własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · snap protocol...

37
Własności elastyczne komórek i tkanek - od fizyki do zastosowań biomedycznych Małgorzata Lekka Zakład Badań Mikroukładów Biofizycznych Instytut Fizyki Jądrowej PAN

Upload: others

Post on 04-Aug-2020

0 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Własności elastyczne komórek i tkanek- od fizyki do zastosowań

biomedycznych

Małgorzata Lekka

Zakład Badań Mikroukładów BiofizycznychInstytut Fizyki Jądrowej PAN

Page 2: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Plan prezentacji

Biomechanika komórek

Biomechanika tkanek

Mikroskop sił atomowych (AFM)

Page 3: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

błona komórkowa

włókna aktynowe

mikrotubule

jądro komórkowe

reticulumendoplazmatyczne

mitochondrium

Aparat Golgiego

lizozom

rybosomy

Struktura komórki jest niejednorodna

centrosom

komórki nabłonka pęcherza moczowego(obraz z mikroskopu fluorescencyjnego)

Page 4: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

komórki nabłonka pęcherza moczowego(obraz z mikroskopu fluorescencyjnego)

włókna aktynowe

mikrotubulejądra komórkowe

Page 5: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Huber et al. Cur. Opin. Cell Biol. (2014)

Levental et al. Soft Matter (2007)

Wiele biologicznych struktur wykazuje nieliniowy charakter

dla dużych odkształceń

Page 6: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Każdy element strukturalny komórki posiada odmienne własności mechaniczne

Harris, Sem. Cell. Develop. Biol. 2018

cytoplazma

cytoszkielet

jądro komórkowe

• Moduł elastyczności (Young’a)• Moduł ścinania

Page 7: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Kasza et al. Cur. Opin. Cell Biol. (2007)

Pole powierzchni Sdługość L

ΔL

Siła F𝜎 =

𝐹

𝑆𝛾 =

∆𝐿

𝐿

𝛾 =∆𝛾

∆𝜏

𝜎 = 𝐺′ ∙ 𝛾Elastyczność

Lepkość 𝜎 = |𝐺"(Δ) ∙ Δ| 𝛾

Page 8: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Voigt model

E η

Kelvin model

E1

E2

η

Maxwell model

E

η

Modele reologiczne dla komórek

+ bardziej zaawansowane modele teoretyczne

Page 9: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

własności mechaniczne pojedynczych komórek mogą być mierzone wieloma metodami

Unal et al. Nanobiomedicine, (2014)

Page 10: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

własności mechaniczne pojedynczych komórek mogą być mierzone wieloma metodami

Prawo Hooke’a:

F = k·x

k – stała sprężystości [N/m]

F

x

L

Lekka BioNanoSciences 6(2016) 65

Page 11: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

AFM -> Tryb modulacji siły (ang. force modulation)

próbka

δ0- początkowe ugięciemateriału (indentacja)

wymuszenie drgań sinusoidalnych o małej

amplitudzie drgań δwokół δ0

𝐹 =3

4

𝐸

1 − 𝜇2𝑡𝑎𝑛𝜃 𝛿2

𝐺∗ =𝐸∗

2 1 + 𝜇

𝐺∗ 𝜔 =1 − 𝜇

3𝛿0𝑡𝑎𝑛𝜃

𝐹∗ 𝜔

𝛿∗ 𝜔

𝐺′ 𝜔 = 𝐺𝑁0 + 𝑘1𝜔

𝑎

𝐺′′ 𝜔 = 𝑘0𝜔−𝑛𝑓 + 𝑏𝑘1𝜔

𝑎

1 10 1001E+02

1E+03

1E+04

HCV29

G'

G''

vis

cous

vis

cous

ela

stic

G0

N

fT

HTB-9

G'

G''

G' [

Pa], G

'' [P

a]

[Hz]

fT

G0

N

ela

stic

Joanna Zemła

dr Joanna Zemła

Page 12: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

http://www.biocurious.com/images

AFM -> Tryb spektroskopii siły (ang. force volume)

0 1 2 3 4 50

2

4

6

cancer prostate cells

PC-3

Du145

LNCaP

normal prostate cells

PZ-HPV-7

Forc

e [

nN

]

Indentation [um]

Page 13: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Moduł Young’a jest wartością względną

Biomechanika komórek

Prostate cancer cells:

LNCaP E = 460 ± 170 PaE = 287 ± 52 Pa

PC-3 E = 1970 ± 410 PaE = 1401 ± 162 Pa

PZHPV-7 E = 3330 ± 650 PaBPH: E = 2790 ± 491 Pa

IFJ PAN, KrakowFaria et al. Analyst 133 (2008) 1498

What was softer – remained softer !

