modelli di studio - scuola di medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella...

72
Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 1 Università del Piemonte Orientale Corso di Laurea in Biotecnologie Mediche Corso di Statistica Medica I modelli di studio Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 2 Modelli di studio • Sperimentale • Osservazionale / Epidemiologico

Upload: hoangngoc

Post on 16-Feb-2019

224 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

1

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 1

Università del Piemonte Orientale

Corso di Laurea in Biotecnologie Mediche

Corso di Statistica Medica

I modelli di studio

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 2

Modelli di studio

• Sperimentale • Osservazionale / Epidemiologico

Page 2: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

2

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 3

Modelli di studio• Sperimentale

– Lo sperimentatore:– determina un’esposizione e

ne studia gli effetti– assegna le ‘unità

sperimentali’ ai diversi trattamenti.

– definisce modalità e durata dei trattamenti.

– definisce il numero di unitàsperimentali per ciascun trattamento.

• Osservazionale– Il ricercatore:– osserva gli effetti di

esposizioni/trattamenti– non può influire

sull’assegnazione dei soggetti

– non può influire sulle modalità di esposizione

– il numero di soggetti eleggibili dipende dalla frequenza degli eventi

– non può aumentare il numero di soggetti eleggibili

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 4

Modelli di studio

• Sperimentale

– Studi in Laboratorio– Sperimentazione

clinica

• Osservazionale / Epidemiologico– Survey– Studio trasversale– Studio prospettico o

di coorte– Studio retrospettivo o

caso-controllo

Page 3: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

3

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 5

Disegno statistico degli esperimenti

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 6

• Principi del disegno sperimentale– Replicazione, – Randomizzazione– Blocchi– Ortogonalità

Page 4: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

4

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 7

• Principi del disegno sperimentale– Replicazione -Alla base della misura precisa della

variabilità e dell'effetto

-Potenza dello studio

-Risorse

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 8

trattamentosoggetto 1 2

1 8,4 9,42 12,8 15,23 9,6 9,14 9,8 8,85 8,4 8,26 8,6 9,97 8,9 9,08 7,9 8,1

tot 74,4 77,7media 9,30 9,71

Replicazioni

Il caso di uno studio con misure ripetute: qui le replicazioni sono i diversi soggetti inclusi

Page 5: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

5

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 9

varietà

A B C D E F

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

20 20 20 20 20 20

Il caso di uno studio sul confronto tra diverse varietàdi piante. Qui le replicazioni sono i semi che sono

stati piantati

Numero di repliche

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 10

• Principi del disegno sperimentale– Replicazione, – Randomizzazione– Blocchi– Ortogonalità

Page 6: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

6

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 11

Selezione

Randomizzazione

Trattamento A

Trattamento B

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 12

-Obiettivo è l’eliminazione delle distorsionisistematiche (bias)

- L’assegnazione del trattamento ad un individuoè fatta dal caso, non dal ricercatore

-Deve essere condotta con metodi appropriati(assegnazione casuale, secondo i metodidescritti nella lezione sul campionamento)

-E’ alla base della stima accurata della variabilitàcasuale

Randomizzazione

Page 7: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

7

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 13

• Principi del disegno sperimentale– Replicazione, – Randomizzazione– Blocchi– Ortogonalità

-Controllo dei fattori estranei di variazione

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 14

Blocking (Stratificazione!)

molto secco secco umido molto umido

Studio della fertilità di diverse varietà di piante(A, B, C, D, E, F)

In un terreno non omogeneo per quanto riguardal’umidità.

Page 8: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

8

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 15

semente A B C D E F Blocco=1 / molto secco Blocco=2/ secco Blocco=3 / umido Blocco=4 / molto umido

Blocchi (stratificazione)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 16

semente A B C D E F 5 5 5 5 5 5 Blocco=1 / very dry 5 5 5 5 5 5 Blocco=2/ dry 5 5 5 5 5 5 Blocco=3 /wet 5 5 5 5 5 5 Blocco=4 / very wet

Replicazioni e blocchi

Numero di repliche distribuite in ciascun blocco

Page 9: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

9

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 17

I blocchi dovrebbero essere:

• Uniformi al loro interno

• Quanto più possibile diversi tra loro

• In queste condizioni i blocchi spieganoquanto più possibile della variabilità dellarisposta e quindi minimizzano la varianzaresidua (Error Mean Square)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 18

• Principi del disegno sperimentale– Replicazione, – Randomizzazione– Blocchi– Ortogonalità

Page 10: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

10

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 19

Varietà A B C D E F Molto secco Secco Umido Molto umido

Ortogonalità nel caso di variabilicategoriche

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 20

Varietà A B C D E F Molto secco Secco Umido Molto umido

Ortogonalità nel caso di variabilicategoriche

In una tabella chepresenta la frequenza di

osservazioni per le diverse

combinazioni delledue variabili, ciascuna cella

dovrebbe contenerelo stesso numero di

osservazioni.

