maldi tof ms - türk mikrobiyoloji cemiyeti€ışını kristalografi, nüklearmanyetik rezonans...
TRANSCRIPT
MALDI‐TOF MS
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS)
(Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
Dr Meltem Yalınay CcedilırakGazi Uumlniversitesi Tıp Fakuumlltesi
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
XXXIV Mikrobiyoloji Kongresi07‐11 Kasım 2010
Belli bir zamanda belli bir huumlcrede belli bir dokuda belli bir organizmada bulunan
gereken tuumlm biyokimyasal tepkimeleri yuumlruumlten proteinlerin tamamı proteom
Proteomik ise belli bir organizmada bulunan proteinlerin toplamını incelemek iccedilin
kullanılan youmlntemlerin tuumlmuuml
ELISA İki youmlnluuml elektroforez (2D‐PAGE) Doku ve protein ccedilip teknolojisi (mikroarray)Kuumltle spektrometresi
MALDI‐TOF MS (Matrix‐assisted laser desorptionionization time of flight Mass Spectrometry)SELDI‐TOF MS (Surface enhanced laser desorptionionization time‐of‐flight Mass Spectrometry)
Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
Kantitatif kuumltle spektrometresiLazer yakalama mikrodisseksiyon [Laser capturemicrodissection (LCM)] Protein‐protein protein‐DNA bağlanma reaksiyonları iccedilin afinite kromatografi floresans rezonans enerji transferi (FRET) Peptid ve proteinlerin uumlccedil boyutlu incelenmesi
X‐ ışını kristalografi nuumlklear manyetik rezonans
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
1980rsquolerin sonunda Alman ve Japon bir grup Proteinlerin peptid kuumltle parmak izi
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Belli bir zamanda belli bir huumlcrede belli bir dokuda belli bir organizmada bulunan
gereken tuumlm biyokimyasal tepkimeleri yuumlruumlten proteinlerin tamamı proteom
Proteomik ise belli bir organizmada bulunan proteinlerin toplamını incelemek iccedilin
kullanılan youmlntemlerin tuumlmuuml
ELISA İki youmlnluuml elektroforez (2D‐PAGE) Doku ve protein ccedilip teknolojisi (mikroarray)Kuumltle spektrometresi
MALDI‐TOF MS (Matrix‐assisted laser desorptionionization time of flight Mass Spectrometry)SELDI‐TOF MS (Surface enhanced laser desorptionionization time‐of‐flight Mass Spectrometry)
Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
Kantitatif kuumltle spektrometresiLazer yakalama mikrodisseksiyon [Laser capturemicrodissection (LCM)] Protein‐protein protein‐DNA bağlanma reaksiyonları iccedilin afinite kromatografi floresans rezonans enerji transferi (FRET) Peptid ve proteinlerin uumlccedil boyutlu incelenmesi
X‐ ışını kristalografi nuumlklear manyetik rezonans
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
1980rsquolerin sonunda Alman ve Japon bir grup Proteinlerin peptid kuumltle parmak izi
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Proteomik ise belli bir organizmada bulunan proteinlerin toplamını incelemek iccedilin
kullanılan youmlntemlerin tuumlmuuml
ELISA İki youmlnluuml elektroforez (2D‐PAGE) Doku ve protein ccedilip teknolojisi (mikroarray)Kuumltle spektrometresi
MALDI‐TOF MS (Matrix‐assisted laser desorptionionization time of flight Mass Spectrometry)SELDI‐TOF MS (Surface enhanced laser desorptionionization time‐of‐flight Mass Spectrometry)
Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
Kantitatif kuumltle spektrometresiLazer yakalama mikrodisseksiyon [Laser capturemicrodissection (LCM)] Protein‐protein protein‐DNA bağlanma reaksiyonları iccedilin afinite kromatografi floresans rezonans enerji transferi (FRET) Peptid ve proteinlerin uumlccedil boyutlu incelenmesi
X‐ ışını kristalografi nuumlklear manyetik rezonans
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
1980rsquolerin sonunda Alman ve Japon bir grup Proteinlerin peptid kuumltle parmak izi
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
ELISA İki youmlnluuml elektroforez (2D‐PAGE) Doku ve protein ccedilip teknolojisi (mikroarray)Kuumltle spektrometresi
MALDI‐TOF MS (Matrix‐assisted laser desorptionionization time of flight Mass Spectrometry)SELDI‐TOF MS (Surface enhanced laser desorptionionization time‐of‐flight Mass Spectrometry)
Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
