citogenética básica y cariotipo

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Citogenética Básica Estas páginas son traducción de Cytogenetics Information Site El autor del contenido original es Dave McDonald y las imágenes de ejemplo fueron cedidas por Dynagene Cytogenetics Laboratory (Seattle, WA, U.S.A.) Traducción al español de Angel Herráez (Univ. de Alcalá) página actualizada en junio de 2002 http://www2.uah.es/biomodel/citogene/dynacare/geninfo.htm#ejemplos Lo Básico Idiograma del Cromosoma 1 Metacéntrico (Cromosoma 1) Idiograma del Cromosoma 9 Submetacéntrico (Cromosoma 9)

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Page 1: Citogenética básica y cariotipo

Citogenética Básica

Estas páginas son traducción de Cytogenetics Information Site

El autor del contenido original es Dave McDonald y las imágenes de ejemplo fueron

cedidas por Dynagene Cytogenetics Laboratory (Seattle, WA, U.S.A.)

Traducción al español de Angel Herráez (Univ. de Alcalá)

página actualizada en junio de 2002

http://www2.uah.es/biomodel/citogene/dynacare/geninfo.htm#ejemplos

Lo Básico

Idiograma del Cromosoma 1

Metacéntrico

(Cromosoma 1)

Idiograma del Cromosoma 9

Submetacéntrico

(Cromosoma 9)

Page 2: Citogenética básica y cariotipo

Idiograma del Cromosoma 14

Acrocéntrico

(Cromosoma 14)

¿Qué son los Cromosomas?

La citogenética es el estudio de los cromosomas y las enfermedades relacionadas,

causadas por un número y/o estructura anormales de los cromosomas. Los

cromosomas son estructuras complejas localizadas en el núcleo de las células,

compuestos por DNA, histonas y otras proteínas, RNA y polisacáridos. Son

básicamente los "paquetes" que contienen el DNA. Normalmente los cromosomas no

se pueden ver con un microscopio óptico, pero durante la división celular se

condensan lo suficiente como para poder ser fácilmente analizados a 1.000 aumentos.

Para recoger células con sus cromosomas en este estado condensado se las expone

a un inhibidor de la mitosis, que bloquea la formación del huso mitótico y detiene la

división celular en la etapa de metafase.

Se pueden usar distintos tejidos para obtener preparaciones de cromosomas; por

Page 3: Citogenética básica y cariotipo

ejemplo, sangre periférica, medula ósea, fluido amniótico y productos de la

concepción. Aunque las técnicas específicas difieren según el tejido usado, el método

básico para obtener preparaciones de cromosomas es así:

* Recolección de la muestra y preparación inicial.

* Cultivo celular.

* Adición de un inhibidor de la mitosis para detener las células en metafase.

* Recogida de las células. Este paso es muy importante para obtener preparaciones

de alta calidad. Implica exponer las células a una disolución hipotónica, seguida de

una serie de disoluciones fijadoras. Esto hace que las células se expandan, de modo

que los cromosomas se extiendan y puedan examinarse individualmente.

* Tinción de las preparaciones cromosómicas para detectar los posibles cambios

numéricos y estructurales.

Morfología del Cromosoma

Bajo el microscopio, los cromosomas se ven como estructuras delgadas y alargadas.

Tienen un brazo corto y otro largo separados por un estrechamiento o constricción

primaria, llamada centrómero. El brazo corto se designa como p y el largo como q. El

centrómero es el punto de unión del huso mitótico y es parte integral del cromosoma.

Es esencial para el movimiento y segregación normales del cromosoma durante la

división celular. Los cromosomas metafásicos humanos presentan tres formas básicas

y se pueden clasificar de acuerdo con la longitud de los brazos corto y largo, así como

por la posición del centrómero. Los cromosomas metacéntricos tienen los brazos corto

y largo de aproximadamente la misma longitud, con el centrómero en el punto medio.