Page 11: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

11

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 21

Varietà A B C D E F 5 5 5 5 5 5 Molto secco 5 5 5 5 5 5 Secco 5 5 5 5 5 5 Umido 5 5 5 5 5 5 Molto umido

Ortogonalità nel caso di variabilicategoriche

In una tabella dellafrequenza di

osservazioni per le diverse

combinazioni delledue variabili, ciascuna cella

dovrebbe contenerelo stesso numero di

osservazioni.

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 22

Varietà A B C D E F 5 5 2 5 5 5 Molto secco 5 5 5 5 5 5 Secco 5 5 5 5 5 5 Umido 5 2 5 5 1 5 Molto umido

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche

Se non è così, conoscendo il valore

di una delle due variabili cambia

anche la distribuzione diprobabilità deivalori dell’altra

variabile

Page 12: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

12

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 23

Varietà A B C D E F 5 5 2 5 5 5 Molto secco 5 5 5 5 5 5 Secco 5 5 5 5 5 5 Umido 5 2 5 5 1 5 Molto umido

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche

In tal caso ho unasituazione di ‘non ortogonalità’ (o confondimento).

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 24

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche:cosa significa mancanza di ortogonalità

a b cstrati 1 10 10 10

2 10 10 103 10 10 104 10 10 10

numero 40 40 40

Trattamenti

Vogliamo studiare l’effetto di tre diversi trattamenti (a, b, c) applicati a quattro diverse categorie di persone (strati 1, 2, 3, 4). Includiamo 40

persone per trattamento, distribuite in 10 per ogni strato.

Page 13: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

13

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 25

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche:cosa significa mancanza di ortogonalità

a b cstrati 1 100 100 100

2 200 200 2003 300 300 3004 400 400 400

Trattamenti

In realtà i tre trattamenti non presentano nessuna differenza tra di loro. Invece i quattro gruppi di persone sono tra loro molto diversi.

La tabella presenta il valore medio misurato dopo il trattamento, per ciascun trattamento e per ciascuno strato.

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 26

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche:cosa significa mancanza di ortogonalità

Confronto i diversi trattamenti calcolando la media pesata (I pesi sono le persone in ciascuna combinazione strato x trattamento). Ottengo il

seguente risultato

a b cstrati 1 100 100 100

2 200 200 2003 300 300 3004 400 400 400

media pesata 250 250 250

Trattamenti

Page 14: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

14

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 27

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche:cosa significa mancanza di ortogonalità

a b cstrati 1 10 5 10

2 10 10 103 10 10 104 5 10 10

numero 35 35 40

Trattamenti

Immaginiamo adesso di ripetere lo studio ma, per errore nel disegno, diincludere un numero diseguale di soggetti (da cui mancanza di

ortogonalità).

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 28

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche:cosa significa mancanza di ortogonalità

a b cstrati 1 100 100 100

2 200 200 2003 300 300 3004 400 400 400

Trattamenti

Il valore medio misurato dopo il trattamento, per ciascun trattamento e per ciascuno strato non cambia.

Page 15: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

15

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 29

Ortogonalità nel caso di variabili categoriche:cosa significa mancanza di ortogonalità

La media pesata invece mostra un’apparente differenza tra i trattamenti. E’ un errore dovuto alla perdita di ortogonalità.

a b cstrati 1 100 100 100

2 200 200 2003 300 300 3004 400 400 400

media pesata 228,57 271,43 250

Trattamenti

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 30

Il disegno fattoriale

• Il disegno fattoriale• L’analisi di un esperimento con disegno

fattoriale• Interazione

Page 16: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

16

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 31

Disegno fattoriale: i totali

S4S3S2S1

S

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 32

Disegno fattoriale: i totali

V2

V1

V

Page 17: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

17

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 33

Disegno fattoriale: i termini di interazione

V2

V1

V2*S4V2*S3V2*S2V2*S1

V1*S4V1*S3V1*S2V1*S1

V

S4S3S2S1

S

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 34

Disegno fattoriale: il disegno completo

V2

V1

V2*S4V2*S3V2*S2V2*S1

V1*S4V1*S3V1*S2V1*S1

V

S4S3S2S1

S

Page 18: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

18

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 35

Disegno fattoriale: il numero di oss(replicazioni implicite).

