

1)- Algunas de sus bases son metiladas por transmetilasas: residuos de Uridina son transformados en

T.

Page 32: conceptos de genetica

32

2)- Los nucleótidos destinados a volverse seudouridinas son isomerizados.

3)- Después de las rupturas se producen adiciones de nucleótidos.

- Los tres nucleótidos CCA se agregan al extemo 3'. Este proceso se localiza en el cito-plasma con un

proceso de renovación de estos 3 nucleótidos que son quitados y reinserta-dos en forma permanente.

- La importancia de nucleótidos de A en posición 3' terminal, cuyos OH libres en 2' o 3' llevan los AA

activados durante el proceso de síntesis proteica.

Las otras pequeñas moléculas de RNA nuclear forman parte de la fracción llamada heterogé-nea

(RNAU), son sintetizados en forma de una gran molécula de precursor y luego son fraccionadas y sufren

modificaciones.

Existen millones de estas en el núcleo donde están asociadas con proteínas por uniones puentes de H

o heteropolares para formar las RNPs.

Los RNAU no tienen poli A en su extremo 3' pero tienen CAP en el 5'.

Otras modificaciones del RNAt:

-Enlaces glucosídicos reordenados.

-Remoción de un intrón próximo al asa anticodón de 10 a 40 nucleótidos de longitud.

-Alquilación de nucleótidos.

-Son transcriptos como grandes moléculas con la secuencia para más de un RNAt que por proceso

nucleolítico son reducidos de tamaño a nivel nuclear.

Page 33: conceptos de genetica

33

http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/adntema3.htm#Replication%20of%20the%20eukaryotic%20c

TRADUCCION DEL DNA. SINTESIS PROTEICA. PROCESO POST-TRADUCCIONAL

Introducción : Iniciamos la última reacción de síntesis que tiene lugar en el proceso del flujo de

información biológica: la traducción del RNAm y la polimerización de los aminoácidos para formar

proteínas. Esta también está dirigida por un molde (RNAm) y lleva la dirección de síntesis 5' a 3' de las

otras reacciones, dividiéndose también en: Iniciación, Elongación y Terminación. Sin embargo, consta

además de una etapa previa de formación del precursor activado: el ami-noacil RNAt.

Page 34: conceptos de genetica

34

Definición: Se llama biosíntesis de proteínas al conjunto de reacciones por las que los aminoácidos se

enlazan unos con otros por uniones peptídicas en el orden dictado por la secuencia de las bases de un

RNAm con el fin de formar un polipéptido. Este proceso se realiza en citoplasma.

Traducción: porque el lenguaje en el que se expresa el mensaje genético cambia completa-mente: "a

la secuencia de bases del RNAm corresponde una secuencia de aminoácidos de la proteína.".

Post-traducción: agrupa todos los fenómenos que modifican al péptido inicial, rupturas proteolíticas,

reacciones de hidroxilación de algunos residuos de aminoácidos (AA) y sobre todo glucosilación para

formar glucoproteínas.

Componentes de la traducción:

1)- RNAm.

2)- RNAt.

3)- AA.

4)- Ion Mg++.

5)- Moléculas de ATP y GTP.

6)- Ribosomas (60s y 40s).

7)- Enzimas de activación de aminoácidos y del complejo de iniciación (eIF1, eIF2, eIF3, eIF4A-4B-

4C-4E-4F, eIF5, eIF6).

1)- Activación de aminoácidos:

Se realiza por medio de enzimas aminoacil RNAt sintetasas que combinan las moléculas de AA con

ATP para formar adenilatos de AA que son anhídridos de ácidos mixtos en un estado energético activado.

Son altamente específicas para un tipo de AA y un tipo de enzima (reconocimiento estereoquímico muy

preciso basado en la estructura misma de la enzima).

Su tamaño varía desde 300 residuos de AA a 1.000 (para triptófano, valina e isoleucina

respectivamente), tiene 5 dominios funcionales, reconoce al AA por su dominio1 determina-do por la

Page 35: conceptos de genetica

35

carga de la cadena lateral y el tamaño. El dominio 2 elimina los AA fijados erróneamente, cuando se une

al adenilo. El dominio 3 fija al ATP y las hace reacciones con el COOH del AA, formando un adenilato

AA (este recupera a la E perdida por el ATP en forma de pirofosfato y AMP).

