rech doc msa 2009

La recherche documentaire en médecine sur l’Internet

Philippe EveillardINMA – Tours

5 et 6mai 2010

Seattle Library par fimoculous Licence CC - Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/fimoculous/54700092/

Programme de la formation

Les moteurs de recherche – GoogleLangage, syntaxe, ressources.Exercices avec Google.Google Scholar : caractéristiques et exercices.

Les répertoires médicaux – CISMeFLangage, syntaxe, ressources.Exercices avec le module Terminologie.Exercices avec le module de recherche avancée.

MEDLINE/PubMedMEDLINE (banque de données) et PubMed (interface).Le langage MeSH – L’affiliation descripteur/qualificatif.Les champs – l’explosion – la pondération.La formulation des débutants (Limits)La formulation des experts (« linéaire »)Les filtres – le coffre-fort My NCBI

Les utilitairesLes sites Internet « utiles » et « accessibles »

Google et Google Scholar

Einstein Google Logo AT Google Kirkland par dannysullivan Licence CC - Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/dannysullivan/272645770/

Le langage des moteurs de recherche (et de Google) est le langage courant = votre langage

Learn

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Les moteurs de recherche – Google – le langage

Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010

Dans Google, comparer les réponses obtenues dans la première page de résultat avec les requêtes :Polyarthrite chronique évolutivePolyarthrite rhumatoïde

Exercice

Les moteurs de recherche – Google – le langage


CommentairesChacune des 2 requêtes affiche des notices différentes.Un outil de recherche comme Google ne prend pas en compte les synonymies, mais uniquement une chaîne de caractères (y compris les fautes d’orthographe et les erreurs de saisie).

La syntaxe est élémentaire +++ et se résume à : mettre des guillemets pour les mots composés remplacer l’opérateur AND par un espace

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Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe


ExemplesRéanimation « arrêt cardiaque »Recommandations « traitement de l’hépatite C »« Diagnostic clinique » appendicite« Hémorragie méningée » « examen TDM »

Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe – exemple


Rechercher des documents sur le traitement de l’insuffisance cardiaque par les bêta-bloquants

Exercice

Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe – exemple


CommentaireVous obtenez un résultat différent si :-les guillemets de sont pas mis en place ;- bêta-bloquant est au singulier ou au pluriel

Bêta-bloquants « insuffisance cardiaque »

Documents de la Toile et articles de la presse

CIMG2977 par David Boyle Licence CC – Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/beglen/151943525/

Analyser la première page de résultat de la requête bêta-bloquants « insuffisance cardiaque ».Distinguer parmi les résultats les documents et les articles.

Les moteurs de recherche – Google – les ressources


Exercice

Les moteurs de recherche – Google – les ressources


CommentaireGoogle recense principalement des documents de la Toile et plus rarement des articles de la presse médicale.Ces derniers sont plus volontiers hébergés dans les banques de données bibliographiques type Google Scholar ou MEDLINE.

Les moteurs de recherche – Google – exercices

Rechercher des documents sur le traitement chirurgical du syndrome du canal carpien.

Exercice

Philippe EveillardINMA Tours 5 et 6 mai 2010



CommentairesLes résultats diffèrent selon la formulation de la requête :« traitement chirurgical » « syndrome du canal carpien »« traitement chirurgical du syndrome du canal carpien »« traitement chirurgical » « canal carpien »Chirurgie « canal carpien »« chirurgie du canal carpien »

Exercice

Rechercher des documents sur l’inertie clinique dans la prise en charge du diabète de type 2


Philippe EveillardINMA Tours5 et 6 mai 2010

CommentairesL’interrogation de Google sur un thème médical est d’autant plus performante et adéquate qu’elle est faite dans un langage médical.

« inertie clinique » « diabète de type 2 »

Exercice

Rechercher des documents sur les types d’organisation des soins primaires



CommentairesDans Google, les requêtes médico-administratives ou médico-économiques obtiennent plus souvent des réponses satisfaisantes que les requêtes spécifiquement médicales

« types d’organisation » « soins primaires »

Les moteurs de recherche – Google Scholar – définition


Google Scholar est l’interface de recherche d’une banque de données bibliographiques dont le « fonds » reste indéfini.

