İnsan etkinliklerinin mikroorganizmaların evrimine etkileri · 2017-08-27 · triassic permian...
TRANSCRIPT
![Page 1: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/1.jpg)
İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine
EtkileriEtkileri
Osman Şadi YENEN
26 Mayıs 2017, Aydın
![Page 2: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/2.jpg)
Yeryüzünden Ay’a doğru yol alan Apollo 17’den Yerkürenin görünüşü. Uzaydan ekosfere bakış.
![Page 3: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/3.jpg)
![Page 4: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/4.jpg)
Jeolojik Zaman Birimleri• Jeokronoloji birimleri: Jeolojik zamanın bölümlerini
oluşturur; karşılık geldikleri kronostratigrafibirimlerinin adlarını alırlar.
• Kronostratigrafi birimi: Jeolojik zamanın belirli bir süresi içinde oluşmuş kaya topluluğudur.
Mertebe Jeokronoloji birimleri Kronostrtigrafi birimleriMertebe Jeokronoloji birimleri Kronostrtigrafi birimleri
1 Eon Eonotem
2 Era (Zaman) Eratem
3 Period (Devir) Sistem
4 Epoch (Devre) Seri
5 Çağ Kat
6 Asçağ Askat
(MTA: 1986)
![Page 5: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/6.jpg)
Hangi jeolojik dönemdeyiz?
• Eon: Phanerozoic
• Era (Zaman): Senezoic
• Period (Devir): Quaternary
• Epoch (Devre): Holocene• Epoch (Devre): Holocene
![Page 7: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/7.jpg)
PR
OT
ER
OZ
OIC
GÜNÜMÜZ
543
Mil
yo
n y
ıl ö
nce
CE
NE
ZO
ICM
ES
OZ
OIC
65
251
Primatlardan insanların dallanması
Kuşlar
Memeliler
Sürüngenler
TERTIARY
CRETACOUS
JURASSIC
TRIASSIC
PERMIAN
Ökaryotlar
Çokhücreli yaşam (deniz
anası, süngerler, kurtçuklar)
P
H
A
N
E
R
HADEAN
AR
CH
AE
AN
2500
4000
4600
Mil
yo
n y
ıl ö
nce
PA
LE
OZ
OIC
543
Sürüngenler
Tetrapodlar
Çeneli balıklar, kara bitkileri
Kambrien patlaması
DEVONIAN
SILURIAN
ORDOVICIAN
CAMBRIAN
CARBONIFEROUS
Fotosentetik bakteriler
(Coyne JA: 2009)
O
Z
O
I
C
![Page 8: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/8.jpg)
Aridipithecus ramidus A. afarensis
Homo rudolfensis
H. habilis
H. erectus
H. ergaster
H. antecessorH. neanderthalensis
H. heidelbergensis
H. sapiens
Australopithecus anamensis
A. bahrelghazali
A. africanus
Parantropus aethiopus
P. boisei
P. robustus bonobo
chimpanzee
gorilla
5 MYÖ 4 MYÖ 3 MYÖ 2 MYÖ 1 MYÖ 100 BYÖ
![Page 9: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/10.jpg)
Microbial landmarks in the evolution of our biosphere.(Blaser MJ et al: 2016)
![Page 11: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/11.jpg)
İnsan Etkinlikleri
• Afrika’dan çıkış
• Tarım toplumuna geçiş
• Coğrafi keşifler
• Endüstri Devrimi• Endüstri Devrimi
• Büyük Hızlanma
![Page 12: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/12.jpg)
(Cavalier-Smith T: 2006)
![Page 13: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/13.jpg)
Yeryüzündeki prokaryotların çoğu açık okyanuslarda (1.2 x 1029), toprakta (2.6 x 1029), okyanusların yüzey altında (3.5 x 1030) ve
karasal yüzey altlarında (2.5 x 1030) bulunurlar.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998; 95: 6578-83
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012; 109: 16213-16
Okyanusların yüzey altında bulunan prokaryot sayısı önceki tahminlerden daha düşüktür (2.9 x 1029).