Kantitatif kuumltle spektrometresiLazer yakalama mikrodisseksiyon [Laser capturemicrodissection (LCM)] Protein‐protein protein‐DNA bağlanma reaksiyonları iccedilin afinite kromatografi floresans rezonans enerji transferi (FRET) Peptid ve proteinlerin uumlccedil boyutlu incelenmesi
X‐ ışını kristalografi nuumlklear manyetik rezonans
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
1980rsquolerin sonunda Alman ve Japon bir grup Proteinlerin peptid kuumltle parmak izi
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Kantitatif kuumltle spektrometresiLazer yakalama mikrodisseksiyon [Laser capturemicrodissection (LCM)] Protein‐protein protein‐DNA bağlanma reaksiyonları iccedilin afinite kromatografi floresans rezonans enerji transferi (FRET) Peptid ve proteinlerin uumlccedil boyutlu incelenmesi
X‐ ışını kristalografi nuumlklear manyetik rezonans
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
1980rsquolerin sonunda Alman ve Japon bir grup Proteinlerin peptid kuumltle parmak izi
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Matrix‐Assisted Laser DesorptionIonization time‐of‐flight Mass Spectrometry (MALDI‐TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyonuccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
1980rsquolerin sonunda Alman ve Japon bir grup Proteinlerin peptid kuumltle parmak izi
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Prensip
MALDI kuumltle spektrometrede kullanılan biriyonizasyon tekniğiBiyomolekuumlllerin (protein peptid ve şekergibi) buumlyuumlk organik molekuumlllerin (polimer dendrimer makromolekuumll gibi) analiziİyonizasyon lazer atışıMatriks biyomolekuumlluumln amacı direkt lazeratışının tahribinden korumak ve iyonizasyonukolaylaştırmak
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Matriks
UV absorbe eden matriks (Hillenkamp ve Karas) Matriks ve polimer molekuumller duumlzeyde uygun bir ccediloumlzuumlcuuml (formik asit trifloroasetik asit asetik asit vb) iccedilinde karıştırılır Ccediloumlzuumlcuuml polimerin agregasyonunu engeller Oumlrnekmatriks karışımı oumlrnek prop ucuna yerleştirilir Vakum koşullarıyla ccediloumlzuumlcuuml uzaklaştırılarak matriksmolekuumllleri iccedilinde homojen olarak yayılmış polimer molekuumlllerini bırakır
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Lazer vuruş atımları uygun frekansa ayarlanınca kısmen buharlaşmış ve buhar fazında intakt polimeri taşıyan ve polimer
zincirlerinin elektrik yuumlklenmesine neden olan matrikse enerji aktarılır
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI-TOF Kuumltle spektrometre
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Biraz fizikhellip
Lazer vuruşları ile oluşan dijitalize veriler TOF kuumltle spektrumu oluşturacak şekilde toplanır TOF kuumltle spektrumu zamanın bir fonksiyonu olarak saptayıcı sinyalin bir kaydıdır Kuumltlenin (m) bir molekuumlluumlnuumln uccediluş zamanı ve bu mesafeyi geccedilerken yuumlklendiği akım (z) (mz)12ye orantılıdır Zaman ve (mz)12 arasındaki ilişki iyonların kuumltlelerini hesaplamada kullanılabilir
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Biyoinformatik Analiz
BioTyper (Bruker Daltonics Inc Bremen Almanya)Saramis (AnagnosTec GmbH Potsdam‐GolmAlmanya)
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Applied Biosystems VoyagerDE Pro MALDI‐TOF Applied Biosystems Q‐Star ESI‐Quadrupole‐TOFShimadzu LC MS IT‐TOF massspectrometerSequenom Mass ARRAY Compact Analyser
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Belirleyiciler
Diagnostik Prognostik Prediktif
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
ldquoMALDI‐TOFrdquo 8396ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquobacteriardquo 1393ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquofungirdquo 847ldquoMALDI‐TOFrdquo ldquovirusrdquo 249
httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezKasım 2010
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI‐MS mikroorganizma analizi iccedilin oumlnemli bir tanı aracıMALDI‐MS
hastalık monitorizasyonutanısıkanın taranması
Bakteri maya ve filamentoumlz mantarların virus viral vektoumlrler ve doğru ve hızlı tanımlanmasıTaksonomi ve epidemiyoloji
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI‐MSBAKTERİ