Documents +++

Articles+

Google

Articles+++Livres +

Google Scholar

Les moteurs de recherche – Google Scholar – utile ?


Utile ?OUI, sous réserve : de l’utiliser comme un « coup de sonde » sur un thème de sélectionner les articles récents.

En termes de « précision de la requête », Google Scholar est nettement moins performant que MEDLINE (PubMed)

Comparer les résultats obtenus en interrogeant CISMeF avec : PR, Polyarthrite rhumatoïde, Polyarthrite chronique évolutive

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Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage


Langage de CISMeF = langage MeSH

Polyarthrite rhumatoïde est un mot clé (descripteur) du langage MeSH (en version française).Il a pour synonyme PR et polyarthrite rhumatoïde.Une requête dans CISMeF donne sensiblement les mêmes résultats quand un descripteur ou ses synonymes sont utilisés.

Les termes (descripteurs) du langage MeSH appartiennent à un thésaurus dont les particularités sont d’avoir une structure arborescente (les termes ont entre eux des relations hiérarchiques) de rassembler des termes non ambigus (un descripteur = un concept et un seul)



La structure arborescente du MeSH

Dans le module terminologie de CISMeF :- entrer « asthme » dans la fenêtre recherche- cliquer sur OK- sélectionner l’onglet « navigation », ce qui affiche le descripteur asthme dans son arborescence.

« asthme » dans la fenêtre « recherche »

L’arborescence du descripteur avec ses

relations hiérarchiques (de niveau supérieur et

de niveau inférieur)



La traduction du langage courant en langage MeSH (VF)

1. Entrer le mot clé « décomposé »

(bloquant pour bêta bloquant) dans la

fenêtre2. Ne pas cocher la

case « sans troncature

3. Sélectionner le « bon » descripteur

dans le cadre « réponse »

Confirmation de la sélection

Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage - exercices


Exercices de traduction langage courant – langage MeSH (VF)

Traduire :

• embolie pulmonaire

• maladie de Kahler

• ostéochondrite de hanche

• vitesse de sédimentation

• anti-TNF alpha

Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage - exercices


Corrigé des exercices de traduction langage courant – langage MeSH (VF)

• embolie pulmonaire embolie embolie pulmonaire

• maladie de Kahler Kahler myélome multiple

• ostéochondrite de hanche ostéochondrite maladie de Legg-Calvé-Perthes

• vitesse de sédimentation sédimentation vitesse sédimentation globulaire

• anti-TNF alpha TNF-alpha Facteur de nécrose tumorale-alpha (pour « anti », ajouter un qualificatif… voir plus loin)

Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation


L’affiliation descripteur/qualificatif +++

Des qualificatifs peuvent s’affilier (se marier) aux descripteurs si (et seulement si) ils ont entre eux des « affinités* ».

Qualificatif = terme qui précise le sens d’un descripteur.

MeSH 2010 :83 qualificatifs

Exemples :Asthme/diagnosticArthrose/complicationsAnalgésiques/effets indésirables

* Affinités

Certains qualificatifs s’affilient : - aux maladies, - d’autres aux médicaments, - d’autres encore aux investigations diagnostiques ou aux protocoles thérapeutiques…

Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation


L’affiliation descripteur/qualificatif +++Exemple : épidémiologie de la polyarthrite rhumatoïde

1. Entrée de polyarthrite

dans la fenêtre

2. Sélection de polyarthrite

rhumatoïde dans le cadre de

réponse

3. Sélection de épidémiologie dans la page « accès aux ressources »

Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation - exercices


Exercices sur l’affiliation descripteur/qualificatif

Traduire en affiliation descripteur/qualificatif :

• les complications de la sarcoïdose

• la chirurgie du cancer du pancréas

• le régime de la maladie de Crohn

• les indications des bêta-bloquants

• le diagnostic de l’asthme d’effort

Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation - exercices


Corrigé des exercices sur l’affiliation descripteur/qualificatif

• les complications de la sarcoïdose sarcoïdose sarcoïdose sarcoïdose/complications