Page 14: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

SNAP Protocol (COST Action TD1002)

Scientific Reports 7 (2017) 5117

0 2000 4000 6000 8000

Inte

nsity [a.u

.]

Frequency [Hz]

𝑘 =𝑘𝐵𝑇

𝑃

P – pole powierzchni

ω = 1.38 kHz

Stała k musi być znana żeby dobrze policzyć czułość detektora

Stał

a sp

ręży

sto

ści [

mN

/m]

numer sprężynki

Schillers et al. Sci. Rep. 7 (2017) 5117

ML, Justyna Bobrowska

Page 15: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Próbka - żele

Schillers et al. Sci. Rep. 7 (2017) 5117

ML, Justyna Bobrowska

Próbka - komórki MDCK C11

Page 16: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Model Hertza(1882)

• Idealnie elastyczne kule• Brak adhezji w polu kontaktu• Własności elastyczne są izotropowe

R1

R2

kula naciskająca na elastyczną półprzestrzeń

promień kontaktu

𝑎𝐻 =𝐹 ∙ 𝑅′

𝐸′

aH

1

𝑅′=

1

𝑅1+1

𝑅2

R1

R2 -> ꚙ

aH

𝑅′ = 𝑅1

1

𝐸′=

1

𝐸1+1

𝐸2

Page 17: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Modyfikacja Ufianda - Sneddona

MLCT

OTR4

PNP

MNSL

Long et al. J. Appl. Mech. 84 (2017) 051007

Osiowosymetryczny indenter

Nieskończona półprzestrzeń(izotropowa, idealnie elastyczna)

wprowadzenie funklcji kształtu indentera

Page 18: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

MLCT

OTR4

PNP

MNSL

Long et al. J. Appl. Mech. 84 (2017) 051007

Modyfikacja Ufianda - Sneddona

Page 19: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

adhezja/nacisk/adhezja

Derjaguin-Mueller-Toporov (DMT)

adhezja nacisk

Jonhson-Kendall-Roberts (JKR)

𝑎𝐷𝑀𝑇3 =

𝑅

𝐸′∙ 𝐹 + 2𝜋𝐸𝐴𝑅

F = FHertz - Fadh

F = FHertz - 4𝐸𝑒𝑓𝑓∙𝐹𝑎𝑑ℎ∙𝑎𝐽𝐾𝑅3

3𝑅

𝑎𝐽𝐾𝑅3 =

𝑅

𝐸′∙ 𝐹 + 2𝜋𝐸𝐴𝑅 + [… . ]0.5

… . = 6𝜋𝐸𝐴𝑅𝐹 + 3𝜋𝐸𝐴𝑅2

R

R

F

F

Adhezja

Page 20: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

0

5

10

PA1

450

n= 64 curves

map 6x6 um

Indentation [nm]

E [kP

a]

Żele polyacrylamidowe (PA): jednorodna próbka

Miękki PA 1 (5% PAA & 0.4% bis-A) Sztywny PA 2 (7% PAA & 0.4% bis-A)

0-0.16 mN/m

Model komórki

Spektroskopia siły

Joanna ZemłaJustyna Bobrowska

Page 21: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Żel PA

100 200 300 400 500 600 7000

10

20

30

100 200 300 400 500 600 7000

10

20

30

100 200 300 400 500 600 7000

10

20

30

100 200 300 400 500 600 7000

10

20

30

100 200 300 400 500 600 7000

10

20

30

PA1

PA2

indentation depth (nm)

indentation depth (nm)

Model komórkiJoanna ZemłaJustyna Bobrowska

E [k

Pa]

E [k

Pa]

E [k

Pa]

E [k

Pa]

E [k

Pa]

Page 22: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

100 200 300 400 500 6000

10

20

30

40

100 200 300 400 500 6000

10

20

30

40

100 200 300 400 500 6000

10

20

30

40

100 200 300 400 500 6000

10

20

30

40

100 200 300 400 500 6000

10

20

30

40 indentation depth (nm)

HCV29 non-malignant

HT1376 cancerous

indentation depth (nm)

Komórki Joanna ZemłaJustyna Bobrowska

Komórki nowotworowe są bardziej deformowalne

E [k

Pa]

E [k

Pa]

E [k

Pa]

E [k

Pa]

E [k

Pa]

αβ αβαβ αβαβ

Page 23: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

0

10

20

30

E [kP

a]

Biomechanika komórek

HCV29 T24

HCV29

T24

Indentacja:

