génétique des populations de plasmodium falciparum en afrique
TRANSCRIPT
![Page 1: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/1.jpg)
����������� �������������� ��� ���������������������������� �������� ���� ����������� �����
�������������������������� ���������� �������������� ��������� �����������������������
���������� ���������������������� ���������������������� ������������������������������������������������������ ���������������� ���������������������������������������������� ��� �������� �������
������������������������������
������������������ ���������!���� ���������!����
� � � �� �� � � �� ������������� ��������������� �������������� �������
![Page 2: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/2.jpg)
!������!������
�� �"������������"�����������" #����������������$������������������������������������%&
" ��������������
" #������������������������������������������������������ '
�� �"�"������ ������ ����������������� ������ ����������� �� ������ ����������" (��� $ )����*+ ���&���,�������� '
" #���������������,��$ ������-����&�./������0
" #�����������������������������������
�� !"!"���������������� �� ������ ����" 1��������������������������� '
" 1����������������������'
" 2����������3#���������������3���������� �����.��0'
�� #"�!��������$�#"�!��������$��������%����������%���
![Page 3: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/3.jpg)
&' �
� � �� ����� ����� � �� ����� �������� ��������(�����������(���
����4�������������
![Page 4: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/4.jpg)
� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���
����4�������������
&')�*&'+�
![Page 5: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/5.jpg)
���,
� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���
����4�������������
![Page 6: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/6.jpg)
���,
� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���
����4�������������
1������5���6��������������#����4�����
#����4����
1������5���6������������
#����4�������������������1������5���6�������������7����
![Page 7: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/7.jpg)
���,
� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���
�,�- �(���.���� ������� ��/��������� �0��$�1� �
![Page 8: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/8.jpg)
���,
� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���
�,�- �(���.���� ������� ��/��������� �0��$�1� �
� ���1��0���������������
![Page 9: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/9.jpg)
!�����!�����/��0��/��0��
#��4����������
2����2��������������
3�/����3�/������������ �������� ���� �� ��/�������� ��/������
������ ���� ������ �������������� ���������� ����
�������� �������� ���� ��� ������ ���
/� �������
�����������
��1�0�/�0�� 1��1�0�/�0�� 1
3�/����3�/�����/���������/���������������� ��������� ���
�������� �������� ���� ��� ������ ���
![Page 10: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/10.jpg)
8����������������������� ���������'
4(�4(� ����� ����� ����� �1����� �1 � ���� � ���� ������ ���������� ����55
#�����6������������� ���� �� �����5
![Page 11: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/11.jpg)
���������������������������������� �������� ���� �� ���5�� ���5
![Page 12: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/12.jpg)
���������������������������������� �������� ���� �� ���5�� ���5
![Page 13: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/13.jpg)
���������������������������������� �������� ���� �� ���5�� ���5
![Page 14: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/14.jpg)
�������(�6��(������������(�6��(��������������� �������� ���� �� ���5�� ���5
![Page 15: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/15.jpg)
![Page 16: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/16.jpg)
9������ ���������������������� )����*+ ����:����
�������������6����������������
�"�"������ ������ ������������������ ������ �������������� ������ ����������
![Page 17: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/17.jpg)
SouthSouthDananéDanané
�������������� ������ ���2;<��������������������:�������� ���4�����$ 7&����������
���������� ����������������������
����������������������������������������������������������������55
=>�?�
@A�?�
�������$B=&) ��7, -
#�������$B@&) ��7,8-
������ $=@&�) ��7 �-
�������$BC&�) �7��+-
D�����$=@&) ��7+8-
) ��9�- ���� ����(��0������) ����1
����������E�����;<2����:��� �������
�����������
� �����������
��������� ��
����� �������
��� ����������
�������
![Page 18: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/18.jpg)
�������������� �� ������ ��������1����1
8��������������������'
![Page 19: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/19.jpg)
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
(����������=(����������B
/���������������������������'
![Page 20: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/20.jpg)
(����������=(����������B
9�������:
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 21: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/21.jpg)
(����������=(����������B
9�������:
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 22: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/22.jpg)
(����������=(����������B
1�5���������������!�������������
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 23: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/23.jpg)
(����������=(����������B
+�������������=�������������� ��
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 24: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/24.jpg)
(����������=(����������B
+�������������=�������������� ��
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 25: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/25.jpg)
(����������=(����������B
+�������������B�������������� ��+�������������=�������������� ��
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 26: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/26.jpg)
(����������=(����������B
+�������������B�������������� ��+�������������=�������������� ��
/�����=
/�����B
-������
/�����=
/�����B
-������
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 27: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/27.jpg)
(����������=(����������B
(��������(����������=�$��������&�F�(����������B�$���� &
(��������(����������=��$�����&�� (����������B�$� &�
:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55
![Page 28: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/28.jpg)
�������������������������������������������,�����������������
����������������������������������������
�����������������������������
1�������:������ ��%������� ��/����� ��/ �;����� ��%������� ��/����� ��/ �;���
$-��������������B>>>�#����������G ���&
![Page 29: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/29.jpg)
����� ������������� ������������0���1/�0��/����0���1/�0��/
H�=@
H�B@
H�I
����� ��������% �1�����0������/6����� ���/���� �������
���� ��<����������0���1/�0��/� /�������%��� ��
![Page 30: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/30.jpg)
����� ������������� ������������1�������1���
���� �
( !�:�������������� �����������
#������������F��$�������������&
���� �G�����������
![Page 31: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/31.jpg)
����������������������������6��(������ ��������������������������������6��(������ ����(��0�(��0�=��=��
������������ ����������:����������������J������� �������:����������������������
2���������������
(����������= (����������BF
2���������������
(����������= (����������B�
>���������K������������ ������L>�>A���������K��������������������������������>�>A6>�=A��#������>�=A6>�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������
=��������-������������������5���
����F�> ����F�=
![Page 32: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/32.jpg)
������������������������(�����������(�����������
$$ ������-����O ������-����O�������>������������>�����&&
��������������������������N�������N�������33��:���:�
$1����$1���� �6����6���**��0�����0���>�����>�����&&
���������������������������������� �������� ���� �� ����(��0������ ���� ����(��0������ ��/ �;���/ �;�������������������������������������������
?�/6 6(�
��� �?�������N�������
�@#@!�
�� ��
�@���
�@���
�@�&�
�@&&&
=��9������/�� ���1�����A
![Page 33: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/33.jpg)
