uporaba lokalne opisne statistike pri segmentaciji...
TRANSCRIPT
![Page 1: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/1.jpg)
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKEPRI SEGMENTACIJI
MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
Andrej Vovk
![Page 2: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/2.jpg)
SEGMENTACIJA – razdelitev na smiselna področja
UVOD 1 / SEGMENTACIJA
2/24
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
Lociranje objektov (satelitske slike; ceste, gozdovi...)
Prepoznava obraza, prstnih odtisov,
Kontrola prometa
Prepoznava zavornih luči
Strojni vid
V agrokulturi – prepoznava bolezni pridelka,
V medicini...
![Page 3: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/3.jpg)
SEGMENTACIJA – razdelitev na smiselna področja
UVOD 2 / SEGMENTACIJA
3/24
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
Lociranje objektov (satelitske slike; ceste, gozdovi...)
Prepoznava obraza, prstnih odtisov
Kontrola prometa
Prepoznava zavornih luči
Strojni vid
V agrokulturi – prepoznava bolezni pridelka,
V medicini...
![Page 4: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/4.jpg)
SEGMENTACIJA – razdelitev na smiselna področja
UVOD 3 / SEGMENTACIJA
4/24
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
Lociranje objektov (satelitske slike; ceste, gozdovi...)
Prepoznava obraza, prstnih odtisov
Kontrola prometa
Prepoznava zavornih luči
Strojni vid
V agrokulturi – prepoznava bolezni pridelka,
V medicini...
![Page 5: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/5.jpg)
SEGMENTACIJA – razdelitev na smiselna področja
UVOD 4 / SEGMENTACIJA
5/24
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
Lociranje objektov (satelitske slike; ceste, gozdovi...)
Prepoznava obraza, prstnih odtisov
Kontrola prometa
Prepoznava zavornih luči
Strojni vid
V agrokulturi – prepoznava bolezni pridelka
V medicini...
![Page 6: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/6.jpg)
Uporaba anatomske informacije za: - kvantitativno klinične študije patoloških sprememb,- diagnostika,- lokalizacija patoloških sprememb,- študija anatomskih struktur in analiza možganske skorje,- pri izdelavi anatomskih atlasov, - načrtovanju zdravljenja,- pri računalniško podprtih operacijah,...
V medicini
CSF, GM in WM
UVOD 5 / SEGMENTACIJA
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
6/24
![Page 7: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/7.jpg)
UVOD 6 / SEGMENTACIJA
7/24
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
* Pham, D.L., Xu, C., Prince, J.L., 2000. Current methods in medical image segmentation.
Segmentacijski algoritmi:* metode pragov, metode rasti območij, metode uvrščanj (klasifikacije), metode razvrščanj, model Markovskih naključnih polj, nevronske mreže, deformacijske modele in metode, ki uporabljajo prostorske atlase.
- senčenje
- šum
- strukturne nepravilnosti objekta
- starostne razlike
Problemi:
![Page 8: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/8.jpg)
NAMEN: razviti avtomatski postopek za generiranje verjetnostnih map,- odporen na šum in senčenje,- ni registracije/poravnave na normalne anatomske predloge
- anatomske atlase; ti zagotavljajo apriori informacije o prostorski razporeditvi vrst tkiv. (pokaži v AFNI)
- Možgane, ki jih želimo segmentirati, moramo poravnati na povprečne možgane. To je proces, ki je tudi občutljiv na šum ter senčenje
- FLIRT – (FMRIB'S Linear Image Registration Tool)
UVOD 7 / SEGMENTACIJA
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
8/24
![Page 9: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/9.jpg)
si=[ stat 1 Y i1 ,stat 1 Y i2 ,. .. stat1 Y ,stat 2 Y i1 , . .. ,stat 2 Y ,. .. ,stat m Y ]
i - indeks voksla - podpis = vektor m opisnih statistik v n prostorskih sosednostih - intenzivnost sivine voksla - nabor intenzivnosti sivin vokslov znotraj krogle s premerom j mm s središčem v vokslu i; stat
k(Y) - opisna statistika, izračunana na naboru Y.
9/24
UVOD 8 / PODPIS
siyiY ij
TREND PODPISOV
bistvena informacija
PROSTORSKI OBSEG
Podpisi (vektorji povprečij) v različnih tkivih
voksli podobnih vrst tkiv in lokalne strukture – podobni podpisi
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 10: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/10.jpg)
y i,z=gz f i,z vi +hz +ϵ Osnovni zapis intenzivnosti MR v vokslu i, med slikanjem z
10/24
METODE 1 / ROBUSTNI PODPIS
vi - želena intenzivnost voksla
g, h - specifična parametra snemanja
fi,z
- senčenje
ε - šum
yi,z,lrg≃ z f i,z vi,lr
+hz
MADi,z,lrg≃ z f i,z MAD i,lr
PREDPOSTAVIMOlr dovolj majhen -> fi,z = konst.