El dominio 2 tiene un poder de reconocimiento del aminoacil adenilo aún más selectivo que el

primero y una actividad de hidrolasa frente a los AA-adenilos formados por error, solo el AA-adenilo

correspondiente resiste esta hidrólisis.

El dominio 4 reconoce al RNAt específico del AA-adenilo (esto es un ejemplo de proteína y ácido

nucleico en interacción), no reconociendo solamente el anticodón sino una secuencia de bases del brazo

del RNAt.

El dominio 5 efectúa la fijación del radical aminoacilo sobre el OH en 2' o 3' de la ribosa situada en el

extremo 3' del RNAt, ya reconocida y fijada por las uniones no covalentes sobre el dominio 4, esta unión

es de tipo éster (COOH del AA + alcohol 2' o 3' de la ribosa) formada con liberación de AMP y

recuperación de la E en la molécula de AA-RNAt en estado activado, luego se separan juntos de la Enz de

activación y acceden al RNAm y ribosomas, donde el RNAt sirve de adaptador del AA sobre la matriz del

RNAm.

2)- Iniciación: La diferencia existente entre procariontes y eucariontes se debe princi-palmente a que

el RNAm eucariótico es transformado antes de ser traducido.

La transformación del RNAm eucariótico sufre los procesos de: añadir el CAP al extremo 5' (remate

de 5', 7 metil guanosil trifosfato), sufre "splicing" y es transportado del núcleo al citosol, esto le permite al

RNAm formar estructuras secundarias extensas y que puedan ser recubiertas por proteínas. Para retirar

estas proteínas y dejar al descubierto el RNAm se necesitan varios factores de iniciación: eIF-4A, eIF4B,

eIF-4F (factor inicia-dor eucariótico) y eIF-4E.

A su vez, el CAP facilita la unión de muchas moléculas de RNAm a la subunidad ribosómica de 40s.

El factor de iniciación eIF-4F se conoce como proteína de unión al CAP (CBP), interaccio-na con el

5' 7 metil guanosil trifosfato y ayuda a seleccionar el codón de iniciación correcto, que generalmente es el

AUG situado en sentido 3' con respecto al CAP5'. Este mecanismo impide que el ribosoma pueda

reconocer codones AUG del RNAm en situación inter-na. La proteína CBP hidroliza una molécula de

ATP durante el reconocimiento del codón de iniciación en eucariontes.

Page 36: conceptos de genetica

36

El RNAr de 18s de la subunidad de 40s se une entonces a una región del RNAm que precede al

primer codón traducido. Esta unión requiere la presencia de un factor proteínico, el Factor de Iniciación 3

(eIF3).

La iniciación de la síntesis proteica eucariótica podría dividirse entonces en varias etapas:

Se disocian las subunidades 40s y 60s del ribosoma de 80s estando implicados factores de iniciación

eIF3, eIF-4C y el eIF6.

El eIF3 y el eIF4C se unen a la subunidad 40s mientras que el IF6 se une a la subunidad 60s.

La subunidad 40s se une al complejo ternario formado por el IF2 + GTP y por el RNAt iniciador

aminoacilado (RNAti-metionina), el GTP actúa como efector alostérico.

El RNAm y los factores de iniciación que lleva unidos (eIF-4A, 4B, 4E y 4F (CBP)) se une a la

subunidad 40s completándose la formación del complejo de iniciación 40s que en presencia del eIF1

adhiere el anticodón del RNAt al primer codón.

Ya formado el complejo de iniciación el eIF5 provoca la liberación de los otros factores de iniciación

y la hidrólisis del GTP.

Esto permite que la subunidad ribosómica de 60s se una al complejo formando el complejo de

iniciación de 80s.

Así se completa la iniciación de la síntesis proteica.

El ribosoma completo posee dos sitios para moléculas de RNAt, el sitio peptidilo (sitio P) que

contiene el peptidil RNAt adherido a su codón y el sitio aminoacilo (sitio A) unido al aminoacil RNAt.