V2=4

V1=4

N=8

V2*S4=1

V2*S3=1

V2*S2=1

V2*S1=1

V1*S4=1

V1*S3=1

V1*S2=1

V1*S1=1

V

S4=2S3=2S2=2S1=2

S

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 36

trattamentostrato 1 2 3 4 tot media

1 8.4 9.4 9.8 12.2 39.8 9.952 12.8 15.2 12.9 14.4 55.3 13.833 9.6 9.1 11.2 9.8 39.7 9.934 9.8 8.8 9.9 12.0 40.5 10.135 8.4 8.2 8.5 8.5 33.6 8.406 8.6 9.9 9.8 10.9 39.2 9.807 8.9 9.0 9.2 10.4 37.5 9.388 7.9 8.1 8.2 10.0 34.2 8.55

tot 74.4 77.7 79.5 88.2 319.8media 9.30 9.71 9.94 11.03 9.99

Page 19: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

19

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 37

trattamentostrato 1 2 3 4 tot media

1 8.4 9.4 9.8 12.2 39.8 9.952 12.8 15.2 12.9 14.4 55.3 13.833 9.6 9.1 11.2 9.8 39.7 9.934 9.8 8.8 9.9 12.0 40.5 10.135 8.4 8.2 8.5 8.5 33.6 8.406 8.6 9.9 9.8 10.9 39.2 9.807 8.9 9.0 9.2 10.4 37.5 9.388 7.9 8.1 8.2 10.0 34.2 8.55

tot 74.4 77.7 79.5 88.2 319.8media 9.30 9.71 9.94 11.03 9.99

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 38

trattamentostrato 1 2 3 4 tot media

1 8.4 9.4 9.8 12.2 39.8 9.952 12.8 15.2 12.9 14.4 55.3 13.833 9.6 9.1 11.2 9.8 39.7 9.934 9.8 8.8 9.9 12.0 40.5 10.135 8.4 8.2 8.5 8.5 33.6 8.406 8.6 9.9 9.8 10.9 39.2 9.807 8.9 9.0 9.2 10.4 37.5 9.388 7.9 8.1 8.2 10.0 34.2 8.55

tot 74.4 77.7 79.5 88.2 319.8media 9.30 9.71 9.94 11.03 9.99

Page 20: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

20

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 39

trattamentostrato 1 2 3 4 tot media

1 8.4 9.4 9.8 12.2 39.8 9.952 12.8 15.2 12.9 14.4 55.3 13.833 9.6 9.1 11.2 9.8 39.7 9.934 9.8 8.8 9.9 12.0 40.5 10.135 8.4 8.2 8.5 8.5 33.6 8.406 8.6 9.9 9.8 10.9 39.2 9.807 8.9 9.0 9.2 10.4 37.5 9.388 7.9 8.1 8.2 10.0 34.2 8.55

tot 74.4 77.7 79.5 88.2 319.8media 9.30 9.71 9.94 11.03 9.99

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 40

Interazione

Parliamo di interazione quando il risultato per unavariabile dipende dal valore dell’altra.

Page 21: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

21

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 41

A

B

(ii)

Trattamento

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 42

A

B

(ii)

A,B

(iii)

FertilizzanteTrattamento

Page 22: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

22

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 43

A

B

(ii)

A,B

(iii)

AB

(iv)

A

B

(v)

Trattamento Fertilizzante

Trattamento e Fertilizzante

? ?

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 44

AB

(iv)

A

B

(v)

No interazione Interazione

Page 23: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

23

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 46

Il disegno dello studio• Il laboratorio: il disegno fattoriale.• Il contesto clinico: lo studio clinico

randomizzato.• Il contesto osservazionale: coorte e

caso controllo.• Gli studi con dati appaiati

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 47

Clinical Trial o Esperimento Clinico

• esperimento condotto per misurare l’efficacia di un

trattamento terapeutico.

