korcsmáros tamás - félrebeszélés sejtszinten - budapest science meetup október
TRANSCRIPT
Félrebeszélés sejtszintenA jelátviteli hálózatok és a rák
Korcsmáros Tamás
Hálózatbiológiai-csoportELTE Genetikai tanszék
A rákos sejtek legfontosabb tulajdonságai 2000-ben
Ellenállás a sejthalálnak
Angiogenezis beindítása
Osztódási immortalitás elérése
Növekedés-gátlók elkerülése
Osztódási jelek fenntartása
Szöveti invázió és metasztázis
Mi a jelátvitel?
Sejten belüli információs és irányító rendszer
SignaLink Egységesen gyűjtött útvonal-adatbázis
• 3 többsejtű állat
• 8 biokémiailag definiált útvonal
• Kézzel gyűjtött, egységes adatszerkezet
• Minden kapcsolat irányított és a leíró hivatkozást is tartalmazza
• Több útvonalban is szerepet játszó fehérjéket és cross-talkokat is
tartalmaz
Útvonalak gerincei
Útvonalak gerincei és perifériája
Jelátviteli útvonalak hálózata
Útvonal-alapú keresztbeszélgetés megjelenítés
Jelátviteli útvonalak hálózata
Korcsmaros és mtsai, Bioinformatics (2010)
Az útvonalak keresztbeszélgetés-hálózata három többsejtű állatban
NHR
Korcsmaros és mtsai, Bioinformatics (2010)
Az útvonalak keresztbeszélgetés-hálózata három többsejtű állatban
Korcsmáros et al., Bioinformatics, 2010
A keresztbeszélgetések kulcsfontosságúak a jelátviteli hálózat komplexitásában
BemenetLigandok
KimenetTranszkripciósfaktorok
Útvonalakés kereszt-beszélgetéseik(cross-talk)
Mediátor 1 A
Mediátor 1 B
Mediátor 1 C
Cross-talkCross-talk
Kritikus pontok mint a jelterjedés szabályozói
Izoforma csoport
Mediátor 1 A
Funkció 1 Funkció 2
Részben eltérő funkció
Transzkripciós faktor 1
Transzkripciós faktor 2
Részben eltérő reguláció
Jelterjedésben közvetlenül résztvevő fehérjék:
Ligand 1
Receptor 1
Ligand 2
Receptor 2
Mediátor 2
Mediátor 3
Mediátor 1 B
Mediátor 1 C
Kritikus pontok daganatokban
Khi-négyzet teszt: *** p<0,001
• Gyakrabban mutálódnak rákban, szignifikánsan több köztük a másodlagos mutáció.
• Központi szerepükből adódóan feltehetően a malignitást emelik.
A rákos sejtek legfontosabb tulajdonságai 2011-ben
Sejtenergetika szabályozásának megváltoztatása
Immun-pusztítás elkerülése
Genom instabilitás és felpörgetett mutáció
Tumorserkentő gyulladás
Valószínű új jellemzők
Lehetővé tevő jellemzők
Köszönöm a figyelmet!
Kutatási területek
• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése
• A sejtek öregedésének hálózatos és rendszerszintű vizsgálata
• A kommunikációs hálózat kóros (rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata
Kutatási területek
• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése
• A jelátviteli hálózat kóros (pl.: rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata
• Az öregedés hálózatos és rendszerszintű vizsgálata
Kutatási területek
• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése
• A sejtek öregedésének hálózatos és rendszerszintű vizsgálata
• A kommunikációs hálózat kóros (rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata
Kutatási területek
• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése
• A sejtek öregedésének hálózatos és rendszerszintű vizsgálata
• A kommunikációs hálózat kóros (rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata
• vizsgálata