![Page 14: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/14.jpg)
Bu sayıların anlamı…
• Yeryüzündeki bakterilerin kuru biyokütlesi350.000-500.000 milyon ton…
• İnsanların kuru biyokütlesi 105 milyon ton ise bakterilerin kuru biyokütlesi insanların 3000 bakterilerin kuru biyokütlesi insanların 3000 katı…
• Toprağın gramında 50 milyon bakteriyel hücre bulunmaktadır…
• Bakterilerde bulunan toplam karbon miktarı bitkilerde bulunana eşittir…
![Page 15: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/15.jpg)
(Theis KR et al: 2016)
Holobiyont ve Hologenom Konseptleri
![Page 16: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/16.jpg)
Konakla birlikte bulunan bütün mikroplar (bakteriler, arkeonlar, viruslar ve mantarlar) sembiyontturlar. Bunların konakla ilişkileri konağa sağladıkları
net fitness avantaj ya da dezavantajına göre olası dört alt gruptan biri içinde değerlendirilir: mutualist, kommensal, patobiyont ve patojen.
(Bullman S et al: 2017)
![Page 17: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/17.jpg)
Konumuz Açısından Sonuçları
• Mikropların yayılması ve hastalıkların ortaya çıkışı
• İnsan mikrobiyotası/mikrobiyomundakideğişmelerdeğişmeler
• Antibiyotik direnci
• Mikrobiyal biyojeokimyasal süreçlere etkiler
• Küresel ısınma ve okyanusların asitleşmesi
![Page 18: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/18.jpg)
Mikropların yayılması ve hastalıkların ortaya çıkışı
![Page 19: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/19.jpg)
Homo sapiens sadece öncüllerinin ayak izlerini izlemedi, tümüyle yeni kara parçalarına da uzandı — ve nereye gittiyse ekosistemleri değiştirdi.
(Marean CW: 2015)
![Page 20: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/21.jpg)
Ay çiçeği ve bataklık mürveri 4000 yıl önce
Mısır, baklagiller,
Sığır 7000 yıl önce
Buğday ve arpa 9000 yıl önce
Akdarı 7500 yıl önce
Pirinç 8000 yıl önce
Kulkas ve baklagiller, kabak 8-5000 yıl önce Lama ve
Alpaka 7000 yıl önce
yıl önce Kulkas ve muz 6500 yıl önce
(Mithen S: 2007)
Tarımın kökenleri olarak ilk evcilleştirilmelerin başladığı sekiz merkez
![Page 22: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/22.jpg)
Köpeklerle 65 Köpeklerle 65 Sığırlarla 50 Koyun ve Keçilerle 46 Atlarla 35 Kümes hayvanlarıyla 26
![Page 23: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/23.jpg)
Keşifler çağı
Kolonileştirme, halkların kıyımı, köleleştirme, sömürü, besinlerin ve mikroorganizmaların değişimi…
![Page 24: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/24.jpg)
(Lewis SL, Maslin MA: 2015)
![Page 25: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/25.jpg)
TEHLİKE: Yabanıl hayvanlar insanlara atlama yeteneği olan patojenleri taşıyabilirler –ki bu başlıca enfeksiyöz katil olma yolunda ilk adımdır – dolayısıyla pandemilerden kaçınmak için yeni planlama onlarla başlar. başlar.
DANGER: Wild animals can carrypathogens capable of jumping intohumans – the first step towardbecoming a major infectious killer – so a new plan for avoidingpandemics begins with them.
![Page 26: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/26.jpg)
![Page 27: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/27.jpg)
Agricultural expansion and declines in forest cover (1990–2010) in primate range regions.
Sixty percent of primate species are threatened with extinction and 75% have declining populations.