Los cromosomas submetacéntricos tienen los brazos corto y largo de longitudes

desiguales, con el centrómero más próximo a uno de los extremos. Los cromosomas

acrocéntricos tienen el centrómero my cerca de un extremo, con un brazo corto muy

pequeño. Con frecuencia tienen constricciones secundarias en los brazos cortos,

conectando trozos muy pequeños del DNA, llamados tallos y satélites, al centrómero.

Los tallos contienen genes que codifican el RNA ribosómico.

Page 4: Citogenética básica y cariotipo

Los diagramas de la izquierda, llamados idiogramas*, de los cromosomas 1, 9 y 14 con

bandas G son ejemplos típicos, respectivamente, de cromosomas metacéntricos,

submetacéntricos y acrocéntricos. El idiograma es básicamente un "mapa

cromosómico" que muestra la relación entre los brazos corto y largo, el centrómero

(cen) y, en el caso de cromosomas acrocéntricos, los tallos (st, de stalk) y satélites

(sa). También se ilustran los patrones de bandas específicos. Cada banda se numera

para ayudar en la descripción de reorganizaciones.

Análisis Cromosómico

Prácticamente todos los análisis citogenéticos de rutina se realizan sobre

preparaciones cromosómicas que se han tratado y teñido para producir un patrón de

bandas específico de cada cromosoma. Esto permite la detección de cambios sutiles

en la estructura de los cromosomas. El tratamiento de tinción más común se llama

bandeo G. Se dispone de otras técnicas de tinción que ayudan a identificar anomalías

específicas. Una vez que se han obtenido las preparaciones de cromosomas

metafásicos teñidos, pueden examinarse al microscopio. Típicamente, se observan y

cuentan de 15 a 20 células, con un análisis completo de al menos 5 de ellas. Durante

un análisis completo, cada cromosoma se compara críticamente banda por banda con

su homólogo. Es necesario examinar tantas células para poder detectar un

mosaicismo, con significado clínico (ver más abajo).

Tras el análisis al microscopio, se toman imágenes de las células en metafase que

tengan mejor calidad, bien mediante fotografía o por digitalización de imagen

computerizada. Cada cromosoma puede entonces disponerse en pares de acuerdo

con su tamaño y patrón de bandas, formando un cariotipo. El cariotipo permite al

citogenetista examinar aún más en detalle cada cromosoma en busca de cambios

estructurales. Se hace entonces una descripción por escrito del cariotipo, definiendo el

análisis cromosómico.

Page 5: Citogenética básica y cariotipo

*Los idiogramas son gentileza de Tim Knight (Fred Hutchinson Cancer Research

Center, Seattle, WA., U.S.A.)

Anomalías Cromosómicas

Cromosomas Normales

Las células somáticas humanas normales tienen 46 cromosomas: 22 pares de

cromosomas homólogos o autosomas (los cromosomas 1 a 22) y dos cromosomas

sexuales. A esto se le llama el número diploide. Las mujeres tienen dos cromosomas X

(46,XX) mientras que los varones tienen un X y un Y (46,XY). Las células germinales

(óvulo y espermatozoide) tienen 23 cromosomas: una copia de cada autosoma más un

solo cromosoma sexual. A esto se le llama el número haploide. Se hereda de cada

progenitor un cromosoma de cada par autosómico y un cromosoma sexual. Las

madres sólo pueden aportar un cromosoma X a sus hijos e hijas, mientras que los

padres pueden aportar bien un X (a sus hijos) o bien un Y (a sus hijas).

* Cariotipos normales de 550 y 650 bandas

Anomalías Cromosómicas

Aunque las anomalías cromosómicas pueden ser muy complejas, hay dos tipos

básicos: numéricas y estructurales. Ambos tipos pueden darse simultáneamente.

Las anomalías numéricas implican la pérdida y/o ganancia de uno o varios

cromosomas completos y puede incluir tanto a autosomas como a cromosomas

sexuales. Generalmente, la pérdida de cromosomas tiene mayor repercusión en un

individuo que la ganancia, aunque ésta también puede tener consecuencias serias.

