sandrine sagan umr 7613 cnrs - université pierre et marie curie « synthèse, structure et fonction...
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Sandrine Sagan
UMR 7613 CNRS - Université Pierre et Marie Curie
« Synthèse, Structure et Fonction de Molécules Biologiques »
FR 2769, Chimie moléculaire de Paris Centre : organique, inorganique et biologique
« Une petite histoire d’une biochimiste chez des chimistes »
« Une petite histoire d’une biochimiste chez des chimistes »
Non pas pour la fin de l’histoire …Mais pour le début !!!
Ou « Le vilain petit canard » (Conte d’Andersen)
Études supérieures à l’Université Pierre et Marie Curie
DEUG SNV ( option Chimie/Biochimie)
Licence de Biochimie (Chimie Organique, Génétique)
Maîtrise de Biochimie (options Neurobiologie et Biologie cellulaire)
DEA de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (option Neurobiologie)
Quelques enseignants …
Philippe ASCHER (électrophysiologie, neurobiologie), Michel CHE,Jean-Renaud GAREL (biochimie, enzymologie, métabolisme),Andrée MARQUET,Pierre NICOLAS (biochimie structurale)
Thèse « Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire » P6, Laboratoire de Bioactivation des Peptides (Pierre Nicolas), IJM,Allocataire de recherches MRT, monitrice de l’Enseignement Supérieur (Paris 12)
La morphine est un alcaloïde extrait de l’opium du pavot Papaver somniferum. Simon et Snyder, entre autres, montrent l’existence de récepteurs spécifiques dans le SNC au début des années 1960. Hughes et Kosterlitz ont isolé en 1975 les deux premières endomorphines appelées enképhalines.
« Unit for Research on Addictive Drugs »Marischal College, Aberdeen, Écosse
« Identification of two related pentapeptides from the brain with potent opiate agonist activity »Nature, 18 décembre 1975.
Methionine-enkephalin H-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-OHLeucine-enkephalin H-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-OH
Du pavot à la grenouille,
H-Tyr-(D)Ala-Phe-Asp-Val-Val-Gly-NH2
H-Tyr-(D)Ala-Phe-Gly-Tyr-Pro-Ser-NH2
Utilisation des peptides opioïdes de la peau d'amphibien,
dermorphine
dermenképhaline H-Tyr-(D)Met-Phe-His-Leu-Met-Asp-NH2
deltorphine
pour l'étude des mécanismes de reconnaissance des récepteurs opioïdes et
Prix Lasker en 1978
Thème : Relations structure-fonction des peptides opioïdes de la peau d’amphibien pour l’analyse du mécanisme de sélectivité des récepteurs du SNC (rat), mu () et delta ()
≈ 50 analogues peptidiques synthétisésH-Tyr-(D)Ala-Phe-Gly-Tyr-Pro-Ser-NH2
H-Tyr-(D)Met-Phe-His-Leu-Met-Asp-NH2
H-Tyr-(D)Ala-Phe-Asp-Val-Val-Gly-NH2 Les rencontres importantes :
Hans Kosterlitz, Unit for Research on Addictive Drugs, Aberdeen (Ecosse)
Jacques Grassi, CEA Saclay
Gérard Chassaing, Solange Lavielle, URA 493 CNRS
Jury de thèse :
Philippe Ascher (Pr P6),Gérard Chassaing, (CNRS, P6)
Jean-Luc Fauchère, (Laboratoires Servier)Pierre Nicolas, (Pr. P6)
Bernard P. Roques (Pr. P5)
11 publications relatives à la thèse
Stage post-doctoral ( bourse MRE), Institute of Molecular Biology, Salzburg (Autriche),
Pr. Günther Kreil
Clonage d’une enzyme à activité hyaluronidase (1 publication)
Octobre 1993 : entrée CR2 CNRS dans l’URA 493 (ex-UMR 7613)
Solange Lavielle et Gérard Chassaing
Mécanismes moléculaires de reconnaissance Substance P / récepteur NK-1 des tachykinines