(Crist E et al: 2017)
![Page 28: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/28.jpg)
Movement of pathogens: an ecological perspective (Kardos N: 2015)
![Page 29: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/29.jpg)
Yeni ortaya çıkan enfeksiyon hastalıkları (1940-2004): Bulaşma şekillerine göre (toplam 335 ‘olay’)%60.3: Zoonoz
%71.8 yabanıl %71.8 yabanıl yaşam
%54.3: Bakteri ve Riketsiya
(Jones KE et al: 2008)
![Page 30: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/30.jpg)
1980-2013 yılları arasında 219 ülkede 44 milyondan fazla olguyu kapsayan, 215 insan enfeksiyonuyla meydana gelmiş 12.102
salgının analizi
(Smith KF et al: 2014)
![Page 31: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/31.jpg)
İnsan mikrobiyotası/mikrobiyomundakideğişmelerdeğişmeler
![Page 32: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/32.jpg)
40 trilyon insan hücresi 22.000 insan geni 40-100 trilyon mikrop
hücresi 9.8 milyon mikrop geni
• Evrendeki yıldızlar: ~1021
• Vücudumuzdaki moleküller: ~1027• Vücudumuzdaki moleküller: ~1027
• Vücudumuzdaki mikroplar: ~1013
• Tüm insanlardaki toplam bakteri ağırlığı: >3.8 x 108 Kg
• Bağırsamızdaki bakteriyofajlar: 108-1010
• Okyanuslardaki bakteriyofajlar: ~1031
![Page 33: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/33.jpg)
Spatial organization of microbial communities and physiological gradients along the mammalian gastrointestinal tract
(Webb CR et al: 2016)
![Page 34: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/34.jpg)
(Hugon P et al: 2016)
![Page 35: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/35.jpg)
Comparison of the number of KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) genes involved in metabolic pathways within all the assembled data of the human genomes and the human İntestinalmetagenome. KEGG genes are organized in functional categories functional categories according to their belonging to different pathways of cellularmetabolism.
(Maccaferri S et al.: 2011)
![Page 36: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/36.jpg)
Pan-genome(Soucy SM et al: 2015)
![Page 37: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/37.jpg)
(Stecher B et al: 2013)
![Page 38: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/38.jpg)
İnsan mikrobiyomu…
• İnsan mikrobiyomu küresel pangenomla (biyosferdeki tüm genlerin toplamı) çevresel temas ve lateral gen transferi (LGT) aracılığıyla etkileşir…
• Potansiyel olarak biyosferdeki herhangi bir gen lateral transferle insan mikrobiyomu içinde kendine yer bulabilir…bulabilir…
• Yüksek hücre yoğunluğu ve biyofilmler transferi daha da etkin kılar.
• İnsan mikrobiyotasındaki yüksek yoğunluklar ve biyofilm komüniteleri gen değişimi ve aksesuvargenlerin birikimi için sıcak noktalardır.
![Page 39: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/39.jpg)
(Schnorr SL et al: 2016)
![Page 40: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/40.jpg)
(Schnorr SL et al: 2016)
![Page 41: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/41.jpg)
KSYA: Kısa zincirli yağ asitleri (Ghaisas S et al: 2016)
![Page 42: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/42.jpg)
(Kumar M et al: 2016)
Doğum öncesinden yaşlılığa dek insan bağırsak mikrobiyotasının gelişimi
![Page 43: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/43.jpg)
The intestinal microbiota and disease development
(Levy M et al: 2017)
![Page 44: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/44.jpg)
(Gillings MR et al: 2015)
Mikrobiyotada türlerin ve
genlerin artışı
![Page 45: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/45.jpg)
Comparison of hominid gut microbiota
(Schnorr SL et al: 2016)
![Page 46: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/46.jpg)
Changes in the diversity and composition of oral microbiota
(Adler CJ et al: 2013)
![Page 47: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/47.jpg)
(Kumar M et al: 2016)
![Page 48: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/48.jpg)
1. Antibakteriyel immün yanıt (patojen gelişimi üzerine olumsuz etki).
2. Çapraz bağlı proteinler immün sistemin aşırı aktivasyonunu önler, patojenleri korurlar.
3. Bakteri topluluğu hızla genişler, fiziksel engel oluşturur.
Artropodların sindirim sisteminde yerleşik mikrobiyota vektör kaynaklı patojenlerin vektörü enfekte etme yeteneklerini etkiler.
(Crimotich CM et al: 2011)
engel oluşturur.4. Bakterilerin salgıladığı
moleküller (ROS v.b.) parazitleri öldürür ya da engellerler.
