virus hepatitis b y c: virología aplicada virus hepatitis b y c: virología aplicada conceptos de...

21
Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular en Argentina Jorge Quarleri Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida UBA-CONICET

Upload: agota-escalona

Post on 11-Apr-2015

163 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

Page 1: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada

Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes

Epidemiología molecular en Argentina

Jorge QuarleriInstituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida

UBA-CONICET

Page 2: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

¿Qué los une?• Virus envueltos• Vías de transmisión• Tropismo celular• Evolución a cronicidad• Polimerasas con errores MUTANTES

variabilidad• Evasión a la respuesta inmune• Proteínas virales con capacidad trans-

activadora carcinoma hepático

Page 3: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

¿Qué los distingue?• Tipo de genoma: RNA (HCV); DNA (HBV)• Cinética inicial de replicación: más lenta en HBV• Uso de transcripción reversa (sólo HBV)• Capacidad de integración al genoma celular (sólo

HBV)• Tasa de evolución a la cronicidad (85% para HCV y

<2% para HBV)• Reservorio intracelular (sólo HBV, forma DNAccc)• Cura con nuevas terapias (sólo HCV)• Vacuna (sólo HBV)

Page 4: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Estructura de los viriones

Delaney WE 4th.; Antiviral Res. 2013

Page 5: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Organización genómica

Delaney WE 4th.; Antiviral Res. 2013

Page 6: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Ciclos de replicación

Re-infección

POLIMERASA VIRAL

DNAccc

Delaney WE 4th.; Antiviral Res. 2013

Page 7: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Las polimerasas virales se equivocan, y no corrigen

1. RNA polimerasa -RNA dependientes: sintetizan RNA desde un molde RNA (virus RNA tal como HCV)

2. DNA polimerasa RNA-dependiente que sintetizan DNA desde un templado RNA, comúnmente conocida como transcriptasa inversa (HIV, y otros retrovirus; HBV)

Quarleri

A C T G

Page 8: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Algunas cifras…

• 3.2-7.9 x 10-5 sustituciones nucleotídicas/ciclo

• 100 veces > otros DNA virus

~1010-11 mutaciones / día

• 1.6-6.2 x 10-5 sustituciones nucleotídicas/ciclo

• ~ RNA virus

Page 9: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

¿Depende la variabilidad de HBV y HCV sólo de la pobre fidelidad de las polimerasas virales?

Factores virales1. Polimerasa que comete errores y no los corrige (alta

tasa de fijación de mutaciones)2. Intensa capacidad replicativa (1012 partículas

virales/día)3. En HBV re-infección durante la replicación4. Recombinación

Factores del hospedador5. En HBV la enzima celular APOBEC contribuye con la

hipermutacionalidad 6. Células blanco con vida media larga

Factores virales7. En HBV, genoma de pequeño tamaño y marcos

abiertos de lectura solapados8. Mutantes defectivas

Faci

litad

ores

Lim

itado

res

Quarleri

Page 10: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Población que evoluciona genéticamente como una distribución compleja de variantes que están

cercanamente relacionadas pero no son idénticas

CUASIESPECIES VIRALES

Page 11: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Inicial Resistente Bajo fitness Fitness

Escape recuperado

Page 12: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Lok A et al, NEJM (2012):366 (3) 216.

Page 13: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

MUTANTES

Gen polimerasa resistencia a drogasS evasión Ac

Gen promotor Core altera expresión HBepreCore X capacidad trans-activadora

Mutaciones puntualesDeleciones Inserciones

Mutaciones puntualesDeleciones Inserciones

Gen NS5B NS3/4A resistencia a drogas NS5A

epitopes evasión

Page 14: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Supervivencia del más apto

(fitness )

MULTIPLICACION VIRAL

Mutaciones

Diversidad genética

(cuasiespecies)

Drogas antivirales

Presión de selección inmune

“Una droga antiviral es una droga que selecciona resistencia”

D.Richman (2000) Hepatology 32, 866

Mutagénesis es replicación dependiente

Page 15: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Cuasiespecies

Estamentos jerárquicos para la nomenclatura de la heterogeneidad viral

Page 16: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Genotipos, subtipos

8%: GENOTIPO4-8%: SUB-GENOTIPO

>25%: GENOTIPO20-25%: SUB-GENOTIPO

Ray SC, Thomas DL. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, editors. Mandell, Douglas, and Bennett’s principles and practice of infectious diseases, 2010

Page 17: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Genotipos de HBV

Shi W, et al. (2013) Hepatitis B virus subgenotyping: history, effects of recombination, misclassifications, and corrections.Infect Genet Evol. Quarleri

Page 18: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Franca et al., 2004, JCM 42 (11), 5015.

QuarleriPezzano et al., 2011, Clin Microbiol Infect. 2011;17(2):223-31

Distribución de genotipos de HBV en

Argentina

Page 19: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Hajarizadeh, B. et al. (2013) Epidemiology and natural history of HCV infectionNat. Rev. Gastroenterol. Hepatol.

Genotipos de HCV

Quarleri

Page 20: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Genotipos: IMPLICANCIAS BIOLÓGICAS

Distribución geográfica: si bien algunos están ampliamente distribuidos, otros se encuentran más restringidos a áreas geográficas definidas

Pronóstico: mayor chance de evolución a cronicidad y/o cuadros de mayor severidad hepática

Tasa de respuesta al tratamiento: Se ajustan tiempos de tratamiento

Tasa de replicación viral

Quarleri

Page 21: Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Virus Hepatitis B y C: Virología aplicada Conceptos de genotipos, cuasiespecies, mutantes Epidemiología molecular

Muchas gracias

Contacto:. [email protected]