Las células que han perdido un cromosoma presentan monosomía para ese

cromosoma, mientras que aquéllas con un cromosoma extra muestran trisomía para el

Page 6: Citogenética básica y cariotipo

cromosoma implicado. Casi todas las monosomías autosómicas llevan a la muerte

poco después de la concepción y sólo unas pocas trisomías permiten llegar al

nacimiento. La anomalía autosómica numérica más común es el Síndrome de Down o

trisomía 21. Los individuos con trisomía en los cromosomas 13 y 18 pueden también

sobrevivir hasta el nacimiento, pero están más seriamente afectados que aquéllos con

síndrome de Down. Curiosamente, los individuos con una condición llamada triploidía,

en la cual hay una copia extra de todos los cromosomas (69 en total), pueden

ocasionalmente sobrevivir hasta el nacimiento, aunque normalmente mueren durante

el periodo neonatal.

Otra regla general es que la pérdida o ganancia de un autosoma tiene consecuencias

más graves que la de un cromosoma sexual. La anomalía de cromosomas sexuales

más común es la monosomía del cromosoma X (45,X), o Síndrome de Turner. Otro

ejemplo bastante común es el Síndrome de Klinefelter (47,XXY). Aunque hay

variaciones considerables dentro de cada síndrome, los individuos afectados a

menudo llevan vidas bastante normales.

En ocasiones, un individuo porta un cromosoma extra que no se puede identificar por

su patrón de bandas; a éstos se les llama cromosomas marcadores. La introducción

de las técnicas FISH ha sido de gran ayuda en la identificación de estos cromosomas

marcadores.

Las anomalías estructurales implican cambios en la estructura de uno o varios

cromosomas. Pueden ser increíblemente complejas, pero para el propósito de esta

discusión nos centraremos en tres de los tipos más comunes:

* Las deleciones implican la pérdida de material de un solo cromosoma. Los efectos

son típicamente graves, puesto que hay pérdida de material genético.

* Las inversiones tienen lugar cuando se dan dos cortes dentro de un mismo

cromosoma y el segmento intermedio gira 180° (se invierte) y se vuelve a unir,

Page 7: Citogenética básica y cariotipo

formando un cromosoma que estructuralmente tiene la secuencia cambiada.

Normalmente no hay riesgo de problemas para el individuo si la inversión es de origen

familiar (es decir, se ha heredado de uno de los progenitores). Hay un riesgo algo

mayor si es una mutación de novo (nueva), debido posiblemente a la interrupción de

una secuencia clave de un gen. Aunque el portador de una inversión puede ser

completamente normal, tiene un riesgo ligeramente mayor de producir un embrión con

un desequilibrio cromosómico. Esto se debe a que un cromosoma invertido tiene

dificultad en emparejarse con su homólogo normal durante la meiosis, lo que puede

producir gametos que contengan derivados cromosómicos desequilibrados si ocurre

un entrecruzamiento desigual.

* Las translocaciones implican el intercambio de material entre dos o más

cromosomas. Si una translocación es recíproca (equilibrada) el riesgo de problemas

para el individuo es similar al de las inversiones: normalmente nulo si es familiar y

ligeramente mayor si es de novo. Surgen problemas con las translocaciones cuando a

partir de un progenitor equilibrado se forman gametos que no contienen ambos

productos de la translocación. Cuando tal gameto se combina con un gameto normal

del otro progenitor, el resultado es un embrión desequilibrado que es parcialmente

monosómico para un cromosoma y parcialmente trisómico para el otro.

Las anomalías numéricas y estructurales se pueden dividir a su vez en dos categorías

principales: constitutivas, aquéllas con las que se nace, y adquiridas, las que surgen

como cambios secundarios a otras enfermedades, tales como el cáncer.