������������������������(�����������(�����������
$$ ������-����O ������-����O�������>������������>�����&&
��������������������������N�������N�������33��:���:�
$1����$1���� �6����6���**��0�����0���>�����>�����&&
/��,����/��,��������4������������4��������:������:������ �����������:������������:�����������������������������������������������BB3������3������>�����C�#�� �������">�����C�#�� �������"
?�/6 6(���F>�P>
��� �?�������N�������
�@#@!�
�� ��
�@���
�@���
�@�&�
# ; �
�@&&&
=��9������/�� ���1�����A
3��; ���#���<����6���/
D�3��; ���#���<����6���/
!��
���������������������������������� �������� ���� �� ����(��0������ ���� ����(��0������ ��/ �;���/ �;�������������������������������������������
![Page 34: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/34.jpg)
��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/
/�����-
/������
=�����������
![Page 35: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/35.jpg)
/�����-
/������
!����� ����������������������
=�����������
��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/
![Page 36: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/36.jpg)
/�����-
/������
!����� ����������������������
=�����������
��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/
![Page 37: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/37.jpg)
/�����-
/������
!����� ����������������������
=����������� B������������
��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/
![Page 38: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/38.jpg)
��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/
/�����-
/������
!����� ����������������������
=����������� B������������
K������� ����������������������
![Page 39: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/39.jpg)
��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/
/�����-
/������
!����� ����������������������
=����������� B������������
K������� ����������������������
/��,����F���������.���0����� ��� ��������.���0����������������������4��������
![Page 40: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/40.jpg)
#�����������������
6 K����������������������� �����������6 9������ /��,��������4��������
+�������������������
#��������������������'�Q%�'
![Page 41: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/41.jpg)
���0����0��������� ���������������� ����������������������������������
1�4������������������������
-�2� �9�2�2�-�-�2�-�-�2�-�-�2�-�-�2�-�-�-�9�2� �-�9�2�-�9� �-�-�2�2�-�2�2�-�2�2�-�2�2�-�2�2�2� �-�9�2�
:��������,�������������K-
=�A ��������������������� �����$2--&���$ -&���$2-&�
@������������������������� �������������'
![Page 42: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/42.jpg)
!/��A��!/��A��/���� �������/���� �������
$--2& !����� R����=
$-222-2& !�����R����B�$����J�������������&
$-2& !����� R����@
����,�����K-
�����5��������������������� ������� ����� �����������������������
![Page 43: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/43.jpg)
'�������� ��������'�������� ��������
#�������������� ��B6@,���������������������������������������
![Page 44: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/44.jpg)
=&�#��������������������5������ ������� ����� �����������������������
B&�1�S�����:��� A>���@A>���� ��������� ��<>���
![Page 45: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/45.jpg)
���������1���������1
��������������K- Q���������������K-
1�4���������������������������������,�����K-������������������������� ����������������������
�����������$���������K-&
����� �K-
![Page 46: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/46.jpg)
�"�"���������1���������1>�>��0����� �/����� ���4�/ ��0����� �/����� ���4�/ � #D��#D��
8"8"�����6����1�����6����1>> ��<��������<������ ��=� �;���=� �;���#D�� ��#D�� �� ��������������� =;���
![Page 47: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/47.jpg)
E �1��� ����E �1��� ����
2����� ������� ����������
![Page 48: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/48.jpg)
������������������61�61�0���00��;���0���00��;���
/�������������������
#������������
#������������
TU
!������������
!����������������
![Page 49: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/49.jpg)
