mendel kalıtımı, tek genli kalıtım, formal genetik
TRANSCRIPT
Mendel kalıtımı, Tek genli kalıtım, Formal Genetik
T dominant
t resesif
Genotip Fenotip TT, Tt
tt
Tall
dwarf
Number of Entries in OMIM (Updated 30 September 2013) :
Prefix Autosomal X Linked Y Linked Mitochondrial Totals
* Gene
description 13,628 664 48 35 14,375
+ Gene and
phenotype,
combined
111 4 0 2 117
# Phenotype
description,
molecular basis
known
3,600 278 4 28 3,910
% Phenotype
description or
locus, molecular
basis unknown
1,596 132 5 0 1,733
Other, mainly
phenotypes with
suspected
mendelian basis
1,755 119 2 0 1,876
Totals 20,690 1,197 59 65 22,011
OMIM Morbid Map Scorecard (Updated 30 September 2013) :
Number of phenotypes* for which the molecular basis is
known 5,023
Number of genes with phenotype-causing mutation 3,061
* Phenotypes include single-gene mendelian disorders, traits, some susceptibilities to
complex disease (e.g., CFH and macular degeneration, 134370.0008), and some somatic cell
genetic disease (e.g., FGFR3 and bladder cancer, 134934.0013)
OMIM Synopsis of the Human Gene Map (Updated 30 September 2013) :
Chromosome Count
1 1,432
2 914
3 770
4 561
5 652
6 860
7 678
8 512
9 551
10 538
11 884
12 757
Chromosome Count
13 268
14 470
15 428
16 589
17 828
18 211
19 905
20 369
21 151
22 349
X 802
Y 53
Table 1 OMIM Phenotypes for which the Molecular Basis Is
Known, 2007 and 2013
Inheritance
Pattern January 2007 July 2013
Autosomal 1,851 3,525
X Linked 169 277
Y Linked 2 4
Mitochondrial 26 28
Total 2,048 3,834
Table 2 Disease-Causing Genes Identified by Exome Sequencing Studies, 2009–2010
Gene Disorder Individuals Citation
DHODH Miller syndrome four affected from three
kindreds
Ng et al., 2010b
FLVCR2 Fowler syndrome two unrelated Lalonde et al., 2010
GPSM2 Nonsyndromic hearing loss one proband Walsh et al., 2010
MLL2 Kabuki syndrome ten unrelated Ng et al., 2010a
WDR62 Severe brain malformations one proband Bilgüvar et al., 2010
PIGV Hyperphosphatasia mental
retardation
three siblings Krawitz et al., 2010
WDR35 Sensenbrenner syndrome two unrelated Gilissen et al., 2010
STIM1 Kaposi sarcoma one patient Byun et al., 2010
ANGPTL3 Familial combined
hypolipidemia
two family members Musunuru et al., 2010
ACAD9 Complex I deficiency one patient Haack et al., 2010
SETBP1 Schinzel-Giedion syndrome four unrelated Hoischen et al., 2010
TGM6 Spinocerebellar ataxia four family members Wang et al., 2010
FADD Autoimmune
lymphoproliferative syndrome
one proband Bolze et al., 2010
VCP Familial ALS two family members Johnson et al., 2010
Pedigri - Aile ağacı
- Tek bir ailenin atasal yapısını gösterir
- Ailedeki bağlantıları ve hastalıkları
sembollerle anlatır
Pedigri çizilmesi
En az üç generasyon araştırılır.
Önemli noktalar
• Yakınlarda benzer şikayetler var mı?
• Ölen kardeş var mı?
• Düşükler ve ölü doğumlar?
• Farklı ebevenlere sahip çoçuklar?
• Akraba evliliği?
• Etnik grup?
Terminoloji Genotype: A A
A A
Genotype: A B
A B
Bir lokustaki alleller ile ilgili özellikler tek genli kalıtımı oluştururlar
Kromozom 6
Maternal DNA
Gen
Kromozom 6
Paternal
Pedigri Analizi
Sağlam erkek
Sağlam dişi
Hasta erkek
Hasta dişi
Ebeveynler
Çocuklar
Bireyler numaralandırılır. Generasyonlar romen
rakamları ile gösterilir.
I1 ve III1 hasta bireyler
Diğerleri normal
Proband - Propositus- indeks vaka
Aile ağacının çizilmesine neden olan olgu
- yatay bir ok ve p harfi ile gösterilebilir.
Tek genli kalıtımda iki önemli faktör vardır:
1. Gen otozomda veya eşem kromozomunda
2. Fenotip dominant veya resesif
1. Otosomal Resesif
2. Otosomal Dominant
3. X-bağlı Resesif
4. X-lbağlı Dominant
Dominant ve Resesif
Mekanizmalar • İşlev kaybı
• İn aktif gen ürünü veya az gen ürünü
• Aktivite azalması yeterli değilse dominant
• Yeni işlev
• Yeni işlev
• mRNA ekspresyonunda azalma
• Protein aktivitesinde artma
• huntington mutasyonları
• Dominant negatif
• Normal alleli etkileyen anormal işlev
kollagen mutasyonları osteogenesis imperfecta’da
İşlev kaybı
• İnaktif gen ürünü veya aktivite azalması
Kritik
normal fenotip
için gerekli
AA aa A-dominant
a-resesif
B-dominant
b-resesif
Otozomal Dominant Hastalıklar
Familial hypercholesterolemia
Familial hypercholesterolemia
P
Bu gebelikte olasılık
nedir?