mz oranı ile biyobelirleyici iyonların belirlenmesiIsıtılan intakt bakteri huumlcreleri
Anhalt JP Fenselau C Identification of bacteria using mass spectrometryAnal Chem 1975 47219ndash25
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Rapid Commun Mass Spectrom 199610(10)1227‐32Rapid identification of intact whole bacteria based on spectralpatterns using matrix‐assisted laser desorptionionization withtime‐of‐flight mass spectrometryHolland RD Wilkes JG Rafii F Sutherland JB Persons CC Voorhees KJ Lay JO JrFood and Drugs Administration National Center for ToxicologicalResearch Jefferson AR 72079 USA
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Bacillus anthracis
Brucella melitensis
Yersinia pestis
Francisella tularensis
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Gram‐pozitif koklarStafilokok streptokoklar
EnterobacteriaceaeEscherichia coliYersinia enterocoliticaErwinia tuumlrleri Salmonella enterica
Nonfermenter bakterilerCampylobacterHelicobacter pyloriAeromonasHaemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniaeStreptococcus agalactiaeBartonella henselaeNeisseria Listeria mikobakteriAntibiyotik direncinin dakikalar iccedilinde belirlenmesi
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
P putida
B atrophaeus E coliP putida
E coli
gt90 doğru tanımlama
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
1660 bakteri izolatının 954 doğru tanımlanmış1 izolat iccedilin 6 dakika
Maliyet konvansiyonel fenotipik tanımlamanın 22‐32
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI‐TOF 99Fenotipik youmlntem 98
Mayıs 2010
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI‐TOF Mass Spectrometry identifies 90 ofbacteria directly from Blood Culture vialsAuthors Wardi Moussaoui1 Benoit Jaulhac1 Anne‐Marie Hoffmann1 Markus Kostrzewa2Philippe Riegel1 Gilles Preacutevost1Ağustos 2010
MALDI‐Biotyper213 Gram (‐) 193 9108319 Gram (+) 284 8902
(Streptococcus pneumonia‐ Smitis)
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Clinical Biochemistry 2010
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI‐MSMANTAR
Filamentoumlz mantarlarPenicilliumAspergillusFusariumTrychophyton rubrum T interdigitale T tonsuransArthroderma benhamiae
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
140 izolat (138) 986
Haziran 2010
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Gram (‐) 966Gram (+) 657İnvaziv fungal enfeksiyonlarda uumlzerinde ccedilalışılmalı
Laura Ferreira1Fernando Saacutenchez‐Juanes1Isabel Porras Guerra2Mordf Inmaculada Garciacutea Garciacutea2 Joseacute Eliacuteas Garciacutea Saacutenchez2Joseacute Manuel Gonzaacutelez‐Buitrago14Juan Luis Muntildeoz Bellido25Nisan 2010
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
MALDI‐MSVİRUS
Viral yapısal proteinlerin belirlenmesiGen terapi iccedilin değiştirilen viral vektoumlrlerin izlenmesiTerapoumltik gen ve ekspresyon uumlruumlnuumlnuumln belirlenmesi
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
Adenovirus yapı proteinleri
Yao X Freas A Ramirez J Demirev PA Fenselau C 2001Proteolytic O‐18 labelingfor comparative proteomics model studies with two serotypes of adenovirus Anal Chem 732836plusmn2842
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-
SONUCcedil
Bakteri identifikasyonu yuumlz guumllduumlruumlcuumlDakikalar iccedilindeMaliyet etkinAntimikrobiyal direnccedilİlaccedil hedefleri
Mantar ccedilalışmalarıFilamentoumlz mantarlar
- MALDI-TOF MSMatrix-Assisted Laser DesorptionIonization time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyoniyonizasyon uccediluş zamanı kuumltle spektrometresi)
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Proteomik ccedilalışmalarda kullanılan youmlntemler
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Prensip
- Matriks
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Biraz fizikhellip
- Slide Number 15
- Biyoinformatik Analiz
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Belirleyiciler
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- MALDI-MSBAKTERİ
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
- Slide Number 33
- Slide Number 34
- Slide Number 35
- MALDI-MSMANTAR
- Slide Number 37
- Slide Number 38
- MALDI-MSVİRUS
- Slide Number 40
- SONUCcedil
-