Possibilità di tesi di laurea sperimentaleCorso di Laurea Magistrale in Biologia

Università degli Studi di Salerno

Questa presentazione intende illustrare a puro titolo di esempio le possibilità di tesi sperimentali per laureandi magistrali in Biologia.

L'elenco è aggiornato al 19-5-2014, ma non si intende esaustivo.

Si invitano comunque gli studenti interessati a verificare l'effettiva disponibilità per lo svolgimento dell'internato di tesi e le effettive linee di ricerca disponibili contattando direttamente il docente o i docenti di riferimento del laboratorio in cui si vorrebbe svolgere la tesi sperimentale.

Per informazioni

SITO WEB DEL CORSO DI LAUREA:LE INFORMAZIONI SUI CORSI DI LAUREA TRIENNALI E MAGISTRALI INCARDINATI NEL DCB SI TROVANO QUI:http://www.unisa.it/dipartimenti/dip_chimica_e_biologia/didattica/index

(N.B.: IL VECCHIO SITO DI FACOLTA' NON E' PIU' AGGIORNATO!!!)

PRESIDENTE DEL CORSO DI STUDI IN BIOLOGIA:PROF.SSA CARLA ESPOSITO: cesposito@unisa.it(fino a ottobre 2014: presidente f.f. PROF.SSA ANNUNZIATA SORIENTE: titti@unisa.it)

RESPONSABILE COMMISSIONE TESI:PROF. MARCO SORIA: msoria@unisa.it

RESPONSABILE ORIENTAMENTO CORSO DI STUDI IN BIOLOGIA:DOTT.SSA ANNA MARABOTTI: amarabotti@unisa.it

INFORMAZIONI SU CONVENZIONI E TIROCINI ESTERNI: DOTT.SSA MATILDE CANNAVALE: mcannavale@unisa.it

Docenti di Ateneo e del corso di studi di Biologia con disponibilità per tesi di laurea

magistrale

Il docente è definito RelatoreL'attività di tesi viene svolta nei laboratori dell'Ateneo di FiscianoNon sono necessarie particolari convenzioni

Laboratorio di Biologia dello SviluppoProf.ssa Elizabeth ILLINGWORTH

Tematiche di ricerca:

Studi basati su saggi funzionali in cellule carenti di TBX1, un fattore di trascrizione e gene malattia (Lab Fisciano e Lab Napoli)

Studi del ruolo di TBX1 nello sviluppo del cervello murino (solo Lab. Napoli)

Studi del ruolo di TBX1 nei sistemi vascolari sanguigni e linfatici (Lab. Fisciano e Lab. Napoli)

Prof.ssa Elizabeth IllingworthDipartimento di Chimica e Biologiaeillingworth@unisa.it

Tematica di ricerca:Approcci biocomputazionali per lo studio delle relazioni struttura-funzione-dinamica di proteine di interesse biotecnologico o associate a malattie.

Studio delle proprietà strutturali e funzionali di enzimi associati alla malattia rara galattosemia: analisi degli effetti delle mutazioni tramite simulazioni di modellistica molecolare e dinamica molecolare, costruzione di database per la raccolta e la diffusione delle informazioni ricavate tramite Web.

Approcci computazionali e sperimentali per l'identificazione di target molecolari coinvolti nell'autismo.

Laboratorio di Chimica BiologicaDott.ssa Anna Marabotti

Alcuni esempi:

dott.ssa Anna MarabottiDipartimento di Chimica e Biologiaamarabotti@unisa.it

Laboratorio di Chimica BiologicaProf.ssa Carla ESPOSITO, dott.ssa Ivana CAPUTO

Tematiche di ricerca:

comprensione delle proprietà biologiche e dei ruoli patologici dell'enzima transglutaminasi tissutale nella malattia celiaca (prof.ssa Esposito, dott.ssa Caputo)caratterizzazione dell'azione tossica di inquinanti ambientali in cellule e tessuti umani e animali (dott.ssa Caputo, in collaborazione con dott.ssa Gay)

dott.ssa Ivana CaputoDipartimento di Chimica e Biologiaicaputo@unisa.it

Prof.ssa Carla EspositoDipartimento di Chimica e Biologiacesposito@unisa.it

Identificazione di proteine differenzialmente fosforilate in linea cellulare intestinale Caco-2 stimolata con anticorpi anti-transglutaminasi