A veces se encuentran personas que tienen tanto líneas celulares normales como

anormales. A estos individuos se los denomina mosaicos y en la inmensa mayoría de

los casos la línea celular anormal tiene una anomalía cromosómica numérica. Los

mosaicos estructurales son extremadamente infrecuentes. El grado en el cual un

individuo resulta afectado clínicamente depende habitualmente del porcentaje de

células anormales. Un análisis citogenético de rutina incluye típicamente el examen de

al menos 15 o 20 células, con el fin de descartar cualquier mosaicismo clínicamente

Page 8: Citogenética básica y cariotipo

significativo.

Éstas son sólo algunas de las anomalías más comunes que se encuentran en un

laboratorio de citogenética. Puesto que el número de posibilidades anormales es casi

infinito, se debe preparar al citogenetista para detectar e interpretar virtalmente

cualquier anomalía cromosómica que pueda tener lugar.

Ejemplos de Anomalías Cromosómicas

Pulse en cualquiera de los enlaces siguientes para ver ejemplos de anomalías

cromosómicas numéricas y estructurales detectadas en nuestro laboratorio:

* Ejemplo 1: Síndrome de Down, una anomalía numérica frecuente.

* Ejemplo 2: Inversión en el cromosoma 10.

* Ejemplo 3: Deleción del cromosoma 16.

* Ejemplo 4: Translocación entre los cromosomas 2 y 15.

* Ejemplo 5: Translocación entre los cromosomas 5 y 8.

* Ejemplo 6: Inversión sutil en el cromosoma 3.

* Ejemplo 7: Deleción intersticial en el cromosoma 7.

* Ejemplo 8: Translocación desequilibrada entre los cromosomas 13 y 14.

Page 9: Citogenética básica y cariotipo

Este cariotipo es un ejemplo del Síndrome de Down, la anomalía numérica más

frecuente en recién nacidos. Se caracteriza por un cromosoma 21 extra y el cariotipo

se escribe así: 47,XX,+21. La clave de la descripción de cariotipo es:

* 47: el número total de cromosomas (46 es lo normal).

* XX: los cromosomas sexuales (femeninos).

* +21: indica que el cromosoma extra es un 21.

Page 10: Citogenética básica y cariotipo

Este cariotipo es un ejemplo de inversión, una de las reorganizaciones estructurales

más frecuentes. En este caso, un segmento del brazo q, o brazo largo, del cromosoma

10 de la derecha está invertido. Puesto que ambas rupturas han ocurrido en el brazo

largo y el centrómero no está implicado, se habla de una inversión paracéntrica. Si

hubiera habido rupturas separadas tanto en el brazo largo como en el corto, el

centrómero estaría también invertido y se hablaría de una inversión pericéntrica. El

cariotipo se escribe como 46,XY,inv(10)(q11.23q26.3). La clave para la descripción del

cariotipo es:

Page 11: Citogenética básica y cariotipo

* 46: el número total de cromosomas.

* XY: los cromosomas sexuales (masculinos).

* inv(10): inversión en el cromosoma 10.

* (q11.23q26.3): puntos de corte del segmento invertido.

El idiograma siguiente ilustra detalladamente esta inversión. Para ver una animación

del proceso pulse aquí .

idiograma inversión 10

Este cariotipo es un ejemplo de deleción simple en un cromosoma. En este caso se ha

perdido un segmento del brazo q, o brazo largo, del cromosoma 16 de la derecha. En

este ejemplo particular hay dos cortes visibles microscópicamente dentro del brazo

Page 12: Citogenética básica y cariotipo

largo, que forman una deleción intersticial. Si hubiera un corte, ocasionando la pérdida

de un extremo del cromosoma, se llamaría deleción terminal. El cariotipo se escribe

así: 46,XX,del(16)(q13q22). La clave de la descripción del cariotipo es:

* 46: el número total de cromosomas.

* XX: los cromosomas sexuales (femeninos).

* del(16): deleción en el cromosoma 16.

* (q13q22): puntos de corte del segmento delecionado (o perdido).

