wp 1. cgen-op - bpdp · 2019. 12. 18. · sub wp2 -(2). p erbanyakan in vitro dan seleksi planlet...

PENGEMBANGAN BIBIT KLONAL KELAPA SAWIT TOLERAN GANODERMA SECARA CISGENIK Asmini Budiani, Riza Arief Putranto, Hayati Minarsih, Sumaryono, Rokhana Faizah Pusat Penelitian Bioteknologi dan Bioindustri Indonesia Riset Grant Sawit K16 Busuk pangkal batang yang disebabkan oleh Ganoderma sp merupakan penyakit palin berbahaya bagi perkebunan kelapa sawit. Perakitan tanaman toleran Ganoderma dapat ditempuh melalui rekaya genetika (transgenesis), namun pendekatan ini memerlukan waktu yang lama serta erng menghadapi penolakan dari LSM. Saat ini, dengan teknologi cisgenik yan melibatkan Teknik genome editing, perakitan tnaman dengan karakter unggul tertentu tramsuk toleran terhadap Ganoderma dapat dilakukan relative lebih cepat dan efisien, serta memiliki aseptabiltas masyarakat yang lebih tinggi WP 1. cGen-OP Sub WP1-(1). Pengembangan teknik genome editing untuk kelapa sawit - Penyediaan kecambah dan penanaman kelapa sawit toleran dan sensitif Ganoderma - Isolasi RNA dari sampel akar dan daun tanaman toleran dan sensitif Ganoderma - Bioinformatika data gen terkait toleransi Ganoderma - Desain primer dan konstruksi sistem CRISPR/Cas9 dengan gen model pada kelapa sawit - Konstruksi sistem CRISPR/Cas9 dengan gen target Sub WP1-(2). Ekspresi gen diferensial dari tanaman kelapa sawit toleran dan sensitif Ganoderma - RNA sequencing dari sampel tanaman toleran dan sensitif Ganoderma - Penentuan kandidat gen untuk genome editing WP 2. Propa-Gano Sub WP2-(1). Pengembangan teknik transformasi menggunakan Agrobacterium tumefaciens yang membawa modul CRISPR/Cas9 -Pengembangan teknik transformasi konstruk CRISPR/Cas9 untuk DNA model - Transformasi konstruk modul CRISPR/Cas9 untuk DNA target Sub WP2-(2). Perbanyakan in vitro dan seleksi planlet toleran Ganoderma -Perbanyakan klonal kelapa sawit melalui embriogenesis somatik dari eksplan embrio zigotik - Perbanyakan klonal eksplan hasil transformasi menggunakan konstruk CRISPR/Cas9 untuk DNA model - Perbanyakan klonal eksplan hasil transformasi menggunakan konstruk CRISPR/Cas9 untuk DNA ta rget - Regenerasi dan aklimatisasi planlet - Seleksi planlet (bioassay tanaman toleran Ganoderma) 2017 2016 2018 2019 2020 Root Leaf EgCHI1 EgVIR-1 EgVIR-2 EgIFR-2 EgMT-1 EgSPI-2 EgCAPX-2 EgDEF1-2 EgMT-2 EgPR1-1 EgPR1-2 EgEMLP1-1 EgWRI1 EgCAPX-1 EgCHI2 EgDEF1-1 EgIFR-1 n ≥ 5 EgSPI-1 1<n<5 EgAD1-1 ND EgEMLP1-2 0,2<n<1 EgAD1-2 n≤ 0,2 LUARAN PENELITIAN 1) Data genom/gen yang terkait dengan toleransi terhadap Ganoderma yang diperoleh melalui studi dan analisis bioinformatika, 2) Primer dan rancangan konstruk untuk genome editing pada kelapa sawit, 3) Teknik genome editing pada tanaman kelapa sawit dengan gen model, 4) Teknik transformasi gen pada tanaman kelapa sawit, 5) Teknik regenerasi embrio somatik dari eksplan embrio zigotik

Upload: others

Post on 27-Jan-2021

4 views

Category:

Documents

0 download

Report

Download

Embed Size (px):

TRANSCRIPT

PENGEMBANGAN BIBIT KLONAL KELAPA SAWIT TOLERAN GANODERMA SECARA CISGENIK

Asmini Budiani, Riza Arief Putranto, Hayati Minarsih,

Sumaryono, Rokhana Faizah

Pusat Penelitian Bioteknologidan Bioindustri Indonesia

Riset Grant Sawit K16

Busuk pangkal batang yang disebabkan oleh

Ganoderma sp merupakan penyakit palin berbahayabagi perkebunan kelapa sawit. Perakitan tanamantoleran Ganoderma dapat ditempuh melalui rekaya

genetika (transgenesis), namun pendekatan inimemerlukan waktu yang lama serta erng menghadapi

penolakan dari LSM. Saat ini, dengan teknologicisgenik yan melibatkan Teknik genome editing,perakitan tnaman dengan karakter unggul tertentu

tramsuk toleran terhadap Ganoderma dapatdilakukan relative lebih cepat dan efisien, serta

memiliki aseptabiltas masyarakat yang lebih tinggi

WP 1. cGen-OPSub WP1-(1). Pengembangan teknik genome editing untuk kelapa sawit

- Penyediaan kecambah dan penanaman kelapa sawit toleran dan sensitif Ganoderma

- Isolasi RNA dari sampel akar dan daun tanaman toleran dan sensitif Ganoderma

- Bioinformatika data gen terkait toleransi Ganoderma

- Desain primer dan konstruksi sistem CRISPR/Cas9 dengan gen model pada kelapa sawit

- Konstruksi sistem CRISPR/Cas9 dengan gen target

Sub WP1-(2). Ekspresi gen diferensial dari tanaman kelapa sawit toleran dan sensitif

Ganoderma

- RNA sequencing dari sampel tanaman toleran dan sensitif Ganoderma

- Penentuan kandidat gen untuk genome editing

WP 2. Propa-GanoSub WP2-(1). Pengembangan teknik transformasi menggunakan Agrobacterium tumefaciens yang membawa modul CRISPR/Cas9

-Pengembangan teknik transformasi konstruk CRISPR/Cas9 untuk DNA model

- Transformasi konstruk modul CRISPR/Cas9 untuk DNA target

Sub WP2-(2). Perbanyakan in vitro dan seleksi planlet toleran Ganoderma

-Perbanyakan klonal kelapa sawit melalui embriogenesis somatik dari eksplan embrio zigotik

- Perbanyakan klonal eksplan hasil transformasi menggunakan konstruk CRISPR/Cas9 untuk DNA model

- Perbanyakan klonal eksplan hasil transformasi menggunaka n konstruk CRISPR/Cas9 untuk

DNA target

- Regenerasi dan aklimatisasi planlet

- Seleksi planlet (bioassay tanaman toleran

Ganoderma)

20172016 2018 2019 2020

Root Leaf

EgCHI1

EgVIR-1

EgVIR-2

EgIFR-2

EgMT-1

EgSPI-2

EgCAPX-2

EgDEF1-2

EgMT-2

EgPR1-1

EgPR1-2

EgEMLP1-1

EgWRI1

EgCAPX-1

EgCHI2

EgDEF1-1

EgIFR-1 n ≥ 5

EgSPI-1 1