G=3 y− y
sGi,z,lr
≃3gz f i,z yi,lr
−yi,lr gz f i,z si,lr
≃3 yi,lr
−yi,lr si,lr
->
- mediana
- medianin absolutni odklon
- skew (Pearsonov drugi koeficient asimetrije)
sy i,z,lr
g≃ z f i,zs v i,lr +hz s y i,z,lr
g≃ z f i,z k1+gz f i,zd i,lr
+hz g≃ z f i,zd i,lr
+k 2 s y0g≃ z f i,z
d i,lr
s MADy i,z,lr g≃ z f i,zs MADv i,lr
s MAD y0
k 3≃
s MADv
MAD v i,l rmax
sG y i,z,lr =s Gv i,lr
Odstranimo povprečje-----> ->
Standardiziramo z MAD pri lrmax
------>
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 11: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/11.jpg)
METODE 2 / POTEK OBDELAVE
11/24
PODPISI
RAZVRŠČANJEPO
TKIVIH / PODRAZREDIH TKIV
MRIMOŽGANI
ROČNOSEGMENTIRANI
MOŽGANI
IBSR
METODAVODITELJEV+ porazdelitve
SVM
VODITELJIPORAZDELITVEFAKTOR MEŠANJA
HIPER-RAVNINE
MRIMOŽGANI
PODPISI
SEGMENTIRANIMOŽGANI
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 12: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/12.jpg)
Metoda voditeljev
- Mera različnosti je v knjižnici razvrščanja, ki sem jo uporabil, izražena kot: d=1 –ρ
ρ=1n∑i= 1
n xi−x σ x
yi−y σ y
- Zaradi možnih vezanih dogodkov se uporablja Pearsonova korelacija med vektorji rangov. *
Pri iskanju novega voditelja iščemo minimum kriterijske funkcije, ki je podana kot: P C =∑ p C
C¿
¿X, ¿¿¿¿
- napaka skupine (lokalna)
12/24
METODE 3 / METODA VODITELJEVobdelovanje obsežnih podatkovnih baz
NENADZOROVANAPREPROSTA
HITRA- Uporaba različnih podobnosti.
* Myers, Jerome L.; Arnold D. Well (2003). Research Design and Statistical Analysis
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 13: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/13.jpg)
13/24
Metoda voditeljev - učenje
METODE 4 / METODA VODITELJEV
MODELIRANJE PORAZDELITEVRAZDALJ/RAZLIČNOSTIod podpisov podrazredov do posam
eznihreprezentativnih podpisov =
voditeljev podrazredov
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 14: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/14.jpg)
ocena verjetnosti pripadnosti voksla določenemu tkivuglede na oddaljenost od reprezentativnih podpisov
Delne karte verjetnosti pripadanja vokslov drugemu podrazredu likvorja
P c i =r =∏ P ci=r∣δi,r ,T r
P ci =r∣δ i,r ,T 1 , . .. ,T L =P c i=r ∗P δ i,r∣c i =r,T r
∑ P c i =r ∗P δ i,r∣c i =r,T r kjer je
ci - razred voksla i
p(ci=k) - parameter mešanja;
p(δi,r|ci=k) - verjetnost razdalje δ
i,r v danem razredu k;
p(ci=r|δi,,1..R
) - verjetnost razreda pri danih razdaljah
14/24
Metoda voditeljev – računanje verjetnosti
METODE 5 / METODA VODITELJEV
Končna verjetnost pripadnosti voksla v podrazred r
produkt vseh verjetnosti istega podrazreda rpridobljenih z različnimi reprezentativnimi voditelji
vseh
po
dra
zred
ov tkiv
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 15: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/15.jpg)
SVM
Podrazredi- za zmanjšanje heterogenosti podpisov v posameznem tkivu- vsako tkivo v 3 podrazrede; 1. podrazred sestavljajo voksli 1. in 2. plasti (približno 2-3mm globoko), 2. podrazred vsebuje 3. in 4. plast, 3. podrazred vsebuje vse globje plasti (> 4-6mm globoko).
Algoritem SVM išče ravnine, ki ločijo pozitivne in negativne elemente.
- hiperravnino z največjo širino robov- določitve zgornje meje števila napak pri učenju - preoblikovanje podatkov v višje dimenzije -> poenostavi izračun hiperravnin
- učenje na treh od 18 IBSR volumnov- v vsakem podrazredu omejil na 100 podpisov
- knjižnica libSVM v programskem paketu R
15/24
METODE 6 / SVM
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 16: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/16.jpg)
Ocenjevanje / primerjava atlasov verjetnosti
- klasifikacija na podlagi maksimalne verjetnosti tkiv WM, GM in likvorja v posameznem vokslu in primerjava tovrstne klasifikacije med prostorskimi atlasi in verjetnostnimi atlasi podpisov (registracija FLIRT in FNIRT iz paketa FSL)
- uporaba verjetnostnih atlasov podpisov v segmentacijskem programu FAST
- za ocenitev rezultatov klasifikacije B z rezultati ročne segmentacije A Diceov koeficient:
DSC A,B =2 A∩B
A B
16/24
METODE 7 / PRIMERJAVA in OCENJEVANJE
Senčenje
Testiranje robustnosti - dodajanje neenakomerne intenzivnosti s polinomom 3. reda (BrainWeb Simulated Brain Database)
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 17: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/17.jpg)
Rezultati Metoda voditeljev
17/24
REZULTATI 1 / PODOBNOST PODPISOV
Prepoznava tumorskega tkiva z uporabo podobnosti podpisa.