![Page 49: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/49.jpg)
Gut microbiota effects on viral infection
In Drosophila, Gram-negative bacteriainduce an antiviral state.
In mice , bacteria promote enteric virus infection through multiple mechanisms.
(Pfeiffer JK: 2016)
![Page 50: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/50.jpg)
Sorular
• Sivrisinek bağırsağındaki bakteriler dengue ve Plasmodium enfeksiyonlarını (dolayısıyla sivrisinek kaynaklı insan enfeksiyonlarını) sınırlamaktadırlar. Isı ve besin kaynağı gibi çevresel faktörlerle değişecek sivrisinek çevresel faktörlerle değişecek sivrisinek bağırsak mikrobiyotası bileşiminin değişimi viral enfeksiyonları nasıl etkileyecektir?
• Drosophila’daki antiviral etki yolakları vertebralılarda da geçerli midir?
![Page 51: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/51.jpg)
Mikrobiyom enterik virus enfeksiyonunu hem doğrudan hem de dolaylı mekanizmalarla değiştirir
(Pfeiffer JK, Virgin HW: 2016)
![Page 52: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/52.jpg)
![Page 53: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/53.jpg)
Estimated proportions of unintended pregnancies (those not planned or wanted by the pregnant women in the next 2 years or
longer) vary from one-third to more than one-half worldwide.
(Crist E et al: 2017)
![Page 54: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/54.jpg)
Artan insan nüfusuna yanıtta mikrobiyal taksonlarıngöreceli oranlarında beklenen eğilimler.
(Pointing SB et al: 2016)
![Page 55: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/55.jpg)
The microbial ecosystem of a decomposing corpse
(DeBruyn J: 2016)
![Page 56: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/56.jpg)
Human-associated bacteria are detected in the soils below a decomposing corpse.
(DeBruyn J: 2016)
![Page 57: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/57.jpg)
Antibiyotik direnci
![Page 58: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/58.jpg)
Parvom…• Biyosfer yaşayan organizmalar tarafından üretilen
olağanüstü çeşitlilikte moleküler yapı gösteren düşük moleküler ağırlıklı organik bileşiklerin dev bir kollleksiyonuna (parvom) sahiptir.
• Bu bileşiklerin önemli bir bölümü olağan biyodegradsyon ürünleri olsa da çoğunluğu biyodegradsyon ürünleri olsa da çoğunluğu tanımlanmış, düzenlenmiş biyosentez yolaklarının ürünüdür ve hücre, doku, organ ve organizmaların işlev ve etkileşimleriyle ilgilidirler.
• Biyoaktif küçük moleküllerin en iyi bilinen gruplarından biri antibiyotik aktivitesine sahip olanlardır ve başlıca bakteriler, mantarlar, bitkiler ve süngerler tarafından üretilirler.
![Page 59: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/59.jpg)
Bioactive secondary metabolites in nature
(Bérdy J: 2015)
![Page 60: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/60.jpg)
(Bérdy J: 2015)
![Page 61: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/61.jpg)
Conceptual representation of the biological molecules of relevance to antibiotic resistance.
(Gillings MR: 2013)
![Page 62: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/62.jpg)
Bioactive microbial metabolites
(Bérdy J: 2015)
![Page 63: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/63.jpg)
(Bennett JW: 2015)
![Page 64: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/64.jpg)
Common mechanisms of antibiotic action and antibiotic resistance
(Crofts TS et al: 2017)
![Page 65: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/65.jpg)
Crosswalk between resistome and mobilome in different environments (Caniça M et al:
2015)
![Page 66: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/66.jpg)
Environ. Sci. Technol. 2010, 44, 580–587
![Page 67: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/67.jpg)
A generalized summary of the mechanisms of lateral gene transfer
(Gillings MR: 2017)
ICE: integrative and conjugative element
![Page 68: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/68.jpg)
İnsan seçilim etkisi altında kompleks, mozaik DNA elementlerinin ardışık tümleşmesinin şematik gösterimi.
(Gillings MR et al: 2015)
Direnç belirteçleri: mer operon (cıva direnci); qacE (dört değerli amonyum bileşiklerine direnç); sul1 (sulfonamidlere direnç); integron gen kaseti (farklı antibiyotiklere direnç).