Page 13: Citogenética básica y cariotipo

El idiograma siguiente ilustra en detalle esta deleción intersticial.

idiograma deleción 16

Page 14: Citogenética básica y cariotipo

Este cariotipo es un ejemplo de una translocación equilibrada entre dos cromosomas.

En este caso, un segmento largo del brazo p, o brazo corto, del cromosoma 2 de la

derecha se ha intercambiado con el brazo q prácticamente completo, o brazo largo, del

cromosoma 15 de la derecha. Debido a que el tamaño de los fragmentos

intercambiados es casi igual, esta reorganización estructural en particular sería casi

imposible de detectar sin técnicas de bandeo. El cariotipo se escribe como

46,XY,t(2;15)(p11.2;q11.2). La clave para la descripción del cariotipo es:

* 46: el número total de cromosomas.

* XY: los cromosomas sexuales (masculinos).

* t(2;15): translocación entre los cromosomas 2 y 15.

* (p11.2;q11.2): los puntos de corte en los cromosomas 2 (p11.2), y 15 (q11.2),

respectivamente.

El siguiente idiograma ilustra en detalle esta translocación.

Page 15: Citogenética básica y cariotipo

Hibridación in situ Fluorescente

(FISH : Fluorescent In Situ Hybridization)

Estas páginas son traducción de Cytogenetics Information Site

El autor del contenido original es Dave McDonald y las imágenes de ejemplo fueron

cedidas por Dynagene Cytogenetics Laboratory (Seattle, WA, U.S.A.)

Traducción al español de Angel Herráez (Univ. de Alcalá)

página actualizada en junio de 2002

La FISH es una nueva tecnología que utiliza sondas de DNA marcadas con

fluorescencia para detectar o confirmar anomalías génicas o cromosómicas que

generalmente están más allá del poder de resolución de la citogenética de rutina.

Primero, la muestra de DNA (cromosomas metafásicos o núcleos en interfase) se

desnaturaliza, proceso que separa las hebras complementarias de la estructura en

doble hélice del DNA. A la muestra desnaturalizada se le añade entonces la sonda de

interés, marcada con fluorescencia, que se hibridará al DNA de la muestra en el sitio

diana, en el proceso denominado templado, donde se vuelve a formar una doble

hélice. La señal de la sonda se observa mediante un microscopio de fluorescencia y la

muestra de DNA se clasifica según la presencia o ausencia de la señal.

Page 16: Citogenética básica y cariotipo

FISH de Metafase

La FISH puede usarse sobre células en metafase para detectar microdeleciones

específicas más allá de la resolución de la citogenética de rutina o para identificar

material extra de origen desconocido. Puede también ser de ayuda en casos donde es

difícil determinar mediante la citogenética de rutina si un cromosoma tiene una

deleción simple o está implicado en una reorganización sutil o compleja. Además, la

FISH de metafase puede detectar algunos de los reordenamientos específicos que se

observan en ciertos cánceres.

El número de síndromes de microdeleción diagnosticados por FISH está aumentando

con rapidez. La sensibilidad de estos ensayos es en todos los casos mejor que la de la

citogenética de rutina, pero depende del síndrome en concreto. En algunos, la sonda

es específica para el gen defectuoso, como en el Síndrome de Williams, donde se ha

encontrado una deleción en el gen de la elastina en el 96% de los pacientes con

diagnóstico confirmado. En otros síndromes como el de Prader-Willi/Angelman, la

etiología es heterogénea y las microdeleciones sólo forman una parte de los casos

(60%).