A a
a
a Aa
Aa
normal
Maternal
Paternal
Punnett Square “a” = normal allel
“A” = mutant allel
aa
aa
1/2 1/2
1/2
1/2
hasta
Aa
Aa
1/4 1/4
1/4 1/4
1/2
+
1/2
+
Polidaktili
Polidaktili
otosomal dominant kalıtım
Brakidaktili
otosomal dominant kalıtım
Pseudoachondroplasia
• Her generasyonda görülür
• Hasta bireyin anne veya babası hastadır
• Hasta bireyde % 50 çocuklara geçme riski vardır
• Hasta olamayan bireylerden çocuklara risk yoktur
• Eşem farkı gözetmez
• Yeni mutasyonlar oldukça çoktur
Otozomal dominant kalıtımın
özellikleri
Otozomal dominant hastalıklarda ekspresyon
farkı oluşur:
1. Penetrans-özelliğin fenotipte görülebilme oranı
2. Expressivite-Fenotipin özelliği gösterme düzeyi
3. Pleiotropi- Bir genetik kusurun birden fazla özelliği
etkilemesi
Azalmış Penetrans
Retinoblastoma
non-penetrant
Tay-Sachs Hastalığı
- otosomal resesif
hastalık
- II1 ve II2 taşıyıcı
- En az 2 taşıyıcı olmalı
- Hepsi taşıyıcı da olabilir
Otozomal Resesif
İki heterozigotun evliliği ile ortaya çıkar.
Eşem farkı gözetmez.
Hastalar ayni generasyonda ve genelde kardeştir.
Cystic Fibrosis- A a
Maternal
a
A Pate
rnal
AA
aa
Aa
Aa
1/4 1/4
1/4 1/4
normal
taşıyıcı
affectedaffected
1/4
1/2
1/4 Bu gebeliklerin etkilenme oranı
aa
Aa Aa
hasta
A-normal CF gen
a-mutant CF gen
Akraba evlilikleri
• Ortak atadan gelen
bireylerin evliliği
• Otozomal resesif
hastalıkların ortaya
çıkışında önemli.
Phenylketonuria
(PKU)
aa
a a
a a
a a
aa
Ptolemy Dynasty 323 BC - 30 BC
A1
pedigree
1/2
1/2
1/2 1/2
1/2
1/2
Path diagram
(1/2)5 + (1/2)5 = 1/16
“inbreeding coefficient “ akrabalık katsayısının
hesaplanması
Eşeme bağlı resesif kalıtım
• Xe bağlı resesif olarak da adlandırılır.
• Dişiler için iki X’de de hastalığın taşınması gerekli
• Erkekler hemizigot halde hastalığı gösterir
A: 46, XY
B: 46, XX
C: 47, XXX
D: 48, XXXX
E: 49 XXXXX
Imprinting ve X-inaktivasyonu
Kodlama yapmayan uzun
RNA (Xist) ekspresyonu X-
inaktivasyon bölgesinde (X-
inactive specific transcript).
Hemophilia A X x
Maternal
X
Y Pa
tern
al
normal
XY
Xx
XY
XX
taşıyıcı
affected
1/4 1/4
1/4 1/4
1/2
1/2
F
1/2
1/2
M
Olası hasta hasta
xY
-Generasyon atlar
- erkekleri etkiler
-- Hemophilia (no factor VIII)
Princess Alix (Alexandra) left
Queen Victoria center
Princess Irene right
• Taşıyıcı anneler tarafından taşınır.
• Erkekten erkeğe geçmez.
• Taşıyıcı dişiler de bazen etkilenebilir.
(X inativasyonu veya Lyonizasyon).
Eşeme bağlı resesif kalıtım
Eşeme bağlı dominant
hypophosphatemic rickets, vitamin D-resistant rickets
Eşeme bağlı dominant kalıtım
• X kromozumuna bağlı dominant
• Dişilerde erkeklerin iki katı ortaya çıkma olasılığı var
• Hasta erkek hastalığı tüm kızlarına geçirir, erkek çocuklar sağlamdır.
• Bazıları erkeklerde letaldir.
Kalıtım şekillerini etkileyen
faktörler
• Yeni mutasyon
• Penetrans
• Expresivite
• Pleiotropi
• Germline mosaiği
• Heterogeni
• Pseudodominans
Germline Mosaiği
Embryo
Heterogeni
– Allelik Heterogeni – farklı mutasyonlar ayni tabloyu oluşturur– Hb gene: thalassemias
– Lokus Heterogeni – Farklı lokuslardaki mutasyonlar ayni hastalığı oluşturur
hyperphenylalanemias: mutations in phenylalanine hydroxylase and biopterin
– Klinik Heterogeni – Ayni gendeki farklı mutasyonlar farklı tablolar oluşturur
phenylalanine hydroxylase mutations lead to different forms of PKU phenylketonuria
Pseudodominans
• Sık akraba evlilikleri nedeniyle otosomal
resesif karakterli bir aile ağacının otosomal
dominant kalıtım biçimi gibi görünüm
alması(Hastalığın her generasyonda
görülmesi).