3)- Elongación: En el ribosoma de 80s completo formado durante el proceso de iniciación el sitio A

está libre ya que el sitio P está ocupado por el primer aminoacil RNAt. La unión del AAcil RNAt

apropiado en el sitio A requiere del reconocimiento del codón apro-piado, y está a cargo del eIF 1Ó que

acopla el AAcil RNAt en el sitio A, formando un complejo con el GTP y el AAcil RNAt entrante, lo

ubica en el codón correspondiente, rompe el GTP a GDP formándose la unión codón-anticodón, y luego

interviene el eIF 1ß que reci-cla al eIF 1Ó haciendo que este se vuelva a unir a otro GTP.

Page 37: conceptos de genetica

37

El grupo amino del nuevo aminoacil RNAt lleva a cabo un ataque nucleofílico sobre el grupo

carboxilo esterificado del peptidil RNAt que ocupa el sitio P, esta reacción la realiza la peptidil

transferasa de la subunidad ribosómica de 60s, como el AA del AAcil RNAt ya está activado no se

requiere de E para esta reacción. La reacción da por resulta-do la adherencia de la cadena peptídica en

crecimiento al RNAt en el sitio A.

4)- Terminación: Después de múltiples ciclos de alargamiento que culminan en la polimerización de

aminoácidos específicos para una cadena peptídica se reconoce un codón sin sentido o terminal del

RNAm que aparece en el sitio A, este no es reconocido por el RNAt alguno. Intervienen entonces los

factores de terminación o liberadores (codones de termi-nación UAA- UAG- UGA). En eucariotas existe

un factor de liberación o RF que reconoce la señal de terminación y unido al GTP y la peptidil transferasa

promueve la hidrólisis del enlace entre el péptido y el RNAt que ocupa el sitio P, liberándose la proteína y

el RNAt del sitio P.

El ribosoma 80s entonces se disocia en sus Sub Unidades 40 y 60s para ser recicladas.

Un solo ribosoma de mamífero es capaz de sintetizar aproximadamente 100 enlaces peptídicos por

minuto. Los polirribosomas (ribosomas múltiples sobre la misma cadena de RNAm) que activamente

sintetizan proteínas pueden existir como partículas libres o en el citoplasma, o pueden estar adheridos a

láminas de material citoplasmático membranoso conocidos como retículo endosplámico rugoso, sus

proteínas sintetizadas son introducidas al interior de sus cisternas y exportadas desde allí. Algunas son

empaquetadas en el Golgi en forma de zimógeno para su eventual exportación.

Las partículas polirribosómicas libres en el citosol son responsables de la síntesis de proteínas

requeridas para las funciones intracelulares.

Requerimiento energético:

La unión del aminoácido al RNAt requiere la hidrólisis de un ATP a un AMP (equivalente a 2 ATP),

la entrada del AAcil RNAt al sitio A necesita la hidrólisis de un GTP a GDP, la translocación de un

peptidil RNAt de nueva formación desde el sitio A hacia el P por medio del FE2 necesita la hidrólisis de

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un GTP a GDP, por consiguiente, los requerimien-tos energéticos para la formación de un enlace

peptídico incluyen el equivalente a la hidrólisis de:

- 2 moléculas de ATP a ADP y 2 de GTP a GDP o la hidrólisis de 4 enlaces

fosfato de alta energía.

http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/adntema3.htm#Replication%20of%20the%20eukaryotic%20c

BIOSINTESIS DE LAS PROTEINAS SOLUBLES Y DE MEMBRANA

En los eucariontes se realiza según tres modalidades.

1)- Se desarrolla internamente en el citoplasma donde los ribosomas permanecen libres, se sintetizan

aquí las proteínas citoplasmáticas y algunas que lleguen a las mitocondrias.

2)- Permite la síntesis de cierto número de proteínas mitocondriales, situado en el líquido

mitocondrial.

3)- Se produce en el retículo endoplásmico y permite la síntesis de las proteínas que se van a secretar

y las que se fijen a la membrana celular.