��1/�0��/��1/�0��/
0%
5%
10%
15%
20%
25%
118
218
221
223
225
228
231
233
235
237
239
242
245
252
255
259
263
270
283
326
Freq
uenc
y
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
91 94 98 101 110
�������������������:������������:�
/�:�������������/�:�������������
-��������S�
#�������������:���������������������������
![Page 50: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/50.jpg)
,","E �1��� ����E �1��� ��������������0���� /������0���� / "������ ���������� "������ ���������� ������������������ �0�/�/���0�/�/��)"�#��� ���)"�#��� ��� 6��(���6��(��� /���� �����������/���� ����������� �� �������� ����������������������������+"�+"������/��� ����1/�0��/�����/��� ����1/�0��/ �<���
![Page 51: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/51.jpg)
F�������&9�������� ���� �� �������������� ������� ������������� ���5
7��������B ������� ���� (���������������������������������'
7��������@!��������#������������������3#������+��������3 ����������������� ������'
!"�!"��������������������� ����<��������� ����<�������
![Page 52: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/52.jpg)
���������� �������� ���� �� �������������5�� �������������5
�����������!���������������������������6��������-����
� K������������������������������:���������������� ������������'
![Page 53: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/53.jpg)
���������� �������� ���� �� �������������5�� �������������5
-� �V (��:��� ��������������:����������:��������$��5����������5&
C��������������������������������������$<�����=;�������������������&
DjiboutiDjiboutin(42)n(42)
DakarDakarn(37)n(37)
SouthSouthDananéDananén(118)n(118)
NiameyNiameyn(43)n(43)
$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&
![Page 54: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/54.jpg)
�=!>��=!>�(��0�(��0� �/���� �����������@ �/���� �����������@
-3.0 -1.5 0.0 1.5AXE I
-1.70
-1.02
-0.34
0.34
1.02
1.70
AX
E II
NiameyDjiboutiDakarDanané
Sites
�������������������� �����������
$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&
![Page 55: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/55.jpg)
����������������������������6��(������ ��������������������������������6��(������ ����(��0�(��0�=��=��
������������ ����������:����������������J������� �������:����������������������
2���������������
(����������= (����������BF
2���������������
(����������= (����������B�
>���������K������������ ������L>�>A���������K��������������������������������>�>A6>�=A��#������>�=A6>�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������
=��������-������������������5���
����F�> ����F�=
![Page 56: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/56.jpg)
�������:����������:��� ��������������������������:����:����������������������������������������
θθθθθθθθ==0.1890.189(0.121(0.121--0.265)0.265)
θθθθθθθθ==0.2100.210(0.152(0.152--0.272)0.272)
θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)
DjiboutiDjibouti
DakarDakar
SudSudDananéDanané
NiameyNiamey
�����������������������������������������
3 �������������� ����6��(������ �������/ #G�6���� ����0��������
>���������K������������ ������
L>�>A��������K��������������������������������>�>A6 >�=A��#������>�=A6 >�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������
=��������-������������������5���
$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&
![Page 57: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/57.jpg)
�������:������������������:���������������������:���:���������������������������������������
θθθθθθθθ==0.1050.105(0.081(0.081--0.172)0.172)
θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)
θθθθθθθθ==0.0840.084(0.074(0.074--0.171)0.171)
DjiboutiDjibouti
DakarDakar
SudSudDananéDanané
NiameyNiamey
θθθθθθθθ==0.1890.189(0.121(0.121--0.265)0.265)
θθθθθθθθ==0.2100.210(0.152(0.152--0.272)0.272)
θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)
��� ��%����� ��%������������ ������������� ��������������� �������� ���� �� ������ ����
6��(�����0�6��(�����0� ��� �� �� ����� �� �� ��# � �H�# � �H� ����0���0�� ����0���0������������
>���������K������������ ������
L>�>A��������K��������������������������������>�>A6 >�=A��#������>�=A6 >�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������
=��������-������������������5���
$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&
![Page 58: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/58.jpg)
=���6��(�����������=���6��(��������������������� (��0(��0/���� �����������/���� �����������
θθθθθθθθ==0.0260.026(0.008(0.008--0.048)0.048)
DjiboutiDjibouti
DakarDakar
SudSudDananéDanané
NiameyNiamey
K���� ����������:������,�6K�����
���,�����!����� ����� ��������
θθθθθθθθ==0.1050.105(0.081(0.081--0.172)0.172) θθθθθθθθ==0.0840.084
(0.074(0.074--0.171)0.171)
θθθθθθθθ==0.1890.189(0.121(0.121--0.265)0.265)
θθθθθθθθ==0.2100.210(0.152(0.152--0.272)0.272)
θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)
>���������K������������ ������
L>�>A��������K��������������������������������>�>A6 >�=A��#������>�=A6 >�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������
=��������-������������������5���
$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&
![Page 59: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/59.jpg)
�������9��������������������9����������������������� �������� ���� �� ������ ����/ �;���/ �;������ /�����5� /�����5
?�/6 6(�
#G�6���D� /�1
# � �H
!��
�� �� �@���
�@���
�@�&�
�@&+'
�@��
�@&�,
�@�&�
�@�8 �@�+8
# ; �
&�������B�������>�����" ����
![Page 60: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/60.jpg)
�������� #��������������������������
������������������������������
5
5
![Page 61: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/61.jpg)
!�������1����������!�������1������������������������������������ �������������,���������������,��33���������'���������'
?�/6 6(�?�/6 6(�
#G�6���#G�6���D� /�1D� /�1
# � �H# � �H
!��!��
�� �� �� �� �@����@���
�@����@���
�@�&�
�@�&�
�@&+'�@&+'
�@�� �@��
�@&�,�@&�,
�@�&��@�&�
�@�8 �@�8 �@�+8�@�+8
θθθθθθθθ = = 0.1930.193
# ; �# ; �
&�������B�������>�����" �������0��&������B�������>�����" ����
![Page 62: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/62.jpg)
����������= ����������=
��� ������������������������ ����������������������������������-�����
![Page 63: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/63.jpg)
F�������&9�������� ���� �� �������������� ������� ������������� ���5
F��������F��������9�9������� ���� ��� �������������� ����� �������������� ���� ���� ���5�� ���� ���5
7��������@!��������#������������������3#������+��������3 ����������������� ������'
![Page 64: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/64.jpg)
K��/��,��������4��������
!����� �������������������
K���������
/��,��������4��������
K������� ���������������:��� ����
1������%
![Page 65: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/65.jpg)
No LinkageNo Linkagedisequilibriumdisequilibrium
SudSudDananéDanané
No LinkageNo Linkagedisequilibriumdisequilibrium
NiameyNiamey
No Linkage No Linkage disequilibriumdisequilibrium
DakarDakar Linkage Linkage DisequilibriumDisequilibriumDjiboutiDjibouti
![Page 66: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/66.jpg)
6 1����������������������� �����������6 G����������������5�������6 1������
Q���������9������ /��,��� ����4�������� ����X������'
![Page 67: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/67.jpg)
3��; ���3��; �������<����6���/����<����6���/
" �������� ��������
" ������
" 1��������
" ���� ��������
" !��������������
" #���������
![Page 68: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/68.jpg)
0
50
100
150
200
250
Jan 19
97MarMay Ju
lSep Nov
Jan 19
98MarMay Ju
lSep Nov
Jan 19
99MarMay Ju
lSep Nov
Jan 20
00MarMay Ju
lSep Nov
Jan 20
01MarMay Ju
lSep Nov
Jan 20
02MarMay
1998 1999 2002
Mon
thly
inci
denc
e of
clin
ical
mal
aria
atta
cks
sampling periods of clinical malaria isolates, Djibouti-city, CHA Bouffard
$!����� ��(�������������������� ���� G���+����������� B>>AO==@=;6@B=�&
![Page 69: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/69.jpg)
1998 1999 2002
0
20
40
60
80
K1K1 Mad20Mad20 RO33RO33 3D73D7 FC27FC27
msp1msp1 block2block2 msp2msp2
percentage
�� 6���������6��������� 6���������6��������� �� 6��;��6��;�� ��� ����� !�� ! ������� �������������#G�6���#G�6���
Isolates with only one allele detected by locus
Q�����������������������������������
$!����� ��(�������������������� ���� G���+����������� B>>AO==@=;6@B=�&
![Page 70: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/70.jpg)
0%
20%
40%
60%
80%
100%
19981998(Sept.-Dec., n=46)
19991999(April, n=61)
20022002(March-May, n=32)
Unb
iase
d ex
pect
ed h
eter
ozyg
ocity
Unb
iase
d ex
pect
ed h
eter
ozyg
ocity msp1msp1 block2block2
msp2msp2
#���� ���������������%�����1������������/��
����������%�����1����������%�����1���0��0� �������� �������� ���� �� ����� ���6����6����>> ������� ��� ������0�������� ��� ������0� &'''&'''����/������/��
$!����� ��(�������������������� ���� G���+����������� B>>AO==@=;6@B=�&
![Page 71: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/71.jpg)
����������B
����� �5��������V�/�����������������������������5����� ��
R���������������������������������� �������������������������:������������� �����������
![Page 72: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/72.jpg)
F�������&9�������� ���� �� �������������� ������� ������������� ���5
F��������9������� ���� ��� �������������� ���� ���� ���5
F��������F��������9��� ����� � �� ��� ��/������9��� ����� � �� ��� ��/��������� � �� ���������� � �� ����������� �������������� �������� ���� ��%�����1�5��%�����1�5
![Page 73: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/73.jpg)
������������������������� �� ��/����� F�K���� ����������������J�����J���
����������1F�K���� ����������������������
���/6�� ������� ��������������#�%�����1
![Page 74: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/74.jpg)
����������9��������� �����F 9������ �����F�G5������������S��������
F�- ����������S�������
� ��:����������������������������������������������������������,���:������������������
�
![Page 75: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/75.jpg)
9��������� �����6������������� �����������
9��������� �����������������������
@������������� =��������
�����������2������������ � #������������� V�9��������� �������+��R��������
Trans < 1 b/Trans < 1 b/perspers/y/yP rate <5%P rate <5%DjiboutiDjibouti
Trans < 1 b/Trans < 1 b/perspers/y/yP rate <5%P rate <5%
DakarDakar
Trans > 300 b/Trans > 300 b/perspers/y/yP rate >80%P rate >80%
southsouthDananéDanané
Trans < 1 b/Trans < 1 b/perspers/y/yP rate <5%P rate <5%�������� 30%30%
NiameyNiamey
$������ ���!���������������� �� ���� B>>A����������&
![Page 76: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/76.jpg)
9��������� �����6������������� �����������
#�������������������� ��������������:����������������
�����������2������������ � #������������� V�9��������� ������+� R��� ����
TransTrans < 1 b/pers/y< 1 b/pers/yMean MultMean Mult.: 1.31.: 1.31
DjiboutiDjibouti
TransTrans < 1 b/pers/y< 1 b/pers/yMean MultMean Mult.: 1.41.: 1.41
DakarDakar
TransTrans > 300 b/pers/y> 300 b/pers/yMean MultMean Mult.: 2.68.: 2.68
southsouthDananéDanané
TransTrans < 1 b/pers/y< 1 b/pers/yMean MultMean Mult.: 1.63.: 1.63
NiameyNiamey
$������ ���!���������������� �� ���� B>>A����������&
![Page 77: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/77.jpg)
H=0.53H=0.53DjiboutiDjibouti
������ ����������������� ������������������������������ �����
#�����������������
H=0.76H=0.76NiameyNiamey
H=0.73H=0.73DakarDakar
3� ����������������������%�����1
H=0.76H=0.76SouthSouth
DananéDanané
![Page 78: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/78.jpg)
H=0.76H=0.76SouthSouth
DananéDanané
�X��������/�:�������������������������:����������� �����
#��������������������:������������������� �����
H=0.76H=0.76NiameyNiamey
H=0.73H=0.73DakarDakar
H=0.53H=0.53DjiboutiDjibouti
![Page 79: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/79.jpg)
H=0.53H=0.53DjiboutiDjibouti
H=0.76H=0.76SouthSouth
DananéDanané
��,��V�K������/�: ������������������������������������������� �����
#���������������������������������
!���6���� ��������
H=0.76H=0.76NiameyNiamey
H=0.73H=0.73DakarDakar
�/���������������%�����1
![Page 80: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/80.jpg)
#����������������� ���������S�������'
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3
Djibouti Dakar Niamey Danané
Mul