Síndromes de Microdeleción Actualmente Diagnosticables mediante FISH

* Síndrome del maullido (cri-du-chat)

* Síndrome de Kallman

* Síndrome de Miller-Dieker

* Síndrome de Williams

* Síndrome de Smith-Magenis

* Síndrome de Wolf-Hirschhorn

* Deficiencia de esteroide-sulfatasa

* Síndrome de Prader-Willi/Angelman

* Síndrome DiGeorge/Velo-Cardio-Facial/CATCH 22/Shprintzen

Page 17: Citogenética básica y cariotipo

FISH de Interfase

La FISH se puede usar sobre células en interfase para determinar el número de copias

de uno o varios cromosomas, así como para detectar algunas reorganizaciones

específicas que son características de ciertos cánceres. La ventaja principal de la FISH

de interfase es que se puede realizar muy rápidamente si es preciso, normalmente en

24 horas, porque no requiere crecimiento de las células.

Un buen ejemplo es el ensayo de Prueba de Aneuploidía, que se realiza sobre células

del fluido amniótico cuando hay una fuerte indicación clínica de una de las trisomías

más comunes. Se desnaturalizan los núcleos de la muestra, se hibridan con sondas

específicas para los cromosomas 13, 18, 21, X e Y, y los resultados se obtienen

comúnmente en 24 horas. La prueba de aneuploidía suele incluir también una

citogenética de rutina para confirmar los resultados o detectar cualquier anomalía no

detectada por la FISH de interfase.

Pulse en los enlaces siguientes para ver algunos ejemplos de FISH detectados en

nuestro laboratorio:

Éste es un ejemplo de una célula en metafase que se ha hibridado con la sonda para

el síndrome DiGeorge/Velo-Cardio-Facial/CATCH 22/Shprintzen, causado por una

microdeleción en el cromosoma 22. En este caso particular, la sonda es una mezcla

bicolor de dos sondas distintas para el cromosoma 22. La señal verde es un control

interno situado en 22q13. Permite identificar rápidamente los dos cromosomas 22. La

señal roja está situada en la región DiGeorge, en 22q11.2. Puesto que ambos

cromosomas 22 tienen la señal roja, en esta célula no hay microdeleción en la región

DiGeorge y este paciente no tendría el síndrome DiGeorge.

Sonda de pintado del cromosoma 4

Page 18: Citogenética básica y cariotipo

Esta metafase se ha hibridado con una sonda "de pintado" para el cromosoma 4, que

hace que el cromosoma completo emita fluorescencia. Uno de los cromosomas 4 de

Page 19: Citogenética básica y cariotipo

este paciente era anormal, pero era difícil determinar con la citogenética de rutina si

tenía una pequeña deleción terminal en 4q o si era el resultado de una reordenación

más compleja. Puesto que ambos cromosomas 4 son fluorescentes en toda su

longitud y no hay matrial fluorescente en ningún otro cromosoma, esto sugiere que la

anomalía es una deleción terminal pequeña. La metafase siguiente es del mismo

paciente y confirma este diagnóstico.

Sonda de Cromosoma 4qter

Esta metafase del mismo paciente anterior se ha hibridado con una sonda para la

parte terminal del cromosoma 4q. Puesto que sólo hay una señal verde, se confirma

que en uno de los cromosomas 4 falta material del extremo terminal del brazo q. Este

caso es un buen ejemplo de cómo la citogenética de rutina y la FISH pueden usarse

conjuntamente para diagnosticar con exactitud anomalías cromosómicas sutiles.

Sonda para esteroide-sulfatasa

Page 20: Citogenética básica y cariotipo

Éste es un ejemplo de una célula en metafase que se ha hibridado con una sonda para

la Deficiencia de esteroide-sulfatasa, causada por una microdeleción en el cromosoma

X. En este caso particular, la sonda es una mezcla de dos sondas independientes para

el cromosoma X, ambas con color rojo. La señal "X cen" de la sonda es un control

interno localizado en el centrómero de X, que permite la identificación rápida del (o los)

cromosoma(s) X. La señal "Xp22.3" de la sonda está localizada en la región de la

esteroide-sulfatasa, en Xp22.3. Puesto que hay dos cromosomas X y sólo uno tiene la

señal del gen de la esteroide-sulfatasa, este individuo es una mujer portadora de la

deficiencia de esteroide-sulfatasa.

Page 21: Citogenética básica y cariotipo