Laboratorio di Biologia e Patologia CellulareProf.ssa Pia RAGNO

Tematiche di ricerca:

Regolazione dei meccanismi di adesione e migrazione di cellule normali e tumorali, con particolare attenzione al ruolo del recettore della serin-proteasi urochinasi (UPAR)

Regolazione post-trascrizionale dell’espressione di UPAR, fattore prognostico negativo in numerosi tumori umani

Prof.ssa Pia RagnoDipartimento di Chimica e Biologiapragno@unisa.it

In figura è mostrata la superficie di contatto della ciclo-esa-N-esil-glicina I siti di interazione intermolecolare sono mostrati in rosso.

La tematica prevede la sintesi, la cristallizzazione, l’analisi strutturale ai raggi X e la caratterizzazione chimico-fisica e dell’attività biologica di peptidi e peptido-mimetici.

Laboratorio di Chimica Fisicadott.ssa Consiglia TEDESCO

Tematica di ricerca:Assemblaggio allo stato solido di peptidi e peptido-mimetici

Dott.ssa Consiglia TedescoDipartimento di Chimica e Biologiactedesco@unisa.it

Laboratorio di Metodologie di SintesiProf. ssa Annunziata SORIENTE, dott.ssa Margherita DE ROSA

Tematiche di ricerca:

Sintesi e valutazione dell’attività biologica di nuovi inibitori delle -lattamasi: il gruppo suicida sconfigge la resistenza batterica.

Sintesi e valutazione dell’attività biologica di nuovi composti attivi su batteri gram-positivi: analoghi del linezolid (ZYVOX).

X-ray structure of PBP2a in complex with MC1 Compresse di Linezolid

Prof.ssa Annunziata SorienteDipartimento di Chimica e Biologiatitti@unisa.it

Dott.ssa Margherita De RosaDipartimento di Chimica e Biologia maderosa@unisa.it

Laboratorio di Chimica Inorganica e Catalisi sostenibileProf. Alfonso GRASSI- Dipartimento di Chimica e Biologia

agrassi@unisa.itTematica di ricerca:Applicazioni teranostiche di nanoparticelle di oro protette con peptidi

a)

b)

c)Figura: Immagini di microscopia di fluorescenza laser confocale di: a) neurone; b) astrocita; c) cellule nervose incubate con nanoparticelle di oro protette con glutatione.

La teranostica combina aspetti diagnostici e terapeutici. Nanodispositivi costituiti da nanoparticelle di oro possono essere rapidamente e selettivamente internalizzati in ambito cellulare. Utilizzando le peculiari proprietà chimico fisiche di questi dispositivi è possibile non solo evidenziare i componenti cellulari desiderati ma anche operare rilascio controllato di farmaci o riscaldare localmente la cellula (ad es. tumorale) producendo la morte cellulare.

Laboratorio di Anatomia morfo-funzionaleProf.ssa Stefania Lucia NORI, dott.ssa Antonietta SANTORO

Principali tematiche di ricerca:

Ruolo della proteina BAG3 in modelli di plasticità neuronale;

Alterazioni morfo-funzionali in pazienti affetti da fibrosi cistica con mutazioni non comuni del gene CFTR;

Studio del potenziale anti-infiammatorio e del meccanismo di azione di composti biologicamente attivi di origine naturale.

Prof. Stefania Lucia NoriDipartimento di Medicina e Chirurgiasnori@unisa.it

dott. ssa Amalia PORTA

Tematica di ricerca:

Studio dell’attività antimicrobica di sostanze di origine naturale o di sintesi

Dott.ssa Amalia PortaDipartimento di Farmaciaaporta@unisa.it

Docenti del corso di studi di Biologia esterni all'Ateneo con disponibilità per tesi di laurea

magistrale

Il docente è definito RelatoreL'attività di tesi viene svolta di solito in laboratori esterni all'Ateneo di Fisciano, ma può essere svolta anche all'interno dell'Ateneo, se esistono rapporti di collaborazione con docenti di AteneoPossono essere necessarie convenzioni per le attività da svolgere all'esterno dell'Ateneo

Dalla conoscenza della struttura primaria delle proteine è possibile applicare metodi computazionali per costruire un modello della struttura terziaria, e simulare l’interazione con ligandi e altre proteine.