– Clinical Trial

– Controlled Clinical Trial

– Randomized Controlled Clinical Trial

– Trial Clinico Controllato Randomizzato.

Page 24: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

24

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 48

Clinical Trial o Esperimento Clinico Controllato

• Un clinical trial non è uno studio isolato ma si

inserisce in una sequenza di indagini per

conoscere e valutare le ‘prestazioni’ di un

farmaco o di un trattamento, in modo

comparativo rispetto ad altri farmaci o

trattamenti.

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 49

• Studi di famacocinetica

• Fase 1: studio preliminare degli effetti e delle dosi possibili (pochi volontari)

• Fase 2: dimostrazione preliminare di efficacia (pochi pazienti)

• Fase 3: misura dell’efficacia del trattamento, in modo comparativo con trattamenti alternativi

• Fase 4: farmacovigilanza (tossicità)

• Meta-analisi

Page 25: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

25

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 50

Studi fase 1

Obiettivi:• Massima Dose somministrabile • Modalità di somministrazione• Effetti avversi (tipo, organi, durata, gravità,

probabilità) limitanti la dose

Non sono randomizzatiNon c’è un gruppo di controlloN. Soggetti < 20

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 51

Studi fase 1

• Disegno generale:

• Somministrazione a pochi soggetti di dosi progressivamente crescenti di farmaco.

• Ricerca della dose associata ad effetti tossici.

Page 26: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

26

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 52

• Se lo studio è riferito ad un farmaco non studiato in precedenza è necessaria una specifica autorizzazione dal ministero della sanità.

• Se invece è uno studio di dose finding per individuare la dose ottimale in condizioni nuove può essere condotto come un normale trial.

• Necessario consenso informato dei partecipanti ed approvazione del comitato etico

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 53

Studi fase 1

Dose e tossicità in oncologia: • Dose Massima Tollerata (MTD): la dose

massima associata con effetti gravi ma reversibili in una proporzione rilevante di soggetti.

• Tossicità Dose Limitante (DLT): l’evento avverso che impedisce un ulteriore incremento della dose

Page 27: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

27

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 54

Studi fase 1

• Dose minima definita in base a studi preclinici o precedenti fase 1

• Incremento scalare (serie di Fibonacci modificata 1- 1 - 2 - 3 - 5 – 8 – 13- 21-34….)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 55

Studi fase 1

30%16 x D34 x D830%12 x D21 x D729%9 x D13 x D640%7 x D8 x D550%5 x D5 x D467%3,3 x D3 x D3100%2 x D2 x D2-DD1incremento%F. modif.Fibonacci

Page 28: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

28

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 56

Livello i

Osservata DLT?

NO

i+1

Si 1 pz

Si > 1 pz

+ 3 pazienti

Osservata DLT?STOP

o espande i-1

3 pazienti

Si >=1 pz

NO

STOP o espande i-1

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 57

Studi fase 1Lettura suggerita: • Orlowski RZ et al. Phase 1 trial of the proteasome inhibitor

PS-341 in patients with refractory hematologicmalignancies. J Clin Oncol 2002; 20:4420-4427.

• E. Claire Dees · Bert H. O’Neil · Celeste M. Lindley ·Frances Collichio Lisa A. Carey · Jason Collins · William J. Riordan · Anastasia Ivanova ·Dixie Esseltine · Robert Z. Orlowski A phase I and pharmacologic study of the combination of bortezomib and pegylated liposomaldoxorubicin in patients with refractory solid tumors. Cancer Chemother Pharmacol DOI 10.1007/s00280-008-0716-8

Page 29: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

29

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 58

• Studi di famacocinetica

• Fase 1: studio preliminare degli effetti e delle dosi possibili (pochi volontari)

• Fase 2: dimostrazione preliminare di efficacia (pochi pazienti)

• Fase 3: misura dell’efficacia del trattamento, in modo comparativo con trattamenti alternativi

• Fase 4: farmacovigilanza (tossicità)

• Meta-analisi

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 59

Studi fase 2Obiettivi:• Valutazione preliminare di efficacia

(frequenza di successi, effetti avversi, tossicità)

• Fattibilità di studi successivi

Page 30: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

30

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 60

Il trial di fase 2mira ad indicare se il risultato è:

Così modesto da non meritare studi

ulteriori (π < π0 )

Sufficientemente buono da

giustificare uno studio di fase 3

(π>π1 )

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 61

Studi fase 2Disegno generale:• Somministrazione a un gruppo di soggetti del farmaco alla

dose definita con il precedente studio di fase 1.

