generación de transfectomas
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TRANSFECCIÓN
Ingeniería de Productos BiológicosUnidad Profesional Interdisciplinaria de Ingenierías Campus GuanajuatoInstituto Politécnico NacionalM.C. Guillermo Garibay Benítez
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La transfección es un procedimiento que introduce ácidos nucleicos hacia las células.
La transfección sirve para estudiar la función de los genes o productos de los genes y producir proteínas recombinantes en células de mamífero.
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Transfección estable: el material genético introducido tiene un gen marcador para la selección (transgenes) los cuales son integrados en el genoma huesped y sostienen la expresión incluso después de que la célula huésped se replica.
Transfección transitoria: Estos genes transitoria transfectados solo son expresados por un periodo de tiempo limitado y no son integrados al genoma,
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Hay métodos biológicos, químicos y físicos.
El método ideal debe mostrar alta eficiencia de transfección, baja toxicidad de las células, efectos mínimos en la fisiología normal, y además de ser reproducible y fácil de usar
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Diagrama de flujo de TransfecciónCultivo de tejidos. Conteo de Células
Resuspender las células en buffer de electroporación
Añadir ácidos nucleicos
Transfectar células
Células en Placa
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AnalisisActividad del Gen
Reportero
Western Blot
Microscopía
Citometria de Flujo
PCR de tiempo
real
Expresión de proteína
Expresión de Gen
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METODOS BIOLÓGICOS
El método más utilizado es la transfección mediada por virus
Es altamente eficiente, y es fácil de lograr una expresión sostenible de la expresión in vivo de transgenes debido a la naturaleza viral de la integración en el genoma huésped
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Vectores Virales
Retrovirus: Virus Murino de Leucemia (MuLV) Virus de Inmunodeficiencia humana
(HIV) Virus limfotrópico de céluas T
humano (HTLV)Virus de ADN: Adenovirus Virus adeno-asociado (AAV) Virus de herpes simple (HSV)
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Retrovirus: una clase de virus que puede crear copias de ADN de doble cadena a partir de sus genomas de ARN, estas copias pueden ser integradas en los cromosomas de las células huésped. El HIV es un retrovirus
Adenovirus: Una clase de virus con genomas de ADN de doble cadena que causan infecciones respiratorias, intestinales y de ojos en humanos. El virus del resfriado común es un adenovirusl
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Virus adeno-asociados: Una clase de virus pequeño de una sola cadena de ADN que puede insertar su material genético a un sitio específico en el cromosoma 19.
Virus del Herpes simple: Una clase de virus de doble cadena de ADN que infecta un tipo de células en particular, las neuronas.
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Vector Viral
Tamaño del Inserto de ADN
Tipo Celular
Expresión Inconveniencias
Retroviral 8 kb Celulas en División
Estable Sitios de inserción al azar
Lentivirus 9 kb Celulas en divisón y sin divisón
Estable Sitios de inserción al azar
Adenovirus 8 kb Celulas en divisón y sin divisón
Transitoria
Altamente inmunogenico
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Vector Viral
Tamaño del Inserto de ADN
Tipo Celular
Expresión
Inconveniencias
Virus adeno-asociado (AAV)
5 kb Celulas en divisón y sin divisón
Estable, localización específica de sitio
Requiere la ayuda de un virus auxiliar para crecer, dificultad de remover el virus auxiliar
Virus de Herpes simpléx
30-40 kb
Celulas en divisón y sin divisón
Transitoria
No hay expresión de genes durante la infección latente
Virus Vaccinia
25 kb Celulas en divisón
Transitoria
Potenciales Efectos citopatologicos
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El retrovirus murino de leucemia (retrovirus leukemia virus MLV) ha sido usado como un vector viral para establecer expresión sostenible de expresión de transgenes
MLV integra su ADN en el genoma huésped, por lo tanto el ADN integrado es expresado en el huésped.