A sinistra: due immagini del modello del recettore del gusto del dolce, realizzato per simulare l’interazione con numerose sostanze dolci (zuccheri naturali, dolcificanti, proteine dolci).A destra: modello del recettore TRPV1 e della sua posizione al’interno della membrana cellulare, realizzato per studiare l’interazione con la capsaicina e altri capsaicinoidi presenti nei peperoncini, nella prospettiva di studi su nuovi farmaci per la terapia del dolore.

Dott. Angelo FacchianoIstituto di Scienze dell'Alimentazione - CNRAvellinoangelo.facchiano@isa.cnr.it

dott. Angelo FACCHIANOTematica di ricerca:Modellamento e simulazioni molecolari per lo studio delle proprietà strutturali e funzionali di proteine

L'effetto delle sostanze nocive viene valutato tramite studi istologici dei loro effetti negativi su alcuni organismi bioindicatori come ad es. il tritone. Alcuni studi vengono compiuti in collaborazione con il laboratorio della prof.ssa Carla Esposito e della dott.ssa Ivana Caputo a Fisciano.

dott. ssa Flaminia GAY

Tritone

Effetti del 4-nonilfenolo (distruttore endocrino) sulla ghiandola pituitaria di Tritone.

Tematiche di ricerca:Effetti dell'uso di droghe sull'ambienteEffetti dei distruttori endocrini sui vertebrati non mammiferi utilizzati come bioindicatori.

Dott.ssa Flaminia Gayflaminia.gay@alice.it

Prof.ssa Lillà LIONETTI

Tematiche di ricerca: Studio della bioenergetica mitocondriale in differenti stati nutrizionali

Effetti dell’esposizione simultanea a diete iperlipidiche e inquinanti ambientali sulla funzionalità mitocondriale e stress del reticolo endoplasmatico

Prof.ssa Lillà LionettiDocente di Fisiologia generale (Università degli studi di Salerno)Docente di Dietetica (Università degli studi di Napoli Federico II)www.docenti.unina.it/lionettililla.lionetti@unina.itSede laboratorio: Via Mezzocannone 8 (Napoli)

presso laboratorio Esposito/Caputo (Fisciano)

Altri docenti di Ateneo con disponibilità per tesi di laurea magistrale

Il docente è definito RelatoreL'attività di tesi viene svolta nei laboratori dell'Ateneo di FiscianoNon sono necessarie particolari convenzioni

Laboratorio di Biologia Vegetale e ApplicataProf. Stefano CASTIGLIONE

Tematica di ricerca:

Genetica di popolazione e Biodiversità di specie vegetali, Bio/Fito-risanamento di suoli inquinati da metalli e/o organici

Prof. Stefano Castiglione Dipartimento di Chimica e Biologiascastiglione@unisa.it

Laboratorio di Materiali PolimericiProf. Gaetano GUERRA, gguerra@unisa.it dott.ssa Paola RIZZO prizzo@unisa.it

Tematica di ricerca:Rilascio controllato di antimicrobici naturali da imballaggi "attivi"al fine di aumentare la “shelf life” di alimenti

Imballaggi attivi a base di sPS Sono in grado di assorbire selettivamente etilene e CO2 responsabili della maturazione e /o marcitura dei vegetali aumentandone la “Shelf-life”

6 days

PP/sPS/PP sPS/PEPE/sPS/PE

Keep Fresh PP LDPE

L’obiettivo della tematica consiste nel caricare questi film attivi con antimicrobici naturali, monitorarne il rilascio e verificare la loro influenza sugli alimenti .

Studi recenti sono stati effettuati utilizzando come molecola antimicrobica il carvacrolo.

Albuia A.R., Rizzo P. et al. JOURNAL OF POLYMER SCIENCE, PART B: POLYMER PHYSICS 2014, 52, 657–665

PET

sPS0 3 6

days

S. aureusGram +

E. coliGram -

H2O Bianco Polimero battericida

Sintesi e studio dell’attività biologica di sistemi polimerici “intelligenti” per veicolare farmaci e/o molecole per imaging esclusivamente nel tessuto tumorale aumentandone la biodisponibilità e diminuendo gli effetti collaterali del farmaco.