tiplic
ity
00,10,20,30,40,50,60,70,80,91
Het
eroz
ygos
ity
Multiplicity Heterozygosity
L�=�J���JY L�=�J���JY L�=�J���JY M@>>�J���JY
� � �� ��� ��/������ ����� � ����A� ����0������������%�����1�6���%��
![Page 81: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/81.jpg)
!���������!���������
/��������������� �����������������:�����
6 ������������������������������V���������������
6 �������������������������
![Page 82: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/82.jpg)
DananDananéé
NiameyNiameyDakarDakar
DiengaDienga
DjiboutiDjibouti
THIAGOTHIAGO
TEMEYE SALANETEMEYE SALANE
SANINTESANINTENDIAKHAYENDIAKHAYE
MALLAMALLA
FATIFATINN
TIPTENGATIPTENGA
S29S29--3030NIOKO II S26NIOKO II S26
PISSY S17PISSY S17
KATKATEE
YOUKOUTYOUKOUT
TCHOLLIRE TCHOLLIRE IIII
SAKDJESAKDJE
BOCKIBOCKI
MELEN/MELEN/NKOLAFENDEKNKOLAFENDEKMIATTA / DJOUZEMIATTA / DJOUZEENDEGUE/ENDEGUE/ABDELONABDELON
ZOEBEFAM/ZOEBEFAM/NKOLEMBOULANKOLEMBOULA
YEN/YEN/MEBAN IIMEBAN II
NIENANIENA
TENASSOTENASSO
Q. SAMAGANQ. SAMAGAN
Q. DOGONAQ. DOGONA
Q. KUINIMAQ. KUINIMA
TIABEDJITIABEDJI
LANDELANDERUNDE/BAITILRUNDE/BAITIL
SAMALSAMALTHIOBOTHIOBO
BANTATABANTATA
ASSONIASSONI
��������%����������%��
![Page 83: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/83.jpg)
Centre Centre MurazMuraz& & InstitutInstitut P. P. RichetRichet
M.C. HenryM.C. HenryS.B. S.B. AssiAssi
InstitutInstitut PasteurPasteuràà ParisParis
O. O. PuijalonPuijalon
IRD IRD Montpellier,Montpellier,F. F. RenaudRenaudP. DurandP. Durand
UnitUnitéé de de RechercheRecherche en en BiologieBiologie & & EpidEpidéémiologie miologie
ParasitairesParasitaires -- IMTSSAIMTSSAC. C. RogierRogier
B. B. PradinesPradinesT. T. FusaiFusai
H. H. BouchibaBouchiba
DGA (DGA (DynapopDynapop), ), SociSociééttéé Pathologie ExotiquePathologie Exotique, SANOFI , SANOFI –– Impact MalariaImpact MalariaService de SantService de Santéé des des ArmArmééeses
MinistMinistèèrere de de la Santla Santéé DjiboutiDjibouti
M.A. M.A. KamilKamil
INSERM U399INSERM U399LaboratoireLaboratoire de de ParasitologieParasitologie et et
MycologieMycologie
P. P. ParolaParola
Hôpital Hôpital PrincipalPrincipalde Dakarde Dakar
B. WadeB. Wade
HôpitalHôpital National National de Niameyde Niamey
E. E. AdehossiAdehossi
HIA HIA LaveranLaveranE. E. GarnotelGarnotel
hervebogreau @ yahoo.fr
![Page 84: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/84.jpg)
�����S���������9������ �����
($�����&F��������J�$��������Z��������&
($�����&F��������J�$��������Z��������&
�����S��������$�&�F�(�$��������&�:���������F�($���������&�Z(�$��������&
F�($�����&�($�����&�Z�($����&�($����&�F�B�($����&�($����&�
#� �!���
![Page 85: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/85.jpg)
�����S���������9������ �����
($�����&F��������J�$��������Z��������&�F�P�J�=B
($�����&F��������J�$��������Z��������&�F�C�J�=B
�����S��������$�&�F�(�$��������&�:���������F�($���������&�Z(�$��������&
F�($�����&�($�����&�Z�($����&�($����&�F�B�($����&�($����&�
���$����&�F��P����$����&�F�C
F�B���$�B�J�@�&���$�=�J�@&�F�C�J�I�
#� �!���
![Page 86: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/86.jpg)
�����S��������9������ ������
" �F=6[��\
(�5(�(B5(�(=5(�-��������� ���(�
(B5(B(=5(B-������B�� ���(B
(=5(=-������=�� ���(=-���������������������
�������������
-��������� ���(�
-������B�� ���(B
-������=�� ����(=
-����������������������������������
#� �!���
![Page 87: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/87.jpg)
�����S��������9������ ������
" �F=6[��\
(�5(�(B5(�(=5(�-��������� ���(�
(B5(B(=5(B-������B�� ���(B
(=5(=-������=�� ���(=-���������������������
�������������
-��������� ���(�
-������B�� ���(B
-������=�� ����(=
-����������������������������������
#� �!���
![Page 88: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique](https://reader031.vdocuments.net/reader031/viewer/2022022201/588a6a871a28ab336f8b4e3b/html5/thumbnails/88.jpg)
�����S��������9������ ������
" �F=6[��\ F�=�� .$BJ@&\ Z�$=J@&\ 0F�=�� .AJI0�F�CJI�
(�5(�(B5(�(=5(�-��������� ���(�
$=J@&\(=5(B-������B�� ���(B
$BJ@&\-������=�� ���(=-���������������������
�������������
-��������� ���(�
-������B�� ���(B
-������=�� ����(=
-����������������������������������
#� �!���