Biosíntesis de proteínas en Retículo Endoplásmico Rugoso (RER)

Page 39: conceptos de genetica

39

Todas las proteínas formadas en el RER poseen a continuación del residuo de metionina N-terminal

una secuencia de 10 a 30 residuos de aminoácidos apolares a menudo con secuen-cias KDEL (Lis-Asp-

Glu-Leu). Es lo que se llama "secuencia señal" que tiene dos funciones:

1)- detiene temporariamente la traducción del RNAm mientras permanece en el citoplasma.

2)- fija el RNAm por medio de los ribosomas a las membranas del RER con el fin de intro-ducir la

proteína a una vesícula.

Cuando una secuencia señal emerge del ribosoma sobre el que han sido traducidos los 30 primeros

codones, es reconocida por una partícula que circula en el citoplasma llamada de "reconocimiento de

señal" (SRP) constituída por dos moléculas de RNA-7s y 6 proteínas.

Esta se fija por el extremo del RNAm y sobre el RNAr por complementariedad de bases.

Una de las proteínas de la SRP se fija sobre la secuencia señal.

Otra parte de la SRP posee dos conformaciones:

1)- Mientras no está fijada a la membrana del RER se fija al ribosoma, y bloquea la elongación.

2)- Después de la fijación sobre la membrana, la proteína cambia de conformación. No tiene más

efecto inhibidor y la traducción se reinicia.

LA SRP conduce el RNAm y su ribosoma sobre la membrana del RER donde proteínas de

membra-na lo reconocen y fijan, una proteína llamada de "atracada" reconoce la secuencia señal, la atrae

y la hace atravesar la doble capa lipídica, haciendo que la continuación de la traducción provoque la

entrada progresiva de toda la proteína en la cisterna, por una especie de orificio sin pasar por el

citoplasma porque el ribosoma se adhiere a la mem-brana.

La proteína internalizada lleva enzimas a su paso, una de ellas actúa muy poco tiempo después, es la

peptidasa señal que rompe el conjunto de la secuencia señal, lo que expli-ca que no se encuentre la

metionina N-terminal en las proteínas definitivas o maduras.

Cuando un ribosoma se fija a la membrana del RER el RNAm se desplaza por sacudidas de 3 en 3

bases y al llegar a 80 otra pequeña subunidad ribosomal se asocia al extremo 5', así como un metionil

RNAt y los factores de iniciación. Una vez que la secuencia señal es traducida, la partícula SRP se le

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40

asocia y fija el ribosoma a la membrana, luego la proteína es vertida en la cisterna. El proceso se reinicia

para fijar otro ribosoma que traduce una nueva molécula proteica.

En consecuencia, cada molécula de RNAm está fijada al mismo tiempo a una decena de ribosomas y

todos traducen moléculas de la misma proteína que se van acumulando en la cisterna.

NOCIONES ACTUALES DE GENÉTICA

ARNI (INTERFERENCIA):

La Interferencia por ARN se emplea con frecuencia en la investigación para evitar que los genes

produzcan proteínas, con lo cual pueden entenderse los efectos de su carencia y las funciones que realiza

la célula.

PROTEOMA:

El conjunto de todas las proteínas que intervienen en los procesos biológicos de una especie es lo que

se conoce como proteoma de esa especie, y el objetivo que se plantea ahora es llegar a determinar la

composición, estructura y funciones de todas y cada una de ellas.

Conseguir el genoma humano no ha sido más que un paso en el camino del objetivo final de tanta

inversión: llegar a conocer lo más exactamente posible el funcionamiento del organismo. Y el genoma no

es más que el libro de instrucciones generales; quienes realizan el trabajo de verdad son las proteínas.

Una vez conocida la secuencia y la estructura de una proteína, es necesario conocer su función. Este

tercer paso es el más complejo, porque la mayor parte de las veces ocurre que ni el proceso se debe

solamente a una proteína ni cada proteína interviene sólo en un proceso. Una forma de buscar en el pajar

de las funciones es comparar la proteína con otras de función conocida, tanto en la propia especie como

en otras, ya que la mayor parte de las mismas proteínas se observan en común en muchos organismos, a

veces muy lejanos filogenéticamente entre sí. Otra manera de abordar el problema es estudiar qué

proteínas interaccionan entre sí, lo que no explica su función, pero va creando un mapa de relaciones cuya

utilidad se pondrá de manifiesto cuando se vayan conociendo funciones de algunas de ellas.