El ADN del MLV se replica al mismo tiempo que el genoma de la célula huésped
Consecuentemente este se segrega en las células hijas, lo cual permite la expresión sostenible de la expresión del transgen
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Desventajas Inmunogenicidad y citotoxicidad. Reacción inflamatoria Inserción de mutaciones, como los
vectores virales se integran en el genoma huésped al azar, esto puede causar una disrupción de genes encargados de suprimir tumores, activar oncogenes o interrumpir genes esenciales
El empaquetamiento del virus tiene un espacio limitado para un gen foráneo y mantener la infectividad
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Métodos Químicos
Por lo general utilizan un polimero catiónico: fosfato de calcio, lípido catiónico o un aminoácido catiónico
Los químicos cargados positivamente forman complejos químicos/ácidos nucleicos con ácidos nucleicos cargados negativamente.
Estos complejos cargados positivamente son atraídos a las membranas cargadas negativamente.
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EFICIENCIA DE LOS METODOS DE TRANSFECCIÓN QUÍMICOS
Depende: proporción de ácidos
nucleicos/químicos pH de la solución Condiciones de las membranas
celulares
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Desventaja: eficiencia de transfección baja (comparada con los métodos de virus)
Ventajas: Baja citotoxicidad, sin mutagénesis, no hay acarreo de ADN extra y sin limitación de tamaño de los ácidos nucleicos
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Lipid-Mediated Gene Delivery(Lipofección o Transfección de genes basados en liposomas)
Utiliza lípidos para causar que la célula absorba ADN exógeno.
Transferencia de material genético hacia las células utilizando liposomas, los cuales son vesículas que pueden fusionarse con la membrana celular ya que ambos están hechos de una membrana de fosfolípidos
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Ventajas de los Lípidos
Desventajas
Entrega de ácidos nucleicos en una placa de cultivo con alta eficiencia
Facil de usar, pasos mínimos requeridos, adaptable a sistemas de métodos “high throughput”
Utilizar un lípido de alta actividad reducirá el costo del lípido y del ácido nucleico, y logrará resultados efectivos
No aplica para todos los tipos celulares
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Fosfato de Calcio Este protocolo involucra el
mezclado del ADN con cloruro de calcio, añadiendo este de una manera controlada a una solución reguladora salina/fosfato, y permitir a la mezcla incubarse a temperatura ambiente.
Este paso genera un precipitado que es dispersado a las células en cultivo.
El precipitado es absorbido por las células vía endocitosis o fagocitosis.
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Ventajas Desventajas
Económico. Alta eficiencia
(depende del tipo de célula).
Puede ser aplicado a un amplio intervalo de tipos celulares.
Puede ser usado para transfección transitoria y transfección estable.
Consistencia en el reactivo es crítica para la reproducibilidad.
Pequeños cambios en el pH (+/-0.1) puede compromoter la eficiencia de transformación.
Tamaño y calidad del precipitado son cruciales.
No se puede usar en medio RPMI, debido a la alta concentración de fosfato en el medio
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Polímeros Catiónicos
Estos, a diferencia de los lípidos catiónicos no contienen una porción hidrofóbica y son completamente solubles en agua.
Estos tienen la habilidad de condensar mas eficientemente el ADN que los lípidos catiónicos.
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DEAE-Dextran
El complejo positivo formado por ADN:polimero forma una asociación cercana con la membrana cargada negativamente.
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Desventajas Desventajas
Económico. Fácil de realizar y
rápido. Puede ser aplicado a
una amplia variedad de tipos celulares
Altas concentraciones de DEAE-Dextran pueden ser tóxicas para las células.
Eficiencias de transfección varian con cada tipo celular.
Solo puede ser usada para transfección transitoria.
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Métodos Físicos
Microinyección Biobalística Electroporación Transfección basada en laser
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Microinyección
Inyección directa de ácidos nucleicos en el citoplasma o núcleos
Este método demanda especialización y es costoso.
Laborioso (una célula a la vez).
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Biobalística
Emplea partículas de oro que se conjugan con ácidos nucleicos.