• 500 nm• 1000 nm• 1500 nm• brak zakresu

Andrzej Kubiak, Tomasz ZielińskiKomórki

Page 24: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Andrzej Kubiak, Tomasz Zielińskiorganizacja cytoszkieletu aktynowego

- rozkład elastyczności

Page 25: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Winflunina powoduje wzrost sztywności komórek prostaty

Brak efektu

MTT assay

Biomechanika komórek – rola cytoszkieletu

efektywność działania leków przeciwnowotworowych

0 200 400 600 800 1000 12000.0

0.5

1.0

1.5

2.0

% k

om

óre

k

cVFL

[nM]

Związek cytotoksyczny

Andrzej Kubiak

CVFL [nM]

E [P

a]

Page 26: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Winflunina powoduje wzrost sztywności komórek prostatypoprzez oddziaływanie z mikrotubulami

CVFL [nM]E

[Pa]

Brak efektu

MTT assay

Biomechanika komórek – rola cytoszkieletu

efektywność działania leków przeciwnowotworowych

0 200 400 600 800 1000 12000.0

0.5

1.0

1.5

2.0

% k

om

óre

k

cVFL

[nM]

Związek cytotoksyczny

Andrzej Kubiak

Page 27: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Justyna Bobrowska

Auranofin

0

5

10

15

20

E

[kP

a]

- auranofin +auranofin

1uM Au

- auranofin + auranofin

efektywność działania leków przeciwnowotworowych

mapa własności elastycznych

Page 28: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika komórek

Fizyko-chemiczne własności komórek czerniaka

healthy melanocytesskin melanoma from primary tumor sites melanoma metastasis to skinmelanoma metastasis to lung

0

10

20

30

40

50

HEMa-LP

WM115

E [

kP

a]

mean standard deviation

median

WM793WM239

WM266-4

1205Lu

A375-P

Justyna Bobrowska

własności biochemiczne powierzchni komórek(ToF SIMS)

Wzrost deformowalności komórekWzrost różnic we własnościach powierzchniowych

Page 29: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika tkanek

Stylianou, Lekka Nanoscale, 2019

Page 30: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika tkanek

60 um x 60 um

rdzeń kręgowy

20 um

Page 31: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika tkanek

Komórki nowotworowe są bardziej deformowalne

Tkanka nowotworowa jest sztywniejsza

Single cell deformabilitysoft

stiff

softstiff

Tissue deformability

Lekka Bionanoscience, 2016

Stylianou, Lekka Nanoscale, 2019

Page 32: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika tkanek

pro

bab

ility

stiffness

pro

bab

ility

stiffness

Single peak

Low and high elasticity peaks

Endometroid carcinoma

Breast cancer

Lekka, Arch. Biochem. Biophys. (2012); Stylianou, Nanoscale, 2018

Page 33: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Biomechanika tkanek

Tian, Nanoscale, 2015

50 um

10 um x 10 um

Page 34: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Podsumowanie

Słaby postęp w leczeniu nowotworów spowodował wzrost zainteresowania własnościami fizyko-chemicznymi na poziomie pojedynczych komórek niosącymi

informację o:

• parametrach fizycznych kontrolujących wzrost i rozprzestrzenianie się komórek nowotworowych,

• O zastosowaniach nowych, dobrze opracowanych metod pomiarowych, w szczególności tych działających w zakresie nanoskali.

Page 35: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Podsumowanie

Zakład Badań Mikroukładów Biofizycznych (NZ55)

1. Justyna Bobrowska

2. Małgorzata Lekka

3. Barbara Orzechowska

4. Joanna Pabijan

5. Joanna Zemła

Doktoranci

1. Joanna Danilkiewicz

2. Andrzej Kubiak

3. Tomasz Zieliński

Aktualnie realizowane projekty

- projekt NCN - Preludium (2014 – 2017)

- projekt NCN OPUS (2015 – 2018)

- Marie-Curie training network ITN (2019 – 2022) –

nowy doktorant

Page 36: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Formalne i nieformalne współprace:

1. Collegium Medicum UJ

2. Uniwersytet w Linzu (Austria)

3. Instytut Fizyki UJ

4. Politechnika w Pradze (Czechy)

5. Politechnika Warszawska

6. Uniwersytet w Mediolanie

7. Universytet w Grenoble

Podsumowanie

Page 37: Własności elastyczne komórek i tkanek od fizyki do zastosowań · 2019-01-31 · SNAP Protocol (COST Action TD1002) Scientific Reports 7 (2017) 5117 0 2000 4000 6000 8000 a.u.]

Dziękuję