Tn: transpozon 21intl1: integron-integraz
![Page 69: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/69.jpg)
The synteny of antibiotic resistance genes provides historical context and foreshadows future threats.
(Crofts TS et al: 2017)
![Page 70: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/70.jpg)
The synteny of antibiotic resistance genes provides historical context and foreshadows future threats.
(Crofts TS et al: 2017)
![Page 71: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/71.jpg)
(CDC: 2014) (WHO: 2017)
![Page 72: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/72.jpg)
Timelines for emergence of drug resistance in parasitic diseases
(Fairlamb AH et al: 2016)
![Page 73: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/73.jpg)
Timelines for emergence of drug resistance in fungi
(Fairlamb AH et al: 2016)
![Page 74: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/74.jpg)
Worldwide travel routes and emergence of antimicrobial resistance
(Holmes AH et al: 2016)
![Page 75: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/75.jpg)
Global spread of plasmid-borne resistance
(Crofts TS et al: 2017)
![Page 76: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/76.jpg)
Sonuç…
• Antimikrobiyal ilaçlara direncin küresel yayılımı insan etkinliklerine dayalı mikrobiyal evrimin en iyi örneklerinden biridir!biridir!
![Page 77: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/77.jpg)
Doğada bakteriyel adaptasyon: Abiyotik seçilimdeki değişim ölçütleri (gradientleri) milimetreden (mikrop yükünün dağıldığı ortamın tuzluluğu gibi) birçok kilometreye (Baltık Denizinin tuzluluğu gibi) kadar değişir. Benzer şekilde biyotik seçilimdeki değişim ölçütleri de çok küçük ölçeklerden (rakip türlerle veya bakteriyofajlarla birlikte evrilen bakterilerde olduğu gibi) çok büyük ölçeklere (uzun ömürlü konaklarda yerleşmiş bakteriler) kadar değişir.
(Koskella B, Vos M: 2015)
![Page 78: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/78.jpg)
Bakteriyel adaptasyonda zamansal ölçeklerin devamlılığı: Çevre hızla (antibiyotik konsantrasyonları enzimatik degradasyonla azalır) veya göreceli yavaş (zaman içinde insanların antibiyotik kullanımındaki kültürel değişme veya iklim değişikliği) değişir.
(Koskella B, Vos M: 2015)
![Page 79: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/79.jpg)
Bakteriyel adaptasyonda genetik düzeyler: Tek mutasyonlardan tam komünitelere kadar, özellikle de bakteriyel türler arasındaki genlerin hareketliliği (örneğin, plazmitler aracılığıyla) ışığında, seçilimin etkili olduğu düzeyler.
(Koskella B, Vos M: 2015)
![Page 80: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/80.jpg)
Mikrobiyal biyojeokimyasal süreçlere etkiler
![Page 81: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/81.jpg)
A generalized biosphere model showing the basic inputs and outputsof energy and materials
(Falkowski PG et al: 2008)
![Page 82: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/82.jpg)
Bakteriler enerji için kullandıkları kimyasal reaksiyonlara göre de farklılıklar gösterirler:
(Aerop respirasyon)
(Manganaz indirgeme)
(Demir indirgeme)(Demir indirgeme)
(Sülfat indirgeme)
(Metanogenez)
![Page 83: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/83.jpg)
A schematic diagram depicting a global, interconnected network of the biologically mediated cycles for hydrogen, carbon, nitrogen, oxygen, sulfur, and iron. A large portion
of these microbially mediated processes are associated only with anaerobic habitats.
(Falkowski PG et al: 2008)
![Page 84: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/84.jpg)
Metan sorunu…
• Hayvanları ve bitkileri evcilleştiren insan bu türlerle birlikte onların sembiyontlarını da evcilleştirmişlerdir.
• Antropojenik metan artışının nedenleri:• Antropojenik metan artışının nedenleri:
– Sulu tarlalarda pirinç üretimi
– Geviş getiren hayvanların çiftliklerde üretimi
– Bunların dışkılarına bağlı metan üreticisi mikroorganizmaların artışı
![Page 85: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/85.jpg)
(Wilkinson DM et al: 2012)
Estimated sauropod methane production compared to total modern (both natural and anthropogenic), global pre-industrial and estimated modern methane production from ruminants. Even reducing our estimate by half
still predicts a major role for sauropod methane in the Mesozoic.