PRIONES:

Los priones son partículas proteicas infecciosas, causantes de enfermedades de tipo encefaliticas.

Page 41: conceptos de genetica

41

En la decada de 1950, el pediatra americano Carleton Gajdusek estudiaba en Nueva Guinea una

enfermedad fatal del sistema nervioso que se conoce con el nombre de kuru (``escalofrio''). El kuru afecta

de modo endémico a la tribu de los Fore. Gajdusek observó que el kuru no se corresponde con ningún

modelo genético conocido, y apuntó al canibalismo ritual practicado por los Fore como causa de

trasmisión de la enfermedad. En 1959 el veterinario americano W.J. Hadlow puso de manifiesto las

similitudes clínicas y neuropatológicas existentes entre el kuru y el scrapie (``tembladera'') de los

carneros. Algún tiempo después, Gajdusek puso de manifiesto que el kuru tiene características comunes

con la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (CJD), una curiosa demencia presenil descrita a principios del

siglo XX.

Desde finales de los años 60 diversas enfermedades han sido agrupadas bajo la denominación de

Encefalopatías Subagudas Espongiformes Transmisibles (ESET). Esta expresión hace referencia a la

evolución lenta e irreversible de los síntomas que conducen a la muerte, a las lesiones del sistema

nervioso que las caracterizan (espongiosis del sistema nervioso central) y a la posibilidad de transmisión.

A finales de los años 60 dos investigadores sugieren, de forma independiente, la posibilidad de la

existencia de un agente infeccioso carente de ácidos nucleicos, capaz de causar y transmitir enfermedades.

En 1982, Standley Prusiner descubrió y aisló las partículas proteicas infecciosas y les asignó el nombre de

PRIONES. Prusiner sugirió que una colección de enfermedades cerebrales, algunas genéticas, algunas

infecciosas y otras esporádicas, son todas ellas el resultado de un proceso común. En 1983 se identificó la

proteína de los priones, y se la denominó PrP (``Prion Protein'').

A mediados de los años 80 se observó que, sorprendentemente, PrP(proteina prión ) es una proteína

del hospedador. Poco después se descubrió la existencia de dos proteínas PrP distintas, una de ellas

causante de las ESET. La comprobación de que ambas proteínas poseen igual secuencia pero distinta

conformacion tridimensional causó gran desconcierto entre la comunidad científica. Además, las PrP

anormales parecen capaces de inducir el replegamiento de las PrP normales existentes en los organismos

sanos. Ambos resultados están en clara contradicción con el Dogma Central de la Biología: según el

enunciado de J.Monod (1970):

La secuencia de aminoácidos o estructura primaria de la proteína determina de manera unívoca el

plegamiento de la proteína para adoptar su estructura terciaria. Es decir, entre los miles de

configuraciones plegadas en principio posibles, sólo se realiza una.

según su enunciado más general:

Page 42: conceptos de genetica

42

Todas las formas de vida, desde los virus hasta las plantas y los animales superiores, transmiten sus

caracteres a las siguientes generaciones a través del DNA (excepcionalmente RNA)

Es decir, el flujo de información es en todos los casos: DNA -> mRNA -> Secuencia de Aminoacidos

-> Estructura Tridimensional Proteínas. La teoría de los priones propuesta por Prusiner supone la

existencia de dos plegamientos para una única secuencia de amino ácidos. Además, el replegamiento de la

PrP normal por acción de la PrP patológica, implica un flujo de información de una proteína a otra a nivel

de estructura terciaria.

Actualmente los priones constituyen las únicas partículas vivas que contradicen el gran Dogma

Central de la Biología.

GENETICA MITOCONDRIAL.

La función genética del DNA mitocondrial:

La mitocondria ocupa una posición única entre las organelas debido a la posesión de un genoma

separado y toda la maquinaria enzimática para la transcripción y traducción de la información genética en

proteínas funcionales.

Existe un alto interés en la definición del grado de autonomía genética de la organela y en la

explotación de la simplicidad del sistema mitocondrial en respuestas a preguntas básicas de la expresión

genética eucariota.