• la chirurgie du cancer du pancréas pancréas tumeurs du pancréas tumeurs du pancréas/chirurgie

• le régime de la maladie de Crohn Crohn maladie de Crohn maladie de Crohn/diétothérapie

• les indications des bêta-bloquants bloquant antagonistes beta-adrénergiques antagonistes beta-adrénergiques/usage thérapeutique

• le diagnostic de l’asthme d’effort effort asthme à l’effort asthme à l’effort/diagnostic

Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire


Simple si réduite à une affiliation descripteur/qualificatif : recours au module Terminologieexemples : complications de l’hépatite C ; contre-indications des anti-émétiques…

Plus complexe si l’équation comporte plusieurs membres : recours au module de recherche avancéeexemples : traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë ; indications des IEC dans l’hypertension…

La requête dans CISMeF



Le débit expiratoire de pointe dans le diagnostic de l’asthme de l’enfant

La recherche se fait dans le module de recherche avancée



Exercices sur les requêtes dans CISMeF

Rechercher :

• les recommandations sur le traitement de la maladie de Parkinson

• les causes rénales de l’hypertension artérielle

• le traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë

• les effets secondaires des antiviraux dans le traitement de l’hépatite C

• les aides financières pour les personnes handicapées



Corrigé des exercices sur les requêtes dans CISMeF

• les recommandations sur le traitement de la maladie de Parkinsonmaladie de Parkinson – thérapie – recommandation pour la pratique clinique

• les causes rénales de l’hypertension artériellemaladies du rein – étiologie - hypertension

• le traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguëotite moyenne suppurée – traitement médicamenteux - antibactériens

• les effets secondaires des antiviraux dans le traitement de l’hépatite Bantiviraux – effets indésirables – hépatite B

Les aides financières pour les personnes handicapées aide financière – personnes handicapées

Utilité et « usability »

Dusan ‘s User Interface Challenge par moggs oceanlane Licence CC – Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/moggsoceanlane/3008417302/

Usability– Administratif

Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010

Recherche de la loi du mars 2002 relative aux droits des malades

Les autres textes législatifs et réglementaireshttp://www.legifrance.gouv.fr/initRechTexte.do

http://www.legifrance.gouv.fr/initRechTexte.do


Formulaireshttp://www.service-public.fr/formulaires/index.html

Demande d'autorisation d'un traitement de recherche dans le domaine de la santé

http://www.service-public.fr/formulaires/index.html

http://www.service-public.fr/formulaires/index.html


Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009

Rapports publicshttp://www.ladocumentationfrancaise.fr/rapports/index.shtml

Recherche du rapport Legmann sur la médecine libérale.




Afficher la dernière circulaire en date

Santé-solidaritéhttp://www.circulaires.gouv.fr/index.php?action=rechercher&domaine=Santé,%20solidarité




Recherche d’un établissement pour personnes âgées dépendantes dans la région d’Egletons (Corrèze)


Espace professionnelshttp://www.sanitaire-social.com/rech_pro_001.php

Usability– Médecine du travail


Recherche des maladies professionnelles dans le régime agricole pouvant être à l’origine d’une neuropathie périphérique.


CRAMIF – site maladies professionnelleshttp://maladies-professionnelles.cramif.fr/maladies-professionnelles-reperer.php



Afficher la fiche du métier de bûcheron


Fiches de métiershttp://www.bossons-fute.fr/index.php?option=com_content&view=category&id=2&Itemid=3



Afficher la fiche « espaces verts »


Métiers et activitéshttp://www.travailler-mieux.gouv.fr/-Metiers-et-Activites-.html

Usability– Médecine


Afficher la fiche de la paraparésie spastique familiale


Liste alphabétique des maladies rareshttp://www.orpha.net/consor/cgi-bin/Disease_Search_List.php?lng=FR

Usability– Médecine


Recherche des recommandations pour la pratique relatives à la toux prolongée de l’enfant


DReFChttp://drefc.sfmg.org/