![Page 86: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/86.jpg)
Azot sorunu…
• Atmosferde bol olan azot gazı biyolojik kullanım için reaktif azota dönüştürülmek zorundadır.
• Biyolojik azot fiksasyonu bakteriler tarafından gerçekleştirilir.
• Köklerinde azotu fikse eden bakterileri barındıran • Köklerinde azotu fikse eden bakterileri barındıran baklagiller tarımı bu bakterilerin göreceli oranlarını artırmaktadır. Bakteriler:– Gaz azotu amonyağa sabitlerler, bunu nitratlara
dönüştürürler (nitrifikasyon);– Nitratları da azot oksitlere ya da geriye azot gazına
dönüştürürler (denitrifikasyon).
![Page 87: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/87.jpg)
Sonuç…
• Endüstriyel azot fiksasyonu, fosil yakıtların yakılması ve baklagillerin üretilmesiyle insanların azot döngüsüne girdileri günümüzde azot fiksasyonunun %45’inden sorumludur.
• Karasal ekosistemlerde artmış azot mycorrhizal• Karasal ekosistemlerde artmış azot mycorrhizalmantarların kütlesinde azalmaya ve mikrop komüniteyapısında değişime yol açar.
• Topraklarda azot artışı sulu sistemlerde ötrofikasyona(azot ve fosfor artışı), bu da toksinler üreten siyanobakterilerin, dinoflagellatların ve diatomlarınsayısında artışa neden olur (alg basması!)
![Page 88: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/88.jpg)
Küresel ısınma ve okyanusların asitleşmesi
![Page 89: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/89.jpg)
Map of world climate oscillations
(McMichael AJ: 2017)
![Page 90: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/90.jpg)
CO2 artışı ve okyanus asidifikasyonu
• Karbon dioksitin antropojenik üretimi gezegenimizi ısıtmaktadır.
• Isınmanın hızı antropojenik emisyonun yaklaşık üçte birinin okyanuslarca absorbe edilmesiyle dengelenmektedir.dengelenmektedir.
• Ancak bu durum okyanuslarda pH düşmesine yol açmaktadır (asidifikasyon).
• Mikrobiyal biyosferde ısınmaya uygun genetik varyantların seçilimine, bireysel türlerin biyokimyasal aktivitelerinin etkilenmesine v.b. Yol açabilir.
![Page 91: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/91.jpg)
Potential effects of elevated CO2 concentrations
, AMF (arbuscular mycorrhizal fungi), EcM (ectomycorrhizal fungi, fine endophytic PGPF (plantgrowth-promoting fungi) and PGPB (plant growth-promoting bacteria). (Compant S et al: 2010)
![Page 92: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/92.jpg)
Potential effects of warming and drought on beneficial plant–microbe interactions
, AMF, EcM, fine endophytic PGPF and PGPB
(Compant S et al: 2010)
![Page 93: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/93.jpg)
Özet
![Page 94: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/94.jpg)
Human influences on microbial ecology and evolution
(Gillings MR, Paulsen IT: 2014)
![Page 95: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/95.jpg)
![Page 96: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/96.jpg)
(Peek K: 2016)
![Page 97: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/97.jpg)
(Peek K: 2016)
![Page 98: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/98.jpg)
![Page 99: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/99.jpg)
The deep roots of the anthropocene
(Ellis E et al: 2017)
![Page 100: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/100.jpg)
2007
![Page 101: İnsan Etkinliklerinin Mikroorganizmaların Evrimine Etkileri · 2017-08-27 · TRIASSIC PERMIAN Ökaryotlar Çokhücreli yaşam (deniz anası, süngerler, kurtçuklar) P H A N E](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022042007/5e70aa1139cdf86d73319198/html5/thumbnails/101.jpg)
At what point did humans’ impact on Earth become geologically significant?
(Certini G, Scalenghe R: 2015)