La mitocondria sintetiza ciertos polipéptidos constituyentes de la citocromo oxidasa, coenzima QH2,

citocromo C reductasa y de la ATPasa, sugiriendo que esas proteínas tam-bién son codificadas en el

DNA mitocondrial (DNAmit).

También se encuentra la información para los dos RNAr, un set variable de RNAt suficiente para

reconocer todos los codones del código genético mitocondrial y los RNAm para las subunidades 1, 2, y 3

de la citocromo oxidasa, el citocromo b, y las subunidades 6 y 8 del complejo ATPasa.

Existe aparte del set común de genes otros siete marcos (URF para marcos inidentificados de lectura)

con transcriptos correspondientes y sus productos de traducción.

Las proteínas codificadas por los URFs tienen composiciones hidrofóbicas y están locali-zadas

probablemente en la membrana. Estos productos son en su mayoría polipéptidos compo-nentes de la

Page 43: conceptos de genetica

43

coenzima Q reductasa-NADH. Este miembro importante de la cadena respiratoria está compuesto por más

de veinte polipéptidos diferentes y es una de las enzimas más complejas de la cadena.

En eucariotas superiores sin embargo, el gen para la subunidad 9 responsable de la acti-vidad de

traslocación del protón de la ATPasa, está codificada en el núcleo.

El genoma mitocondrial más simple y altamente especializado se encuentra en animales. Este codifica

para los dos RNAr, el número mínimo de RNAt necesario para decodificar los mensajes endógenos y un

número pequeño de proteínas constitutivas cuya función exclusiva se relaciona con el transporte

electrónico y la fosforilación oxidativa.

Esta información genética está organizada de una forma altamente económica con la ausen-cia de

regiones regulatorias en la secuencia del DNA.

GENES DEL DNA MITOCONDRIAL HUMANO

PRODUCTO GENETICO GEN

Subunidad 1 de cit.ox COI

Subunidad 2 de cit.ox COII

Subunidad 3 de cit.ox COIII

Citocromo b Cyt b

Subunidad 6 de ATPasa ATPasa 6

Subunidad 8 de ATPasa URF A6L

Subunidad de reductasa Q URF 1

Subunidad de reductasa Q URF 2

Subunidad de reductasa Q URF 3

Subunidad de reductasa Q URF 4

Subunidad de reductasa Q URF 4L

Subunidad de reductasa Q URF 5

RNAr 21s 16s RNA

RNAr 15s 12s RNA

RNAt D

Page 44: conceptos de genetica

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Estructura del DNA mitocondrial mamífero

El genoma mitocondrial del hombre ha sido secuenciado completamente. La mayoría de los genes

codificantes de proteínas están presentes en una cadena de la molécula circular doble. Los genes para

RNAt, en cambio, están distribuidos en ambas cadenas.

La estructura organizativa más remarcable de este DNA que tiene consecuencias importantes para la

producción de los diferentes RNAs mitocondriales es la ausencia de secuencias intergénicas y la presencia

casi general de uno o más genes de RNAt entre las regiones codificantes para RNAr y RNAm. Todos los

genes son terminados no dejando espacio para secuencias extrañas.

La impresión que da es de un genoma extremadamente especializado con una pequeña oportu-nidad

para simplificación.

Transcripción y procesamiento del RNA en mitocondria

Ambas cadenas de este genoma son transcriptas de promotores únicos dando lugar a trans-criptos

primarios que contienen toda información codificada en cada una de las dos he-bras.

Esto junto con el rasgo organizativo del DNA lleva a un modelo simple y elegante de la forma en que

son generados los RNAr, RNAt y RNAm maduros.

La maduración de las tres clases de transcriptos requieren solo tres tipos de enzimas RNA

procesadoras. La más importante es la endonucleasa responsable de la escisión de los RNAt que

demarcan el principio y el final de los RNAr y los RNAm. Una endonucleasa tipo RNAasa

probablemente catalice el clivaje del RNA precursor en el extremo 5' de la secuencia de RNA. Los

transcriptos pequeños generados como resultado de la remoción endonucleolítica de los RNAt son

madurados por modificación de las bases de los RNAt y RNAr, y poliadeni-lación de los precursores de

RNAm.