H-Arg-Pro-Lys-Pro-Gln-Gln-Phe-Phe-Gly-Leu-Met-NH2
(Culture cellulaire, pharmacologie, affinité, production de seconds messagers, photomarquage)
En collaboration avec Pr. Jacques Glowinski (chaire Neuropharmacologie, INSERM U114, Collège de France)
Début de l’histoire à l’interface chimie-biologie …
H
H
NOC H
H
NOC
HHH
NOC
H
H
NOC
H
H
NOC H
H
NOCOC N OC N
OC N OC NOC N OC N
H
H
NOC
H
H
H
NOCH
H
NOC H
H
NOC
[HPh] [2-Ing] [(2S, 3R)-Bfi] [(2S, 3S)-Bfi]
[ EPhe] [ ZPhe] [ΔE ]Nal [ΔZ ]Nal
[(2 , 3 )- ]S R Ing [(2 , 3 )- ]S S Ing [ΔE ]Phe [ΔZ ]Phe
[ ]Dip [ ]Flg [ ]Dmp [ ]Tic
Chimie des AA et des peptides : quelques exemples de synthèse …
… parmi plus d’une centaine d’analogues de la SP
NH
CO2H
SCH3
(2S, 3S)-3-prolinométhionine
NH
CO2H
SCH3
(2S, 3R)-3-prolinométhionine
[P t Met]3[P c Met]3
NHCH(CH3)2
CO2H
NHCH(CH3)2
CO2H
(2S, 3S)-3-prolinoleucine (2S, 3R)-3-prolinoleucine
[P t Leu]3[P c Leu]3
χ1χ2 χ1
χ2
χ2χ1χ1 χ2
Solange Lavielle et Gérard Chassaing
Philippe Karoyan
Mimoun AyoubSophie Girault-Lagrange
Hubert JosienThierry MilcentRachel PonsinetJean Quancard
Gs Gq/11
pas d'interconversionou phénomène lent
cAMP IP
NK-1M NK-1m
Ki (NK-1M)
Ki (NK-1m)
> 60Ki (NK-1M)
Ki (NK-1m)
< 20
Analogues SP Analogues SP
différences d'internalisation
25000 40000 55000 70000 85000 100000
Mass (m/z)
319.5
0
10
20
30
40
50
60
70
80
4700 Linear Spec #1[BP = 6277.1, 3716]
28516.04
58020.71
56963.43
70605.95
25000 40000 55000 70000 85000 100000
Mass (m/z)
288.6
0
10
20
30
40
50
60
70
80
4700 Linear Spec #1[BP = 6651.2, 6579]
69065.24
6539.0 29912.6 53286.2 76659.8 100033.4 123407.0
Mass (m/z)
321.0
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
% Intensity
4700 Linear Spec #1=>BC[BP = 6009.7, 821]
57068 57874M1
+
M2+
M12+
M13+
48468
* ≈ 30 publications* Médaille de bronze CNRS 2001
L
E
181
L
L
11
L
L
LL
L
LG
L L
L L
E
L
L
1
L
G
E
L
LL
E
EE
E
21
30
42 81
90
100
110
120
160
170
190
200
211260
270
280
290
299
174
W
A A A
Y T V I
V V T
F
P
V
AA F N
A S M
F AA
NH F
F IP
A
Y Y
A V F
A S
I C
VFY
S
PF Q
A
AV
W AQ
V
F
QN
P
S
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T
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NP
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SD
V
P
V
N
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N KCF
YFT
Y
AV
H NY
YW
V
T
TT
M
I
SRV
C
M
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W PH
P
H
NK
Y
PK
V
Y
I VV
S
S
T
Q
NH
H2C
OC
S CH3
CH2
H
V
V
IP
T
P
T
F
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F
F
P
N
D
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W
I
H
A
Y
P
Y
I
I
K
M
Y
V
W
M
K
F
Q
I
S
A
Q
Y
I
S
N
A
M
T
PPI I
Met 174
H-Arg-Pro-Lys-Pro-Gln-Gln-Phe-Phe-Gly-Leu-Met-NH2(t) (t) (g+) (t)
non structurée hélice α
Structure Bioactive de la SP
Domaines d’interaction de la SP dans le récepteur NK-1 Deux sites de liaison indépendants
Spectrométrie de masse de protéines membranaires entières
Chimie des AA, peptidesSolange Lavielle
Gérard ChassaingPhilippe Karoyan
Pharmacologie, Photomarquage, Ingénierie protéinesSophie Girault-Lagrange (doctorat 1996)
Emmanuelle Sachon (doctorat 2003)Isabel Alves (post-doc. 2005- )
Diane Delaroche (thèse 2004-2007)Sandrine Sagan
RMNGérard Chassaing
Odile ConvertOlivier Lequin
Spectrométrie de masseMALDI-TOF
Gérard Bolbach
Vive la Biologie, la Chimie, la Physique ….
Mais surtout, toutes les interfaces !!