• Una sola posologia

• Non randomizzati: confronto con valori attesi da serie storiche o trattamento in uso corrente

oppure• Randomizzati: confronto con interno

• N. Soggetti 20 – 100 (minimizzazione delle dimensioni)

Page 31: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

31

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 62

Studi fase 2

• Disegno ad uno stadio (Fleming)

• Disegno a due stadi (Gehan; Simon)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 63

Studi fase 2

• Disegno ad uno stadio (Fleming)

Analisi dei dati e dimensione dello studio in base al calcolo dell’intervallo di confidenza

nppzp )1(ˆ

2

−×± α

Page 32: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

32

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 64

Studi fase 2

• Disegno ad uno stadio (Fleming)

Il farmaco è di interesse se il limite inferiore dell’IC supera un valore predefinito.

nppzp )1(ˆ

2

−×± α

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 65

Studi fase 2

• Disegno a due stadi (Gehan; Simon)

• Nel disegno a due stadi viene prima valutato se (π < π0 )

• Quindi vengono reclutati ulteriori soggetti per valutare se (π>π1 )

Page 33: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

33

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 66

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 67

• Studi di famacocinetica

• Fase 1: studio preliminare degli effetti e delle dosi possibili (pochi volontari)

• Fase 2: dimostrazione preliminare di efficacia (pochi pazienti)

• Fase 3: misura dell’efficacia del trattamento, in modo comparativo con trattamenti alternativi

• Fase 4: farmacovigilanza (tossicità)

• Meta-analisi

Page 34: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

34

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 68

Studi fase 3Obiettivi:• Valutazione comparativa della frequenza /

importanza di successi ed effetti avversi

Disegno generale:• Il nuovo farmaco viene confrontato al trattamento

correntemente in uso in modo da valutare in modo comparativo efficacia ed effetti avversi.

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 69

Pazienti in studio

Trattamento base Trattamento innovativo

Risultato osservato Risultato osservato

Test di H0 sulla differenza tra i risultati osservati

Page 35: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

35

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 70

Clinical Trial o Esperimento Clinico Controllato

• Il clinical trial è uno strumento

essenziale per valutare l’efficacia di un

farmaco

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 71

Tipo di studio Forza dell’evidenza

Massima, forte convinzioneMeta-analisi di RCT

Replicazioni di RCT

Trial clinici randomizzati

Studi osservazionali

Analisi di serie storiche

Serie cliniche

Minima, un suggerimentoCase reports singoli

Page 36: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

36

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 72

Studi fase 3Disegno generale:

• Controllati • Randomizzati • In cieco o valutazione indipendente• N. Soggetti > 100

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 73

Come si costruisce un C.T.

• Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Aspetti etici

• Potenza dello studio

• Selezione dei pazienti

• Assegnazione ai diversi trattamenti

• Valutazione della risposta a livello individuale

• Analisi dei dati (Valutazione della risposta a livello dello studio)

Page 37: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

37

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 74

Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Il quesito non è di competenza dello statistico

ma del clinico cui lo statistico fornisce la

metodologia necessaria e (quando

opportuno) uno stimolo critico.

• Problema e risultati attesi debbono essere chiaramente specificati nel protocollo dello studio.

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 75

Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Es.1: la somministrazione di chemioterapia migliora

la sopravvivenza dei pazienti di mesotelioma?

• Es.2 tra due diversi schemi di trattamento con un

chemioterapico, qual’è più efficace?

• Es.3: la riduzione del trattamento radioterapico

pregiudica la sopravvivenza?

• Es.4: due farmaci hanno la stessa efficacia?

Page 38: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

38

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 76

La somministrazione di chemioterapia migliora la sopravvivenza dei pazienti affetti da mesotelioma?

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 77

Confronto tra Capecitabina e fluorouracile + leucovorin nel tumore metastatico del colon (J Clin Oncol 2001 19: 4097-4106)

Domanda: “ La somministrazione per os di un composto che a livello cellulare rilascia 5-FU ha la stessa efficacia della somministrazione di 5-FU endovenosa? “

due farmaci hanno la stessa efficacia?

Page 39: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

39

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 78

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 79

Come si costruisce un C.T.

• Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Aspetti etici

• Potenza dello studio

• Selezione dei pazienti

• Assegnazione ai diversi trattamenti

• Valutazione della risposta a livello individuale

• Analisi dei dati (Valutazione della risposta a livello dello studio)

Page 40: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

40

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 80

Aspetti etici

• Requisiti: – incertezza tra diverse soluzioni equivalenti– sufficiente conoscenza dei farmaci– qualità dello studio

• Revisione scientifica

• Comitati etici

• Consenso informato

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 81

Come si costruisce un C.T.

• Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Aspetti etici

• Potenza dello studio

• Selezione dei pazienti

• Assegnazione ai diversi trattamenti

• Valutazione della risposta a livello individuale

• Analisi dei dati (Valutazione della risposta a livello dello studio)

Page 41: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

41

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 82

Selezione dei pazienti

• Rappresentatività dei pazienti inclusi nello studio rispetto all’universo dei pazienti della malattia in studio

• Spesso gli studi clinici sono condotti su sottogruppi selezionati di pazienti

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 83

Rappresentatività dei pazienti inclusi nello studio rispetto all’universo dei pazienti

della malattia in studio

elenco dei pazienti affetti dalla malattia – in ciascuno dei centri

– informazioni essenziali

– indicazione dell’inclusione o meno nello studio (con i motivi)

Page 42: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

42

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 84

Come si costruisce un C.T.

• Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Aspetti etici

• Potenza dello studio

• Selezione dei pazienti

• Assegnazione ai diversi trattamenti

• Valutazione della risposta a livello individuale

• Analisi dei dati (Valutazione della risposta a livello dello studio)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 85

Pazienti in studio

Trattamento base Trattamento innovativo

Risultato osservato Risultato osservato

Test di H0 sulla differenza tra i risultati osservati

Assegnazione casuale

Page 43: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

43

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 86

Assegnazione casuale del trattamento -Randomizzazione

Non dipende dal ricercatore

Non dipende dal paziente

Garantisce l’uniformità dei gruppi a confronto rispetto a tutte le variabili, anche se dimenticate.

Giustificato eticamente dalla equivalenza dei trattamenti che sono posti a confronto

Requisito per la corretta inferenza statistica

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 87

Aspetti etici• Requisiti:

– incertezza tra diverse soluzioni equivalenti– sufficiente conoscenza dei farmaci– qualità dello studio– partecipazione volontaria e senza penalizzazioni per la

mancata partecipazione

• Strumenti:– Consenso informato

– Revisione scientifica

– Comitati etici

Page 44: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

44

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 88

Prerequisiti etici per un CT

Incertezza tra alternative di trattamento

– Relativamente all’efficacia terapeutica

– Relativamente agli effetti collaterali

– Relativamente al costo, sia diretto sia indiretto (a parità di efficacia ed effetti collaterali)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 89

Assegnazione casuale del trattamento -Randomizzazione

Metodo:

- Tavole dei numeri casuali

- Estrazione da urna

- Programmi al calcolatore

Page 45: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

45

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 90

Esempio di randomizzazione in uno studio multicentrico:

• Studi AIEOP - protocollo LLA 2000

• registrazione su data base comune via internet

• contestuale randomizzazione

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 91

Verifichiamo se la randomizzazione ha

portato a gruppi equivalenti per le loro

caratteristiche di base.

Page 46: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

46

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 92

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 93

Page 47: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

47

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 94

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 95

Come si costruisce un C.T.

• Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Aspetti etici

• Potenza dello studio

• Assegnazione dei diversi trattamenti ai diversi pazienti

• Valutazione della risposta a livello individuale

• Analisi dei dati (Valutazione della risposta a livello dello studio)

Page 48: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

48

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 96

Risultati (End-points)

• Riduzione lesione

• Remissione

• Riduzione sintomi

• Sopravvivenza

• Durata dell’intervallo libero da malattia

• Effetti indesiderati del farmaco

• ………………

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 97

Valutazione della risposta a livello individuale

• Cieco (il paziente ignora il trattamento)

• Doppio cieco (il paziente ed il medico ignorano il

trattamento)