Otra consecuencia de la estructura de los genes mitocondriales es la ausencia de secuen-cia señal líder

5' en los mensajes. El extremo 5' comienza con codones de iniciación AUG o AUA predichos por la

secuencia del DNA.

Page 45: conceptos de genetica

45

El mecanismo por el cual los ribosomas mitocondriales interaccionan con los mensajes sin secuencia

señal en el extremo 5' es desconocido. Los ribosomas de mitocondrial son inu-suales en su aspecto de

tamaño de las subunidades y contenido proteico relativo al RNA.

Fueron identificados dos sitios distintos de iniciación de la transcripción separados por menos de 100

bases en la cadena H. Uno de estos sitios produce transcriptos a mayores velocidades de las vistas para

RNAr, mientras transcriptos iniciados en el segundo sitio son producidos a velocidades menores, más

típicas de la síntesis de RNAm.

La transcripción del cistrón de RNAr ocurre predominantemente por iniciación en el sitio más activo.

El transcripto emitido del sitio de iniciación menos activo supera la señal de termina-ción y sirve

como el precursor para los RNAm y RNAt. Aun queda por entenderse la manera en que el sitio de

iniciación de la transcripción puede influenciar la actividad del complejo de la RNA polimerasa en una

región de atenuación de 2.700 pb .

Hasta el momento no se conoce la atenuación transcripcional de las regiones codificantes de proteínas

del genoma.

La ausencia de promotores separados para los genes mitocondriales, así como la ausencia de las

señales 5' en el RNAm maduro para la modulación de la eficiencia de translación, sostiene en contra de la

existencia de algún mecanismo elaborado para la regulación de la síntesis de este set de proteínas.

El carácter invariante de la cadena respiratoria (cuyas proteínas constituyentes son codificadas en este

genoma) en animales superiores podría explicar la ausencia de signi-ficado para la regulación individual

de la expresión de productos génicos mitocondriales.

Los genes del DNA mitocondrial humano con productos conocidos se muestran como barras sólidas.

Los URFs se indican con barras abiertas. La subunidad 8 de la ATPasa está loca-lizada junto y corriente

arriba del gen de la subunidad 6. Los genes de RNAt se ven como triángulos sólidos (la presencia se

indica con una flecha y asterisco).

Todos los genes, excepto URF 6 y los 8 RNAt , se transcriben en el sentido de las agujas del reloj. El

origen de replicación de la cadena H está representado por el círculo abierto.

Interacciones núcleo-mitocondria

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El hecho de que la información genética es distribuída en dos compartimientos separados

espacialmente implica la existencia de mecanismos para asegurar una expresión coordinada de las

proteínas y/o RNAs codificados de los dos genomas.

Existen enzimas mitocondriales con subunidades polipeptídicas derivadas de genes mitocon-driales y

nucleares. Ellas son: dos complejos respiratorios de la citocromo oxidasa, Coenzima QH2 reductasa, la

ATPasa, ribosomas mitocondriales, NADH-coenzima Q reductasa. Cada una de estas enzimas

oligoméricas contiene subunidades codificadas nuclearmente cuyas funciones son esenciales para la

actividad catalítica.

El aparato mitocondrial proteico importado

La mitocondria está formada por dos subcompartimientos membranosos (membrana externa y

membrana interna) y dos subcompartimientos acuosos (espacio intermembrana y matriz). La mayoría de

las proteínas destinadas a estos subcompartimientos son sintetizadas en poli-somas citosólicos y luego son

importadas por la organela.

La traslocación de las proteínas precursoras dentro de las membranas no está acoplada

mecánicamente a la síntesis de la cadena polipeptídca en el ribosoma. El proceso de importación requiere

de energía aportada por el ATP y el potencial de membrana a través de la membrana interna mitocondrial.

El transporte proteico hacia o a través de la mem-brana interna ocurre en sitios de contacto entre las dos

membranas mitocondriales. Los precursores proteicos son procesados proteolíticamente en la matriz

mitocondrial y sus cadenas polipeptídicas son re- plegadas. Finalmente las proteínas son distribuídas a sus

respectivos subcompartimientos y en muchos casos son ensambladas en complejos con múlti-ples

subunidades.

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