presentación de powerpoint · 2019-04-11 · discovery and development of dna methyltransferase...
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DIFACQUIM
UNAM
Dr. José Luis Medina FrancoRed Temática de Farmoquímicos, CONACyT
Abril, 2017
Realizado por: QFB. Mariana González Medina
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LICENCIATURA• José Chew• Hugo Vite• Juan Mora• David Vásquez
ALUMNI• Dr. Oscar Méndez• Dr. Eli Fernández• Q.F.B Mariana González• Q.F.B Omar García• Q.F.B Fernanda Saldívar• Q.A Andrea Peña
INVESTIGADOR TITULAR• Dr. José Luis Medina
POSDOCTORADO• Dr. Alberto Cabrera• Dr. Christiaan Jardínez• Dr. Dionisio Olmedo
DOCTORADO• M. en C. Fernando Prieto• M.C. Jesús Naveja
MAESTRÍA• Q. Oscar Palomino• Q.F.B Bárbara Díaz
Grupo de investigación
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Modelado molecular de compuestos con actividad biológica
Quimiogenómica computacional y reposicionamiento de fármacos
Relaciones: SAR, SmAR
Análisis quimioinformático de bases de datos moleculares
Líneas de investigación
Definir el enfoque
Fármaco Enfermedad
Seleccionar una estrategia
HTS
Compuestos activos
VS
IV
Evaluar si es factible
DM
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Quimiogenómica computacional y reposicionamiento de fármacos
Sim
ilitu
d d
e b
lan
cos
QSAR Predicción de actividad
Proteoquimiomimétrica Target fishing
Se identifica un blanco
Publicaciones:❖ Drug Repurposing for Epigenetic Targets Guided by Computational Methods❖ One Drug for Multiple Targets: A Computational Perspective❖ Ribavirin as a tri-targeted antitumor repositioned drug
Investigación básica Selección del blanco Identificación del hit Optimización Desarrollo pre-clínico
Reposicionamiento de fármacos
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Publicaciones:❖ Epigenetic relevant chemical space: a chemoinformatic characterization of inhibitors of DNA methyltransferases❖ A chemical space odyssey of inhibitors of histone deacetylases and bromodomains❖ Molecular Modeling and Chemoinformatics to Advance the Development of Modulators of Epigenetic Targets: A
Focus on DNA Methyltransferases❖ Chemoinformatic expedition of the chemical space of fungal products
Productos naturales
PéptidosFármacos Bases de datos públicas y
comercialesIndustria
alimenticia
Curado de bases de
datos
Compuestos únicos
Análisis quimioinformático de bases de datos moleculares
Perfil de las bases de datos
molecularesSimilitud
DiversidadPropiedades moleculares
Complejidad
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Relaciones estructura-actividad (SAR) y relación estructura-actividad múltiple (SmAR)
Publicaciones:❖ Activity landscape of DNA methyltransferase inhibitors bridges chemoinformatics with epigenetic drug discovery❖ Activity landscape analysis of novel 5alpha-reductase inhibitors❖ Getting SMARt in drug discovery: chemoinformatics approaches for mining structure–multiple activity
relationships❖ Activity Landscape Plotter: A Web-based Application for the Analysis of Structure-Activity Relationships
Actividad biológica
Similitud estructural
Acantilados de actividad
plC50 = 13.41
plC50 = 6.91
QSAR
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Modelado molecular de compuestos con actividad biológica
Publicaciones:❖ Discovery and development of DNA methyltransferase inhibitors using in silico approaches❖ Insights into the structure and inhibition of Giardia intestinalis arginine deiminase: Homology modeling, docking
and molecular dynamics studies❖ Avances en el diseño de fármacos asistido por computadora❖ Descubrimiento y desarrollo de fármacos: un enfoque computacional
Acoplamiento molecular Modelado del farmacóforo
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Virtual Screening ❖ Encontrar nuevos compuestos líder para posterior optimización
❖ Identificar compuestos selectivos (chemical probes).
❖ Optimizar actividad biológica de compuestos activos.
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Hitscomputacionales
Colaboración con grupos experimentales que hagan pruebas biológicas
Hitsexperimentales
Optimización y desarrollo
¿Qué se requiere de la red?
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Supercómputo en la UNAM
PCs de escritorio: 8 (Windows y
Ubuntu)
Software:MOE, ICM, OpenEye, Autodock,
Data Warrior, R, Knime.
https://unam-shiny-difacquim.shinyapps.io/A
ctLSmaps/
https://consensusdiversityplots-difacquim-
unam.shinyapps.io/RscriptsCDPlots/
Infraestructura disponible
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Caracterización de bases de datos
Análisis y visualización
de datos
Minería de datos
Cálculo de propiedades moleculares
Espacio químico
Similitud molecular
Diversidad
Búsqueda de blancos
moleculares
Cribado virtual
Optimización de compuestos bioactivos
Modelado molecular de compuestos bioactivos
Panoramas de actividad
Acoplamiento molecular automatizado
Modelado del
farmacóforo
QSAR
¿Qué se puede ofrecer a la red?
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https://www.difacquim.com/
Facultad de Química, U.N.A.M. Edificio F,cubículo 305Teléfono: +52(55)-56223899, ext. 44458Email: [email protected]
Dr. José Luis Medina Franco
Página de facebook: Difacquim, UNAM
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