Sintesi e studio dell’attività biologica di materiali polimerici recanti gruppi battericidi opportunamente modificati per aumentarne l’efficienza e lo spettro di azione.

Tematica di ricerca 2: Studio di materiali polimerici ad elevata attività antimicrobica

Tematica di ricerca 1: Studio di nanosistemi polimerici come carrier di farmaci antitumorali e/o per imaging.

Polimero fluorescente per il rilascio di farmaci antitumorali sintetizzato nel nostro laboratorio e incubato per 24 ore con 293T (kidney cancer cell line).

Azione battericida di un polimero sintetizzato nel nostro laboratorio. Il polimero agisce per contatto (completa assenza di rilascio di molecole potenzialmente tossiche) uccidendo il 99.98% ± 0.01 di batteri in 5 ore.

Laboratorio di Catalisi e Chimica delle Macromolecoledott.ssa Lorella IZZO lizzo@unisa.it

Laboratorio di Chimica ComputazionaleDr. Giuseppe MILANO

Tematica di ricerca: Modellazione molecolare di sistemi biologici e loro interazione con materiali biocompatibili

BIOMEMBRANE POLIMERI BIOCOMPATIBILI INTERAZIONI NANOPARTICELLA/PROTEINA POLYMER BINDING PEPTIDES1

Dr. Giuseppe Milano Dipartimento di Chimica e Biologia gmilano@unisa.it

Le Istone Deacetilasi HDACs Le Topoisomerasi

Prof. Placido NERI , Dr. Carmine GAETADipartimento di Chimica e Biologianeri@unisa.it cgaeta@unisa.it

O

R4

R3

O OO

R4R4 R4

NH NHNH NH

R2O

O O

OH

O

O

R1

O OOO

RR

O O

O

NHNH

O

R

R

ButBut

Laboratorio di Chimica Supramolecolare

Tematica di ricerca: Progettazione e sintesi di derivati macrociclici di natura calixarenica come potenziali inibitori di bersagli proteici coinvolti in patologie tumorali

Laboratorio di Analisi e Sviluppo Programmi Dr. Andrea PELUSO

Tematiche di ricerca: Studio del danneggiamento ossidativo del DNA

Dr. Andrea PelusoDipartimento di Chimica e Biologiaapeluso@unisa.it

La tematica si inquadra in un progetto finalizzato alla diversificazione di piattaforme molecolari strutturalmente semplici e di facile reperibilità, allo scopo di ottenere prodotti eterociclici variamente finzionalizzati di potenziale attività biologica. L'approccio sintetico utilizzato è di tipo DOS, ovvero orientato alla diversità, mentre i metodi ai quali si ricorre sono caratterizzati da eco- ed atom-economy.

Laboratorio di Sintesi AsimmetricaDr. Laura PALOMBI

Tematica di ricerca:Metodi non convenzionali per la sintesi di composti eterociclici di interesse bio- farmacologico.

Dr. Laura PalombiDipartimento di Chimica e Biologialpalombi@unisa.it

Laboratorio di Sintesi AsimmetricaProf. Alessandra LATTANZI

Tematica di ricerca:

Sviluppo di nuove metodologie semplici e a cascata per la sintesi asimmetrica di composti utili, come building blocks o a potenziale attività biologica, mediante l'uso di organocatalizzatori chirali.

Prof. Alessandra LattanziDipartimento di Chimica e Biologialattanzi@unisa.it

Laboratorio di Sostanze Naturali e Sintesi OrganicaProf. Aldo SPINELLA

Tematica di ricerca:

Sintesi e correlazione attività – struttura di composti attivi verso termorecettori

Indagine su sostanze naturali e sintetiche che, come ad es. capsaicina e mentolo, inducono sensazioni psicofisiche di caldo e freddo, allo scopo di fornire approfondimenti fondamentali sul meccanismo molecolare delle sensazioni termiche.