(A) referenčni podpis je izbran v sredini prikazanega križca.Barvna mapa prikazuje podobnost podpisov.Opazimo lahko, kako velika večina najbolj podobnih podpisov pripada cisti.
(B) tkivo tumorja, ki je po intenzivnosti sivine podoben signalu beline, je ostro obrobljeno. V tem primeru sem izbral 3 referenčne podpise in nato izračunal povprečje treh dobljenih mask.
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 18: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/18.jpg)
Rezultati Metoda voditeljev
18/24
REZULTATI 2 / METODA VODITELJEV
Atlasi verjetnosti
Klasifikacija izračunana z največjo verjetnostjo.
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 19: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/19.jpg)
SVM
19/24
REZULTATI 3 / SVM
Histogrami p za vokslev celotni maski možganov (črna pikčasta črta)
in tiste v tkivu določene maske (rdeča polna črta).
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 20: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/20.jpg)
20/24
REZULTATI 4 / SVM
Klasifikacija na osnovi podpisov bolje sledi orisu anatomije posameznika v vseh treh primerih.
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 21: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/21.jpg)
REZULTATI 5 / SVM
21/24
Rdeče črte - klasifikacij z atlasi podpisov, Modre in zelene črte - klasifikacije z linearno in nelinearno registriranimi prostorskimi atlasi
![Page 22: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/22.jpg)
Ocena končne segmentacije z različnimi priorji. Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov.
Črna črta za primerjavo predstavlja Diceove koeficiente za enostavno klasifikacijo samo s priorji podpisov.
- Segmentacija brez ali z uporabo priorjev
samo za inicializacijo segmentacije daje signif. (p<0,01)
slabše Diceove koeficiente, v primerjavi s segmentacijo,
ki uporablja priorje v celotnem postopku segmentacije.
(za WM p=0,08).
- Z uporabo priorjev podpisov dobimo signif. (p<0,01)
boljše segmentacije za GM in CSF.
- Za WM je izboljšanje statistično manj signif. (p<0,05).
22/24
REZULTATI 6 / SVM - FAST
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 23: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/23.jpg)
Izbira tekstur- rotacijsko neodvisni, neobčutljive na senčenje in razpon intenzitet sivin- dodatne teksture -> večje natančnosti in razmejevanje tkiv na več razredov
Izbira razredov in podrazredov- večina napak izhaja iz 1. plasti - na stičišču tkiv različnih vrst- možna razširitev na več razredov
Izbira razpona prostorskih sosednosti- majhnih sosednostih - prostorske podrobnosti- dovolj velik prostor, da zajame teksturo, kjer se sivina, belina in likvor razlikujejo
Metoda voditeljev- omogoča uporabo različnih razdalj/podobnosti za mero različnosti- pomanjkanje jamstva konvergence v globalni optimum (hierarhično razvrščanje)
SVM- neuravnoteženost podatkov (likvor)
23/24
RAZPRAVA .
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV
![Page 24: UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI …ibmi.mf.uni-lj.si/sites/default/files/IBMI_Vovk_2012.pdf · 2012-12-26 · Segmentacija s prog. FAST v CSF, GM in WM na 5 načinov](https://reader033.vdocuments.net/reader033/viewer/2022041816/5e5b40bec5132e1c3b11076c/html5/thumbnails/24.jpg)
Nov pristop na podlagi podpisov proizvede priorje tkiv -> za inicializacijo in vodenje segmentacije možganov.
Za povezavo podpisov z vrstami tkiv sem uporabil metodo voditeljev in klasifikacijsko metodo SVM.
Optimizacija potrebna samo v fazi učenja za izračun voditeljev ali SVM hiperravnin in s tem povezanimi porazdelitvami; proces, ločen od segmentacije.
Priorji dobljeni s podpisi, dajo statistično značilno boljše rezultate klasifikacij ter segmantacijv primerjavi z uporabo lokacijskih priorjev.
Pristop loči vrste možganskih tkiv in je uporaben za kvantitativno odmero možganske poškodbe:-> sklep, da so izračunani reprezentativni podpisi v pomoč pri objektivnih diagnostičnih postopkih.
24/24
ZAKLJUČEK .
UPORABA LOKALNE OPISNE STATISTIKE PRI SEGMENTACIJI MAGNETNO RESONANČNIH SLIK MOŽGANOV