• Triplo cieco (il paziente, il medico che segue il

paziente, il medico che valuta il risultato ignorano il

trattamento

• Uso del Placebo

Page 49: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

49

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 98

Valutazione dell’end-point

• Valutazione in cieco

• Metodi obiettivi

• Sopravvivenza da dati anagrafici

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 99

Frequenza di risposta al trattamento

CAP 5-FU

Clinico 26.6%21.7-32.0

17.9%13.8 – 22.8

Page 50: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

50

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 100

Frequenza di risposta al trattamentoconfronto tra osservatori

CAP 5-FU

Revisoreesterno

18.9%14.7-23.8

15.0%11.1-19.5

Clinico 26.6%21.7-32.0

17.9%13.8 – 22.8

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 101

Il disegno dello studio• Il laboratorio: il disegno fattoriale. • Il contesto clinico: lo studio clinico

randomizzato (fase III).• Il contesto osservazionale: coorte e caso

controllo (cenni).• Gli studi con dati appaiati.• Interazione• Accuratezza• Precisione• Potenza statistica

Page 51: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

51

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 102

Gli studi con dati appaiati.

• Esperimenti con disegno ‘cross-over’

• Studi con appaiamento individuale

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 103

Esperimenti con disegno ‘cross-over’

Selezione

Randomizzazione

Trattamento A

Trattamento B

Wash-out

Trattamento B

Trattamento A

Page 52: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

52

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 104

Come si costruisce un C.T.

• Definizione del problema e dei risultati attesi.

• Aspetti etici

• Potenza dello studio

• Assegnazione dei diversi trattamenti ai diversi pazienti

• Valutazione della risposta a livello individuale

• Analisi dei dati (Valutazione della risposta a livello dello studio)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 105

Come misuriamo l’associazione tra:

trattamento (o esposizione)ed

effetto (outcome)?

Page 53: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

53

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 106

Metodi di analisi

• Analisi per dati quantitativi• Analisi per dati categorici• Analisi sopravvivenza

• Analisi univariate• Analisi stratificate• Analisi multivariate• Metodi non-parametrici

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 107

Il tipo di variabile che definisce l’outcome

• categorica binaria

• categorica non binaria

• quantitativa

• tempo (di sopravvivenza)

Page 54: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

54

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 108

Var. categorica binaria

• Es. miglioramento vs non miglioramento dopo la somministrazione di un farmaco.

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 109

Var. categorica non binaria• Esito dopo un ricovero in rianimazione per

trauma cranico. L’esito è classificato secondo una scala a 5 livelli:– morto– in stato vegetativo– gravemente invalido– lievemente invalido– buone condizioni

(scala di Glasgow, ordinale)

Page 55: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

55

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 110

Frequenza di risposta al trattamento

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 111

Var. quantitativa

• Variazione di una misura ematochimica

Page 56: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

56

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 112

Var. tempo

• Tempo di sopravvivenza• tempo di remissione

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 113

Se var. categorica binaria

OR (Meropenem vs. Ceftazidima) = (79 * 65) / (49 * 56) = 1,87

Febbre

Farmaco Curato Non curato Totale

Meropenem 79 56 135

Ceftazidima 49 65 114

TOTALE 128 121 249

Page 57: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

57

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 114

Cosa dobbiamo sempre calcolare?

• Intervallo di confidenza

• test di significatività (chi^2)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 115

quantitativa• Differenza (o rapporto) tra i risultati dei

diversi trattamenti

• Test di significatività– analisi della varianza – test t– tests non parametrici

• intervallo di confidenza

Page 58: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

58

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 116

• Se lo studio è appaiato occorre analizzare i dati adottando le tecniche appropriate.

• Variabili continue: analisi della differenza (cfr. Test t per dati appaiati)

• Variabili categoriche: tabelle di corrispondenza (cfr. OR di McNemar)

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 117

Bibliografia• Peto R, Pike MC, Armitage P et al. Design and analysis of

randomized clinical trials requiring prolonged observation of eachpatient. I Introduction and design Br. J. Cancer 1976; 34: 585-612. II Analysis and examples Br. J. Cancer 1977; 35: 1-39.

• Marubini E and Valsecchi. Analysing Survival Data from ClinicalTrials and Observational Studies, Wiley, 1995.