Prof. Aldo SpinellaDipartimento di Chimica e Biologiaspinella@unisa.it

Laboratorio di Catalisi omogenea e Sensoristica molecolareProf. Claudio PELLECCHIA-Dipartimento di Chimica e Biologia

cpellecchia@unisa.it

Tematiche di ricerca: Sviluppo di sensori basati sulla fluorescenza per la rilevazione di molecole di interesse biologico

Sintesi di polimeri biodegradabili e bio-compatibili per applicazioni in campo biomedico

Obiettivo: messa a punto di sensori a base di metallo–proteine per la rilevazione di H2S e NO, molecole coinvolte in molti processi fisiologici e patologici, sfruttando variazioni di fluorescenza.

Obiettivo: sviluppo di nuovi materiali biodegradabili ottenibili da fonti rinnovabili, quali il poli(acido lattico) PLA o il poli(idrossibutirrato) PHB, con struttura e proprietà opportunamente progettate per applicazioni biomediche (dispositivi per il rilascio controllato di farmaci, scaffold per la rigenerazione di tessuti, etc.)

Ciclo del PLA

PHB prodotto in cellule di Pseudomonas oleovorans

Prof. Alessandro WEISZ

Prof. Alessandro WeiszResponsabile del Laboratorio di Medicina Molecolare e GenomicaDipartimento di Medicina e Chirurgia - sede di Baronissiaweisz@unisa.it

Tematiche di ricerca: Studio del carcinoma mammario ormono-responsivo Epigenetica dei tumori Sviluppo di sistemi integrati per l'analisi dei dati genomici

Laboratorio di Medicina Molecolare e Genomica

Esempi di istituzioni pubbliche e private esterne all'Università di Salerno in cui svolgere la tesi di

Laurea Magistrale in Biologia

L'attività di tesi viene svolta di solito in laboratori esterni all'Ateneo di FiscianoSono necessarie convenzioni per le attività da svolgere all'esterno dell'Ateneo (per informazioni rivolgersi all'Ufficio Stage).Il docente di riferimento esterno all'ateneo viene definito Correlatore; è necessaria l'assegnazione di un Relatore interno al corso di studi.NB: Prima dell'inizio della tesi è necessario produrre un progetto di ricerca che va approvato dal Relatore universitario interno al corso di studi.

Enti pubblici in cui si sono svolte tesi magistrali in Biologia:• Istituto di Scienze dell’Alimentazione (ISA) – CNR, Avellino• Istituto di Biochimica delle Proteine (IBP) – CNR, Napoli• CRA (Consiglio per la Ricerca e la sperimentazione in Agricoltura) – CAT (Unità di ricerca per le colture alternative al tabacco), Scafati (SA)• CRA (Consiglio per la Ricerca e la sperimentazione in Agricoltura) – ORT (Centro di ricerca per l’orticoltura), Pontecagnano (SA) e Battipaglia (SA)• Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Portici (NA) + sedi decentrate• ARPAC (Agenzia regionale protezione ambientale Campania) – sede di Salerno e altre sedi• ENEA (Agenzia nazionale per le nuove tecnologie, l’energia e lo sviluppo economico sostenibile) – sede di Trisaia (MT) e altre possibili sedi (Portici (NA), Frascati (RM), Casaccia (RM), Brindisi (BR))• Az. Ospedaliera Universitaria OO.RR. S. Giovanni di Dio e Ruggi D’Aragona, Salerno• Az. Ospedaliera “S. Maria Inc. dell’Olmo”, Cava de’ Tirreni (SA)• Az. Ospedaliera R.N. “San Giuseppe Moscati”, Avellino• Az. Ospedaliera R.N. “S. Anna e S. Sebastiano, Caserta• Az. Sanitaria Locale – Presidio Ospedaliero “Ospedale Amico Gaetano Fucito” – Mercato S. Severino (SA)• Az. Sanitaria Locale “Umberto I”, Nocera Inferiore (SA)• Az. Sanitaria 1 Paola (CS)

Enti privati in cui si sono svolte tesi magistrali in Biologia:

•Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico (IRCCS) – CROB, Rionero in Vulture (PZ)

•Laboratorio Analisi Cliniche Mater Dei, Pagani (SA)

•Laboratorio Analisi Cliniche Schiavo, Vallo della Lucania (SA)