Estos conjugados son “disparados” a recipientes celulares a alta velocidad
Este método es directo y confiable pero causa daño físico a las muestras
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1.Precipite el ADN en las partículas de oro2.Cargue el ADN/oro en los tubos3.Rote los tubos para cubrir de ADN/oro en
la superficie interna.4.Corte los tubos en cartuchos5.Cargue los cartuchos en la pistola de
genes6.Entregue el ADN a las células
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1. Las partículas de oro recubiertas de ADN (microacarreador) son esparcidas sobre el área central de un disco de plástico fino (macroacarreador).
2. El disco cargado de ADN es colocado en un soporte dentro del equipo.
3. El sistema usa helio de alta presión, liberado por un disco de ruptura y vacío parcial para propulsar el macroacarreador cargado con el microacarreador hacia las células .
4. El macroacarreador es detenido a corta distancia por una pantalla de detención.
5. Las partículas de oro recubiertas de ADN continuan viajando hacia el objetivo para penetrar las células.
6. La cámara de muestra esta sujeta a vacio parcial.
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Electroporación
Un pulso eléctrico corto causa una disrupción en la membrana celular y abre poros en la membrana, a través de los cuales los ácidos nucleicos pueden pasar.
Es capaz de transfectar una gran cantidad de células en un periodo corto de tiempo, una vez que las condiciones optimas de electroporación son alcanzadas
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1. La electroporación expone a la célula a un campo eléctrico de alta intensidad que desestabiliza temporalmente a la membrana
2. Durante este tiempo la membrana es altamente permeable a moléculas exógenas presentes en el medio
3. El ADN se mueve hacia la célula a través de estos poros.
4. Cuando el campo eléctrico es apagado, los poros de la membrana se resellan, encerrando al ADN dentro de la célula
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Ventajas Desventajas
No altera la estructura biológica o de función de las células.
Fácil de realizar. Alta Eficiencia. Puede ser aplicado a
un amplio número de tipos celulares
Mortalidad Celular
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Factores que afectan la transfección
En la célula huésped: salud de la célula, cultivo celular
Del material genético: Calidad y cantidad del ADN
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Salud Celular
Las células deben de crecer en medio adecuado con todos los factores necesarios
Los cultivos deben estar libres de contaminación
Medio fresco debe ser utilizado si este contiene componentes químicos inestables como timina
Las células deben ser incubadas a 37°C con un porcentaje de CO2 de 5 a 10% y un 100% de humedad relativa
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Cultivo Celular
Muy pocas células causan que el cultivo celular crezca pobremente sin contacto el contacto de célula a célula.
Por el contrario, muchas células resultan en inhibición por contacto, haciendo a las células resistentes al consumo de ADN y otras macromoléculas.
Es decir, las células deben ser transfectadas a un 40 a 80% de confluencia.
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Cultivo Celular
Las células en división asimilan el ADN mejor.
(El rompimiento y perforación de la membrana nuclear durante la mitosis habilita la entrega nuclear)
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Cultivo Celular
El número de pasajes debe de ser bajo (<50)
Las características de las células pueden cambiar con el tiempo con líneas celulares inmortalizadas y las células pueden no responder a las mismas condiciones de transfección.
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Calidad y Cantidad del ADN Usar plásmidos de ADN de alta calidad que estén libres de proteína, ARN y químicos para las transfecciones. (La remoción de endotoxinas debe ser parte del procedimiento de preparación).
Por lo general el ADN es suspendido en agua estéril o buffer TE a una concentración final de 0.2-1 mg/mL
La cantidad óptima de ADN puede variar dependiendo del tipo de ADN, método/reactivo de transfección, línea celular y número de células
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Sophie Mehier-Humbert, Richard H. Guy, Physical methods for gene transfer: Improving the kinetics of gene delivery into cells, Advanced Drug Delivery Reviews 57 (2005) 733– 753
Jian Yang, Ming Hong Shen, Polyetylene Gycol-Mediated Cell Fusion in Methods in Molecular Biology, vol. 325: Nuclear Reprogramming: Methods and Protocols Edited by: S. Pells © Humana Press Inc., Totowa, NJ