• Friedman LM, Furberg CD, DeMets DL Fundamentals of ClinicalTrials Springer, 1998

• Piantadosi S. Clinical Trials - A methodologic Perspective. Wiley, 1997

• http://www.consort-statement.org/

Page 59: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

59

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 118

Il disegno dello studio• Il laboratorio: il disegno fattoriale. • Il contesto clinico: lo studio clinico

randomizzato (fase III).• Il contesto osservazionale: coorte e caso

controllo (cenni).• Gli studi con dati appaiati.• Interazione• Accuratezza• Precisione• Potenza statistica

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 119

• Accuratezza:stima senza errore sistematico

• Precisione:stima senza errore casuale

Page 60: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

60

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 120

Il disegno dello studio• Il laboratorio: il disegno fattoriale. • Il contesto clinico: lo studio clinico

randomizzato (fase III).• Il contesto osservazionale: coorte e caso

controllo (cenni).• Gli studi con dati appaiati.• Interazione• Accuratezza• Precisione• Potenza statistica

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 121

Potenza statistica di uno studio

• Probabilità di riconoscere come statisticamente significativo il valore ipotizzato per il parametro (assumendo che tale sia il valore del parametro nella popolazione).

• Dipende da:– valore del parametro– variabilità– numero di soggetti– errore statistico accettato

Page 61: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

61

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 122

Potenza dello studio e dimensione campionaria

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 123

Introduzione

• Nella pianificazione di uno studio clinico è fondamentale determinare in modo appropriato il numero di soggetti da includere in ogni gruppo.

• La stima del campione permette la valutazione a priori del costo della sperimentazione, del numero di centri da coinvolgere e del numero di pazienti per ogni centro in caso di studio multicentrico.

• Il numero di soggetti da includere nello studio è ottenuto sulla base del valore di potenza dello studio fissato dal ricercatore

Page 62: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

62

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 124

I test di ipotesi

• I test di ipotesi permettono di rifiutare o meno specifiche affermazioni sui parametri della popolazione

• L’ipotesi nulla è un’affermazione riferita ad uno o più parametri sottoposta a test statistico per valutare se è supportata dai dati campionari

• L’ipotesi alternativa viene accettata, se si prova, sulla base dei dati osservati, che l’ipotesi nulla non è plausibile

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 125

Errori di prima e seconda specie

Conclusione del test

Verità

H0 Vera H0 Falsa

Rifiutare H0 Errore di I specie α

Potenza (1 – β)

Accettare H0 1 - α Errore di II specie β

Page 63: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

63

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 126

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 127

Page 64: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

64

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 128

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 129

Errori di prima e seconda specie

• Solitamente la probabilità di commettere l’errore di primo tipo (α) viene fissato pari a 0.05

• La potenza viene fissata uguale a 0.80 o 0.90

Page 65: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

65

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 130

Potenza

• La potenza di un test (1 – β) è la probabilità di rifiutare l’ipotesi nulla quando è falsa

• Un valore di potenza basso comporterebbe il rifiuto di una terapia potenzialmente efficace

• Un valore di potenza troppo elevato condurrebbe ad un sostanziale aumento della dimensione campionaria

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 131

Dimensione campionaria

• Per determinare la dimensione campionaria da considerare in uno studio clinico il ricercatore deve tenere conto:

• dell’errore di prima e di seconda specie• dell’entità dell’effetto del trattamento atteso

secondo l’ipotesi di lavoro (corretto per la variabilità nel campione)

Page 66: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

66

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 133

Variazione della media vera nella popolazione

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 134

Page 67: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

67

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 135

Media = 0,4

Media = 0,6

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 136

Variazione della deviazione standard

Page 68: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

68

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 137

DS=1,0

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 138

DS=0,8

DS=1,0

Page 69: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

69

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 139

Variazione del numero di osservazioni

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 140

N=36

Page 70: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

70

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 141

N = 36

N=36

N=64

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 142

Variazione dell’errore di primo tipo

Page 71: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

71

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 143

Alfa= 0,05

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 144

Alfa= 0,05

Alfa= 0,01

Page 72: Modelli di studio - Scuola di Medicinamagnani/pdf/biotech_2009_13_disegno.pdf · descritti nella lezione sul campionamento) ... Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche

72

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 145

L’equazione fondamentale

( )2

22112

δσβα −− +

=zz

n

Corso di laurea magistrale in biotecnologie mediche - Statistica Medica – Disegno dello studio 146

Dimensione campionaria

α=0.10α=0.05α=0.10α=0.05

121416181.50162022281.25243234421445662750.75981261381680.503965025486720.25

1- β = 0.801- β = 0.90∆ / σ